聚類分析和NMDS分析的基本步驟

1、聚類分析和NMDS分析的基本步驟以 z q夏季重量為例1.打開primer,選擇已經(jīng)輸入為“站位x種類漁獲率” 矩陣的excel文件（圖1）。在excel file properties對(duì)話框按照默認(rèn)選項(xiàng)。 Sample data properties對(duì)話框也按照,默認(rèn)選項(xiàng)， Title可以輸 入標(biāo)志此表的名稱。2.打開excel文件如圖，注息行首名稱為samples ，列首為variables 。 Samples即聚類分析中的樣本，variables即聚類分析中的指標(biāo)。我們就是要把這么多種類的漁獲率作為指標(biāo)來 分析站位間的相似性。Samples*"q"*>3.生成相

2、似性矩陣。選擇 data>similarity ,在similarity對(duì)話框含義如圖。PRIIKR分析哪個(gè)序列的相似性>計(jì)算多位空間距離的方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)變的方法,圣法使用四次方根， 但我不JCH491 |MJ2E|ZDMJK591 ZD -MJK570| ZH-MJK5+5|MJ2O |MJ16MJIOEDMJK的 |MJ 能ZD+kggZDWJT55l|田氏四益耳00112年14A?DDnal5D.D737153.2920001DG23雙00口0aDD0na011.D500班靖0QQg0等5型QQ0Q0QQ0義城拍00000000Q0Q0展無料烏00Bill0QD0DD000

3、0置母弼ID000QD0DD035.9205300小修椎身掘17 SI034.41花13a前274 SB1魄制S31.E457B.&3S9.5527nm249.%35740%254 39JM003CL0DD5a 350a0flQ多蛇的枳品00aBDDn 1G3.19294門始21905方F聃0000Q9的0JIM0Q0耕口0000000Q0Q00知道什么原因選中表示在分析前對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,建議選中4 .相似性矩陣如下:5 .聚類分析：選擇 analyse >cluster, cluster對(duì)話框選擇如圖，聚類按照群組平均值P PRI1ERFile Edi t Vi ewCLUS

4、TER.MDS.MVDISP.RELATE.2STAGE.ANOSIM.AB0SIM2.Oji t i ons Window Help結(jié)果:Ffiu 口匚i回回I OSI 83I 35I MIri-nr-JII式*n E-fsYTi-M 113 宏良 I sentI 一品 f 一崽F3Z 號(hào)I 00具 IM屋I mH-忘出二 hihI建艮RB TEEsf 耨HI門息6 .NMDS ：回至ij相似性矩陣窗口，選擇 analyse>MDS,RELATE結(jié)果的初步分析，從 cluster圖可以看出有四個(gè)，那么最后可以在站點(diǎn)圖上把每一個(gè)類的站 位都改成一樣的，就看出在空間上的相似趨勢(shì)來了。全部按照默認(rèn)值，ok即可。結(jié)果如下可以調(diào)整字體等來顯示CLUSTER .MVDISF .EiJi!由 一加工 1111bdor卬圉口| 4| x>|n| 司朝，| T|Opti ons Window HelpDllHl <1郵項(xiàng)ANDSIM2.jnwainr；n-皿便由加.10ZIMIJES3T3-