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文檔簡介
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能第一章StructureandFunctionofProtein什麼是蛋白質(zhì)?蛋白質(zhì)(protein)是由許多氨基酸(aminoacids)通過肽鍵(peptidebond)相連形成的高分子含氮化合物。蛋白質(zhì)研究的歷史1833年,Payen和Persoz分離出澱粉酶。1838年,荷蘭科學(xué)家G.J.Mulder引入“protein”(源自希臘字proteios,意為primary)一詞
1864年,Hoppe-Seyler從血液分離出血紅蛋白,並將其製成結(jié)晶。19世紀(jì)末,F(xiàn)ischer證明蛋白質(zhì)是由氨基酸組成的,並將氨基酸合成了多種短肽。1951年,
Pauling採用X(射)線晶體衍射發(fā)現(xiàn)了蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)——α-螺旋(α-helix)。1953年,F(xiàn)rederickSanger完成胰島素一級(jí)序列測定。1962年,JohnKendrew和MaxPerutz確定了血紅蛋白的四級(jí)結(jié)構(gòu)。20世紀(jì)90年代以後,隨著人類基因組計(jì)畫實(shí)施,功能基因組與蛋白質(zhì)組計(jì)畫的展開,使蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的研究達(dá)到新的高峰。蛋白質(zhì)的分子組成
TheMolecularComponentofProtein第一節(jié)蛋白質(zhì)的生物學(xué)重要性分佈廣:所有器官、組織都含有蛋白質(zhì);細(xì)胞的各個(gè)部分都含有蛋白質(zhì)。含量高:蛋白質(zhì)是生物體中含量最豐富的生物大分子,約占人體固體成分的45%,而在細(xì)胞中可達(dá)細(xì)胞幹重的70%以上。1.蛋白質(zhì)是生物體重要組成成分作為生物催化劑(酶)代謝調(diào)節(jié)作用免疫保護(hù)作用物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和存儲(chǔ)運(yùn)動(dòng)與支持作用參與細(xì)胞間資訊傳遞2.蛋白質(zhì)具有重要的生物學(xué)功能3.氧化供能組成蛋白質(zhì)的元素主要有C、H、O、N和S。
有些蛋白質(zhì)含有少量磷或金屬元素鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬,個(gè)別蛋白質(zhì)還含有碘。
各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。由於體內(nèi)的含氮物質(zhì)以蛋白質(zhì)為主,因此,只要測定生物樣品中的含氮量,就可以根據(jù)以下公式推算出蛋白質(zhì)的大致含量:100克樣品中蛋白質(zhì)的含量(g%)=每克樣品含氮克數(shù)×6.25×1001/16%蛋白質(zhì)元素組成的特點(diǎn)一、組成人體蛋白質(zhì)的20種L-
-氨基酸
存在自然界中的氨基酸有300餘種,但組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸僅有20種,且均屬L-α-氨基酸(甘氨酸除外)。H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式RC+NH3COO-H
除了20種基本的氨基酸外,近年發(fā)現(xiàn)硒代半胱氨酸在某些情況下也可用於合成蛋白質(zhì)。硒代半胱氨酸從結(jié)構(gòu)上來看,硒原子替代了半胱氨酸分子中的硫原子。硒代半胱氨酸存在於少數(shù)天然蛋白質(zhì)中,包括過氧化物酶和電子傳遞鏈中的還原酶等。硒代半胱氨酸參與蛋白質(zhì)合成時(shí),並不是由目前已知的密碼子編碼,具體機(jī)制尚不完全清楚。體內(nèi)也存在若干不參與蛋白質(zhì)合成但具有重要生理作用的L-α-氨基酸,如參與合成尿素的鳥氨酸(ornithine)、瓜氨酸(citrulline)和精氨酸代琥珀酸(argininosuccinate)。非極性脂肪族氨基酸極性中性氨基酸芳香族氨基酸酸性氨基酸鹼性氨基酸二、氨基酸可根據(jù)側(cè)鏈結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)進(jìn)行分類(一)側(cè)鏈含烴鏈的氨基酸屬於非極性脂肪族氨基酸(二)側(cè)鏈有極性但不帶電荷的氨基酸是極性中性氨基酸甲硫氨酸(三)側(cè)鏈含芳香基團(tuán)的氨基酸是芳香族氨基酸(四)側(cè)鏈含負(fù)性解離基團(tuán)的氨基酸是酸性氨基酸(五)側(cè)鏈含正性解離基團(tuán)的氨基酸屬於鹼性氨基酸幾種特殊氨基酸
脯氨酸(亞氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2
