基因診斷與測序技術(shù)在其中的應(yīng)用_陳然_2015-03-20

1、基因診斷與測序技術(shù)基因診斷與測序技術(shù) 在其中的應(yīng)用在其中的應(yīng)用 武漢分子生物學(xué)實驗室武漢分子生物學(xué)實驗室 陳然陳然 2015-03-202015-03-20 KG Diagnostics Confidential 內(nèi)容內(nèi)容 基因診斷的概念 基因測序技術(shù)及發(fā)展沿革 一代測序及片段分析檢測流程 二代測序技術(shù)流程 測序結(jié)果的分類及測序策略的選擇 測序技術(shù)的局限性 KG Diagnostics Confidential 基因診斷的概念 內(nèi)容內(nèi)容-1-1 KG Diagnostics Confidential 基因檢測 基因預(yù)測 基因診斷 即分子診斷，應(yīng)用分子生物學(xué)方法檢測患者體 內(nèi)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達(dá)

2、水平的變化等而做出 的或輔助臨床診斷的技術(shù)。 又稱基因體檢，通過檢測基因判斷未來患某種 疾病的可能性（風(fēng)險預(yù)測），進(jìn)而加強(qiáng)健康管 理。 基因診斷的概念基因診斷的概念 KG Diagnostics Confidential 正常人不會發(fā)生融合基因或基因突變。正常人不會發(fā)生融合基因或基因突變。 某些疾病的患者會檢測出融合基因或基因突變。某些疾病的患者會檢測出融合基因或基因突變。 兩個或多個基因的編 碼區(qū)相連接，表達(dá)融 合蛋白?？捎扇旧w 易位造成，常與染色 體項目、流式項目同 時送檢。 項目：BCR/ABL, AML1/ETO, PML/RARa, AML 16種篩查，ALL 15種篩查，31種篩

3、 查 技術(shù)：定性PCR、定 量PCR、基因芯片、 二代測序。 融合 基因 基因在結(jié)構(gòu)上發(fā)生的 堿基對或排列順序的 改變，包括點(diǎn)突變、 插入/缺失突變 （INDEL）。 項目：JAK2 V617F, CALR Exon9, AML預(yù) 后, EGFR, Kras, HLH, Fanconi, 地貧 DMD, HBV耐藥 技術(shù)：定量PCR、基 因芯片、一代測序、 二代測序、MLPA、定 性PCR、雜交。 基因 突變 分子實驗室開展的診斷類檢測分子實驗室開展的診斷類檢測-1-1 KG Diagnostics Confidential 正常人正常人和某和某 些疾病的患些疾病的患 者間基因表者間基因表 達(dá)

4、量不同。達(dá)量不同。 用分子生物學(xué)手段檢 測個體基因型 （Genotype）。 項目：配型, 嵌合率, HCV分型，SNP，親子 鑒定 技術(shù)：一代測序、片 段分析、二代測序、 基因芯片。 基因 分型 量化檢測mRNA的多少。 項目：化療ERCC1， RRM1，TUBB3，TYMS 基因mRNA表達(dá)含 量 技術(shù)：定量PCR、二 代測序。 基因 表達(dá) 正常人之間的正常人之間的 基因分型不同?；蚍中筒煌?。 分子實驗室開展的診斷類檢測分子實驗室開展的診斷類檢測-2-2 KG Diagnostics Confidential 基因測序技術(shù)及發(fā)展沿革 內(nèi)容內(nèi)容-2-2 KG Diagnostics Con

5、fidential v DNADNA測序技術(shù)，即基因測序技術(shù)，是測序技術(shù)，即基因測序技術(shù)，是 指測定指測定DNADNA堿基序列的技術(shù)。堿基序列的技術(shù)。 v 人類基因組約有人類基因組約有3030億個堿基對。大部億個堿基對。大部 分分DNADNA測序的目的是得到特定基因的測序的目的是得到特定基因的 特定區(qū)域上序列信息特定區(qū)域上序列信息AA、T T、G G、C C 四種堿基的排列順序，即靶向基因測四種堿基的排列順序，即靶向基因測 序序/ /目標(biāo)區(qū)域測序。目標(biāo)區(qū)域測序。 v 通過對比被檢者的堿基排列順序是否通過對比被檢者的堿基排列順序是否 與正常人一致，以此作為疾病診斷的與正常人一致，以此作為疾病診斷

