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文檔簡介

1、超高分辨率顯微鏡學(xué)習(xí)報告地空學(xué)院趙思源20141000215摘要:超高分辨率顯微鏡是近年來生命科學(xué)領(lǐng)域重要的研究手段之一。2014 年諾貝爾化學(xué)獎頒發(fā)給超高分辨率顯微技術(shù)領(lǐng)域的三位科學(xué)家,以表彰他們在該領(lǐng)域所作出的杰出貢獻。超高分辨率技術(shù)的典型代表有受激損耗、結(jié)構(gòu)光照明以及單分子定位等。這些技術(shù)的出現(xiàn)使得傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡難以分辨的細胞器、分子等細節(jié)信息可以被觀察到,幫助科學(xué)家從納米尺度認識細胞內(nèi)分子結(jié)構(gòu)、定位以及相互作用。關(guān)鍵詞:光學(xué)衍射極限 超分辨熒光成像 受激發(fā)射損耗 隨機顯微重構(gòu) 單分子成像Abstract: Super-resolution microscopy is one of th

2、e advanced means for the study of life sciences. The 2014 Nobel prize in Chemistry was awarded to three scientists for their contributions to the super-resolution microscopy. Representative techniques achieving super-resolution are stimulated-emission, structured-illumination, and singlemolecule loc

3、alization. The advancement of these techniques enable the visualization of the detail in cell organelle, macromolecules, and the localization of molecules. Such kind of information was unresolvable under traditional optical microscopes and will help understand the structure, location, interaction of

4、 molecules within cells in nanometer scale.Key words: Optical diffraction limit; Super-resolution fluorescence imaging; Stimulated emission depletion (STED) ; Stochastic reconstruction microscopy; Single molecule imaging1 光學(xué)顯微成像的衍射極限生物醫(yī)學(xué)成像技術(shù)是基礎(chǔ)生物學(xué)研究和臨床醫(yī)學(xué)最重要的工具之一?;仡櫄v史,已有多位科學(xué)家憑借在成像技術(shù)方面的突破獲得諾貝爾獎。其中,oen

5、tgen 因發(fā)現(xiàn) X 射線獲得 1901 年諾貝爾物理學(xué)獎; Zernike 因發(fā)明相襯顯微鏡獲得 1953 年諾貝爾物理學(xué)獎; uska 的電子顯微鏡以及 Binning 和 Rohrer 的掃描隧道顯微鏡獲得 1986 年諾貝爾物理學(xué)獎; Lauterbur 和 Mansfield 因發(fā)明核磁共振成像技術(shù)共同獲得 2003 年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎。在剛剛過去的 2014 年,諾貝爾獎評審委員會再一次肯定成像技術(shù)的重要性,將諾貝爾化學(xué)獎授予發(fā)展超分辨率熒光顯微成像技術(shù)的 3 位科學(xué)家。他們分別是來自美國霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所的 Eric Betzig、德國馬普生物物理化學(xué)所的 Stef

6、an WHell和美國斯坦福大學(xué)的William EMoerner(圖1) 。圖 1 獲得 2014 年諾貝爾化學(xué)獎的 3 位科學(xué)家光學(xué)顯微成像的起源大約可以追溯到16世紀(jì)末荷蘭眼鏡商Janssen和他的兒子發(fā)明的原始光學(xué)顯微鏡。他們把兩個凸透鏡安裝在一個筒中,發(fā)現(xiàn)這種組合可以放大物體。在之后的幾十年中,荷蘭人Anthony Von Leeuwenhoek和英國人Robert Hooke在成像原理和實踐中不斷改進,實現(xiàn)了現(xiàn)代光學(xué)顯微鏡的雛形。Leeuwenhoek第一次觀察到了牙縫中的細菌; 而Hooke則于1665年在顯微鏡下看到了軟木塞的微小結(jié)構(gòu)并將其命名為細胞(cell),成為生物學(xué)研究

