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文檔簡介
1、傳染病的傳播及控制分析摘要為進一步探索傳染病的傳播和流行規(guī)律及其與防治措施的關系, 本文通過建立傳染病的傳播模型, 了解傳染病的擴散傳播規(guī)律, 為預測和控制傳染病提供可靠、足夠的信息。本文針對該問題建立了 SEIR 微分方程模型,對病毒的傳播過程進行了模擬分析,得出了患者人數(shù)隨時間的變化規(guī)律。我們將人群分為五類:患者、疑似患者、正常人、治愈者和死亡者。前三者作為傳染系統(tǒng)。我們認為治愈者獲得終身免疫,和死亡者一樣移出傳染系統(tǒng),即后兩者合并為移出者。本模型將病毒的傳染與擴散分為兩個部分: 控制前和控制后。 在控制前,相當于沒有對病毒擴散做任何限制, 患者數(shù)量短時間內大量增長, 并以死亡的形式退出傳
2、染系統(tǒng);在控制后,由于對潛伏者進行了一定強度的隔離,與此同時,確診患者得到有效的治療,使得傳染源數(shù)量減少,患者平均每天接觸的人數(shù)減少,治愈者增多,并作為主要的移出者移出傳染系統(tǒng)。在模型建立的基礎上, 通過 Matlab 軟件擬合出患者人數(shù)隨時間變化的曲線關系圖,得到如下結果:控制前,患者人數(shù)呈指數(shù)增長趨勢;控制后,在 p=0.4 時,患者人數(shù)大致在 7 天時到達最大值,在 25 天時基本沒有患者;在 p=0.3 時,患者人數(shù)大概在第 8 天到達最大值 186383,大概在 28 天之后基本沒有患者;在 p=0.6 時,大概在第 5 天患者人數(shù)到達峰值為 47391,在 21 天時基本沒有患者。
3、綜上分析,對隔離強度的處理是控制傳染病的一個重要手段。 針對所得結果, 對H7N9的傳播控制時提出了醫(yī)院、政府和個人應有的一些控制措施。關鍵詞: 隔離強度潛伏期SEIR 模型0一、問題重述:2013年中, H7N9是網上的熱點,尤其是其高致死率,引起了人們的恐慌,最近又有研究顯示, H7N9有變異的可能。假設已知有一種未知的現(xiàn)病毒1 潛伏期為a1 : a2 天,患病者的治愈時間為a3 天,假設該病毒可以通過人與人之間的直接接觸進行傳播,患者每天接觸的人數(shù)為r ,因接觸被感染的概率為(為感染率 ) 。為了控制疾病的傳播與擴散,將人群分成五類,患者、疑似患者、治愈者、死亡者、正常人。潛伏期內的患者
4、被隔離的強度為p (為潛伏期內患者被隔離的百分數(shù))。在合理的假設下建立該病毒擴散與傳播的控制模型,利用所給數(shù)據(jù)值生成患者人數(shù)隨時間變化的曲線,增強或者減弱疑似患者的隔離強度,比較患者人數(shù)發(fā)生的變化,并分析結果的合理性。最后結合該模型的數(shù)據(jù)對控制 H7N9的傳播做出一些科學的建議。二、問題假設:1、假設單位時間內感染病毒的人數(shù)與現(xiàn)有的感染者成比例;2、假設單位時間內治愈人數(shù)與現(xiàn)有感染者成比例;3、假設單位時間內死亡人數(shù)與現(xiàn)有的感染者成比例;4、假設患者治愈恢復后不會再被感染同種病毒,有很強的免疫能力,即被移除出此傳染系統(tǒng);5、假設正常人被傳染后,進入一段時間的潛伏期,處于潛伏期的人群不會表現(xiàn)癥狀
5、,不可傳染健康人,不具有傳染性;6、假設患者入院即表示患者被隔離治療,被視為無法跟別人接觸,故不會傳染健康人;7、假設實際治愈周期過后,如果患者沒有治愈,則認為患者死亡,即實際治愈周期過后,患者都被移出此感染系統(tǒng);8、假設考察地區(qū)內疾病傳播期間忽略人口的出生,死亡,流動等種群動力因素對總人數(shù)的影響。即:總人口數(shù)不變,記為 N;三、符號說明:1符號解釋說明S(t)t 時刻正常人(易受感染)人數(shù)E(t)t 時刻疑似患者的人數(shù)Q(t)t 時刻處于潛伏期的人數(shù)I(t)t 時刻確診患者的人數(shù)R(t)t 時刻退出傳染系統(tǒng)的人數(shù) (包括治愈者和死亡者)潛伏期的人數(shù)中轉化為確診患病的人數(shù)占潛伏期1人數(shù)的比例2
