宏基因組二代測(cè)序技術(shù)在新生兒感染性疾病中的臨床應(yīng)用專家共識(shí)（2022年）

【標(biāo)準(zhǔn)·方案·指南】宏基因組二代測(cè)序技術(shù)在新生兒感染性疾病中的臨床應(yīng)用專家共識(shí)摘要近年來(lái)基于高通量測(cè)序平臺(tái)的宏基因組二代測(cè)序（mNGS）技術(shù)在新生兒感染性疾病領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。為了更加規(guī)范mNGS技術(shù)在新生兒重癥監(jiān)護(hù)病房的應(yīng)用，中華醫(yī)學(xué)會(huì)兒科學(xué)分會(huì)新生兒學(xué)組和中華兒科雜志編輯委員會(huì)組織專家以國(guó)內(nèi)外循證醫(yī)學(xué)證據(jù)和最新進(jìn)展為基礎(chǔ)，從mNGS技術(shù)的臨床適應(yīng)證、標(biāo)本采集與轉(zhuǎn)運(yùn)、報(bào)告解讀等方面給出建議。宏基因組二代測(cè)序（metagenomicsnext-generationsequencing，mNGS）平臺(tái)是基于高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)各種臨床樣本中的全部生物基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)室診斷技術(shù)，近年來(lái)已逐漸被認(rèn)識(shí)并應(yīng)用于各種感染性疾病的診斷。mNGS可以同時(shí)測(cè)定某一臨床樣本中數(shù)千萬(wàn)條核酸序列，然后通過(guò)強(qiáng)大的生物信息學(xué)平臺(tái)將測(cè)序數(shù)據(jù)與病原體數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，獲得病原體的分類信息，以鑒定可能的致病病原體。此外，mNGS還可以直接從臨床樣本分析耐藥基因，輔助臨床診斷以及分析人類宿主反應(yīng)（轉(zhuǎn)錄組）數(shù)據(jù)以預(yù)測(cè)感染原因和評(píng)估疾病風(fēng)險(xiǎn)。mNGS技術(shù)的成功開(kāi)展對(duì)部分感染性疾病患者尤其是免疫抑制人群及重癥感染人群的病原學(xué)診斷起到了突破性作用。長(zhǎng)期以來(lái)新生兒感染一直是兒科醫(yī)生面臨的重大挑戰(zhàn)，新生兒的免疫系統(tǒng)不成熟，易感因素多，在接觸病原體時(shí)防御功能較為脆弱，導(dǎo)致相對(duì)高的發(fā)病率和病死率。由于新生兒感染的臨床表現(xiàn)往往不典型，病情較為隱匿、進(jìn)展迅速，快速明確病原體對(duì)疾病的診治及轉(zhuǎn)歸十分重要?；趍NGS具有無(wú)偏倚性、覆蓋廣、敏感性高，用時(shí)相對(duì)較短等優(yōu)點(diǎn)，尤其可在混合感染或病毒感染方面展現(xiàn)其優(yōu)勢(shì)，因此mNGS在新生兒感染性疾病中具有廣闊的應(yīng)用前景，但現(xiàn)階段在新生兒重癥監(jiān)護(hù)病房（neonatalintensivecareunit，NICU）實(shí)踐中仍存在一定的局限性及問(wèn)題：成本相對(duì)昂貴；對(duì)新生兒的臨床適應(yīng)證認(rèn)識(shí)不足，送檢存在較大的盲目性和隨意性；樣本類型的選擇以及對(duì)樣本送檢的流程及注意事項(xiàng)不清楚；實(shí)驗(yàn)檢測(cè)流程操作復(fù)雜，缺乏統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)；測(cè)序結(jié)果復(fù)雜，可能出現(xiàn)假陽(yáng)性結(jié)果誤導(dǎo)臨床等。