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文檔簡(jiǎn)介
1、PubMed檢索系統(tǒng)簡(jiǎn)介PubMed系統(tǒng)是由美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的用于檢索MEDLINE、PreMED-LINE數(shù)據(jù)庫(kù)的網(wǎng)上檢索系統(tǒng)。MEDLINE是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館(U.S.National Library of Medicine)最重要的書目文摘數(shù)據(jù)庫(kù),內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、牙科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生保健和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)。收錄了全世界70多個(gè)國(guó)家和地區(qū)的4000余種生物醫(yī)學(xué)期刊,現(xiàn)有書目文摘條目1000萬(wàn)余條,時(shí)間起自1966年。 PreMEDLINE是一個(gè)臨時(shí)性醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)。它每天都在不斷地接受新數(shù)據(jù),可為用戶提供基本的文獻(xiàn)條目和文摘,其文獻(xiàn)條目在標(biāo)引和加工后每周向MEDLI
2、NE移加一次。 PubMed還通過電子通訊方式接受出版商提供的文獻(xiàn)條目數(shù)據(jù),這種條目帶有MEDLINE record in process的說(shuō)明,并標(biāo)有Record as supplied by publisher的標(biāo)識(shí)。這種條目每天都在不停地向PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)中傳送,但其中有些條目由于超出了MEDLARS數(shù)據(jù)庫(kù)的收錄范圍,將永遠(yuǎn)不會(huì)被PreMEDLINE或MEDLINE條目所取代,例如在綜合性的科學(xué)雜志(Science或Nature)上發(fā)表的地理學(xué)文章等。 PubMed 系統(tǒng)的主要特點(diǎn) 1.詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主頁(yè)的檢索提
3、問框中鍵入檢索詞,系統(tǒng)將按順序使用如下4種表或索引,對(duì)檢索詞進(jìn)行轉(zhuǎn)換后再檢索。 (1)MeSH轉(zhuǎn)換表(MeSH Translation Table),包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞,就會(huì)自動(dòng)將其轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH詞和TextWord詞(題名詞和文摘詞)進(jìn)行檢索。例如:鍵入“Vitamin h",系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成"Biotin MeSH Tems OR Vitamin h Textword"后進(jìn)行檢索。 (2)刊名轉(zhuǎn)換表(Journal Tanslation Table),包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN
4、號(hào)。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為“MEDLINE縮寫Journal Name"后進(jìn)行檢索。如:在檢索提問框中鍵入:“new england journal of medicine", PubMed將其轉(zhuǎn)換為"N Engl J Med Journal Name"后進(jìn)行檢索。 (3)短語(yǔ)表(Phrase list)。該表中的短語(yǔ)來(lái)自MeSH、含有同義詞或不同英文詞匯書寫形式的統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語(yǔ)言系統(tǒng)(UMLS: Unified Medical Language System)和補(bǔ)充概念(物質(zhì))名稱表Supplementary Concept (Substance
5、) Name。如果PubMed 系統(tǒng)在MeSH和刊名轉(zhuǎn)換表中未發(fā)現(xiàn)與檢索詞相匹配的詞,就會(huì)查找短詞表。 (4)著者索引(Author Index)。如果鍵入的詞語(yǔ)未在上述各表中找到相匹配的詞,或者鍵入的詞是一個(gè)后面跟有12個(gè)字母的短語(yǔ),PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配詞,PubMed就會(huì)把該詞斷開后再重復(fù)上述自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換過程,直到找到與鍵入的詞語(yǔ)相匹配詞語(yǔ)為止。若仍然沒有匹配詞,單個(gè)詞會(huì)被聯(lián)一起(用AND)在全部字段中檢索。 如:"single cell",系統(tǒng)就會(huì)自動(dòng)將其分成兩個(gè)詞:“single“和“cell”檢索,其檢索表達(dá)式為:“single AND c
6、ell”。要查驗(yàn)檢索詞的轉(zhuǎn)換情況,可點(diǎn)擊“Details”鍵。 2.截詞檢索功能 PubMed 允許使用“*”號(hào)作為通配符進(jìn)行截詞檢索。如:鍵入“bacter *”,系統(tǒng)會(huì)找到那些前一部分是bacter的單詞(如bacteria, bacterium, bacteriophage等),并對(duì)其分別進(jìn)行檢索。如果這咱詞少于150個(gè),PubMed會(huì)逐個(gè)詞檢索,若超過150個(gè)(如:Staph*),PubMed將顯示如下警告信息:“Wildcard search for 'term*' used only the first 150 variations. Lengthen the ro
7、ot word to search for all endings"。截詞功能只限于單詞,對(duì)詞組無(wú)效。如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infection control”等。 使用截詞功能時(shí),PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。 3.強(qiáng)制檢索功能 如上所述,在PubMed主頁(yè)的檢索提問框中鍵入一個(gè)短語(yǔ)后點(diǎn)擊“Go”,系統(tǒng)會(huì)高速用自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能查找到相應(yīng)的匹配詞后再進(jìn)行檢索;但是,當(dāng)鍵入的詞語(yǔ)無(wú)匹配詞時(shí),PubMed就會(huì)將鍵入的詞語(yǔ)斷開后再重復(fù)上述自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換過程,若仍然沒有匹配詞,系統(tǒng)就將短語(yǔ)分解成單詞,再用AND聯(lián)在一起在全部字段中檢索。很明顯
