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文檔簡(jiǎn)介
確定某單基因遺傳病是由某基因造成的對(duì)于臨床治療有重大意義,可以對(duì)癥下藥。那么怎樣在實(shí)驗(yàn)室里準(zhǔn)確的確定某單基因遺傳病是由某基因的突變?cè)斐傻??ControlsDNAsequencingMicroarrayorRNAseqBioinformaticsSelectmodelorganismGeneratetransgenicanimals,mutant?RNAioroverexpress.PhenotypicandbiochemistryanalysisRescue第五大節(jié)1.線粒體遺傳病2.多基因遺傳病
線粒體遺傳病
(diseaseofmitochondrialinheritance)要點(diǎn)線粒體DNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)mtDNA與nDNA的不同mtDNA突變遺傳特征mt遺傳病與衰老和癌癥關(guān)系研究方法
1894年,Altmann發(fā)現(xiàn)動(dòng)物細(xì)胞中線粒體。1963年,M.Nass和S.Nass首次在雞卵母細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)線
粒體中存在有DNA。1987年,Wallace等通過(guò)對(duì)線粒體DNA突變和Leber病的
關(guān)系的研究后,明確地提出線粒體DNA突變可以引起人
類(lèi)的疾病。
目前已發(fā)現(xiàn)人類(lèi)100余種疾病與線粒體DNA突變有關(guān)。
發(fā)現(xiàn)歷史Cellstructureandmitochondrion
ComplexⅢComplexⅠComplexⅣATPase8/6mtDNA結(jié)構(gòu)16569bprRNAtRNA一、
線粒體DNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)復(fù)合物I:NADH脫氫酶復(fù)合物,催化電子從NADH傳遞給輔酶Q.復(fù)合物II:琥珀酸脫氫酶復(fù)合物,催化電子從琥珀酸傳遞給輔酶Q.復(fù)合物Ⅲ:細(xì)胞色素c還原酶復(fù)合物,催化電子從輔酶Q向細(xì)胞色素c傳遞.復(fù)合物Ⅳ:細(xì)胞色素c氧化酶,將電子從細(xì)胞色素c傳遞給O2.
線粒體DNA特點(diǎn)
外環(huán)為重鏈(H)富含G
內(nèi)環(huán)為輕鏈(L)富含C12種多肽鏈12SrRNA16SrRNA14種tRNA1種多肽鏈8種tRNA
mtDNA:雙鏈環(huán)狀的DNA分子、裸露不與組蛋白結(jié)合,分散在線粒體基質(zhì)中,長(zhǎng)約5um、含16569個(gè)堿基對(duì)。
線粒體DNA組成2種編碼rRNA(12S和16S)基因22種編碼tRNA基因13種編碼蛋白質(zhì)基因HumanmtDNA,acircularmoleculethathasbeenfirstcompletelysequenced,containing16,569basepairs.Howtoextractit?
