微生物的代謝調(diào)節(jié)和代謝工程_第1頁
微生物的代謝調(diào)節(jié)和代謝工程_第2頁
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微生物的代謝調(diào)節(jié)和代謝工程_第4頁
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1、第五章 微生物的代謝調(diào)節(jié)和代謝工程 在生物進(jìn)化過程中,微生物細(xì)胞形成了愈來愈完善的代謝調(diào)節(jié)機(jī)制,細(xì)胞經(jīng)常處于平衡生長狀態(tài),不會有代謝產(chǎn)物的積累。從進(jìn)化角度看,代謝產(chǎn)物的過量產(chǎn)生對細(xì)胞能量的利用和細(xì)胞組成、物質(zhì)的合成都是一種浪費。 想獲得代謝產(chǎn)物的積累就必須打破正常的代謝系統(tǒng)。可采取兩種方式: 1.通過各種育種方法,選育基因突變株,從根本上改變微生物的代謝; 2.控制微生物的各種培養(yǎng)條件,改變控制代謝速率,影響其代謝過程。即影響基因型的表達(dá)。 代謝類型:分解代謝和合成代謝代謝調(diào)節(jié)(regulation of metablism)是指微生物的代謝速度和方向按照微生物的需要而改變的一種作用,即自我調(diào)

2、節(jié)。微生物代謝的控制是指運用人為的方法對微生物的代謝調(diào)節(jié)進(jìn)行遺傳改造和條件的控制,以期按照人們的愿望,生產(chǎn)有用的微生物制品。代謝調(diào)節(jié)的方式酶合成的調(diào)節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)方式初級代謝的調(diào)節(jié)次級代謝的調(diào)節(jié)5.1 代謝調(diào)節(jié)方式細(xì)胞透性的調(diào)節(jié)代謝途徑區(qū)域化代謝流向的調(diào)控代謝速度的調(diào)控1,細(xì)胞透性的調(diào)節(jié)細(xì)胞質(zhì)膜的透性直接影響物質(zhì)的吸收和代謝產(chǎn)物的分泌,從而影響到細(xì)胞內(nèi)代謝的變化。細(xì)胞質(zhì)膜的透性的調(diào)節(jié)是微生物代謝調(diào)節(jié)的重要方式,由它控制著營養(yǎng)物質(zhì)的吸收和產(chǎn)物分泌。代謝調(diào)節(jié)方式例如,大腸桿菌和鼠傷寒沙門氏菌吸收乳糖是由滲透酶和環(huán)狀A(yù)MP(cAMP)協(xié)同控制來完成的。cAMP的濃度是由腺苷酸環(huán)化酶(AC)的活性控制

3、的,也就是說,乳糖的吸收受滲透酶和AMP環(huán)化酶的控制,調(diào)節(jié)蛋白通過磷酸化的形式和腺苷酸環(huán)化酶(AC)或滲透酶結(jié)合,分別使腺苷酸環(huán)化酶活化或使?jié)B透酶失活。當(dāng)有葡萄糖時,乳糖的滲透酶以無活性狀態(tài)存在,而腺苷酸環(huán)化酶也以非活性狀態(tài)存在。代謝調(diào)節(jié)方式L-異亮氨酸的膜滲透情況BrnEBrnFBrnQ代謝調(diào)節(jié)方式2,代謝途徑區(qū)域化原核微生物細(xì)胞結(jié)構(gòu)雖然簡單,但也劃分出不同的區(qū)域,對于某一代謝途徑有關(guān)的酶系則集中某一區(qū)域,以保證這一代謝途徑的酶促反應(yīng)順利進(jìn)行,避免了其他途徑的干擾。例如呼吸的酶系集中在細(xì)胞質(zhì)膜上;而與蛋白質(zhì)合成有關(guān)的酶系則位于核蛋白體上;分解大分子的水解酶,在革蘭氏陰性菌里是位于壁膜間隙中,

4、而革蘭氏陽性菌則將這些水解酶類,分泌于胞外。代謝調(diào)節(jié)方式 在真核微生物細(xì)胞里,各種酶系被細(xì)胞器隔離分布。如與呼吸產(chǎn)能有關(guān)的酶系集中于線粒體內(nèi)膜上;蛋白質(zhì)的合成酶系位于核蛋白體上;DNA合成的某些酶位于細(xì)胞核里。代謝調(diào)節(jié)方式細(xì)胞具有復(fù)雜的膜結(jié)構(gòu)使其代謝活動只能在特定的部位上進(jìn)行,即代謝活動是區(qū)域化的,其實質(zhì)是控制酶與底物接觸,使各個反應(yīng)有序地進(jìn)行。代謝調(diào)節(jié)方式線粒體:丙酮酸氧化;三羧酸循環(huán);b-氧化;呼吸鏈電子傳遞;氧化磷酸化細(xì)胞質(zhì):酵解;磷戊糖途徑;糖原合成;脂肪酸合成;細(xì)胞核:核酸合成內(nèi)質(zhì)網(wǎng):蛋白質(zhì)合成;磷脂合成酶定位的區(qū)域化代謝調(diào)節(jié)方式3,代謝流向的調(diào)控微生物在不同條件下可以通過控制各代謝