以上問(wèn)題均限制了mNGS在NICU中的臨床應(yīng)用和推廣。為了提高mNGS的診斷質(zhì)量，規(guī)范其在新生兒感染性疾病領(lǐng)域的臨床應(yīng)用，中華醫(yī)學(xué)會(huì)兒科學(xué)分會(huì)新生兒學(xué)組和中華兒科雜志編輯委員會(huì)成立專家組，廣泛征求意見(jiàn)和建議，基于國(guó)內(nèi)外臨床證據(jù)，結(jié)合臨床實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，于2021年7—12月經(jīng)過(guò)專家反復(fù)討論，制定了“宏基因組二代測(cè)序技術(shù)在新生兒感染性疾病中的臨床應(yīng)用專家共識(shí)”（簡(jiǎn)稱本共識(shí)）。本共識(shí)主要目標(biāo)讀者為兒科尤其是新生兒科專業(yè)醫(yī)生。一、mNGS在NICU感染性疾病中的應(yīng)用共識(shí)1：患兒具有急危重癥表現(xiàn)，不除外感染，或有繼發(fā)或并發(fā)危及生命的嚴(yán)重感染，需要盡快明確病原體，建議常規(guī)檢測(cè)的同時(shí)送檢mNGS。急危重癥指多器官功能衰竭，由新生兒敗血癥、腦膜炎、重癥肺炎、腹腔感染等引起者應(yīng)及時(shí)明確致病微生物，這對(duì)于制定有效的治療方案具有重要作用。但由于其致病微生物復(fù)雜，常規(guī)方法易遺漏部分病原微生物，因此建議常規(guī)檢測(cè)的同時(shí)送檢mNGS。多項(xiàng)研究表明mNGS對(duì)敗血癥的檢測(cè)靈敏度遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)培養(yǎng)。亦有研究通過(guò)檢測(cè)敗血癥患者血漿樣本的細(xì)胞游離DNA，表明基于mNGS的檢測(cè)結(jié)果有53%的患者治療方案進(jìn)行了調(diào)整。共識(shí)2：高度懷疑患兒存在新生兒血流感染甚至敗血癥時(shí)，若經(jīng)驗(yàn)治療3d效果不佳且常規(guī)微生物學(xué)檢查送檢陰性，建議調(diào)整經(jīng)驗(yàn)抗微生物治療方案的同時(shí)采集血液樣本送檢mNGS。推薦DNA測(cè)序作為血流感染的首選檢測(cè)方法，在高度懷疑RNA病毒感染的情況下可同時(shí)進(jìn)行RNA測(cè)序。Yan等的回顧性研究是應(yīng)用mNGS檢測(cè)兒科重癥監(jiān)護(hù)病房中疑似敗血癥患兒的血液微生物組，在血液樣本中的游離循環(huán)DNA檢測(cè)出了潛在的致病微生物。由于大部分血流感染的病原體（包括細(xì)菌、真菌、寄生蟲(chóng)、DNA病毒）均以DNA作為遺傳物質(zhì)，如果根據(jù)適應(yīng)證送檢mNGS，推薦DNA測(cè)序作為血流感染的首選檢測(cè)方法。但也應(yīng)根據(jù)臨床流行病學(xué)，如發(fā)病季節(jié)、母親疾病史、生后時(shí)間及臨床表現(xiàn)共同判斷，選擇進(jìn)行DNA或RNA測(cè)序。共識(shí)3：對(duì)于疑似中樞神經(jīng)系統(tǒng)（centralnervoussystem，CNS）感染的患兒，條件允許的情況下建議留取常規(guī)、生化及微生物檢查所需腦脊液的同時(shí)留取mNGS所需腦脊液，若腦脊液檢查結(jié)果提示常規(guī)和（或）生化指標(biāo)異常且常規(guī)微生物檢測(cè)陰性且經(jīng)驗(yàn)性抗感染治療3d無(wú)效，建議立即送檢mNGS。