PUBMED檢索-非常全面解讀課件

PubMed檢索2012年9月PubMed檢索2012年9月

PubMed(/pubmed)是由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（National

Library

of

Medicine，NLM)的國家生物技術(shù)信息中心（National

Center

for

Biotechnology

Information，NCBI)開發(fā)的一個(gè)以網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng),是NCBI龐大的檢索體系Entrez的一部分。

概況PubMed(http://www.ncbi.nlm.ni

概況收錄從1948年至今80多個(gè)國家和地區(qū)37種文字的5400多種生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)2000多萬條。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000條完整記錄。PUBMED引文90%為英文文獻(xiàn)，79%有英文摘要。概況收錄從1948年至今80多個(gè)國家和地區(qū)3PUBMED收錄的文獻(xiàn)包括4個(gè)數(shù)據(jù)庫：1.Medline2.InProcessCitations3.Publisher-SuppliedCitations4.OldMedline

概況PUBMED收錄的文獻(xiàn)包括4個(gè)數(shù)據(jù)庫：概況

概況Medline是NLM最主要的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫，覆蓋了醫(yī)學(xué)、護(hù)理、口腔、獸醫(yī)、衛(wèi)生等各個(gè)學(xué)科。收錄1948年以來生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)。該數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)的標(biāo)識(shí)為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。這部分文獻(xiàn)的一個(gè)明顯標(biāo)志就是其數(shù)據(jù)都標(biāo)引有主題詞、文獻(xiàn)類型、GeneBank獲取號(hào)以及其他的一些標(biāo)引數(shù)據(jù)。

概況Medline是NLM最主要的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

概況InProcessCitations中的記錄提供基本的題錄信息和文摘，沒有標(biāo)引主題詞。其標(biāo)識(shí)為：[PubMed-inprocess]，PubMed每天（周二至周六）添加新文獻(xiàn)到InProcessCitations中。InProcessCitations中的數(shù)據(jù)經(jīng)標(biāo)引部門標(biāo)引主題詞、文獻(xiàn)類型、GenBank獲取號(hào)等標(biāo)引數(shù)據(jù)后加入到Medline數(shù)據(jù)庫之中。標(biāo)識(shí)改為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。概況InProcessCitation

概況Publisher－SuppliedCitations中記錄由出版商以電子版形式直接傳送到PubMed，標(biāo)識(shí)為：[PubMed-assuppliedbypublisher]，大部分出版商提供的文獻(xiàn)處于正在加工狀態(tài)，經(jīng)標(biāo)引后加入到MEDLINE中。此外，還有少部分出版商提供的文獻(xiàn)不進(jìn)行標(biāo)引，保持[PubMed-assuppliedbypublisher]標(biāo)識(shí)或[PubMed]標(biāo)識(shí)。出版商在印刷版期刊出版之前向PUBMED傳送的電子版內(nèi)容將顯示[Epubaheadofprint]標(biāo)識(shí)。概況Publisher－SuppliedC

概況OldMedline:收錄部分1966年以前出版且未被Medline收錄的文獻(xiàn)記錄，標(biāo)識(shí)為[PubMed-OldMedline]概況OldMedline:收錄部分1966年

概況PubMed在不斷增加新數(shù)據(jù)的同時(shí)，還會(huì)向數(shù)據(jù)庫中追加更早的數(shù)據(jù)，目前（2012.9.15)通過PubMed可查到的最早文獻(xiàn)為1809年出版的Medico-chirurgicaltransactions上的文獻(xiàn)，且為免費(fèi)全文。

需要注意的是：InProcessCitations和Publisher-suppliedCitations數(shù)據(jù)未標(biāo)引主題詞，因此使用主題詞檢索只能查到Medline中的數(shù)據(jù)。概況PubMed在不斷增加新數(shù)據(jù)的同時(shí)，還

檢索字段及標(biāo)識(shí)符AD(Address):第一作者所屬單位和地址ALL(AllFields):全部字段AU(Author):作者姓名DP(PublicationDate):出版時(shí)間EDAT(EntrezDate):錄入時(shí)間1AU(FirstAuthorName):第一作者姓名FAU(FullAuthorName):作者姓名全稱(02年以后）LASTAU(LastAuthor)最后一個(gè)作者（通訊作者）IP(Issue):期號(hào)、部分號(hào)、增刊號(hào)IS(ISSN):國際標(biāo)準(zhǔn)刊號(hào)LA(Language):原文語種檢索字段及標(biāo)識(shí)符AD(Address):

