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文檔簡介

1、 PubMed PubMed PubMed是美國是美國NLM所屬的國家所屬的國家生物技術信息中心(生物技術信息中心(NCBI)開發(fā)的一開發(fā)的一個以個以Web方式向用戶提供服務的生物方式向用戶提供服務的生物醫(yī)學文獻檢索系統(tǒng),醫(yī)學文獻檢索系統(tǒng),是是出版商提供的書目信息出版商提供的書目信息 PreMedlineOLDMEDLINE(1950-1965)MEDLINEl收錄范圍:收錄范圍:來源于美國和世界上來源于美國和世界上7070多個國多個國家和地區(qū)、家和地區(qū)、5050種語言的種語言的7395種種(截止到現(xiàn)截止到現(xiàn)在在)權威權威生物醫(yī)學生物醫(yī)學及相關學科期刊,內容及相關學科期刊,內容涉及生物醫(yī)學各個

2、領域;涉及生物醫(yī)學各個領域;85%以上以上原文為原文為英語,英語,80%記錄有文摘,記錄有文摘,5%免費全文。免費全文。目前記錄已達約目前記錄已達約2200萬條,約萬條,約40萬篇萬篇/年年 。l回溯時間:回溯時間:1966年至今年至今。l記錄中有記錄中有indexed for MEDLIEN標記標記l學科范圍學科范圍:l基礎生命科學基礎生命科學臨床生命科學臨床生命科學 l生物科學生物科學 解剖學解剖學l組織學組織學化學與藥物化學與藥物l心理學心理學社會醫(yī)學社會醫(yī)學l農業(yè)農業(yè) 醫(yī)技設備學醫(yī)技設備學 l醫(yī)技工業(yè)學醫(yī)技工業(yè)學 醫(yī)學信息學醫(yī)學信息學使用詞表:使用詞表:MeSH(醫(yī)學主題詞表)(醫(yī)學主

3、題詞表)l 是一種由是一種由正在加工處理正在加工處理中的文獻記錄組中的文獻記錄組成的數(shù)據庫,這些新記錄還未被或正在標引,成的數(shù)據庫,這些新記錄還未被或正在標引,暫時存放在暫時存放在PreMEDLINE數(shù)據庫中。數(shù)據庫中。每天更每天更新新,經過標引(增加主題詞、文獻類型、數(shù)據,經過標引(增加主題詞、文獻類型、數(shù)據庫存取號等字段)以后轉入庫存取號等字段)以后轉入Medline,一旦記一旦記錄被轉入到錄被轉入到Medline數(shù)據庫,就被從數(shù)據庫,就被從PreMEDLINE數(shù)據庫中刪除。數(shù)據庫中刪除。記錄中有記錄中有PubMed-in process的標記。的標記。Pre-Medline最新信息最新信

4、息MedlineNew DataCollectProcess一周以后一周以后 出版商提供的書目出版商提供的書目信息信息(Publisher-Supplied Citation ) 出版商直接向出版商直接向PubMed提供的非提供的非Medline收錄的電子刊物,記錄標有收錄的電子刊物,記錄標有Record as supplied by publishers標標記。(如:記。(如:Science或或Nature中的地質學中的地質學文獻等)。文獻等)。 標記不同,出自分庫亦不同標記不同,出自分庫亦不同Nucleotide:DNA序列數(shù)據庫序列數(shù)據庫Protein:蛋白質序列數(shù)據庫蛋白質序列數(shù)據庫G

5、enome:基因組序列數(shù)據庫基因組序列數(shù)據庫Structure:分子結構模型數(shù)據庫分子結構模型數(shù)據庫OMIM:人類孟德爾遺傳學在線數(shù)據庫人類孟德爾遺傳學在線數(shù)據庫PMC: PubMed中心,免費中心,免費全文期刊檢索全文期刊檢索3.特點特點|獲取生物醫(yī)學權威期刊最多 世界上70多個國家的7395種權威期刊|多種檢索方法,多條檢索途徑|時效性極強(每周更新)|回溯年代久遠(1950年至今)|利用MeSH作為轉換詞表,標引質量高|部分文獻可以免費獲取全文|檢全率、檢準率高免費進入免費進入PubMedPubMed途徑:途徑:http:/ http:/www.

