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文檔簡(jiǎn)介

1、名詞解釋:發(fā)酵工程:在最適發(fā)酵條件下,在發(fā)酵罐中大量培養(yǎng)細(xì)胞和生產(chǎn)代謝產(chǎn)物的工藝技術(shù)。發(fā)酵單位:又稱效價(jià)。是衡量發(fā)酵罐中目的產(chǎn)物的含量高低的指標(biāo),屬于技術(shù)指標(biāo)一把用u/ml,mg/l。一般情況下用于表示發(fā)酵水平的高低生物轉(zhuǎn)化:指外源化學(xué)物在機(jī)體內(nèi)經(jīng)多種酶催化的代謝轉(zhuǎn)化前體:指在產(chǎn)物合成過(guò)程中,被菌體直接用于產(chǎn)物合成而自身結(jié)構(gòu)無(wú)顯著改變的物質(zhì)。最早是在青霉素生產(chǎn)中發(fā)現(xiàn)的 玉米漿(苯乙胺) 蝦青素(甲羥戊酸)消毒:在工業(yè)微生物中消毒指的是除去雜菌,除去會(huì)引起污染的微生物,在工業(yè)上是滅殺引起生產(chǎn)污染的微生物滅菌:指的是殺死一切微生物(包括繁殖體和芽孢),不分病原和非病原微生物,雜菌和非雜菌。指把物體

2、上的所有微生物(包括細(xì)菌芽孢在內(nèi))全部殺死的方法透氣比/VVM:?jiǎn)挝粫r(shí)間(min)單位體積(m³)培養(yǎng)基中通入標(biāo)準(zhǔn)狀況下空氣的體積在線檢測(cè):利用傳感器檢測(cè)不離開(kāi)生產(chǎn)線的對(duì)參數(shù)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)離線監(jiān)測(cè):檢測(cè)樣品離開(kāi)生產(chǎn)線,檢測(cè)后生成不在一起的檢測(cè)溶解氧:指溶解在水中的分子氧,以每升水中所含氧的毫克數(shù)來(lái)表示臨界溶氧濃度:不影響微生物呼吸時(shí)的最低溶氧濃度Monod方程:隨著細(xì)胞的大量繁殖,培養(yǎng)基中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)迅速消耗至限制濃度,培養(yǎng)基中有害代謝產(chǎn)物積累增多,細(xì)胞的生長(zhǎng)速率逐漸下降,進(jìn)入減速期,當(dāng)培養(yǎng)液中不存在抑制細(xì)胞生長(zhǎng)的物質(zhì)時(shí),細(xì)胞的比生長(zhǎng)速率和限制性基質(zhì)濃度S的關(guān)系活化:保藏菌種到斜面種子擴(kuò)大培

3、養(yǎng):斜面種子-三角瓶液體培養(yǎng)-種子罐干熱滅菌:利用高溫對(duì)微生物有氧化、蛋白質(zhì)變性和電解質(zhì)濃縮作用而殺滅微生物,適用于玻璃及金屬用具、沙土管滅菌 140180 12h濕熱滅菌法:借助蒸汽釋放的熱能使微生物蛋白質(zhì)酶核酸分子內(nèi)部的化學(xué)鍵,特別是氫鍵受到破壞,引起不可逆變形,使微生物死亡。在有水分存在情況下,pr更易受熱凝固變性,是用培養(yǎng)基和發(fā)酵設(shè)備滅菌。121 30min 飽和蒸汽;100度 水煮熱滅菌法:利用空氣壓縮時(shí)放出的熱量進(jìn)行保溫殺菌。從壓縮機(jī)到空氣貯罐一段管道保溫進(jìn)行保溫是空氣達(dá)到高溫后保持一段時(shí)間,保證衛(wèi)生網(wǎng)死亡輻射滅菌:聲能,高能陰極射線、X射線、Y射線和紫外線都能破壞蛋白質(zhì)活性起到殺

4、菌作用靜電除菌:懸浮于空氣中的微生物,微生物孢子大多有不同的電荷,沒(méi)有帶電荷而微粒在進(jìn)入高壓靜電場(chǎng)是都會(huì)被電橋變成帶電微粒過(guò)濾除菌:微粒隨電流通過(guò)濾層是,濾層纖維所形成的網(wǎng)格阻礙氣流直線前進(jìn),使氣流出現(xiàn)五十次改變運(yùn)動(dòng)速度和運(yùn)動(dòng)方向,繞過(guò)纖維前進(jìn),這些改變引起微粒對(duì)濾層纖維產(chǎn)生慣性沖擊、阻攔,重力沉降,布朗擴(kuò)散,靜電吸引壁作用而微粒滯留子纖維表面,從而達(dá)到除菌目的。影響氧傳遞的因素:微生物發(fā)酵中,通入發(fā)酵罐內(nèi)的空氣中含有的氧不斷溶于培養(yǎng)液中,以供菌體細(xì)胞代謝之需。這種由氣態(tài)氧轉(zhuǎn)變?yōu)槿芙鈶B(tài)氧的過(guò)程與液體吸收氣體的過(guò)程相同,所以可用描述氣體溶解于液體的雙膜理論的傳質(zhì)公式表示:N=kLa(C*-CL)