5、途徑中某個酶促反應(yīng)的速率來控制代謝物的流向,從而保持機(jī)體代謝的平衡。它包括兩種形式由一個關(guān)鍵酶控制的可逆反應(yīng)由兩種酶控制的逆單向反應(yīng)代謝調(diào)節(jié)方式由一個關(guān)鍵酶控制的可逆反應(yīng) 同一個酶可以通過不同輔基(或輔酶)控制代謝物的流向。例如,谷氨酸脫氫酶以NADP+為輔酶時,主要是催化谷氨酸的合成,當(dāng)以NAD+為輔酶時,則催化谷氨酸的分解。因此微生物可以通過不同的輔基來控制代謝物的流向。由一個關(guān)鍵酶控制的可逆反應(yīng) :同一個酶可以通過不同輔基(或輔酶)控制代謝物的流向。例如,谷氨酸脫氫酶以NADP+為輔酶時,主要是催化谷氨酸的合成,當(dāng)以NAD+為輔酶時,則催化谷氨酸的分解。因此微生物可以通過不同的輔基來控制

6、代謝物的流向。代謝調(diào)節(jié)方式由兩種酶控制的逆單向反應(yīng) 逆單向反應(yīng)是在生物體代謝的關(guān)鍵部位的某些反應(yīng),它是由兩種各自不同的酶來催化的。即在一個“可逆”反應(yīng)中,其中一種酶催化正反應(yīng),而另一種酶則催化逆反應(yīng)。例如,葡萄糖轉(zhuǎn)化為6-磷酸葡萄糖是由己糖激酶催化的,而其逆反應(yīng)則是由6-磷酸葡萄糖酯酶催化的。6-磷酸果糖轉(zhuǎn)化為1,6-二磷酸果糖是由磷酸果糖激酶催化的,逆反應(yīng)則由1,6-二磷酸果糖酯酶催化。代謝調(diào)節(jié)方式4,代謝速度的調(diào)控在不可逆反應(yīng)中,微生物通過調(diào)節(jié)酶的活性和酶量來控制代謝物的流量。微生物在不同條件下能按照需要,通過激活或抑制原有酶的活性或通過誘導(dǎo)或阻遏酶的合成來自我調(diào)節(jié)其代謝速度,使之高度經(jīng)濟(jì)

7、有效地利用能量和原料進(jìn)行生長繁殖。代謝調(diào)節(jié)方式5.2 酶活性的調(diào)節(jié)概 念酶活性調(diào)節(jié)是指一定數(shù)量的酶,通過其分子構(gòu)象或分子結(jié)構(gòu)的改變來調(diào)節(jié)其催化反應(yīng)的速率。影響因素底物和產(chǎn)物的性質(zhì)和濃度環(huán)境因子(如壓力、pH、離子強(qiáng)度和輔助因子等)其他的酶的存在調(diào)節(jié)方式激活已有酶的活性抑制已有酶的活性(一)激活激活:在激活劑的作用下,使原來無活性的酶變成有活性,或使原來活性低的酶提高了活性的現(xiàn)象。代謝調(diào)節(jié)的激活作用:主要是指代謝物對酶的激活。前(體)饋激活,指代謝途徑中后面的酶促反應(yīng),可被該途徑中較前面的一個中間產(chǎn)物所促進(jìn)。代謝中間產(chǎn)物的反饋激活,指代謝中間產(chǎn)物對該代謝途徑的前面的酶起激活作用酶活性的調(diào)節(jié)前(體

8、)饋激活和反饋激活示意圖A®B ® C ® D ® FA®B ® ® GCDEE例1:糖代謝途徑中丙酮酸積累激活丙酮酸羧化酶例2:乙酰CoA的積累激活PEP羧化酶酶的反饋激活葡萄糖草酰乙酸丙酮酸羧化酶乙酰CoA活化磷酸烯醇式丙酮酸擰檬酸a-酮戊二酸1,6-二磷酸果糖(二)抑制抑制:由于某些物質(zhì)的存在, 降低酶活性的現(xiàn)象。反饋抑制(feedback inhibition) :反饋抑制是指代謝的末端產(chǎn)物對酶(往往是代謝途徑中的第一個酶)活性的抑 制。無分支代謝途徑的調(diào)節(jié)有分支代謝途徑的調(diào)節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)抑制和激活相反。由于某些物質(zhì)

9、的存在, 降低酶活性,稱為抑制。抑制可以是不可逆 的,這將造成代謝作用的停止;抑制也有可逆的,當(dāng)抑制劑除去后, 酶活性又恢復(fù)。在代謝 調(diào)節(jié)過程中所發(fā)生的抑制現(xiàn)象主要是可逆的,而且大多屬于反饋抑制。 反遺抑制 反饋抑制是指代謝的末端產(chǎn)物對酶(往往是代謝途徑中的第一個酶)活性的抑 制。反饋抑制作用在生物體內(nèi)普通存在,它在維持細(xì)胞正常代謝、經(jīng)濟(jì)有效地利用代謝原 料、以及適應(yīng)環(huán)境的變化,都具有重要作用。(二)抑制抑制:由于某些物質(zhì)的存在, 降低酶活性的現(xiàn)象。反饋抑制(feedback inhibition) :反饋抑制是指代謝的末端產(chǎn)物對酶(往往是代謝途徑中的第一個酶)活性的抑 制。無分支代謝途徑的調(diào)

10、節(jié)有分支代謝途徑的調(diào)節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)抑制和激活相反。由于某些物質(zhì)的存在, 降低酶活性,稱為抑制。抑制可以是不可逆 的,這將造成代謝作用的停止;抑制也有可逆的,當(dāng)抑制劑除去后, 酶活性又恢復(fù)。在代謝 調(diào)節(jié)過程中所發(fā)生的抑制現(xiàn)象主要是可逆的,而且大多屬于反饋抑制。 反遺抑制 反饋抑制是指代謝的末端產(chǎn)物對酶(往往是代謝途徑中的第一個酶)活性的抑 制。反饋抑制作用在生物體內(nèi)普通存在,它在維持細(xì)胞正常代謝、經(jīng)濟(jì)有效地利用代謝原 料、以及適應(yīng)環(huán)境的變化,都具有重要作用。1,無分支代謝途徑的調(diào)節(jié)通常是在線形的代謝途徑中末端產(chǎn)物對催化第一步反應(yīng)的酶活性有抑制作用。酶活性的調(diào)節(jié)如圖827所示。例如,在大腸桿菌中,