8、,這樣檢索的結(jié)果是不符合用戶要求的。因此,PubMed允許使用雙引號(hào)(“”)來(lái)強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語(yǔ)檢索。例如,在PubMed主頁(yè)的檢索提問框中鍵入“Single cell”,并用雙引號(hào)引起來(lái),然后點(diǎn)擊“Go”,系統(tǒng)會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫(kù)的全部字段中進(jìn)行檢索。 使用雙引號(hào)檢索,會(huì)自動(dòng)關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。 4.鏈接功能 (1)鏈接相關(guān)文獻(xiàn)。PubMed系統(tǒng)中的每條文獻(xiàn)記錄均有一個(gè)相關(guān)文獻(xiàn)鏈接,在檢索結(jié)果的顯示狀態(tài)下,每條記錄的右邊均有“Related Articles”超鏈。點(diǎn)擊該鏈,系統(tǒng)按文獻(xiàn)的相關(guān)度從高到低顯示相關(guān)文獻(xiàn)。利用檢索史(History)按鈕能進(jìn)一步限制相關(guān)文獻(xiàn)。點(diǎn)擊“His
9、tory”,把相關(guān)檢索式的編號(hào)錄入檢索提問框,然后再鍵入附加條件詞,最后點(diǎn)“Go”。如在檢索提問框中鍵入“#7 AND englishla”,可將檢索進(jìn)一步限定在英文文獻(xiàn)范圍內(nèi)。 (2)鏈接NCBI(National Center for Biotechnology Information)數(shù)據(jù)庫(kù)。PubMed在其主頁(yè)上與NCBI的5個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)建立了超鏈接。這些數(shù)據(jù)庫(kù)包括:Protein氨基酸(蛋白質(zhì))序列數(shù)據(jù)庫(kù),Nucleotide(DNA序列)數(shù)據(jù)庫(kù),Popset(種群、種系發(fā)生或突變序列)數(shù)據(jù)庫(kù),Structure(分子結(jié)構(gòu)模型)數(shù)據(jù)庫(kù)和Genome(基因組序列)數(shù)據(jù)庫(kù)。 (3)鏈接外部資
10、源。PubMed提供從檢索結(jié)果到期刊全文、生物學(xué)數(shù)據(jù)、序列中心等的鏈接。該功能通過鏈接上述資源站點(diǎn)的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)。在檢索結(jié)果顯示狀態(tài)下,點(diǎn)擊“LinkOut”進(jìn)入相關(guān)網(wǎng)站。 (4)鏈接相關(guān)圖書。點(diǎn)擊“Books”,可參考相關(guān)書籍的文摘頁(yè)。書籍文摘頁(yè)上的某些短語(yǔ)是超鏈接,點(diǎn)擊短語(yǔ)超鏈,可連到相關(guān)圖書的頁(yè)碼表,可在表上找到有關(guān)短語(yǔ)。 此外,PubMed系統(tǒng)允許用戶查看被引期刊名稱表,點(diǎn)擊主頁(yè)上的PubMed Journal Brower即可,PubMed向用戶提供期刊的縮寫名稱和ISSN號(hào)。PubMed 檢索 PubMed系統(tǒng)檢索范圍:MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)和PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)。 1.詞語(yǔ)(主
11、題)檢索 在PubMed主頁(yè)的提問框中鍵入英文單詞或短語(yǔ)(大寫或小寫均可后回車或點(diǎn)擊“Go”, PubMed即使用其詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行檢索,并將檢索結(jié)果直接顯示在主頁(yè)下方。例如:鍵入“vitamin c common cold”后回車或點(diǎn)擊“Go”, PubMed開始檢索并將檢索結(jié)果顯示出來(lái)。 如果檢索結(jié)果不符合要求,可以在提問框中增加或刪除詞語(yǔ),或者在Details狀態(tài)下(參見Details鍵的用法)來(lái)修改檢索式,也可使用“Limits”(參見Limits的用法)選擇限定條件后再進(jìn)行檢索。此外,用戶可根據(jù)需要使用通配符“*”或雙引號(hào)進(jìn)行截詞檢索或強(qiáng)制檢索。 2.著者檢索 在提問框中鍵入著者
12、姓氏全稱和名字的首字母縮寫,格式為:著者姓空格名字首字母縮寫,例如smith ja,然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)到著者字段去檢索,并顯示檢索結(jié)果。 如果在錄入了著者的姓氏,系統(tǒng)將首先在MeSH轉(zhuǎn)換表中查找該著者的姓。查到后,系統(tǒng)檢索主題字段和題名與文摘字段,否則,系統(tǒng)將在全部字段中檢索。 如果在著者姓名前后使用雙引號(hào),并用著者字段標(biāo)識(shí)au加以限定,如“smith ja”au,那么系統(tǒng)只檢索著者字段。 3.刊名檢索 在提問框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡(jiǎn)稱、ISSN號(hào),例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-152
13、4,然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索,并顯示檢索結(jié)果。如果刊名與MeSH詞表中的詞相同,例如:Gene Therapy、Science或Cell等,PubMed將把這些詞作為MeSH詞檢索。在這種情況下,需要用刊名字段標(biāo)識(shí)ta加以限定,如“gene therapy ta ”。 單個(gè)詞的刊名也需要用 ta 限定,如:Scanning ta 。否則,系統(tǒng)將在全部字段中檢索。使用刊名全稱或MEDLINE簡(jiǎn)稱可檢索到數(shù)據(jù)庫(kù)中的全部相關(guān)記錄。使用ISSN號(hào)進(jìn)行檢索,則不能保證檢到數(shù)據(jù)庫(kù)中較早的記錄。 若刊名有括號(hào),錄入時(shí)應(yīng)將括號(hào)省略。如:J Hand Surg Am 應(yīng)鍵入 J Hand Sur