半胱氨酸+胱氨酸二硫鍵-HH-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3在蛋白質(zhì)翻譯後的修飾過程中,脯氨酸和賴氨酸可分別被羥化為羥脯氨酸和羥賴氨酸。蛋白質(zhì)分子中20種氨基酸殘基的某些基團(tuán)還可被甲基化、甲醯化、乙醯化、異戊二烯化和磷酸化等。這些翻譯後修飾,可改變蛋白質(zhì)的溶解度、穩(wěn)定性、亞細(xì)胞定位和與其他細(xì)胞蛋白質(zhì)相互作用的性質(zhì)等,體現(xiàn)了蛋白質(zhì)生物多樣性的一個(gè)方面。三、20種氨基酸具有共同或特異的理化性質(zhì)兩性解離及等電點(diǎn)氨基酸是兩性電解質(zhì),其解離程度取決於所處溶液的酸鹼度。等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)
在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,成為兼性離子,呈電中性。此時(shí)溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。(一)氨基酸具有兩性解離的性質(zhì)pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性離子陽離子陰離子(二)含共軛雙鍵的氨基酸具有紫外吸收性質(zhì)色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm
附近。大多數(shù)蛋白質(zhì)含有這兩種氨基酸殘基,所以測定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收(三)氨基酸與茚三酮反應(yīng)生成藍(lán)紫色化合物氨基酸與茚三酮水合物共熱,可生成藍(lán)紫色化合物,其最大吸收峰在570nm處。由於此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比關(guān)係,因此可作為氨基酸定量分析方法。四、氨基酸通過肽鍵連接而形成蛋白質(zhì)或活性肽肽鍵(peptidebond)是由一個(gè)氨基酸的
-羧基與另一個(gè)氨基酸的
-氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵。(一)氨基酸通過肽鍵連接而形成肽+-HOH甘氨醯甘氨酸肽鍵肽(peptide)是由氨基酸通過肽鍵縮合而形成的化合物。兩分子氨基酸縮合形成二肽,三分子氨基酸縮合則形成三肽……肽鏈中的氨基酸分子因?yàn)槊撍s合而基團(tuán)不全,被稱為氨基酸殘基(residue)。由十個(gè)以內(nèi)氨基酸相連而成的肽稱為寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相連形成的肽稱多肽(polypeptide)。N末端:多肽鏈中有游離α-氨基的一端C末端:多肽鏈中有游離α-羧基的一端多肽鏈有兩端:多肽鏈(polypeptidechain)是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。N末端C末端牛核糖核酸酶
蛋白質(zhì)是由許多氨基酸殘基組成、折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)、並具有特定生物學(xué)功能的多肽。一般而論,蛋白質(zhì)的氨基酸殘基數(shù)通常在50個(gè)以上,50個(gè)氨基酸殘基以下則仍稱為多肽。(二)體內(nèi)存在多種重要的生物活性肽1.穀胱甘肽(glutathione,GSH)GSH過氧化物酶H2O22GSH2H2OGSSG
GSH還原酶NADPH+H+NADP+GSH與GSSG間的轉(zhuǎn)換
體內(nèi)許多激素屬寡肽或多肽
神經(jīng)肽(neuropeptide)2.多肽類激素及神經(jīng)肽蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)
TheMolecularStructureofProtein
第二節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括:
高級(jí)結(jié)構(gòu)一級(jí)結(jié)構(gòu)(primarystructure)二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondarystructure)三級(jí)結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)定義:蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)指在蛋白質(zhì)分子從N-端至C-端的氨基酸排列順序。一、氨基酸的排列順序決定蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)主要的化學(xué)鍵:肽鍵,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ),但不是決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的唯一因素。目前已知一級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)量已相當(dāng)可觀,並且還以更快的速度增加。