ctDNA在淋巴瘤診療中的全程應(yīng)用

1、tumor DNADistinct biological subtypes and patterns of genomeevolution in lymphoma revealed by circulatingSci. Transl. Med . Nov 2016IF: 16.3背景.彌漫大 B 細(xì)胞淋巴瘤(Diffuse Large B Cell Lymphoma, DLBCL) 是非霍 奇金淋巴瘤(NHL)中最為常見的類型。治愈率高，但是 30-40%的患者仍會復(fù) 發(fā)；.目前缺乏有效方法對患者進行 風(fēng)險分級評估并指導(dǎo)治療。COO分類法 的臨床應(yīng)用潛力巨大，但是基于組織的分子表達水平檢測具有

2、局限性；發(fā)生中心 B 細(xì)胞樣(germinal center B cel I-like, GCB) DLBCL活化 B 斑胞樣(activated B cd Hike. ABC).對于由濾泡淋巴瘤(Follicular Lymphoma, FL)轉(zhuǎn)化而來的DLBCL ,缺乏準(zhǔn) 確的轉(zhuǎn)化預(yù)測指標(biāo)。ctDNA :無創(chuàng)連續(xù)方法. Panel 設(shè)計:recurrent SNV Indel;breakpoints (BCL2, BCL6, MYC IGH);重鏈可變區(qū)IgVH &重鏈連接簇IgJH.樣本信息患者92例：76 DLBCL (初診/復(fù)發(fā))+ 12 FL + 4其它組織?S檢76份:76 DL

3、BCL血漿144份：45治療前+ 99治療后結(jié)果技術(shù)表現(xiàn)A Ttimorperag m 二了后立田鵬Df G3*LiIIeLiI. Jll.llllhlll IlllillLUl J II h .IblLll.lL Li.aLJ H _ _ ； 1 -H&M4hH 守AH5 再屬rwIHKjF raCJtmrrmtjTsaCACW*-dwSrriTF E*.E#耳Mmxin 7 p：ih*!-nli1-wir i)T-kvriMutf.Kit-啊白U 皿0 hMdHnmiH100%的月中瘤組織中檢測到體細(xì)胞變異，中位突變個數(shù)為134;與Fish相比，translocation的檢出靈敏度為 8

4、9% Fi7PZJir s：xri-.r r r-r：|t3鼻耳:ao-c r：二” .二二1 一二：一l1 ?/. 一二 工?。篿，fM hflnfctuEGrB&smai 但f 羯口J 11 0|沖 MhGEniL; CcnceutiatiQiif of ctDNA eie pressedinhaploid gcnouie equivalenn per mLhG E/m L =AF * ctDNA i! p jj/ni L)33血漿中能檢出組織中91%的driver突變；52%的組織Non-driver突變能在血漿中檢測到；檢出率與分期和 ctDNA濃度（黑色三角）有關(guān)：當(dāng)ctDNA濃度大

5、于 5hGE/mL時，血漿中能檢出至少一個 SNV;基于CAPP-seq的ctDNA檢測能夠反應(yīng)月中瘤組織的分子特征結(jié)果 監(jiān)測DiKHMilRM4*PS*PDTumor Prnatrmrt 州Ptyiwvg rlDNA Mkht1W-),一mH T S , -ymphoma 口MA moleculM m一IgHTS: loimiMiogfiubulm mgh-mroughout sequencingCAPP-seq的靈膿度優(yōu)于IgHTSi對三例服用依魯替尼的患者進行療效監(jiān)測，其中2例患者的ctDNA檢測到BTK的耐藥突變，相鄰的BTK突變顯示趨同的進化方式-6217T jmc?r Mirpes

6、PET.CTPET CT PETCT工二*上二Dvyfl frexn fil 124 T66 222 271 439 572 fiB 二 loriJiiniDPlasma sanptesMdjh AF 8rxC4S1S A. Tf Ems牝.of SFKC4S1S I re&jslance mulAticrw育可 flCiV-工 7二w s基于CAPP-seq的ctDNA檢測能夠?qū)崟r監(jiān)測月中瘤的克隆進化和分子耐藥結(jié)果 預(yù)后療前的ctDNA濃度與DLBCL預(yù)后相關(guān)的3個信床指標(biāo)LDH. MTV和Ann Aibor分期均顯著免關(guān)CovariatpnFndpoinTP (Univariate)P (

7、Multivariate)ctDNA cone.PF50.0036。訂(hGE/mL)OS0350.82ctDNA可以作為一個獨立的預(yù)后指標(biāo)結(jié)果復(fù)發(fā)對來自11名患者的30個CR期血漿和8個復(fù)發(fā)血漿進行CAPP-seq檢測TnMEment laled： br3inRadiogr-xpiw: OjAcotkEfDfrtAMiwM 1CRl Mbm*|woo w二|也|_茂久勘& 見典卜研p * A O 就40200 T勺*史4M型口 Rd FP= OOOD3zF 匚占EmM KVN pfrt aft9r tng4rtwr4 愀.11Q)Othi*Et pMJKvfldfHr wsiHir r =

