現(xiàn)代分子生物學(xué)名詞解釋

1、第一章 緒論1分子生物學(xué)是研究核酸、蛋白質(zhì)等生物大分子的結(jié)構(gòu)與功能，并從分子水平上闡明蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)與核酸之間的互作及其基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理的學(xué)科。2醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)是分子生物學(xué)的一個(gè)重要分支，是從分子水平上研究人體和疾病相關(guān)生物在正常和疾病狀態(tài)下的生命活動(dòng)及其規(guī)律，從分子水平上開展人類疾病的預(yù)防、診斷和治療研究的一門科學(xué)。3順反子是編碼一條多肽鏈的單位。有關(guān)基因就是一個(gè)順反子 4 C值（C value）：?jiǎn)伪扼w基因組中DNA的含量。第2章 染色體與DNA1基因：基因是產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必須的全部核苷酸序列,是決定遺傳性狀的功能單位。2 基因組：細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體的遺傳物

2、質(zhì)的總和。3C值矛盾也稱C值悖論，指生物體的進(jìn)化程度與基因組大小之間不完全成比例的現(xiàn)象。4DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)是 指4種脫氧核苷酸的連接（磷酸二酯鍵）及其排列順序， DNA序列是這一概念的簡(jiǎn)稱。5DNA 的二級(jí)結(jié)構(gòu)是指兩條多核苷酸鏈反向平行盤繞所產(chǎn)生的雙螺旋結(jié)構(gòu)。6DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)是指DNA雙螺旋進(jìn)一步扭曲盤繞所形成的特定空間結(jié)構(gòu)。是一種比雙螺旋更高層次的空間構(gòu)象。7DNA的半保留復(fù)制是由親代DNA生成子代DNA時(shí)，每個(gè)新形成的子代DNA中，一條鏈來自親代DNA，而另一條鏈則是新合成的，這種復(fù)制方式稱半保留復(fù)制。8復(fù)制子是DNA復(fù)制時(shí)在復(fù)制的局部將鏈解開，形成復(fù)制單位，稱為復(fù)制子。9 復(fù)制叉是 復(fù)

3、制時(shí)DNA雙鏈解開分成二股單鏈新鏈沿著張開的二股單鏈生成，復(fù)制中形成的這種 Y 字形的結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉10 DNA的半不連續(xù)復(fù)制是DNA復(fù)制時(shí)其中一條子鏈的合成是連續(xù)的，而另一條子鏈的合成是不連續(xù)的，故稱半不連續(xù)復(fù)制。11前導(dǎo)鏈?zhǔn)窃贒NA復(fù)制時(shí)，合成方向與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致并連續(xù)合成的鏈為前導(dǎo)鏈；合成方向與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反，形成許多不連續(xù)的片段，最后再連成一條完整的DNA鏈為滯后鏈。12在DNA復(fù)制過程中，前導(dǎo)鏈能連續(xù)合成，而滯后鏈只能是斷續(xù)的合成5 3 "¢的多個(gè)短片段，這些不連續(xù)的小片段稱為岡崎片段13體外定向突變（離體定向誘變）：是指利用分子克隆技術(shù)在已知DNA序

4、列中特異地產(chǎn)生所需位點(diǎn)的突變。14重組修復(fù)被稱為“復(fù)制后修復(fù)”，修復(fù)的對(duì)象是子代DNA。損傷的DNA先進(jìn)行復(fù)制，在子代DNA損傷互補(bǔ)的部位出現(xiàn)缺口，通過分子間重組，將另一個(gè)子代完好的片段移至缺口處，再填補(bǔ)重組產(chǎn)生的缺口。15SOS反應(yīng)是細(xì)胞DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的經(jīng)濟(jì)狀況下，細(xì)胞為求生存而產(chǎn)生的一種應(yīng)急措施。16DNA的轉(zhuǎn)座，或稱位移，是由可位移因子介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。17DNA的轉(zhuǎn)座：由可移位因子介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。18轉(zhuǎn)座子（transposon）：存在與染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位。19反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（retrotransposon）：指通過RNA為中介，反轉(zhuǎn)

5、錄成DNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)座的可動(dòng)元件。 20復(fù)合轉(zhuǎn)座子是一類帶有某些抗藥性基因（或其他宿主基因）的轉(zhuǎn)座子，其兩翼往往是兩個(gè)相同或高度同源的IS序列 21復(fù)合型轉(zhuǎn)座子還有一類無IS序列、體積龐大的的轉(zhuǎn)座子（5000bp以上）TnA家族。22組蛋白是染色體的結(jié)構(gòu)蛋白，其與DNA組成核小體。根據(jù)其凝膠電泳性質(zhì)可將其分為H1、H2A、H2B、H3及H4。23真核細(xì)胞基因組最大的特點(diǎn)是好有大量的重復(fù)序列，而且功能DNA序列大多被不編碼蛋白質(zhì)的非功能DNA所隔開，這就是著名的“C值反?，F(xiàn)象”24不重復(fù)序列。在單倍體基因組里，這些序列一般只有一個(gè)或幾個(gè)拷貝，它占DNA總量的40%80%。不重復(fù)序列長(zhǎng)約750200

