生物信息學復習資料全

歡迎下載內容僅供參考一、名詞解釋(31個)信息科學。狹義：應用信息科學的理論、方法和技術，管理、分析和利用生物分子數據。二級數據庫實驗數據和理論分析的根底上針對特定的應用目標而建立的。序列的功能區(qū)域，也可用于研究一組蛋白質之間的進化關系。是研究物種進化和系統(tǒng)分類的一種方法，其常用一種類似樹稱為系統(tǒng)發(fā)育樹。是進化保守的并且在其他物種中具有直系同源性。指的是不同物種之間的同源性，例如蛋白質的同源性，DNA序列的同源性?！瞾碜园俣取矲ASTADNA苷酸或氨基酸字符串。開放閱讀框〔ORF〕：密碼子的閱讀框可編碼完整的多肽鏈，其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。〔來自百度〕域，折疊得較為嚴密，各行其功能，稱為結構域。位并進展罰分，以控制空位插入的合理性cDNAcDNA3’5GeneOntology協(xié)會：HMM隱馬爾可夫模型：將核苷酸序列看成一個隨機序列，DNAMarkov的歸類整理和注釋DNA質的同一氨基酸位置的一樣的氨基酸成員,可用百分比表示。占的比例。是核酸序列到蛋白庫中的一種查詢。先將核酸序列翻譯成蛋白序列是蛋白序列到核酸庫中的一種查詢。與BLASTXTblastx：是核酸序列到核酸庫中的一種查詢。此種查詢將庫中的核酸序列和所查的Tblastx：是核酸序列到核酸庫中的一種查詢。此種查詢將庫中的核酸序列和所查的6條可能的蛋白序列產生36種比對陣列?！瞾碜园俣取矺EGG：者把基因與表達信息作為一個整體網絡進展研究。ChIP-Seq：ChIPDNA分子生物網絡：PPI號轉導和遺傳網絡的角度研究這種相關性。高通量測序：一次性對幾百萬到十億條DNA的分析，所以又被稱為深度測序。擬。NCBInr：GT-AGEntrez二、選擇題〔30個〕mRNAAA.dbESTB.PDBC.OMIMD.HTGSA.NDB數據庫、C.GenBankD.SWISS-PROTPIRA.B.mRNAC.D據庫以下哪一項不屬于啟動子研究圍？〔〕A.CpG島預測、BC.糖基化修飾、D.甲基化檢測HTGS的含義是〔C〕。A.表達序列標簽、B.序列標簽位點、C序列、D.人工合成序列STS的含義是〔〕。A.表達序列標簽、B.序列標簽位點、C列、D.人工合成序列HGPCA.B.C.組計劃、D.水稻基因組計劃8、以下中屬于一級蛋白質結構數據庫的是：〔〕A.EMBL、B.DDBJ、C.PDB、D.SWISS-PROT9．BLAST教案所程序中，哪個方法是不存在的？〔〕A.BLASTP、B.BLASTN、C.BLASTX、D.BLASTQ10A.基因進化、B.基因數目、C.基因重復序列、D.基因組復制11、以下哪個選項不是微陣列實驗設計的容？〔〕A.貝葉斯網絡法、B.對照組的選擇、C.重復樣本的使用、D.隨機化原那么12、構建序列進化樹的一般步驟不包括.〔〕A.建立DNA文庫、B.建立數據模型、C.建立取代模型、D.建立進化樹13GenbankWebA.BankIt、B.Sequin、C.VersionD.Matrix14A.PIR、B.Uniprot、C.SWISS-PROT、D.OMIM15A.Genbank、B.GenPept、C.EMBL、D.DDBJ16NCBINCBIA.Retrieve、B.SRS、C.Entrez、D.PIR17、EntrezA.500B.1000C.5000D.1000018A.nnpredictB.PredictProteinC.SingalDD.SingalP19、Bioinformatics的含義是〔〕。A. 生物信息學、B. 基因組學、C. 白質組學、D. 表觀遺傳學20、目前應用于基因芯片表達數據統(tǒng)計分析的主要方法是〔〕。A.卡方檢驗、B.相關分析、C. 聚類分析、D. 正態(tài)性分布檢驗21NCBIA.UniGeneB.UniProC.UniRef、D. URF22根本局部比對搜素工具〔A. MegaB. ClustalWC. BLASTD. GCG23、根據研究發(fā)現，人類基因組中真正編碼蛋白質的區(qū)域僅占DNA序列的〔〕。A.1-2%、B.3-5%、C.5-10%、D.10-20%24、被譽為“生物信息學之父〞的科學家是〔〕。A.Dulbecco、B.Sanger、吳瑞、D.25、多序列比對工具是〔〕。A. BLAST、B. ClustalW、C. Mega、D. GCG26B.C.D.色線條表示27、HTGS的含義是〔〕。A.表達序列標簽、B.序列標簽位點、C.高通量基因組序列、D.人工合成序列28、accessionnumberA.登錄號、B.算法、C.比對、D.類推29EMBLnetA.Query、B.SRS、C.PDB、D.PIR30、數據挖掘的四個步驟不包括以下哪個.〔〕A.數據選擇、B.數據轉換、C.數據記錄、D.結果分析三、是非題〔16個〕1、生物學就是實驗科學，所有的研究結論從實驗中來，于實驗中得到驗證。2、比擬是科學研究中最常見的方法，在生物信息學研究中，比對是最常用和最經典的研究手段。3、兩個蛋白質序列相似性超過30%就是同源蛋白。4、蛋白質序列相似性指一級序列中氨基酸殘基一樣。5、蛋白質序列相似性指氨基酸殘基具有相似特性.側鏈基團大小電荷性、疏水性等一樣。6、核酸序列相似性指序列中一樣堿基所占的比例。7DNA38DNA69、相似性是指一種很直接的數量關系，無需實驗驗證。、相似性是指一種很直接的數量關系，也需實驗驗證。、不同種屬間的同源序列稱為直向同源序列。、不同種屬間的同源序列稱為共生同源序列。13、所謂局部比對，即分析兩個序列是否有局部序列的相似。14、所謂整體比對，即找出兩個序列全長的最優(yōu)比對結果。15、PSI-BLASTBLAST16、PHI-BLASTBLAST四、問答題〔15個〕1、生物信息學的開展經歷了哪幾個階段2、序列的相似性與同源性有什么區(qū)別與聯(lián)系？3、BLASTblastn、blastp、blastx、tblastntblastx什么？4、生物信息學的主要研究領域。5、初級數據庫、二級數據庫的概念，說出幾個數據并說明包含什么數據。6、簡述高通量測序的應用圍7、簡述系統(tǒng)發(fā)生分析步驟8、說出至少一種蛋白質結構數據庫和一種可視化工具。9、Entrez集成于哪個數據庫平臺？主要功能是什么？在應用中可以訪問哪些子數據庫〔請列舉5個以上〕？10、試述SWISS-PROT中的數據來源11、分子生物網絡可以分成哪幾類？簡單介紹。12、常用的蛋白質互作數據庫有哪些？13、試述蛋白質三維結構預測的三類方法14、國際上權威的核酸序列數據庫有那些？15、生物分子數據類型