小鼠遺傳學(xué)以及其分類(lèi)命名

1、關(guān)于小鼠遺傳學(xué)及其分類(lèi)命名第一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月遺傳學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)實(shí)驗(yàn)小鼠起源實(shí)驗(yàn)小鼠的分類(lèi)及其命名遺傳監(jiān)測(cè)繁育體系第二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月分子遺傳學(xué)第三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月編碼特定蛋白產(chǎn)物的DNA序列基因可能存在可變形式，稱(chēng)為等位基因（allele）基因（GENE）第四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月homozygousheterozygoushemizygous等位基因(Alleles)野生型“wildtype” 在自然群體中往往有一種占多數(shù)的（因此常被視為正常的）等位基因第五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6

2、月基因的命名沒(méi)有特定的命名體系,因此比較混亂通過(guò)基因功能命名 (通常為酶)Nos2, Sod1通過(guò)基因產(chǎn)物的大小命名p53, p21通過(guò)表型命名Apc, Rb, Mom1同物異名當(dāng)基因功能確定后命名常會(huì)發(fā)生改變單個(gè)基因有多個(gè)功能時(shí)通常會(huì)有多個(gè)名字第六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月基因型/表型 基因型(Genotype)狹義 = 個(gè)體特定基因的等位基因組成情況廣義 = 個(gè)體所有基因的整套等位基因(整個(gè)遺傳背景或基因組)表型(Phenotype)狹義=因特定基因的等位基因組成而引起的個(gè)體特征廣義=因個(gè)體的基因組組成而引起的一系列解剖,生理和行為學(xué)等特征第七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2

3、022年6月小鼠基因組學(xué)人基因組 3 billion bp小鼠基因組 3 billion bp其它模式生物基因組大小果蠅 140 million bp (21-fold less)線蟲(chóng) 97 million bp (31-fold less)酵母 12 million bp (250-fold less)細(xì)菌 (E. coli) 5 million bp (600-fold less)第八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月小鼠基因組學(xué)小鼠是研究人類(lèi)基因功能最好的模式動(dòng)物C57BL/6, BALB/c, C3H 是歷史上最常使用的小鼠C57BL/6, 129, FVB最常使用的基因工程小

4、鼠可獲取基因組序列的小鼠品系C57BL/6 (NIH Mouse Sequencing Consortium)A/J2, DBA/2, 129X1/SvJ, 129S1/SvImJ (Celera Genomics) 第九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月小鼠基因組學(xué)小鼠基因組大概包含30,000 到 50,000 個(gè)不同基因 (2000 個(gè)每染色體)至少 50% 與人類(lèi)基因同源 (相似的序列和功能) 與人類(lèi)基因同源的小鼠基因的命名 Nitric oxide synthase 2 Human gene = NOS2 (斜體, 全大寫(xiě))Mouse gene = Nos2 (斜體, 首字母

5、大寫(xiě))Protein = NOS2 (正體,全大寫(xiě))第十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月小鼠功能基因組學(xué)基因型驅(qū)動(dòng)的或”正向”基因組學(xué)引入突變 (遺產(chǎn)工程)篩選表型改變具有人為偏好的特點(diǎn)表型驅(qū)動(dòng)的或”反向”基因組學(xué)隨機(jī)突變后觀測(cè)表型改變或隨機(jī)引入點(diǎn)突變 (by ENU)觀測(cè)表型改變找出表型相關(guān)基因位點(diǎn)鑒定未知基因,基因功能需要大量篩選工作第十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月實(shí)驗(yàn)小鼠起源第十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月家鼠起源第十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月M. musculus 各亞種的地理分

6、布第十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月History of the Laboratory Mouse1100 BC-color-variant mice (China)1909- first inbred strain1929- The Jackson Laboratory1962- nude mouse1980- first transgenic mouse1989- first knockout mouse1990s- conditional/inducible knockouts, knock-in, mouse genome project2002-RNA interfer

7、ence knockouts?第十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Jon A. Back et al. 2000 Nature Genetics, vol24, 23-25第十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第十八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ C