7、的一個里程碑。在接下來的300 多年里,各種基于光學(xué)顯微的生物成像技術(shù)不斷涌現(xiàn),生物學(xué)家也因此取得了一個接一個重大發(fā)現(xiàn)。雖然光學(xué)顯微鏡如此有用,但生物學(xué)家一直不滿意其分辨率。特別是細胞生物學(xué)家在觀察細胞內(nèi)部結(jié)構(gòu)時圖像模糊,無法看清楚細節(jié)。在實際操作中,有多種因素會影響光學(xué)成像的清晰度,包括樣品自身的背景光以及對光的吸收、散射和折射等光與物質(zhì)的相互作用過程,也包括物鏡的色差、球差、透光度和成像元件的靈敏度等硬件因素。在這些因素之外,光學(xué)成像的分辨率的理論極限則是由光的衍射決定的。早在1835年,英國科學(xué)家George BAiry就提出了“愛里斑(Airy disk) ”的概念( 圖 2) : 由

8、于光的衍射,即使一個無限小的發(fā)光點在通過透鏡成像時都會形成一個彌散的圖案,即愛里斑,而其在像平面處的光強分布函數(shù)稱為這個光學(xué)系統(tǒng)的點擴散函數(shù)(point spread function,PSF) 。圖 2George B Airy 和他提出的愛里斑1873年,德國著名科學(xué)家Ernst Abbe揭示了由于光學(xué)成像有限孔徑下光的衍射效應(yīng)產(chǎn)生的Airy disk與成像分辨率之間的關(guān)系,即著名的阿貝光學(xué)衍射極限理論(Abbe's diffraction limit)。d = (1)式中d是分辨率,是光的波長,n是介質(zhì)的折射率,是聚焦光錐的半角。nsin又稱為數(shù)值孔徑(numerical ape

9、rture,NA)?;谶@個公式可以看出,對于可見光波段(波長400 700nm)以水為介質(zhì)的成像,由于水的折射率為1.33,而sin最大值是1,則其分辨率極限約為 150nm。當(dāng)然,角無法達到90度,而實際上水鏡的數(shù)值孔徑(NA) 一般在1左右。所以通??梢远x成像分辨率約為光的波長的一半,即當(dāng)兩個點光源相距200nm以內(nèi)時,它們的 Airy disk 會有很大的重疊而無法區(qū)分; 同時這個公式也限定了光束聚焦形成光斑的最小尺寸約為光波長的一半。阿貝光學(xué)衍射極限理論給了我們基本的物理極限,意義重大,因此 Abbe 的這個經(jīng)典公式也成為了他墓碑上的全部內(nèi)容(圖3) 。圖 3Ernst Abbe

10、揭示了光學(xué)成像中著名的阿貝光學(xué)衍射極限理論( Abbe's diffraction limit) ,其經(jīng)典公式成為他墓碑上的全部內(nèi)容關(guān)于阿貝光學(xué)衍射極限還有兩點值得一提。一是該衍射極限對分辨率的限制也適用于其他基于物質(zhì)波成像的技術(shù),從 X 射線到超聲成像。像 X 射線和電子顯微鏡的成像波長遠遠小于可見光的波長,因此有非常高的空間分辨率。但可惜這兩個技術(shù)目前在活體成像方面還有很多困難,另外也不容易像熒光顯微鏡一樣對目的分子實現(xiàn)特異成像和觀察。另外一點是這個 200nm的分辨率極限正好對生物學(xué)研究有很大的制約。首先,很多亞細胞結(jié)構(gòu)和細胞器的尺度都是幾百納米到幾微米,而最常用的模式生物之一大