11、由蘇氨酸(Thr)合成異亮氨酸(IIeu)時,異亮氨酸對催化反應(yīng)途徑中的第一步反應(yīng)的蘇氨酸脫氨酶(TD)有抑制作用。蘇氨酸 -酮丁酸 異亮氨酸TD酶活性的調(diào)節(jié)2,有分支代謝途徑的調(diào)節(jié)在有兩種或兩種以上的末端產(chǎn)物的分支合成代謝途徑中,調(diào)節(jié)方式較復(fù)雜,其共同特點是每個分支途徑的末端產(chǎn)物控制分支點后的第一個酶,同時每個末端產(chǎn)物又對整個途徑的第一個酶有部分的抑制作用,分支代謝的反饋調(diào)節(jié)方式有多種:順序反饋抑制(sequential feedback inhibition) 同工酶的反饋抑制(isoenzyme feedback inhibition) 協(xié)同反饋抑制(concerted feedback

12、 inhibition) 累積反饋抑制(cumulative feedback inhibition) 超相加反饋抑制(cooperative feedback inhibition) 酶活性的調(diào)節(jié)(1)順序反饋抑制sequential feedback inhibition 分支代謝途徑中的兩個末端產(chǎn)物,不能直接抑制途徑中的第一個酶,只有當(dāng)兩個末端產(chǎn)物都過量時,才能對途徑中的第一個酶有抑制作用。酶活性的調(diào)節(jié)例如,枯草桿菌在芳香族氨基酸合成中,色氨酸(Try)抑制鄰氨基苯甲酸合成酶(AS),苯丙氨酸(Phe)抑制預(yù)苯酸脫水酶(PT),酪氨酸(Tyr)抑制預(yù)苯酸脫氫酶(PD),預(yù)苯酸和分支酸又部

13、分地抑制7-磷酸-2-酮-3-脫氧庚糖酸合成酶(DS)。PEP:磷酸烯醇丙酮酸;E4P:4-磷酸赤蘚糖;DAHP:7-磷酸-2-酮-3-脫氧庚糖酸;CA:分支酸;Per:預(yù)苯酸;AA:鄰氨基苯甲酸;HPPA:對羥基苯丙酮酸;PPA:苯丙酮酸;Tyr:酪氨酸;Try:色氨酸;Phe:苯丙氨酸;I:7-磷酸-2-酮-3-脫氧庚糖酸合成酶;II:鄰氨基苯甲酸合成酶ASPTPDPEP:磷酸烯醇丙酮酸;E4P:4-磷酸赤蘚糖;DAHP:7-磷酸-2-酮-3-脫氧庚糖酸;CA:分支酸;Per:預(yù)苯酸;AA:鄰氨基苯甲酸;HPPA:對羥基苯丙酮酸;PPA:苯丙酮酸;Tyr:酪氨酸;Try:色氨酸;Phe:苯

14、丙氨酸;I:7-磷酸-2-酮-3-脫氧庚糖酸合成酶;II:鄰氨基苯甲酸合成酶;III:分支酸變位酶;IV:預(yù)苯酸脫氫酶;V:預(yù)苯酸脫水酶(2)同工酶的反饋抑制isoenzyme feedback inhibition 同功酶是指能催化同一生化反應(yīng),但它們的結(jié)構(gòu)稍有不同,可分別被相應(yīng)的末端產(chǎn)物抑制的一類酶。其特點是:途徑中第一個反應(yīng)被兩個不同的酶所催化,一個酶被H抑制,另一個酶被G抑制。只有當(dāng)H和G同時過量才能完全阻止A轉(zhuǎn)變?yōu)锽。例如,大腸桿菌以天門冬氨酸為前體合成蘇氨酸(Thr)、異亮氨酸(Ileu)、甲硫氨酸(Met)和賴氨酸(Lys)的代謝途徑中有三種天門冬氨酸激酶的同功酶(AKI、AKI

15、I和AKIII)和兩種高絲氨酸脫氫酶的同功酶(HSDHI和HSDHII)。其中AKI和HSDHI受到蘇氨酸、異亮氨酸的反饋抑制和阻遏,AKII和HSDHII受甲硫氨酸的反饋抑制和阻遏;AKIII受賴氨酸的反饋抑制和阻遏。 Asp:天門冬氨酸;Asp-Pi:天門冬酰磷酸;Asa:天門冬氨酸半醛;Hse:高絲氨酸;Thr:蘇氨酸;Ileu:異亮氨酸;KB:-酮丁酸;Met:甲硫氨酸;Lys:賴氨酸;R:阻遏作用;I:反饋抑制;AK:天門冬氨酸激酶;HSDH:高絲氨酸脫氫酶(3)協(xié)同反饋抑制concerted feedback inhibition 在分支代謝系統(tǒng)中,幾種末端產(chǎn)物同時都過量,才對途徑