6、0dp，相當(dāng)于一個(gè)結(jié)構(gòu)基因的長(zhǎng)度。單拷貝基因通過基因擴(kuò)增仍可合成大量的蛋白質(zhì) 。如蠶絲心蛋白基因。25中度重復(fù)序列。 這類重復(fù)序列的重復(fù)次數(shù)在10104之間，占總DNA的10%40%。各種rRNA、tRNA 及組蛋白基因等都屬這一類。26高度重復(fù)序列衛(wèi)星DNA。 這類DNA只在真核生物中發(fā)現(xiàn)，占基因組的10%60%，由6100個(gè)堿基組成，在DNA鏈上串聯(lián)重復(fù)幾百萬(wàn)次。由于堿基的組成不同，在CsCl密度梯度離心中易與其他DNA分開，形成含量較大的主峰及高度重復(fù)序列小峰，后者又稱衛(wèi)星區(qū)帶（峰）。27核小體是由H2A、H2B、H3、H4各兩個(gè)分子生成的八聚體和由大約200bpDNA組成的。28螺線管

7、是由10nm染色質(zhì)細(xì)絲盤繞形成的螺旋管狀細(xì)絲，表現(xiàn)為30nm纖維。29順式作用元件：是指基因序列中可在原位發(fā)揮作用并影響其在物理上相連的基因表達(dá)的保守結(jié)構(gòu)。如啟動(dòng)子、上游啟動(dòng)子元件、增強(qiáng)子、終止子等。30反式作用因子：是指真核細(xì)胞內(nèi)含有的大量可以通過直接或間接結(jié)合順式作用元件而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì)因子。如RNA聚合酶。第3章 生物信息的傳遞（上） 從DNA到RNA1 DNA序列是遺傳信息的貯存者，它通過自主復(fù)制得到永存，并通過轉(zhuǎn)錄生成信使RNA，翻譯生成蛋白質(zhì)的過程來控制生命現(xiàn)象。2轉(zhuǎn)錄是指拷貝出一條與DNA鏈序列完全相同(除了TU之外）的RNA單鏈的過程，是基因表達(dá)的核心步驟。3翻譯是指

8、以新生的mRNA為模板，把核苷酸三聯(lián)遺傳密碼子翻譯成氨基酸序列、合成多肽鏈的過程，是基因表達(dá)的最終目的。4轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱性：在RNA的合成中，DNA的二條鏈中僅有一條鏈可作為轉(zhuǎn)錄的模板，稱為轉(zhuǎn)錄的不對(duì)稱性。5與mRNA序列相同的那條DNA鏈稱為編碼鏈(有意義鏈)；將另一條根據(jù)堿基互補(bǔ)原則指導(dǎo)mRNA合成的DNA鏈稱為模板鏈(反義鏈)。6DNA分子上轉(zhuǎn)錄出RNA的區(qū)段，稱為結(jié)構(gòu)基因。7啟動(dòng)子：指RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。一段位于結(jié)構(gòu)基因5端上游的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之與模板DNA準(zhǔn)確地結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。8模板識(shí)別是、RNA聚合酶與啟動(dòng)子DNA雙鏈相互

9、作用并與之相結(jié)合的過程。轉(zhuǎn)錄起始前，啟動(dòng)子附近的DNA雙鏈分開形成轉(zhuǎn)錄泡以促使底物核糖核苷酸與模板DNA的堿基配對(duì)。9轉(zhuǎn)錄起始就是RNA鏈上第一個(gè)核苷酸鍵的產(chǎn)生。10上游和下游：以編碼鏈為準(zhǔn)， 5端一側(cè)為上游，3端一側(cè)為下游；11RNA聚合酶離開啟動(dòng)子，沿DNA鏈移動(dòng)并使新生RNA鏈不斷伸長(zhǎng)的過程就是轉(zhuǎn)錄的延伸12轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)是指與新生RNA鏈第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)DNA鏈上的堿基，通常為嘌呤13轉(zhuǎn)錄單元 是一段從啟動(dòng)子開始至終止子(terminator)結(jié)束的DNA序列。 14如果把Pribnow區(qū)從TATAAT變成AATAAT就會(huì)大大降低其結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄水平，使該啟動(dòng)子發(fā)生下降突變(down mu