mNGS應(yīng)用于新生兒CNS感染方面的研究較少，多為病例報(bào)告，揭示了mNGS在疑難病例中的應(yīng)用價(jià)值；以mNGS為基礎(chǔ)檢測(cè)CNS感染病原以病毒感染多見(jiàn)，細(xì)菌檢測(cè)的研究較少，同時(shí)經(jīng)驗(yàn)性抗菌藥物在NICU中應(yīng)用較為廣泛，因此mNGS在CNS感染中的應(yīng)用更傾向于病毒、非典型病原體或已應(yīng)用抗菌藥物的細(xì)菌感染病例。Guo等應(yīng)用mNGS技術(shù)對(duì)北京兒童醫(yī)院99例細(xì)菌性腦膜炎患兒的腦脊液標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)mNGS將病原體檢測(cè)陽(yáng)性率提高了13.1%；Li等在22.1%的疑似CNS感染病例中發(fā)現(xiàn)了潛在的致病病原體，而這些病例多是常規(guī)微生物檢測(cè)方法陰性情況下才送檢mNGS的。此外，有報(bào)道稱通過(guò)mNGS檢測(cè)細(xì)菌性腦膜炎患兒的腦脊液和血液標(biāo)本，分析其不同的微生物組特征有助于臨床分析及診療過(guò)程。Ge等提出對(duì)于疑似CNS感染的患兒，mNGS聯(lián)合全外顯子測(cè)序可顯著提高病因診斷率。考慮到腦脊液常規(guī)微生物檢查的陽(yáng)性率較其他類型樣本低且腦脊液樣本所含人核酸含量較低，因此腦脊液較適合開(kāi)展mNGS檢測(cè)。在測(cè)序方法的選擇上，若臨床排除病毒感染的可能，優(yōu)先進(jìn)行DNA測(cè)序。當(dāng)腦脊液常規(guī)、生化無(wú)明顯異常且腦脊液微生物學(xué)檢查陰性，臨床上仍高度懷疑CNS感染，或臨床表現(xiàn)復(fù)雜、無(wú)特定懷疑方向送檢mNGS時(shí)，推薦對(duì)腦脊液樣本中的DNA和RNA同時(shí)進(jìn)行測(cè)序。共識(shí)4：對(duì)于疑似呼吸道感染的重癥患兒，常規(guī)微生物檢查（培養(yǎng)或核酸檢測(cè)）陰性且治療3d無(wú)效，可送檢mNGS，應(yīng)同時(shí)進(jìn)行DNA及RNA測(cè)序。樣本類型優(yōu)先選擇肺泡灌洗液，其次考慮氣管插管下獲得痰液及鼻咽拭子樣本。mNGS可對(duì)包括呼吸道定植菌群和引起感染的病原菌同時(shí)進(jìn)行檢測(cè)，同時(shí)對(duì)于多重感染的鑒定具有極大優(yōu)勢(shì)。已有多篇報(bào)道應(yīng)用mNGS技術(shù)診斷兒童呼吸道感染性疾病的病原體，mNGS技術(shù)在傳統(tǒng)病原微生物檢測(cè)（包括培養(yǎng)、PCR等）陰性及免疫功能抑制的患兒中應(yīng)用價(jià)值更高。新生兒肺部存在的定植微生物參與其出生后的免疫系統(tǒng)發(fā)育和成熟，因此關(guān)注呼吸道微生物的構(gòu)成對(duì)于評(píng)估患兒病情也很重要。共識(shí)5：疑似新發(fā)病原體、臨床上提示可能有一定的傳染性，或者疑似特殊病原體或罕見(jiàn)病原感染，常規(guī)微生物檢測(cè)方法陰性，建議盡快完善mNGS。mNGS檢測(cè)無(wú)需提前設(shè)定目標(biāo)病原體，其直接對(duì)樣本中所有核酸進(jìn)行測(cè)序，具有檢測(cè)新發(fā)病原和罕見(jiàn)病原的能力。新發(fā)病原體指引起人群中出現(xiàn)某種新的臨床表型的病原，或過(guò)去存在但其引起的發(fā)病率或地理分布明顯增加的病原。但對(duì)于新發(fā)病原，由于缺乏參考基因組，完整的鑒定種屬以及和已知種屬的進(jìn)化關(guān)系，需要較高的測(cè)序序列數(shù)，建議優(yōu)先采集病灶標(biāo)本或進(jìn)行富集。共識(shí)6：疑似存在混合感染，常規(guī)微生物檢查結(jié)果不能解釋臨床表現(xiàn)的全貌或抗感染治療的反應(yīng)，經(jīng)驗(yàn)性治療3d無(wú)效時(shí)，建議進(jìn)一步完善常規(guī)檢測(cè)的基礎(chǔ)上，開(kāi)展mNGS。