14、g Am。 4.布爾邏輯檢索 PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索,但要在提問框中鍵入布爾邏輯運(yùn)算符(AND,OR或NOT)。如:vitamin c OR zinc。 布爾邏輯檢索的運(yùn)算順序?yàn)閺淖笾劣遥墒褂脠A括號(hào)來(lái)改變其運(yùn)算順序。如common cold AND (vitamin c OR zinc), 圓括號(hào)中的檢索式最先運(yùn)算。 布爾邏輯檢索允許在檢索詞后附加字段標(biāo)識(shí)以限定檢索字段(字段標(biāo)識(shí)要用方括號(hào)括起來(lái),位于檢索詞這后)。其檢索表達(dá)式的格式為:檢索詞字段標(biāo)識(shí)布爾運(yùn)算符檢索詞字段標(biāo)識(shí)。如:dna mh AND crick au AND 1993 dp ; 又如:ansthma/ther
15、apy mh AND review pt AND child, preschool mh 。各種字段標(biāo)識(shí)見表1。 表1 字段標(biāo)識(shí)一覽表 字段標(biāo)識(shí) 字段名稱 簡(jiǎn)要說(shuō)明 AD Affiliation 第一責(zé)任者的工作單位、地址,合同號(hào) ALL All Fields 全字段 AU Author Name 著者姓名 RN EC/RN Number 酶學(xué)委員會(huì)分配給特定酶的編號(hào)和化學(xué)文獻(xiàn)社的登記號(hào) EDAT Entrez Date 錄入PubMed系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)的日期 FILTER Filter 由PubMed系統(tǒng)鏈接的外部資源站點(diǎn)所使用的用來(lái)限 定文獻(xiàn)的技術(shù)標(biāo)識(shí) IP Issue 期刊的期號(hào) TA Jou
16、rnal Title 期刊名稱或IISN號(hào) LA Language 語(yǔ)言文種 MHDA MeSH Date 標(biāo)引MeSH主題詞的日期 MAJR MeSH Major Topic 主要MeSH主題詞 MH MeSH Terms 全部MeSH主題詞 PG Page Number 期刊頁(yè)碼 PS Personal Name as Subject 人名主題詞 DP Publication Date 文獻(xiàn)出版日期 PT Publication Type 文獻(xiàn)類型,包括綜述、臨床試驗(yàn)、通信等 SHP Subheadings MeSH副主題詞 SI Secondary source ID 用于限定檢索與Pu
17、bMed系統(tǒng)中的文獻(xiàn)條目相關(guān)的分 子序列資源數(shù)據(jù)庫(kù)(如Genbank si )和/或該數(shù)據(jù)庫(kù) 中的存取號(hào)(如:AF001892 si ) * Subset 用于限定檢索PubMed下屬的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(包括 MEDLINE,PreMEDLINE, Publisher和AIDS數(shù)據(jù) 庫(kù))。如:Publisher * ;aids * NM Substance Name 化學(xué)物質(zhì)名稱 TW Text Words 題名詞和文摘詞 TI Title words 題名詞 UID Unique Identifiers PubMed系統(tǒng)或MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)惟一記錄標(biāo)識(shí)號(hào),即PMID或UI。單獨(dú)用其檢索時(shí),該標(biāo)識(shí)
18、可以省略。但當(dāng) 用該號(hào)與其他詞一同檢索時(shí),必須使用 uid ,如:smith au AND (10403340 uid OR vaccines mh )。 VI Volume 期刊卷號(hào) 5.日期或日期范圍檢索 在提問框中鍵入日期或日期范圍,然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)在日期字段檢索,并將符合條件的記錄予以顯示。日期字段共有3種不同標(biāo)識(shí): mhda 、 dp 和 edat 。 日期的錄入格式為YYYY/MM/DD日期字段標(biāo)識(shí);如:1999/09/08 edat 也可以不錄月份和日子,如:2000dp或1999/12mhda。 日期范圍的錄入格式為:日期,如:1999:2000dp或1999/12ed
19、at 6檢索期刊子集(輯) 檢索式的格式為:檢索詞AND jsubseta,如:neoplasms AND jsubseta??晒z索的期刊子庫(kù)有3種:Abridged Index Medicus(有120種重要核心期刊)、Dental和Nursing。分別使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn進(jìn)行限定。 7檢索帶文摘的記錄 檢索式的格式為:檢索詞AND hasabstract, 如:liver cancer AND hasabstract。1975年前出版的文章,其MEDLINE記錄中沒有文摘。Details 鍵的用法 Details用于查看PubMed的檢索策略。即,
20、在提問框中鍵入的檢索詞被PubMed自動(dòng)地轉(zhuǎn)換成了那些詞,并使用了什么樣的檢索規(guī)則和檢索語(yǔ)法。此外,使用Details鍵可以對(duì)檢索策略進(jìn)行編輯,然后再一次檢索。在PubMed Query框內(nèi)顯示的是PubMed實(shí)際使用的檢索策略和語(yǔ)法。該框下有四個(gè)區(qū)域:Result區(qū)顯示檢索結(jié)果的記錄總數(shù),點(diǎn)擊這個(gè)數(shù)字,可回到檢索結(jié)果顯示屏;Translation區(qū)顯示檢索詞轉(zhuǎn)換的詳細(xì)情況;Dataabase區(qū)顯示檢索的數(shù)據(jù)庫(kù);User Query 區(qū)顯示用戶鍵入的檢索詞或檢索式。 要對(duì)檢索策略進(jìn)行編輯可直接使用鼠標(biāo)點(diǎn)擊PubMed Query框中的檢索策略,將其增加、刪除或修改后點(diǎn)擊Search鍵。如:在其
21、后加上“AND 2000 dp ",點(diǎn)擊 Search鍵。 存儲(chǔ)檢索策略-URL 鍵的用法 在PubMed Query狀態(tài)下,點(diǎn)擊URL鍵,PubMed返回檢索結(jié)果顯示狀態(tài)。檢索策略將會(huì)顯示在提問框中并作為URL的一部分保存起來(lái)。然后用瀏覽器的書簽功能把URL保存為一個(gè)書簽,最后用瀏覽器的編輯功能為其重命名即可。 用編號(hào)代表的檢索策略,如:#10 or # 2 AND notpubref * ,在檢索史(History)被刪除后也會(huì)隨之丟失。存儲(chǔ)檢索策略-URL 鍵的用法 特征欄(Feature Bar)介紹 特征欄(Feature Bar)包括條件限定(Limits)、預(yù)覽/索引(