11、腸桿菌也就是2微米長、0.5 微米粗。在這些情況下,200nm的分辨率極限制約了我們對于細節(jié)的觀察。另外,細胞本身是高度擁擠的,即使目的分子的細胞內(nèi)濃度只有 1mol/L,在光學(xué)衍射極限的 200nm 見方的立方體中也有 5 個目的分子,而衍射極限的存在卻使我們無從知道這個體積內(nèi)的具體分子數(shù)目,也無法區(qū)分它們。因此,生物學(xué)研究迫切地需要“突破”衍射極限的超高分辨率顯微成像技術(shù)。2 “突破”光學(xué)顯微成像的衍射極限實際上,衍射極限是一種遠場(far-field) 效應(yīng),在近場(near-field) 條件下無效。因此早期的一些嘗試突破光學(xué)衍射極限的努力都是基于近場光學(xué)成像的。像這次諾貝爾獎得主 E

12、ric Betzig 就早在 1993年發(fā)展了掃描近場光學(xué)顯微鏡,首次實現(xiàn)了室溫下的單分子超分辨率成像。然而,近場光學(xué)顯微鏡無法用于細胞內(nèi)部的成像,因此在生物領(lǐng)域的應(yīng)用一直沒有發(fā)展起來。后期的各種“突破”光學(xué)衍射極限的努力都是在遠場條件下發(fā)展起來的。超高分辨率顯微成像一般指在遠場條件下基于熒光的、“突破”衍射極限的光學(xué)顯微成像技術(shù)。熒光是物質(zhì)吸收光照后發(fā)出的一類光。物質(zhì)分子中的電子分布在不同的能級上。當(dāng)一束光打到分子,分子具有一定的概率吸收光子,同時其處在基態(tài)的電子會躍遷到更高能量的激發(fā)態(tài)能級。處在激發(fā)態(tài)的電子有多種途徑回到基態(tài),其中一條途徑就是發(fā)出一個光子(熒光) ,釋放能量回到基態(tài)。發(fā)射光

13、子的能量小于被吸收的光子,因此熒光的波長比激發(fā)光的波長要長。熒光顯微鏡利用了熒光發(fā)射光波長比吸收光波長較長這一重要原理,通過光路設(shè)計,分開激發(fā)光和發(fā)射光,大幅降低了成像的背景。結(jié)合靈敏的檢測器件,在優(yōu)化條件下,熒光顯微鏡還可以檢測單個熒光分子發(fā)出的極其微弱的熒光,成為單分子成像的最佳選擇,其發(fā)展也奠定了這次諾貝爾化學(xué)獎的半壁江山。除了低背景和高靈敏度,熒光顯微鏡還通過對特定分子進行標(biāo)記,具備很高的特異性。這一系列特點使得熒光顯微鏡成為生物學(xué)研究中最常用的一種光學(xué)顯微鏡。超高分辨率熒光顯微技術(shù)通過應(yīng)用一系列物理原理、化學(xué)機制和算法“突破”了光學(xué)衍射極限,把光學(xué)顯微鏡的分辨率提高了幾十倍,使我們能

14、以前所未有的視角觀察生物微觀世界。目前的超高分辨率熒光顯微技術(shù)大體可分為兩類,一類通過調(diào)制照明光斑縮小系統(tǒng)的點擴散函數(shù)來實現(xiàn)超分辨成像,主要貢獻者包括這次諾貝爾獎得主 Stefan Hell 以及 Mats Gustafsson; 另一類則是基于單分子定位的超分辨技術(shù),主要貢獻者包括這次諾貝爾獎得主 Eric Betzig、WEMoerner 以及哈佛大學(xué)莊小威教授和 Samuel Hess。2 1 基于點擴散函數(shù)調(diào)制的超分辨技術(shù)此次獲獎的德國科學(xué)家 Stefan Hell 現(xiàn)為德國哥廷根大學(xué)教授和德國馬克斯·普朗克生物物理化學(xué)研究所所長。他在1994 年還在做博士后的時候就最先提出