相比于常規(guī)方法有限的檢測(cè)范圍，mNGS的原理使得其具有更廣泛的檢測(cè)范圍，理論上可以檢測(cè)任意病原微生物。這一特點(diǎn)使得其更易檢出混合感染。Wang等的研究表明對(duì)于肺部混合感染的檢測(cè)，mNGS的靈敏度達(dá)到97.2%，而常規(guī)方法僅為13.9%。共識(shí)7：出現(xiàn)某種感染性疾病的聚集性發(fā)病或者疑似院內(nèi)感染暴發(fā)，在常規(guī)快速檢測(cè)不能明確病原時(shí)，建議開(kāi)展mNGS。mNGS能夠通過(guò)重構(gòu)病原微生物間的親緣關(guān)系，并結(jié)合流行病學(xué)信息，鑒定傳播簇以及傳播鏈，具有鑒定、監(jiān)控傳染性疾病的暴發(fā)和院內(nèi)感染的能力。Casto等通過(guò)mNGS實(shí)現(xiàn)了對(duì)兒童諾如病毒院內(nèi)感染暴發(fā)的實(shí)時(shí)監(jiān)控，在13例患兒中鑒定到3個(gè)不同的傳播簇，并發(fā)現(xiàn)4例社區(qū)傳播的病毒毒株和院內(nèi)感染病毒毒株成簇，提示兩者之間具有潛在的傳播關(guān)系。Xu等利用mNGS對(duì)25例呼吸道樣本的測(cè)序，發(fā)現(xiàn)8例偏肺病毒毒株均來(lái)源于血液科病房，提示存在院內(nèi)傳播。由于病毒的基因組較小，對(duì)全基因組范圍遺傳多樣性的刻畫所需的測(cè)序數(shù)據(jù)量較小，因此利用mNGS對(duì)傳染性疾病傳播的推斷主要集中于病毒。亦有研究利用mNGS對(duì)糞便樣本進(jìn)行測(cè)序，通過(guò)將測(cè)序序列和地區(qū)流行的肺炎克雷伯成簇代表性菌株進(jìn)行比對(duì)的方式，鑒定可能的傳播來(lái)源。共識(shí)8：疑似局部感染，如眼部（角膜炎或潰瘍、眼內(nèi)炎、急性視網(wǎng)膜壞死等）、鼻部、耳部或局部蜂窩織炎等，在常規(guī)微生物檢測(cè)未能明確病原情況下，可開(kāi)展mNGS。共識(shí)9：由于各種原因?qū)е碌男厍环e液及腹腔積液，在送檢常規(guī)生化及培養(yǎng)的同時(shí)留取胸、腹腔積液樣本，若常規(guī)、培養(yǎng)陰性或經(jīng)驗(yàn)性抗感染治療3d無(wú)效，仍懷疑感染所致者，建議立即送檢mNGS。共識(shí)10：對(duì)于mNGS檢測(cè)陰性但臨床高度懷疑感染的患兒，必要時(shí)再次取樣復(fù)查mNGS。共識(shí)11：對(duì)常規(guī)微生物學(xué)檢查容易明確病原體且經(jīng)驗(yàn)治療通常有效的感染，不建議常規(guī)進(jìn)行mNGS檢測(cè)。不建議應(yīng)用mNGS評(píng)估抗感染治療效果。圖1為新生兒感染性疾病送檢mNGS的流程圖，以便臨床醫(yī)生快速查閱。二、標(biāo)本采集和轉(zhuǎn)運(yùn)臨床上采集的樣本類型主要包括靜脈血、腦脊液、痰液、肺泡灌洗液、胸腔積液、腹腔積液、組織、咽拭子、局灶穿刺物等。不同類型的樣本采集需遵循以下原則。1.從無(wú)菌部位（如靜脈血、腦脊液、胸腔積液、腹腔積液等）采集標(biāo)本時(shí)，應(yīng)嚴(yán)格無(wú)菌操作，采集前對(duì)局部及周圍皮膚的消毒，消毒液與皮膚需要作用一定時(shí)間，待其干燥后采樣。采集后的標(biāo)本須用無(wú)菌容器盛裝。血液標(biāo)本建議取1~3ml（不同實(shí)驗(yàn)室要求不同，最低限為0.5ml），采用專用采血管，即游離DNA樣本保存管，其內(nèi)由乙二胺四乙酸（ethylenediaminetetraaceticacid，EDTA）和保護(hù)劑組成，可抑制血漿中核酸酶及有核細(xì)胞中DNA的釋放，采血后上下顛倒混勻5~10次；腦脊液樣本常規(guī)建議應(yīng)為1ml以上（新生兒因腦脊液樣本較難獲得，最低樣本量為600μl），采用專用采血管或無(wú)菌凍存管；胸、腹腔積液需富集后提取核酸，至少采集5ml，避免經(jīng)引流管采集。