22、Preview/Index)、檢索史(History)和粘貼板(Clipboard)4種功能設(shè)置。 1“條件限定”(Limits)的用法 點(diǎn)擊Limits,系統(tǒng)顯示多咱限定條件供用戶選擇,各限定選項(xiàng)的含義參見表1。其中,“Entrez Date”指錄入系統(tǒng)的日期;“Publication Date”指出版日期:“Only items with abstracts”指只檢索那些有文摘的記錄(1975年前出版的文章的記錄中沒有文摘);“Subsets”指只檢索PubMed下屬的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(包括 MEDLINE,PreMEDLINE, Publisher和AIDS數(shù)據(jù)庫(kù))。 如果選擇了Limits,
23、其左邊的選擇框內(nèi)則顯示“(”。若要取消選擇,點(diǎn)擊該框即可。注意事項(xiàng): (1)選擇了“出版物類型”、“年齡”、“性別”、“人或動(dòng)物”中的任何一項(xiàng),檢索將限制在MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行,PreMEDLINE則被排除在外。因?yàn)檫@些特征限制只有MEDLINE中才有。PreMEDLINE中的條目尚未完成標(biāo)引,未含這些數(shù)據(jù)。 (2)“Subsets”下拉菜單允許做如下限制:“AIDS”限制在艾制滋病文獻(xiàn)庫(kù);“AIM”限制在AIM(Abridged Index Medicus)引用的120種重點(diǎn)核心期刊文獻(xiàn)庫(kù);“Dental”限制在牙科學(xué)文獻(xiàn)庫(kù);“MEDLINE”限制在MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù);“Nursin
24、g”限制在護(hù)理學(xué)文獻(xiàn)庫(kù);“PreMEDLINE”限制在PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù);“Publisher”限制在出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù);“PubRef”限制在PubRef范圍內(nèi)。選擇PubRef,除了要求系統(tǒng)檢索PubMed中的數(shù)據(jù)庫(kù)外,同時(shí)要求系統(tǒng)通過鏈接檢索較廣范圍的科學(xué)(如物理學(xué)、天文學(xué)等)期刊文獻(xiàn),以及出版機(jī)構(gòu)站點(diǎn)的文獻(xiàn)全文。但要獲得文獻(xiàn)全文則需要交費(fèi)。 2“預(yù)覽/索引”(Preview/Index)的用法 該特征的功能是: (1)在顯示條目之前預(yù)覽檢索策略和檢索結(jié)果的記錄數(shù):在提問框內(nèi)鍵入檢索詞后,點(diǎn)擊Preview/ Index,顯示檢索策略和檢索結(jié)果的記錄數(shù)。點(diǎn)擊記錄數(shù)超鏈,系統(tǒng)顯
25、示檢索結(jié)果。 (2)修改檢索策略:在“All Fields”下拉菜單中選擇一個(gè)檢索字段,然后在提問框內(nèi)增加檢索詞,點(diǎn)擊Preview鍵,系統(tǒng)顯示新一次檢索結(jié)果的記錄數(shù)。這樣反復(fù)進(jìn)行,直到檢索結(jié)果記錄數(shù)量令人滿意為止。 (3)從索引表中選詞檢索:在“All Fields”下拉菜單中選擇一個(gè)檢索字段,然后在提問框內(nèi)鍵入詞語(yǔ),點(diǎn)擊Index鍵,系統(tǒng)顯示相應(yīng)字段的索引詞表。 用鼠標(biāo)點(diǎn)亮其中一個(gè)檢索詞,然后,點(diǎn)擊合適的邏輯運(yùn)算符(AND、OR或NOT),被點(diǎn)亮的詞會(huì)自動(dòng)加進(jìn)檢索提問框中。如果使用運(yùn)算符OR,系統(tǒng)允許從索引詞表中詞表中同時(shí)選擇多個(gè)詞(按下Ctrl鍵點(diǎn)擊每個(gè)詞即可),當(dāng)需要的詞全部點(diǎn)亮后,點(diǎn)
26、擊運(yùn)算符號(hào)可以將其加到提問框中。然后點(diǎn)擊Preview鍵,系統(tǒng)顯示新檢索結(jié)果數(shù)。 還可以從其他檢索字段中選擇詞匯,不斷增加到檢索提問框中,直到滿意為止。最后點(diǎn)擊Preview查看檢索結(jié)果記錄數(shù),或點(diǎn)擊Go顯示檢索結(jié)果。 3“檢索史”(History)的用法 History主要用于查看檢索策略,也可用于查看檢索結(jié)果記錄數(shù)量。點(diǎn)擊History,顯示檢索史:檢索號(hào)、檢索策略、檢索時(shí)間和檢索結(jié)果數(shù)。要查看檢索到的記錄,直接點(diǎn)擊檢索結(jié)果數(shù)即可。 在History狀態(tài)下,可以將檢索式用邏輯運(yùn)算符連接起來(lái)后再檢索。如在提問框中鍵入#6 OR(drug therapy OR diet therapy),然后
27、點(diǎn)擊Go。要清除檢索史,請(qǐng)點(diǎn)擊Clear History鍵。 注意事項(xiàng):PubMed最多可保留100個(gè)檢索式,超過100個(gè)時(shí)自動(dòng)刪除最早的檢索式。 4“粘貼板”(Clipboard)的用法 Clipboard是在一次檢索中存放檢索結(jié)果的地方,以便于集中存盤、打印或訂購(gòu)原文時(shí)使用。粘貼板最多能存放500條記錄。只要粘貼板中有記錄,就可點(diǎn)擊Clipboard查看其中的記錄(記錄為Summary格式)。粘貼板按記錄存放的先后順序顯示記錄題錄。 要把檢索結(jié)果全部存入粘貼板中,只需直接點(diǎn)擊Add to Clipboard鍵。如果要把部分檢索結(jié)果存入粘貼板,需要點(diǎn)擊該記錄左邊的選擇框后,再點(diǎn)擊Add to
28、 Clipboard鍵。完成后,記錄編號(hào)的顏色變綠。 (1)將粘貼板中的檢索結(jié)果存盤 點(diǎn)擊Clipboard,系統(tǒng)顯示暫時(shí)存放在粘貼板中的記錄,選擇顯示格式(顯示格式有6種,系統(tǒng)默認(rèn)Summary格式,即題錄格式,見圖15-17),然后點(diǎn)擊Display鍵。以Summary格式顯示時(shí),記錄按錄入PubMed的日期降序排列。 檢索結(jié)果可以按Summary下拉菜單中的某種格式全部顯示或存盤(不需要選擇記錄),也可經(jīng)選擇后部分顯示或存盤。方法:點(diǎn)擊Summary下欄菜單,從中選擇一種格式,點(diǎn)擊Save鍵保存檢索結(jié)果。 要打印檢索結(jié)果,需使用網(wǎng)絡(luò)瀏覽器的打印功能,打印內(nèi)容僅限于Web頁(yè)顯示的內(nèi)容。 如