10、tation)；15如果增加Pribnow區(qū)的共同序列，將乳糖操縱子的啟動(dòng)子中的TATGTT變成TATATT，就會(huì)提高啟動(dòng)子的效率，稱為上升突變(up mutation)。16在DNA分子上（基因末端）提供轉(zhuǎn)錄停止信號(hào)的DNA序列稱為終止子17因子是一個(gè)相對(duì)分子質(zhì)量為2.0×105的六聚體蛋白。18零類帽子（cap0）：第一個(gè)甲基出現(xiàn)在所有真核細(xì)胞的mRNA中（單細(xì)胞真核生物mRNA主要是這個(gè)結(jié)構(gòu)），由鳥苷酸-7甲基轉(zhuǎn)移酶催化，稱為零類帽子。19 1類帽子(cap1)：如在第二個(gè)核苷酸(原mRNA 5第一位)的2-OH位上加另一個(gè)甲基，這步反應(yīng)由2-O-甲基轉(zhuǎn)移酶完成。一般把有這兩個(gè)

11、甲基的結(jié)構(gòu)稱為1類帽子。真核生物中以這類帽子結(jié)構(gòu)為主。20 2類帽子(cap2): 在某些生物細(xì)胞內(nèi)，mRNA鏈上的第三個(gè)核苷酸的2-OH位也可能被甲基化，因?yàn)檫@個(gè)反應(yīng)只以帶有1類帽子的mRNA為底物，所以被稱為2類帽子。只占有帽mRNA總量的10%-15%以下。21不連續(xù)基因： 真核生物在編碼多肽鏈的核苷酸序列中間存在著與氨基酸編碼無關(guān)的DNA序列，即一個(gè)基因編碼序列被分隔成不連續(xù)的若干區(qū)段，稱為真核生物的不連續(xù)基因22 外顯子：編碼蛋白質(zhì)的序列。23內(nèi)含子：初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物hnRNA加工產(chǎn)生成熟mRNA時(shí)被切除的間隔序列。24終止子：DNA上與轉(zhuǎn)錄終止有關(guān)的序列。25增強(qiáng)子：位于真核基因中遠(yuǎn)離

12、轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)，能明顯增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄效率的特殊DNA序列。它可位于被增強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄基因的上游或下游，也可相距靶基因較遠(yuǎn)。26并與其它蛋白一起構(gòu)成一個(gè)大的顆粒復(fù)合體,稱為剪接體27RNA的編輯是 轉(zhuǎn)錄后的RNA在編碼區(qū)發(fā)生堿基的加入、丟失或轉(zhuǎn)換等現(xiàn)象。是發(fā)生于mRNA水平的遺傳信息的改變，但DNA模板并未發(fā)生改變，其產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)不能從基因組DNA序列中推導(dǎo)出來。28序列經(jīng)過轉(zhuǎn)錄后加工，是可有多用途分化的，因此也稱作分化加工。29編輯（editing）是指轉(zhuǎn)錄后的RNA在編碼區(qū)發(fā)生堿基的加入，丟失或轉(zhuǎn)換等現(xiàn)象。 30把RNA編碼和讀碼方式的改變稱為RNA 的再編碼 31單順反子mRNA：只編碼一個(gè)蛋白質(zhì)的m

13、RNA。32多順反子mRNA：編碼多個(gè)蛋白質(zhì)的mRNA。、33DNA變性：在物理或化學(xué)因素的作用下，導(dǎo)致兩條DNA鏈之間的氫鍵斷裂，而核酸分子中的所有共價(jià)鍵則不受影響。34DNA復(fù)性：當(dāng)促使變性的因素解除后，兩條DNA鏈又可以通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合形成DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。35退火：指將溫度降至引物的TM值左右或以下，引物與DNA摸板互補(bǔ)區(qū)域結(jié)合形成雜交鏈。15、核酶ribozyme：具有催化活性的RNA，在RNA的剪接加工過程中起到自我催化的作用。36管家基因（House-keeping gene）：在生物體生命的全過程都是必須的，且在一個(gè)生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的基因。37奢侈基因（lu

14、xury gene）：又稱可調(diào)節(jié)基因（regulated gene）、可誘導(dǎo)基因，是在特殊類型的細(xì)胞中為特化功能蛋白質(zhì)編碼的基因，其表達(dá)和調(diào)控都受環(huán)境條件的影響。第4章 生物信息的傳遞（下） 從mRNA到蛋白質(zhì)1 翻譯：指將mRNA鏈上的核甘酸從一個(gè)特定的起始位點(diǎn)開始，按每三個(gè)核甘酸代表一個(gè)氨基酸的原則，依次合成一條多肽鏈的過程。2遺傳密碼：是mRNA分子上按照53方向，每三個(gè)核苷酸與一種氨基酸對(duì)應(yīng)，全部64種組合所形成的體系。3密碼子：每一個(gè)三聯(lián)核苷酸的順序稱為密碼子，也叫三聯(lián)體密碼。4終止密碼：也稱無意密碼子沒有對(duì)應(yīng)的tRNA的反密碼子與之結(jié)合，但能被蛋白質(zhì)合成的終止因子或釋放因子識(shí)別，終