若增加RNA測(cè)序時(shí)，需提前聯(lián)系實(shí)驗(yàn)室提供添加RNA穩(wěn)定劑的采血管或無(wú)菌凍存管，在采集樣本時(shí)須同時(shí)采2管；若樣本同時(shí)進(jìn)行DNA及RNA測(cè)序，1管樣本量為單獨(dú)DNA測(cè)序的2倍，同時(shí)向檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室特殊說(shuō)明需立即進(jìn)行核酸提取。2.從有菌部位（如痰液、肺泡灌洗液、咽拭子等）采集標(biāo)本時(shí)，應(yīng)采取必要措施，嚴(yán)格無(wú)菌操作等，盡量減少污染，以免干擾后續(xù)檢測(cè)結(jié)果；同時(shí)標(biāo)明樣本的采集部位。肺泡灌洗液樣本應(yīng)為3ml以上，采用無(wú)菌凍存管；痰液樣本應(yīng)為3ml以上，采用無(wú)菌凍存管；咽拭子只適用于呼吸道病毒檢測(cè)。共識(shí)12：各類型樣本采集需要無(wú)菌操作，血液、高凝狀態(tài)的胸腔積液、腹腔積液、腦脊液樣本，采集后需上下顛倒混勻5~10次。非血液標(biāo)本采集通常采用帶螺旋蓋的無(wú)菌凍存管，但預(yù)期可能凝集的標(biāo)本及血液樣本需采用專用采血管。所有樣本采集完成后，均需要封口膜密封，條碼標(biāo)記。共識(shí)13：推薦直接從患兒感染部位的體液或組織中采集樣本。共識(shí)14：患兒存在感染表現(xiàn)但病情危重或不能耐受有創(chuàng)操作時(shí)，可考慮采集患兒的血液標(biāo)本進(jìn)行常規(guī)微生物方法檢測(cè)的同時(shí)送檢mNGS。原則上，送檢感染部位的體液或者組織標(biāo)本靈敏度、特異度和可信度更高。有創(chuàng)操作不耐受時(shí)，可送檢血液標(biāo)本，但可能會(huì)降低檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。有研究發(fā)現(xiàn)，對(duì)于重癥肺部感染患者，痰液或肺泡灌洗液和血液標(biāo)本檢測(cè)病原體的一致性為40%~50%。標(biāo)本轉(zhuǎn)運(yùn)：所有樣本均應(yīng)及時(shí)送檢。若樣本在24h內(nèi)到達(dá)實(shí)驗(yàn)室并開(kāi)始檢測(cè)，可考慮冰袋低溫運(yùn)輸；若運(yùn)輸時(shí)間24~72h，應(yīng)干冰運(yùn)輸（血液樣本應(yīng)先分離血漿后保存運(yùn)輸）。不能及時(shí)送檢樣本長(zhǎng)期保存原則：（1）DNA測(cè)序?yàn)?20℃保存不超過(guò)7d；（2）RNA測(cè)序應(yīng)置-80℃理論上可長(zhǎng)期保存；（3）避免樣本反復(fù)凍融，一般不得超過(guò)3次；（4）若懷疑高致病性或突發(fā)傳染病，嚴(yán)格按照國(guó)內(nèi)傳染病法等相關(guān)法律要求包裝及轉(zhuǎn)運(yùn)。盡可能在醫(yī)院生物安全防護(hù)條件下抽提核酸后再送測(cè)序。三、報(bào)告解讀共識(shí)15：解讀mNGS檢測(cè)報(bào)告應(yīng)參考檢測(cè)方法的數(shù)據(jù)和檢出病原序列數(shù)量、基因組覆蓋度、微生物豐度等指標(biāo)，結(jié)合標(biāo)本采集部位、檢出病原的致病特性以及患兒臨床資料進(jìn)行個(gè)體化解讀。mNGS由于檢出結(jié)果豐富，雖然提高了病原微生物檢測(cè)敏感性，也對(duì)正確判讀致病微生物造成了困難。