6、每日退出傳染系統(tǒng)的人數(shù)比例a3確診患者的治愈時間r患者的人均日接觸人數(shù)因接觸被感染的概率p潛伏期內的患者被隔離的強度四、問題分析:根據(jù)題意,這是一個傳染性病毒隨著時間演變的過程, 需要研究傳染病在傳播過程中各類人群的人數(shù)變化, 特別是通過研究患者和疑似患者的人數(shù)變化, 預測傳染病的傳染的高峰期和持續(xù)時間長度, 從而我們可以采取相應隔離措施達到控制傳染病傳播的效果。我們要分析、預測、研究它就得建立動態(tài)模型,查閱相關資料可知,關于傳染病的模型已有不少, 其中以微分方程模型最具代表性, 因題目中把人群分為五類:確診患者、疑似患者、治愈者、死亡和正常人,所以我們采用微分方程中的 SIER 模型,將死亡
7、者和治愈者都歸于系統(tǒng)移出者統(tǒng)稱為恢復人群。 在此基礎上,我們找出單位時間內這五類人群人數(shù)的變化來建立微分方程, 得出模型。再利用 matlab 編程畫出圖形,改變其隔離強度后重新作圖進行比較,對結果進行分析,并利用此模型對控制H7N9 的傳播做出建議。五、模型的建立和求解:5.1 傳染病模型的準備不同類型傳染病的傳播過程有其各自不同的特點, 弄清這些特點需要相當多的病理知識,因此我們不可能從醫(yī)學的角度一一分析各種傳染病的傳播, 而只是按一般的傳播機理建立模型。查閱相關資料可知, 目前關于傳染病的模型已有不少,其中以微分方程建立的模型比較具有代表性,模型復雜程度有區(qū)別,故適合的情形也不同,包括
8、I 模型、 SI 模型、 SIR 模型、 SEIR模型等 2 。2I 模型是最簡單的模型,從已感染人數(shù)和有效接觸率出發(fā)構建模型,但未區(qū)分已感染者 ( 病人 ) 和未感染者 ( 健康人 ) ,結果發(fā)現(xiàn),隨著時間增加, 病人人數(shù)會無限增長,這顯然不符合實際; SI 模型是 I 模型的改進模型,它區(qū)分了已感染者和未感染者, 但是該模型沒有考慮到病人可以治愈, 導致人群中的健康者只能變成病人,病人不能變成健康者, 這也是不符合實際的; 在考慮病人治愈后有較強免疫力的情況下, SIR 模型對 SI 模型進行了改進,即增加了移除者(包括死亡者和治愈者),但在實際情況下,傳染病會出現(xiàn)疑似患者,故需要考慮隔離
9、的情況。SEIR 模型 3-4 對 SIR 模型進行了改進, 增加了疑似患者, 考慮到了隔離強度,故我們選擇 SEIR 模型進行此次建模。根據(jù)題目所給的條件,人群分為五類:確診患者、疑似患者、治愈者、死亡和正常人。根據(jù) SEIR 模型重新歸類,得到以下結果:(1)健康人群,即易感染( Susceptibles)人群。記其數(shù)量為 S(t),表示 t 時刻未感染病但有可能感染該疾病的人數(shù);(2)確診患者,即被感染( Infection)該疾病的人群,記其數(shù)量為 I(t) ,表示 t 時刻已經確診為患者入院的人數(shù);(3)疑似病患,即被入院隔離的人群,包括一部分正常人一部分處于潛伏期的感染者,記其數(shù)量
