微生物檢驗(yàn)理論課 01緒論+復(fù)習(xí) 學(xué)習(xí)資料

《臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)》緒論南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院芮勇宇某年9月某日晚上，某院急診科一病人。突然起病，寒戰(zhàn)、劇烈頭痛、惡心嘔吐。面色潮紅、眼結(jié)膜充血、咳嗽。左耳紅腫熱痛，體溫40℃。案例分析醫(yī)生及時(shí)抽血進(jìn)行血液培養(yǎng)，血常規(guī)白細(xì)胞增高及核左移。初步診斷敗血癥，收入院，使用泰能。但是使用泰能3天，病人癥狀沒有改善，血液培養(yǎng)陰性，給家屬下病危通知書。案例分析請(qǐng)南方醫(yī)院專家會(huì)診，詳細(xì)詢問病史和仔細(xì)體查，得到重要線索。病人一周前爬過白云山，躺在草地上休息。病人左耳有似被蚊蟲叮咬后形成焦痂。案例分析懷疑恙蟲病，外裴試驗(yàn)陽性。恙蟲病立克次對(duì)頭孢菌素類耐藥，用四環(huán)素類抗生素，1天后退熱，繼續(xù)用藥1周，病人康復(fù)出院。病原體檢測重要性：明確臨床診斷和指導(dǎo)臨床用藥。案例分析第一部分：臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)基本概念第二部分：臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)開展項(xiàng)目第三部分：臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)性質(zhì)和任務(wù)第四部分：臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容及安排第五部分：臨床常見細(xì)菌檢驗(yàn)要點(diǎn)總結(jié)第一部分：基本概念原核細(xì)胞型：細(xì)菌、支原體、衣原體、立克次體、螺旋體、放線菌。真核細(xì)胞型：真菌、藻類。

非細(xì)胞型微生物：病毒、亞病毒、阮粒。微生物分類正常菌群、條件致病微生物。病原微生物、人獸共患病原微生物。微生物與人類的關(guān)系研究微生物的類型、分布、形態(tài)結(jié)構(gòu)、生命活動(dòng)及其規(guī)律、遺傳、進(jìn)化；以及與人類、動(dòng)物、植物等相互關(guān)系的科學(xué)；目前學(xué)科分類屬于生物學(xué)。微生物學(xué)(microbiology)研究與醫(yī)學(xué)有關(guān)的病原微生物的生物學(xué)特性、致病性、免疫性，特異性診斷和防治措施的學(xué)科；目前學(xué)科分類屬于基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)，病原生物學(xué)。醫(yī)學(xué)微生物學(xué)（medicalmicrobiology）屬醫(yī)學(xué)微生物學(xué)范疇，與臨床醫(yī)學(xué)密切相關(guān)，因側(cè)重研究感染性疾病快速、準(zhǔn)確的診斷病原體的策略與方法，為臨床診斷提供依據(jù)；又稱診斷微生物學(xué)(diagnosticmicrobiology)；目前學(xué)科分類屬于臨床醫(yī)學(xué)，臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)。臨床微生物學(xué)(clinicalmicrobiology)第二部分：開展項(xiàng)目臨床免疫學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室：酶鏈免疫吸附試驗(yàn)（ELISA）、膠體金層析試紙條、化學(xué)發(fā)光或電化學(xué)發(fā)光、乳膠凝集方法；檢測肝炎病毒、性病、呼吸系統(tǒng)病原體抗原或抗體。檢驗(yàn)科三個(gè)實(shí)驗(yàn)室合作進(jìn)行病原體檢查臨床分子診斷實(shí)驗(yàn)室：熒光定量PCR方法，定量檢測病原體基因；基因芯片方法，HPV檢測及分型；高通量測序，遺傳病診斷。