蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件

蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究1摘要a腫瘤標(biāo)志物是細(xì)胞在特定疾病狀態(tài)下的分子信號(hào)是檢測(cè)、診斷、治療、監(jiān)測(cè)腫瘤和判斷腫瘤預(yù)后的重要工具。如何發(fā)現(xiàn)新的、具有高度特異度和靈敏度的腫瘤標(biāo)志物多年來(lái)一直是腫瘤研究的熱點(diǎn)之蛋百質(zhì)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究的快速發(fā)展給腫瘤標(biāo)志物研究注入了新的活力。運(yùn)用比較蛋自質(zhì)組學(xué)研元揭示腫瘤發(fā)病機(jī)理,尋找腫瘤述斷和治療的靶標(biāo)血清蛋自質(zhì)組學(xué)研究尋找腫瘤相關(guān)抗原,是蛋白質(zhì)組學(xué)尋找腫瘤標(biāo)志物的主要路線(xiàn)。前運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)方法已在多種腫瘤如肺癌肝癌,胃癌結(jié)直腸癌膀胱癌,腎癌等中找到暴湖的白、這日有量成為有效的摘要2蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究什么是蛋白質(zhì)組學(xué)口二腫瘤產(chǎn)生的相關(guān)機(jī)理三蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤研究中的應(yīng)用四前景與展望蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究3技術(shù)與平臺(tái)樣品制備蛋自質(zhì)分離蛋白質(zhì)鑒定生物信息學(xué)技術(shù)與平臺(tái)4蛋自質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究(一)蛋白質(zhì)組學(xué)蛋白質(zhì)組(proteome)一詞由Wilkins于1904年首次提出,意指一個(gè)細(xì)胞或一個(gè)組織的基因組所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。它是一個(gè)在空間和時(shí)間上動(dòng)態(tài)變化著的整體。蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)是指應(yīng)用各種技術(shù)手段來(lái)研究蛋白質(zhì)組的一門(mén)新興學(xué)科,其目的是從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成分,表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律蛋自質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究5蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究口技術(shù)與平臺(tái)(1)禪品制備通常使用蛋白質(zhì)樣晶溶解液或細(xì)胞裂解緩沖液從細(xì)胞,組織或其他體液中盡可能完整地將蛋白質(zhì)以溶解狀態(tài)提取出來(lái),并將其他雜質(zhì)(DNA,糖類(lèi),脂類(lèi)等)去除。LCMB](lasercapturemicrodissection,激光捕獲微切割)技術(shù)是最近發(fā)展起來(lái)的一種提取腫瘤細(xì)胞的技術(shù),成功地解決了組織中的細(xì)胞異質(zhì)性問(wèn)題,是提取腫瘤細(xì)胞最理想的方法。蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究6蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究(2)蛋白質(zhì)分離:目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究中蛋白質(zhì)分離的主流技術(shù)仍然是雙向凝膠電泳(two-dimensionalgelelectrophorus,2DE),但是,以2DE為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)存在固有的缺陷:上樣量的限制使低豐度蛋白質(zhì)難以檢測(cè)到,低溶解度和極大(>200kD)、極小(<10kD)和極端等電點(diǎn)值(pl)蛋自無(wú)法進(jìn)入2DE技術(shù)的有效分離范圍內(nèi),故難以通過(guò)2DE技術(shù)進(jìn)行分析。目前多采用多維色譜技術(shù)。在蛋白質(zhì)組學(xué)的定量研究方面,熒光差示電泳(differentialgelelectrophoresis,DGE)技術(shù)以及同位素親和標(biāo)簽技術(shù)(isotopecoded-attinitytags,ICAT),可實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的定量分析蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究7口(3)蛋白質(zhì)鑒定蛋白質(zhì)鑒定主要包括氨基酸組成分析,序列分析,肽質(zhì)量指紋圖分析和肽序列標(biāo)簽分析等。其中,肽質(zhì)量指紋圖(poptidemassfingerprint,PMF)分析是對(duì)蛋白質(zhì)酶解后的多肽混合物進(jìn)行質(zhì)譜分析。質(zhì)譜鑒定的主要原理是根據(jù)樣品電離后樣品離子的質(zhì)量電荷比(m/z)的差異分離樣品口(3)蛋白質(zhì)鑒定蛋白質(zhì)鑒定主要包括8口(4)生物信息學(xué):生物信息學(xué)是隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃、計(jì)算機(jī)技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展而誕生的一門(mén)新興學(xué)科,它是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中不可缺少的一部分。