
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文檔簡介
1、NCBI序列提交方法NCBI提交序列有兩大類方式,一個(gè)是批量提交一個(gè)是單個(gè)序列提交。下面說的就是單個(gè)序列提交方式,這是最新的提交方式,由于NCBI更新很快,也許過段時(shí)間又不一樣了,主要是按鈕位置可能會(huì)變。首先要注冊(cè)一個(gè)自己的NCBI賬號(hào):點(diǎn)擊此處注冊(cè)然后登陸賬號(hào):在已登陸狀態(tài)下點(diǎn)擊Submit:點(diǎn)擊圖中標(biāo)記處選擇GengBank:點(diǎn)擊GO:選擇:Banklt:建議認(rèn)真閱讀填寫要求等:點(diǎn)擊Sign in to use Banklt點(diǎn)擊New Sub,下面是你提交的記錄,即使你提交過程中中斷了,也可以Continue!以下是具體提交過程:一.填寫基本信息二1. 圖中1是作者名字,可以添加作者名,F(xiàn)
2、irst和Last Name,填了就可以,其他可以不填。2. 圖中2是填是否出版,有三個(gè)選項(xiàng):未出版,正在出版,已經(jīng)出版。需要注意的是,如果選則未出版,需要在Title中注明,否則無法提交。3. 可以添加作者,然后Continue即可。三.這是選擇是用生么測(cè)序方法后的的序列1. 現(xiàn)在我們用的一次只能測(cè)一條序列的都是Sanger測(cè)序,下面的454等都代表儀器型號(hào),是我們現(xiàn)在說的高通量測(cè)序,簡單的書不同型號(hào)靈敏度不同。2. 這是選擇你測(cè)序是一個(gè)反應(yīng)還是幾個(gè)反應(yīng),就是你這條序列是一個(gè)測(cè)序結(jié)果就出來了,還是幾個(gè)測(cè)序結(jié)果拼在一起得到的結(jié)果,一代測(cè)序一個(gè)反應(yīng)最可信的測(cè)序范圍是50-750bp,根據(jù)實(shí)際選擇
3、,然后繼續(xù)。四 填寫序列信息:1.選擇什么時(shí)候公布你的序列信息,你可以選怎立刻,也可以選擇在以后的某一時(shí)間,如果你選擇了時(shí)間,那么即使你已經(jīng)上傳序列,有了序列號(hào),在時(shí)間未到的時(shí)候你也是找不到的。2.選擇你的序列是不是16SrRNA基因是細(xì)菌上編碼rRNA相對(duì)應(yīng)的DNA序列,可能有一個(gè)專門的庫,所以一般選擇NO3.選擇你的序列類型,1.我選了cDNA ,然后選擇是什么類型:是線性,我們一般的都是線狀的,還是環(huán)狀一般想線粒體,葉綠體或者各種質(zhì)粒都是現(xiàn)狀的。4.然后填寫你上傳了多少個(gè)序列,黏貼序列,注意序列一定要是FASTA格式。你也可以選擇上傳文檔,這個(gè)自己學(xué)。然后繼續(xù)兩次繼續(xù)。五填寫你上傳序列所
4、屬物種。然后即使繼續(xù)。六選擇你要你的序列式原始序列,就是你自己測(cè)序的序列,還是為已有序列做注釋。然后繼續(xù)。七序列信息1. 填寫你基因所屬細(xì)胞器2. 填寫你對(duì)基因的注釋,可以添加選項(xiàng),根據(jù)自己實(shí)際情況添加。3. 最下面可以添加你的PCR引物,然后繼續(xù),會(huì)讓你檢查,你檢查后繼續(xù)即可。八信息補(bǔ)充1. 填加序列信息,可以上傳文件,也可以選項(xiàng)填寫,建議用選項(xiàng)。2. 選擇你的信息,可以添加,然后繼續(xù)在上圖中選擇添加選項(xiàng),會(huì)讓你填寫模板是正鏈還是負(fù)鏈,如果是部分序列,是哪一端,產(chǎn)物是指你把序列通過BlastP比對(duì)后的到的序列號(hào)(qualifiers)和相似度(Value),然后Accept。跳轉(zhuǎn)后然后繼續(xù)。九最后會(huì)讓你最終檢
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