16、中的第一個酶具有抑制作用,如果末端產(chǎn)物單獨過量則對途徑中的第一個酶無抑制作用。例如,莢膜紅假單胞菌中天門冬氨酸族氨基酸生物合成途徑中,天門冬氨酸激酶(AK)是受末端產(chǎn)物賴氨酸和蘇氨酸的協(xié)同反饋抑制。(4)累積反饋抑制cumulative feedback inhibition在分支代謝途徑中各種末端產(chǎn)物單獨過量時,它們各自能對途徑中的第一個反應(yīng)的酶僅產(chǎn)生較小的抑制作用。一種末端產(chǎn)物單獨過量并不影響其它末端產(chǎn)物的形成,只有當(dāng)幾種末端產(chǎn)物同時過量時,才對途徑中的第一個酶產(chǎn)生較大的抑制。酶活性的調(diào)節(jié)例如,大腸桿菌谷氨酰胺合成酶(GS)活性的調(diào)節(jié)是一個典型的累積反饋調(diào)節(jié)的例子。谷氨酰胺由谷氨酸、銨和A

17、TP合成。谷氨酰胺中的酰胺基是色氨酸、組氨酸、氨基甲酰磷酸、6-磷酸葡萄糖胺、CTP、AMP、GMP等化合物生物合成過程中的氮源。谷氨酰胺合成酶被谷氨酰胺代謝的每種末端產(chǎn)物以及丙氨酸和甘氨酸所累積抑制。谷氨酰胺合成酶對這些抑制物中的每一種末端產(chǎn)物均有特異的結(jié)合部位。當(dāng)上述8種末端產(chǎn)物同時過量都與酶結(jié)合時,谷氨酰胺合成酶的活性將受到最大的抑制。(5)超相加反饋抑制cooperative feedback inhibition超相加反饋抑制是一種既不同于協(xié)同反饋抑制又不同于累積反饋抑制。對一個分支代謝途徑中,幾種末端產(chǎn)物單獨過量時,僅產(chǎn)生對共同途徑的第一個酶部分的抑制。如果每種末端產(chǎn)物都過量時,其

18、抑制作用則超過各種末端產(chǎn)物單獨過量時抑制的總和。酶活性的調(diào)節(jié)例如,在嘌呤核苷酸的生物合成途徑中,催化第一步反應(yīng)的酶,5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP)的酰胺基轉(zhuǎn)移酶,可被各種嘌呤核苷酸產(chǎn)物(如AMP、GMP)所抑制。例如,一定量的GMP或AMP僅能抑制5-磷酸核糖-1-焦磷酸酰胺基轉(zhuǎn)移酶活力的10,而當(dāng)二者混合時,則可抑制其酶活力的50。因為這些嘌呤核苷酸與5-磷酸核糖-1-焦磷酸并無結(jié)構(gòu)相似性,又因該酶是一種調(diào)節(jié)酶,GMP和AMP可能分別結(jié)合在該酶的不同部位上。酶活性調(diào)節(jié)包括:酶的激活作用 酶的抑制作用酶活性調(diào)節(jié)的機(jī)制:有變構(gòu)調(diào)節(jié)理論、化學(xué)修飾作用、締合與解離、競爭性抑制等。 1)

19、0; 變構(gòu)調(diào)節(jié)理論:變構(gòu)酶為一種變構(gòu)蛋白,酶分子空間構(gòu)象的變化 影響酶活。其上具有兩個以上立體專一性不同的接受部位,一個是活性中心,另一個是調(diào)節(jié)中心?;钚晕稽c:與底物結(jié)合變構(gòu)位點:與抑制劑結(jié)合,構(gòu)象變化,不能與底物結(jié)合 與激活劑結(jié)合, 構(gòu)象變化,促進(jìn)與底物結(jié)合 2)  化學(xué)修飾作用(共價修飾): 是指蛋白質(zhì)分子中的一個或多個氨基酸殘基與一化學(xué)基團(tuán)共價連接或解開,使其活性改變的作用。 用共價修飾方式可使酶鈍化或活化。從蛋白質(zhì)中除去或加入小的化學(xué)基團(tuán)可以是磷酸基,甲基,乙基,腺苷酰基,蛋白質(zhì)的共價結(jié)合部位一般為絲氨酸殘基的CH2OH。共價修飾分為可逆的和不可逆的兩種。 酶合成調(diào)節(jié)的類型:

20、包括誘導(dǎo)和阻遏兩種類型。 誘導(dǎo):是指在某種化合物作用下,導(dǎo)致某種酶合成或合成速率提高的現(xiàn)象。5.3 酶合成(酶量)的調(diào)節(jié)阻遏:是在某種物質(zhì)作用下導(dǎo)致某種酶合成停止或合成速率降低的現(xiàn)象。 酶合成的誘導(dǎo)與阻遏同時存在于微生物中,通過它們的協(xié)調(diào)作用能有效地控制胞內(nèi)酶量變化。 1. 酶合成的誘導(dǎo)作用 在微生物里,酶可以分成誘導(dǎo)酶與組成酶兩大類。組成酶:是機(jī)體內(nèi)一類不依賴于酶的底物或底物結(jié)構(gòu)類似物的存在而合成的酶,如EMP途徑的一些酶。誘導(dǎo)酶(又稱適應(yīng)酶):是一類依賴于底物或底物結(jié)構(gòu)類似物的存在而合成的酶。如:乳糖酶 決定誘導(dǎo)酶合成的基因以隱性狀態(tài)存在于染色體中。 5.3酶合成(酶量)的調(diào)節(jié)誘導(dǎo)劑:能夠