15、止肽鏈的合成。5閱讀框架：指mRNA中從特定位點(diǎn)開始的，一段含有翻譯密碼的堿基序列6由一種以上密碼子編碼同一個(gè)氨基酸的現(xiàn)象稱為簡(jiǎn)并，對(duì)應(yīng)于同一氨基酸的密碼子稱為同義密碼子7tRNA不僅為每個(gè)三聯(lián)密碼子翻譯成氨基酸提供了接合體，還為準(zhǔn)確無誤地將所需氨基酸運(yùn)送到核糖體上提供運(yùn)送載體，它又被稱為第二遺傳密碼。8無義突變：在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因中，一個(gè)核苷酸的改變可能使代表某個(gè)氨基酸的密碼子變成終止密碼子（UAG、UGA、UAA），使蛋白質(zhì)合成提前終止，合成無功能的或無意義的多肽，這種突變就稱為無義突變。 9錯(cuò)義突變：由于結(jié)構(gòu)基因中某個(gè)核甘酸的變化使一種氨基酸的密碼子變?yōu)榱硪环N氨基酸的密碼子，這種基因突變

16、叫錯(cuò)義突變。10S-D序列：是原核細(xì)胞中mRNA和核糖體識(shí)別、結(jié)合的位點(diǎn)。11原核生物: 30S小亞基首先與mRNA模板相結(jié)合，再與fMet-tRNAfMet結(jié)合，最后與50S大亞基結(jié)合。12真核生物: 40S小亞基首先與Met-tRNAMet相結(jié)合，再與模板mRNA結(jié)合，最后與60S大亞基結(jié)合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始復(fù)合物。第 五 章 分子生物學(xué)研究法（上）DNA、RNA及蛋白質(zhì)操作技術(shù)1基因工程：指在體外將核酸分子插入病毒、質(zhì)粒或其它載體分子，構(gòu)成遺傳物質(zhì)的新組合，使之進(jìn)入原先沒有這類分子的寄主細(xì)胞內(nèi)并進(jìn)行持續(xù)穩(wěn)定的繁殖和表達(dá)。2基因工程技術(shù)是核

17、酸操作技術(shù)的一部分，只不過它強(qiáng)調(diào)了外源核酸分子在另一種不同的寄主細(xì)胞中的繁衍與性狀表達(dá)。3限制酶是一類專門切割DNA的酶，能識(shí)別雙鏈DNA分子中的某種特定核苷酸序列，并與其特異結(jié)合，并在識(shí)別位點(diǎn)或其周圍切割雙鏈DNA的一類核酸內(nèi)切酶。4穿梭質(zhì)粒載體指由人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和選擇記號(hào)，可在兩種不同的寄主細(xì)胞中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。5細(xì)菌轉(zhuǎn)化是指一種細(xì)菌菌株由于捕獲了來自供體菌株的DNA而導(dǎo)致性狀特征發(fā)生遺傳改變的過程。6PCR技術(shù)是一種在體外快速擴(kuò)增特定基因或DNA序列的方法。7Ct值是產(chǎn)物熒光強(qiáng)度首次超過設(shè)定閾值時(shí)，PCR反應(yīng)所需的循環(huán)數(shù)。8基因組DNA文庫(kù)：是把某種生物的基因組DN

18、A切成適當(dāng)大小，分別與載體組合，導(dǎo)入微生物細(xì)胞，形成克隆。匯集包含基因組中所有DNA序列的克?。ɡ碚撋厦總€(gè)序列至少有一個(gè)代表），這樣的克隆片段的總匯，稱為基因組DNA文庫(kù)。9cDNA 文庫(kù)是指某生物某發(fā)育時(shí)期所轉(zhuǎn)錄的全部 mRNA 經(jīng)反轉(zhuǎn)錄形成的 cDNA 片段與某種載體連接而形成的克隆的集合。10基因文庫(kù)的篩選是指通過某種特殊方法從基因文庫(kù)中鑒定出含有所需重組DNA分子的特定克隆的過程。11SNP是Single Nucleotide Polymorphism的縮寫，即單核苷酸多態(tài)性，指基因組DNA序列中由于單個(gè)核苷酸（A，T，C和G）的突變而引起的多態(tài)性。SNP是基因組中最簡(jiǎn)單最常見的多態(tài)性