8、onplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月封閉群（遠(yuǎn)交群）Closed Colony or Outbred Stock以非近親交配方式進(jìn)行繁殖生產(chǎn)的一個(gè)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物種群，在不從其外部引入新個(gè)體的條件下，至少連續(xù)繁殖4 代以上，封閉群亦稱(chēng)遠(yuǎn)交群。Lab code: stock symble例如：N: NIH 表示由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院（N）保持的NIH 封閉群小鼠。 Lac: LACA 表示由英國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心（Lac）保持的LACA封閉群小鼠。某些命名較早，又廣為人知的封閉群動(dòng)物，名稱(chēng)與上述規(guī)則不一致時(shí)，仍可沿用其原來(lái)的名稱(chēng)

9、。如：Wistar大鼠封閉群，日本的ddy封閉群小鼠等。第二十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型第二十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月近交的結(jié)果第二十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月98.7 homozygosity第二十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第二十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月近交系：經(jīng)至少連續(xù)20 代的全同胞兄妹

10、交配培育而成，品系內(nèi)所有個(gè)體都可追溯到起源于第20代或以后代數(shù)的一對(duì)共同祖先。經(jīng)連續(xù)20 代以上親代與子代交配與全同胞兄妹交配有等同效果。近交系 Inbred strain第二十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月近交系的命名基于毛色DBA (Dilute Brown nonAgouti, first inbred mouse)基于起源NZW (New Zealand White)基于表型NOD (Non-Obese Diabetic)其它BALB/c, C57BL, 129第二十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月近交系的命名1一般均用一個(gè)或幾個(gè)大寫(xiě)英文字母表示，如A、AE、

11、BA、AKR、DBA、NZB、STAR、NMRT、NYLR、NZBR等2有些品系可在大寫(xiě)英文字母間加入一些阿拉拍數(shù)字來(lái)表示，如C3H、C57BL、C57BR、C57L、CC57W、CC57BR等 3非正規(guī)的命名，如果已廣泛為國(guó)際所共知者，則可保留沿用，如：“129”、“101”、“615”等第二十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月近交系代數(shù)近交代數(shù)表示，一般是在品系符號(hào)后括號(hào)里寫(xiě)上代數(shù)，并在代數(shù)前加寫(xiě)“F”（Filial的縮寫(xiě)），例如A（F78）。C57BL/6J(F？+10 )C57BL/6JNga(F73+26)第二十八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型

12、近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第二十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月亞系的形成近交系的亞系分化是指一個(gè)近交系內(nèi)各個(gè)分支的動(dòng)物之間，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)或十分可能存在遺傳差異。通常下述三種情況會(huì)發(fā)生亞系分化。a) 在兄妹交配代數(shù)達(dá)40 代以前形成的分支（即分支發(fā)生于F20到F40之間）；b) 一個(gè)分支與其他分支分開(kāi)繁殖超過(guò)100 代；c) 已發(fā)現(xiàn)一個(gè)分支與其他分支存在遺傳差異。產(chǎn)生這種差異的原因可能是殘留雜合、突變或遺傳污染（genetic cont

13、amination）（即一個(gè)近交系與非本品系動(dòng)物之間雜交引起遺傳改變）。由于遺傳污染形成的亞系，通常與原品系之間遺傳差異較大，因此對(duì)這樣形成的亞系應(yīng)重新命名。例如由GLaxo保持的A近交系在發(fā)生遺傳污染后，重新命名為A2G。第三十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月亞系的命名C57BL/6,C57BL/10C57BL/6J,C57BL/6N例外BALB/c、C57BR/cd第三十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月亞系的命名更復(fù)雜的亞系命名是通過(guò)把實(shí)驗(yàn)室代碼按順序?qū)懗?不添加斜杠BALB/cByJ, BALB/cAnN, BALB/cJC57BL = parent strain

14、designation 6JOlaHsdEi = substrain designation 6 = line number J = laboratory code Ola = laboratory code Hsd = laboratory code Ei = Laboratory codeC57BL/6JOlaHsdEi第三十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月實(shí)驗(yàn)室代碼由 Institute for Laboratory Animal Research (ILAR) 來(lái)管理實(shí)驗(yàn)室代碼 International Laboratory Code Registry (Lab Code