檢索字段及標(biāo)識(shí)符MH(MeshTerms):主題詞MAJR(MeshMajorTopic):主要主題詞PG(Pagination):頁碼（起頁）PT(PublicationType):出版類型SB(Subset):文獻(xiàn)子集SH(MeshSubheadings):副主題詞TA(JournalTitleAbbreviation):刊名縮寫TI(Title):文章題名TIAB(Title/Abstract):題名摘要TW(TextWords):文本詞VI(Volume):卷號(hào)檢索字段及標(biāo)識(shí)符MH(MeshTerms):

限定字段檢索兩種方式：1.通過“AdvancedSearch”頁面的“Builder”選擇字段并構(gòu)建檢索式，詳見“AdvancedSearch”。2.檢索式：檢索詞[字段標(biāo)識(shí)]

例：SmithJ[au]Chi[la]hypertension[mh]2000:2011[dp]2011/01/01:2011/01/31[edat]注：時(shí)間格式：YYYY/MM/DD限定字段檢索兩種方式：

開始檢索

在檢索框中輸入一個(gè)或多個(gè)檢索詞，單擊“Search”執(zhí)行檢索。在多個(gè)檢索詞間可使用布爾邏輯運(yùn)算符“AND”、“OR”、“NOT”，需注意的是，邏輯運(yùn)算符須用大寫字母，邏輯運(yùn)算符的優(yōu)先順序?yàn)閺淖笙蛴业捻樞?，可通過加括號(hào)提高運(yùn)算的優(yōu)先級(jí)。檢索詞可以是主題、作者名或期刊名等。開始檢索在檢索框中輸入一個(gè)或多個(gè)檢索詞，單擊“Se

自動(dòng)匹配檢索對(duì)于輸入檢索框中未加標(biāo)識(shí)的檢索詞，PubMed依次在下列詞表中查找匹配的內(nèi)容：MeSHtranslationtableJournalstranslationtableFullAuthortranslationtableAuthorindexFullInvestigator(Collaborator)translationtableInvestigator(Collaborator)index自動(dòng)匹配檢索對(duì)于輸入檢索框中未加標(biāo)識(shí)的檢索詞

自動(dòng)匹配檢索

如果在6個(gè)詞表的任何一個(gè)中找到匹配的內(nèi)容，則匹配結(jié)束。例如：如果輸入的檢索詞在主題詞轉(zhuǎn)換表中找到與其相匹配的主題詞，則使用該主題詞進(jìn)行檢索并結(jié)束匹配，不會(huì)在其他詞表中進(jìn)行匹配。如果輸入的單個(gè)詞在6個(gè)詞表中都未找到匹配的內(nèi)容，其將被在allfields中進(jìn)行檢索；如果輸入的詞組未找到匹配的內(nèi)容，該詞組將被拆成單詞并分別對(duì)其進(jìn)行匹配后將匹配結(jié)果以AND連接。輸入的檢索詞被自動(dòng)匹配后的具體檢索式可通過Advancedsearch頁面中的details選項(xiàng)查看或在檢索結(jié)果頁面右側(cè)的Searchdetails欄中查看。

自動(dòng)匹配檢索如果在6個(gè)詞表的任何一個(gè)中找到匹配的

自動(dòng)匹配檢索自動(dòng)匹配檢索

自動(dòng)匹配檢索自動(dòng)匹配檢索

自動(dòng)匹配檢索自動(dòng)匹配檢索

作者檢索兩種方式：1.以作者姓全稱加名首字縮寫的格式輸入姓名，PubMed通過自動(dòng)匹配自動(dòng)在作者字段進(jìn)行檢索。2.通過AdvancedSearch頁面中的“SearchBuilder”下拉列表選擇“Author”字段，在字段后的檢索框中輸入作者姓名，姓名的輸入具有自動(dòng)完成屬性。作者檢索有自動(dòng)截詞功能，可通過在姓名前后加雙引號(hào)并加作者字段標(biāo)識(shí)[au]關(guān)閉該功能，如：“SmithJ”[au]作者檢索兩種方式：

作者檢索作者檢索

作者檢索如果只輸入作者的姓，則PubMed會(huì)在所有字段中對(duì)其進(jìn)行檢索，如只想將其作為作者檢索，需加作者字段標(biāo)識(shí)[au]。2002年以后的論文，如果提供作者全名，可使用作者全名進(jìn)行檢索。作者姓名可正序或倒序，如：juilaswong或wongjulias。為了區(qū)分姓名全稱與首字縮寫，需加標(biāo)全名字段標(biāo)識(shí)[fau]，如：petersondo[fau]作者檢索如果只輸入作者的姓，則PubMed會(huì)