6、/PubMed /sites/entrezl主頁結構主頁結構PUBMED提供了詞匯自動轉換功能:提供了詞匯自動轉換功能: MeSH轉換表轉換表期刊轉換表期刊轉換表短語表短語表作者姓名索引作者姓名索引邏輯運算符檢索邏輯運算符檢索(1)邏輯運算符: OR、AND、NOT 運算順序:ORANDNOT,可用()改變檢索詞的處理順序。(2)截詞符:*。eg: cell*:cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等詞的文獻。(3)利用字段標識符進行限定檢索: 檢索式格式:檢索詞A

7、字段標識B,檢索在字段中含有檢索詞A的文獻。 如: hepatitisTI,smith AU,cellTA。(4)“ ”,將短語做為不可分割的整體進行檢索。 如:“OXYGEN FREE RADICALS ”注意:注意:AND 必須大寫、必須大寫、 和和“ ”必須為英文或中文半必須為英文或中文半角。角。Pubmed簡單檢索實例簡單檢索實例例一例一 查找有關查找有關“肝癌和肝炎的關系肝癌和肝炎的關系”的文獻,英文的文獻,英文 “l(fā)iver cancer ” 和和 “hepatitis” 檢索結果顯示檢索結果顯示顯示檢索策略顯示檢索策略l例二例二 查找作者查找作者 Hemila h著作的文獻著作的

8、文獻在西文文獻里,著者的署名一般名在前姓在后,在西文文獻里,著者的署名一般名在前姓在后,例例:著者著者“Henry Hemila”應轉換成應轉換成“ Hemila h”,后加著者字段限定來檢索,后加著者字段限定來檢索,注意:姓在前,名在后注意:姓在前,名在后 姓全稱,名縮寫姓全稱,名縮寫檢索框檢索框預覽預覽檢索史檢索史限定檢索限定檢索30個字段Limits (限定)限定)Publication Types:有有7種類型種類型Languages:提供常用的提供常用的7種語種種語種Ages:共有共有13個年齡段個年齡段Gender:男性、女性男性、女性Human or AnimalSubsets(

9、子集):子集):11個主要子集個主要子集Dates:可檢索可檢索1965年至今的文獻年至今的文獻限定檢索限定檢索索引檢索索引檢索PubMed高級高級檢索實例檢索實例 例例: : 查找關于查找關于“鋅對于鋅對于2歲歲嬰兒嬰兒(即出生(即出生至至23個月個月)成長的作用成長的作用”(要求時間(要求時間200020002002008 8)的英文文獻)的英文文獻 步驟一,確定關鍵詞步驟一,確定關鍵詞Zinc Infant Growth,把它們輸入檢索框。把它們輸入檢索框。 步驟二,限定時間。點擊步驟二,限定時間。點擊。在其中的。在其中的Publication Date的輸入框內輸入的輸入框內輸入FRO

10、M2000 TO2008 . 步驟三,限定語種。在步驟三,限定語種。在Languages下拉菜單下拉菜單內選擇內選擇English。lMeSH Database:l例例1:從主題途徑查找:從主題途徑查找FK506副作用副作用l例例2:從主題途徑查找從主題途徑查找腎移植腎移植的文獻的文獻l例例3:從主題途徑查找阿司匹林治療高血壓的:從主題途徑查找阿司匹林治療高血壓的文獻文獻l檢索流程檢索流程l第一步:主題分析第一步:主題分析 英文轉換英文轉換lFK506 adverse effectslkidney transplantation點擊點擊MeSH Database Mesh界面界面 輸入檢索詞輸