6、的 依據(jù)。依據(jù)。 v 測序技術(shù)已廣泛應(yīng)用在醫(yī)學(xué)、生物學(xué)測序技術(shù)已廣泛應(yīng)用在醫(yī)學(xué)、生物學(xué) 研究，各類疾病的檢測和篩查，物種研究，各類疾病的檢測和篩查，物種 鑒定，農(nóng)作物篩選，基因工程鑒定，農(nóng)作物篩選，基因工程 基因測序技術(shù)基因測序技術(shù) KG Diagnostics Confidential 為什么使用測序技術(shù)進(jìn)行診斷為什么使用測序技術(shù)進(jìn)行診斷 既能檢測已知突變、也能既能檢測已知突變、也能 檢測未知突變。檢測未知突變。 二代測序技術(shù)的發(fā)展使得二代測序技術(shù)的發(fā)展使得 基因診斷的深度和廣度得基因診斷的深度和廣度得 到極大擴(kuò)展，使得多基因到極大擴(kuò)展，使得多基因 參與的復(fù)雜疾病檢測，及參與的復(fù)雜疾病檢測，

7、及 高靈敏度檢測成為可能。高靈敏度檢測成為可能。 能夠檢測一段區(qū)域內(nèi)的所能夠檢測一段區(qū)域內(nèi)的所 有點(diǎn)突變。有點(diǎn)突變。 具備成本和可操作性具備成本和可操作性 上的優(yōu)勢。上的優(yōu)勢。 KG Diagnostics Confidential Thermo Life/ABI 3500 xL Beckman Coulter GenomeLab GeXP Roche/454 Genome Sequenser FLX Illunima HiSeq 2500 Life/Ion Torrent PGM PacBio RS System 一代一代測測序序二代二代測測序序三代三代測測序序 1977起2005起2011

8、起 Thermo Life/ABI Solid 5500 測序技術(shù)的發(fā)展測序技術(shù)的發(fā)展 KG Diagnostics Confidential 一代一代測測序序 二代二代測測序序 (NGS) 三代三代測測序序 (3GS) 技術(shù) 原理 雙脫氧末端終止法 （Sanger法）+毛細(xì) 管電泳（CE）； Roche 454：高通量焦磷酸測序； Illumina：橋接PCR+邊合成邊測序； ABI Solid：寡聚物連接檢測測序； Ion Torrent：H+電位信號檢測+半導(dǎo)體芯片； 大規(guī)模平行測序（massively parallel DNA sequencing），生物信息技術(shù)處理產(chǎn)出 數(shù)據(jù)； 單分

9、子實時測序； 特點(diǎn) 高讀長；檢測通量中 等；檢測靈敏度低； 單孔成本低，適用于 少數(shù)基因的少量位點(diǎn) 測序； 檢測通量高；檢測靈敏度高；開機(jī)運(yùn)行成本 高，但平攤到每樣本、每堿基的成本低；適 用于多基因，多位點(diǎn)的測序；可自動完成數(shù) 據(jù)分析； 高讀長，特別適合于de novo測序；檢測通量高； 準(zhǔn)確性低（81-83%）；開 機(jī)運(yùn)行成本很高； 應(yīng)用 范圍 研究和臨床檢測；研究和臨床檢測；目前只用于研究； 三代測序技術(shù)的比較三代測序技術(shù)的比較 KG Diagnostics Confidential 一代測序及片段分析檢測流程 內(nèi)容內(nèi)容-3-3 KG Diagnostics Confidential 樣本