15、了受激發(fā)射損耗的方法(stimulated emission depletion,簡稱 STED) 來打破光學(xué)衍射極限。其原理非常樸素但卻十分巧妙。前面提到由于衍射極限的存在,光束聚焦的光斑尺寸不能無窮小,而是限定為光的波長的一半,這對應(yīng)了熒光顯微鏡中聚焦激光光斑的點擴散函數(shù)。理論上,如果能縮小激光光斑就可以實現(xiàn)超分辨成像。Hell 的基本想法是在激發(fā)光斑點擴散函數(shù)周圍套上一個環(huán)形點擴散函數(shù),以“擦除”激發(fā)光斑的外圍,從而使得激發(fā)光斑“變小”(圖4) 。在這里,Hell 利用了產(chǎn)生激光的受激輻射原理,用位相板產(chǎn)生環(huán)狀的激光光斑并套在激發(fā)光斑外。這個環(huán)狀光的波長匹配激發(fā)態(tài)到基態(tài)的能量差,同時功率

16、夠高,使得其區(qū)域內(nèi)處在激發(fā)態(tài)的熒光分子在環(huán)狀光照射下會發(fā)生整齊劃一的飽和受激輻射。因為受激輻射波長與自發(fā)輻射( 熒光) 不同,所以環(huán)狀光覆蓋的受激輻射可以被擋住,而環(huán)內(nèi)的自發(fā)輻射則是我們需要的熒光。由于環(huán)狀光的孔徑理論上可以通過增加激光強度無限縮小,這樣就可以獲得一個小于衍射極限的熒光激發(fā)點。這樣,Hell 的方法就更改了 Abbe 的衍射極限公式: d=2nsin1+I/lIs (2)式中 Is 是飽和受激輻射的激光強度,I 是環(huán)狀光的強度??梢?,隨著 I 的增加,STED 技術(shù)的分辨率可以無窮小。這個巧妙的思想在技術(shù)實現(xiàn)上當(dāng)時是非常困難的。Hell 經(jīng)過多年堅韌的努力,終于在 2000 年

17、實現(xiàn)了他在 1994 年提出的這個想法。他用一束激光激發(fā)熒光分子發(fā)光,再用另一束環(huán)狀激光消除激發(fā)光周邊的熒光,通過二維點掃描實現(xiàn)了超高分辨率成像,將光學(xué)顯微鏡分辨率提高了近 10 倍。然而由于熒光分子一般飽和光強較高,可達 100MW/cm2,因此環(huán)狀光需要極高的功率,大大加重了樣品的光損傷和光漂白,制約了 STED 技術(shù)在生物中的應(yīng)用。從 2000 年開始,Hell 的團隊不斷改進 STED 技術(shù),包括通過相似原理發(fā)明了基態(tài)損耗( ground state depletion,GSD)等一系列超高分辨率顯微技術(shù),使其更加圖 4 德國科學(xué)家 Stefan Hell 發(fā)明的受激發(fā)射損耗的方法適用

18、于生物研究。后期,Hell 團隊將 STED 的思想進一步延展,將這種利用飽和激發(fā)壓縮激發(fā)光點擴散函數(shù)并驅(qū)動熒光分子熒光態(tài)(亮態(tài)) 和非熒光態(tài)(暗態(tài)) 之間的轉(zhuǎn)化的方法統(tǒng)稱為可逆飽和線性熒光躍遷( reversible saturable optical linear fluorescence transitions,簡稱RESOLFT) ,其分辨率統(tǒng)一由式(2) 描述。值得一提的是,Hell 早期發(fā)明的 STED 和 GSD 等技術(shù)是基于熒光分子電子能級的躍遷,這些狀態(tài)的躍遷及弛豫速率都非常快,因此需要很高的飽和光強來實現(xiàn)飽和受激輻射。為了進一步提高ESOLFT 技術(shù)的生物兼容性,Hell