5、 N:O2的傳遞速率 C*:溶液中飽和溶解氧濃度 CL:溶液主流中的溶解氧濃度 kL:以濃度差為推動(dòng)力的氧傳質(zhì)系數(shù) a:比表面積培養(yǎng)基滅菌機(jī)理:致死溫度:殺死微生物的極限溫度(最低或最高溫度)2致死時(shí)間:在致死溫度下,殺死全部微生物所需時(shí)間。反應(yīng)速率常熟K:K與菌種的特性有關(guān),相同溫度下,微生物越耐熱,K值越?。幌嗤瑴囟认?,微生物越不耐熱,K值越大同樣的溫差,如同樣升高10,活化能越高,則K增加越多,K對(duì)溫度越敏感。活化能為零,則為零級(jí)反應(yīng)。K不隨溫度變化。碳氮比:有機(jī)物中碳的總含量與氮的總含量的比氮源過(guò)多,會(huì)使菌體生長(zhǎng)過(guò)于旺盛,pH偏高,不利于代謝產(chǎn)物的積累;氮源不足,則菌體繁殖量少,從而影

6、響產(chǎn)量。碳源過(guò)多,則容易形成較低的pH(封壓變大,CO2在水中溶解度變大),不利于菌體的生長(zhǎng),若碳源不足則會(huì)引起菌體的衰老和自溶。速效碳源:能夠被微生物直接利用的含碳化合物遲效氮源:無(wú)機(jī)氮源或已蛋白質(zhì)降解產(chǎn)物形式存在的有機(jī)氮源速效氮源:可以直接被菌體吸收利用的氮源內(nèi)源調(diào)節(jié):由發(fā)酵液中微生物分泌的代謝產(chǎn)物導(dǎo)致的發(fā)酵液pH的變化外源調(diào)節(jié):由外源添加的物質(zhì)導(dǎo)致的發(fā)酵液pH的變化如何調(diào)節(jié):用難溶碳酸鹽調(diào)節(jié)pH滲透壓:在半透膜兩側(cè)由于濃度差而導(dǎo)致的溶劑壓力差。附上圖 恰好能夠阻止水分子通過(guò)半透膜從濃度較低的溶液移向濃度較高的液體的,在較高濃度溶液的液面上施加的額外壓強(qiáng)。濕熱滅菌:微生物細(xì)胞是由蛋白質(zhì)組成

7、,加熱可以導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性,從而達(dá)到微生物滅菌的目的。微生物對(duì)高溫的敏感性大于對(duì)低溫的敏感性,所以采用高溫滅菌是一種有效的滅菌方法。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的凝固性與其本身的含水量有關(guān),在菌體受熱時(shí),當(dāng)環(huán)境和細(xì)胞內(nèi)的含水量越大,蛋白質(zhì)凝固越快。優(yōu)點(diǎn):更低溫度達(dá)到更好的效果。高溫比低溫易死,濕熱比干熱更易死。易錯(cuò)PCR:指在擴(kuò)增目的基因的同時(shí)加入堿基錯(cuò)配,導(dǎo)致目的基因隨機(jī)突變交錯(cuò)延伸:在PCR反應(yīng)中把常規(guī)的退火和延伸合并為一步,縮短其反應(yīng)時(shí)間,從而只能合成出非常短的新生鏈,經(jīng)變性的新生鏈再作為引物與體系內(nèi)同時(shí)存在的不同模板退火而繼續(xù)延伸。填空:發(fā)酵方法的類別:按微生物生長(zhǎng)特性: 分批發(fā)酵 連續(xù)發(fā)酵按培養(yǎng)基物理

8、性狀: 液體 固體 按對(duì)氧氣需要: 厭氧 有氧發(fā)酵按用途: 斜面培養(yǎng)基 種子培養(yǎng)基 發(fā)酵培養(yǎng)基細(xì)菌:營(yíng)養(yǎng)肉湯和營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基 牛肉膏和蛋白胨菌種保藏的意義:菌種會(huì)退化菌種保藏的原理:休眠體菌種保藏的方法:斜面低溫保藏 液體石蠟保藏 液氮冷凍保藏 臨時(shí)保種 低溫缺氧 慢速凍結(jié) 每min 30 霉菌 酵母菌 有芽孢的細(xì)菌易保存Q發(fā)酵=Q生物+Q攪拌Q蒸發(fā)Q輻射微生物細(xì)胞的破碎:機(jī)械破碎法:高壓勻漿法 珠磨法 超聲波碎法 非機(jī)械破碎法:溶酶法 化學(xué)滲透法 除菌方法:輻射殺菌 熱殺菌 靜電除菌 過(guò)濾除菌法(空氣中用得最多)降低發(fā)酵液中的CL:減少通氣量或攪拌轉(zhuǎn)速膜分離的四種方法: 透析、超濾、反滲透、

9、電滲透簡(jiǎn)答:滅菌意義:如有雜菌 6.噬菌體溶菌 5.雜菌降解所要產(chǎn)物 4.雜菌湯所產(chǎn)生的物質(zhì)使提取產(chǎn)物時(shí)發(fā)生困難 3.雜菌污染終產(chǎn)品 2.雜菌生長(zhǎng)速度快1.攪拌槳的作用:1產(chǎn)生軸向和橫向流動(dòng),促進(jìn)傳質(zhì)和傳熱2打碎氣泡,增加氣液接觸面積,提高溶氧3消除泡沫4速度太快會(huì)導(dǎo)致剪切力增加,也會(huì)導(dǎo)致氣泛提高飽和溶解氧濃度C*的辦法:降溫溶液性質(zhì):溶質(zhì)含量越高,氧溶解度越小氧分壓:在系統(tǒng)總壓小于0.5MPa時(shí),氧在aq中溶解度只與氧的分壓成直線關(guān)系,氣相中氧濃度越高,溶液中氧濃度也增加溫?zé)釡缇退沟聹缇壕?、啤酒、乳類、奶油和各種腌制食物的調(diào)制63 30s 7215s間歇滅菌:各種M的營(yíng)養(yǎng)體在100下半小