21、誘導(dǎo)某種酶合成的化合物稱為該酶的誘導(dǎo)劑。 誘導(dǎo)劑可以是被誘導(dǎo)的酶的底物或底物的結(jié)構(gòu)類似物,一種誘導(dǎo)酶的合成可以有一種以上的誘導(dǎo)劑,但是這些誘導(dǎo)劑的誘導(dǎo)能力不同,而且一種誘導(dǎo)劑的誘導(dǎo)能力還與誘導(dǎo)劑的濃度有關(guān)。 阻止酶合成的現(xiàn)象稱為酶合成的阻遏。阻遏酶合成的物質(zhì)稱為阻遏物。5.3酶合成(酶量)的調(diào)節(jié)2. 酶合成的阻遏終點產(chǎn)物(末端產(chǎn)物)反饋阻遏:如果阻遏物是被阻遏生成的酶(或酶系)所催化生成的終點產(chǎn)物,則這種阻遏現(xiàn)象稱為終點產(chǎn)物(末端產(chǎn)物)反饋阻遏。代謝產(chǎn)物反饋阻遏:如果阻遏物是其分解代謝的產(chǎn)物,則稱為分解代謝產(chǎn)物阻遏。 1). 末端產(chǎn)物反饋阻遏 這種阻遏現(xiàn)象主要發(fā)生在合成代謝途徑上。這種現(xiàn)象最初

22、是在大腸桿菌合成甲硫氨酸的途徑中被發(fā)現(xiàn)的。如果在培養(yǎng)基中加入過量的甲硫氨酸時, 則這些酶系的合成都同時被阻遏。 5.3酶合成(酶量)的調(diào)節(jié)2. 酶合成的阻遏由于利用葡萄糖的酶系是固有的,而利用乳糖(或阿拉伯糖、半乳糖等)的酶系是誘導(dǎo)生成的。在有葡萄糖的情況下,阻遏了利用乳糖的酶系的合成。因而只有當(dāng)葡萄糖被利用完之后,乳糖才能誘導(dǎo)能利用它的酶系合成,由于合成新酶系需要一定的時間,所以在二次生長之間出現(xiàn)了一段停滯期。2) 分解代謝產(chǎn)物阻遏枯草桿菌的二次生長曲線5.3酶合成(酶量)的調(diào)節(jié)2. 酶合成的阻遏3) 酶合成調(diào)節(jié)的機(jī)制 主要是操縱子學(xué)說。根據(jù)這個理論認(rèn)為在DNA分子的不同區(qū)段上分布著調(diào)節(jié)基因

23、和操縱子;操縱子由操縱基因(O) 、一群功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因(S)以及在操縱基因與調(diào)節(jié)基因之間的啟動基因(P)組成,調(diào)節(jié)基因編碼一種低分子量的變構(gòu)蛋白(或稱調(diào)節(jié)蛋白),這種蛋白可以結(jié)合到操縱基因上,以控制基因的轉(zhuǎn)錄;5.3 酶合成(酶量)的調(diào)節(jié)2. 酶合成的阻遏酶合成誘導(dǎo)的機(jī)制酶合成阻遏的機(jī)制根據(jù)操縱子的調(diào)節(jié)方式不同,可以將操縱子調(diào)節(jié)分成三種類型: 單一效應(yīng)物的調(diào)節(jié),二種效應(yīng)物的共同調(diào)節(jié)弱化調(diào)節(jié)區(qū)別:酶活性調(diào)節(jié):是對現(xiàn)有的酶在活性變化上進(jìn)行調(diào)節(jié),它不會涉及酶量的變化, 酶量的調(diào)節(jié):不涉及現(xiàn)有酶活性的變化,只是通過影響酶合成或酶合成速率以控制酶量變化,達(dá)到控制代謝過程的目的。 從調(diào)節(jié)作用的特點上看

24、:酶活性調(diào)節(jié)的效果既及時又迅速,但由于酶量調(diào)節(jié)涉及到酶蛋白合成,它調(diào)節(jié)的效果相應(yīng)地來得慢。酶量的調(diào)節(jié)與酶活調(diào)節(jié)的區(qū)別5.4 初級代謝的調(diào)節(jié)Regulation of Primary Metabolism初級代謝與次級代謝初級代謝:是為生物提供能量、合成中間體及其關(guān)鍵大分子的各種相互關(guān)聯(lián)的代謝網(wǎng)絡(luò)(包括分解與合成) ,對菌的生長是必需的。初級代謝產(chǎn)物有單糖、核苷酸、脂肪酸、蛋白質(zhì)、核酸、多糖、脂類等等。次級代謝:次級代謝主要涉及合成過程,其終產(chǎn)物、次級代謝物對菌的生長不是必需的,對其生命活動可能具有某種意義,通常是在生長后期開始形成的。次級代謝產(chǎn)物主要有抗生素、維生素、生物堿、色素、毒素等等。

25、初級代謝調(diào)節(jié)產(chǎn)能代謝的調(diào)節(jié):能荷調(diào)節(jié)(Energy Charge Regulation)核蛋白體合成的調(diào)節(jié)(Regulation of Ribosome Synthesis)氨基酸、核苷酸合成代謝的調(diào)節(jié)(Regulation of amino acids and nucleotide metabolism)能荷調(diào)節(jié)能荷:即指細(xì)胞中ATP、ADP、AMP系統(tǒng)中可為代謝反應(yīng)供能的高能磷酸鍵的量度能荷的大小與細(xì)胞中ATP、ADP和AMP的相對含量有關(guān)。當(dāng)細(xì)胞中全部腺苷酸均以ATP形式存在時,則能荷最大,為100%,即能荷為滿載。當(dāng)全部以AMP形式存在時,則能荷最小,為零。當(dāng)全部以ADP形式存在時,能