期刊檢索

三種方式：使用PubMed資源的“JournalsDatabase”查詢特定期刊上的文章。通過AdvancedSearch頁面中的“Builder”下拉列表選擇“Journal”字段，在字段后的檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN直接在檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN，PubMed通過自動(dòng)匹配自動(dòng)在刊名字段進(jìn)行檢索。期刊檢索三種方式：

期刊檢索

如果刊名是Mesh詞（如：GeneTherapy、Science、Cell)，或刊名是單個(gè)單詞（Scanning)，如只想將其作為刊名檢索，需加刊名字段標(biāo)識(shí)[ta]。

推薦使用刊名全稱或縮寫查找，因?yàn)橛行┻^早的文獻(xiàn)沒有ISSN。

期刊檢索如果刊名是Mesh

詞組檢索

對(duì)于輸入PubMed的多詞詞組，PubMed會(huì)查詢?cè)~組索引，如果查到相應(yīng)詞組則將其作為一個(gè)檢索詞來檢索。如果未查到相應(yīng)詞組，則將其拆分成單個(gè)詞，分別進(jìn)行檢索并以邏輯和（AND）進(jìn)行組配，如：singlecell相當(dāng)于檢索singleANDcell。可通過如下方式強(qiáng)制將其作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索：

1.加雙引號(hào)，如：“singlecell”2.加標(biāo)段標(biāo)識(shí)[tw]:singlecell[tw]3.使用短橫線“-”將兩詞連接起來：single-cell4.使用截詞符*：singlecell*詞組檢索對(duì)于輸入PubMed的多詞

詞組檢索詞組檢索

截詞檢索和禁用詞截詞檢索：可通過在詞干后加“*”檢索以該詞干開頭的所有詞的文獻(xiàn)。需要注意的是：截詞檢索將關(guān)閉PubMed的自動(dòng)單詞匹配功能以及Mesh主題詞的擴(kuò)展檢索功能。如：輸入heartattack*，不會(huì)啟動(dòng)自動(dòng)匹配功能檢索與之匹配的Mesh主題詞“MyocardialInfarction”及其下位更專指的主題詞的相關(guān)文獻(xiàn)。截詞功能最多可使用600個(gè)詞形變化。超過600個(gè)會(huì)顯示如下圖的提示信息。截詞檢索和禁用詞截詞檢索：可通過在詞干后加“*”檢索以該

截詞檢索和禁用詞截詞檢索和禁用詞

截詞檢索和禁用詞PubMed在檢索時(shí)忽略一些常用的英語詞匯，下表為禁用詞列表截詞檢索和禁用詞PubMed在檢索時(shí)忽略一些

AdvancedSearch

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對(duì)檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield

?

Browsingtheindexofterms?Combiningsearchesusinghistory?Previewingthenumberofsearchresults?DisplayingthesearchdetailsAdvancedSearchPUBMED的APUBMED檢索-非常全面解讀課件Searchingbyaspecificfield通過高級(jí)檢索頁面的“PubMedAdvancedSearchBuilder”可以進(jìn)行特定字段的限定檢索。首先在下拉列表中選擇要檢索的字段，然后在檢索框中輸入檢索詞，再選擇“AND”、“OR”、“NOT”三種邏輯關(guān)系之一，即可將輸入的檢索詞在所選字段中檢索的策略以相應(yīng)的邏輯關(guān)系加入到檢索框中。SearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfield

Index-Browsingtheindexofterms

通過“Builder”檢索框后面的“Showindexlist”選項(xiàng)可查詢?cè)谒凶侄位蚰骋惶囟ㄗ侄沃械乃饕?，可以從索引中選擇一個(gè)或幾個(gè)詞來完善檢索策略。

Index-Browsingtheindexoft

Index-Browsingtheindexofterms

Index-BrowsingtheindexoftHistory-Combiningsearchesusinghistory

檢索史按檢索式運(yùn)行的順序列出各檢索式，包括檢索式序號(hào)、檢索策略、檢索時(shí)間、檢索到的文獻(xiàn)條數(shù)。檢索史最多保存100條檢索式，檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時(shí)后消失。單擊檢索式后的文獻(xiàn)數(shù)鏈接可顯示該檢索式的檢索結(jié)果?？赏ㄟ^檢索策式的序號(hào)對(duì)檢索策略進(jìn)行組配，如：#2AND#6，#3AND(drugtherapyORdiettherapy)單擊檢索史窗口下方的ClearHistory按鈕可將所有檢索式刪除。History-CombiningsearchesusiHistory-CombiningsearchesusinghistoryHistory-Combiningsearchesusi