mtDNA與nDNA不同:
①其分子上無(wú)核苷酸結(jié)合蛋白,缺少組蛋白的保護(hù)。②線粒體內(nèi)無(wú)DNA損傷修復(fù)系統(tǒng),mtDNA易發(fā)生突變并容易得到保存。③每個(gè)線粒體內(nèi)含有2~10個(gè)拷貝的mtDNA分子。④每個(gè)細(xì)胞可具有數(shù)千個(gè)mtDNA分子
。
mtDNA的半保留復(fù)制:H鏈復(fù)制的起始點(diǎn)(OH)與L鏈復(fù)制起始點(diǎn)(OL)相隔2/3個(gè)mtDNA。復(fù)制起始于L鏈的轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子,首先以L鏈為模板合成一段RNA作為H鏈復(fù)制的引物,在DNA聚合酶作用下,復(fù)制一條互補(bǔ)的H鏈,取代親代H鏈與L鏈互補(bǔ)。被置換的親代H鏈保持單鏈狀態(tài),這段發(fā)生置換的區(qū)域稱(chēng)為置換環(huán)或D環(huán)。
隨著新H鏈的合成,D環(huán)延伸,輕鏈復(fù)制起始點(diǎn)OL暴露,L鏈開(kāi)始以被置換的親代H鏈為模板沿逆時(shí)針?lè)较驈?fù)制。兩條鏈的復(fù)制全部完成后,起始點(diǎn)的RNA引物被切除,缺口封閉,兩條子代DNA分子分離。40分鐘后,新合成的松弛型線粒體DNA成為超螺旋狀態(tài)。線粒體DNA復(fù)制
二、線粒體DNA的遺傳學(xué)特征1.mtDNA半自主性,受核蛋白調(diào)控
2.mtDNA遺傳密碼與通用密碼不完全相同
3.mtDNA為母系遺傳
4.mtDNA在有絲分裂和減數(shù)分裂期間都要經(jīng)過(guò)
復(fù)制分離,也有時(shí)不復(fù)制
5.mtDNA具有閾值效應(yīng)的特征
6.mtDNA的突變率很高
(一)mtDNA具有半自主性
線粒體是一種半自主細(xì)胞器,受線粒體基因組和核基因組兩套遺傳系統(tǒng)共同控制
。
mtDNA僅編碼13種蛋白質(zhì),絕大部分蛋白質(zhì)亞基和其他維持線粒體結(jié)構(gòu)和功能的蛋白質(zhì)都依賴(lài)于nDNA編碼,在細(xì)胞質(zhì)中合成后,經(jīng)特定轉(zhuǎn)運(yùn)方式進(jìn)入線粒體
。mtDNA基因的表達(dá)受nDNA的制約,線粒體氧化磷酸酶化系統(tǒng)的組裝和維護(hù)需要nDNA和mtDNA的協(xié)調(diào),二者共同作用參與機(jī)體代謝調(diào)節(jié)。線粒體的半自主性Complex Subunits Nuclear mtDNAⅠ 41347Ⅱ 440Ⅲ11101Ⅳ
13 10 3ATPase1412 2
合計(jì)877013(二)線粒體基因組所用的遺傳密碼和通用密碼不完全等同
MetIleAUAMetMetAUGStopArgAGAStopArgAGGTrpStopUGATrpTrpUGGmtDNAUniversalcodeCodon(三)mtDNA為母系遺傳
母親將她的mtDNA傳遞給兒子和女兒,但只有女兒能將其mtDNA傳遞給下一代。線粒體的母系遺傳,O:卵子;S:精子;A、B、C子細(xì)胞;Z:受精卵突變檢測(cè)與遺傳特點(diǎn)有些可通過(guò)southern檢測(cè),常規(guī)檢測(cè)呢?母系遺傳(四)mtDNA在有絲分裂和減數(shù)分裂期間都要經(jīng)過(guò)復(fù)制分離
人的細(xì)胞里通常有上千個(gè)mtDNA拷貝,在突變體和正常mtDNA共存的細(xì)胞中,mtDNA在細(xì)胞的復(fù)制和分離過(guò)程中發(fā)生遺傳漂變,可導(dǎo)致子細(xì)胞出現(xiàn)三種基因型:純合的突變體mtDNA、純合的正常mtDNA、突變體和正常的mtDNA的雜合體。
(五)mtDNA具有閾值效應(yīng)的特性
線粒體病發(fā)病有一閾值,只有當(dāng)異常的mtDNA超過(guò)閾值時(shí)才發(fā)病。女性攜帶者的細(xì)胞內(nèi)突變的mtDNA未達(dá)到閾值或在某種程度上受核影響而未發(fā)病,但仍可以通過(guò)mtDNA突變體向下代傳遞。