19、團隊利用熒光分子的可逆構(gòu)像變化等化學(xué)過程對應(yīng)的可逆光開關(guān) (reversible photoswitch) 來實現(xiàn)超高分辨率成像?;诜肿踊瘜W(xué)過程的亮態(tài)和暗態(tài)間的轉(zhuǎn)化所需的飽和光強很小,大大降低了光損傷和光漂白。這類方法的不足之處在于其每個點的成像時間較長,所以通過點掃描成像將耗費太多時間。為此,Hell 團隊在 2013 年發(fā)明了一種平行 ESOLFT 方法(parallelized ESOLFT approach) ,將十萬個 STED 光斑排成一個矩陣來成像,用 rsEGFP 熒光蛋白在活細胞內(nèi)實現(xiàn)了約 1s 時間分辨率的超高分辨率成像。Stefan Hell 20 年來的一系列工作為超

20、分辨率熒光顯微成像技術(shù)的發(fā)展做出了巨大貢獻。在這個方面值得一書的還有美國科學(xué)家 Mats Gustafsson,他是光學(xué)成像領(lǐng)域公認的天才。Gustafsson 在 2000 年發(fā)明了基于結(jié)構(gòu)照明原理的超高分辨率技術(shù)8。這個技術(shù)基于兩個高空間頻率的圖案重疊可以形成低頻率莫爾條紋的原理,通過解析低頻莫爾條紋實現(xiàn)超高分辨率成像( 圖 5) 。這個技術(shù)使用起來非常簡單,對樣品制備也沒有任何特殊要求,因此非常適于細胞研究,但可惜分辨率只能提高一倍。在此基礎(chǔ)上,Gustafsson 在 2005 年發(fā)明了飽和 SIM,與 ESOLFT 原理相似,利用熒光飽和實現(xiàn)更高的分辨率,其本質(zhì)也是點擴散函數(shù)的縮小。

21、可惜 Gustafsson 于 2011 年 51 歲時因癌癥英年早逝,無緣分享這次的諾貝爾獎。圖 5 美國科學(xué)家 Mats Gustafsson 基于莫爾條紋原理發(fā)明的結(jié)構(gòu)照明超高分辨率技術(shù)2 2 基于單分子定位的超分辨技術(shù)另一大類超分辨熒光顯微成像技術(shù)的發(fā)明是基于單個熒光分子的定位。雖然 Abbe 衍射極限指出無法區(qū)分相距約 200nm 的兩個熒光分子,但是通過提取單個熒光分子的愛里斑信息卻可以實現(xiàn)對這個熒光分子的精確定位。對單個熒光分子的成像嘗試最早可以追溯到 1976 年,T Hirschfeld 使用基于全內(nèi)反射式的近場照明方式實現(xiàn)了對單個蛋白抗體分子的熒光觀察。但他當(dāng)時在抗體上標(biāo)記

22、了數(shù)十個熒光基團,因此并非對單個熒光分子的成像。這次獲獎的美國斯坦福大學(xué)教授 W E Moerner 是單分子熒光技術(shù)的先驅(qū)人物。他于 1989 年在超低溫下首次實現(xiàn)了單個分子的吸收光譜測量11。這一開創(chuàng)性研究直接激發(fā)了后續(xù)的一系列單分子熒光方面的突破性工作。1990 年,MOrrit 在低溫下實現(xiàn)了對單個熒光分子的熒光測量; 同年,AKeller 等人則利用共聚焦顯微鏡和脈沖激發(fā)等方法在室溫下實現(xiàn)了對溶液中單個熒光分子的檢測。此次諾貝爾獎得主 Eric Betzig 則在 1993 年利用近場顯微鏡首次實現(xiàn)了常溫下單個熒光分子在表面的成像。1994 年,AKeller,SXie以及 SNie

23、,DChiu和 Zare 等人在單分子檢測方面接連取得突破; 而在 1995 年,日本 Yanagida 團隊使用全內(nèi)反射顯微鏡觀察到了熒光標(biāo)記的 ATP 分子和單個肌球馬達蛋白分子的相互作用,開創(chuàng)了單分子技術(shù)在生物系統(tǒng)中的應(yīng)用。利用單分子定位研究生物學(xué)問題最有影響力的一個工作是 2003 年 Yildiz 等人使用全內(nèi)反射單分子熒光顯微鏡追蹤 Cy3 熒光標(biāo)記的單個肌球馬達蛋白分子沿著肌動蛋白微絲的行走。在這個工作中,單個肌球蛋白分子的位置被精確定位,精度達幾納米,因此可以觀察到肌球馬達蛋白分子約 37 納米的步長,并推斷出其行走方式是像人一樣兩個腿交替邁進。這一高精度單分子熒光定位方法被稱