10、時(shí)即可被殺死,先殺親本,等子代長(zhǎng)大再殺而芽孢和孢子不會(huì)失去活力,當(dāng)它們長(zhǎng)成營(yíng)養(yǎng)體再殺菌,連續(xù)滅菌3次過(guò)濾除菌:用于壓縮空氣,酶溶液以及其他不耐熱的微生物 0.01-0.45mm輻射滅菌(超凈工作臺(tái)):紫外線、X射線、Y射線 紫外燈剛滅菌有O3(臭味)化學(xué)物質(zhì)滅菌:使用范圍:器皿、雙手,實(shí)驗(yàn)室、無(wú)菌室的環(huán)境滅菌,不能用于培養(yǎng)基滅菌高錳酸鉀:強(qiáng)氧化劑,使Pro氧化 (浸化)漂白粉:強(qiáng)氧化劑,使Pro氧化變性75%酒精:細(xì)胞脫水,Pro凝固 新潔爾滅:陽(yáng)離子表面活性劑,膜損傷和蛋白質(zhì)變性甲醛:強(qiáng)還原劑,與氨基結(jié)合,蛋白質(zhì)變性。利用高錳酸鉀的催化作用,促使甲醛迅速蒸發(fā)放出大量穿透力大,殺菌力弧的甲醛氣

11、體,進(jìn)行空氣消毒發(fā)酵工程的產(chǎn)品:1.以微生物細(xì)胞為產(chǎn)物的發(fā)酵工業(yè) 2.以微生物代謝產(chǎn)物為產(chǎn)品的發(fā)酵工業(yè) 3.以微生物酶為產(chǎn)品的發(fā)酵工業(yè) 4.生物轉(zhuǎn)化或修飾化合物的發(fā)酵工業(yè)1、 生物技術(shù)包括哪些主要內(nèi)容?基因工程在生物技術(shù)中作用和地位? 主要內(nèi)容:基因、細(xì)胞、酶、蛋白質(zhì)、分子進(jìn)化工程 地位:是現(xiàn)代生物技術(shù)中的核心技術(shù) 作用:基因工程的主要原理是應(yīng)用人工方法將生物遺傳物質(zhì)DNA分離出來(lái),在體外進(jìn)行切割、拼接和重組,然后通過(guò)運(yùn)載工具將重組的基因?qū)肽撤N宿主細(xì)胞或個(gè)體,從而改變宿主的遺傳特性;有時(shí)還使導(dǎo)入新的遺傳信息在宿主細(xì)胞中或個(gè)體中大量表達(dá),以獲得大量所需的基因表達(dá)產(chǎn)物(各種生理活性物質(zhì),如蛋白質(zhì)

12、、酶、多肽、抗生素等等)。這種利用DNA重組技術(shù)來(lái)創(chuàng)造新物種或給予生物以特殊的技術(shù)稱基因工程,由此可見(jiàn),基因工程為生物技術(shù)中的其他內(nèi)容如細(xì)胞工程、酶工程等提供了基礎(chǔ),為其它內(nèi)容提供新的,具有特殊功能的細(xì)胞。2、 簡(jiǎn)述生物技術(shù)在食品工業(yè)中的作用 傳統(tǒng)生物技術(shù):傳統(tǒng)生物技術(shù)從很早起便為人們所開(kāi)發(fā)和利用,并造福人類,如利用傳統(tǒng)生物技術(shù),人們使面包發(fā)酵,制作酒精飲料,果汁發(fā)酵、制醋和釀酒等。豐富了食物的風(fēng)味和種類 現(xiàn)代生物技術(shù):現(xiàn)代生物技術(shù)以基因工程為核心,帶動(dòng)了現(xiàn)代發(fā)酵工程、現(xiàn)代酶工程、現(xiàn)代細(xì)胞工程、蛋白質(zhì)工程以及分子進(jìn)化工程的發(fā)展,它的出現(xiàn),為改造傳統(tǒng)的食品生產(chǎn)、進(jìn)行食品深度加工,開(kāi)發(fā)新產(chǎn)品,提高

13、食品質(zhì)量和減少營(yíng)養(yǎng)損失增添了新的活力如其中的基因工程和細(xì)胞工程可改善食品原料農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)和提高產(chǎn)量;通過(guò)基因工程、發(fā)酵工程、酶工程、蛋白質(zhì)工程和分子進(jìn)化工程食品加工工藝高效化,提高食品附加值,提高農(nóng)產(chǎn)品利用率,以及提高食品保健功能;利用生物技術(shù)減少食品損失,保證食品的安全性和質(zhì)量。1、 何為限制性內(nèi)切酶?II型限制性內(nèi)切酶的基本特征有哪些?限制性內(nèi)切核酸酶,簡(jiǎn)稱限制酶,是指一類能夠識(shí)別和切割雙鏈DNA分子內(nèi)核苷酸序列的內(nèi)切核酸酶基本特征: 識(shí)別序列和切割位點(diǎn):大多數(shù)II型限制性內(nèi)切核酸酶可識(shí)別長(zhǎng)度為4-7bp的雙鏈DNA特定序列,該識(shí)別序列(識(shí)別位點(diǎn))常呈旋轉(zhuǎn)對(duì)稱性 切割方式:根據(jù)雙鏈DNA被