(六)mtDNA的突變率極高
mtDNA中基因排列緊湊,任何突變都可能會(huì)影響到其基因組內(nèi)的某一重要功能區(qū)域。mtDNA是裸露的分子,不與組蛋白結(jié)合。mtDNA位于線粒體內(nèi)膜附近,直接暴露于呼吸鏈代謝產(chǎn)生的超氧離子和電子傳遞產(chǎn)生的羥自由基中,極易受氧化損傷。mtDNA復(fù)制頻率較高,復(fù)制時(shí)不對(duì)稱(chēng),缺乏有效的DNA損傷修復(fù)能力。
第二節(jié)mtDNA突變與人類(lèi)疾病
線粒體突變導(dǎo)致的疾病主要累及肌肉、中樞和外周神經(jīng)系統(tǒng),與貧血和糖尿病等疾病也相關(guān)。一、線粒體遺傳病的突變類(lèi)型
1.堿基突變蛋白質(zhì)錯(cuò)義突變:
也稱(chēng)氨基酸替換突變,主要與腦脊髓性及神經(jīng)性疾病有關(guān),常見(jiàn)有Leber遺傳性視神經(jīng)病和神經(jīng)肌病。蛋白質(zhì)合成基因突變:
tRNA
突變,比錯(cuò)義突變的疾病表型更具有系統(tǒng)性特征,并與線粒體肌病相關(guān)。主要有MERRF綜合征。2.缺失、插入突變
mtDNA缺失突變引起絕大多數(shù)眼肌病,這種缺失導(dǎo)致的疾病一般無(wú)家族史。3.mtDNA拷貝數(shù)目突變
此型較少,如嬰兒致死性呼吸障礙。二、人類(lèi)線粒體遺傳病
目前發(fā)現(xiàn)的線粒體疾病集中在神經(jīng)和肌肉系統(tǒng),內(nèi)分泌系統(tǒng)等疾病也與線粒體功能障礙有關(guān)。線粒體病的常見(jiàn)臨床表現(xiàn)
神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)
腦血管意外樣癥狀癲癇發(fā)作眼肌麻痹肌陣攣眼神經(jīng)病肌病抑制性精神病感覺(jué)性神經(jīng)耳聾共濟(jì)失調(diào)
健忘外周性神經(jīng)病
血管性頭痛
脊髓病
其他系統(tǒng)疾病表現(xiàn)
心臟傳導(dǎo)系統(tǒng)缺陷
范可尼近端神經(jīng)元機(jī)能障礙視網(wǎng)膜色素變性腎小球病,肝病小腸假性梗阻糖尿病
個(gè)體矮小
乳酸中毒
全血減少
心肌病
主要病變?yōu)橐暽窠?jīng)退行性變,發(fā)病較早,表現(xiàn)為急性亞急性視力減退,中心視野喪失最明顯。LeberT醫(yī)生(一)Leber遺傳性視神經(jīng)?。∣MIM#535000)
一般認(rèn)為是由于mtDNA點(diǎn)突變導(dǎo)致其第11778位堿基突變,精氨酸→組氨酸,使編碼呼吸鏈NADH脫氫酶mtDNA第340位精氨酸被組氨酸取代,改變了mtDNA閥間構(gòu)型,導(dǎo)致NADH脫氫酶活性降低,線粒體產(chǎn)能下降,對(duì)需能量多的視神經(jīng)組織損害最大,久之導(dǎo)致視神經(jīng)細(xì)胞退行性變,直至萎縮。mtDNA結(jié)構(gòu)16569bp11778G→A
假如幾十個(gè)線粒體中有數(shù)個(gè)線粒體的堿基突變,如何鑒定?I12II123456III1234567Leber遺傳性視神經(jīng)病家系之一母系遺傳,女病人的后代都可患病,壽命短Leber遺傳性視神經(jīng)病家系之二女病人的后代不一定患病,正常女人(攜帶者)的后代也可能是患者Leber遺傳性視神經(jīng)病家系之三有的患病,有的正常Leber遺傳性視神經(jīng)病家系之四(二)神經(jīng)病伴運(yùn)動(dòng)性共濟(jì)失調(diào)和視網(wǎng)膜色素變性(Neuropathy,ataxia,andretinitispigmentosa)
以發(fā)育遲緩,近端肢體肌無(wú)力,癡呆,抽搐,視網(wǎng)膜色素變性和感覺(jué)功能減退為特點(diǎn)。