點(diǎn)擊檢索式序號(hào)將彈出一選項(xiàng)菜單，提供的選項(xiàng)包括布爾邏輯操作符AND,OR,NOT,點(diǎn)擊相應(yīng)的操作符菜單，將把該條檢索策略加入到檢索框中，并與檢索框中現(xiàn)有的檢索式進(jìn)行選中的邏輯組配。除邏輯操作符外，彈出的選項(xiàng)菜單還提供如下選項(xiàng)：

Deletefromhistory:從檢索史中刪除該條檢索式

Showsearchresults:查看該條檢索策略的檢索結(jié)果

Showsearchdetails:顯示該條檢索策略的具體執(zhí)行情況

SaveinMyNCBI：在MyNCBI中保存該條檢索策略。

History-Combiningsearchesusinghistory點(diǎn)擊檢索式序號(hào)將彈出一選項(xiàng)菜單，提供的選項(xiàng)包

Details-Displayingthesearchdetails

“Details”(細(xì)節(jié)）可實(shí)現(xiàn)如下功能：1.查看檢索策略被PubMed的自動(dòng)單詞匹配功能、檢索規(guī)則和句法轉(zhuǎn)換后的形式。2.存儲(chǔ)和編輯檢索策略并重新發(fā)送出該項(xiàng)策略。Details-Displayingthesearc

Details-Displayingthesearchdetails

Details-Displayingthesearc

Details-Displayingthesearchdetails

/pubmed?term=%22myocardial%20infarction%22%5BMeSH%20Terms%5D%20OR%20%28%22myocardial%22%5BAll%20Fields%5D%20AND%20%22infarction%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22myocardial%20infarction%22%5BAll%20Fields%5D%20OR%20%28%22heart%22%5BAll%20Fields%5D%20AND%20%22attack%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22heart%20attack%22%5BAll%20Fields%5D&cmd=DetailsSearchDetails-DisplayingthesearcPreview-Previewingthenumberofsearchresults

制定好檢索策略后，單擊“Addtohistory”，可在顯示文獻(xiàn)條目之前，預(yù)覽檢索到的文獻(xiàn)條數(shù)，節(jié)省查找文獻(xiàn)的時(shí)間；通過該功能可以逐漸增加檢索詞來完善檢索策略。Preview-Previewingthenumber

MoreResources

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UsingClinicalQueriesUsingClinicalQueries

UsingClinicalQueries

PubMed在其臨床查詢頁面為臨床醫(yī)生提供如下特殊的PubMed檢索服務(wù):?SearchbyClinicalStudyCategory?FindingSystematicReviews?MedicalGeneticsSearches

UsingClinicalQueriesP

SearchbyClinicalStudyCategory

1.按臨床研究類別檢索文獻(xiàn)使用內(nèi)建過濾器專門查詢有關(guān)臨床研究類別的文獻(xiàn)，提供5種研究類別（etiology、diagnosis、therapy、prognosis、clinicalpredictionguides）和2種強(qiáng)調(diào)類型（narrowspecificsearch、broadsensitivesearch）SearchbyClinicalStudyCatResearchMethodologyFilters

SearchbyClinicalStudyCategoryResearchMethodologyFilters2.查詢系統(tǒng)綜述

系統(tǒng)綜述包括如下文獻(xiàn)類型：

systematicreviewsmeta-analysisreviewsofclinicaltrialsevidence-basedmedicineconsensusdevelopmentconferencesguidelines

FindingSystematicReviews2.查詢系統(tǒng)綜述FindingSystematicR

也可以通過在選擇過濾器頁面選擇Articletypes為“SystematicReviews”或直接在檢索框中輸入檢索詞加上“ANDsystematic[sb]”來檢索系統(tǒng)綜述。

FindingSystematicReviews也可以通過在選擇過濾器頁面選擇Articlet

MedicalGeneticResearchs3.醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究用來查找醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)相關(guān)的各主題的文獻(xiàn)，包括：DiagnosisDifferentialDiagnosisClinicalDescriptionManagementGeneticCounselingMolecularGeneticsGeneticTestingMedicalGeneticResearchs3.醫(yī)