24、為 fluorescence imaging with 1-nm accuracy,簡稱 FIONA。其原理是基于 2002 年 Webb 等人的工作。他們指出,單個熒光分子的愛里斑雖然有幾百納米寬,但其光強度的分布卻像山峰一樣,峰尖對應(yīng)熒光分子的位置。這個類似于山峰的光子分布可以用一個二維高斯函數(shù)來擬合,其中心即為熒光分子的物理位置,而定位中心的誤差則由下式給出:i=Si2N+a2/12N+8Si4b2a2N2 (3)式中 i代表中心位置 在 x 和 y 方向上的定位誤差,i 指代 x 和 y 方向; Si 為高斯擬合在 x 和 y 方向上的標(biāo)準(zhǔn)偏差; N 為檢測到的光子數(shù); a 是探測器有

25、效像素尺寸; 而 b 為背景噪音。如果忽略像素尺寸和背景噪音的影響,可以看出單分子的定位精度與光子數(shù)的平方根成反比。與式( 1) 結(jié)合,則基于單分子定位的理論成像分辨率為:d=2nNsin (4)在通常情況下,一個熒光蛋白分子可檢測到的光子數(shù)約為幾百個,而一個熒光染料分子為幾千個。通過擬合找到峰尖,精確度高達幾納米,遠超衍射極限。因此通過單分子定位的原理可以將熒光成像的分辨率提高幾十倍。即便如此,還需要同時考慮的是解析一個結(jié)構(gòu)時的分辨率也是由采樣密度( 頻率) 決定的,即所謂 Nyquist-Shannon 采樣定律。該定律指出,為了解析一個空間頻率為 f 的信號,檢測的空間采樣頻率至少應(yīng)為

26、2f。換句話說,在超分辨熒光顯微鏡成像中,樣品的標(biāo)記密度至少應(yīng)為空間分辨率的 2 倍,如式(5) 所示:dsampling=21/dim (5)式中 dsampling為由采樣頻率決定的空間分辨率, 為熒光標(biāo)記密度,dim 為空間維度。因此,單分子定位的有效空間分辨率為:deff =dlocalization2+dsampling2 (6) 式(4) 的分辨率是基于每個衍射極限體積內(nèi)只有一個熒光分子,如果有兩個分子并且同時發(fā)光則還是無法分辨,也無法實現(xiàn)單分子定位。這就要求樣品的標(biāo)記密度很低,然而這樣會導(dǎo)致式(5)中的采樣分辨率大大下降??梢姡瑢畏肿语@微技術(shù)的高精度定位轉(zhuǎn)化為高分辨率的關(guān)鍵在于

27、如何在一個衍射極限體積中區(qū)分多個熒光分子。最早在概念上提出解決方案的是此次諾貝爾獎得主 Eric Betzig,他在發(fā)表于 1995 年的一篇文章中指出可以通過光譜來區(qū)分密集堆積的熒光分子并重構(gòu)出一幅超高分辨率圖像。由于可用的熒光分子種類及其光譜有限,且標(biāo)記方法繁瑣,該方法的實現(xiàn)相當(dāng)困難。盡管如此,這篇文章為之后的一系列工作打開了思路,使人們意識到可以利用熒光分子的各種過程和性質(zhì)來實現(xiàn)超高分辨率成像,其中包括熒光分子的光漂白、閃爍、結(jié)合-解離、以及光控轉(zhuǎn)化等。在 1997 年,WEMoerner 與憑借綠色熒光蛋白獲得 2008 年諾貝爾化學(xué)獎的 Tsien 合作發(fā)現(xiàn)了綠色熒光蛋白 GFP 的