15、s). 環(huán)境因素會(huì)影響一個(gè)品系的特征,所以標(biāo)明一個(gè)品系是從哪來(lái)的是很重要的. /ilar/codes.asp?id=codes J：The Jackson LaboratoryN：National Insititutes of HealthCrl：The Charles River LaboratoryRik：The Institute of Physical and Chemical Research (RIKEN)第三十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Reference: Specht CG, Schoepfer R. Deletion of the alpha-synucle

16、in locus in a subpopulation of C57BL/6J inbred mice, BMC Neuroscience 2001: 2: 11.亞系提供單位基因型表型C57BL/6JOlaHsdHarlan, Bicester, UKdeletion of the alpha-synuclein (Snca)locusImplicated in the aetiology of Parkinson and Alzheimer diseasesC57BL/6JThe Jackson LaboratoryLocus intactNormalC57BL/6NCharles Riv

17、er, Margate, UKLocus intactNormal近交系亞系之間的差異第三十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月BALB/c的家譜1932, Snell(added the /c), University of Texas?,NCI, Amsterdam1935, F?, Andervont(An), NIH1967, F99, Bailey(By), JAXBALB/cAJcl1951, F72, NIHBALB/cAnN1975, F136, JAXBALB/cByJ1935, F26, Snell moved to JAX1961, Bailey, NIH1923

18、, Little & MacDowell, start inbreeding1927, F12, Muller, University of Texas1913, Halsey J. Bagg albino1973, CIEA, Japan1989, CLEA, Japan免疫反應(yīng)最強(qiáng)第三十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月BALB/c亞系的差異SubstrainAnimal ProviderGenotypePhenotypeBALB/cByJThe Jackson LaboratoryA 278bps deletion of the acyl-Coenzyme A dehydrog

19、enase, short chain, (Acads )locussevere organic aciduria hypoglycemia and elevated urinary and muscle butyrylcarnitine concentrations (after 18hrs fasting) BALB/cAnNThe NIHLocus intactNormalBALB/cAJclCLEA, JapanLocus intactNormalReference: Armstrong DL; Masiowski ML; Wood PA, Pathologic characteriza

20、tion of short-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency in BALB/cByJ mice., Am J Med Genet 1993 ;47(6):884-92 第三十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第三十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月F1雜合子(F1 Hybrids)定義:兩個(gè)不同近交系交配后生產(chǎn)的第一代優(yōu)點(diǎn):基因型和表

21、型一致;雜交優(yōu)勢(shì);可以接受來(lái)自雙親品系的器官移植缺點(diǎn):不能自我維持品系延續(xù)第三十八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月F1 雜合子的命名用交配的兩個(gè)近交系的縮寫(xiě),先雌鼠后雄鼠再跟一個(gè)F1B6CBF1第三十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月雜合子命名中使用的標(biāo)準(zhǔn)縮寫(xiě)縮寫(xiě)品系縮寫(xiě) 品系129P129P3/JLC57L/J129S129S1/SvImJCBACaCBA/CaGnLeAHeA/HeJCBCBAAA/JC3C3H/HeJAKAKR/JC3FeC3HeB/FeJCByBALB/cByJD1DBA/1JCBALB/cJD2DBA/2JBC57BLNZBNZB/BlNJB6C5

22、7BL/6JNZWNZW/LacJB10C57BL/10JSJL or JSJL/JBRC57BR/cdJSWSWR/J第四十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月品系縮寫(xiě)C57這個(gè)縮寫(xiě)可意味著七、八個(gè)特征不同的品系（如C57BL及其亞系6個(gè)，C57BR/cdJ,C57L）。C57BL就包括有幾個(gè)特征不同的亞系（如C57BL/1，C57B/6J、C57BL/6N、C57BL/10J等）。只寫(xiě)CBA亦為不確切的書(shū)寫(xiě)法，因?yàn)樗灿腥舾蓚€(gè)特性不同的亞系，如CBA/J是有視網(wǎng)膜退變基因的，而CBA/ca則沒(méi)有這種基因，兩者對(duì)放射線的敏感性也不一樣，組織相容性也不同，至少有5個(gè)位點(diǎn)不同的； 第四十一

23、張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第四十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同源突變近交系：兩個(gè)近交系，除了在一個(gè)指明位點(diǎn)等位基因不同外，其他遺傳基因全部相同，簡(jiǎn)稱(chēng)同源突變系。同源突變系一般皆由近交系發(fā)生基因突變而形成。同源突變近交系 Coisogenic Inbred Strain第四十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同源突變近交系命名由發(fā)生突變的近交系名稱(chēng)后加突變基因符