國際互聯(lián)網(wǎng)有若干重要的蛋白質(zhì)資料庫,例如EMBL(EuropeanMolecularBiologyLaboratoryDataLibrary)Genbank(GeneticSequenceDatabank)PIR(ProteinIdentificationResourceSequenceDatabase)收集了大量最新的蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)及其他資料,為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的深入研究提供了便利。二、多肽鏈的局部主鏈構(gòu)象為蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,並不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象
。定義:
主要的化學(xué)鍵:氫鍵
-螺旋(
-helix)
-折疊(
-pleatedsheet)
-轉(zhuǎn)角(
-turn)
無規(guī)捲曲(randomcoil)
蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)所謂肽鏈主鏈骨架原子即N(氨基氮)、Cα(α-碳原子)和Co(羰基碳)3個(gè)原子依次重複排列。
(一)參與肽鍵形成的6個(gè)原子在同一平面上參與肽鍵的6個(gè)原子C
1、C、O、N、H、C
2位於同一平面,C
1和C
2在平面上所處的位置為反式(trans)構(gòu)型,此同一平面上的6個(gè)原子構(gòu)成了所謂的肽單元
(peptideunit)
。
-螺旋(
-helix)
-折疊(
-pleatedsheet)
-轉(zhuǎn)角(
-turn)
無規(guī)捲曲(randomcoil)
(二)α-螺旋結(jié)構(gòu)是常見的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)(二)α-螺旋結(jié)構(gòu)是常見的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)(三)
-折疊使多肽鏈形成片層結(jié)構(gòu)(四)
-轉(zhuǎn)角和無規(guī)捲曲在蛋白質(zhì)分子中普遍存在
-轉(zhuǎn)角無規(guī)捲曲是用來闡述沒有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。(五)二級(jí)結(jié)構(gòu)可組成蛋白質(zhì)分子中的模體在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)有規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合,被稱為超二級(jí)結(jié)構(gòu)。二級(jí)結(jié)構(gòu)組合形式有3種:αα,βαβ,ββ。二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象,稱為模體(motif)
。模體是具有特殊功能的超二級(jí)結(jié)構(gòu)。鈣結(jié)合蛋白中結(jié)合鈣離子的模體鋅指結(jié)構(gòu)α-螺旋-β轉(zhuǎn)角(或環(huán))-α-螺旋模體鏈-β轉(zhuǎn)角-鏈模體鏈-β轉(zhuǎn)角-α-螺旋-β轉(zhuǎn)角-鏈模體模體常見的形式(六)氨基酸殘基的側(cè)鏈影響二級(jí)結(jié)構(gòu)的形成蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)是以一級(jí)結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的。一段肽鏈其氨基酸殘基的側(cè)鏈適合形成
-螺旋或β-折疊,它就會(huì)出現(xiàn)相應(yīng)的二級(jí)結(jié)構(gòu)。三、多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)一步折疊形成三級(jí)結(jié)構(gòu)疏水鍵、離子鍵、氫鍵和範(fàn)德華力等。主要的化學(xué)鍵:整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。定義:(一)三級(jí)結(jié)構(gòu)是指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置