28、光轉(zhuǎn)化效應(yīng)。他們發(fā)現(xiàn) GFP 在 488nm 的光照下發(fā)生閃爍并進入暗態(tài)。令人吃驚的是,這個暗態(tài)并非光漂白狀態(tài),而是可以被 405nm 的激光激活并在 488nm 激光激發(fā)下重新發(fā)熒光。這是第一次發(fā)現(xiàn)可以用光來控制一個熒光分子的發(fā)光狀態(tài),為基于單分子定位的超分辨技術(shù)打開了一扇大門。可惜的是,這扇已經(jīng)開啟的大門并未受到過多關(guān)注,直到 2002 年 JLippincott-Swartz 等人對 GFP 進行改造取得了性質(zhì)非常好的光激活熒光蛋白。此時,Eric Betzig 剛剛從工業(yè)界返回到學(xué)術(shù)界,他意識到這種光控?zé)晒獾鞍卓梢院苋菀椎貙崿F(xiàn)他在約 10 年前提出的想法。首先通過融合蛋白實現(xiàn)對樣品的高

29、密度熒光標(biāo)記,之后通過控制激光強度,使用非常微弱的 405nm 激光激活很少數(shù)目的熒光蛋白。因為這個激活過程是隨機的,所以激活的熒光蛋白分布稀疏而離散,就可以通過式(3) 進行精確的單分子定位。當(dāng)之前激活的熒光蛋白被 488nm 激光漂白后,405nm 激光將會激活另一批熒光蛋白進行單分子定位。如此多次反復(fù),就可以將高密度的熒光分子一一定位,同時滿足單分子高精度定位和 Nyquist-Shannon 采樣定律,把多張圖片疊加形成一幅超高分辨率圖像( 圖 6) 。意識到這一點后,Betzig 開始和 Lippincott-Schwarz 及HFHess合作以實現(xiàn)他的想法。圖 6 基于單分子定位的

30、超高分辨率成像技術(shù)由 Eirc Betzig、莊小威以及 Samuel Hess 3 個研究組在 2006 年分別獨立發(fā)明,包括 PALM、STOM 和 FPALM 技術(shù)。2006 年是超高分辨率熒光顯微技術(shù)發(fā)展的重要一年。在這一年,Betzig 和 Lippincott-Schwarz 以及 HFHess 合作發(fā)明了基于熒光蛋白單分子定位原理的 PALM( photoactivated localization microscopy) 技術(shù); 幾乎在同時,哈佛大學(xué)莊小威研究組發(fā)表了基于熒光染料單分子定位的 STOM( stochastic optical reconstruction mic

31、roscopy) 技術(shù); 隨后,Samuel Hess 研究組也獨立發(fā)明了 FPALM( fluorescence photoactivated localization microscopy) 技術(shù)27。它們在原理上都是基于熒光分子的光轉(zhuǎn)化能力和單分子定位(圖6) 。這種“以時間換空間”的思路非常巧妙,把熒光成像的分辨率一下子提高了 20 倍左右。加之這些技術(shù)實現(xiàn)比較容易,因此大大推動了超分辨熒光顯微鏡技術(shù)的成熟和在生物學(xué)研究中的廣泛應(yīng)用。莊小威教授本科畢業(yè)于中科大少年班,34 歲獲得哈佛大學(xué)的正教授職位,40 歲當(dāng)選美國科學(xué)院院士。作為 STOM 技術(shù)的發(fā)明人,莊小威教授一直領(lǐng)導(dǎo)并推進著超

32、高分辨率顯微技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用,包括在率先實現(xiàn)單分子超分辨技術(shù)的先后實現(xiàn)了多色、三維和活細胞高速成像以及在各種生物問題中的應(yīng)用; 她領(lǐng)導(dǎo)的團隊是近 8 年來這個領(lǐng)域最活躍的研究團隊。除了 STOM/(F) PALM 技術(shù),還有幾種基于單分子定位或熒光分子閃爍的超高分辨率熒光顯微技術(shù),包括 PAINT( points accumulation for imaging in nanoscale topography),SOFI( super-resolution optical fluctuation imaging)和 3B( bayesian analysis of bleaching and