19、形式，具有很高的遺傳穩(wěn)定性。12基因分型是指利用數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的SNP進(jìn)行特定人群的序列和發(fā)生頻率的研究，主要包括基因芯片技術(shù)、Taqman技術(shù)、分子信標(biāo)（molecular beacons）技術(shù)和焦磷酸測(cè)序法13分子信標(biāo)（molecular beacon）技術(shù)是一種呈莖環(huán)結(jié)構(gòu)的熒光標(biāo)記的寡核苷酸，環(huán)狀區(qū)與靶序列特異性結(jié)合，莖干區(qū)由5-8個(gè)堿基對(duì)組成，5端帶有熒光發(fā)生基團(tuán)，3端帶有熒光淬滅基團(tuán)。第 六 章 分子生物學(xué)基本研究法（下）基因功能研究技術(shù)1 RNA的選擇性剪接是指用不同的剪接方式從一個(gè)mRNA前體產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體的過程。2原位雜交( In Situ Hybridizatio

20、n，ISH) 是用標(biāo)記的核酸探針，經(jīng)放射自顯影或非放射檢測(cè)體系，在組織、細(xì)胞、間期核及染色體上對(duì)核酸進(jìn)行定位和相對(duì)定量研究的一種手段，分為RNA和染色體原位雜交兩大類3 基因定點(diǎn)突變是通過改變基因特定位點(diǎn)核苷酸序列來改變所編碼的氨基酸序列，用于研究某個(gè)（些）氨基酸殘基對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、催化活性以及結(jié)合配體能力的影響，也可用于改造DNA調(diào)控元件特征序列、修飾表達(dá)載體、引入新的酶切位點(diǎn)等。4基因敲除又稱基因打靶，通過外源DNA與染色體DNA之間的同源重組，進(jìn)行精確的定點(diǎn)修飾和基因改造，具有專一性強(qiáng)、染色體DNA可與目的片段共同穩(wěn)定遺傳等特點(diǎn)。5完全基因敲除是指通過同源重組法完全消除細(xì)胞或者動(dòng)物個(gè)體中

21、的靶基因活性6條件型基因敲除是指通過定位重組系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)特定時(shí)間和空間的基因敲除。7基因芯片是在固相支持物上原位合成寡核苷酸或直接將大量DNA探針以點(diǎn)涂的方式有序地固化于支持物表面，然后與標(biāo)記的樣品雜交，通過對(duì)雜交信號(hào)的檢測(cè)分析，即可得出樣品的信號(hào)（基因序列或表達(dá)的信息。）8Taqman技術(shù)是PCR反應(yīng)系統(tǒng)中加入2種不同熒光標(biāo)記的分別與兩個(gè)等位基因配對(duì)的探針。9分子信標(biāo)（molecular beacon）技術(shù)是一種呈莖環(huán)結(jié)構(gòu)的熒光標(biāo)記的寡核苷酸，環(huán)狀區(qū)與靶序列特異性結(jié)合，莖干區(qū)由5-8個(gè)堿基對(duì)組成，5端帶有熒光發(fā)生基團(tuán)，3端帶有熒光淬滅基團(tuán)10焦磷酸測(cè)序技術(shù)是新一代DNA序列分析技術(shù)，該技術(shù)無須進(jìn)

22、行電泳，DNA片段也無須熒光標(biāo)記，操作極為簡(jiǎn)便。由4種酶催化的同一反應(yīng)體系中的酶級(jí)聯(lián)化學(xué)發(fā)光反應(yīng).11基因表達(dá)系列分析技術(shù)是以DNA序列測(cè)定為基礎(chǔ)分析全基因組表達(dá)模式的技術(shù)。12RNA的選擇性剪接是指用不同的剪接方式從一個(gè)mRNA前體產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體的過程13原位雜交( In Situ Hybridization，ISH) 是用標(biāo)記的核酸探針，經(jīng)放射自顯影或非放射檢測(cè)體系，在組織、細(xì)胞、間期核及染色體上對(duì)核酸進(jìn)行定位和相對(duì)定量研究的一種手段，分為RNA和染色體原位雜交兩大類。14基因定點(diǎn)突變是通過改變基因特定位點(diǎn)核苷酸序列來改變所編碼的氨基酸序列，用于研究某個(gè)（些）氨基酸殘基對(duì)蛋白

23、質(zhì)的結(jié)構(gòu)、催化活性以及結(jié)合配體能力的影響，也可用于改造DNA調(diào)控元件特征序列、修飾表達(dá)載體、引入新的酶切位點(diǎn)等。15 酵母單雜交系統(tǒng)（Yeast one-hybrid system）是上世紀(jì)90年代中發(fā)展起來的研究DNA-蛋白質(zhì)之間相互作用的新技術(shù)，在酵母細(xì)胞內(nèi)研究真核生物中DNA-蛋白質(zhì)之間的相互作用，并通過篩選DNA文庫(kù)直接獲得靶序列相互作用蛋白的編碼基因。16等離子表面共振技術(shù)是將誘餌蛋白結(jié)合于葡聚糖表面并固定于納米級(jí)厚度的金屬膜上。17免疫共沉淀技術(shù)(Co-IP)是將靶蛋白的抗體連接到固體基質(zhì)上，再將可能與靶蛋白發(fā)生相互作用的待篩選蛋白加入反應(yīng)體系中，用低離心力沉淀或微膜過濾法在固體基