生物信息學(xué)在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中有兩個(gè)重要應(yīng)用是分析和構(gòu)建雙向凝膠電泳圖譜,二是搜索與構(gòu)建蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)。目前應(yīng)用最普遍的數(shù)據(jù)庫(kù)是NRDB和dbst數(shù)據(jù)庫(kù)。口(4)生物信息學(xué):生物信息學(xué)是隨著人類(lèi)9口(二)腫瘤產(chǎn)生的相關(guān)機(jī)理中醫(yī)觀點(diǎn):一般正常人的氣升降出入,是循環(huán)暢通的。但在內(nèi)因素影響致使氣的功能失調(diào),引起氣的郁滯。氣滯日久,必然血瘀滯血瘀,積久成塊。或由火毒內(nèi)蘊(yùn),情志化火血遇火則凝結(jié),氣血紊亂,堵塞經(jīng)絡(luò),久則凝結(jié)成塊。大多數(shù)癌瘤,是由于情郁結(jié),過(guò)子勞體酒過(guò)多惑病蠶侵裝。某些特別刺激,致使生理機(jī)能反常,局部組織變形、變性從分子水平看:腫瘤是由于DNARNA病毒等生物因素亞硝胺類(lèi)等化學(xué)因素,又射線(xiàn)等物理因素引起細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)策的結(jié)構(gòu)發(fā)生改變而引起的:特別是蛋白質(zhì)的改變,因此我蛋百質(zhì)對(duì)于抗師瘤特別口(二)腫瘤產(chǎn)生的相關(guān)機(jī)理10蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件11蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件12蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件13蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件14蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件15蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件16蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件17蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件18蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件19蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件20蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件21蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件22蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件23蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件24蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件25蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件26蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件27蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件28蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件29蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件30蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件31蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件32蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究33摘要a腫瘤標(biāo)志物是細(xì)胞在特定疾病狀態(tài)下的分子信號(hào)是檢測(cè)、診斷、治療、監(jiān)測(cè)腫瘤和判斷腫瘤預(yù)后的重要工具。如何發(fā)現(xiàn)新的、具有高度特異度和靈敏度的腫瘤標(biāo)志物多年來(lái)一直是腫瘤研究的熱點(diǎn)之蛋百質(zhì)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究的快速發(fā)展給腫瘤標(biāo)志物研究注入了新的活力。運(yùn)用比較蛋自質(zhì)組學(xué)研元揭示腫瘤發(fā)病機(jī)理,尋找腫瘤述斷和治療的靶標(biāo)血清蛋自質(zhì)組學(xué)研究尋找腫瘤相關(guān)抗原,是蛋白質(zhì)組學(xué)尋找腫瘤標(biāo)志物的主要路線(xiàn)。前運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)方法已在多種腫瘤如肺癌肝癌,胃癌結(jié)直腸癌膀胱癌,腎癌等中找到暴湖的白、這日有量成為有效的摘要34蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究什么是蛋白質(zhì)組學(xué)口二腫瘤產(chǎn)生的相關(guān)機(jī)理三蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤研究中的應(yīng)用四前景與展望蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究35技術(shù)與平臺(tái)樣品制備蛋自質(zhì)分離蛋白質(zhì)鑒定生物信息學(xué)技術(shù)與平臺(tái)36蛋自質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究(一)蛋白質(zhì)組學(xué)蛋白質(zhì)組(proteome)一詞由Wilkins于1904年首次提出,意指一個(gè)細(xì)胞或一個(gè)組織的基因組所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。