14、切割所稱的末端,可分為平齊末端,黏性末端和單鏈黏性末端 同裂酶和同尾酶:由同尾酶切割DNA所得到的黏性末端可以彼此連接起來(lái),但是由此連接形成的重組DNA分子往往不能被原來(lái)同尾酶中的任何一種重新切開(kāi),即原來(lái)同尾酶的識(shí)別序列都已不再存在。 限制性片段長(zhǎng)度與切割頻率:不同限制酶切割后所產(chǎn)生的DNA后所形成的限制性片段長(zhǎng)度不一2、 DNA聚合酶在分子生物學(xué)基因工程中有哪些用途?DNA聚合酶催化DNA體外合成反應(yīng)。不同DNA聚合酶具有不同用途: 大腸桿菌DNA聚合酶I:a以切刻平板法標(biāo)記DNA;b對(duì)DNA分子的3突出尾進(jìn)行末端標(biāo)記 大腸桿菌DNA聚合酶I大片段:a補(bǔ)平限制酶切割雙鏈DNA所產(chǎn)生的3凹端;

15、b如果以標(biāo)記的dNTP補(bǔ)平雙鏈DNA的3凹端,那么可對(duì)DNA分子進(jìn)行末端標(biāo)記;c對(duì)DNA分子的3突出尾進(jìn)行末端標(biāo)記;d在cDNA克隆中,合成cDNA第二鏈;e應(yīng)用Sanger雙脫氧末端終止法進(jìn)行DNA測(cè)序 T4噬菌體DNA聚合酶:a補(bǔ)平限制酶雙鏈DNA產(chǎn)生的3凹端;b如果以標(biāo)記的dNTP補(bǔ)平雙鏈DNA的3凹端,那么可對(duì)DNA分子進(jìn)行末端標(biāo)記;c對(duì)DNA分子的3突出尾進(jìn)行末端標(biāo)記,并且該酶為利用此法進(jìn)行此類末端標(biāo)記的首選酶;d將雙鏈DNA的突出端轉(zhuǎn)化成平齊端 TaqDNA聚合酶:a對(duì)DNA進(jìn)行測(cè)序b通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)對(duì)DNA分子的特定序列進(jìn)行體外擴(kuò)增 逆轉(zhuǎn)錄酶:a將mRNA轉(zhuǎn)錄成雙鏈cDNA;b

16、標(biāo)記帶5突出端的DNA片段(補(bǔ)平反應(yīng));c當(dāng)大腸桿菌DNA聚合酶I的KIenow片段或測(cè)序酶等使用結(jié)果不理想時(shí),它可用于雙脫氧鏈終止法測(cè)定DNA序列 末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶:a給載體DNA或cDNA加上互補(bǔ)的同聚尾;b以32P標(biāo)記的一種dNTP、一種ddNTP或一種rNTP來(lái)標(biāo)記DNA片段的3端3、 理想的質(zhì)粒基因工程載體的應(yīng)具備哪些條件? 分子結(jié)構(gòu)中具有多個(gè)單一限制酶切位點(diǎn),具有易被檢測(cè)的選擇標(biāo)記基因,且切點(diǎn)位于選擇標(biāo)記基因上; 能插入、運(yùn)載一定大小的外源基因; 在攜帶外源基因前后在宿主細(xì)胞內(nèi)均能自主復(fù)制 在與外源基因構(gòu)建重組質(zhì)粒后具有轉(zhuǎn)化功能; 分子量小,易于操作,一般為松弛型復(fù)制控制 容易

17、控制,安全可靠4、 Ti一元載體和雙元載體體統(tǒng)比較有哪些優(yōu)缺點(diǎn)? 微型Ti質(zhì)粒具有大腸桿菌質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn),能在大腸桿菌宿主中復(fù)制,使其質(zhì)??截悢?shù)增加10-100倍 微型Ti質(zhì)粒分子量?。?0kb),可以直接對(duì)其進(jìn)行體外遺傳操作,而且將其導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌也比較容易 一元載體系統(tǒng)的重組頻率很低,而雙元載體系統(tǒng)兩個(gè)質(zhì)粒的接合頻率較高,一般后者比前者至少高4倍 一元載體系統(tǒng)構(gòu)建成功后工程菌的穩(wěn)定性較好,而雙元載體系統(tǒng)相應(yīng)穩(wěn)定性較差,易丟失 雙元載體系統(tǒng)不需要經(jīng)過(guò)共整合過(guò)程。因?yàn)?,雙元載體系統(tǒng)中的兩個(gè)質(zhì)粒不必含有同源序列,而且構(gòu)建操作步驟比較簡(jiǎn)單。 雙元載體系統(tǒng)在外源基因轉(zhuǎn)入植物細(xì)胞前,無(wú)須進(jìn)行同源重組。

18、因此插入雙元載體系統(tǒng)外源基因的可能變異比插入一元載體系統(tǒng)外源基因的可能變異小 雙元載體系統(tǒng)比一元載體系統(tǒng)對(duì)植物的轉(zhuǎn)化效率高5、 標(biāo)記基因應(yīng)具備哪些條件?舉例說(shuō)明植物載體中常用的選擇標(biāo)記基因和篩選標(biāo)記基因標(biāo)記基因一般需要具備以下幾個(gè)條件: 編碼一種不存在于正常植物細(xì)胞中的酶 基因較小,可以構(gòu)成嵌合基因 能在轉(zhuǎn)化體中得到充分表達(dá) 檢測(cè)容易,并能定量分析植物載體中常用的選擇標(biāo)記基因: Npt-II(新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶)基因:目前在植物基因工程中應(yīng)用最廣泛的選擇標(biāo)記基因原理:其表達(dá)產(chǎn)物通過(guò)酶促磷酸化作用使氨基葡萄糖苷類抗生素失活,從而解除其毒性,它對(duì)茄科植物的轉(zhuǎn)化選擇特別有效,但是,其對(duì)豆科植物和單子葉