UsingClinicalQueriesUsingClinicalQueries

Topic-SpecificQueries列出了為臨床醫(yī)生和衛(wèi)生服務(wù)研究者進(jìn)行特殊目的檢索的目錄，可以按檢索目的、檢索主題以及特定期刊子集等分類來檢索相關(guān)信息。Topic-SpecificQueries列出了為

Topic-SpecificQueriesTopic-SpecificQueries

Topic-SpecificQueriesTopic-SpecificQueries

Topic-SpecificQueriesTopic-SpecificQueries

MeshDatabase通過主題詞數(shù)據(jù)庫可以查詢Mesh詞、副主題詞、出版類型、物質(zhì)名和藥物作用等，并生成檢索策略?？梢允褂肕esh詞、Mesh款目詞、副主題詞、出版類型、物質(zhì)名或Mesh范疇注釋中的詞檢索Mesh數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)。MeshDatabase通過主題詞數(shù)據(jù)庫可以查

MeshDatabaseMeshDatabase

MeshDatabaseMeshDatabase

SingleCitationMatcher以填空的方式填入已知的期刊信息，查詢一篇已知論文或指定期刊某一卷或期上的一批論文。期刊名和作者名有自動(dòng)完成屬性，輸入部分信息會(huì)提示以該信息開頭的全部期刊名或作者名。

SingleCitationMatcher

SingleCitationMatcherSingleCitationMatcher

檢索結(jié)果處理PubMed的檢索結(jié)果默認(rèn)顯示為Summary格式，此外還提供Abstact、Medline、XML、Pmidlist等顯示格式。選中想要的檢索結(jié)果，可將其保存為文本文件，或通過email發(fā)送，也可在線訂閱全文（需付費(fèi)）。在檢索結(jié)果頁面右側(cè)有對(duì)當(dāng)前檢索結(jié)果進(jìn)行分組顯示的標(biāo)簽、檢索其他NCBI數(shù)據(jù)庫的鏈接及當(dāng)前檢索的Details查看等內(nèi)容。在頁面的左側(cè)有選擇過濾器選項(xiàng)，可以選擇限定條件對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行進(jìn)一步限定。檢索結(jié)果處理PubMed的檢索結(jié)果默認(rèn)顯示為

檢索結(jié)果處理過濾器可限定只檢索那些提供全文或免費(fèi)全文的文獻(xiàn)，也可將檢索策略限定于特定的年齡組、性別、人類與動(dòng)物研究、語種、文獻(xiàn)類型、PubMed的特定文獻(xiàn)子集等。由于inprocesscitations和publishersuppliedcitaions沒有進(jìn)行標(biāo)引，因此選擇某些限定功能，PubMed將僅在Medline中進(jìn)行檢索。選擇了某種限定條件并進(jìn)行檢索后當(dāng)前的限定條件顯示于檢索結(jié)果頁面上方，進(jìn)行新的檢索時(shí)需單擊限定條件右側(cè)的“Clear”清除當(dāng)前的限定條件，或單擊檢索結(jié)果頁面上方限定條件后的“ClearAll”清除所有限定條件，否則將使用相同的限定條件進(jìn)行檢索。檢索結(jié)果處理過濾器可限定只檢索那些提供全文

DisplayResults

DisplayResults

DisplayResults

題名（TI）作者（AU）刊名（TA）出版時(shí)間（DP）卷（期）(VI（IP）)起止頁碼（PG）相關(guān)文獻(xiàn)免費(fèi)全文標(biāo)識(shí)DisplayResults題名（TI）作者（AU

DisplayResultsAbstract格式DisplayResultsAbstract格式

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Clipboard

Clipboard給我們提供一個(gè)臨時(shí)存放所選文獻(xiàn)的空間。Clipboard中的文獻(xiàn)將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時(shí)后消失。Clipboard的最大容量為500篇文獻(xiàn)。去重作用：對(duì)于已經(jīng)存在于Clipboard中的文獻(xiàn)將不能再存入Clipboard之中。

Clipboard中的文獻(xiàn)默認(rèn)的檢索式序號(hào)為#0，可以此對(duì)其進(jìn)行布爾邏輯檢索操作，如：檢索剪貼板中的英文文獻(xiàn)可使用檢索式：#0ANDenglish[la]ClipboardClipboard給我們

Clipboard

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File:按規(guī)定格式保存為本地文件Collections:在MyNCBI的collections中永久保存所選文獻(xiàn)，一次最多1000條E-mail:將檢索結(jié)果以所選格式發(fā)送給指定的e-mail，一次最多發(fā)送200條文獻(xiàn)Order:定購所選文獻(xiàn)全文，需注冊(cè)，