肌紅蛋白(Mb)N端C端(二)結(jié)構(gòu)域是三級(jí)結(jié)構(gòu)層次上的獨(dú)立功能區(qū)分子量較大的蛋白質(zhì)??烧郫B成多個(gè)結(jié)構(gòu)較為緊密且穩(wěn)定的區(qū)域,並各行其功能,稱為結(jié)構(gòu)域(domain)。大多數(shù)結(jié)構(gòu)域含有序列上連續(xù)的100至200個(gè)氨基酸殘基,若用限制性蛋白酶水解,含多個(gè)結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)常分解出獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域,而各結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象可以基本不改變,並保持其功能。超二級(jí)結(jié)構(gòu)則不具備這種特點(diǎn)。因此,結(jié)構(gòu)域也可看作是球狀蛋白質(zhì)的獨(dú)立折疊單位,有較為獨(dú)立的三維空間結(jié)構(gòu)。3-磷酸甘油醛脫氫酶亞基的結(jié)構(gòu)示意圖(三)蛋白質(zhì)的多肽鏈須折疊成正確的空間構(gòu)象分子伴侶(chaperon)通過提供一個(gè)保護(hù)環(huán)境從而加速蛋白質(zhì)折疊成天然構(gòu)象或形成四級(jí)結(jié)構(gòu)。分子伴侶可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨後鬆開,如此重複進(jìn)行可防止錯(cuò)誤的聚集發(fā)生,使肽鏈正確折疊。分子伴侶也可與錯(cuò)誤聚集的肽段結(jié)合,使之解聚後,再誘導(dǎo)其正確折疊。分子伴侶在蛋白質(zhì)分子折疊過程中二硫鍵的正確形成起了重要的作用。亞基之間的結(jié)合主要是氫鍵和離子鍵。四、含有二條以上多肽鏈的蛋白質(zhì)具有四級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的佈局和相互作用,稱為蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。許多功能性蛋白質(zhì)分子含有2條或2條以上多肽鏈。每一條多肽鏈都有完整的三級(jí)結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的亞基(subunit)。由2個(gè)亞基組成的蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)中,若亞基分子結(jié)構(gòu)相同,稱之為同二聚體(homodimer),若亞基分子結(jié)構(gòu)不同,則稱之為異二聚體(heterodimer)。血紅蛋白的四級(jí)結(jié)構(gòu)五、蛋白質(zhì)的分類根據(jù)蛋白質(zhì)組成成分:單純蛋白質(zhì)結(jié)合蛋白質(zhì)=蛋白質(zhì)部分+非蛋白質(zhì)部分根據(jù)蛋白質(zhì)形狀:纖維狀蛋白質(zhì)球狀蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)家族(proteinfamily)
:氨基酸序列相似而且空間結(jié)構(gòu)與功能也十分相近的蛋白質(zhì)。屬於同一蛋白質(zhì)家族的成員,稱為同源蛋白質(zhì)(homologousprotein)。
蛋白質(zhì)超家族(superfamily)
:2個(gè)或2個(gè)以上的蛋白質(zhì)家族之間,其氨基酸序列的相似性並不高,但含有發(fā)揮相似作用的同一模體結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)係TheRelationofStructureandFunctionofProtein第三節(jié)(一)一級(jí)結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)是高級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的基礎(chǔ)牛核糖核酸酶的一級(jí)結(jié)構(gòu)二硫鍵
天然狀態(tài),有催化活性
尿素、β-巰基乙醇
去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無活性(二)一級(jí)結(jié)構(gòu)相似的蛋白質(zhì)具有相似的高級(jí)結(jié)構(gòu)與功能一級(jí)結(jié)構(gòu)相似的多肽或蛋白質(zhì),其空間構(gòu)象以及功能也相似。────────────────────────
氨基酸殘基序號(hào)胰島素───────────────
A5A6A10A30────────────────────────
人ThrSerIleThr
豬ThrSerIleAla
狗ThrSerIleAla
兔ThrGlyIleSer
牛AlaGlyValAla
羊AlaSerValAla
馬ThrSerIleAla────────────────────────(三)氨基酸序列提供重要的生物進(jìn)化資訊一些廣泛存在於生物界的蛋白質(zhì)如細(xì)胞色素(cytochromeC),比較它們的一級(jí)結(jié)構(gòu),可以幫助瞭解物種進(jìn)化間的關(guān)係。(四)重要蛋白質(zhì)的氨基酸序列改變可引起疾病例:鐮刀形紅細(xì)胞貧血N-val·his·leu·thr·pro·glu
·glu·····C(146)HbSβ肽鏈HbAβ肽鏈N-val·his·leu·thr·pro·val·glu·····C(146)