19、植物的轉(zhuǎn)化選擇效果不好 HPT(潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶)基因:原理:其表達(dá)產(chǎn)物通過(guò)酶促磷酸化作用使潮霉素失活,從而解除其毒性植物載體中常用的篩選標(biāo)記基因: Gus(葡萄醛酸糖苷酶)基因:來(lái)自于大腸桿菌染色體其在植物細(xì)胞中所產(chǎn)生的葡糖醛酸糖苷酶在檢測(cè)上具有以下特點(diǎn):A 在一定條件下水解特定底物5-溴-4-氯-3-吲哚-D-葡糖醛酸酯生成藍(lán)色物質(zhì),呈現(xiàn)藍(lán)色沉淀。因此,既可用分光光度計(jì)測(cè)定,又可通過(guò)組織化學(xué)方法直接觀察植物組織中的藍(lán)色沉淀斑點(diǎn)B 在一定條件下,水解特定底物4-甲基傘形酮酰-葡糖醛酸苷生成4-甲基傘形酮,產(chǎn)生熒光,因此,可用熒光光譜法測(cè)定,該法非常靈敏。C 檢測(cè)簡(jiǎn)便、迅速且能定量D Gus檢

20、測(cè)比Ntp-II檢測(cè)便宜,且不需要使用放射性同位素 Cat(氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶)基因:該基因來(lái)自于細(xì)菌轉(zhuǎn)座子Tn9其在植物細(xì)胞中所產(chǎn)生的氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶在檢測(cè)上具有以下特點(diǎn):A 可用硅膠G薄層層析法等測(cè)定所生成的乙?;a(chǎn)物以確定該酶的活性,但操作繁瑣B 一般Cat基因表達(dá)產(chǎn)物不夠穩(wěn)定C 測(cè)定花費(fèi)大6、 酶促標(biāo)記探針的方法有哪些?用到了哪些工具酶? 切刻平移法:DNA酶I DNA聚合酶I 隨機(jī)引物法:DNA聚合酶I 末端標(biāo)記法:DNA聚合酶I,T4DNA聚合酶,T4多核苷酸激酶,末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶7、 Southern blotting的實(shí)驗(yàn)流程及注意要點(diǎn)實(shí)驗(yàn)流程:用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切核酸酶對(duì)待測(cè)

21、DNA進(jìn)行酶切經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳將所得DNA片段按分子量大小分離將含有DNA片段的瓊脂糖凝膠進(jìn)行堿變性處理將其中的單鏈DNA片段轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素濾膜或其它固相支持物上(各DNA片段的相對(duì)位置保持不變)放射自顯影或免疫酶法顯色顯示雜交結(jié)果注意要點(diǎn): 所取待測(cè)DNA樣品的量因樣品種類及研究目的而異,對(duì)于克隆片段的限制性內(nèi)切酶圖譜分析,取0.1-0.5g;對(duì)于鑒定基因組DNA中的單拷貝基因序列,取10-20g;對(duì)于采用寡核苷酸探針或當(dāng)探針的比放射性活性較低時(shí),取30-50g 選用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切核酸酶酶切待測(cè)DNA樣品的目的在于獲得合適長(zhǎng)度的DNA片段,一般而言,較理想的片段長(zhǎng)度為0.5-10kb 電

22、泳結(jié)束后,需要在紫外線下仔細(xì)觀察檢查DNA樣品有無(wú)降解,酶切是否完全,電泳分離效果是否理想,DNA電泳帶型是否清晰,有無(wú)拖尾現(xiàn)象。 一般采用0.45m孔徑的硝酸纖維素濾膜,但當(dāng)DNA片段小于300bp時(shí),可選用0.22m孔徑的硝酸纖維素濾膜或采用尼龍膜8、 PCR反應(yīng)體系有哪些成分?PCR的基本流程反應(yīng)體系: KCl 50mmol/L Tris-Cl 10mmol/L(在室溫時(shí)pH8.4) MgCl2 1.5mmol/L 明膠或牛血清蛋白 100g/L 2個(gè)引物 各0.25mol/L 4種底物(dATP、dCTP、dGTP、dTTP) 各200mol/L 模板DNA 0.1g TaqDNA聚合

23、酶 2.5IUPCR的基本流程: 變性,通過(guò)加熱至一定溫度使雙鏈DNA兩鏈之間的氫鍵斷裂,DNA雙鏈離解形成兩條DNA單鏈 復(fù)性,當(dāng)反應(yīng)體系溫度突然降低時(shí),由于模板DNA分子的結(jié)構(gòu)比引物DNA分子復(fù)雜得多,而且反應(yīng)體系中引物的量大大多于模板,因此引物和與其互補(bǔ)的模板配對(duì)形成局部雜交雙鏈,而變形后離解形成的兩條模板DNA單鏈之間互補(bǔ)配對(duì)的機(jī)會(huì)則較少 延伸:在4種脫氧核糖核苷三磷酸底物、Mg2+等存在的條件下,TaqDNA聚合酶以模板-引物雜交體分別為模板和引物催化DNA鏈沿5-3方向合成延伸,每個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增產(chǎn)物作為下循環(huán)的模板9、 PCR引物設(shè)計(jì)的一般原則(1) 長(zhǎng)度可為15-30nt,常為20

24、-27nt(2) G+C含量一般可謂40%-60%,常為45%-55%(3) 組成堿基盡可能隨機(jī)分布,不能存在聚嘌呤或者聚嘧啶。尤其3端不能以3個(gè)連續(xù)G或者3個(gè)連續(xù)結(jié)束。否則,會(huì)使引物在模板G+C富集區(qū)錯(cuò)誤引發(fā)。(4) 引物自身不能存在互補(bǔ)序列,連續(xù)互補(bǔ)堿基不能超過(guò)3個(gè)。否則,引物自身會(huì)折疊形成發(fā)獎(jiǎng)狀等二級(jí)結(jié)構(gòu),這些二級(jí)結(jié)構(gòu)的空間位阻作用更影響引物與末班的復(fù)性結(jié)合。(5) 兩個(gè)引物之間不能有互補(bǔ)性,尤其3端不能存在互補(bǔ)性。否則,會(huì)形成引物二聚體。兩個(gè)引物之間不能超過(guò)4個(gè)連續(xù)堿基的同源性或者互補(bǔ)性。(6) 引物3端原則上須與模板DNA配對(duì)。當(dāng)引物3端末位堿基為A時(shí),即使在錯(cuò)配的情況下,也能較好引

