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5基因克隆的酶學(xué)基礎(chǔ)(1)核酸內(nèi)切限制酶(restrictionendonucleases)1)寄主控制的限制(restriction)與修飾現(xiàn)象(modification)2)核酸內(nèi)切限制酶的類型(I型、II型、III型)
3)核酸內(nèi)切限制酶的基本特性同裂酶(isoschizomers)
同尾酶(isocaudamer)4)核酸內(nèi)切限制酶的命名法大腸桿菌(Escherichiacoli)縮寫為Eco
流感噬血菌(Haemophilusinfluenzae)縮寫為Hin5)影響核酸內(nèi)切限制酶活性的因素
a.DNA的純度,b.DNA的甲基化程度,c.反應(yīng)溫度,
d.DNA的分子結(jié)構(gòu),e.核酸內(nèi)切限制酶的緩沖液6)核酸內(nèi)切限制酶對(duì)DNA的消化作用
a.結(jié)合模式,b.局部消化,c.消化作用
核酸內(nèi)切限制酶EcoRI及修飾的甲基化酶MEcoRI的限制與修飾作用核酸內(nèi)切限制酶HindIII對(duì)雙鏈DNA分子的切割作用具有粘性末端的DNA片段結(jié)合方式堿性磷酸酶的脫磷酸作用阻止線性的質(zhì)粒DNA分子再環(huán)化(2)DNA連接酶(Ligase)1)粘性末端DNA片段的連接2)平末端DNA片段的連接
a.同聚物加尾法(homopolymertail-joining)b.銜接物連接法(linker)c.DNA接頭連接法(adapter)3)熱穩(wěn)定的DNA連接酶(thermostableDNAligase)a.寡核苷酸連接測(cè)定法(oligonucleotideligationassay)b.連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(ligasechainreaction,LCR)或連接擴(kuò)增反應(yīng)(ligationamplificationreaction)a)裂口連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
LCR探針(LCRprobe)b)不對(duì)稱裂口連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(AG—LCR)
應(yīng)用互補(bǔ)的同聚物加尾法連接DNA片段用銜接物分子連接平末端的DNA片段雙銜接物連接法的基本程序具異常的5’-OH粘性末端結(jié)構(gòu)的BamHI接頭的連接機(jī)理寡核苷酸連接測(cè)定原理DNA連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(LCR)原理不對(duì)稱裂口DNA連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(AG-LCR)的分子機(jī)里(3)DNA聚合酶(DNApolymerase)
1)DNA聚合酶Ia.DNA缺口轉(zhuǎn)移(nicktranslation)b.DNA雜交探針的制備2)大腸桿菌DNA聚合酶I的Klenow片段與DNA末端標(biāo)記3)T4DNA聚合酶取代合成法標(biāo)記DNA片段4)依賴RNA的DNA聚合酶與互補(bǔ)DNA的合成5)T7DNA聚合酶6)修飾的T7DNA聚合酶DNA聚合酶I催化合成DNA合成鏈按5’—3’方向延長(zhǎng)線性和環(huán)形DNA分子的取代缺口轉(zhuǎn)移用T4DNA聚合酶的取代合成法標(biāo)記DNA片段末端制備探針(4)DNA和RNA的修飾酶1)末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶與同聚物加尾(terminaldeoxynucleotidyltransferase)2)T4多核苷酸激酶(polynucleotidekinase)與DNA分子5’末端的標(biāo)記3)堿性磷酸酶與DNA脫磷酸作用細(xì)菌堿性磷酸酶(bacterialalkalinephosphatase)
小牛腸堿性磷酸酶(calfintestinalalkalinephosphatase)(5)核酸外切酶(exonucleases)1)核酸外切酶VII(exoVII)2)核酸外切酶III(exoIII)3)入核酸外切酶(入exo)和T7基因6核酸外切酶
堿性磷酸酶的活性(6)單鏈核酸內(nèi)切酶(singleendonucleases)1)SI核酸酶與RNA分子定位
2)Bal31核酸酶與限制位點(diǎn)的確定
SI核酸酶的活性
同摸板DNA有共同線性關(guān)系的RNA分子的定位
Bal31核酸酶的活性
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