這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病,稱為“分子病”。肌紅蛋白/血紅蛋白含有血紅素輔基血紅素結(jié)構(gòu)二、蛋白質(zhì)的功能依賴特定空間結(jié)構(gòu)(一)血紅蛋白亞基與肌紅蛋白結(jié)構(gòu)相似肌紅蛋白(myoglobin,Mb)
肌紅蛋白是一個(gè)只有三級(jí)結(jié)構(gòu)的單鏈蛋白質(zhì),有8段α-螺旋結(jié)構(gòu)。血紅素分子中的兩個(gè)丙酸側(cè)鏈以離子鍵形式與肽鏈中的兩個(gè)鹼性氨基酸側(cè)鏈上的正電荷相連,加之肽鏈中的F8組氨酸殘基還與Fe2+形成配位結(jié)合,所以血紅素輔基與蛋白質(zhì)部分穩(wěn)定結(jié)合。血紅蛋白(hemoglobin,Hb)血紅蛋白具有4個(gè)亞基組成的四級(jí)結(jié)構(gòu),每個(gè)亞基可結(jié)合1個(gè)血紅素並攜帶1分子氧。Hb亞基之間通過8對鹽鍵,使4個(gè)亞基緊密結(jié)合而形成親水的球狀蛋白。去氧Hb亞基間和亞基內(nèi)的鹽鍵Hb與Mb一樣能可逆地與O2結(jié)合,Hb與O2結(jié)合後稱為氧合Hb。氧合Hb占總Hb的百分?jǐn)?shù)(稱百分飽和度)隨O2濃度變化而改變。(二)血紅蛋白亞基構(gòu)象變化可影響亞基與氧結(jié)合肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白(Hb)的氧解離曲線協(xié)同效應(yīng)(cooperativity)一個(gè)寡聚體蛋白質(zhì)的一個(gè)亞基與其配體結(jié)合後,能影響此寡聚體中另一個(gè)亞基與配體結(jié)合能力的現(xiàn)象,稱為協(xié)同效應(yīng)。如果是促進(jìn)作用則稱為正協(xié)同效應(yīng)(positivecooperativity)如果是抑制作用則稱為負(fù)協(xié)同效應(yīng)(negativecooperativity)血紅素與氧結(jié)合後,鐵原子半徑變小,就能進(jìn)入卟啉環(huán)的小孔中,繼而引起肽鏈位置的變動(dòng)。別構(gòu)效應(yīng)(allostericeffect)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變伴隨其功能的變化,稱為別構(gòu)效應(yīng)。(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象改變可引起疾病蛋白質(zhì)構(gòu)象疾病:若蛋白質(zhì)的折疊發(fā)生錯(cuò)誤,儘管其一級(jí)結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致疾病發(fā)生。蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導(dǎo)致疾病的機(jī)理:有些蛋白質(zhì)錯(cuò)誤折疊後相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的澱粉樣纖維沉澱,產(chǎn)生毒性而致病,表現(xiàn)為蛋白質(zhì)澱粉樣纖維沉澱的病理改變。這類疾病包括:人紋狀體脊髓變性病、老年癡呆癥、亨停頓舞蹈病、瘋牛病等。瘋牛病是由朊病毒蛋白(prionprotein,PrP)引起的一組人和動(dòng)物神經(jīng)退行性病變。正常的PrP富含α-螺旋,稱為PrPc。PrPc在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全為β-折疊的PrPsc,從而致病。瘋牛病中的蛋白質(zhì)構(gòu)象改變第四節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)ThePhysicalandChemicalCharactersofProtein一、蛋白質(zhì)具有兩性電離的性質(zhì)蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團(tuán),在一定的溶液pH條件下都可解離成帶負(fù)電荷或正電荷的基團(tuán)。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處於某一pH時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢相等,即成為兼性離子,淨(jìng)電荷為零,此時(shí)溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)二、蛋白質(zhì)具有膠體性質(zhì)蛋白質(zhì)屬於生物大分子之一,分子量可自1萬至100萬之巨,其分子的直徑可達(dá)1~100nm,為膠粒範(fàn)圍之內(nèi)。顆粒表面電荷水化膜蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素:+++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)水化膜++++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)顆粒酸堿酸堿酸堿脫水作用脫水作用脫水作用溶液中蛋白質(zhì)的聚沉三、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)破壞而引起變性在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生物活性的喪失。蛋白質(zhì)的變性(denaturation)造成變性的因素:如加熱、乙醇等有機(jī)溶劑、強(qiáng)酸、強(qiáng)鹼、重金屬離子及生物鹼試劑等。
