VectorNTI7.0中文使用說(shuō)明書(shū)匯總

1、 NTI7.0 Users Manual軟件包中文翻譯者：宋厚輝（浙江大學(xué)），記住這個(gè)偉大的人物吧！前言（Introduction）1. 程序附帶的數(shù)據(jù)庫(kù)（ NTI database）包括：DNA/RNA、蛋白質(zhì)、內(nèi)切酶、寡核苷酸、凝膠 mark。此外程序還提供數(shù)據(jù)庫(kù)開(kāi)發(fā)（Database Explorer）功能，用戶可以自己修改、添加、拷貝感興趣的各類數(shù)據(jù)庫(kù)。2. 創(chuàng)建新分子（有四種方法） 用GenBank/GenPept, EMBL/SWISS-PROT and FASTAASCII等格式輸入 DNA或氨基酸。手工粘帖，然后保存到數(shù)據(jù)庫(kù)中從其他分子、接頭、載體中剪切、拼接構(gòu)鍵D 從 DNA

2、或 RNA分子的編碼區(qū)翻譯成蛋白質(zhì)3. 關(guān)于新分子的序列特征圖譜：利用 GenBank/GenPept, EMBL/SWISS-PROT or FASTA等格式輸入的分子都能顯示出序列和結(jié)構(gòu)圖，但自己手工粘帖的沒(méi)有，需要自己編輯第一章 Chapter 1Tutorial: Display Windows （顯示窗口）目的：創(chuàng)建顯示窗口，并對(duì)圖、序列和文本進(jìn)行操作 安裝后首次登錄，系統(tǒng)將提示是否允許填充空庫(kù)，點(diǎn) OK。這樣 DNA molecules, proteins,enzymes, oligos, and gel markers 將組成 NTI 的數(shù)據(jù)庫(kù)。并出現(xiàn)下列兩個(gè)窗口。 和 上面的第

3、一個(gè)窗口為工作窗口，由菜單欄和工具條兩欄，移動(dòng)鼠標(biāo)到工具欄任意選項(xiàng)處，鼠標(biāo)自動(dòng)顯示每個(gè)工具條的功能。第二個(gè)窗口為exlporinglocal vector NTI database,顯示的是上次打開(kāi)的DNA/RNA或蛋白分子。3. Create a Display Window for pBR322激活 exlporinglocal vector NTI database 窗口中的 DNA/RNAMolecules(MAIN) 數(shù)據(jù)庫(kù)，找到 pBR322分子并雙擊打開(kāi)。顯示如下窗口： 上面的窗口由文本區(qū)（對(duì)分子信息的文字描述，雙擊文件夾可以看到）、圖形區(qū)（標(biāo)住限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)等）和序列區(qū)（全序

4、列及酶切位點(diǎn)）三個(gè)部分組成。 pane） 對(duì) 、， 輸入 100bp1000bp, OK. 將 5端 在 3 5 ， （Setup） 個(gè) Add, OK OK發(fā)現(xiàn)限制酶是大大的多了，不過(guò)美中不足的是序列顯示的是兩條鏈（正鏈和先選中全序列（） 對(duì) TC(R) 7 將 ）按鈕，點(diǎn)它。完了， 點(diǎn)（Arrangement TCR 23： 12.為 和 shift+ Copy. , 255 aa27897.66 35.845 pMoles11250Molar Extinction coefficient1 A280 corr. toA280 of 1 mg/mlIsoelectric PointChar

5、ge at pH 72.48 mg/ml0.40 AU8.133.72% by frequency32.559.8011.3735.2926.273.029.334.516.348.144.850.962.835.858.481.384.886.385.408.587.126.243.970.631.129.3911.740.004.319.804.315.496.278.240.782.755.108.241.184.717.064.716.278.636.674.310.390.789.0210.200.0023260X Xxx 為 分子圖形上的各種特征顯示的十分緊湊，大有眼花繚亂的感覺(jué)，

6、為了 feature OK第二章：Chapter 2Tutorial: Molecule Operations 分子操作 的 進(jìn) NTI PBR322 對(duì) 1st plasmid 的 pBR322* pBR322 OK 的 。 edit OK。 和 new bp 和 2 OK， 將 bp Position 個(gè) T editnew 個(gè) T OK ， 個(gè) 到 （ 3 3 5 選 , OK P2P 點(diǎn) OK（ ， 的 OK， 的 Molecule ) 10bp OK 76bp有 （ 第三章：Chapter 3Tutorial: Working With A Molecules Graphical Representation （對(duì)分子圖形的展示進(jìn)行操作） ）在 , 后 。 或讓 。 （ （ blue，點(diǎn) OK （ 6 兩種編輯圖片的方式， （picture ) ) 5 5 將 點(diǎn) OK= 和 。 TC(R) 點(diǎn) 。 （ edit 將 asfile, pBR322.gb 點(diǎn) 第四章 Chapter 4Vector NTI 工具和 internet 連接目的：將本地?cái)?shù)據(jù)發(fā)送到 internet上，并進(jìn)行 BLAST 搜索, 序列對(duì)排、比較和分析等 PBR322 Server 點(diǎn) 點(diǎn) done用戶可以通過(guò)拖動(dòng)滾動(dòng)條查看結(jié)果（很多的），找到 gi|416343|gb|U035