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文檔簡介
第二章
蛋白質(zhì)Proteins本章主要內(nèi)容一.蛋白質(zhì)概述二.氨基酸
(重點)三.多肽(重點)四.蛋白質(zhì)的結構(重點)五.蛋白質(zhì)結構與功能(重點)六.蛋白質(zhì)的性質(zhì)(重點)七.蛋白質(zhì)的分離純化與鑒定(重點)一、Introduction
for
Proteins構成生物體最基本的結構物質(zhì)和功能物質(zhì)。一切生命過程,都離不開蛋白質(zhì)的參與。Protein來自希臘文“Proteios”---
“首要地位”---
1838年,荷蘭化學家G.
J.
Mulder1、蛋白質(zhì)研究史上的重大事件1890年,結晶出第一個蛋白質(zhì),
egg
albumin
(Hofmeister)1902年,蛋白質(zhì)是多肽鏈(Hofmeister,
Fischer)1、蛋白質(zhì)研究史上的重大事件1952年,蛋白質(zhì)的α-helix模型(Pauling)1、蛋白質(zhì)研究史上的重大事件1953年,胰島素的一級結構(Sanger)1、蛋白質(zhì)研究史上的重大事件1960年前后,蛋白質(zhì)第一個三維結構,sperm
whale
(抹香鯨)myoglobin(Kendrew)1962
Nobel
Prize1、蛋白質(zhì)研究史上的重大事件1960年前后,hemoglobin(Perutz)1962
NobelPrize2、蛋白質(zhì)的主要功能
a.
構成生命體,特別是動物體的基本結構材料
(structural
proteins)
b.
催化活性
---
酶(enzyme)
c.
物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(transport
proteins)
d.
協(xié)調(diào)運動,調(diào)節(jié)機體活動(motile
and
regulatory
proteins)
e.
營養(yǎng)物(nutrient
proteins)f.免疫保護(defense
proteins)g.
支架(adapter
proteins)h.
控制生長和分化(control
proteins)3、蛋白質(zhì)的化學組成(1)
元素組成
都含有C、H、O、N
其他主要是S、P、Fe、Cu、Zn、
Mg
和I等。元
素百
分
含
量
平
均(%)CH
50~556.9~7.752
7ONSP
21~2415.0~17.6
0.3~2.3
0.4~0.9
23
16
20.6?(2)
蛋白質(zhì)含量計算蛋白質(zhì)占生物組織中所有含氮物質(zhì)的絕大部分。因此,可以將生物組織的含氮量近似地看作蛋白質(zhì)的含氮量。蛋白質(zhì)粗略含量的計算公式:3、蛋白質(zhì)的化學組成蛋白質(zhì)含量(克%)
=每克生物樣品中含氮的克數(shù)
×
6.25
×
100完全水解:
各種氨基酸的混合物?;景被?/p>
(standard
amino
acids)
:大多數(shù)的蛋白質(zhì)都是由20
種氨基酸組成,它們被稱作基本氨基酸。(3)
氨基酸是蛋白質(zhì)的基本結構單元3、蛋白質(zhì)的化學組成?二、Amino
Acids什么是氨基酸?什么又是α-氨基酸?組成肽和蛋白質(zhì)的結構單元分子---
α-
amino
Acid二、Amino
Acids1.
ConfigurationWhen
R
≠
H,
α-C
is
a
chiral
carbon,
there
aretwo
stereoisomers
(D
and
L-
α-
amino
acid)The
amino
acids
in
natural
proteins
are
the
L-α
-
amino
acids.Side
chainH3N+H3NCOO-H+H3NCOO-H+H3NCOO-H+H+H3NH
HGlycine
(Gly,
G)
甘氨酸
COO-
CH3Alanine
(Ala,
A)
丙氨酸
COO-
CH2
CH(CH3)2Leucine
(Leu,
L)
亮氨酸
CH(CH3)
CH2CH3Isoleucine
(Ile,
I)
異亮氨酸+H3N
CH(CH3)2Valine
(Val,
V)
纈氨酸
COO-H
CH2
CH2SCH3Methionine
(Met,
M)
甲硫氨酸(蛋氨酸)
2.
20
standard
amino
acids(1)
Nonpolar
side
chain
(9
members)H3NH2N
2.
20
standard
amino
acids(1)
Nonpolar
side
chain
(9)COO-
+Proline
(Pro,
P)
脯氨酸+H3NCOO-
HCH2+COO-
HCH2
N
HTryptophan
(Try,
W)
色氨酸?