10、收取&處理PCR擴(kuò)增目的片段酶解消化 測序反應(yīng) （雙脫氧末端終止 法） 測序反應(yīng)產(chǎn)物純化 （乙醇沉淀） 加入Hi-Di甲酰胺， 變性 基因分析儀上機(jī) （毛細(xì)管電泳） 分析結(jié)果，得出報 告 一代測序檢測流程一代測序檢測流程 KG Diagnostics Confidential 醫(yī)院 前處理 錄入Lis系統(tǒng) 分子實驗室 分揀、登記 物流 標(biāo)本 （血液） DNA RNA 提取核酸過程 標(biāo)本收取標(biāo)本收取& &處理處理 KG Diagnostics Confidential v PCR：Polymerase Chain Reaction（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）的簡稱。PCR是一個在 體外特異性的復(fù)制一段DN

11、A片段的過程。1985年由美國科學(xué)家Mullis發(fā)明。 v 分子生物學(xué)最常用的體外擴(kuò)增DNA的方法，使人們很快的獲得大量拷貝的特異 DNA片段，利于繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)檢測的分析。 DNA模板； 4種脫氧單核苷酸 dNTP（包括dATP、 dTTP、 dGTP、 dCTP ）； 耐熱性聚合酶(如 Taq)； 一對特異性引物； 適量的反應(yīng)緩沖 液； 基因擴(kuò)增儀（PCR儀） PCRPCR擴(kuò)展目的基因片段擴(kuò)展目的基因片段 KG Diagnostics Confidential 時間 溫度 延伸 3 變性 1 退火 2 1個PCR循環(huán)包 括變性、退火、 延伸3步 重復(fù)13步 30-35輪 目的DNA片段 擴(kuò)增

12、百萬至億倍以上， 能夠被電泳等后續(xù) 方法檢測到。 DNA單鏈 與引物復(fù)性 DNA變性 形成2條單鏈 子鏈延伸 DNA加倍 PCRPCR程序程序 KG Diagnostics Confidential 模板DNA 95 KG Diagnostics Confidential PCRPCR的基本原理的基本原理 vPCR反應(yīng)條件 vPCR過程 vPCR的特點(diǎn) 56 引物1 引物2 DNA引物 KG Diagnostics Confidential PCRPCR的基本原理的基本原理 vPCR反應(yīng)條件 vPCR過程 vPCR的特點(diǎn) 72 引物1 引物2 DNA引物 Taq Taq dATP dGTP d

13、TTP dCTP KG Diagnostics Confidential PCRPCR的基本原理的基本原理 vPCR反應(yīng)條件 vPCR過程 vPCR的特點(diǎn) 95 第1輪循環(huán)結(jié)束 第2輪循環(huán)開始 KG Diagnostics Confidential PCRPCR的基本原理的基本原理 vPCR反應(yīng)條件 vPCR過程 vPCR的特點(diǎn) Taq Taq Taq Taq dATP dGTP dTTP dCTP 56 72 95 KG Diagnostics Confidential PCRPCR的基本原理的基本原理 vPCR反應(yīng)條件 vPCR過程 vPCR的特點(diǎn) 72 第2輪循環(huán)結(jié)束 第3輪、第4輪 K

14、G Diagnostics Confidential No. ofNo. Amplicon CyclesCopies of Target 12 24 38 416 532 664 201,048,576 301,073,741,824 經(jīng)多次循環(huán)后靶片段擴(kuò)增的數(shù)量經(jīng)多次循環(huán)后靶片段擴(kuò)增的數(shù)量 KG Diagnostics Confidential v SAP：Shrimp Alkaline Phosphatase，蝦堿性磷酸酶，催 化降解體系里多余的dNTP。 v Exo I： Exonuclease I，核酸外切酶I，催化分解體系里 多余的單鏈DNA（即引物）。 v 同時向PCR產(chǎn)物中加入一

