lncRNA芯片技術(shù)服務(wù)

1、In cRNA芯片技術(shù)服務(wù)長鏈非編碼RNA(IncRNA是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過 200nt的RNA分子， 它們并不編碼蛋白，而是以 RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)調(diào)控基因的表達(dá)水平。隨著越來越多的In cRNA被發(fā)現(xiàn)，人們開始關(guān)注到IncRNA在各種生物學(xué)過程以及疾病中所發(fā)揮的功能。通過In cRNA芯片，研究人員能夠快速高通量地獲得與特定生物學(xué)過程或者疾病相關(guān) 的IncRNA信息。Ln cRNA芯片服務(wù)我們?yōu)槟峁┟绹鳤rraystar公司IncRNA芯片的全程技術(shù)服務(wù)，該芯 片覆蓋目前所有權(quán)威數(shù)據(jù)庫所注釋的長鏈非編碼RNA是目前市面上唯一一款以In cRN

2、A為主，數(shù)據(jù)庫版本最新，覆蓋最全面的In cRNA芯片。Arraystar 公司IncRNA芯片產(chǎn)品列表:服務(wù)名稱U-R l_L 心片規(guī)格描述Huma n In cRNA Microarray ServiceHuman In cRNAArray12X 135K覆蓋Refseq 18,874條蛋白編碼 mRNA以及 NCBI Refseq，UCSC Known Gene NREDRNAdb等多個數(shù)據(jù)庫的18,534條 In cRNAMouse In cRNA Microarray ServiceMouse In cRNAArray FullVersio n4X 44K覆蓋 NCBI Refseq

3、，UCSC Known Gene NREDRNAdb Fantom3等多個數(shù)據(jù)庫的 40,023 條 IncRNAMouse In cRNAArray Stringent Versio n4X 44K覆蓋Refseq 19,465條蛋白編碼 mRNA以及 NCBI Refseq，UCSC Known Gene NREDFantom3等多個數(shù)據(jù)庫的13,868條In cRNA(stri ngent)Rat In cRNAMicroarray ServiceRat I ncRNAArray4X 44K覆蓋Refseq 15,283條蛋白編碼 mRNA以及 NCBI Refseq，UCSC Know

4、nGene，等多個數(shù)據(jù)庫的9,319條In cRNA可靠的數(shù)據(jù)來源IncRNA芯片覆蓋所有來自 Refseq (2009)，UCSCCnownGene( 2009)，NRE(2009)，RNAdb(2006), Fantom3等多個權(quán)威數(shù)據(jù)庫注釋為IncRNA的轉(zhuǎn) 錄本，并在此基礎(chǔ)上收錄了 相關(guān)文獻(xiàn)中報道的IncRNA,是目前覆蓋最為全面的 In cRNA 芯片。優(yōu)質(zhì)的探針設(shè)計ArraystarIncRNA芯片設(shè)計探針為60mer的長寡核苷酸，這些長寡核苷酸探針在高嚴(yán)謹(jǐn)雜交條件下可得到高靈敏度及高特異性的理想實驗結(jié)果。與mRN表達(dá)相結(jié)合IncRNA 芯片還覆蓋最新的Refseq數(shù)據(jù)庫中所有mR

5、N( proteincoding )的轉(zhuǎn)錄本。因此，在一次雜交實驗中，可以同時檢測 mRNA和IncRNA 的表達(dá)水平，并根據(jù)相關(guān)的 mRNAl達(dá)水平變化將鑒定出的IncRNA和已知的信 號通路聯(lián)系起來。常規(guī)IncRNA芯片研究流程缶芯片賽定差異表達(dá)ImRNAb.碾耘曲平額 鏈特異性RT-PC R驗證表達(dá)差異 寧RACE &于RACE克隆全長 基因組定儘及序列保守性芬析桃選特定興趣卿蟻人硏究c. IncRNA*能研究* siRNA干擾&外源過表達(dá)分析 表達(dá)譜芯片分析下游基因康成生物IncRNA芯片技術(shù)服務(wù)實驗流程1. 樣品總RNA抽提若實驗對象為組織樣品，取適量(50-100m

6、g)新鮮組織樣品或正確保存的組 織樣品，加1ml的RNA抽提試劑Trizol (Invitrogen )，勻漿后抽提RNA若實驗對象為細(xì)胞樣品，每份樣品取 1X1061X107細(xì)胞，完全吸去培養(yǎng)液 后加1ml的RNA抽提試劑Trizol (Invitrogen )，裂解后抽提RNA2. RNA質(zhì)量檢測使用Na nodrop測定RNA在分光光度計260nm 280nm和230nm的吸收值，以 計算濃度并評估純度。使用甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳檢測 RNA屯度及完整性3. cDNA樣品合成和標(biāo)記4. 芯片雜交在標(biāo)準(zhǔn)條件下將標(biāo)記號的探針和高密度基因組芯片進行雜交。5. 圖像采集和數(shù)據(jù)分析使用GenePix 4000B芯片掃描儀掃描芯片的熒光強度，并將