檢驗(yàn)科三個(gè)實(shí)驗(yàn)室合作進(jìn)行病原體檢查臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室（重點(diǎn)）：細(xì)菌真菌涂片、染色及鏡檢，細(xì)菌真菌結(jié)核桿菌培養(yǎng)、鑒定及藥敏試驗(yàn)。檢驗(yàn)科三個(gè)實(shí)驗(yàn)室合作進(jìn)行病原體檢查檢驗(yàn)科臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室開展項(xiàng)目細(xì)菌真菌涂片、染色及鏡檢：革蘭染色（Gramstain）查細(xì)菌和真菌；抗酸染色（Anti-faststain）查抗酸桿菌；墨汁染色（Indianinknegativestain）查隱球菌。革蘭染色G-雙球菌（淋球菌）革蘭染色尿中真菌抗酸染色分枝桿菌墨汁染色隱球菌細(xì)菌真菌涂片、染色及鏡檢：快速，價(jià)廉，不受殘余抗生素影響，可初步診斷部分病原體；不能準(zhǔn)確鑒定細(xì)菌真菌的屬種；未進(jìn)行藥敏試驗(yàn)；大醫(yī)院和小醫(yī)院，或門診均可開展。細(xì)菌真菌培養(yǎng)、鑒定及藥敏實(shí)驗(yàn)：手工方法鑒定，分腸桿菌科、非發(fā)酵G-桿菌、葡萄球菌屬、腸球菌屬、鏈球菌屬、嗜血桿菌屬、念珠菌等配套試劑盒；手工方法K-B藥敏試驗(yàn)；利用半自動(dòng)、自動(dòng)化的儀器，進(jìn)行培養(yǎng)及鑒定，稀釋法藥敏試驗(yàn)。檢驗(yàn)科臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室開展項(xiàng)目BACTEC?MGIT?系列采用無害，無污染的連續(xù)熒光檢測技術(shù)。是市場上最快的分枝桿菌檢測系統(tǒng)。陽性培養(yǎng)時(shí)間4-11天。BACTEC?MGIT?960全自動(dòng)分枝桿菌培養(yǎng)/藥敏系統(tǒng)由臨床將靜脈血采集后直接注入血液培養(yǎng)瓶；盡快放入血液培養(yǎng)檢測儀，自動(dòng)培養(yǎng)及實(shí)時(shí)檢測。革蘭染色培養(yǎng)陽性血液涂片快速：鑒定只需6-10小時(shí)；藥敏只需8-12小時(shí)；準(zhǔn)確：鑒定50余種生化反應(yīng)；藥敏稀釋法定量。PhoenixSystem全自動(dòng)細(xì)菌鑒定/藥敏系統(tǒng)細(xì)菌真菌培養(yǎng)、鑒定及藥敏試驗(yàn)：手工鑒定，K-B藥敏，適合標(biāo)本量少的小醫(yī)院；自動(dòng)化儀器，結(jié)果更準(zhǔn)確、快速，適合大醫(yī)院。第三部分：性質(zhì)和任務(wù)（一）臨床微生物學(xué)的性質(zhì)和任務(wù)研究感染性疾病的病原體特征提供快速、準(zhǔn)確的病原學(xué)診斷指導(dǎo)臨床合理使用抗菌藥物對(duì)醫(yī)院感染進(jìn)行監(jiān)控（二）臨床微生物檢驗(yàn)的思路與原則確保分析前質(zhì)量全面了解機(jī)體正常菌群保證檢驗(yàn)質(zhì)量微生物學(xué)定性、定量和定位分析加強(qiáng)與臨床聯(lián)系正確進(jìn)行標(biāo)本采集、運(yùn)送、保存及處理等、醫(yī)療廢物處理，定期對(duì)檢驗(yàn)科工作人員及醫(yī)院醫(yī)護(hù)人員進(jìn)行培訓(xùn)，提高病原微生物檢出率。舉例常見類型標(biāo)本注意事項(xiàng)。（三）臨床微生物學(xué)的性質(zhì)和任務(wù)討論選擇各種感染性疾病病原體的最佳檢驗(yàn)方法，探討各種病原微生物的鑒定程序，舉例乙肝病毒感染，免疫學(xué)方法（膠體金層析試紙條、ELISA、化學(xué)發(fā)光）分子生物學(xué)檢驗(yàn)（熒光定量PCR、基因測序）。（三）臨床微生物學(xué)的性質(zhì)和任務(wù)討論各類標(biāo)本病原菌分離培養(yǎng)及藥物敏感性試驗(yàn),