15、定的SAP和Exo I，去除多余的 dNTP和引物，只保留擴(kuò)增產(chǎn)物，達(dá)到純化的效果。 酶解消化酶解消化 KG Diagnostics Confidential Frederick Sanger, 1918-2013。 1958年和1980年諾貝爾化學(xué)獎得 主。 1977年提出雙脫氧末端終止法。 在反應(yīng)體系中加入已經(jīng)過酶解消化的PCR產(chǎn) 物、耐熱性聚合酶、4種脫氧單核苷酸dNTP （包括dATP、dTTP、dGTP、dCTP）、4種帶 熒光標(biāo)記的雙脫氧單核苷酸ddNTP（包括 ddATP、ddTTP、ddGTP、ddCTP ）、單條特 異性引物、適量的緩沖液。 測序反應(yīng)：雙脫氧末端終止法（測序反

16、應(yīng)：雙脫氧末端終止法（SangerSanger法）法） KG Diagnostics Confidential # 由于雙脫氧單核苷酸缺乏延伸所需要的3-OH基團(tuán)， 一旦摻入到DNA鏈中，此DNA鏈就不能進(jìn)一步延長。 # 每當(dāng)DNA聚合酶需要dNTP參入到正常延長的DNA 鏈中時，就有兩種可能性，一是摻入ddNTP，結(jié)果 導(dǎo)致DNA鏈延長的終止；二是摻入dNTP，使DNA鏈仍 可繼續(xù)延長，直至摻入下一個ddNTP。 # 根據(jù)這一方法，就可得到一組長短不一的鏈終 止產(chǎn)物，彼此只相差一個堿基。它們有共同的起始 點(diǎn)，但終止在不同的熒光標(biāo)記的ddNTP上。 # 通過高分辨電泳對這一組產(chǎn)物進(jìn)行分離，光學(xué)

17、 系統(tǒng)捕捉到ddNTP的熒光信號，以峰的形式展現(xiàn)成 圖譜，并按順序排列。從電泳圖譜上可讀得DNA堿 基序列。 測序反應(yīng)：雙脫氧末端終止法（測序反應(yīng)：雙脫氧末端終止法（SangerSanger法）法）-2-2 KG Diagnostics Confidential v測序反應(yīng)產(chǎn)物純化目的：去除多余熒光ddNTP對激光 檢測器的干擾；方法：乙醇沉淀法。 v加入Hi-Di甲酰胺并變性：將DNA雙鏈打開，維持其 處于單鏈狀態(tài)。 測序反應(yīng)產(chǎn)物純化及變性測序反應(yīng)產(chǎn)物純化及變性 KG Diagnostics Confidential 基因分析儀工作原理 毛細(xì)管電泳（Capillary Electrophor

18、esis，CE）：以毛細(xì)管 為分離通道、以高壓直流電場為驅(qū) 動力，依據(jù)樣品中各組分之間的淌 度和分配行為上的差異而實現(xiàn)分離 的電泳分離分析方法。毛細(xì)管電泳 的分辨率比PAGE電泳更高，能夠分 辨出1個堿基的DNA片段差異。經(jīng)雙 脫氧末端終止法擴(kuò)增出來的以ddNTP 結(jié)尾的長短不一的DNA片段通過毛細(xì) 管電泳分離，再經(jīng)激光系統(tǒng)對ddNTP 上的熒光信號檢測，就能得到DNA的 序列信息。 基因分析儀上機(jī)基因分析儀上機(jī) KG Diagnostics Confidential 參考序列 樣本序列 報出與參考 序列不一致 的地方 測序結(jié)果分析測序結(jié)果分析 KG Diagnostics Confident

19、ial 毛細(xì)管 電泳 分離Sanger法測序產(chǎn)物 一代測序 分離PCR產(chǎn)物 片段分析 片段分析（Fragment Analysis）：用帶熒光標(biāo)記的引物擴(kuò)增目的DNA片 段（可實現(xiàn)多重擴(kuò)增），產(chǎn)物經(jīng)毛細(xì)管電泳分離后得到熒光峰圖譜，再 經(jīng)軟件處理得出產(chǎn)物的片段大小，從而得到基因型等結(jié)果。 基因分析儀基因分析儀不僅僅用于測序不僅僅用于測序 KG Diagnostics Confidential 測序：檢測DNA片段中的堿基序列。 片段分析：分離熒光標(biāo)記的片段并檢測其大小。 流程短；靈敏度高； 多重擴(kuò)增增加了檢測 通量；應(yīng)用及衍生技 術(shù)多； 不能檢測點(diǎn)突變，不 能檢測未知突變。 測序測序vsvs片段