25、發(fā)鏈的延伸。而當(dāng)引物3端末位堿基為T(mén)時(shí),如果為錯(cuò)配之堿基,其引發(fā)鏈延伸的效率就大大降低。當(dāng)引物3端末位堿基為G或C時(shí),如果錯(cuò)配之堿基,其引發(fā)鏈延伸的效率就介于上述兩者之間。因此,引物3端的末位堿基最好選T、C或G,不選A。(7) 由于引物5端只限定PCR產(chǎn)物的長(zhǎng)度,而不影響擴(kuò)增的特異性,因此引物5端可被修飾。修飾包括:附加酶切位點(diǎn)、引入蛋白質(zhì)結(jié)合序列、突變位點(diǎn)、啟動(dòng)子、生物素等。總之,引物5端堿基沒(méi)有嚴(yán)格限制,只要與模板DNA結(jié)合的引物部分的長(zhǎng)度足夠,其5端堿基可以不與模板DNA匹配而呈游離狀。(8) 如果需要擴(kuò)增編碼區(qū)域,引物3端就不要終止于密碼子的第三位,因?yàn)槊艽a子的第三位易出現(xiàn)簡(jiǎn)并現(xiàn)象,

26、從而影響擴(kuò)增的特異性與效率。(9) 引物的序列與模板的非擴(kuò)增區(qū)序列之間的同源性不要超過(guò)70%或者不要有連續(xù)8個(gè)堿基互補(bǔ)同源。10、 反向PCR,簡(jiǎn)并PCR,逆轉(zhuǎn)錄PCR,巢式PCR(1) 反向PCR:將含已知序列區(qū)段的DNA分子,用在已知序列區(qū)段內(nèi)沒(méi)有切點(diǎn)的合適的限制性內(nèi)切核酸酶媒介,產(chǎn)生大小適于PCR擴(kuò)增的酶切片段。將這些酶切片段的兩端連接起來(lái)形成環(huán)狀分子,用一對(duì)與已知序列區(qū)段兩側(cè)互補(bǔ)的引物進(jìn)行PCR。對(duì)已知序列區(qū)段而言,在引物與模板復(fù)性后,兩引物的3端相背,兩引物的延伸沿環(huán)狀分子的未知序列區(qū)段進(jìn)行。(2) 簡(jiǎn)并PCR:所謂簡(jiǎn)并引物是指堿基序列不同,但有相同堿基數(shù)的一組針對(duì)某一基因相同區(qū)段的

27、寡核苷酸混合物。值得指出的是,由于次黃嘌呤可與任何堿基配對(duì),因此在堿基高度簡(jiǎn)并位置可以使用次黃嘌呤替代。簡(jiǎn)并引物PCR是指利用簡(jiǎn)并引物進(jìn)行PCR的方法,該法主要用于僅知蛋白質(zhì)部分序列而求知其編碼基因序列的研究、尋找已知基因家族中新成員的研究等。(3) 逆轉(zhuǎn)錄PCR:以總RNA或mRNA為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,然后再進(jìn)行PCR擴(kuò)增。該法主要用于基因表達(dá)等研究。(4) 巢式PCR:首先以第一對(duì)引物對(duì)模板進(jìn)行擴(kuò)增,即擴(kuò)增靶基因中較大區(qū)域片段DNA,然后再以較大區(qū)域內(nèi)的序列設(shè)計(jì)合成第二對(duì)引物。再對(duì)模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,即擴(kuò)增靶基因中較小區(qū)域片段DNA。該法兩次連續(xù)擴(kuò)增模板靶基因,可進(jìn)一步提高PCR檢測(cè)的靈敏度

28、和特異性。該法特別適于微量模板的擴(kuò)增11、 如果要分離目標(biāo)基因,應(yīng)該至少知道哪些特征?在完全位置基因核苷酸序列的情況下,基因的分離策略大多比較復(fù)雜。一般分離基因的策略多基于基因一下幾個(gè)基本特性中的至少一個(gè):具有特定的核苷酸序列;存在于基因組中某一特定位置;編碼mRNA;大多具有一定的功能。12、 目標(biāo)基因制備的方法有哪些?(1) 基因化學(xué)合成法:全基因合成;基因的半合成就化學(xué)本質(zhì)而言,基因是一段具有特定生物功能的核苷酸序列。如果知道了基因的分子結(jié)構(gòu),就可以進(jìn)行基因的化學(xué)合成。(2) 基因組文庫(kù)法:機(jī)械切割法;限制性內(nèi)切酶局部消化法是一種直接從基因組中分離目的基因的方法。所謂基因組文庫(kù)是指匯集某

