文摘索引型數(shù)據(jù)庫(kù)

1、李春英李春英北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館20172017年年1 1月月文摘索引文摘索引 型數(shù)據(jù)庫(kù)檢索與利用型數(shù)據(jù)庫(kù)檢索與利用內(nèi)容提要內(nèi)容提要文摘庫(kù)概述文摘庫(kù)概述PubMedPubMed文摘索引型數(shù)據(jù)庫(kù)概述文摘索引型數(shù)據(jù)庫(kù)概述報(bào)道和揭示文獻(xiàn)的外部特征（題名、著者、出處、報(bào)道和揭示文獻(xiàn)的外部特征（題名、著者、出處、卷期、頁(yè)碼、時(shí)間、文獻(xiàn)類型、語種），同時(shí)對(duì)文卷期、頁(yè)碼、時(shí)間、文獻(xiàn)類型、語種），同時(shí)對(duì)文獻(xiàn)的內(nèi)容進(jìn)行摘要性描述的檢索工具。獻(xiàn)的內(nèi)容進(jìn)行摘要性描述的檢索工具。 文摘報(bào)道和揭示的一般是單篇文章文摘報(bào)道和揭示的一般是單篇文章生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中外文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中外文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)美

2、國(guó)全科醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)美國(guó)全科醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(Medline)荷蘭醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)荷蘭醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)(Embase)美國(guó)生物學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)美國(guó)生物學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)(BIOSIS Previews)美國(guó)化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)美國(guó)化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)(SciFinder)美國(guó)科學(xué)引文索引數(shù)據(jù)庫(kù)（美國(guó)科學(xué)引文索引數(shù)據(jù)庫(kù)（SCI）中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（CBM）中文生物醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（中文生物醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（CMCC）文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)特點(diǎn)文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)特點(diǎn)提供原文的摘要信息提供原文的摘要信息摘要信息包括：題目、作者、刊名，或同論文相關(guān)摘要信息包括：題目、作者、刊名，或同論文相關(guān)信息信息數(shù)據(jù)量大，

3、文獻(xiàn)類型多、信息量大數(shù)據(jù)量大，文獻(xiàn)類型多、信息量大收錄文獻(xiàn)回溯年代長(zhǎng)收錄文獻(xiàn)回溯年代長(zhǎng)收錄文獻(xiàn)期刊種類多收錄文獻(xiàn)期刊種類多出版形式多樣出版形式多樣文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)使用情況文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)使用情況文摘數(shù)據(jù)庫(kù)的作用文摘數(shù)據(jù)庫(kù)的作用1.1. 可了解和把握某課題領(lǐng)域研究動(dòng)態(tài)和研究現(xiàn)狀可了解和把握某課題領(lǐng)域研究動(dòng)態(tài)和研究現(xiàn)狀2. 2. 找到全文的重要和必要線索找到全文的重要和必要線索3.3. 判斷自己課題的新穎性判斷自己課題的新穎性對(duì)不熟悉的語種文章，看英文摘要即可對(duì)不熟悉的語種文章，看英文摘要即可科研評(píng)價(jià)科研評(píng)價(jià)（學(xué)位）論文選題、開題、課題查新時(shí)文獻(xiàn)調(diào)研的重要途徑（學(xué)位）論文選題、開題、課題查新時(shí)文獻(xiàn)調(diào)研

4、的重要途徑文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)掌握要領(lǐng)文摘索引數(shù)據(jù)庫(kù)掌握要領(lǐng)1.1.數(shù)據(jù)庫(kù)的概況數(shù)據(jù)庫(kù)的概況2.2.數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)3.3.數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索界面數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索界面4.4.數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索技巧與方法數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索技巧與方法PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)主要內(nèi)容主要內(nèi)容1. 1. 數(shù)據(jù)庫(kù)概況數(shù)據(jù)庫(kù)概況2. 2. 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索機(jī)制數(shù)據(jù)庫(kù)檢索機(jī)制3.3. 數(shù)據(jù)庫(kù)的組成結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的組成結(jié)構(gòu)4. 4. 檢索界面檢索界面5.5. 檢索方法與技巧檢索方法與技巧PubMedPubMed概況概況1.1.創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國(guó)生物創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國(guó)生物技術(shù)信息中心技術(shù)信息中心(NCBI)(NCBI)2.