29、果只起顯示檢索結(jié)果,而不顯示W(wǎng)eb頁(yè)邊框菜單和工具條等,需點(diǎn)擊Text鍵。當(dāng)檢索結(jié)果超過一頁(yè)時(shí),PubMed系統(tǒng)允許從全部檢索結(jié)果中挑選完記錄后一次性存盤,不必選一頁(yè)存一次。 (2)定購(gòu)粘貼板中檢索結(jié)果的全文 定購(gòu)文獻(xiàn)全文需要事先與有關(guān)文獻(xiàn)外借(Loansome Doc)成員館簽署有關(guān)協(xié)議,并需付一暄的費(fèi)用。 要求提供粘貼板中全部記錄的文獻(xiàn)全文時(shí),可直接點(diǎn)擊Order鍵。要求提供部分文獻(xiàn)的全文時(shí),應(yīng)先選擇文獻(xiàn)記錄(方法:點(diǎn)擊該記錄左邊的選擇框,使之顯示“(”,再點(diǎn)擊Order鍵。訂購(gòu)過程完成后,粘貼板中的記錄仍保持原樣不變。 要?jiǎng)h除粘貼板中的全部記錄,直接點(diǎn)擊Remove from Clipb
30、oard鍵。要?jiǎng)h除其中部分記錄,需要點(diǎn)擊要?jiǎng)h除的記錄左邊的選擇框,然后點(diǎn)南Remove from Clipboard鍵。檢索結(jié)果的顯示、存盤、打印 1顯示檢索結(jié)果(Displaying) PubMed系統(tǒng)可用6種不同的格式顯示檢索結(jié)果,其默認(rèn)Summary格式。打開Summary下拉菜單,從中選擇一種預(yù)設(shè)格式并用鼠標(biāo)點(diǎn)擊,然后點(diǎn)擊Display鍵,系統(tǒng)按所選格式全部檢索結(jié)果;如果只需要顯示其中一部分記錄,則需點(diǎn)擊該記錄左邊的選擇框,使標(biāo)記后,再點(diǎn)擊Display鍵;如果只需顯示一條記錄,則可直接點(diǎn)擊該記錄中的作者姓名超鏈,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)顯示該記錄的文摘格式,在此界面,也可選擇其他格式令系統(tǒng)顯示。
31、其中“ASN.1”(Abstract Syntax Notation One)格式是一種國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),用于平臺(tái)之間(包括計(jì)算機(jī)之間、Pager與計(jì)算機(jī),以及許多其他可能的聯(lián)結(jié)設(shè)備之間)的相互操作。 點(diǎn)擊Text鍵,系統(tǒng)顯示記錄的純文本形式。 點(diǎn)擊Show鍵,可選擇每頁(yè)顯示的記錄條數(shù)。 點(diǎn)擊Select Page的數(shù)字,顯示相應(yīng)Web頁(yè)的記錄。 2.保存檢索結(jié)果(Saving) PubMed系統(tǒng)可用不同的格式(同顯示格式)保存檢索結(jié)果,其默認(rèn)Summary格式。PubMed系統(tǒng)允許最多可保存5000條記錄。 要保存全部檢索結(jié)果時(shí),打開Summary下欄菜單選擇其中一種格式,然后點(diǎn)擊Save鍵;要保存
32、特定記錄時(shí),點(diǎn)擊記錄左邊的選擇框予以標(biāo)記后,再點(diǎn)擊Save鍵。 存盤時(shí)PubMed默認(rèn)文件名為“query.fegi”。該文件名可以修改,文件格式也可在“.fegi”和“.txt”中選擇。選擇.txt格式,便于用文字處理軟件和文本編輯器打開所存文件。如果想存為超文本格式,則需要使用Web瀏覽器的“另存為.”功能,并選擇“.html”格式后再存盤。 3.打印檢索結(jié)果(Printing) 使用瀏覽器的打印功能,可打印Web頁(yè)上顯示的檢索記錄,默認(rèn)值為20條。若檢索結(jié)果超過20條,則需修改每頁(yè)顯示的記錄數(shù)。點(diǎn)擊Show鍵,選擇每頁(yè)顯示的條數(shù),然后再打印。系統(tǒng)允許每頁(yè)多顯示500條記錄。如果想打印成文
33、本格式,請(qǐng)先點(diǎn)擊Text鍵,然后再打印。PubMed完全攻略(一)第一章 進(jìn)入PubMed魔法學(xué)校-PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感嘆:"你們現(xiàn)在真是幸福,我們那時(shí)候要查一篇相關(guān)的文獻(xiàn),要到圖書館一本一本目錄去檢索。尤其是做一些別人不太做的課題時(shí),要搜集幾篇有用的文獻(xiàn),竟要花上3,4個(gè)月時(shí)間,而你們現(xiàn)在。"趁他打頓的時(shí)候,我告訴他,"快的話,可能只要3秒鐘"。從他兩個(gè)厚厚的酒瓶底后面露出一絲羨慕的眼神。我可以想見他當(dāng)時(shí)在一大堆期刊中埋頭查閱的情形,但對(duì)于現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)工作者來(lái)說(shuō),我已經(jīng)無(wú)法想像,如果我們失去PubMed,世界將會(huì)
34、怎樣。盡管在因特網(wǎng)上,類似于PubMed的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。還有非常重要的一點(diǎn),正如它的名字(PubMedPublic+Medicine)所暗示的, PubMed是免費(fèi)向公眾開放的。無(wú)論何時(shí)何地,你只要在瀏覽器地址欄中輸入:就可以立刻進(jìn)入PubMed的界面并開始享受PubMed所給你帶來(lái)的無(wú)窮便利。俗話說(shuō),喝水不忘掘井人。PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng),位于美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)的平臺(tái)上。有不少西方人有在飯前祈禱感恩的習(xí)慣
35、,不知道我們是否也有必要每次使用PubMed前都感謝NCBI呢?PubMed覆蓋了全世界70多個(gè)國(guó)家4300多種主要生物醫(yī)學(xué)期刊的摘要和部分全文。其覆蓋的時(shí)間段也非常長(zhǎng),早的可以追溯到20世紀(jì)60年代,通常而言,這已經(jīng)足夠早了,很少有人會(huì)需要查閱在此之前的文獻(xiàn)。當(dāng)然,研究生物醫(yī)學(xué)史的工作者可能是個(gè)例外。而最新的文獻(xiàn)幾乎就在此時(shí)此刻。與PubMed掛鉤的出版商會(huì)自動(dòng)向PubMed提供最新的文獻(xiàn)摘要,而往往在這個(gè)時(shí)候文獻(xiàn)還沒有正式出版。所以盡管生物醫(yī)學(xué)的文章從被期刊接受到出版往往要好幾個(gè)月的時(shí)間,但借助于PubMed,我們?nèi)耘f可以隨時(shí)掌握最新的動(dòng)向,從而大大有利于自己的臨床和研究工作。還有些出版商
36、通過PubMed提供文獻(xiàn)的全文,有時(shí)甚至是免費(fèi)的,這樣,我們就可以在PubMed上真正享受"坐擁書城"的感覺了(關(guān)于如何獲取全文將在以后的章節(jié)中詳述)。進(jìn)入PubMed的主界面后, 首先映入我們眼簾的就是頁(yè)面上方的檢索框和功能鍵(如下圖)。這是PubMed的核心部分。大部分工作,我們只要利用這"一框五鍵"(檢索框,Limit鍵, Preview/Index鍵, History鍵,Clipboard鍵和Details鍵)即可完成。 在主界面的左側(cè)框(如下圖),有:· Journal Browser 期刊瀏覽· MeSh Bro