11、入檢索詞 GoFK506第二步:第二步:選定該主題詞選定該主題詞 主題詞輪排表主題詞輪排表點擊該主題詞點擊該主題詞 主題詞細節(jié)屏主題詞細節(jié)屏 主題詞輪排主題詞輪排提示相關詞提示相關詞主題詞輪排表主題詞輪排表第三步:第三步:主題詞細節(jié)屏主題詞細節(jié)屏(主題詞詞義注釋、副主題詞、主題詞詞義注釋、副主題詞、加權或不擴展、入口詞、曾用詞、樹狀結構)加權或不擴展、入口詞、曾用詞、樹狀結構) 選擇合適的副主題詞選擇合適的副主題詞選擇加權或不擴展選擇加權或不擴展 send to 主題詞細節(jié)屏主題詞細節(jié)屏主題詞詞義注釋主題詞詞義注釋主題詞細節(jié)屏主題詞細節(jié)屏副主題詞選擇副主題詞選擇主題詞詞義注釋主題詞詞義注釋加權

12、檢索加權檢索不擴展檢索不擴展檢索曾用詞曾用詞藥理作用藥理作用樹狀結構樹狀結構曾用詞曾用詞入口詞入口詞樹狀結構樹狀結構藥理作用藥理作用 選擇發(fā)送方式選擇發(fā)送方式Search Box with ANDSearch Box with ORSearch Box with NOT 第四步:第四步:search box 點擊點擊 search PubMed 檢索結果檢索結果search box題錄格式界面題錄格式界面邏輯組配(邏輯組配(#4 and #6)l例:檢索利用阿司匹林治療高血壓的文例:檢索利用阿司匹林治療高血壓的文獻。獻。l分析:本課題包含兩個主題詞,即阿司分析:本課題包含兩個主題詞,即阿司匹林

13、(匹林(aspirin)aspirin)和高血壓和高血壓(hypertension)(hypertension),阿司匹林(,阿司匹林(aspirin) aspirin) 組配副主題詞治療應用(組配副主題詞治療應用(theraputic theraputic use)use),高血壓應組配副主題詞藥物療法,高血壓應組配副主題詞藥物療法(drug therapy)drug therapy),兩條檢索式之間用,兩條檢索式之間用andand聯(lián)接。聯(lián)接。 Pubmed主題詞檢索的功能:主題詞檢索的功能: (1)理解詞義和收入詞表的時間)理解詞義和收入詞表的時間 (2)限定副主題詞限定副主題詞 ,提高查

14、準率。提高查準率。 (3 3)加權檢索加權檢索,提高查準率。提高查準率。 (4)了解樹形結構了解樹形結構, ,擴展檢索,擴展檢索,提高查全率提高查全率 (5 5)了解同義詞,提高查全率。)了解同義詞,提高查全率。 lJournal Database (期刊數(shù)據庫期刊數(shù)據庫)l 可輸入刊名全稱、縮寫或國際標準期刊號(ISSN)檢索特定期刊的編目信息;l檢索: PubMed中收錄關于高血壓(hypertension)的期刊有哪些?l引文匹配器(Single Citation Matcher) nursing,2008,38(12):61 PubMed | 1、檢索結果的顯示與標記| 2、檢索結果的保存及定購 檢索結果顯示檢索結果顯示默認為題錄格式默認為題錄格式每頁顯示每頁顯示20條記錄條記錄結果顯示格式結果顯示格式每頁顯示記錄數(shù)每頁顯示記錄數(shù)結果排序方式結果排序方式純文本方式顯示純文本顯示記錄純文本顯示記錄文摘顯示格式文摘顯示格式MEDLINE格式格式可鏈接到可鏈接到SpringerLink數(shù)據庫數(shù)據庫獲取全文獲取全文 ,但是是收費的但是是收費的可鏈接到可鏈接到PubMed中心獲中心獲取免費全文取免費全文 全文鏈接圖標全文鏈接圖標選擇選擇“File”,可完成將記,可完成將記錄保存為文件;錄保存為文件;選擇選擇“clipboard”,可將記,可將記錄保存在剪貼板;錄保存在

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