它是一個(gè)在空間和時(shí)間上動(dòng)態(tài)變化著的整體。蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)是指應(yīng)用各種技術(shù)手段來(lái)研究蛋白質(zhì)組的一門(mén)新興學(xué)科,其目的是從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成分,表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律蛋自質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究37蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究口技術(shù)與平臺(tái)(1)禪品制備通常使用蛋白質(zhì)樣晶溶解液或細(xì)胞裂解緩沖液從細(xì)胞,組織或其他體液中盡可能完整地將蛋白質(zhì)以溶解狀態(tài)提取出來(lái),并將其他雜質(zhì)(DNA,糖類(lèi),脂類(lèi)等)去除。LCMB](lasercapturemicrodissection,激光捕獲微切割)技術(shù)是最近發(fā)展起來(lái)的一種提取腫瘤細(xì)胞的技術(shù),成功地解決了組織中的細(xì)胞異質(zhì)性問(wèn)題,是提取腫瘤細(xì)胞最理想的方法。蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究38蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究(2)蛋白質(zhì)分離:目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究中蛋白質(zhì)分離的主流技術(shù)仍然是雙向凝膠電泳(two-dimensionalgelelectrophorus,2DE),但是,以2DE為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)存在固有的缺陷:上樣量的限制使低豐度蛋白質(zhì)難以檢測(cè)到,低溶解度和極大(>200kD)、極小(<10kD)和極端等電點(diǎn)值(pl)蛋自無(wú)法進(jìn)入2DE技術(shù)的有效分離范圍內(nèi),故難以通過(guò)2DE技術(shù)進(jìn)行分析。目前多采用多維色譜技術(shù)。在蛋白質(zhì)組學(xué)的定量研究方面,熒光差示電泳(differentialgelelectrophoresis,DGE)技術(shù)以及同位素親和標(biāo)簽技術(shù)(isotopecoded-attinitytags,ICAT),可實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的定量分析蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤研究39口(3)蛋白質(zhì)鑒定蛋白質(zhì)鑒定主要包括氨基酸組成分析,序列分析,肽質(zhì)量指紋圖分析和肽序列標(biāo)簽分析等。其中,肽質(zhì)量指紋圖(poptidemassfingerprint,PMF)分析是對(duì)蛋白質(zhì)酶解后的多肽混合物進(jìn)行質(zhì)譜分析。質(zhì)譜鑒定的主要原理是根據(jù)樣品電離后樣品離子的質(zhì)量電荷比(m/z)的差異分離樣品口(3)蛋白質(zhì)鑒定蛋白質(zhì)鑒定主要包括40口(4)生物信息學(xué):生物信息學(xué)是隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃、計(jì)算機(jī)技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展而誕生的一門(mén)新興學(xué)科,它是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中不可缺少的一部分。生物信息學(xué)在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中有兩個(gè)重要應(yīng)用是分析和構(gòu)建雙向凝膠電泳圖譜,二是搜索與構(gòu)建蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)。目前應(yīng)用最普遍的數(shù)據(jù)庫(kù)是NRDB和dbst數(shù)據(jù)庫(kù)。口(4)生物信息學(xué):生物信息學(xué)是隨著人類(lèi)41口(二)腫瘤產(chǎn)生的相關(guān)機(jī)理中醫(yī)觀點(diǎn):一般正常人的氣升降出入,是循環(huán)暢通的。但在內(nèi)因素影響致使氣的功能失調(diào),引起氣的郁滯。氣滯日久,必然血瘀滯血瘀,積久成塊?；蛴苫鸲緝?nèi)蘊(yùn),情志化火血遇火則凝結(jié),氣血紊亂,堵塞經(jīng)絡(luò),久則凝結(jié)成塊。大多數(shù)癌瘤,是由于情郁結(jié),過(guò)子勞體酒過(guò)多惑病蠶侵裝。某些特別刺激,致使生理機(jī)能反常,局部組織變形、變性從分子水平看:腫瘤是由于DNARNA病毒等生物因素亞硝胺類(lèi)等化學(xué)因素,又射線(xiàn)等物理因素引起細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)策的結(jié)構(gòu)發(fā)生改變而引起的:特別是蛋白質(zhì)的改變,因此我蛋百質(zhì)對(duì)于抗師瘤特別口(二)腫瘤產(chǎn)生的相關(guān)機(jī)理42蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件43蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件44蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件45蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件46蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件47蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤課件48蛋白質(zhì)組學(xué)與腫瘤