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1、親權(quán)指數(shù)的計(jì)算 北京華生恒業(yè)科技有限公司 一、父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 1.父權(quán)指數(shù)與父權(quán)概率 父權(quán)概率:被檢測(cè)男子與孩子之間不排除親子關(guān)系時(shí), 被檢測(cè)男子是真正生父可能性的大小。(常用W表示) 父權(quán)指數(shù):被檢測(cè)男子與孩子之間不排除親子關(guān)系時(shí), 嫌疑男子作為生父的機(jī)會(huì)是隨機(jī)男子的作為生父的機(jī) 會(huì)的多少倍。(常用PI表示) PI=似然比(LR)*前概率比 (在沒(méi)有明確的非遺傳證據(jù)時(shí),前概率比為0.5/0.5=1) 簡(jiǎn)化后PI=LR=爭(zhēng)議父為生父的概率/隨機(jī)男子為生父 的概率 1.父權(quán)指數(shù)與父權(quán)概率 PI=LR=爭(zhēng)議父為生父的概率/隨機(jī)男子為生父的概率 若爭(zhēng)議父為生父的概率=X 隨機(jī)男子為生父的概率=Y P
2、I=X/Y 父權(quán)概率W=X/(X+Y)=PI/(1+PI) 2.父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 2.12.1三聯(lián)體父權(quán)指數(shù)的計(jì)算三聯(lián)體父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 PI=X/Y X=嫌疑父基因頻率*母親基因頻率*嫌疑父把基因遺傳 給孩子的概率*母親把基因遺傳給孩子的概率 Y=嫌疑父基因頻率*母親基因頻率*隨即男子把基因遺 傳給孩子的概率*母親把基因遺傳給孩子的概率 公式再進(jìn)行簡(jiǎn)化: X=嫌疑父把基因遺傳給孩子的概率 Y=隨即男子把基因遺傳給孩子的概率 2.父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 2.12.1三聯(lián)體父權(quán)指數(shù)的計(jì)算三聯(lián)體父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 PI=X/Y 母親基因型母親基因型孩子基因型孩子基因型嫌疑父基因嫌疑父基因 型型 PI PRPQQS
3、PI=1/(2q) PRPQQQPI=q/2 PQPQQRPI=1/2(p+q) PQPQPQPI=1/(p+q) 例如第一種情況時(shí) X=0.5*0.5+0*0 Y=0.5*q+0*p 故PI=1/(2q) 2.父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 2.22.2二聯(lián)體父權(quán)指數(shù)的計(jì)算二聯(lián)體父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 PI=X/Y,母親沒(méi)有參加檢驗(yàn),基因型不確定,看成一 個(gè)隨機(jī)個(gè)體。 孩子基因型孩子基因型嫌疑父基因型嫌疑父基因型PI PQQRPI=1/(4q) PQQQPI=1/(2q) PQPQPI=1/(4p)+1/(4q) QQPQPI=1/(2q) QQQQPI=1/q 例如第一種情況時(shí) X=0.5*p+0*q Y=pq+
4、pq=2pq 故PI=1/(4q) 2.父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 2.32.3雙親皆疑父權(quán)指數(shù)的計(jì)算雙親皆疑父權(quán)指數(shù)的計(jì)算 PI=X/Y X=孩子為嫌疑父與嫌疑母所生概率 Y=孩子為隨機(jī)男與隨機(jī)母所生概率 二、PI算法與ITO算法 1.二者的描述 父權(quán)指數(shù)PI=LR=P(爭(zhēng)議父為生父)/P(隨機(jī)男子為生父) 親緣關(guān)系指數(shù)=LR=P(該親緣關(guān)系)/P(無(wú)親緣關(guān)系) 兩種算法之間的關(guān)系? (PI為二聯(lián)體時(shí)) 2.二者計(jì)算結(jié)果 3.結(jié)論 A.兩種算法在結(jié)果上具有一致性 B.兩種算法的生物學(xué)意義不同: ITO兩個(gè)個(gè)體不賦予任何生物學(xué)意義。 二聯(lián)體PI計(jì)算首先考慮了二者存在相同的等位基因; 若無(wú)相同的等位基因,在
5、不考慮突變的情況下,二者 的關(guān)系是不成立的。 三、STR分型技術(shù)親權(quán)關(guān) 系鑒定的標(biāo)準(zhǔn) 三聯(lián)體判斷 不對(duì)實(shí)驗(yàn)室的要求和分析技術(shù)體系的要求進(jìn)行總 結(jié),只總結(jié)STR分型結(jié)果。 STR 分型結(jié)果符合下述條件者可做出否定親生關(guān) 系的結(jié)論: 出現(xiàn)4個(gè)或更多矛盾 STR 基因座 累計(jì)PI值11000 三聯(lián)體判斷 STR分型結(jié)果符合下述條件者可以描述為肯定或支持 親生關(guān)系: 起碼檢測(cè)15個(gè)STR基因座爭(zhēng)議父與孩子之間沒(méi)有發(fā)現(xiàn) 矛盾基因座; 或檢測(cè)19個(gè)STR基因座只發(fā)現(xiàn)1個(gè)矛盾基因座; 或檢測(cè)28個(gè)STR基因座只發(fā)現(xiàn)2個(gè)矛盾基因座; 或檢測(cè)35個(gè)STR基因座只發(fā)現(xiàn)3個(gè)矛盾基因座; 累計(jì)PI值10000,(親權(quán)
6、概率W0.9999假定前概率 0.5) 二聯(lián)體判斷 STR 分型結(jié)果符合下述條件者可做出否定親生關(guān) 系的結(jié)論: 出現(xiàn)3個(gè)或更多矛盾 STR 基因座 累計(jì)PI值11000 二聯(lián)體判斷 STR分型結(jié)果符合下述條件者可以描述為肯定或支持 親生關(guān)系: 起碼檢測(cè)18個(gè)STR基因座爭(zhēng)議父與孩子之間沒(méi)有發(fā)現(xiàn) 矛盾基因座; 或檢測(cè)29個(gè)STR基因座只發(fā)現(xiàn)1個(gè)矛盾基因座; 或檢測(cè)41個(gè)STR基因座只發(fā)現(xiàn)2個(gè)矛盾基因座; 累計(jì)PI值10000,(親權(quán)概率W0.9999假定前概率 0.5) STR分型軟件GeneMaker HID GeneMaker HID為美國(guó)FBI認(rèn)定的專(zhuān)家 系統(tǒng),基于微衛(wèi)星(STR)原理的
7、DNA分型分析技術(shù),獲得的圖形數(shù)據(jù), 經(jīng)過(guò)一系列算法處理獲得生物DNA特 征數(shù)據(jù)。 /about-us/lab/biometric- analysis/codis/codis-and-ndis-fact-sheet 美國(guó)FBI指定的13個(gè)STR位點(diǎn)及對(duì) GeneMaker HID認(rèn)定的網(wǎng)址 美國(guó)多位專(zhuān)家發(fā)文章將GeneMaker HID與同類(lèi)軟件進(jìn)行比較,并 指出GeneMaker HID以其他軟件相比可減少18%-73%分析工作量, 節(jié)約40%的時(shí)間。 GeneMaker HID應(yīng)用應(yīng)用: a.親子鑒定(二聯(lián)體、三聯(lián)體親子鑒定) b.親緣關(guān)系鑒定(父子、同胞、半胞、祖孫、叔侄等親緣關(guān)系) c.混合樣本分析(用于犯罪現(xiàn)場(chǎng)和不明的人類(lèi)遺骸等
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