26、荷居中,為50%。若三者并存時,能荷則隨三者含量的比例不同而表現(xiàn)不同的百分值。能荷調(diào)節(jié)(Energy Charge Regulation)研究證明,細(xì)胞中能荷高時,抑制了ATP的生成,但促進(jìn)了ATP的利用,也就是說,高能荷可促進(jìn)分解代謝,并抑制合成代謝。相反,低能荷則促進(jìn)合成代謝,抑制分解代謝。能荷調(diào)節(jié)是通過ATP、ADP和AMP分子對某些酶分子進(jìn)行變構(gòu)調(diào)節(jié)進(jìn)行的。例如糖酵解中,磷酸果糖激酶是一個關(guān)鍵酶,它受ATP的強(qiáng)烈抑制,但受ADP和AMP促進(jìn)。丙酮酸激酶也是如此。在三羧酸循環(huán)中,丙酮酸脫氫酶、檸檬酸合成酶、異檸檬酸脫氫酶和-酮戊二酸脫氫酶等,都受ATP的抑制和ADP的促進(jìn)。呼吸鏈的氧化磷

27、酸化速度同樣受ATP抑制和ADP促進(jìn)。 5.5 次級代謝的調(diào)節(jié)Regulation of Secondary Metabolism初級代謝對次級代謝的調(diào)節(jié)碳代謝物的調(diào)節(jié)作用氮代謝物的調(diào)節(jié)作用磷酸鹽的調(diào)節(jié)作用次級代謝中的誘導(dǎo)作用及產(chǎn)物的反饋作用次級代謝中細(xì)胞膜透性調(diào)節(jié)初級代謝對次級代謝的調(diào)節(jié)許多次級代謝產(chǎn)物的基本結(jié)構(gòu)是由少數(shù)幾種初級代謝產(chǎn)物構(gòu)成的,所以次級代謝產(chǎn)物是以初級代謝產(chǎn)物為母體衍生出來的,次級代謝途徑并不是獨立的,而是與初級代謝途徑有密切關(guān)系的。因此次級代謝必然會受到初級代謝的調(diào)節(jié)。例如青霉素的合成會受到賴氨酸的強(qiáng)烈抑制,而賴氨酸合成的前體 - 氨基己二酸可以緩解賴氨酸的抑制作用,并能刺

28、激青霉素的合成。這是因為 - 氨基己二酸是合成青霉素和賴氨酸的共同前體。如果賴氨酸過量,它就會抑制這個反應(yīng)途徑中的第一個酶,減少 - 氨基己二酸的產(chǎn)量,從而進(jìn)一步影響青霉素的合成。碳源代謝產(chǎn)物的調(diào)節(jié)碳分解代謝產(chǎn)物調(diào)節(jié)指能迅速被利用的碳源(葡萄糖)或其分解代謝產(chǎn)物,對其他代謝中的酶(包括分解酶和合成酶)的調(diào)節(jié)。分為分解產(chǎn)物阻遏和抑制兩種。葡萄糖是菌體生長良好的碳源和能源,但對青霉素、頭孢菌素、卡那霉素、新霉素、絲裂霉素等都有明顯降低產(chǎn)量的作用。氮代謝物的調(diào)節(jié)作用在次級代謝中,氮分解代謝產(chǎn)物調(diào)節(jié),即被迅速利用的氮源(氨)抑制作用于含底物的酶(蛋白酶、硝酸鹽還原酶、酰胺酶、脲酶、組氨酸酶)的合成。在

29、次級代謝中,其阻遏作用也確實存在。在抗生素生產(chǎn)中使用黃豆餅粉就是由于它緩慢分解成有阻遏作用的氨基酸和氨,防止或減弱氮分解代謝產(chǎn)物阻遏作用的結(jié)果。磷酸鹽的調(diào)節(jié)磷酸鹽不僅是菌體生長的主要限制性營養(yǎng)成分,還是調(diào)節(jié)抗生素生物合成的重要參數(shù)。其機(jī)制按效應(yīng)劑說有直接作用,即磷酸鹽自身影響抗生素合成,和間接作用,即磷酸鹽調(diào)節(jié)胞內(nèi)其他效應(yīng)劑(如ATP、腺苷酸能量負(fù)荷和cAMP),進(jìn)而影響抗生素合成。已發(fā)現(xiàn)過量磷酸鹽對四環(huán)素、氨基糖苷類和多烯大環(huán)內(nèi)酯等32種抗生素的合成產(chǎn)生阻抑作用。細(xì)胞膜透性的調(diào)節(jié)外界物質(zhì)的吸收或代謝產(chǎn)物的分泌都需經(jīng)細(xì)胞膜的運輸,如發(fā)生障礙,則胞內(nèi)合成代謝物不能分泌出來,影響發(fā)酵產(chǎn)物收獲,或胞

30、外營養(yǎng)物不能進(jìn)入胞內(nèi),也影響產(chǎn)物合成,使產(chǎn)量下降。如在青霉素發(fā)酵中,產(chǎn)生菌細(xì)胞膜輸入硫化物能力的大小影響青霉素發(fā)酵單位的高低。如果輸入硫化物能力增加,硫源供應(yīng)允足,合成青霉素的量就增多。5.6代謝調(diào)節(jié)理論在工業(yè)發(fā)酵上的應(yīng)用(代謝調(diào)控)工業(yè)發(fā)酵的目的:大量積累人們所需要的微生物代謝產(chǎn)物。代謝的人工控制:人為地打破微生物的代謝控制體系,使代謝朝著人們希望的方向進(jìn)行。人工控制代謝的手段: 控制發(fā)酵條件(生物化學(xué)方法); 改變微生物遺傳特性(遺傳學(xué)方法); 改變細(xì)胞膜透性;1.各種發(fā)酵條件對微生物代謝的影響 在微生物發(fā)酵過程中,發(fā)酵條件適合與否是發(fā)酵過程成敗的重要條件,因為發(fā)酵條件既能影響微生物的生長