Phenylalanine
(Phe,
F)
苯丙氨酸(2)
Uncharged
polar
side
chain
(6)?(3)
Charged
polar
side
chain
(5)+H3NCOO-
H+H3NCOO-
H+H3N
CH2
COO-Aspartate
(Asp,
D)
門冬氨酸
COO-H+H3N
CH2
CH2
COO-Glutamate(Glu,
E)
谷氨酸
COO-H+H3NH
H2Cimidazole
NH
HN
Histidine
(His,
H)
組氨酸
CH2
4
NH3+Lysine
(Lys,
K)
賴氨酸
CH2
3
NH2guanidino
C
NH2+
NH2
Arginine
(Arg,
R)
精氨酸Acidic
amino
acidsBasic
amino
acids
COO-3.
Essential
amino
acidsThe
amino
acids
that
must
obtain
fromour
diets
because
we
either
cannotsynthesize
them
at
all
or
cannotsynthesize
them
in
adequate
amounts.10
essential
amino
acids:Val,
Leu,
Ile,
Thr,
Met,
Lys,
Arg,
Phe,
His,Trp二、Amino
Acids4.
Nonstandard
Amino
AcidsMore
than
200
different
amino
acids
arefound
in
living
organisms.(1)
amino
acid
derivatives
in
proteins
---
Unusual
amino
acids
in
proteins
---
In
almost
cases,
they
result
fromposttranslationalmodifications---
Modification:
hydroxylation,
methylation,
acetylation,
carboxylation,
phosphorylation二、Amino
AcidsSome
modified
amino
acids
in
proteins4.
Nonstandard
Amino
Acids(2)
D-amino
acid非蛋白氨基酸Components
of
relatively
short
(<20
residues)bacterial
polypeptides(細菌多肽).Important
constituents
of
bacterial
cell
wallsCompoments
of
many
bacterially
produced
peptideantibiotics(抗生素)4.
Nonstandard
Amino
Acids(3)
Biologically
active
amino
acids非蛋白氨基酸Transport
nitrogen,
such
as
Orn
(鳥氨酸),Cit
(瓜氨酸)
in
the
biosynthesis
of
ureaβ-alanine
as
a
component
of
pantothenicacid
(泛酸)Chemical
messengers
(化學信使)A
glutamine(谷氨酸)
decarboxylation(脫羧)
product重要的抑制性神經(jīng)遞質(zhì)。Neurotransmitters
(神經(jīng)遞質(zhì))---
substances
released
by
nerve
cells
toalter
the
behavior
of
their
neighbors.Example
1A
tyrosine
(酪氨酸)
derivative重要的興奮性神經(jīng)遞質(zhì)。傳遞亢奮和歡愉信息,與情欲、開心、上癮等有關。Arvid
Carlsson,確定多巴胺的作用,獲2000年諾貝爾醫(yī)學獎。Example
2Tyrosine
derivativeAn
iodine-containing
thyroid(甲狀腺)hormone
that
generally
stimulates
vertebrate(脊椎動物)
metabolismExample
321st
and
22nd
amino
acids全程導師組學習活動課后思考題(交一頁紙陳述)這兩個氨基酸是如何發(fā)現(xiàn)的?屬于基本氨基酸嗎?請陳述理由。下次課(9月28)選3組派代表用PPT陳述3-5分鐘。(1)
optical
activity5.
Properties
of
Amino
Acids二、Amino
Acids除
Glycine(R
=
H)外,氨基酸均含有一個手性α-碳原子,因此都具有旋光性。比旋光度
([α])
:氨基酸重要物理常數(shù)之一,是鑒別各種氨基酸的重要依據(jù)。(見教材p46,
表3.3)UV
特征吸收:λmax
=
260-280
nm+H3NCOO-
H+H3NCOO-
H+H3NCOO-
H
CH2Phenylalanine
(Phe,
F)
苯丙氨酸
CH2
N
HTryptophan
(Try,
W)
色氨酸
CH2
OHTyrosine
(Tyr,
Y)
酪氨酸
5.
Properties
of
Amino
Acids(2)
UV
absorption(2)
UV
absorptionTyr:
λmax=275
nmε275=
1.4x103Phe:
λmax=257
nmε257=
2.0x102Trp:
λmax=280
nmε280=
5.6x103存在形式?
or
√氨基酸在結晶狀態(tài)或在接近中性的溶液中,是以兩性離子
(dipolar
ion
or
zwitterion)的形式存在。是一種內(nèi)鹽
(inner
salt)。Act
as
an
base
(proton
acceptor)
NH3+R
C
COO-H
NH2R
C
COO-H+H+-
NH3+R
C
COOH
NH3+R
C
COOHH+H+Amino
acids
are
ampholytes
(兩性電解質(zhì))(3)
Acid-Base
Properties
氨基酸既是酸又是堿
Act
as
an
acid
(proton
donor)(4)
Isoelectric
Point如果在某一
pH
值下,氨基酸所帶正電荷的數(shù)目與負電荷的數(shù)目正好相等,即凈電荷為零,則稱該
pH
值為該氨基酸的等電點
(pI)。a.