24、質(zhì)和抗體的共同作用下將蛋白復(fù)合物沉淀到試管的底部或微膜上。18凝膠滯緩試驗(yàn)（electrophoretic mobility shift assay，EMSA），又叫作DNA遷移率變動(dòng)試驗(yàn)，是用于體外研究DNA與蛋白質(zhì)相互作用的一種特殊的凝膠電泳技術(shù)。19錯(cuò)義突變：DNA分子中堿基對(duì)的取代，使得mRNA的某一密碼子發(fā)生變化，由它所編碼的氨基酸就變成另一種的氨基酸，使得多肽鏈中的氨基酸順序也相應(yīng)的發(fā)生改變的突變。20無義突變：由于堿基對(duì)的取代，使原來可以翻譯某種氨基酸的密碼子變成了終止密碼子的突變。21同義突變：堿基對(duì)的取代并不都是引起錯(cuò)義突變和翻譯終止，有時(shí)雖然有堿基被取代，但在蛋白質(zhì)水平上沒

25、有引起變化，氨基酸沒有被取代，這是因?yàn)橥蛔兒蟮拿艽a子和原來的密碼子代表同一個(gè)氨基酸的突變。22移碼突變：在編碼序列中，單個(gè)堿基、數(shù)個(gè)堿基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可以使突變位點(diǎn)之后的三聯(lián)體密碼閱讀框發(fā)生改變，不能編碼原來的蛋白質(zhì)的突變。第七章 基因的表達(dá)與調(diào)控(上)原核基因表達(dá)調(diào)控模式1基因表達(dá)：指基因通過轉(zhuǎn)錄和翻譯而產(chǎn)生其蛋白質(zhì)產(chǎn)物，或轉(zhuǎn)錄直接產(chǎn)生其RNA產(chǎn)物(tRNA、rRNA)的過程。2順式作用元件是指與相關(guān)基因處于同一DNA分子上，能起調(diào)控作用的DNA序列。3反式作用因子是一個(gè)基因的產(chǎn)物，如蛋白質(zhì)或RNA(tRNA、rRNA),對(duì)另一個(gè)基因的表達(dá)具有調(diào)控作用，這些產(chǎn)物即被稱為

26、反式作用因子。4負(fù)調(diào)控系統(tǒng)：調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是阻遏蛋白，其與結(jié)構(gòu)基因特異位點(diǎn)的結(jié)合，阻止了RNA聚合酶的起始轉(zhuǎn)錄。如阻遏物缺乏或失活，則結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄開啟。5正調(diào)控系統(tǒng)：調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白，當(dāng)其處于活化狀態(tài)時(shí)與啟動(dòng)子結(jié)合以及和RNA聚合酶的相互作用幫助結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄起始。 6誘導(dǎo)調(diào)節(jié)是指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下，由原來關(guān)閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài)，即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化。這類基因中最突出的例子是大腸桿菌的乳糖操縱子。7可阻遏調(diào)節(jié)。這類基因平時(shí)都是開啟的，處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中，由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將其關(guān)閉，阻遏了基因的表達(dá)。比如大腸桿菌中的色氨酸操縱

27、子。8操縱子是原核細(xì)胞DNA上的一段區(qū)域，由若干功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因和控制這些基因表達(dá)的元件組成的一個(gè)完整的連續(xù)的功能單位。9弱化子： 一段位于結(jié)構(gòu)基因上游前導(dǎo)區(qū)，具有終止子結(jié)構(gòu)的短序列，通過前導(dǎo)序列轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的 mRNA 形成類似于終止子的二級(jí)結(jié)構(gòu)，達(dá)到轉(zhuǎn)錄終止的目的。10弱化作用：是使已經(jīng)起始的轉(zhuǎn)錄在RNA聚合酶到達(dá)第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因之前便終止，但該終止作用并不使所有正轉(zhuǎn)錄的mRNA全部中途停止，而僅部分終止。11分析前導(dǎo)序列發(fā)現(xiàn)，它包括起始密碼子AUG和終止密碼子UGA，能產(chǎn)生一個(gè)含有14個(gè)氨基酸的多肽，這個(gè)假設(shè)的多肽被稱為前導(dǎo)肽12前導(dǎo)序列：在trp mRNA5'端trpE基因的起始密