31、,又能影響代謝產(chǎn)物的形成。發(fā)酵工藝條件的控制例如在谷氨酸發(fā)酵過程中,發(fā)酵條件不同,則發(fā)酵生成的主要產(chǎn)物也不同,如下表:2. 使用誘導(dǎo)物 許多與蛋白質(zhì)、糖類或其他物質(zhì)降解有關(guān)的酶類都是誘導(dǎo)酶,在發(fā)酵過程中加入相應(yīng)的底物作為誘導(dǎo)物,可以有效的增加這些酶的產(chǎn)量。如加入槐糖(1,2-D-葡二糖)誘導(dǎo)木霉菌的纖維素酶的生成,木糖誘導(dǎo)半纖維素酶和葡萄糖異構(gòu)酶的生成等。 誘導(dǎo)物的濃度過高及能被迅速利用時,會發(fā)生酶合成的阻遏,這在纖維二糖對纖維素酶的產(chǎn)生,木二糖對半纖維素酶產(chǎn)生中都己觀察到,這也是使用誘導(dǎo)物時應(yīng)予注意的發(fā)酵工藝條件的控制3. 添加生物合成的前體 前體是指加入到發(fā)酵培養(yǎng)基中的某些化合物,能被微生

32、物直接結(jié)合到產(chǎn)物分子中去,而自身的結(jié)構(gòu)無多大變化,且具有促進(jìn)產(chǎn)物合成的作用。如青霉素G的生產(chǎn)中,苯乙酰-CoA是限速性因子,補(bǔ)加苯乙酸或其衍生物都能增加青霉素G的產(chǎn)量。發(fā)酵工藝條件的控制前體與誘導(dǎo)物的區(qū)別: 有時難于區(qū)分促進(jìn)作用是誘導(dǎo)物的作用還是前體的作用。 一般,可把那些能在生長期內(nèi)、生產(chǎn)期前促進(jìn)產(chǎn)物合成的化合物看做誘導(dǎo)物,而前體往往只在生產(chǎn)期內(nèi)起作用。 另外,誘導(dǎo)物可以被非前體的結(jié)構(gòu)類似物取代。4.培養(yǎng)基成分和濃度的控制 (1)在考慮培養(yǎng)基組成與各組成成分的比例時, 要保證能夠滿足機(jī)體生長的需要, 要有利于代謝產(chǎn)物的形成, 同時還要盡量避免使用容易引起分解代謝產(chǎn)物阻遏的成分或避免使用高用量

33、的這種物質(zhì)。發(fā)酵工藝條件的控制防止碳分解代謝阻遏或抑制的發(fā)生青霉素發(fā)酵中限量流加葡萄糖(或糖蜜)以減少碳分解阻遏的發(fā)生,是一項很有效的提高產(chǎn)量的方法。 使用寡糖、多糖等緩慢利用的碳源,葡萄糖與麥芽糖、葡萄糖與蔗糖、葡萄糖與淀粉混合碳源的利用,也都能減少碳分解阻遏的發(fā)生。加入影響糖代謝的硫氰酸芐酯可使金霉菌對葡萄糖的利用速度減緩,可增加金霉素的產(chǎn)量。 防止氮、磷代謝阻遏的發(fā)生避免使用高濃度的銨鹽做氮源以防止氮代謝阻遏的發(fā)生,是抗生素發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)中比較成熟的經(jīng)驗。在抗生素產(chǎn)生期如補(bǔ)加氮源則會造成發(fā)酵逆轉(zhuǎn),返回生長期,抗生素的產(chǎn)量會大為減少。使用亞適量(對菌體生長)的磷酸鹽,亦是抗生素發(fā)酵工業(yè)中遵循

34、的原則之一。 為防止氮、磷分解阻遏的發(fā)生,應(yīng)選用黃豆餅粉、蛋白胨類物質(zhì)為主要原料,而盡量少用易被迅速利用的無機(jī)氮源。 因此在發(fā)酵培養(yǎng)基中通常是采用有適量速效碳源或氮源,以促進(jìn)機(jī)體的生長;又要有充足的遲效碳源或氮源,以利于發(fā)酵產(chǎn)物的形成,從而也可以避免速效碳源或氮源在機(jī)體內(nèi)產(chǎn)生分解代謝產(chǎn)物阻遏。 例如用甘油代替果糖作碳源培養(yǎng)嗜熱脂肪酵母,可以使淀粉酶產(chǎn)量提高25倍以上。. 菌種遺傳特性的改變 優(yōu)良菌種是提高發(fā)酵效果的重要前提。在微生物發(fā)酵上通常采用的優(yōu)良菌種指那些能夠克服末端產(chǎn)物反饋調(diào)節(jié)的和通過基因重組與基因擴(kuò)增方法篩選出的新菌種,這些優(yōu)良菌種可以過量合成所需要的產(chǎn)物。 (1)對于直線式代謝途徑

35、:選育營養(yǎng)缺陷性突變株只能積累中間代謝產(chǎn)物 A a B b C c D d E 1. 營養(yǎng)缺陷型菌株的應(yīng)用末端產(chǎn)物E對生長乃是必需的,所以,應(yīng)在培養(yǎng)基中限量供給E,使之足以維持菌株生長,但又不至于造成反饋調(diào)節(jié)(阻遏或抑制),這樣才能有利于菌株積累中間產(chǎn)物C 。(2) 分支代謝途徑:情況較復(fù)雜,可利用營養(yǎng)缺陷性克服協(xié)同或累加反饋抑制積累末端產(chǎn)物,亦可利用雙重缺陷發(fā)酵生產(chǎn)中間產(chǎn)物分支途徑賴氨酸發(fā)酵:谷氨酸棒桿菌的Hom分支途徑肌苷酸發(fā)酵(IMP合成途徑的代謝調(diào)控)調(diào)控理論的實踐應(yīng)用2 抗反饋控制或反饋阻遏突變株的應(yīng)用抗反饋控制突變株是指對反饋抑制不敏感或?qū)ψ瓒粲锌剐?,或兩者兼有之的菌株??狗纸獯x