5、2.類型：類型：WebWeb數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)庫(kù)3.3.網(wǎng)址：網(wǎng)址：/pubmed/pubmed4.4.特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn)，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接檢索體系完備等特點(diǎn)，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。免費(fèi)獲得全文。5.5. 學(xué)科范圍：生物醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)、行為科學(xué)、學(xué)科范圍：生物醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)、行為科學(xué)、生物工程、化學(xué)等學(xué)科。生物工程、化學(xué)等學(xué)科。6.6.與與MedlineMedline光盤數(shù)據(jù)庫(kù)的區(qū)別：檢索機(jī)制、檢

6、索光盤數(shù)據(jù)庫(kù)的區(qū)別：檢索機(jī)制、檢索界面、檢索方法以及收錄文獻(xiàn)數(shù)量不同。界面、檢索方法以及收錄文獻(xiàn)數(shù)量不同。PubMedPubMed數(shù)據(jù)來源數(shù)據(jù)來源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINEOLDMEDLINE 2.In Process Citations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的電子文獻(xiàn)，每條記錄標(biāo)有PubMed-as supplied by Publisher。PubMedPubMed檢索機(jī)制檢索機(jī)制1 1自動(dòng)截詞轉(zhuǎn)換匹配功能自動(dòng)截詞轉(zhuǎn)換匹配功能(Automatic Term Mapping)(Automa

7、tic Term Mapping)對(duì)于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對(duì)照匹配和轉(zhuǎn)換，再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表(MeSH translation table)、期刊刊名表(Journal translation table)、全體作者表(Full author translation table)、作者索引(Author Index)、全體調(diào)查者表(Full investigator translation table)、調(diào)查者索引(Investigator Index)。如果在以上6個(gè)表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以

8、上的過程，檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。2 2短語檢索短語檢索(Phrase Searching)(Phrase Searching)也可稱為強(qiáng)迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索，可用雙引號(hào)“ ”將其引起來。如：“drug therapy”作為詞組進(jìn)行檢索的詞，系統(tǒng)不進(jìn)行自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配，也不進(jìn)行MeSH詞的擴(kuò)檢。1.1.邏輯運(yùn)算符：邏輯運(yùn)算符： 邏輯與：邏輯與：ANDAND，邏輯或：，邏輯或：OROR，邏輯非：，邏輯非：NOTNOT。當(dāng)一。當(dāng)一個(gè)檢索表達(dá)式中同時(shí)含有三個(gè)運(yùn)算符時(shí)，運(yùn)算順序個(gè)檢索表達(dá)式中同時(shí)含有三個(gè)運(yùn)算符時(shí)，運(yùn)算順序從左至右，括號(hào)可以改變運(yùn)算順序。從左至右，括號(hào)可

9、以改變運(yùn)算順序。2.2.截詞符：截詞符：* *，一個(gè)詞或字拼寫出部分字母后面加上，一個(gè)詞或字拼寫出部分字母后面加上一個(gè)截詞符，一個(gè)截詞符，chemchem* *表示用詞根進(jìn)行檢索。表示用詞根進(jìn)行檢索。Heart attackHeart attack* * 會(huì)關(guān)閉自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配檢索詞，會(huì)關(guān)閉自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配檢索詞，myocardialmyocardial infarction,infarction, myocardial stunning,myocardial stunning, shockshock等詞等詞 3.3.雙引號(hào)：雙引號(hào)：“ ”，表示對(duì)引號(hào)中的短語進(jìn)行檢索。，表示對(duì)引號(hào)中的短語進(jìn)行檢索。4

10、.4.檢索字段標(biāo)識(shí)符：檢索字段標(biāo)識(shí)符：tagtag，tagtag為字段名稱。為字段名稱。 titi，auau，tata，soso，lala，ptpt。PubMedPubMed檢索運(yùn)算符檢索運(yùn)算符常用字段組成常用字段組成標(biāo)識(shí)符標(biāo)識(shí)符 字段名稱字段名稱TI TitleTI TitleAU AuthorAU AuthorAD AffiliationAD AffiliationAB AbstractAB AbstractDP Publication DateDP Publication DateEDAT Entrez DateEDAT Entrez DateSO SourceSO SourceTA J

11、ournal Title TA Journal Title AbbreviationAbbreviationMH MeSH TermsMH MeSH TermsPT Publication TypePT Publication Type 檢索界面檢索界面基本檢索基本檢索高級(jí)檢索高級(jí)檢索MeSHMeSH DatabaseDatabase檢索檢索限定檢索限定檢索期刊查詢期刊查詢(Journals Databases ) (Journals Databases ) 引文匹配器引文匹配器(Citation Matcher)(Citation Matcher)臨床查詢臨床查詢(Clinical Quer