28、碼前一個(gè)長(zhǎng)162bp的mRNA片段。13信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)：外部信號(hào)通過傳感器（不直接傳遞給調(diào)節(jié)蛋白）接受，然后以不同方式傳到調(diào)節(jié)部位。14二組分系統(tǒng)：最簡(jiǎn)單的細(xì)胞信號(hào)系統(tǒng)，由2種不同的蛋白質(zhì)組成，傳感蛋白（位于細(xì)胞質(zhì)膜上，具有激酶活性，又稱傳感激酶）和應(yīng)答調(diào)節(jié)蛋白（位于細(xì)胞質(zhì)）15共生固氮微生物是指與一些綠色植物互利共生的固氮微生物。16轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子：與基因的啟動(dòng)區(qū)相結(jié)合，對(duì)基因的轉(zhuǎn)錄起激活或抑制作用的DNA結(jié)合蛋白17抗終止因子：在特定位點(diǎn)阻止轉(zhuǎn)錄終止的一類蛋白質(zhì)18 反義RNA：又稱干擾 mRNA 的互補(bǔ) RNA，簡(jiǎn)稱 micRNA 指與靶 mRNA具有互補(bǔ)序列的調(diào)控RNA，通過互補(bǔ) 的RNA序列

29、與特定靶 mRNA結(jié)合，起負(fù)調(diào)控作用19嚴(yán)緊因子（RelA）：是一種（p）ppGpp的合成酶，它可以催化ATP將焦磷酸加到另一個(gè)GTP或GDP的3位點(diǎn)。20在不同時(shí)期和不同條件下，基因表達(dá)的開啟或關(guān)閉以及基因活性的增加或減弱等是受到嚴(yán)格調(diào)節(jié)控制的，這種控制即基因表達(dá)調(diào)控。21輔阻遏物是在如果某種物質(zhì)能夠阻止細(xì)菌產(chǎn)生合成這種物質(zhì)的酶，這種物質(zhì)就是輔阻遏物。2270是調(diào)控最基本的生理功能如碳代謝、生物合成等基因的轉(zhuǎn)錄所必須的。23可誘導(dǎo)調(diào)節(jié)。是指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下，由原來關(guān)閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài)，即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化。這類基因中最突出的例子是大腸桿菌的乳糖操縱子。24

30、可阻遏調(diào)節(jié)是由這類基因平時(shí)都是開啟的，處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中，由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將其關(guān)閉，阻遏了基因的表達(dá)。比如大腸桿菌中的色氨酸操縱子。25 P區(qū)（即啟動(dòng)子區(qū)）一般是從I基因結(jié)束到mRNA轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)下游5-10bp。O區(qū)（即阻遏物結(jié)合區(qū)）位于-7+28位，該區(qū)的堿基序列有對(duì)稱性，其對(duì)稱軸在+11位堿基對(duì)。26trpE基因是第一個(gè)被翻譯的基因，與緊鄰的是啟動(dòng)子區(qū)和操縱區(qū)。前導(dǎo)區(qū)和弱化子區(qū)分別定名為trpL和trpa。27固氮微生物是將大氣中的N2還原為NH3的過程。第8章 基因的表達(dá)與調(diào)控(下)真核基因表達(dá)調(diào)控的一般規(guī)律1真核細(xì)胞中許多相關(guān)的基因常按功能成套組合，被稱

31、為基因家族2外顯子(Exon) ：真核細(xì)胞基因DNA中的編碼序 列，這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA并進(jìn)而翻譯為蛋白質(zhì)。3內(nèi)含子(Intron) ：真核細(xì)胞基因DNA中的間插序列，這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA，但隨即被剪除而不翻譯4組成型剪接：一個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物通過剪接只能產(chǎn)生一種成熟的mRNA。5選擇性剪接：同一基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物由于不同的剪接方式形成不同mRNA。6 基因擴(kuò)增是指某些基因的拷貝數(shù)專一性大量增加的現(xiàn)象，它使細(xì)胞在短期內(nèi)產(chǎn)生大量的基因產(chǎn)物以滿足生長(zhǎng)發(fā)育的需要，是基因活性調(diào)控的一種方式。7基因重排：將一個(gè)基因從遠(yuǎn)離啟動(dòng)子的地方移到距它很近的位點(diǎn)從而啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄，這種方式被稱為基因重排。8“基因”的分子生