33、blinking)。這些技術(shù)的出現(xiàn)進一步豐富了超分辨技術(shù)的選擇和應(yīng)用范圍。3 總結(jié)與展望超高分辨率熒光顯微成像作為一類很新的技術(shù),突破了光學(xué)成像中的衍射極限,把傳統(tǒng)成像分辨率提高了 1020 倍,達到了幾十納米,把我們從顯“微”鏡時代帶入到顯“納”鏡時代。對生物學(xué)家而言,好比一個近視眼的人突然戴上了合適的眼鏡,從而可以用前所未有的視角觀察奇妙的生物微觀世界,揭示前所未見的生物微觀結(jié)構(gòu)和現(xiàn)象。這些超分辨技術(shù)在過去的七八年間不斷進步,同時也已經(jīng)在生物學(xué)研究中廣泛應(yīng)用,包括細胞膜蛋白分布、細胞骨架、線粒體、染色質(zhì)、神經(jīng)元突觸以及原核生物的研究等。超高分辨率技術(shù)一出現(xiàn)就引起廣泛關(guān)注,先是在 2006

34、年被世界著名期刊 Science 評為年度 10 大技術(shù)突破,接著被生物醫(yī)學(xué)方法學(xué)最好的期刊 Nature Methods 評為 2008 年年度方法。在 2014 年 10 月的 Nature Methods10 周年特刊評出的 10 年 10 大技術(shù)中,超高分辨率熒光顯微成像和單分子技術(shù)都出現(xiàn)在榜中,并幾乎在同時獲得 2014 年諾貝爾化學(xué)獎。展望未來,超高分辨率顯微技術(shù)的發(fā)展趨勢應(yīng)該是更高、更快、更深( 即更高的空間分辨率、更快的時間分辨率以及更深的成像深度) ,這與生物醫(yī)學(xué)成像越來越多地應(yīng)用于活體研究的趨勢需求是一致的。與這些趨勢相對應(yīng)并值得關(guān)注的幾個方面可以大致歸納如下。首先是通過進

35、一步的物理成像、化學(xué)修飾原理創(chuàng)新,發(fā)展新型的超分辨技術(shù)和標(biāo)記技術(shù)。目前的各種超分辨技術(shù)時間分辨率都不夠,成像深度更是不能滿足在體成像的需求。其中,提高超分辨技術(shù)時間分辨率,需要結(jié)合新型成像器件,例如更快的掃描元件,更靈敏的檢測元件等; 實現(xiàn)更深的成像深度和解決在體成像需求,還需考慮到組織對光子的散射作用,結(jié)合自適應(yīng)光學(xué)和組織透明化( CLAITY) 技術(shù)是解決這一問題的關(guān)鍵之一。第二是進一步發(fā)展和優(yōu)化熒光探針,比如提高探針的亮度、光穩(wěn)定性、轉(zhuǎn)換速率以及發(fā)射波長等。為解決現(xiàn)有探針的信噪比差、光漂白嚴(yán)重等缺陷,開發(fā)新型高亮度、高穩(wěn)定的熒光探針成為推動超分辨技術(shù)的保證。例如上轉(zhuǎn)換納米材料,熒光鉆石,石墨烯量子點等無機染料。此外,結(jié)合現(xiàn)有探針和超分辨技術(shù),發(fā)展新型超分辨標(biāo)記技術(shù),如聯(lián)合標(biāo)記、特異性活細胞標(biāo)記染料、量子點等。第三是注重模態(tài)融合。生命體組成跨越了很大的空間尺度,而不同尺度下的生命功能、結(jié)構(gòu)和過程都緊密聯(lián)系和互相影響。沒有哪種技術(shù)能兼顧時間分辨

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