24、號(hào)（用英文斜體印刷體）組成，二者之間以連接號(hào)分開(kāi)，如：BALB/cJ-nu。當(dāng)突變基因必須以雜合予形式保持時(shí)，用+號(hào)代表野生型基因，如：A/Fa-+/c.。第四十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Inbred miceGreat job!第四十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月小鼠基因工程第四十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月種植前小鼠胚胎發(fā)育FertilizationActivation of embryonic genomeCompactionE0.5E2.5E3.5E1.5第四十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月轉(zhuǎn)基因小鼠的制作0.5天受精卵DN

25、Arecover原核融合移植到假孕鼠輸卵管首建鼠 founder檢測(cè)表型第四十八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月轉(zhuǎn)基因小鼠制備時(shí)間表DNA純化1天原核注射2天小仔出生3周斷奶，編號(hào)，剪尾34周提尾巴gDNA2天Founder鑒定1天總計(jì)22.5月第四十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月ES細(xì)胞基因打靶Analyze offspringfor phenotypeelectroporateselectionanalyzecoloniestest forgermlinetransmissionmakechimerascrossheterozygotestest offspring

26、for chimerismimplantP12第五十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月嵌合鼠的制作BlastocystInjectionAggregationFlush embryosUterusE3.5OviductE2.5BlastocystMorulaRecover 1-2 hoursRemove zona pellucidaDarning needleaggregationculture overnightimplant into pseudopregnantsurrogate motherES cells第五十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月基因打靶小鼠制備時(shí)間表

27、索取BAC質(zhì)粒1月載體構(gòu)建2-3月細(xì)胞培養(yǎng)電轉(zhuǎn)篩選6-10周囊胚注射2周驗(yàn)證種質(zhì)細(xì)胞傳遞12-14周總計(jì)10月第五十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月轉(zhuǎn)基因動(dòng)物命名符號(hào)：一個(gè)轉(zhuǎn)基因符號(hào)由以下三部分組成，均以羅馬字體表示：C57BL/6J-TgN(CD8Ge)23Jwg轉(zhuǎn)基因方式TgN:非同源插入TgH:同源重組TgR:逆轉(zhuǎn)錄病毒載體感染的插入插入片段實(shí)驗(yàn)室指定序號(hào)實(shí)驗(yàn)室注冊(cè)代碼品系A(chǔ)n 匿名序列Ge 基因組Im 插入突變Nc 非編碼序列Rp 報(bào)告基因Sn 合成序列Et 增強(qiáng)子捕獲裝置Pt 啟動(dòng)子捕獲裝置XXX/YYY：fusion genesXXX,YYY：double transg

28、enes第五十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月打靶突變小鼠命名 129X1-Cftrtm1Uncthe first targeted mutation of the cystic fibrosis transmembrane regulator (Cftr) gene at 129X1produced at the University of North Carolina 129X1-En1tm1(Otx2)Wrstthe coding region of En1 was replaced by the Otx2 gene, originating from the W. Wurs

29、t laboratory第五十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月The 129 Strains Most ES cell lines derived from 129 strainsLots of genetic variability among 129 substrainsSimpson et al. 1997 Nature Genetics 16:19-27Threadgill et al. 1997 Mammalian Genome 8:390-393Important to match 129 strains in targeted mutagenesisDNA ES ce

30、ll linesCrossing chimera to generate pure 129 strainB6129PF2/J multiple coat colorssegregating for Aw, a, p and Tyrc-chChanged nomenclature from 129 substrains to different 129 parental strainsParental Steel TeratomaReference:/html/nomenclature/nomen_129.shtml第五十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月129小鼠的命名及ES細(xì)胞系的

31、起源AbbreviatesFull designationFormer designationES Cell Line129P1129P1/ReJ129/ReJ129P2129P2/OlaHsd129/OlaHsdE14TG2aHM-1(Hprtb-m1)129P3129P3/J129/J129X1129X1/SvJ129/SvJRW-4PJ1-5129S1129S1/Sv-+p+Tyr-cKitlSl-J/+129/Sv-+p+Tyr-c+MgfSl-J/+W9.5 (+Kitl-SlJ)CJ7 (+Kitl-SlJ)129S1129S1/SvImJ129S3/SvImJ (formerly