等電點時,幾乎全部以兩性離子
I
的形式存在,
并伴以極少量、嚴格相等的
II
和
III。b.
處于等電點的氨基酸,其溶解度最小。c.
PI
與解離常數(shù)
pK間的關系
Neutral
amino
acids:
pI
=
(pK1
+
pK2)/2Acidic
amino
acids
:
pI
=
(pK1
+
pKRCOOH)/2Basic
amino
acids
:
pI
=
(pK2
+
pKRNH2)/2(4)
Isoelectric
PointTitration
Curve
and
pICalculation
of
pI
(1)Calculation
of
pI
(2)Calculation
of
pI
(3)思考:為什么α-氨基酸中羧基的酸性比
醋酸的酸性強100倍以上?1.
誘導效應2.
場效應6.
Chemical
Reactions二、Amino
Acids自學(參看教材p49-58)(1)
α-氨基參與的反應(2)
α-羧基參與的反應(3)
α-氨基和羧基共同參與的反應要求了解1、各反應的原理及其用途2、生物體系中的有關反應過程6.
Chemical
Reactions二、Amino
Acids(4)
側(cè)鏈基團的化學性質(zhì)a.
Sulfhydryl(-SH,
教材p54
-
56)---
弱酸性(pKa
=
10.28)---
親核性---
絡合性---
還原性CHCOO-H3NCH2S--+
ICH2COO弱堿性CHCOO-H3NCH2SCH2COO-I-CHCH2H3NS-COO-CHCOO-CH2H3NS
HgCOO-COO-
+
Cl
HgCl-氧化-NH3OOC
CH
CH2CH2NH3CH
COO-二硫鍵CH2H3NSHCHCOO-CH2SHCH
COO-
+
H3NSS半胱氨酸半胱氨酸胱氨酸親核性絡合性還原性還原性(Cys分析測定)(4)
側(cè)鏈基團的化學性質(zhì)
b.
Imidazole
group(咪唑基,教材p56)
---
酸堿性(重要特性)
---
磷?;?--
烷基化?Acid-base
properties
of
imidazole
group222
+
3
-323
活化酶使酶失活磷?;榛?4)
側(cè)鏈基團的化學性質(zhì)c.Methylthioethergroup
(-SCH3,
教材p57)---
親核性應用:蛋白標記(4)
側(cè)鏈基團的化學性質(zhì)d.hydroxylgroup
(-OH,
教材p56)---
Ser
and
Thr---
form
hydrogen
bond
with
other
groups---
form
ester
with
acids,
such
asphosphate
in
casein
(酪蛋白)---
acylating
reagent
(?;瘎゛sinactivator
(失活劑)of
enzymeInactivation
of
Enzyme強堿性?(4)
側(cè)鏈基團的化學性質(zhì)
e.guanidinogroup
(胍基,教材p57)e.guanidinogroup
(胍基)應用:氨基酸順序分析(4)
側(cè)鏈基團的化學性質(zhì)f.Aromaticgroup
(芳基,教材p57-58)Pauly顯色反應與重氮鹽發(fā)生顏色反應protein二、Amino
Acids
7.
Preparation
of
amino
acids
1.
蛋白質(zhì)水解法pure
amino
acids6
N
HClmixture
of
amino
acids
seperation2.
微生物發(fā)酵法3.
人工合成法b.
α-鹵代酸的氨化c.
Gabriel-丙二酸酯合成法d.
Strecker合成法二、Amino
Acids
8.
Chemical
Synthesis
(1)
經(jīng)典化學合成法及拆分
(自學,教材p58~61)
a.
還原氨化法
消旋產(chǎn)物化學或酶法拆分8.
Chemical
Synthesis二、Amino
Acids(2)
氨基酸的不對稱合成(了解原理,教材p61~62)a.
應用不對稱前體(asymmetric
precursor)合成法的原理b.
應用不對稱催化劑(asymmetric
catalyst)合成法的原理9.
Separation
and
analysis二、Amino
Acids(1)
Paper
chromatography---
濾紙為支持物---
濾紙吸附的水為固定相---
水飽和的有機溶劑為流動相---
分離原理:不同氨基酸在水和有機溶劑中的溶解度不同。---
鑒定:茚三酮顯色,與氨基酸標樣對照。---
二維層析:分離效果更佳紙層析一次展層二次展層二、Amino
Acids
9.
Separation
and
analysis
(2)
Paper
electrophoresis
---
分離原理:不同氨基酸在一定pH值下,所
帶的凈電荷不同,在電場中移動情況不同。
---
示意圖(下一頁)ΔP
=
pI
-
pHΔP為正,帶正電荷ΔP為負,帶負電荷紙電泳
(Paper
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