37、wser可以用它來(lái)分層流覽MeSH表· Single Citation Matcher輸入期刊的信息可以找到某單篇的文獻(xiàn)或整個(gè)期刊的內(nèi)容。· Batch Citution Matcher用一種特定的形式輸入期刊的信息一次搜索多篇文獻(xiàn)。· Clinical Queries這一部分為臨床醫(yī)生設(shè)置,通過過濾的方式將搜索的文獻(xiàn)固定在4個(gè)范圍:治療、診斷、病原學(xué)與預(yù)后。· Old PubMed (使用舊式的PubMed查詢方式)3) Related Resources· Order Documents可以使用戶在當(dāng)?shù)氐玫轿墨I(xiàn)的全文, 但這是要收費(fèi)的,至于
38、如何免費(fèi)獲得文獻(xiàn)全文,我將在后面的有關(guān)章節(jié)中詳述。· Grateful Med是對(duì)另一個(gè)NLM基于網(wǎng)絡(luò)的查詢系統(tǒng)的鏈接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且還有一些其他的數(shù)據(jù)庫(kù)如AIDSLINE、HISTLINE等等。· Consumer Health提供與MEDLINEplus的鏈接,MEDLINEplus是與消費(fèi)者健康信息相關(guān)的國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)。· Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH資助的臨床研究成果的發(fā)布。 利用左側(cè)框的這些服務(wù),我們不僅能夠進(jìn)行功能更加強(qiáng)大的檢索,而且還能得到不少非常有用的服務(wù)。這些
39、都將在后續(xù)章節(jié)中介紹??傮w而言,PubMed的界面相當(dāng)簡(jiǎn)潔清晰,幾乎是傻瓜式的。然而傻瓜式的界面并不意味著傻瓜式的操作。我看到很多人用了幾年的PubMed,還是只知道在檢索框里輸入一個(gè)關(guān)鍵字,然后按一下"Go"按鈕這樣一種單一原始的檢索方式。雖然有一半左右的情況,這樣的操作就足以得到令人滿意的信息,但對(duì)于另一半情況,就沒有那么幸運(yùn)了,要么你真正所需的信息湮沒在大量紛繁蕪雜的"無(wú)用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人費(fèi)解的是,很多醫(yī)務(wù)工作者寧可在每次檢索時(shí)都花上成倍的時(shí)間,卻不愿花上幾個(gè)小時(shí)的時(shí)間去認(rèn)真研究一下PubMed。&q
40、uot;君欲善其事,必先利其器", PubMed就好像一把功能強(qiáng)大的槍,你決不能僅僅滿足于知道扣動(dòng)扳機(jī)就可以發(fā)射子彈,更重要的是,你要知道如何利用準(zhǔn)星瞄準(zhǔn),如何把這把槍的功能發(fā)揮到及至。在以后的章節(jié)中,我們將逐步深入地了解PubMed,相信通過這些章節(jié)的學(xué)習(xí),我們可以真正熟練掌握PubMed,從而使自己的工作事半功 0主界面的左側(cè)框 第二章 PUBMED簡(jiǎn)單檢索技巧 一在這一章里,我們將對(duì)如何應(yīng)用PUBMED這一得力助手檢索文獻(xiàn),作以簡(jiǎn)單介紹。1當(dāng)你打開瀏覽器,在地址欄內(nèi)鍵入或是后,就進(jìn)入了PUBMED檢索系統(tǒng)主頁(yè),可以見到如下的頁(yè)面。2在靠近頁(yè)面上部的
41、地方,首先映入我們眼簾的,即是供我們輸入所需查詢內(nèi)容的檢索框。 在檢索框中輸入查詢?cè)~,然后單擊"go"按鈕或按回車鍵,PubMed將會(huì)自動(dòng)開始檢索,并將檢索到的相關(guān)條目顯示在屏幕上。在檢索框前面,你還可以選定所要檢索內(nèi)容的數(shù)據(jù)庫(kù)范圍,除NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)以外,可供選擇的還有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。說(shuō)到這里,很多人可能以為只需傻瓜式的輸入幾個(gè)字符然后回車一敲便可萬(wàn)事大吉,其實(shí)不然。每個(gè)人搜索效率的高低往往存在很大差別。在這里提供以下建議僅供讀者參考: 明確你索要檢索的關(guān)鍵概念及詞語(yǔ),即關(guān)鍵字; 考慮到關(guān)鍵字的類似說(shuō)法,即有可能出現(xiàn)的
42、同義詞; 通過限定DATES, STUDY GROUP等,精煉你的檢索范圍; 多向有經(jīng)驗(yàn)的人求教,因?yàn)椴煌膶I(yè)背景以及個(gè)人的差異,都有可能形成不同的方法和技巧。3通過布爾(BOOLEAN)運(yùn)算來(lái)提高你的效率最常用的三種布爾運(yùn)算即是AND,OR,和NOT。 AND提供的運(yùn)算方式即不管所輸入的兩個(gè)關(guān)鍵詞語(yǔ)所出現(xiàn)的位置在哪,只要他們都出現(xiàn)在索引文章的某一處,就將其列出。 而OR則是將出現(xiàn)至少一個(gè)關(guān)鍵詞的文章列出,這種運(yùn)算在想將相似主題的文章羅列在一起時(shí),十分有效。 NOT運(yùn)算可以在你的檢索范圍內(nèi)將某些不需要的部分除去。但是在使用的時(shí)候要特別注意,會(huì)有可能將一些你所需要的文章漏掉。比如當(dāng)你的檢索詞為
43、LEAD POISONING NOT CHILDREN時(shí),除了會(huì)刪除掉那些僅討論兒童的文章,同時(shí)也會(huì)刪去那些同時(shí)討論兒童及其他年齡組的文章。4PUBMED檢索類型通常我們所要查詢的單詞類型大致可以分為: 詞語(yǔ)(主題)檢索 這時(shí)我們?cè)赑ubMed主頁(yè)的檢索框中鍵入的是英文單詞或短語(yǔ)(大寫或小寫均可)。然后回車或點(diǎn)擊"Go", PubMed即使用其詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行檢索,并將檢索結(jié)果直接顯示在主頁(yè)下方。例如:鍵入"vitamin c common cold"后回車或點(diǎn)擊"Go", PubMed開始檢索并將檢索結(jié)果顯示出來(lái)。 著者檢索 當(dāng)