在線粒體ATPase6基因的第8993位點(diǎn)發(fā)生T至G的顛換,使ATPase第6亞單位的第156位上的亮氨酸改變?yōu)榫彼帷?/p>
如果8993位置突變的異質(zhì)性超過(guò)90%時(shí),通常會(huì)發(fā)生一種致命的、發(fā)生在嬰兒期的疾病,稱(chēng)Leigh綜合征(Leighsyndrome,LS,OMIM#256000)。主要病理學(xué)特征是基底神經(jīng)節(jié)和腦干部位神經(jīng)元細(xì)胞的退化
。Leigh綜合征患者
NARP和Leigh綜合征主要與ATP復(fù)合酶的功能受損有關(guān),目前發(fā)現(xiàn)該病的致病突變主要是mtDNA第8993位點(diǎn)(ATPase6基因)T→G或T→C,將Pase6亞基156位的亮氨酸改變?yōu)榫彼峄蚋彼?,從而影響ATP合酶的質(zhì)子通道。
mtDNA結(jié)構(gòu)16569bpNARP8993T→G(三)MERRF綜合征
多系統(tǒng)紊亂,肌陣攣性癲癇,共濟(jì)失調(diào),輕度癡呆,耳聾,脊髓退化。
大量團(tuán)塊狀線粒體聚集于肌細(xì)胞中(可被特異性染料染成紅色,—破碎紅纖維)。大腦卵圓核與齒狀核有神經(jīng)元的缺失。MERRF綜合征患者M(jìn)TTK*MERRF8344GmtDNA結(jié)構(gòu)16569bp(四)MELAS綜合征
40歲以前開(kāi)始出現(xiàn)的復(fù)發(fā)性休克、肌病、共濟(jì)失調(diào)、肌陣攣、癡呆和耳聾。少數(shù)患者出現(xiàn)反復(fù)嘔吐、周期性的偏頭痛、糖尿病。進(jìn)行性眼外肌無(wú)力或麻痹使眼的水平運(yùn)動(dòng)受限,眼外肌麻痹,眼瞼下垂。肌無(wú)力,身材矮小等。
在MELAS患者中,異常的線粒體不能夠代謝丙酮酸,導(dǎo)致大量丙酮酸生成乳酸,而后者在血液和其他體液中累積。MELAS患者的特征性病理變化就是在腦和肌肉的小動(dòng)脈和毛細(xì)血管管壁中有大量的形態(tài)異常的聚集的線粒體。
超過(guò)80%的突變率發(fā)生在tRNAleu(UUR)基因上的A3243G突變。(五)鏈霉素耳毒性耳聾
1993年,Prezant等通過(guò)3個(gè)母系遺傳的氨基糖甙類(lèi)抗生素致聾(aminoglycosideantibioticsinduceddeafness,AAID)家系的研究,首次報(bào)道m(xù)tDNA編碼的12SrRNA基因1555位點(diǎn)A→G的突變。
另一個(gè)導(dǎo)致聽(tīng)力喪失的純質(zhì)性突變是7445位點(diǎn)T→G的突變
。
mtDNA結(jié)構(gòu)16569bpDEAF1555位點(diǎn)A→G
7445位點(diǎn)T→G氨基糖甙類(lèi)抗生素耳神經(jīng)毒性(六)KSS
常見(jiàn)臨床表現(xiàn)是進(jìn)行性眼外肌麻痹(PEO)和視網(wǎng)膜色素變性。還包括心肌電傳導(dǎo)異常,共濟(jì)失調(diào),耳聾,癡呆和糖尿病。發(fā)病年齡一般低于20歲,大多數(shù)患者在確診后幾年內(nèi)死亡。
KSS并不表現(xiàn)出特定的母系或核基因遺傳方式。然而癥狀表明是一種線粒體病。
KSS患者的線粒體分析表明有mtDNA結(jié)構(gòu)的改變,包括大片段缺失(>1000bp)和DNA復(fù)制。
mtDNA結(jié)構(gòu)16569bp第8648位
第13460位
(七)其他與線粒體有關(guān)的病變帕金森病(Parkinsondisease)腫瘤糖尿病冠心病衰老
巴金和陳景潤(rùn)都是帕金森病患者帕金森病患者腦和脊髓發(fā)生神經(jīng)元退性變性,丟失。一個(gè)母系遺傳的非綜合征耳聾家系衰
老
三、核DNA編碼的線粒體遺傳病
由核基因突變導(dǎo)致的線粒體功能損害比較少見(jiàn),但是目前這種缺陷的發(fā)生率在逐漸增加。nDNA改變引起的遺傳疾病主要表現(xiàn)為線粒體功能障礙,呈孟德?tīng)栠z傳方式。(一)線粒體蛋白輸入缺陷(二)底物運(yùn)輸缺陷(三)底物利用缺陷(四)鐵運(yùn)輸缺陷(五)電子傳遞鏈缺陷第六章