20、分析片段分析 KG Diagnostics Confidential 片段片段 分析分析 SNP分型 SNaPshot SNaPlex 微衛(wèi)星/STR 基因連鎖定位 動物育種 人身份鑒定 微衛(wèi)星不穩(wěn)定性 嵌合體 相對熒光定量 MLPA LOH QF-PCR/QMPSF 指紋圖譜分析 AFLP 片段分析的應(yīng)用片段分析的應(yīng)用 KG Diagnostics Confidential 樣本收取&處理 PCR擴(kuò)增目的片 段 上樣準(zhǔn)備 基因分析儀上機(jī) （毛細(xì)管電泳） 分析結(jié)果，得出 報告 片段分析的檢測流程片段分析的檢測流程 KG Diagnostics Confidential PCR：引物帶有熒光標(biāo)記

21、，故擴(kuò)增 出的PCR產(chǎn)物也帶有熒光標(biāo)記。 上樣準(zhǔn)備：PCR產(chǎn)物+Hi-Di甲酰胺 +內(nèi)標(biāo)，變性。 基因分析儀上機(jī)：進(jìn)行毛細(xì)管電 泳，光學(xué)系統(tǒng)捕捉到熒光信號， 并以峰的形式展現(xiàn)成圖譜。 PCRPCR上樣準(zhǔn)備上樣準(zhǔn)備上機(jī)上機(jī) KG Diagnostics Confidential 片段結(jié)果示例片段結(jié)果示例 KG Diagnostics Confidential v MLPA： Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification（ 多重連接依賴式探針擴(kuò)增）的簡稱，由MRC-Holland公司于2002年 首創(chuàng)。 v 該技術(shù)利用雜交、連接和PCR擴(kuò)增反應(yīng)三

22、個基本步驟，在單個反應(yīng) 管內(nèi)可進(jìn)行最高達(dá)50種的核苷酸片段相對定量檢測。 v 優(yōu)勢：通量高；靈敏度高；操作簡單；特別適于檢測DNA缺失/重復(fù) 突變（Indel），CNV（Copy Number Variation）突變。 v 局限：不能用于檢測STR（短串聯(lián)重復(fù)序列多態(tài)性）；不能用于檢 測染色體平衡易位；不能用于單個細(xì)胞檢測；開發(fā)新MLPA試劑盒很 困難；只集中于人DNA分析； 定量PCR不 能達(dá)到 Southern Blot費(fèi)時 費(fèi)力 測序不能檢測中大片段Indel和CNV MLPAMLPA技術(shù)技術(shù) KG Diagnostics Confidential MLPAMLPA技術(shù)流程技術(shù)流程 K

23、G Diagnostics Confidential 缺失突變 CNV突變 MLPAMLPA舉例舉例 KG Diagnostics Confidential MLPAMLPA的量化結(jié)果的量化結(jié)果 KG Diagnostics Confidential ThermoFisher Scientific Life Technologies Ion Torrent二代測序平臺 內(nèi)容內(nèi)容-4.1-4.1 KG Diagnostics Confidential Ion TorrentIon Torrent公司簡介公司簡介 Ion Torrent公司，由Dr.Jonathan Rothberg創(chuàng)辦。 創(chuàng)立4

