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Word第第頁畢業(yè)設計開題報告的模板1、二維定量結(jié)構(gòu)活性關系方法(2d-qsar)傳統(tǒng)的二維定量結(jié)構(gòu)活性關系方法許多,有hansch法、基團奉獻法和分子連接性指數(shù)法等[3]。
其中最為有名、應用最為廣泛的是hansch法。它假設同系列化合某些生物活性的改變是和它們某些可測量的物理化學性質(zhì)(疏水性、電性質(zhì)和空間立體性質(zhì)等)的改變相聯(lián)系的,并假定這些因子是彼此孤立的,采納多重自由能相關法,借助多重線性回來等統(tǒng)計方法就可以得到定量結(jié)構(gòu)活性關系模型。
基團奉獻法是free-wilson在對有機物亞結(jié)構(gòu)信息和生物毒性的相關討論基礎上建立的一種方法。這種模式認為有機物與受體間的毒性效應是該有機物特定位置上不同取代基團毒性奉獻的加和。free-wilson法僅適用于具有相同母體結(jié)構(gòu)的有機物,常被用來對有機物進行毒性初評。
分子連接性指數(shù)法(molecularconnectiveindex,mci)是由kier和hall提出的。它是依據(jù)分子中各個骨架原子排列或相連接的方式來描述分子的結(jié)構(gòu)性質(zhì)。mci是一種拓撲學參數(shù),有零階項(0xv)、易階項(1xv)、二階項(2xv)等等,可以依據(jù)分子的結(jié)構(gòu)式和原子的點價(δ)計算得到,與有機物的毒性數(shù)據(jù)有較好的相關性。mci能較強地反映分子的立體結(jié)構(gòu),但反映子電子結(jié)構(gòu)的力量較弱,因此缺乏明確的物理意義,但由于其具有便利、簡潔且不依靠于試驗等優(yōu)點,近年來得到廣泛應用和進展[4~8]。
2、三維定量結(jié)構(gòu)活性關系方法(3d-qsar)隨著結(jié)構(gòu)活性關系理論和統(tǒng)計方法的進一步進展,20世紀80年月,三維結(jié)構(gòu)信息被間續(xù)引入到定量結(jié)構(gòu)活性關系討論中,即3d-qsar。與2d-qsar比較,3d-qsar方法在物理化學上的意義更為明確,能間接反映藥物分子和靶點之間的非鍵互相作用特征。因此,近十多年來3d-qsar方法得到了快速的進展和廣泛的應用,討論方法也許多[9],比方分子樣子分(molecularshapeanalysis,msa),距離幾何方法(distancegeometry,dg,比較分子力場分析(comparativemolecularfieldanalysis,comfa),比較分子相像因子分析(comparativemolecularsimilarityindicesanalysicomsia)以及虛擬受體(phesudoreceptor)等方法。其中應用最為廣泛的comfa方法。
3、隨著技術的進展和生產(chǎn)技術的進步,又消失了一些先進的方法來構(gòu)建qsar模型,都具有很好的預報力量。其中又以啟發(fā)發(fā)(heuristicmethod,簡稱hm),支持向量機(supportvectormachine,簡稱svm),基因表達式編程(geneexpressionprogramming,簡稱gep)比較常見。支持向量機(supportvectormachine)是vapnik[10]等人依據(jù)統(tǒng)計學理論提出的一種新的通用學習方法,它是建立在統(tǒng)計學理論的vc維理論和結(jié)構(gòu)風險最小原理基礎上的,能較好地解決小樣本、非線性、高維數(shù)等實際問題[11-12],已勝利地應用于分類、函數(shù)靠近和時間序列預報等方面[13-15];基因表達式編程(gep)是基于生物學遺傳思想,保持了生物學的特性,具有良好的結(jié)果重現(xiàn)性,同時也能夠進行“遺傳變異”掌握,最終能獲得牢靠的試驗效果。
三、主要討論內(nèi)容
1、查閱中外文文獻選取數(shù)據(jù)來源。
2、理化參數(shù)與結(jié)構(gòu)參數(shù)的計算。
3、詳細的結(jié)構(gòu)參數(shù)的分析。
4、svm與gep的方法討論。
5、定量結(jié)構(gòu)關系式的建立。
6、定量結(jié)構(gòu)關系式的驗證。
7、得出結(jié)論和總結(jié)。
四、論文工作打算
3月中旬—4月初:選題。
4月初—4月底:查閱資料,熟識試驗原理及方法,預備開題報告。
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