44、我們所要查詢的是著作者時(shí), 在檢索框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫,格式為:"著者姓 空格 名字首字母縮寫",例如smith ja,然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)到著者字段去檢索,并顯示檢索結(jié)果。 刊名檢索 在檢索框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡(jiǎn)稱、ISSN號(hào),例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索,并顯示檢索結(jié)果。 日期或日期范圍檢索 可以在檢索框中鍵入日期或日期范圍,然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)會(huì)按日期段檢索,并將符合條件的記錄予以顯示。
45、日期的錄入格式為YYYY/MM/DD;如:1999/09/08 也可以不錄月份和日子,如:2000或1999/12。 檢索期刊子集(輯) 檢索的格式為:檢索詞AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta??晒z索的期刊子庫(kù)有3種:Abridged Index Medicus(有120種重要核心期刊)、Dental和Nursing。分別使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn進(jìn)行限定。 檢索帶文摘的記錄 檢索的格式為:檢索詞AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在19
46、75年前出版的文章,其MEDLINE記錄中沒有文摘。 布爾邏輯檢索 PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索,只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運(yùn)算符(AND,OR或NOT)。具體使用時(shí)要注意的問題,詳見上第3點(diǎn)所述。5如何處理檢索結(jié)果當(dāng)你點(diǎn)擊GO或回車后,PubMed將會(huì)自動(dòng)運(yùn)行檢索命令,在屏幕的下方顯示出符合檢索要求的項(xiàng)目,并且在查詢框內(nèi)保留原檢索詞。此時(shí)要注意的是符合檢索要求的項(xiàng)目是以SUMMARY(簡(jiǎn)要格式)顯示出來(lái)的,就是列出作者,文章題目,以及文章來(lái)源的一些信息。在DISPLAY鍵后還可以選擇別的顯示格式,點(diǎn)擊DISPLAY鍵后,系統(tǒng)按所選格式全部檢索結(jié)果。如果只需要顯示其中一部分記錄,則需點(diǎn)
47、擊該記錄左邊的查詢框,使標(biāo)記后,再點(diǎn)擊Display鍵;如果只需顯示一條記錄,則可直接點(diǎn)擊該記錄中的作者姓名超鏈接,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)顯示該記錄的文摘格式。還有一點(diǎn),系統(tǒng)所設(shè)定的默認(rèn)值為每頁(yè)顯示20條選項(xiàng),這點(diǎn)可以在SHOW后的下拉菜單處選擇。如果選中所感興趣的內(nèi)容,即可進(jìn)行保存,打印等等操作。PubMed系統(tǒng)允許最多可保存5000條記錄。要保存全部檢索結(jié)果時(shí),打開Summary下拉菜單選擇其中一種格式,然后點(diǎn)擊Save鍵;要保存特定記錄時(shí),點(diǎn)擊記錄左邊的選擇框予以標(biāo)記后,再點(diǎn)擊Save鍵。使用瀏覽器的打印功能,即可把感興趣的內(nèi)容打印出來(lái)。系統(tǒng)允許每頁(yè)最多顯示500條記錄。如果想打印成文本格式,請(qǐng)先點(diǎn)
48、擊Text鍵,然后再打印。下一章我們將用幾個(gè)實(shí)例來(lái)使大家熟悉以上檢索技巧。 0第三章 PUBMED簡(jiǎn)單檢索實(shí)例 在上一章里,我們已經(jīng)對(duì)如何用PUBMED來(lái)查詢我們感興趣問題的文獻(xiàn)。在這一章,我們可以通過幾個(gè)簡(jiǎn)單的實(shí)例來(lái)具體熟悉PUBMED的用法。 例一 1明確所要檢索的內(nèi)容。如果我們要查詢的問題是"維生素C對(duì)于普通感冒的防治作用"。首先我們應(yīng)分析這一問題中的關(guān)鍵詞語(yǔ),主要由"維生素C",和"普通感冒"構(gòu)成。即"VITAMIN C"和"COMMON COLD"
49、;。2分析所要檢索的兩個(gè)相關(guān)詞語(yǔ)的關(guān)系。根據(jù)我們的日常生活經(jīng)驗(yàn),可以將兩個(gè)關(guān)鍵詞之間的關(guān)系定義為"AND",于是我們可以在檢索框內(nèi)鍵入"VITAMIN C AND COMMON COLD".,然后點(diǎn)擊"GO",進(jìn)行檢索。下面的畫面即為經(jīng)過上面檢索過程后所得到的相關(guān)文章。 03以上初步檢索后所顯示的結(jié)果都以默認(rèn)的SUMMER格式顯示出來(lái),在經(jīng)過對(duì)SUMMER的閱讀后,我們可以進(jìn)一步篩選文獻(xiàn)的內(nèi)容。如我們感興趣的是第二、三、五篇的話,選中這幾篇文獻(xiàn)左側(cè)的方框。如果我們想要同時(shí)看到這幾篇的ABSTRACT,在DISPLAY鍵后的下
50、拉菜單選擇ABSTRACT,然后點(diǎn)擊DISPLAY。即可看到所要結(jié)果 0第四章 PUBMED高級(jí)檢索技巧 在以上兩章我們已經(jīng)掌握了如何運(yùn)用初級(jí)檢索法達(dá)到檢索文獻(xiàn)的目的。不過在我們所要檢索的問題相對(duì)較為復(fù)雜的時(shí)候,僅僅靠初級(jí)檢索就遠(yuǎn)遠(yuǎn)達(dá)不到需求了。為了使得我們的檢索更為準(zhǔn)確,高效,我們可以充分利用PubMed所提供的高級(jí)檢索功能。在你進(jìn)入PubMed首頁(yè)之后,在檢索框的下方,有PubMed所提供的五個(gè)重要的功能按鈕,即Limits按鈕, Preview/Index按鈕, History按鈕, Clipboard按鈕,及Details按鈕。如果你能夠充分的利用好這幾個(gè)功能按鈕,
51、那你的檢索則很有可能事半功倍。首先,讓我們來(lái)簡(jiǎn)單的了解一下這幾個(gè)按鈕的主要功能。 1. Limits 按鈕當(dāng)你單擊Limits按鈕后,你可以看到如下界面。在這里可以進(jìn)行以下設(shè)定: 將搜索范圍設(shè)定在一個(gè)特定的域。 將搜索范圍設(shè)定在特定的年齡組、性別組、人類或動(dòng)物學(xué)范圍。 也可以將搜索限定在某一語(yǔ)種出版的或某一特定的文章類型(如綜述)。 設(shè)定只搜索包含摘要的文獻(xiàn)。 設(shè)定搜索Entrez數(shù)據(jù)庫(kù)或Publication數(shù)據(jù)庫(kù)。 設(shè)定搜索范圍為PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的某一子數(shù)據(jù)庫(kù)(如Abridged Index Medicus 或AIDS相關(guān)的條目)。例如 在All Fields域選擇下拉菜單里,