24、54生命科學(xué)公司， 推出第一臺NGS測序儀。 2007年以1.4億美元被羅 氏公司收購。 創(chuàng)立Ion Torrent公司， 推出第一臺半導(dǎo)體測序儀 PGM。 2010年以3.5億美元被 Life Technologies收購。 創(chuàng)立RainDance公司，開 拓出第三代PCR數(shù)字 PCR技術(shù)。 KG Diagnostics Confidential Ion TorrentIon Torrent半導(dǎo)體測序技術(shù)的特點(diǎn)半導(dǎo)體測序技術(shù)的特點(diǎn)-1-1 成本低成本低：設(shè)備價格實惠，無光 學(xué)系統(tǒng)。 通量靈活通量靈活：選擇合適的芯片， 無論樣本多少都能開機(jī)。 小型化小型化：為臨床檢測而設(shè)計的 臺式測序儀，改變

25、了NGS的發(fā)展 方向。 快速性快速性：無熒光檢測，測序步 驟耗時短。 Ion PGM首款半導(dǎo)體測序儀，全球銷售速度、普及速度最快的測序儀。 KG Diagnostics Confidential Ion TorrentIon Torrent半導(dǎo)體測序技術(shù)的原理半導(dǎo)體測序技術(shù)的原理 KG Diagnostics Confidential Ion TorrentIon Torrent半導(dǎo)體測序核心技術(shù)半導(dǎo)體測序核心技術(shù) KG Diagnostics Confidential Ion TorrentIon Torrent技術(shù)流程技術(shù)流程 文庫制備 手工完成 模板制備 手工完成 上機(jī)測序 自動化完成

26、數(shù)據(jù)分析 自動化完成 核酸提取 PCR擴(kuò)增目的片段 KG Diagnostics Confidential 文庫制備的目的文庫制備的目的 打斷打斷DNADNA分子分子 增加接頭增加接頭 增加增加BarcodeBarcode KG Diagnostics Confidential 模板制備的目的模板制備的目的 使ISP珠子上富集同一克隆的DNA片段。 KG Diagnostics Confidential 芯片上樣和測序儀測序芯片上樣和測序儀測序 PGM的清洗 PGM的初始化 模板上芯片-ISP 珠子的Loading KG Diagnostics Confidential PGMPGM測序結(jié)果測

27、序結(jié)果 KG Diagnostics Confidential 數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù)分析 通過專用服務(wù) 器的插件分析。 插件平臺開放， 便于升級、共 享。 KG Diagnostics Confidential VariantCallerVariantCaller插件分析結(jié)果插件分析結(jié)果 KG Diagnostics Confidential Illumina二代測序平臺 內(nèi)容內(nèi)容-4.2-4.2 KG Diagnostics Confidential Illumina 公司，成立于1998年，原專注于BeadArray芯片分型技 術(shù)。 2006年收購Solexa，不斷改良Genome Analyze

28、r NGS平臺，目前成 為高通量測序的行業(yè)領(lǐng)導(dǎo)者。 IlluminaIllumina公司簡介公司簡介 KG Diagnostics Confidential IlluminaIllumina二二代代測序技術(shù)特點(diǎn)測序技術(shù)特點(diǎn) 準(zhǔn)確性高準(zhǔn)確性高：唯一在Q30上表現(xiàn)出 色的二代測序平臺。世界上第 一臺獲得FDA認(rèn)證的測序平臺。 數(shù)據(jù)產(chǎn)出量巨大數(shù)據(jù)產(chǎn)出量巨大：大規(guī)模樣本 一起測序時，每樣本平攤成本 低。 市場占有率高市場占有率高：眾多科研文章 均是基于Illumina平臺發(fā)表。 集成自動化集成自動化：Miseq可承擔(dān)簇生 成、測序與數(shù)據(jù)分析。 KG Diagnostics Confidential I

29、lluminaIllumina二二代代測序核心技術(shù)測序核心技術(shù) Sequencing By Synthesis (SBS, 邊合成邊測序邊合成邊測序 ) 雜交的測 序引物 第一個堿基被合成， 檢測熒光信號 切掉阻遏基團(tuán)和熒 光基團(tuán) KG Diagnostics Confidential IlluminaIllumina二二代代測序技術(shù)流程測序技術(shù)流程-1-1 KG Diagnostics Confidential IlluminaIllumina二二代代測序技術(shù)流程測序技術(shù)流程-2-2 文庫構(gòu)建：通過捕獲/擴(kuò)增的方式達(dá)到：打斷 DNA分子、加接頭、加Index。 簇生成：經(jīng)過橋接PCR在Flo