多基因遺傳病(diseaseofpolygenicinheritance)多基因病的定義與特點(diǎn)遺傳率的計(jì)算Falconer公式
Holgiger公式發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的評(píng)估
要點(diǎn)第一節(jié)
多基因遺傳的定義和特點(diǎn)
一種遺傳性狀或遺傳病受兩對(duì)或兩對(duì)以上基因的控制,每對(duì)基因彼此間沒(méi)有顯性和隱性的關(guān)系,每對(duì)基因?qū)Ρ硇偷男?yīng)都很小,但是各對(duì)基因的作用有積累效應(yīng),這種遺傳方式稱(chēng)為多基因遺傳(poly-genicinheritance)。
質(zhì)量性狀(qualitativetrait)
單基因遺傳的性狀或疾病的變異在一個(gè)群體中的分布是不連續(xù)的,可以明顯地將變異個(gè)體分為2~3群,2~3群個(gè)體間差異顯著。120cm165cmaaAA或Aa垂體性侏儒和正常人的身高0~5%45~50%100%
aaAaAAPKU患者、攜帶者和正常人PAH的活性
數(shù)量性狀(quantitativetrait)
多基因遺傳的性狀或疾病的變異在一個(gè)群體中的分布是連續(xù)的,不同個(gè)體之間的差異只有數(shù)量上的差異,沒(méi)有質(zhì)的不同。130140150160170180190200身高(cm)8070605040302010變異數(shù)數(shù)
量
性
狀親代
極高個(gè)體
極矮個(gè)體
AABBCCA’A’B’B’C’C’子1代
中等身高
AA’BB’CC’子2代總計(jì)0’1’2’3’4’5’6’16152015611.兩個(gè)極端變異(純種)的個(gè)體雜交2.兩個(gè)中間類(lèi)型的子1代個(gè)體之間雜交3.子一代隨機(jī)雜交后的群體20151566110’1’2’3’4’5’6’高矮第二節(jié)
多基因遺傳病一、易患性與閾值閾值(threshold)
低
高
易患性605040302010變異數(shù)平均值μ68.28%95.46%99.74%σ其估量的尺度以正態(tài)分布的標(biāo)準(zhǔn)差為單位,就是在正態(tài)分布中,以平均值為0,在±1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差(0)范圍內(nèi)的面積占曲線內(nèi)總面積的68%,以外的面積的占32%,兩邊各占16%。如此類(lèi)推,在±2個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差以?xún)?nèi)面積占總面積的95.4%,標(biāo)準(zhǔn)差以外的面積占4.6%,兩邊各占2.3%;在±3個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差時(shí),標(biāo)準(zhǔn)差以?xún)?nèi)面積占總面積的99.74%,以外面積占0.26%,兩邊各占0.13%。多基因病的易患性閾值與平均值距離越近,其群體易患性的平均值越高,閾值越低,則群體發(fā)病率也越高。反之,兩者距離越遠(yuǎn),其群體易患性平均值越低;閾值越高,則群體發(fā)病率越低。因此,可從群體發(fā)病率的高低計(jì)算出閾值與平均值之間的距離。下圖表示易患性閾值和平均值距離與發(fā)病率的關(guān)系。σμ均數(shù)標(biāo)準(zhǔn)差二、遺傳率(h2)
多基因病中,易患性的高低受遺傳基礎(chǔ)和環(huán)境因素的雙重影響,其中遺傳基礎(chǔ)所起作用的大小稱(chēng)為遺傳率(heritability)。一般用百分率(%)來(lái)表示。
遺傳率高:表明遺傳基礎(chǔ)在決定易患性變異和發(fā)病上起重要作用,環(huán)境因素的作用較小.