10、為 E(t),表示 t 時刻可能感染該疾病的入院被隔離的人數(shù);(4)潛伏期感染者,即已感染病毒但處于潛伏期的人群,記起數(shù)量為 Q(t) 表示 t 時刻已經感染病毒但沒有表現(xiàn)癥狀即處在潛伏期的人數(shù)。(5)恢復人群( Recovered),記其數(shù)量為 R(t),表示 t 時刻已從感染病者中移出的人數(shù), 包括死亡者和治愈者, 這部分人數(shù)既不是已感染者, 也不是非感染者,不具有傳染性,也不會再次被感染,他們已經推出了傳染系統(tǒng)。該傳染病的傳播流程圖如下:圖 1傳染病傳播流程圖5.2 傳染病模型的建立 5傳播過程中每一個群體都處于動態(tài)的變化中。對 S來說,一部分未被隔離的潛伏期感染者能感染正常人,使其成為
11、潛伏期感染者流出 S;對于 E 來說,流入者包括一部分潛伏期的感染者和一部分正常人, 流出者包括一部分沒有被感染的正常人和隔離后被確診患者;對于 I 來說,它既有從包括隔離和未被隔離的 H 中確診的流入者, 也有已經治愈的流出者; 對于 R 來說,它只有從 I 中治愈轉化而來的流入者。 以上過程在傳染的每一時刻都是相同的。 為此我們可將時間假定的非常小,在某一時刻對 S、E、I 、R 取其對時間的微分,這樣既可建立傳染病控制模型的微分方程組如下:3a3 ,則有退出人數(shù)1 、控制前階段:前兩天,患者沒有住院, 疑似患者沒有被隔離, 患者可以隨意接觸和感染正常人。分析控制前 Vt 階段時間內,疫情
12、的發(fā)展與變化。( 1)正常人 -疑似患者:控制前階段病人尚未被隔離, 所以疫情發(fā)展比較迅速, 此時病人人均每天接觸 r 個正常人,假設t 時刻病人人數(shù)為I t,則新增疑似患者人數(shù)為E ,EI trtr I tt 。( 2)疑似患者 -潛伏期:疑似患者中包括病毒攜帶者和非病毒攜帶者, 病毒攜帶者會進入潛伏期, 而非病毒攜帶者最終還是正常人。設疑似患者中病毒攜帶者占疑似患者的比例為,假設 t 時刻疑似患者人數(shù)為 E t,潛伏期患者人數(shù)為Q t,則 Q tE t,故新增潛伏期人數(shù)為QE。( 3)潛伏期 - 確診患者:因為每日潛伏期病人變?yōu)榇_診患者的數(shù)量呈指數(shù)增長,用1 表示這一特性。那么新增確診患者
13、人數(shù)為 I 1 Q t t ,現(xiàn)在要確定 1 ,如果潛伏期天數(shù)為 a1 到 a2 ,假設其變化到了一個穩(wěn)定階段, 那么隨著天數(shù)的增加潛伏期的病人越來越多,其概率分布呈指數(shù)穩(wěn)步增長, 則每天有 11 1/ a2 a1 e t 概率的人變?yōu)樨i流感患者,即11 1 1/ a2 a1 e t。所以新增患者人數(shù):I 1 1 1/ a2a1e tQ t 。( 4)確診患者 - 治愈、死亡:設 T 為退出系統(tǒng)人數(shù)(治愈者和死亡者) ,如果治愈天數(shù)設為 a3 ,那么 a3 天后病人要么死亡要么被治愈, 而被治愈的人產生抗體, 不再會被傳染, 所以被治愈的人和死亡的人都算作退出系統(tǒng)的人。設系統(tǒng)退出率為TIt2t
14、 。 2 的求解方法與1相同,即隨著天數(shù)的增加退出傳染系統(tǒng)的人數(shù)也越來越多,則21 1 1/ a3e t 。 故 新 退 出 傳 染 系 統(tǒng) 的 人 數(shù)T1 1/ ae tI tt 。3根據(jù)上述( 1):( 4)的式子可進一步得出:QEQ(tt)Q(t)rItt(1(11/ (a2a1 )e(t ) ) Q(t ) tIttI t111/a2a1etQ t(1(1(1/ a3) e t ) I t tTttTt(1(1(1/ a3)et )Itt所以得出以下:dQ / dtrI t(1(11/ (a2a1)e t )Q(t)tdI / dt(1 (11/ (a2a1) e( t ) Qt(1
