染色體微陣列分析技術(CMA)在產前診斷中的應用ppt課件

1、,1,主要內容,CMA在產前診斷中的應用概況 CMA芯片平臺選擇 CMA應用于產前診斷的臨床指征 CMA檢測前后的遺傳咨詢及結果解釋,2,CMA在產前診斷中的應用概況,3,CMA在產前診斷中的應用概況,在染色體核型分析未發(fā)現異常的病例中，CMA 技術對基因組不平衡重組的額外檢出率為0.4%50%（變異范圍較大的原因主要為樣本量、樣本選擇標準及芯片平臺存在差異），臨床意義不明確的CNV比例為1.4%； 在超聲提示胎兒結構異常且核型正常的病例中，CMA 技術的額外檢出率為10%，VOUS 比例為2.1%； 超聲提示胎兒結構異常且CMA 檢測正常的病例中，染色體核型分析的額外檢出率為0.8%，其中絕

2、大部分為染色體平衡重組。 而在CMA 檢測結果未發(fā)現異常的病例中，染色體核型分析的額外檢出率為0.6%，其中絕大部分為染色體平衡易位或倒位。,2013 年Hillman 等的meta 分析共涉及25 篇文獻共18 113 例個體:,CMA 技術可以作為臨床產前診斷常規(guī)檢測的 一部分，對于所有介入性產前診斷，特別是超聲提示胎兒結構異常者，應用CMA 技術可明顯提高有臨床意義的CNV 檢出率。,4,CMA芯片平臺選擇,基于微陣列的比較基因組雜交技術(aCGH),單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(SNP array),優(yōu)勢：用戶可根據需要設計并制作芯片 可針對特定區(qū)域設計高密度探針 以增加在該區(qū)域的檢測靈敏

3、度和特異性,優(yōu)勢：SNP 芯片除了帶有拷貝數信息外， 還帶有SNP 分型的信息； 可檢測雜合性缺失（loss of heterozygous，LOH），從而用于檢測單親二倍體（uniparental disomy，UPD）、低水平嵌合體（mosaic）、近親婚配及三倍體。,5,6,CMA檢測前的遺傳咨詢,1. CMA 技術的優(yōu)勢：能夠檢出所有引起基因組不平衡改變的染色體異常，包括所有核型分析能夠檢出的染色體不平衡變異，以及核型分析無法檢出的染色體微缺失與微重復。 2. CMA 技術的局限性： （1） 無法檢測平衡染色體重組、極低比例嵌合體（10%）、某些標記染色體、單基因突變及DNA 甲基化異

4、常、aCGH 芯片還無法檢測三倍體。 （2）可能會發(fā)現VOUS，即可能需要對父母樣本進行檢測，通過家系綜合分析，以協助對胎兒檢測結果的判讀。但基于目前對人類基因組的認識和數據庫的積累程度，仍然無法對某些檢測結果進行精確判讀和解釋。,7,3. 檢出疾病的遺傳異質性：所檢出的某些遺傳性疾病由于外顯率和表現度的差異，在不同患者間臨床表現可能存在很大的變異。 4. 可能檢出與臨床表型不相關的CNV：通過CMA 技術檢測可能發(fā)現非親生父親、近親婚配、遲發(fā)性的遺傳病或成人期發(fā)病的遺傳?。ㄈ缒[瘤），這些結果應該讓孕婦及家屬選擇是否被告知。,CMA檢測前的遺傳咨詢,8,CMA檢測報告及結果解釋,CMA 檢測的

5、臨床報告至少應包括以下幾方面內容：,9,CMA檢測后咨詢及臨床處理,1. 非致病性CNV： 基本可以排除由基因組不平衡改變而導致的遺傳病，但必須向患者說明CMA 技術不能檢測所有的遺傳病，如極低比例嵌合體（10%）、平衡染色體重組、單基因突變等。 2. 致病性CNV：（1）胎兒檢出明確致病性染色體微缺失或微重復綜合征：若其父母有再次妊娠計劃，應建議父母行CMA 檢測以明確胎兒致病性片段是新發(fā)突變還是遺傳自父母，以對再次生育作遺傳風險評估。（2）胎兒同時檢出缺失和重復： 胎兒的缺失和重復可能來源于親代的染色體平衡易位片段的不平衡分離，若其父母有再次妊娠計劃，應對父母樣本進行熒光原位雜交FISH或

6、染色體核型分析以排除染色體相互易位或倒位，并對再發(fā)風險進行評估。,10,3. VOUS：應建議父母行CMA 檢測，通過家系綜合分析以協助對胎兒檢測結果的判斷。 （1）新發(fā)CNV：若有證據表明該區(qū)域內有疾病表型相關的功能基因，通常認為是可能致病性；若該區(qū)域內無基因，通常認為是可能良性，也有可能目前未發(fā)現其臨床意義。 （2） 遺傳性CNV： 若胎兒父母有臨床表型，且該區(qū)域內有疾病表型相關的功能基因，通常認為該CNV 為可能致病性。 若胎兒父母無臨床表型，通常情況下，可判斷該CNV 為家族性良性CNV；若胎兒CNV與親代CNV 大小不同，且缺失或重復的范圍擴大了，則應考慮為可能致病性。此外，還需考慮不完全外顯、臨床表型差異（父母可能有亞臨床表現）的可能。,11,CMA檢出數據,對檢出的CNV進行注釋,致病性CNV,良性CNV,臨床意義不確定CNV,報告對應的遺傳