12、ies)(Clinical Queries)打開搜狗瀏覽器打開搜狗瀏覽器用戶名：用戶名：jf20120001jf20120001密碼：密碼：123456123456PubMed檢索方法檢索方法1.基本檢索：在基本檢索界面下完成的檢索方法2.高級(jí)檢索：高級(jí)檢索界面下進(jìn)行的檢索方法3.MeSH Database檢索：MeSH主題詞界面下進(jìn)行的檢索方法基本檢索基本檢索基本檢索基本檢索1.1.關(guān)鍵詞、詞關(guān)鍵詞、詞( (詞組詞組) )或短語：或短語：2.2.作者：作者：Smith JS Smith JS 或或 SmithauSmithau3.3.期刊刊名：期刊刊名：GENE THERAPYTAGENE

13、THERAPYTA，JAMATAJAMATA4.4.截詞：截詞：CHEMOCHEMO* *5.5.復(fù)雜表達(dá)式：復(fù)雜表達(dá)式：CANCER AND THERAPYCANCER AND THERAPY6.#1 AND #26.#1 AND #2 艾滋病的藥物治療艾滋病的藥物治療Aids drug therapySearch details檢索過程檢索過程(acquired immunodeficiency (acquired immunodeficiency syndromeMeSH Terms OR syndromeMeSH Terms OR (acquiredAll Fields AND (ac

14、quiredAll Fields AND immunodeficiencyAll Fields AND immunodeficiencyAll Fields AND syndromeAll Fields) OR acquired syndromeAll Fields) OR acquired immunodeficiency syndromeAll Fields immunodeficiency syndromeAll Fields OR aidsAll Fields) OR aidsAll Fields) (drug therapySubheading OR (drug therapySub

15、heading OR (drugAll Fields AND therapyAll (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug therapyAll Fields Fields) OR drug therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll (drugAll Fields AND therapyAll Fields)Fields)修改后的檢索結(jié)果修改后的檢索結(jié)果高級(jí)檢索高級(jí)檢索高

16、級(jí)檢索高級(jí)檢索MeSH DatabaseMeSH Database檢索檢索輸入查找的主題詞Aids drug therapy主題詞注釋主題詞注釋樹狀結(jié)構(gòu)表樹狀結(jié)構(gòu)表款目詞款目詞檢索步驟查看檢索歷史查看檢索歷史限定檢索限定檢索1.1.限制檢索或條件檢索：限制檢索或條件檢索：LimitsLimits(1)(1)日期：日期：Date of publicationDPDate of publicationDP原始文獻(xiàn)出版日期；原始文獻(xiàn)出版日期；Entrez DateEDATEntrez DateEDAT文獻(xiàn)首次錄入文獻(xiàn)首次錄入PubMedPubMed日期；日期；MeSH MeSH DateMHDADa

17、teMHDA文獻(xiàn)被文獻(xiàn)被MeSHMeSH詞條標(biāo)引日期。詞條標(biāo)引日期。 (2)(2)地址：?jiǎn)蝹€(gè)詞加標(biāo)識(shí)符地址：?jiǎn)蝹€(gè)詞加標(biāo)識(shí)符adad(3)(3)帶有摘要文獻(xiàn)的檢索帶有摘要文獻(xiàn)的檢索 ：CANCER AND hasabstract CANCER AND hasabstract (4)(4)數(shù)據(jù)庫(kù)子集的限定：特殊主題的檢索數(shù)據(jù)庫(kù)子集的限定：特殊主題的檢索 AMERICAN AND AMERICAN AND history sb history sb 2.2.限定檢索結(jié)束后，及時(shí)取消限定條件限定檢索結(jié)束后，及時(shí)取消限定條件 限定檢索限定檢索限定檢索限定檢索點(diǎn)擊取消PubMedPubMed幾種檢索方法的

18、選擇幾種檢索方法的選擇l基本檢索基本檢索l高級(jí)檢索高級(jí)檢索lMeSHMeSH DatabaseDatabase檢索檢索舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)基本檢索基本檢索 1.1.檢索表達(dá)式：檢索表達(dá)式： children asthma drug children asthma drug therapytherapy2.2.直接輸入檢索框中，進(jìn)行檢索直接輸入檢索框中，進(jìn)行檢索檢索過程（檢索過程（SearchSearch detailsdetails） (childMeSH Terms OR childAll (childMeSH Terms OR childAll

19、Fields OR childrenAll Fields) Fields OR childrenAll Fields) AND AND (asthmaMeSH Terms OR asthmaAll (asthmaMeSH Terms OR asthmaAll Fields) ANDFields) AND (drug therapySubheading OR (drugAll (drug therapySubheading OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields) OR drug Fields AND therapyAll Fields) OR drug