15、(1 (1/ a3) eI tdT / dt1 1 1/ a3e tI t2、控制后階段:4兩天之后,患者全部住院, 疑似患者全部被隔離, 剩下一部分未被隔離的感染者變成患者后可以接觸和感染正常人。分析控制后階段 t 時間內,疫情的發(fā)展與變化。( 1)正常人 -疑似患者:控制后階段, 病人開始被隔離, 所以疫情發(fā)展開始變慢, 并受隔離強度p 影響,此時病人每天接觸的E r ' I t正常人數(shù)目 r '也在變小,假設病人的數(shù)目為 It ,則疑似患者數(shù)目。 又因為接觸率 r ' 與隔離強度 p 有關,也呈指數(shù)分布,所以 r 'r e pt ,故新增疑似患者的數(shù)目E
16、r e ptI tt 。( 2)疑似患者 -潛伏期:不會改變。假設 t 時控制后階段,疑似患者中病毒攜帶者占疑似患者的比例刻疑似患者人數(shù)為 E t,潛伏期患者人數(shù)為 Q tE tu ,故新增潛伏期人數(shù)為 QE u 。( 3)潛伏期 - 確診患者:潛伏期患者變?yōu)榇_診患者的過程與控制前時刻相同,所以新增患者人數(shù)I111/a2a1e tQt 。( 4)確診患者 - 治愈者、死亡者:同樣退出傳染系統(tǒng)的人數(shù)不變,則新增退出傳染系統(tǒng)的人數(shù)T 1 1/ a3e t I tt 。(1):( 4)根據(jù)上述可進一步求得出:QEQ ttQ tr e ptI tt1 1 1/ a2a1e tQ ttI ttIt1 1
17、1/a2a1etQ tt(1(1(1/ a3) et I tt整理后得:dQ / dtr e ptI t1 1 1/ a2ae tQ tt1tdI / dt111/a2a1Qt(1(1(1/ a3)ette) IdT / dt(1(1(1/ a3)e) It5.3傳染病模型的求解:1 、控制前:通過對模型的推導,我們發(fā)現(xiàn)不能給出每個函數(shù)的解析解,因此考慮利用 Matlab 中的 ode 系列函數(shù)進行求解。首先,對傳染病模型進行標準化, 再帶入參數(shù), 并由此建立微分方程組函數(shù)文件,隨后用 ode 函數(shù)對該文件進行調用, 即可得到微分方程組的解向量, 然后利用 plot 函數(shù)畫出此解向量即可得到各
18、類人群歲時間變化的曲線圖??刂魄盎颊呷藬?shù)隨時間變化的關系如下圖所示:5患者隨時間的變化8000700060005000人/者 4000患300020001000000.20.40.60.811.21.41.61.82時間/天圖 2 控制前患者的人數(shù)隨時間的變化由上圖可以看出控制前還未采取任何措施時,患者的人數(shù)迅速增加,類似于指數(shù)型增長曲線。 這是由于在開始的兩天, 患者兩天后才入院, 疑似患者兩天后才被隔離缺乏。一方面,他們將病原體迅速地傳染給了健康人;另一方面,他們由于缺乏治療, 無法被治愈。當時,患者的數(shù)量越來越多, 增長速度越來越快?;痉蠈嶋H情況,可見模型的合理性。2、控制后:(1)
19、當 p0.4 隔離強度時,患者人數(shù)隨時間變化的關系如下圖所示:x 104患者隨時間的變化10max p=0.49t=6.5994ymax=93701.2174876人/者5患4321051015202530350時間/天圖 3 控制后p0.4 時患者人數(shù)隨時間的變化6由上圖分析可知,兩天后,對患者進行入院隔離, 對疑似患者進行部分隔離,使得新進入潛伏期的人數(shù)在減少。 因此,由于時間的延遲,患者人數(shù)的迅速增長,并在接下來的幾天內達到峰值, 隨后逐漸下降最后平緩的趨于零。 患者人數(shù)在增長趨于緩慢的幾天后到達一個峰值。我們求得當隔離率為 p=0.4 時,患者人數(shù)大致在 7天時到達最大值 93701,