遺傳率低:表明在決定易患性變異和發(fā)病上,環(huán)境因素起重要作用,遺傳基礎(chǔ)的作用較小.1.從一般群體G和患者親屬R易患性的對(duì)比計(jì)算遺傳率2.從患者和對(duì)照組的一級(jí)親屬易患性的對(duì)比計(jì)算遺傳率h2=brb:患者親屬對(duì)患者的回歸系數(shù)r:親緣系數(shù)b=Xg—Xragb=Pc(Xc—Xr)acagXrTGR遺傳率(h2)——Falconer公式Xgar從一般群體和患者親屬易患性的對(duì)比計(jì)算遺傳率b=Xg—Xragb=3.090-1.8383.367=0.372h2=brh2=0.3721/2=0.744b=0.996(2.652-1.960)2.962=0.233h2=brh2=0.2331/2=0.466b=Pc(Xc—Xr)ac二、遺傳率(h2)——
Holgiger公式h2
=CMZ—CDZ100—CDZ根據(jù)遺傳率越高的疾病,MZ的發(fā)病一致率與DZ的發(fā)病一致率相差越大。發(fā)病一致率(concordance):指雙生子中一個(gè)患某種病,另一個(gè)也患同樣疾病的概念。三、多基因病的遺傳特點(diǎn)包括一些常見(jiàn)病和常見(jiàn)的畸形,發(fā)病率大多超過(guò)1/1000。發(fā)病有家族傾向。發(fā)病率有種族(或民族)差異近親婚配,子女發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增高,但不如AR顯著?;颊唠p親、同胞、子女親緣系數(shù)相同,發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相同。隨著親屬級(jí)別降低,發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)迅速下降。1、發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與遺傳率和群體發(fā)病率的關(guān)系相當(dāng)多的多基因病的群體發(fā)病率為0.1%~1%,遺傳率為70%~80%。這時(shí)可用Edward公式估計(jì)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),即f=
P,f為患者一級(jí)親屬發(fā)病率,P為群體發(fā)病率。四、多基因病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的估計(jì)0.10.20.40.60.81246810一般群體發(fā)病率(%)402010864210.80.60.40.2患者一級(jí)親屬發(fā)病率(%)10090807060504030201003、發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與患病人數(shù)的關(guān)系雙親患病數(shù)012群
體遺傳率患病同胞數(shù)患病同胞數(shù)患病同胞數(shù)發(fā)病率(%)01201201210017141124346365671.0801614818284147525014849151521261000.1411516266263640.1800.131041423606162500.113139711152、多基因病有家族聚集傾向
閾值♀♂先天性幽門(mén)狹窄4、發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與病情嚴(yán)重程度的關(guān)系5、發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與發(fā)病率的性別差異
C
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