29、一基因組所有DNA序列的重組DNA群體(3) cDNA文庫(kù)法:是從真核生物細(xì)胞分中分離目的基因的常用方法cDNA文庫(kù):是指匯集以某種生物成熟mRNA為模板逆轉(zhuǎn)錄而成的cDNA序列的重組DNA群體構(gòu)建cDNA文庫(kù)的一般操作程序如下:總RNA的提取mRNA的分離cDNA雙鏈的合成cDNA與載體連接噬菌體的包裝及轉(zhuǎn)染或質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化(4) PCR法:可用于已知核苷酸片段的特意擴(kuò)增;而一些改進(jìn)的PCR法可以用于一些未知核苷酸序列核酸片段的特意擴(kuò)增。13、 重組體導(dǎo)入大腸桿菌,植物動(dòng)物各有什么方法?植物:農(nóng)桿菌質(zhì)粒介導(dǎo)法;基因槍法動(dòng)物:顯微注射法;磷酸鈣共沉淀法;電穿孔法;病毒感染法14、 重組體篩選和鑒定

30、方法(遺傳檢測(cè)法) 利用表型特征進(jìn)行篩選a) 利用載體提供的表型特征進(jìn)行篩選(抗藥性標(biāo)記基因插入失活篩選法;-半乳糖苷酶顯色反應(yīng)篩選法)b) 利用外源DNA提供的表型特征進(jìn)行篩選c) 利用噬菌斑的形成進(jìn)行篩選d) 利用遺傳互補(bǔ)作用進(jìn)行篩選 物理篩選鑒定法(電泳檢測(cè)法;R-環(huán)檢測(cè)法) 利用限制性內(nèi)切核酸酶酶切進(jìn)行鑒定 利用核酸雜交進(jìn)行鑒定 利用PCR技術(shù)進(jìn)行鑒定 利用免疫學(xué)方法進(jìn)行篩選鑒定放射性抗體檢測(cè)法;免疫沉淀檢測(cè)法;酶聯(lián)免疫吸附檢測(cè)法 利用Western雜交進(jìn)行鑒定 利用寡核苷酸序列測(cè)定進(jìn)行鑒定 轉(zhuǎn)譯篩選鑒定法(阻斷轉(zhuǎn)譯雜交法;釋放轉(zhuǎn)譯雜交法)15、 幾丁質(zhì)酶具有抗真菌作用,設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)獲得幾

31、丁質(zhì)抗真菌植物基因序列已知 基因序列未知 設(shè)計(jì)引物(加合適限制性內(nèi)切酶 獲得基因序列 位點(diǎn),保證閱讀框不被破壞) 擴(kuò)增基因、酶和Ti載體連接 (合適的啟動(dòng)子、終止子、篩選標(biāo)記等) 篩選陽(yáng)性克隆(抗藥性、PCR、酶切、 測(cè)序)-E.coli 轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌、轉(zhuǎn)入植物細(xì)胞 篩選轉(zhuǎn)化細(xì)胞,驗(yàn)證、獲得完整植株評(píng)價(jià)蛋白質(zhì)工程1、 蛋白質(zhì)工程的組成部分蛋白質(zhì)工程主要包括以下兩方面: 分子遺傳學(xué)的相關(guān)理論與技術(shù):完整的cDNA克隆技術(shù)、DNA序列的快速測(cè)定技術(shù)、DNA序列推測(cè)蛋白質(zhì)序列的多維程序系統(tǒng)、原核生物及真核生物基因表達(dá)過(guò)程的調(diào)控、基因的定位誘變及隨機(jī)誘變理論與技術(shù) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能相關(guān)的理論與技術(shù):蛋白質(zhì)

32、一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸序列的分析、X光單晶衍射結(jié)構(gòu)分析技術(shù)、兩維和三維核磁共振結(jié)構(gòu)分析技術(shù)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)的建立、蛋白質(zhì)功能的酶學(xué)和免疫研究技術(shù)。2、 目的基因的定點(diǎn)突變的方法有哪些 寡核苷酸引物街道的定點(diǎn)突變 PCR介導(dǎo)的定點(diǎn)突變 盒式突變3、 易錯(cuò)PCR的原理,簡(jiǎn)述利用易錯(cuò)PCR進(jìn)行酶分子進(jìn)化的基本實(shí)驗(yàn)流程易錯(cuò)PCR:是在采用DNA聚合酶進(jìn)行目的基因擴(kuò)增時(shí),通過(guò)調(diào)整反應(yīng)條件,如提高M(jìn)g2+濃度、加入錳離子、改變體系中四種dNTPs濃度或運(yùn)用低保真度DNA聚合酶等,未改變擴(kuò)增過(guò)程中的突變頻率,從而以一定的頻率向目的基因中隨機(jī)引入突變,獲得蛋白質(zhì)分子的隨機(jī)突變體第五章 細(xì)胞工程1、 何為細(xì)胞融合技術(shù)?誘

33、導(dǎo)細(xì)胞融合的方法有哪些?細(xì)胞融合技術(shù):是利用自然或人工的方法使兩個(gè)或幾個(gè)不同細(xì)胞融合為一個(gè)細(xì)胞,用于制造新的物種或品系(植物、微生物上用得多,動(dòng)物上用得少)及產(chǎn)生單克隆抗體等的技術(shù)誘導(dǎo)細(xì)胞融合的方法:病毒誘導(dǎo)細(xì)胞融合、化學(xué)因子誘導(dǎo)的細(xì)胞融合、電融合方法、其他2、 影響微生物原生質(zhì)體形成的因素有哪些? 菌齡:微生物菌體的不同生長(zhǎng)時(shí)期,表現(xiàn)的生理狀況不同,不同生長(zhǎng)時(shí)期的微生物細(xì)胞的細(xì)胞壁對(duì)脫壁促進(jìn)劑的敏感程度可能會(huì)存在很大的不同。一般而言,對(duì)數(shù)期的菌體易被溶解酶脫壁,原生質(zhì)體的生成效率最高 培養(yǎng)基成分;構(gòu)巢曲霉生長(zhǎng)于葡萄糖+鹽的培養(yǎng)基菌絲比酵母膏培養(yǎng)基培養(yǎng)的菌絲有利于原生質(zhì)體的形成,降低磷或增加螯