20、 therapyAll Fields OR drug therapyMeSH therapyAll Fields OR drug therapyMeSH Terms OR (drugAll Fields AND Terms OR (drugAll Fields AND therapyAll Fields)therapyAll Fields)修改檢索式：修改檢索式： childMeSHchildMeSH Terms AND asthmaMeSHTerms AND asthmaMeSH Terms Terms AND drug therapySubheadingAND drug therapySu

21、bheading舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)MeSHMeSH DatabaseDatabase檢索檢索1.1.確定主題詞：確定主題詞：child asthma child asthma drug therapy(drug therapy(副主副主題詞題詞) ) 2.2.查找主題詞查找主題詞舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻(xiàn)高級(jí)檢索高級(jí)檢索1.1.確定檢索詞：確定檢索詞：child asthma drug therapychild asthma drug therapy2.2.選擇檢索字段選擇檢索字段3.3.輸入檢索詞輸入檢索詞J

22、ournals Databases主題、刊名全稱或縮寫、主題、刊名全稱或縮寫、ISSNISSN單篇文獻(xiàn)匹配器單篇文獻(xiàn)匹配器臨床咨詢臨床咨詢特殊專題咨詢檢索結(jié)果檢索結(jié)果顯示顯示保存保存打印打印顯示格式顯示格式Summary(簡(jiǎn)要格式)Abstract（文摘格式）MEDLINE保存格式保存格式1.File(文件) 2.Format（格式）檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用使用使用My NCBI(Cubby)My NCBI(Cubby)首先要登記注冊(cè)首先要登記注冊(cè)保存檢索策略保存檢索策略定期瀏覽新的檢索結(jié)果定期瀏覽新的檢索結(jié)果注冊(cè)或登錄個(gè)人帳號(hào)注冊(cè)或登錄個(gè)人帳號(hào)注冊(cè)后的功能注冊(cè)后的功能保存、修

23、改、刪除檢索式其它功能其它功能全文鏈接全文鏈接相關(guān)文獻(xiàn)鏈接相關(guān)文獻(xiàn)鏈接相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接RSSRSS閱讀器的使用閱讀器的使用全文鏈接全文鏈接全文鏈接全文鏈接檢索練習(xí)檢索練習(xí)1.1.檢索有關(guān)檢索有關(guān)“禽流感禽流感(bird flu)(bird flu)預(yù)防控制方面預(yù)防控制方面”的文獻(xiàn)的文獻(xiàn)2.2.檢索微量元素缺乏檢索微量元素缺乏(trace elements)(trace elements)與皮膚病與皮膚病(skin diseases)(skin diseases)關(guān)系的文獻(xiàn)（限英文綜述）關(guān)系的文獻(xiàn)（限英文綜述）3.3.利巴韋林（利巴韋林（ribavirinribavirin）治療

24、）治療SARSSARS方面的綜述文獻(xiàn)方面的綜述文獻(xiàn)4.4.眼結(jié)核眼結(jié)核(ocular tuberculosis)(ocular tuberculosis)引起失明引起失明(blindness)(blindness)的文獻(xiàn)的文獻(xiàn)5.5.北京大學(xué)韓濟(jì)生教授發(fā)表的英文文獻(xiàn)北京大學(xué)韓濟(jì)生教授發(fā)表的英文文獻(xiàn)6.CANCER LETTERS6.CANCER LETTERS期刊上查找有關(guān)基因治療方面的文獻(xiàn)期刊上查找有關(guān)基因治療方面的文獻(xiàn)1.1.檢索過程和步驟檢索過程和步驟2022/5/775（1 1）分析課題，提煉出兩個(gè)主題概念，并明確概念）分析課題，提煉出兩個(gè)主題概念，并明確概念之間的相互關(guān)系如下：之間的

25、相互關(guān)系如下：預(yù)防控制禽流感事物與特征的關(guān)系2022/5/776（2 2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMEDPUBMED數(shù)據(jù)庫(kù)中即為數(shù)據(jù)庫(kù)中即為選擇選擇MeSHMeSH入口進(jìn)行檢索。入口進(jìn)行檢索。（3 3）編制檢索策略。）編制檢索策略。 Influenza in Birds / prevention and controlInfluenza in Birds / prevention and control （禽流感（禽流感 / / 預(yù)防控制）預(yù)防控制） 其中其中 主題詞為：主題詞為： Influenza in BirdsInfluenza in Birds（禽流感）（禽流感） 副主題詞為：副主題詞為： prevention and control prevention and control （預(yù)防控（預(yù)防控制）制）2.2.檢索過程和步驟檢索過程和步驟2022/5/777（1 1）分析課題，提煉出兩個(gè)主題概念，并明確概念）分析課題，提煉出兩個(gè)主題概念，并明確概念之間的相互關(guān)