利用WHONET軟件各科室臨床分離病原菌種類及抗菌藥物的抗菌譜，定期（每季度）向醫(yī)院報(bào)告，指導(dǎo)臨床合理使用抗菌藥物（包括經(jīng)驗(yàn)用藥）。舉例葡萄球菌、腸球菌、腸桿菌科、非發(fā)酵G-桿菌、產(chǎn)新德里金屬酶超級(jí)細(xì)菌，念珠菌、霉菌。（三）臨床微生物學(xué)的性質(zhì)和任務(wù)討論以患者標(biāo)本為分析對(duì)象，學(xué)會(huì)對(duì)未知病原微生物的綜合分析，認(rèn)真進(jìn)行檢驗(yàn)結(jié)果的分析、實(shí)驗(yàn)方法及臨床意義的評(píng)價(jià)，尤其新發(fā)傳染病。舉例SARS。（三）臨床微生物學(xué)的性質(zhì)和任務(wù)討論在醫(yī)院感染中，對(duì)重點(diǎn)部門房間空氣、重點(diǎn)科室醫(yī)護(hù)人員手、重點(diǎn)科室物體表面，進(jìn)行微生物學(xué)調(diào)查、分析與質(zhì)量控制。懷疑發(fā)生暴發(fā)或流行時(shí)，對(duì)病原菌進(jìn)行同源性分析，如常見細(xì)菌真菌ERIC-PCR分型及聚類。舉例本單位開展醫(yī)院感染監(jiān)測項(xiàng)目。（三）臨床微生物學(xué)的性質(zhì)和任務(wù)討論第四部分：教學(xué)內(nèi)容及安排理論課，53學(xué)時(shí)，內(nèi)容強(qiáng)調(diào)實(shí)用性；緒論，微生物檢驗(yàn)一、二、三、四；臨床常見球菌、腸桿菌科、非發(fā)酵G-桿菌、厭氧菌等細(xì)菌檢驗(yàn)；臨床常見真菌、病毒檢驗(yàn)；醫(yī)院感染監(jiān)測和質(zhì)量控制。臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)：課程安排實(shí)驗(yàn)課，44學(xué)時(shí)，內(nèi)容強(qiáng)調(diào)實(shí)用性，少而精，要求反復(fù)練習(xí)、熟練掌握，包括基本技能訓(xùn)練，臨床常見病原菌檢驗(yàn)，醫(yī)院感染監(jiān)測常見項(xiàng)目。臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)：課程安排教員情況芮勇宇教授，趙衛(wèi)教授，龍軍教授,陳佑明副教授，李海俠講師，陳晶講師，顏曉慧講師，柴志欣講師，童曉文助教。第五部分：臨床常見細(xì)菌檢驗(yàn)要點(diǎn)總結(jié)臨床常見細(xì)菌中英文名稱pae銅綠假單胞菌Pseudomonasaeruginosaeco大腸埃希菌Escherichiacolisau金黃色葡萄球菌Staphylococcusaureusss.aureussep表皮葡萄球菌Staphylococcusepidermidiskpn肺炎型肺炎克雷伯菌Klebsiellapneumoniaess.pneumoniaaba鮑曼不動(dòng)桿菌Acinetobacterbaumanniiefa糞腸球菌Enterococcusfaecalishpi副流感嗜血桿菌Haemophilusparainfluenzaeshl溶血葡萄球菌Staphylococcushaemolyticus臨床常見細(xì)菌中英文名稱pma嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌Stenotrophomonas(Xantho.)maltophiecl陰溝腸桿菌Enterobactercloacaepmi奇異變形桿菌Proteusmirabilisefm屎腸球菌Enterococcusfaeciumpce洋蔥伯克霍爾德菌Burkholderia(Pseudo.)cepaciasap腐生葡萄球菌Staphylococcussaprophyticusspn肺炎鏈球菌Streptococcuspneumoniae臨床常見細(xì)菌鑒定要點(diǎn)G+球菌G-球菌G-桿菌G+桿菌分枝桿菌菌落特征、革蘭/抗酸染色觸酶葡萄球菌+腸球菌-鏈球菌-觸酶，氧化酶奈瑟菌++布蘭漢菌++氧化酶，O/F腸桿菌科非發(fā)酵菌4糖：葡乳麥蔗DNA，N硝還臨床常見G+球菌鑒定要點(diǎn)葡萄球菌鏈球菌腸球菌觸酶+觸酶—觸酶—金葡溶血凝固酶+溶血葡溶血凝固酶-表皮葡不溶血凝固酶-肺炎鏈α溶血奧撲托辛S化膿鏈β溶血桿菌肽S無乳鏈β溶血CAMP+高鹽七葉苷阿拉伯糖屎腸阿+糞腸阿-發(fā)酵菌氧化