34、合劑也有利于原生質(zhì)體的形成 培養(yǎng)方法也影響原生質(zhì)體形成 酶的用量和處理時(shí)間也影響原生質(zhì)體的形成 獲得的原生質(zhì)體要保存與核實(shí)的滲透環(huán)境3、 微生物原生質(zhì)體如何制備?1) 親本菌株的標(biāo)記(如何將親本菌株與雜種細(xì)胞有效地分離是原生質(zhì)體融合技術(shù)中非常關(guān)鍵的一步)親本的標(biāo)記是否適于融合子的有效檢出和融合子中優(yōu)良性狀的保持有很大關(guān)系。 營(yíng)養(yǎng)缺陷型標(biāo)記 抗藥性標(biāo)記 熒光標(biāo)記 失活原生質(zhì)體供體法2) 不同微生物細(xì)胞壁的消化一般采用溶菌酶處理就可達(dá)到細(xì)胞壁消化的目的。主要的細(xì)菌細(xì)胞壁溶解酶可分為兩大類:作用與糖苷鍵的糖苷酶類和作用于酰胺部分和肽部分的酶。前者也稱自溶素,在微生物的細(xì)胞自溶中起重要作用;后一類酶包

35、括了切開(kāi)肽聚糖中肽段部分肽鍵的肽酶。4、 微生物細(xì)胞融合的基本步驟 微生物原生質(zhì)體的制備 原生質(zhì)體的再生(原生質(zhì)體只有再生才能對(duì)其后代進(jìn)行遺傳鑒定, 而且再生率的高低,將直接影響原生質(zhì)體融合育種的重組效果 原生質(zhì)體的融合和雜合子的篩選5、 細(xì)胞系、細(xì)胞株、原代培養(yǎng)、細(xì)胞傳代細(xì)胞系:原代培養(yǎng)物經(jīng)首次傳代成功后即成為細(xì)胞系。如果傳代有限,可稱為有限細(xì)胞系;如可連續(xù)傳代,則稱為聯(lián)系細(xì)胞系。細(xì)胞株:通過(guò)選擇法或克隆從原代培養(yǎng)物或細(xì)胞系中獲得的具有特殊性質(zhì)或標(biāo)志的培養(yǎng)物稱為細(xì)胞株。原代培養(yǎng):從供體取得組織細(xì)胞后,在體外進(jìn)行的首次培養(yǎng)(PPT)。以直接取自生物體細(xì)胞、組織或器官開(kāi)始的培養(yǎng)稱為原代培養(yǎng)。細(xì)胞

36、傳代:當(dāng)原代培養(yǎng)的細(xì)胞增值到一定程度時(shí)(一般標(biāo)準(zhǔn)是瓶底被細(xì)胞覆蓋),這時(shí)需進(jìn)行分離培養(yǎng),細(xì)胞由原代培養(yǎng)瓶分離稀釋后轉(zhuǎn)到新的培養(yǎng)液的過(guò)程,稱為傳代。(PPT)無(wú)論稀釋與否,將細(xì)胞從一個(gè)培養(yǎng)容器轉(zhuǎn)移或移植到另一個(gè)培養(yǎng)容器即稱為傳代或傳代培養(yǎng)。6、 植物細(xì)胞培養(yǎng)、外植體、愈傷組織、細(xì)胞全能性植物細(xì)胞培養(yǎng):即植物細(xì)胞的體外培養(yǎng),是指在無(wú)菌條件i啊,將植物細(xì)胞從機(jī)體內(nèi)分離出來(lái),在營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基上使其生存和生長(zhǎng)的過(guò)程。利用細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)可以直接觀察到生活細(xì)胞的形態(tài)和生長(zhǎng)活動(dòng),并且將植物微生物化,在一定容積的反應(yīng)器中得到大量的植物細(xì)胞。植物細(xì)胞培養(yǎng)主要依據(jù)是細(xì)胞的全能性,即植物體每一個(gè)分化的細(xì)胞在一定培養(yǎng)條件下具

37、有形成一個(gè)完整植株的潛在能力。再生的植物具有與母體植株基本相同的全套遺傳信息。外植體:植物組織培養(yǎng)中,作為離體培養(yǎng)材料的器官或組織的片段統(tǒng)稱為外植體愈傷組織:愈傷組織是由母體外植體組織的增生細(xì)胞產(chǎn)生的一團(tuán)不定型的疏松排列的薄壁細(xì)胞。一般愈傷組織培養(yǎng)中沒(méi)有明顯的組織或器官的分化。細(xì)胞全能性:這是指植物體的每個(gè)細(xì)胞在離體條件下都具有誘導(dǎo)生長(zhǎng)分化形成完整植株的潛在能力,這是由于每個(gè)細(xì)胞都有一套完整的基因組。細(xì)胞全能性是植物細(xì)胞核組織培養(yǎng)的主要依據(jù)。7、 植物細(xì)胞培養(yǎng)的營(yíng)養(yǎng)要求和特點(diǎn)植物細(xì)胞生長(zhǎng)所需營(yíng)養(yǎng)成分與整個(gè)植物對(duì)營(yíng)養(yǎng)的要求一樣,通產(chǎn)更包括:無(wú)機(jī)鹽、碳源、維生素、生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑、氮源、核酸及其水解物和其他成分。應(yīng)用最廣的是MS和LS培養(yǎng)基,特別適于植株再生。 無(wú)機(jī)鹽:鉀、銨、鈣、鎂、磷、 碳源和能源:一般以蔗糖和葡萄糖為碳源 維生素:植物細(xì)胞培養(yǎng)需要硫胺素,如果加入煙

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