計(jì)算化學(xué)9常用計(jì)算化學(xué)應(yīng)用軟件及資源.ppt

1、常用計(jì)算化學(xué)應(yīng)用軟件及資源,Gaussian 軟件,Gaussian的功能很強(qiáng)大 可以做從頭算 半經(jīng)驗(yàn) DFT,Gaussian 軟件,可用來(lái)研究分子的能量與幾何結(jié)構(gòu) 化學(xué)反應(yīng)過(guò)渡態(tài)的能量與幾何結(jié)構(gòu) 振動(dòng)頻率分析、紅外與拉曼光譜; 分子的熱化學(xué)性質(zhì)、鍵能 化學(xué)反應(yīng)能 化學(xué)反應(yīng)途徑,研究分子軌道的能量與性質(zhì) 原子電荷分布（布居分析）和自旋密度分布 分子的多極矩（永久偶極矩和四極至十六極矩） NMR 屏蔽常數(shù)、化學(xué)位移及分子的磁化率、振動(dòng)園二色強(qiáng)度 電子親和性與電離勢(shì)、極化率與超極化率、靜電勢(shì)與電子密度分布等,第一步工作準(zhǔn)備輸入文件。Gaussian程序?qū)斎胛募幸欢ǖ母袷揭?，如圖顯示了一個(gè)完

2、整的Gaussian輸入文件,準(zhǔn)備好輸入文件后，便可在Gaussian程序中讀入此輸入文件進(jìn)行計(jì)算,程序運(yùn)算完后，Gaussian會(huì)給出正常結(jié)束的信息。此時(shí)，可打開(kāi)文本格式的輸出文件，提取所需信息。,MOPAC 軟件,MOPAC 軟件是一款大眾化、功能強(qiáng)大的半經(jīng)驗(yàn)量化程序 可以計(jì)算分子、自由基、離子和聚合物的電子結(jié)構(gòu)、光譜，熱化學(xué)性質(zhì)、同位素取代效應(yīng)和力常數(shù)等。其中的一個(gè)過(guò)渡態(tài)定位程序和兩個(gè)過(guò)渡態(tài)優(yōu)化程序用于研究化學(xué)反應(yīng)。 此外，它還常用作定量結(jié)構(gòu)性質(zhì)（或活性）關(guān)系研究中結(jié)構(gòu)參數(shù)的計(jì)算。,ADF軟件,ADF可以進(jìn)行單點(diǎn)計(jì)算、幾何優(yōu)化、尋找過(guò)渡態(tài)、計(jì)算力常數(shù)和熱化學(xué)性質(zhì)、跟蹤反應(yīng)路徑、研究電子結(jié)

3、構(gòu)、通過(guò)比較離子的激發(fā)態(tài)和基態(tài)而獲得激發(fā)能。,新版本的ADF包括了含時(shí)密度泛函理論，基組庫(kù)中包含了1118號(hào)所有元素，而且對(duì)常見(jiàn)元素有不同大小的基組，從最小的到高質(zhì)量的。,ADF軟件在材料科學(xué)和生命科學(xué)均有應(yīng)用，但更側(cè)重于前者，尤其在重元素化學(xué)、無(wú)機(jī)化學(xué)、催化領(lǐng)域非常流行。最新版的ADF加入了QM/MM方法，可用于生物大分子體系的研究。,量子化學(xué)資源,International Journal of Quantum chemistry Journal of molecular modeling Journal of physical chemistry Journal of chemical

4、theory and computation （美國(guó)化學(xué)會(huì)2005年推出） Journal of molecular structure (Theochem) Reviews in Computational Chemistry （叢書(shū)） Journal of theoretical and computational chemistry Theoretical chemical accounts Journal of computational chemistry,Gaussian公司的官方網(wǎng)站,國(guó)際上著名的計(jì)算化學(xué)列表網(wǎng)站，開(kāi)通較早，內(nèi)有大量關(guān)于計(jì)算化學(xué)的郵件列表。,北京大學(xué)化學(xué)系開(kāi)設(shè)的量化計(jì)算論壇,廈門(mén)大學(xué)化學(xué)系開(kāi)設(shè)的量化計(jì)算論壇,國(guó)內(nèi)著名的量子化學(xué)論壇,國(guó)內(nèi)著名的量子化學(xué)論壇,化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)（Data base） 分子結(jié)構(gòu)庫(kù) 晶體庫(kù) 熱力學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù) 藥物庫(kù) 高分子庫(kù) 分子光譜、波譜圖譜庫(kù) 生物數(shù)據(jù)庫(kù)（蛋白質(zhì)、核酸、多糖庫(kù)） 化學(xué)文獻(xiàn)