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文檔簡介
PCR的擴增是指數(shù)增長嗎先看一道試題:如圖為形成cDNA過程和PCR擴增過程示意圖.據(jù)圖分析,下列說法正確的是A.催化①過程的酶是RNA聚合酶B.④過程發(fā)生的變化是引物與單鏈DNA結(jié)合C.催化②⑤過程的酶相同,且都能耐高溫D.通過該過程可以使目的基因的量以指數(shù)的形式增長答案:BD解析:結(jié)合圖示過程分析,①過程為逆轉(zhuǎn)錄過程,②過程為單鏈DNA合成雙鏈DNA的過程;③④⑤過程為PCR反應(yīng)過程。①過程為逆轉(zhuǎn)錄過程,需要逆轉(zhuǎn)錄酶催化,A錯誤;④過程發(fā)生的變化是引物與單鏈DNA結(jié)合,B正確;催化②⑤過程的酶都是DNA聚合酶,但只有催化⑤過程的酶能耐高溫,C錯誤;通過PCR技術(shù)可以使DNA
擴增量呈指數(shù)上升,反應(yīng)最終的DNA擴增量可用Y=(1+X)n計算,D正確。這道試題D選項:通過該過程可以使目的基因的量以指數(shù)的形式增長。解析中認(rèn)為如此。PCR擴增中是指數(shù)增長嗎?在PCR中,隨著擴增周期的增加,理論上模板以指數(shù)方式進行擴增。每一擴增周期后產(chǎn)物的量可以下式表達Yn=Yn-1*(1+E)
0≤E≤1
-------1其中E表示擴增效率,Yn表示在n個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,Yn-1為n-1個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量。而擴增一定的周期后,擴增產(chǎn)物的總數(shù)量可以下式表示Yn=X·(1+E)n
-------2其中Y為PCR產(chǎn)物的分子數(shù)量,X為原始模板的數(shù)量,n為周期數(shù),E為擴增效率,位于0至1之間。公式(2)僅在限定的擴增周期數(shù)即指數(shù)擴增期(通常為20~30個循環(huán))內(nèi)成立,超過此周期數(shù),擴增過程即由指數(shù)擴增降低至穩(wěn)定的擴增速率,最終達到平臺,不再擴增。此時,公式(1)中的E逐步降低,直至0。影響擴增效率的因素較多,如:引物/靶核酸的退火情況;參與擴增反應(yīng)試劑的相對量尤其是TaqDNA聚合酶/靶核酸;擴增儀孔中溫度的不均一性;臨床標(biāo)本中TaqDNA聚合酶抑制物的去除不完全;擴增試劑的有限和擴增中焦亞磷酸鹽累積等。因此,PCR擴增最后不再以指數(shù)方式進行。要定量PCR擴增產(chǎn)物很容易,但從上述擴增產(chǎn)物與模板之間的關(guān)系來看,由于E和擴增周期數(shù)(n)的變化,擴增產(chǎn)物的量與最初PCR模板的量之間沒有一個確定的比例關(guān)系。只有在PCR的指數(shù)擴增期的擴增產(chǎn)物量才與起始模板的量有正比例相關(guān)。因此,定量PCR必須在PCR擴增的指數(shù)期進行測定,而以前的非實時PCR方法很難確定特定的PCR的擴增指數(shù)期,通常需要大量的實驗論證實時PCR的出現(xiàn),則使得整個PCR的擴增過程測定信號的變化處于動態(tài)監(jiān)測之中,很容易判斷指數(shù)擴增期的出現(xiàn),從而避免了傳統(tǒng)PCR反應(yīng)中產(chǎn)物量的可變性。實時PCR,就是檢測PCR擴增周期每個時間點上擴增產(chǎn)物的量,通常是檢測每個循環(huán)結(jié)束后的產(chǎn)物量,從而實現(xiàn)PCR擴增的動力學(xué)監(jiān)測。要達到這一點,就需要有
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