8、1%1n 2Mn 308 4000 MX口3，fltom nd M gopy73% (8/11)的患者復(fù)發(fā)前能檢測到ctDNA ;首次檢測到MRD距離臨床復(fù)發(fā)平均時長188天；CAPP-seq的MRD檢出率高于IgHTS兩倍；療后ctDNA陽性患者的PFS顯著短于ctDNA陰性患者基于CAPP-seq的ctDNA能夠改善MRD檢測和提前預(yù)測復(fù)發(fā)結(jié)果一一分型從以往研究中篩選出23個基因以及該基因在不同類別中的突變頻率FrEq/Eficy e ABC舊曲小與 Frequency in GCB0 1籬 MU7 343 t,BCW時火2口36:dpiyi5K U.iUh/SUXH承川：，VLWM心”。

9、稠 3，7Air5* m rAiMiuii run|Mewlona-uiD|配LB MAflM山伸j| IIwwtarrteru b她I央傳闋uh；通日NLCCKJMuUbnU U伯17世MiAmfiii.DiD1Zt MwlntioD,-n?T|SEJ Mtfflfign口加(AmQrA MuUIkmitST-MLf2V Wjuhot而.VBKLl1 DH 力0:11也 SlAK MtdaUcn/ 6*TMH mas 1 題 /IMn i r U1 . d Hr 0 g a囤 a曲 n心刑 口,蛔 3-M2SI幅NV：M】T uwC,9*lM3 -自 CUFmExMmU .： M；IlJ.l

10、MU 金岫/崢ri電aLJ MCD fB MutfllunD.mJ cflPW hiirtatrr卬MWd* ,柏Eh4 MITQ i?Q|JfDUT Miri95丁/*心.Mlp ir*0 tJMQb2U 13FFWOHMHtflfi.：齷了MXCMlUtiMoi7整u i riUkukHi一期：itKtMfi；： Oft+ 1W Wwttwi；疔Htl.-ftM GM* *同E根據(jù)樣品的突變頻譜，通過 Bayesian方法分別計算歸屬ABC和GCB類別CAPPSeqdsssificaijon心OMrtpp 口 F 8Q 86 ddTOPalient tumo sartipJ&s (rt =

11、 76)的可能性并完成分類。Hns algorithm dassi If cation與臨床分類的一致性接近到80%CPP-Seq如一 GCB (fl = 2t)Nan-GCB i.fl = ?4)融mp帕typeFTPHR (STS Qi,Hjnw500 003Q.爐 0.42,0.M)Plasma25O.tt2O.47 40.25-0.8)CAPP- Srq clatuher prugncnilc pe他nmancu 酒 prkray DL8CL: PFS ham ctiunosl10002C003000口ys tram dgnoisTumcr-de fined GCENon心C8HubT

12、ypa m h 247? 17* f 3U6PJ0-XT840，GCBn , 21段 Non-GCB 17)01F*1 ”i-f010W2000 MOODays from &i3ggi1值Plasmadermtd subtype 一 GOB基于CAPP-seq的COO分類比Hans algorithm萬法更能體現(xiàn) GCB與非GCB類型的預(yù)后差異；血漿和組織的分類一致性達到88%ctDNA在DLBCL分型方面具有應(yīng)用前景結(jié)果病理轉(zhuǎn)化出展醫(yī)慘的癡沮淋巴瘙FL會在沒有警覺的情況不轉(zhuǎn)化學(xué)卡茶性曲DLBCL假說，想時的腫痛坦魴基因烈譜比皎，能夠鼻示耨理轉(zhuǎn)化的口甌就分子特在三Ifli FL vi tFL

13、(n = r： v： ： . ? ? : ,:i；巾=12);DI.rsDLHCi (retaimdrafiKtory)(a = 7)對腳浦俎加2的分析能烤有俄國 分三種猛鹿集型F區(qū)化的M蛔1FLT呈現(xiàn)最大 的進優(yōu)距離，基因郎基祥也與廿原的時W和 簫療史無關(guān)P-0.03Biapay-hva trsnalormation prediction 3 1610 u s 互 drKcq 夏- 1 - 1 lu T- - 1 laaxs承群d醺21 i 1 1. 1 1 1 k百蘿-Id dnfiMrrOL6CLntFL- 向PPV NPVJransfwming vs. non*translorming FL (n = 21)03%89%91%00%Sn, f?nsitiviry; Sph specificity;PPV positive preictive aiue; NPA nesahve predictive ralue.隨訪期血漿能夠以更高比率的新增突變區(qū)分tFL ;ctDNA濃度能夠從ntFL中區(qū)分tFL和rrDLBL ;通過logistic回歸建模和leaveone-out交叉驗證，血漿區(qū)分tFL和ntFL 的靈敏性和特異性分別達到83%和89%。diagnosisDaysORituximabtFL diagnosisSot id drrie： mmoc bK甲s 庭已Da