30、w Cell上生成大量 模板。 測序：每次流過1種dNTP；照相機(jī)拍下熒光信號； 分析處理后得出堿基序列。 決定了測 序通量 KG Diagnostics Confidential IlluminaIllumina二二代代測序技術(shù)流程測序技術(shù)流程-3-3 Library Preparation Cluster Generation MiSeq cBot Sequencing MiSeq HiSeq Data Analysis MSR CASAVA 手工完成 自動完成 自動完成 自動完成 KG Diagnostics Confidential TruSight系列（腫瘤、心血管、遺傳性 疾病等）

31、 臨床靶向基因測序（基因突變引起的疾 病檢測等），如范可尼貧血、MDS套系等。 微生物基因組測序 全外顯子組測序 轉(zhuǎn)錄組測序 其他科研測序項目 IlluminaIllumina二二代代測序平臺的分工測序平臺的分工 KG Diagnostics Confidential Vcf.outVcf.out數(shù)據(jù)結(jié)果數(shù)據(jù)結(jié)果 KG Diagnostics Confidential 測序結(jié)果的分類 測序策略的選擇 內(nèi)容內(nèi)容-5-5 KG Diagnostics Confidential 測序結(jié)果報告測序結(jié)果報告& &注釋注釋- -致病性突變致病性突變 KG Diagnostics Confidential

32、測序結(jié)果報告測序結(jié)果報告& &注釋注釋- -可能致病性可能致病性/ /增加風(fēng)險增加風(fēng)險 KG Diagnostics Confidential 測序結(jié)果報告測序結(jié)果報告& &注釋注釋- -臨床意義不明確臨床意義不明確 KG Diagnostics Confidential 測序結(jié)果報告測序結(jié)果報告& &注釋注釋- -多態(tài)性位點(diǎn)，無致病性多態(tài)性位點(diǎn)，無致病性 KG Diagnostics Confidential 已推出的遺傳病測序檢測項目已推出的遺傳病測序檢測項目-1-1 遺傳代謝類疾 病 高苯丙氨酸血癥 甲基丙二酸血癥 糖原累積癥 戈謝病 （注意與質(zhì)譜的區(qū)別） 遺傳型肌肉病 假肥大型肌營養(yǎng)不

33、良 癥MLPA方法和測 序方法是兩個不同項 目 脊髓性肌萎縮 運(yùn)動、神經(jīng)、生長發(fā)育異常 軟骨發(fā)育不全/低下 脆性X綜合征 X連鎖低血磷酸抗生素 D佝僂病 Rett綜合癥 線粒體疾病 線粒體腦肌病MELAS綜 合癥 MERRF綜合癥 Leigh綜合癥 KG Diagnostics Confidential 已推出的遺傳病測序檢測項目已推出的遺傳病測序檢測項目-2-2 兒科血液病 嗜血細(xì)胞綜合征 范可尼貧血 先天性純合細(xì)胞再障 地中海貧血 血友病 遺傳性結(jié)締組 織疾病 新生兒馬凡氏綜合癥- FBN1基因測序 Loeys-Dietz綜合征- TGFBR1、TGFBR2基因 測序 遺傳性心血管疾病 載脂蛋白E基因分型 家族性高膽固醇血癥 LDLR基因檢測 遺傳性出血性毛細(xì)血 管擴(kuò)張癥的基因檢測 遺傳性淀粉樣變性 轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白TTR基 因測序 載脂蛋白A-I (APOA1)、 載脂蛋白A-II (APOA2) 基因檢測 KG Diagnostics Confidential 已推出的遺傳病測序檢測項目已推出的遺傳病測序檢測項目-3-3 免疫缺陷遺傳 病 X