尤其是有菌區(qū)的樣本，由于定植微生物和致病微生物的混雜以及不同微生物基因組大小和核酸提取效率的差異，單純依靠檢出序列數(shù)判讀并不準(zhǔn)確。建議由臨床感染或臨床微生物學(xué)從業(yè)人員在相關(guān)的生物信息學(xué)培訓(xùn)后進(jìn)行解讀。通常，mNGS報(bào)告通過(guò)測(cè)序短序列的數(shù)量、基因組覆蓋度及微生物豐度進(jìn)行病原體鑒定，即指示某個(gè)潛在病原體的堿基序列片段數(shù)量越多，基因組覆蓋率及微生物豐度越高，表明該物種在樣本中存在的可能性越高，可信度越大。陽(yáng)性的判讀通過(guò)建立閾值實(shí)現(xiàn)，閾值往往包含以上3個(gè)指標(biāo)及內(nèi)參對(duì)照的檢出等情況，不同實(shí)驗(yàn)室采取的閾值標(biāo)準(zhǔn)往往不同。在陽(yáng)性報(bào)告中，達(dá)到陽(yáng)性閾值的微生物檢測(cè)結(jié)果即可信，但如果有多種微生物存在，則應(yīng)結(jié)合樣本類型考慮定植微生物相關(guān)假陽(yáng)性結(jié)果；在陰性報(bào)告中，需判斷陰性結(jié)果原因，是因?yàn)椴≡w載量未達(dá)到陽(yáng)性閾值標(biāo)準(zhǔn)還是因?yàn)榇_實(shí)不存在病原體，需結(jié)合患兒具體臨床信息。此外，陰性結(jié)果標(biāo)本如僅進(jìn)行DNA測(cè)序，建議進(jìn)一步進(jìn)行RNA測(cè)序以防RNA病毒作為病原體引起假陰性結(jié)果。結(jié)果報(bào)告信息：（1）患兒姓名、出生日期和性別；（2）送檢單位名稱及實(shí)驗(yàn)室的名稱、地址及聯(lián)系方式；（3）樣本采集日期和時(shí)間、驗(yàn)收日期和測(cè)試日期；（4）報(bào)告發(fā)布日期；（5）實(shí)驗(yàn)操作分析人員及審核人員；（6）檢測(cè)方法相關(guān)指標(biāo)包括測(cè)序質(zhì)量、讀長(zhǎng)（測(cè)序儀單個(gè)測(cè)序反應(yīng)所得到的堿基序列）等，同時(shí)對(duì)相關(guān)專業(yè)術(shù)語(yǔ)進(jìn)行解釋說(shuō)明，并注明檢測(cè)方法的局限性、檢測(cè)靈敏度和特異度等；（7）檢測(cè)病原微生物列表、檢出病原序列數(shù)量、深度、離散度、基因組覆蓋度或綜合以上多個(gè)指標(biāo)計(jì)算而得的鑒定置信度和相對(duì)豐度等；（8）結(jié)論及建議。結(jié)果報(bào)告常用術(shù)語(yǔ)解釋：（1）深度為該微生物基因組上某段序列被檢測(cè)到的次數(shù)；（2）離散度指檢測(cè)到某病原微生物的序列在該病原微生物基因組上分布的隨機(jī)性；（3）基因組覆蓋度指達(dá)到給定深度的測(cè)序堿基占整個(gè)基因組或目標(biāo)區(qū)域的百分比；（4）微生物豐度指除去宿主序列之后，某微生物物種序列在相應(yīng)大類物種中的分布比例；（5）鑒定置信度指綜合離散度、基因組覆蓋度、深度等多個(gè)參數(shù)計(jì)算所得的簡(jiǎn)化參數(shù)，用于判斷樣本是否存在疑似致病微生物核酸序列。共識(shí)16：源于微生物正常定植部位的標(biāo)本（例如支氣管肺泡灌洗液），鑒別檢出序列是屬于致病微生物、污染物，還是定植菌群較為困難，應(yīng)綜合患兒臨床表現(xiàn)及輔助檢查綜合判斷。微生物和宿主因素復(fù)雜的相互作用影響患兒健康，例如微生物組在調(diào)節(jié)宿主免疫反應(yīng)中的作用，或者難以區(qū)分檢測(cè)到的微生物是污染物、定植者還是真正的病原體。因此建議在出具檢測(cè)報(bào)告時(shí)，結(jié)合不同標(biāo)本類型與檢出病原微生物的種類進(jìn)行解讀，關(guān)注疑似病原體