課件-53蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)_第1頁
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蛋白質(zhì)的三有原子的空間排列。第一個(gè)蛋白質(zhì)的三結(jié)構(gòu)于1958年用X-射線衍射法（X-rayCrystallography）測(cè)定。這種方法目前仍然是獲取蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的主要方法。PDB數(shù)據(jù)庫磁法（NuclearMagneticResonance,NMR。無法結(jié)晶的蛋白質(zhì)，可以利用核磁法在液體環(huán)境中進(jìn)行結(jié)構(gòu)測(cè)定。但是核磁法只能用于質(zhì)量小于70千的分子，大約對(duì)Mcoscoy1PDB如圖1所示，從PDB首頁的搜索條里，可以通過搜索PDBID、分子名稱、作者等db_earch.fata輸入序列相似的蛋白質(zhì)。點(diǎn)擊“108PDBEntities”。2.高級(jí)搜索工具BLASTdUTPasePDBID2HQU（圖。這個(gè)結(jié)構(gòu)所對(duì)應(yīng)的序列與輸入序列中黃色片段之間的一致度是100%。輸入的序列中藍(lán)結(jié)構(gòu)里不會(huì)有這一段。此外，成熟肽段N端的一小部分，由于實(shí)驗(yàn)技術(shù)等原因，也沒有被解析出來，這在PDB結(jié)構(gòu)中是很常見的。有時(shí)，在序列中間也會(huì)有未解析出的斷口。甚至復(fù)習(xí)：PDB文件是通過記錄蛋白質(zhì)中每一個(gè)氨基酸上的每一個(gè)原子的三維坐標(biāo)來們連上化學(xué)鍵

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