變性的本質(zhì):——破壞非共價(jià)鍵和二硫鍵,不改變蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。
應(yīng)用舉例:臨床醫(yī)學(xué)上,變性因素常被應(yīng)用來消毒及滅菌。此外,防止蛋白質(zhì)變性也是有效保存蛋白質(zhì)製劑(如疫苗等)的必要條件。
若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素後,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱為複性(renaturation)。
天然狀態(tài),有催化活性
尿素、β-巰基乙醇
去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無活性在一定條件下,蛋白疏水側(cè)鏈暴露在外,肽鏈融會(huì)相互纏繞繼而聚集,因而從溶液中析出。變性的蛋白質(zhì)易於沉澱,有時(shí)蛋白質(zhì)發(fā)生沉澱,但並不變性。蛋白質(zhì)變性後的絮狀物加熱可變成比較堅(jiān)固的凝塊,此凝塊不易再溶於強(qiáng)酸和強(qiáng)鹼中。
蛋白質(zhì)沉澱蛋白質(zhì)的凝固作用(proteincoagulation)四、蛋白質(zhì)在紫外光譜區(qū)有特徵性吸收峰由於蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm波長處有特徵性吸收峰。蛋白質(zhì)的A280與其濃度呈正比關(guān)係,因此可作蛋白質(zhì)定量測定。蛋白質(zhì)經(jīng)水解後產(chǎn)生的氨基酸也可發(fā)生茚三酮反應(yīng)。蛋白質(zhì)和多肽分子中肽鍵在稀堿溶液中與硫酸銅共熱,呈現(xiàn)紫色或紅色,此反應(yīng)稱為雙縮脲反應(yīng),雙縮脲反應(yīng)可用來檢測蛋白質(zhì)水解程度。五、應(yīng)用蛋白質(zhì)呈色反應(yīng)可測定蛋白質(zhì)溶液含量茚三酮反應(yīng)(ninhydrinreaction)雙縮脲反應(yīng)(biuretreaction)第五節(jié)蛋白質(zhì)的分離純化與結(jié)構(gòu)分析TheSeparationandPurificationandStructureAnalysisofProtein一、透析及超濾法可去除蛋白質(zhì)溶液中的小分子化合物應(yīng)用正壓或離心力使蛋白質(zhì)溶液透過有一定截留分子量的超濾膜,達(dá)到濃縮蛋白質(zhì)溶液的目的。透析(dialysis)超濾法利用透析袋把大分子蛋白質(zhì)與小分子化合物分開的方法。二、丙酮沉澱、鹽析及免疫沉澱是常用的蛋白質(zhì)濃縮方法使用丙酮沉澱時(shí),必須在0~4℃低溫下進(jìn)行,丙酮用量一般10倍於蛋白質(zhì)溶液體積。蛋白質(zhì)被丙酮沉澱後,應(yīng)立即分離。除了丙酮以外,也可用乙醇沉澱。鹽析(saltprecipitation)是將硫酸銨、硫酸鈉或氯化鈉等加入蛋白質(zhì)溶液,使蛋白質(zhì)表面電荷被中和以及水化膜被破壞,導(dǎo)致蛋白質(zhì)沉澱。免疫沉澱法:將某一純化蛋白質(zhì)免疫動(dòng)物可獲得抗該蛋白的特異抗體。利用特異抗體識(shí)別相應(yīng)的抗原蛋白,並形成抗原抗體複合物的性質(zhì),可從蛋白質(zhì)混合溶液中分離獲得抗原蛋白。三、利用荷電性質(zhì)可電泳分離蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)在高於或低於其pI的溶液中為帶電的顆粒,在電場中能向正極或負(fù)極移動(dòng)。這種通過蛋白質(zhì)在電場中泳動(dòng)而達(dá)到分離各種蛋白質(zhì)的技術(shù),稱為電泳(elctrophoresis)
。根據(jù)支撐物的不同,可分為薄膜電泳、凝膠電泳等。
SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳,常用於蛋白質(zhì)分子量的測定。等電聚焦電泳,通過蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的差異而分離蛋白質(zhì)的電泳方法。雙向凝膠電泳是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù)。幾種重要的蛋白質(zhì)電泳:四、應(yīng)用相分配或親和原理可將蛋白質(zhì)進(jìn)行層析分離待分離蛋白質(zhì)溶液(流動(dòng)相)經(jīng)過一個(gè)固態(tài)物質(zhì)(固定相)時(shí),根據(jù)溶液中待分離的蛋白質(zhì)顆粒大小
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