32、 129/SvImJ, 129/Sv-+p+Tyr-c+Mgf-Sl/J)R1 (+Kitl-SlJ)129S2129S2/SvPas129/SvPasD3129S4129S4/SvJae129/SvJaeJ1129S6129S6/SvEvTac129/SvEvTacTC1W4129S7129S7/SvEvBrd-Hprtb-m2129/SvEvBrd-Hprtb-m2AB1(+Hprt-bm2)AB2.1(+Hprt-bm2)129T1129T1/Sv-+p Tyrc-ch Ter/+Na129/Sv-+p Tyrc-ch Ter/+NaJAX Bulletn, No1, 1999 JAX

33、Notes, No 481, 2001第五十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Nature Genet. 16, 19-27第五十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月轉(zhuǎn)基因鼠/KO鼠的回交N10F20第五十八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第五十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同源導(dǎo)入近交系（同類(lèi)近交系） Congenic Inbred Strain通過(guò)雜交-互

34、交（cross-intercross）或回交（backcross）等方式將一個(gè)基因?qū)氲浇幌抵?，由此形成的一個(gè)新的近交系與原來(lái)的近交系只是在一個(gè)很小的染色體片段上的基因不同，稱(chēng)為同源導(dǎo)入近交系（同類(lèi)近交系），簡(jiǎn)稱(chēng)同源導(dǎo)入系（同類(lèi)系）。第六十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同源導(dǎo)入近交系的命名同源導(dǎo)入系名稱(chēng)由以下三部分組成：a) 接受導(dǎo)入基因的近交系名稱(chēng)；b) 提供導(dǎo)入基因的近交系的縮寫(xiě)名稱(chēng)，并與a項(xiàng)之間用英文句號(hào)分開(kāi)；c) 導(dǎo)入基因的符號(hào)（用英文斜體），與b 項(xiàng)之間以連字符分開(kāi)。例如：B10.129-H-12b 表示該同源導(dǎo)入近交系的遺傳背景為C57BL/10sn(=B10)，導(dǎo)入

35、B10的基因?yàn)镠-12b，基因提供者為129近交系。如果供體品系非近交系或是混合的或是未知的需要加Cg符號(hào).如B6.Cg-Tcrbtm1Mom第六十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第六十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月混合近交系Mixed Inbred Strains來(lái)自于2個(gè)親代品系(其中1個(gè)可以是ES細(xì)胞系),還未達(dá)到近交系狀態(tài)(即未F 20).命名:兩個(gè)品系的大寫(xiě)縮寫(xiě)之間

36、用分號(hào)(;)隔開(kāi)B6;129P2-Tcrbtm1MomA mixed strain derived from C57BL/6J and a 129 ES cell line carrying a targeted knockout of the Tcrb gene第六十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月混合近交系Mixed Inbred Strains來(lái)自于2個(gè)以上親代品系(其中1個(gè)可以是ES細(xì)胞系)或背景未知,還未達(dá)到近交系狀態(tài)(即未F 20).命名:STOCK符號(hào)后空一格,加上突變的基因名稱(chēng)或染色體的異常標(biāo)記STOCK Rb(16.17)5Bnr 3uhAn strain of

37、unknown or complex background carrying the Robertsonian translocation Rb(16.17)5BnrSTOCK Hdhtm2MemAn strain of unknown or complex background carrying Hdh targeted mutation第六十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月MARC現(xiàn)有品系舉例第六十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplast

38、ic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第六十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月重組近交系（Recombinant Inbred Strain）和重組同類(lèi)系（Recombinant Congenic Strain）a) 重組近交系（RI）：由兩個(gè)近交系雜交后，經(jīng)連續(xù)20 代以上兄妹交配育成的近交系。b) 重組同類(lèi)系（RC）：由兩個(gè)近交系雜交后，子代與兩個(gè)親代近交系中的一個(gè)近交系進(jìn)行數(shù)次回次（通常回交2 次），再經(jīng)無(wú)對(duì)特殊基因選擇的近親交配而育成的近交系。重組近交系（RI） 命名：由BALB/c與C57BL兩個(gè)近交系雜交育成的一組重組近交系，分別命名為CXB1、CXB