36、阻遏突變株:如天冬氨酸激酶是賴氨酸生物合成途徑中的調(diào)節(jié)酶,由黃色短桿菌分離到對賴氨酸的類似物(2-氨基半胱氨酸)有抗性的突變株,它對天冬氨酸激酶的反饋抑制不敏感,賴氨酸的產(chǎn)量可達(dá)57mgm1。3 選育組成型突變株和超產(chǎn)突變株在發(fā)酵工業(yè)中,要選擇到一種廉價、高效的誘導(dǎo)物是不容易的,分批限量加入誘導(dǎo)物在工藝上也多不便,更為有效的方法是改變菌株的遺傳特性,除去對誘導(dǎo)物的需要,即選育組成型突變株。 通過誘變處理,使調(diào)節(jié)基因發(fā)生突變,不產(chǎn)生有活性的阻遏蛋白,或者操縱基因發(fā)生突變不再能與阻遏物相結(jié)合,都可達(dá)到此目的。 這樣的突變株稱為 組成型突變株。少數(shù)情況下,組成型突變株可產(chǎn)生大量的、比親本高的多的酶,

37、這種突變株稱為超產(chǎn)突變株。4 篩選耐前體或前體類似物的突變株加入前體有提高次級產(chǎn)物產(chǎn)量的效果;但過量對菌體又會有毒。篩選對前體育抗性的突變株以減少或消除前體的反饋阻遏,從而可獲得高產(chǎn)。如抗苯乙酸的青霉突變株,其青霉素的產(chǎn)量會增加。半胱氨酸、纈氨酸是-內(nèi)酰胺類抗生素的前體,篩選上述氨基酸的結(jié)構(gòu)類似物,三氟亮氨酸、D-纈氨酸的抗性菌株,其-內(nèi)酰胺類抗生素產(chǎn)量會提高。 控制細(xì)胞膜滲透性使胞內(nèi)的代謝產(chǎn)物迅速滲漏出去,解除末端產(chǎn)物的反饋抑制。 1. 用生理學(xué)手段 直接抑制膜的合成或使膜受缺損 如: 在Glu發(fā)酵中把生物素濃度控制在亞適量可大量分泌Glu;控制生物素的含量可改變細(xì)胞膜的成分,進(jìn)而改變膜透性

38、;當(dāng)培養(yǎng)液中生物素含量較高時采用適量添加青霉素的方法;再如:產(chǎn)氨短桿菌的核苷酸發(fā)酵中控制因素是Mn2+; Mn2+的作用與生物素相似。2. 利用膜缺損突變株 油酸缺陷型、甘油缺陷型如:用谷氨酸生產(chǎn)菌的油酸缺陷型,培養(yǎng)過程中,有限制地添加油酸,合成有缺損的膜,使細(xì)胞膜發(fā)生滲漏而提高谷氨酸產(chǎn)量。甘油缺陷型菌株的細(xì)胞膜中磷脂含量比野生型菌株低,易造成谷氨酸大量滲漏。應(yīng)用甘油缺陷型菌株,就是在生物素或油酸過量的情況下,也可以獲得大量谷氨酸。5.7代謝工程 代謝工程是指利用基因工程技術(shù),定向地對細(xì)胞代謝途徑進(jìn)行修飾、改造,以改變微生物的代謝特性,并與微生物基因調(diào)控、代謝調(diào)控及生化工程相結(jié)合,構(gòu)建新的代謝

39、途徑,生產(chǎn)新的代謝產(chǎn)物的工程技術(shù)領(lǐng)域。 基本思想是: 根據(jù)已有的遺傳和生化知識,找出限速步驟,進(jìn)行遺傳操作代謝工程:定向改造微生物的自然能力以生產(chǎn)(降解)某種物質(zhì)為目標(biāo)的工業(yè)生物技術(shù),需要 拓展底物利用能力和范圍 引入新的合成途徑,或延伸已有途徑 減少副產(chǎn)物形成;提高產(chǎn)量、產(chǎn)率和生產(chǎn)強(qiáng)度 改善細(xì)胞生理功能傳統(tǒng)育種:隨機(jī)突變,非理性設(shè)計代謝工程:定向遺傳修飾,理性設(shè)計 為了實現(xiàn)某種工業(yè)目的(生產(chǎn)工業(yè)原料或降解有毒物質(zhì)),傳統(tǒng)的手段是從自然界中篩選微生物、并通過化學(xué)或物理誘變改善其工業(yè)性能雖然在工業(yè)應(yīng)用上是有效的,但由于突變的非定向性和設(shè)計的非理性,越來越暴露出其難以認(rèn)識微生物生理本質(zhì)的缺陷。代謝工程策略碳水化合物原料丙酮丁醇C3酸P利用系統(tǒng)生物學(xué)手段,發(fā)現(xiàn)新的支路途徑和調(diào)控位點´´酸P´´´´設(shè)計新的代謝工程策略代謝工程策略碳水化合物原料C3酸P´´酸P´´´´實現(xiàn)代謝途徑重構(gòu)´遺傳修飾設(shè)計策略代謝分析出發(fā)菌株高效生產(chǎn)菌株代謝

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