32、物學(xué)定義是：產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必需的全部核苷酸序列。9增強(qiáng)子是指能使和它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列。10真核生物啟動(dòng)子和增強(qiáng)子是由若干DNA序列元件組成的，由于它們常與特定的功能基因連鎖在一起，因此被稱為順式作用元件11保守氨基酸的殘基與鋅離子結(jié)合，使中間的氨基酸殘基回折成一種手指狀結(jié)構(gòu)，稱為鋅指。12同源域：是指由60個(gè)保守氨基酸組成的結(jié)構(gòu)域。它存在于許多或幾乎所有真核生物的DNA結(jié)合蛋白中，負(fù)責(zé)與DNA結(jié)合。13分子伴侶或伴侶蛋白：HSP參與靶蛋白活性和功能的調(diào)節(jié)，卻不是靶蛋白的組成部分稱-14核心啟動(dòng)子：是指保證RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄正常起始所必需的、最少的DNA序列

33、，包括轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-25-30bp處的TATA盒。核心啟動(dòng)子確定轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)并產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄。15上游啟動(dòng)子元件是包括通常位于-70bp附近的CAAT盒（CCAAT）和GC盒（GGGCGG）等，能通過TFIID復(fù)合物調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始的頻率，提高轉(zhuǎn)錄效率。16保守氨基酸的殘基與鋅離子結(jié)合，使中間的氨基酸殘基回折成一種手指狀結(jié)構(gòu)，稱為鋅指。17依賴于cAMP的蛋白激酶稱為A激酶（PKA）18該蛋白激酶活性是依賴于Ca2+的，故稱C激酶（PKC）19能與某個(gè)（類）專一蛋白因子結(jié)合，從而控制基因特異表達(dá)的DNA上游序列稱為應(yīng)答元件第九章 疾病與人類健康1基因領(lǐng)域：基因與基因之間的間隔

34、距離2基因領(lǐng)域效應(yīng)：同一DNA鏈上兩個(gè)具有相同轉(zhuǎn)錄方向的基因間隔小于一定長(zhǎng)度時(shí)，影響有效轉(zhuǎn)錄所必需的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的形成，從而使這兩個(gè)基因中的一個(gè)或兩個(gè)均不能轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄活性顯著降低。3抑癌基因又名抗癌基因 、隱性癌基因。是一種抑制細(xì)胞生長(zhǎng)和腫瘤形成的基因。4癌是一群不受生長(zhǎng)調(diào)控而繁殖的細(xì)胞，也稱惡性腫瘤。5良性腫瘤是一群僅局限在自己的正常位置，且不侵染周圍其它的組織和器官的細(xì)胞。6原癌基因是細(xì)胞內(nèi)與細(xì)胞增殖相關(guān)的正?；?，是維持機(jī)體正常生命活動(dòng)所必須的，在進(jìn)化上高度保守7基因治療是人體細(xì)胞中自身基因的改變或外源病原體的基因產(chǎn)物與人體基因相互作用的結(jié)果。8基因診斷：以DNA或RNA為診斷材料，通過檢

35、查基因的存在、結(jié)構(gòu)缺陷或表達(dá)異常，對(duì)人體的狀態(tài)和疾病作出診斷的方法和過程。9細(xì)胞癌基因：存在于正常的細(xì)胞基因組中，與病毒癌基因有同源序列，具有促進(jìn)正常細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化和發(fā)育等生理功能。在正常細(xì)胞內(nèi)未激活的細(xì)胞癌基因叫原癌基因，當(dāng)其受到某些條件激活時(shí)，結(jié)構(gòu)和表達(dá)發(fā)生異常，能使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化。10病毒癌基因：存在于病毒（大多是逆轉(zhuǎn)錄病毒）基因組中能使靶細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化的基因。它不編碼病毒結(jié)構(gòu)成分，對(duì)病毒無復(fù)制作用，但是當(dāng)受到外界的條件激活時(shí)可產(chǎn)生誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生的作用。第十章基因和發(fā)育1T細(xì)胞受體（T cell receptor，TCR）是T淋巴細(xì)胞表面識(shí)別自身MHC-抗原肽復(fù)合物的受體，TCR識(shí)別抗原后其刺激信號(hào)是由CD3分子傳遞的。2Ig是由兩條相同的重鏈（H）和兩條相同的輕鏈（L），借其中形成的二硫鍵而彼此連接在一起的四肽鏈結(jié)構(gòu)分子。3可變區(qū)：H鏈N端的1/4和L鏈N端的1/2區(qū)域內(nèi)，氨基酸的種類、排列順序與構(gòu)型的變化很大，故稱。4恒定區(qū)： H鏈C端的3/4和L鏈C端的1/2區(qū)域內(nèi)，氨基酸的種類、排列順序與構(gòu)型相對(duì)恒定，故稱。5V區(qū)和C區(qū)不同片段在DNA分子水平上的各種排列組合是形成lg分子多態(tài)的根本原因，這種假設(shè)被稱為重組種系理論。6重鏈基因組合重排是指在DNA水平上由無功能V、D和J基因片段組合重排為有功能