20、在 25天時基本沒有患者。( 2)改變隔離強度p=0.3 為時,患者人數(shù)隨時間變化的關系如下圖所示:x 105患者隨時間的變化2max p=0.31.8t=7.8604ymax=186383.57531.61.41.2人/者1患0.80.60.40.2051015202530350時間/天圖 4 控制后 p=0.3 時患者人數(shù)隨時間的變化由上圖分析可知,當 p=0.3 時,即隔離強度有所下降時,患者人數(shù)在前 8天屬于迅速增長趨勢,但增長趨勢慢慢減緩。大概在第 8天,患者人數(shù)到達最大值186383,其后由于大量的患者被治愈且受感染的人數(shù)越來越少, 導致患者人數(shù)顯著下降,大概在 28天之后基本沒有
21、患者。(3)改變隔離強度 p=0.6 為時,患者人數(shù)隨時間變化的關系如下圖所示:7x 104患者隨時間的變化max p=0.65t=5.41414.5ymax=47391.656143.53人/2.5者患21.510.5051015202530350時間/天圖 5 控制后 p=0.6 時患者人數(shù)隨時間的變化由上圖分析可知,當 p=0.6 時,患者人數(shù)在前四天增長迅速,但由于隔離率很高,病情很快得到有效的控制, 使增長人數(shù)越來越少, 在第 5 天患者人數(shù)到達峰值為 47391,其后患者由于治愈人數(shù)越來越多,人數(shù)逐漸減少,在21 天時基本沒有患者。3、控制前后模型總體:上圖皆為總體模型的分圖,在進
22、行總體分析時,可以進行進一步的表示。為更直觀的比較不同隔離強度引起的患者人數(shù)變化情況, 我們作圖 6 將不同強度的隔離強度情況相結合。 同時,為了貼合題意, 我們在圖像上將控制前的兩天和控制后的情況結合起來,得到總圖如下所示:8x 105患者隨時間的變化2max p=0.31.8t=7.8604ymax=186383.57531.61.41.2人max p=0.4/1者t=6.5994患0.8ymax=93701.21740.6max p=0.60.4t=5.4141ymax=47391.65610.2051015202530350時間/天圖 6患者人數(shù)隨時間的變化由上圖分析可知,控制前,患者
23、人數(shù)的增長速度遠高于控制后患者人數(shù)的增長速度,說明實行疑似患者隔離政策對控制傳染病傳播的效果是很明顯的; 三條曲線比較可知, 當隔離強度不同時, 對患者人數(shù)最高峰出現(xiàn)的天數(shù)和傳染病傳播的持續(xù)時間 (即患者全部痊愈沒有再出現(xiàn)患者) 有極大的影響。 在隔離強度較小時,患者人數(shù)的最高峰出現(xiàn)時間靠后, 傳染病持續(xù)的傳播時間較長; 在隔離強度較大時,患者人數(shù)能較快的出現(xiàn)最高峰再較迅速的下降, 因此傳染病持續(xù)的時間比較短,更有利于傳染病的控制。所以,在實際的傳染病控制過程中,對傳染病進行有效的控制,加大疑似患者隔離的強度是很有必要的。六、模型評價:優(yōu)點:本模型中采用微分方程中的SEIR 模型,對傳染病傳播
24、做出合理假設,對人群進行了合理的分類, 并對其進行數(shù)據(jù)擬合, 得出傳染病傳播過程中, 各類人群的人數(shù)發(fā)展趨勢, 采用數(shù)值計算 , 圖形觀察與理論分析相結合的方法, 先有感性認識,再用特殊點進行理論分析, 最后進行數(shù)值驗證和估算, 可以看作計算機技術與建模方法的巧妙配合。比較全面地達到了建模的目的, 即描述傳播過程、分析感染人數(shù)的變化規(guī)律 , 可以有效預報傳染病高潮到來的時刻和傳染病將持續(xù)的時期,對群眾接受傳染病的預防知識起到很好的警示作用。通過這些數(shù)據(jù), 政府可以更好的探索制止蔓延的手段和措施。缺點:所建立的模型中, 沒有考慮不同年齡段病毒的抵抗力不同, 且將治愈者和死亡者當作一類人進行了處理