52、你可以把搜索詞限定在一個(gè)特定的域,缺省設(shè)置是所有的域;打開下拉菜單就可以選擇所需的域名了。又如"Only items with abstracts"指只檢索那些有文摘的記錄(1975年前出版的文章的記錄中沒有文摘)2Preview/Index 按鈕在按下Preview/Index按鈕之后,我們可以進(jìn)行的設(shè)定有: 在顯示條目之前顯示所查到的文獻(xiàn)數(shù)。 隨時(shí)通過增加查詢單詞來(lái)修改查詢方案。 在特定的搜索域中向方案里加入查詢?cè)~。 從Index中查看并選擇詞語(yǔ)來(lái)修改查詢方案。 在你修改查詢時(shí)查看方案。Preview(預(yù)覽) 使用此功能可以在顯示條目之前顯示所查到的文獻(xiàn)數(shù)。使用時(shí),在輸
53、入框中鍵入搜索詞,然后單擊Preview,PubMed返回的信息是條目的數(shù)量。Index(索引) 使用此功能,可以從特定域中選擇以索引的單詞,并把他們加入查詢方案之中;可以查看某一個(gè)特定搜索域中詞語(yǔ)列表;也可以使用布爾運(yùn)算符來(lái)建立一個(gè)查詢方案。3History 按鈕History (歷史記錄)歷史記錄中保存的是你所有的查詢方案與查詢結(jié)果,只有當(dāng)你運(yùn)行了一次查詢之后,History中才有內(nèi)容。History屏幕將會(huì)顯示:你的查詢方案、查詢時(shí)間、查詢到的文獻(xiàn)數(shù)量。Preview顯示的是歷史記錄中最近的三條記錄,而使用History可以看到最近100次的查詢結(jié)果。一旦查詢數(shù)量超過100,PubMed
54、會(huì)將最早的查詢除去,加進(jìn)最新的一次查詢。如果兩次查詢內(nèi)容相同,PubMed會(huì)將頭一次的去除。4Clipboard 按鈕剪貼板可以幫助你保存或查看在一個(gè)或多個(gè)查詢中選擇的條目,然后就可以打印、保存、訂購(gòu)剪切板中的內(nèi)容了。將條目左邊的復(fù)選框選中,單擊"Add to clipboard"就可以將其加入剪切板中。當(dāng)點(diǎn)擊 Clear History可以將History中的所有內(nèi)容清除。剪切板中最大的儲(chǔ)存數(shù)是500條。而放在剪切板中的內(nèi)容如果在一小時(shí)內(nèi)沒有任何操作,將會(huì)自動(dòng)消失。5Details 按鈕Details是用于幫助你查看PubMed的檢索策略。即在提問框中鍵入的檢索詞被Pub
55、Med自動(dòng)地轉(zhuǎn)換成了那些詞,并使用了什么樣的檢索規(guī)則和檢索語(yǔ)法。此外,使用Details鍵可以對(duì)檢索策略進(jìn)行編輯,然后再一次檢索。在PubMed Query框內(nèi)顯示的是PubMed實(shí)際使用的檢索策略和語(yǔ)法。該框下有四個(gè)區(qū)域:Result區(qū)顯示檢索結(jié)果的記錄總數(shù),點(diǎn)擊這個(gè)數(shù)字,可回到檢索結(jié)果顯示屏;Translation區(qū)顯示檢索詞轉(zhuǎn)換的詳細(xì)情況;Database區(qū)顯示檢索的數(shù)據(jù)庫(kù);User Query 區(qū)顯示用戶鍵入的檢索詞或檢索式。要對(duì)檢索策略進(jìn)行編輯可直接點(diǎn)擊PubMed Query框中的檢索策略,將其增加、刪除或修改后點(diǎn)擊Search鍵。除了以上五個(gè)主要功能鍵以外,利用PubMed提供的
56、其他一些功能,如MeSH 等,也可以在很大一部分程度上提高我們的檢索效率。在以后的若干章里,我們將會(huì)以詳盡的筆墨來(lái)系統(tǒng)的剖析這些功能用法。通過對(duì)PubMed的進(jìn)一步認(rèn)識(shí),我們可以在初級(jí)檢索的基 0第五章 PUBMED高級(jí)檢索技巧實(shí)例 在我們對(duì)如何運(yùn)用PubMed進(jìn)行較為復(fù)雜的檢索有了初步的了解后,我們來(lái)看幾個(gè)應(yīng)用性的實(shí)例。例: 現(xiàn)在讓我們來(lái)查找一下有關(guān)于"鋅對(duì)于兒童成長(zhǎng)的作用"的文獻(xiàn)。步驟一,我們先來(lái)對(duì)這一話題進(jìn)行初步的檢索。我們確定了它的關(guān)鍵字應(yīng)為"Zinc Infant Growth",把它輸入查詢框,按GO鍵進(jìn)行檢索。共有492
57、篇相關(guān)文獻(xiàn)。顯然如果我們對(duì)這些文獻(xiàn)一一打開逐項(xiàng)閱讀,將是一項(xiàng)非常繁復(fù)的工作。這時(shí)我們就需要用高級(jí)檢索的方法來(lái)減少工作量。步驟二,如果我們所要檢索的文獻(xiàn)要求是反映比較新的動(dòng)態(tài)進(jìn)展,那么我們可以點(diǎn)擊功能鍵Limits按鈕.在其中的Publication Date的輸入框內(nèi)輸入FROM"2000 01 01" TO"2002 01 01".("Entrez Date"指錄入系統(tǒng)的日期;"Publication Date"指出版日期)步驟三,如果我們進(jìn)一步要求文章是用英文發(fā)表,且PubMed可以顯示出Abstract的,我
58、們可以依照上面的方法類推,在Languages下拉菜單內(nèi)選擇English,選中"Only items with abstracts"前的方框。然后點(diǎn)擊GO鍵,開始檢索。共有61篇,在當(dāng)前頁(yè)內(nèi)顯示出最新的20篇。 0第六章 談MeSH Browser(醫(yī)學(xué)主題詞瀏覽器) 何為MeSH? MeSH其實(shí)是Medical Subject Headings的縮略詞,即醫(yī)學(xué)主題詞,是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語(yǔ)來(lái)描述生物醫(yī)學(xué)概念。NIH的工作人員按MeSH詞表規(guī)定,瀏覽生物醫(yī)學(xué)期刊全文后標(biāo)引出每篇文獻(xiàn)中的MeSH主題詞,其中論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞(major topic headings),論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞。 那么為什么要使用醫(yī)學(xué)主題詞呢? 我們先來(lái)看個(gè)比喻,如果有人問你感冒了嗎?你會(huì)不會(huì)回答"沒有啦,我只是有點(diǎn)著涼發(fā)燒而已"呢?當(dāng)然不會(huì),因?yàn)槟阒栏忻熬褪侵鴽霭l(fā)燒。但一個(gè)檢索系統(tǒng),如果你不告訴它的話,它就有可能不知道這一點(diǎn)。在期刊中,對(duì)于同一個(gè)概念往往可能有不同的描述形式,如Tumor和Neoplasm都是指腫瘤。當(dāng)一個(gè)查詢者希望查閱腫瘤和diet(飲食)相關(guān)的文獻(xiàn)時(shí),他可能會(huì)輸入Tumor,也可能輸入Neoplasm作為關(guān)鍵字,但其實(shí)這兩者之間是沒有區(qū)別的。一個(gè)愚蠢
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