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1、20種氨基酸Table 2.2 Abbreviations foraminoAmino addThree-letter abbreviationOnsetter abbreviationAmino acidThree-letter abbreviationOne-letter abbreviationAUnineAhAM«th ionineMetMArginineArgRPhenylalaninePheFAsparagineAsnNProlineProPAspartic acidAspDSerineSerSCysteine5cThreonineThrTGlutamin*GinQTry
2、ptophanTrpWGlutamic addGluETyrosineTyrYGlycineGlyGValineVaiVHistidineHisHAsparagine orAsxBIwleucinelie1a&partit acidLeucineL«uLGlutamine erGlxZLysineL斡Kglutamic addisW.H.nrruri脂肪側(cè)鏈aliphatic side較大的氨基酸是疏水的氨基酸,它們?cè)谒袑⒋睾隙慌c水接觸,可溶,但水溶性較差,脂溶性好。水溶性蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性來(lái)自于蛋白質(zhì)疏水氨基酸 側(cè)鏈簇合,即疏水效應(yīng)。名稱英文結(jié)構(gòu)甘氨酸丙氨酸頡氨酸亮
3、氨酸glycine/? g la? ?sin,/ alanine/?l ? nin/vali ne/?v?l?i n/leuci ne/?lu?s in/異亮氨酸isoleucine/?a ? s? lu?sin/特性無(wú)手性C大脂肪側(cè)鏈大脂肪側(cè)鏈大脂肪側(cè)鏈甲硫氨酸脯氨酸苯丙氨酸絡(luò)氨酸色氨酸絲氨酸蘇氨酸天冬酰胺谷氨酰胺methionine/me ? 0 a?ni:n/proli ne/ ?pro?li n/tyrosine/ ? ta? r? sin/大脂肪側(cè)鏈唯一成環(huán)氨基酸,氨基酸的側(cè)鏈既與:-碳原子結(jié)合又與-氨基N-原子結(jié)合,缺phenylalanine/? f? n?l?ltryptoph
4、an/ ? tr? pt? f? n/serine/? s? r?in /threonine/? 0 ri?iin/asparagine/? sp? r? d? in/glutamine/? glut? min/側(cè)鏈有芳香環(huán),疏水氨基酸酪氨酸的芳香環(huán)有一個(gè)羥基。與其他氨基酸側(cè)鏈呈化學(xué)惰性相吲哚基團(tuán)替代丙氨酸側(cè)鏈的氫原子。吲哚基團(tuán)有的兩個(gè)環(huán)融合在一鏈有極性但不帶電荷基團(tuán)側(cè)鏈有羥基與 故疏水性連。親水,其反應(yīng)活性比丙氨肪鏈相連。親水,其反應(yīng)活性比丙氨酸和頡氨酸大得多。有第二個(gè)不對(duì)稱碳原子,極性但不帶電荷。含酰胺的極性但蛋白質(zhì)的蘇氨酸只有一種構(gòu)型。氨基酸極性但不帶電荷。含酰胺的極性氨基酸極性不帶電。
5、結(jié)構(gòu)上類似蘇氨酸,但 是用巰基替代了羥基。 巰基比羥基活 潑。一對(duì)巰基靠近可以形成二硫鍵,穩(wěn)定蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。半胱氨酸cysteine/ s ? st? in/胱氨酸cyst in e/ ? s? s?tin /賴氨酸lysine/?la ? ? sin/帶電荷的氨基酸,高度親水,側(cè)鏈長(zhǎng),末端是氨基,在中性pH精氨酸argi nin e/? a rd? nin/組氨酸histidine/? h? st? ? din/時(shí)側(cè)鏈末端帶正電荷。帶電荷,高度親水,側(cè)鏈長(zhǎng),末端是胍基,在中性衛(wèi)H時(shí)側(cè)鏈末端 帶電荷,高度親水,側(cè)鏈含有咪唑基,咪唑基是芳香 環(huán),也能被質(zhì)子化后帶正電荷。咪唑的pKa值接近于6,在中性pH附近的溶液中咪唑基既可以質(zhì)子化 也可以不帶電荷,實(shí)際情況取決于咪唑基團(tuán)所在的局 部環(huán)境。組氨酸常在酶的活性中心。在酶促反應(yīng)中咪唑環(huán)既可以結(jié)合質(zhì)子,有可以釋放質(zhì)子。天冬氨酸aspartate/? sp a rtet/酸性氨酸。常被稱為天冬氨酸鹽,主要是強(qiáng) 調(diào)在生理pH溶液中側(cè)鏈基團(tuán)解離,因此帶谷氨酸glutamate/?
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