25、, 題目只給出了患者治愈所需的天數(shù), 沒有給出患者死亡的概率,于是我們暫且認為其患者住院達到治愈天數(shù)時即被移出系統(tǒng),可能是治愈也可能是死亡。 其所得的結果存在一定的誤差,只能粗略的反應9此傳染病的傳播情況。要準確反映,需對模型進行進一步的改進。七、模型應用:根據(jù)建立的 SEIR 模型和計算所得的數(shù)據(jù),我們發(fā)現(xiàn),人群接觸的人數(shù)r 值越大,正常人被感染的幾率越大,疫情擴散得越快,因此在疫情期間,應減少公共活動,降低病毒的傳播率;通過改變隔離強大的大小后比較可知,p 值越小病情越難控制,所以要保證患者能及時住院治療, 從而遏制病毒的擴散; 綜上所述,結合實際情況我們可以對控制 H7N9傳播提供一些建
26、議:醫(yī)院方面:醫(yī)院應提高醫(yī)院的醫(yī)療水平和衛(wèi)生水平, 提高醫(yī)療工作人員的工作效率,加強醫(yī)院的合理化管理, 加大對感染者的隔離力度, 這樣有助于傳染病的治療和控制工作有序的展開:(1)根據(jù)人感染 H7N9 禽流感的流行病學特點,針對傳染源、傳播途徑和易感人群,結合實際情況,建立預警機制,制定應急預案和工作流程。(2)醫(yī)院應當規(guī)范消毒、隔離和防護工作,為醫(yī)務人員提供充足、必要、符合要求的消毒和防護用品, 確保消毒、 隔離和個人防護等措施落實到位, 并加大隔離疑似病患的力度,這有利于傳染病的快速控制。政府方面:應具有敏銳的警覺性, 在傳染病開始廣泛傳播之前, 應迅速采取一定的方法進行控制:(1)根據(jù)
27、H7N9 病毒的特點,加強醫(yī)院、學校、家禽養(yǎng)殖廠、活禽市場等這些重點區(qū)域的疫情防控,確保一旦發(fā)生疫情能及時應對和有效控制。(2)應對地方醫(yī)療保障措施進行完善, 防止患者不能及時就醫(yī)的情況出現(xiàn),增加傳染病蔓延的趨勢。(3)一方面應加大傳染病的宣傳力度,使公眾對傳染病有一定的警覺和預防意識;另一方面應進行科學的引導, 不造成公眾的恐慌心理, 日常生活不受影響。個人方面:應加強對傳染病的認識, 提高自身的科學知識, 不盲從,不恐慌,以正確的態(tài)度進行預防:(1)保持良好的個人衛(wèi)生習慣,減少與家禽類的直接接觸,減少去禽流感疫區(qū)。(2)加強體育鍛煉,注意補充營養(yǎng),保證充足的睡眠和休息,增強抵抗力。(3)不
28、要輕視重感冒, 禽流感的病癥與其他流行性感冒病癥相似, 如發(fā)燒、頭痛、咳嗽及喉嚨痛等,在某些情況下,會引起并發(fā)癥,導致患者死亡。因此,若出現(xiàn)發(fā)熱、頭痛、鼻塞、咳嗽、全身不適等呼吸道癥狀時,應戴上口罩,盡快到醫(yī)院就診,并務必告訴醫(yī)生自己發(fā)病前是否與病禽類接觸等情況, 并在醫(yī)生指導下治療和用藥。10八、參考文獻:1 張彤 . 一類具潛伏期和非線性飽和接觸率的流行病模型 J, 浙江工程學院學報 ,2004,21(2):136-140.2 姜啟源,謝金星,葉俊 . 數(shù)學模型 . 高等教育出版社, 2003.135-1443 Anderson RM,May RM.Infection diseases of humans:dynamics and control.Oxford Univ press,Oxford,1991.4 張娟 . 馬知恩 各倉室均有常數(shù)輸入的 SEIR 流行病模型的全局分析2003(06).5 Pagilla PR.Robust decentralized control of large-scale inter
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