39、2由兩個(gè)親代近交系的縮寫(xiě)的縮寫(xiě)名稱(chēng)中間加小寫(xiě)英文字母c命名，用其中做回交的親代近交系（稱(chēng)受體近交系）在前，供體近交系在后。由相同雙親育成的一組重組同類(lèi)系阿拉拍數(shù)字予以區(qū)分。如CcS1，表示由以BALB/c(C)為親代受體近親系，以STS（S）品系為供體近交系，經(jīng)2 代回交育成的編號(hào)為1的重組同類(lèi)系。第六十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第六十八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月同基因型不同基因型近交系 亞系F1雜合子同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系 混合近交系重組近交系/重組同類(lèi)系Consomic/ Conplastic strain遠(yuǎn)交系/封閉群根據(jù)遺傳學(xué)分類(lèi)小鼠品系分類(lèi)第六

40、十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月定義:通過(guò)不斷的回交將一整條染色體替換到一個(gè)近交品系里,又叫染色體替換品系(chromosome substitution strains)命名:HOST STRAIN-Chr #DONOR STRAINConsomic StrainsC56BL/6J-Chr 19AA strain Chromosome 19 has been backcrossed onto C57BL/6JIn JAX,there are 20 C57BL/6 consomic strains that been backcrossed for 20 individual c

41、hromosome from A strains第七十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第七十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Conplastic Strains定義:一個(gè)品系的核基因組與另一個(gè)品系的胞漿相配合,在不斷的回交過(guò)程中,線粒體只來(lái)源于雌鼠品系命名:NUCLEAR GENOME-mt CYTOPLASMIC GENOMEC57BL/6J-mt BALB/cA strain with the nuclear genome of C57BL/6J and the cytoplasmic (mitochondrial) genome of BALB/c第七十二張，PPT

42、共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Rules for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles, and Mutations in Mouse and Rat For mouse: International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for Mice/mgihome/nomen/gene.shtml#genenom For rat: Rat Genome and Nomenclature Committee/nomen_rules.html 第七十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)

43、作于2022年6月Mouse Genome Informatics (MGI)/The Jackson Laboratory/第七十四張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月遺傳監(jiān)測(cè)第七十五張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月遺傳監(jiān)測(cè)傳統(tǒng)方法生化同功酶分析主要組織相容復(fù)合體 (MHC)serology for MHC antigenstail allograft transplants下頜骨測(cè)量分子方法 (“DNA fingerprinting”)simple sequence length polymorphisms (SSLP)microsatellite DNArestricti

44、on fragment length polymorphisms (RFLP) minisatellite DNAPCR genotyping for specific gene mutations第七十六張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月PCR技術(shù)的原理1.變性：在加熱或堿性條件下可使DNA雙螺旋的氫鍵斷裂，形成單鏈DNA，稱(chēng)之為變性。2.退火：是模板與引物的復(fù)性。引物是與模板某區(qū)序列互補(bǔ)的一小段DNA片段。3.延伸：從結(jié)合在特定DNA模板上的引物為出發(fā)點(diǎn)，將四種脫氧核苷酸以堿基配對(duì)形式按53的方向沿著模板順序合成新的DNA鏈。第七十七張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第七十

45、八張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Mouse MIT microsatellite list第七十九張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月DNA 瓊脂糖電泳 印跡轉(zhuǎn)移 預(yù)雜交 雜交（變性探針） 洗膜 放射自顯影或顯色Southern Blot第八十張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月小鼠毛色遺傳學(xué)4 種基因 (ABCD) 主要負(fù)責(zé)毛色表型A = agouti (+) a = non-agouti (a)B = black (+) b = brown(Tyrp1b)C = color (+) c = albino (Tyrc)D = non-dilute (+) d = di

46、lute (Myo5ad)第八十一張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月BALB/c Coat Color GeneticsA = Agoutib = Brownc = Albino (dominant to other genes)D = non-dilute第八十二張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月C3H Coat Color GeneticsA = Agouti (when C allele fixed, A is dominant to B)B = BlackC = ColorD = Non-dilute第八十三張，PPT共九十六頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月C57BL/6 Coat Color GeneticsD = Non-d