付費(fèi)MyBibliography:將檢索結(jié)果直接保存到MyNCBI帳戶中的MyBibliography中。CitationManager:將檢索結(jié)果輸出到EndNote,ReferenceManager和ProCite等參考文獻(xiàn)管理軟件SendtoFileFile:按規(guī)定格式保

MyNCBI注冊(cè)MyNCBI并登錄后，可以對(duì)NCBI網(wǎng)站的服務(wù)進(jìn)行個(gè)性化設(shè)置，可實(shí)現(xiàn)如下操作：保存檢索策略

保存檢索結(jié)果

設(shè)置在檢索結(jié)果中高亮顯示檢索詞建立內(nèi)容更新的e-mail提醒（需確認(rèn)）在檢索結(jié)果中顯示網(wǎng)站資源的鏈接選擇過濾器對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行分組

MyNCBI注冊(cè)MyNCBI并登錄后，可

SaveSearchInputyoursearchname(lessthan100characters)SaveSearchInputyoursearch

MyNCBIMyNCBITheEnd!TheEnd!PubMed檢索2012年9月PubMed檢索2012年9月

PubMed(/pubmed)是由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（National

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Medicine，NLM)的國家生物技術(shù)信息中心（National

Center

for

Biotechnology

Information，NCBI)開發(fā)的一個(gè)以網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng),是NCBI龐大的檢索體系Entrez的一部分。

概況PubMed(http://www.ncbi.nlm.ni

概況收錄從1948年至今80多個(gè)國家和地區(qū)37種文字的5400多種生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)2000多萬條。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000條完整記錄。PUBMED引文90%為英文文獻(xiàn)，79%有英文摘要。概況收錄從1948年至今80多個(gè)國家和地區(qū)3PUBMED收錄的文獻(xiàn)包括4個(gè)數(shù)據(jù)庫：1.Medline2.InProcessCitations3.Publisher-SuppliedCitations4.OldMedline

概況PUBMED收錄的文獻(xiàn)包括4個(gè)數(shù)據(jù)庫：概況

概況Medline是NLM最主要的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫，覆蓋了醫(yī)學(xué)、護(hù)理、口腔、獸醫(yī)、衛(wèi)生等各個(gè)學(xué)科。收錄1948年以來生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)。該數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)的標(biāo)識(shí)為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。這部分文獻(xiàn)的一個(gè)明顯標(biāo)志就是其數(shù)據(jù)都標(biāo)引有主題詞、文獻(xiàn)類型、GeneBank獲取號(hào)以及其他的一些標(biāo)引數(shù)據(jù)。

概況Medline是NLM最主要的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

概況InProcessCitations中的記錄提供基本的題錄信息和文摘，沒有標(biāo)引主題詞。其標(biāo)識(shí)為：[PubMed-inprocess]，PubMed每天（周二至周六）添加新文獻(xiàn)到InProcessCitations中。InProcessCitations中的數(shù)據(jù)經(jīng)標(biāo)引部門標(biāo)引主題詞、文獻(xiàn)類型、GenBank獲取號(hào)等標(biāo)引數(shù)據(jù)后加入到Medline數(shù)據(jù)庫之中。標(biāo)識(shí)改為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。概況InProcessCitation

概況Publisher－SuppliedCitations中記錄由出版商以電子版形式直接傳送到PubMed，標(biāo)識(shí)為：[PubMed-assuppliedbypublisher]，大部分出版商提供的文獻(xiàn)處于正在加工狀態(tài)，經(jīng)標(biāo)引后加入到MEDLINE中。此外，還有少部分出版商提供的文獻(xiàn)不進(jìn)行標(biāo)引，保持[PubMed-assuppliedbypublisher]標(biāo)識(shí)或[PubMed]標(biāo)識(shí)。出版商在印刷版期刊出版之前向PUBMED傳送的電子版內(nèi)容將顯示[Epubaheadofprint]標(biāo)識(shí)。概況Publisher－SuppliedC

概況OldMedline:收錄部分1966年以前出版且未被Medline收錄的文獻(xiàn)記錄，標(biāo)識(shí)為[PubMed-OldMedline]概況OldMedline:收錄部分1966年

概況PubMed在不斷增加新數(shù)據(jù)的同時(shí)，還會(huì)向數(shù)據(jù)庫中追加更早的數(shù)據(jù)，目前（2012.9.15)通過PubMed可查到的最早文獻(xiàn)為1809年出版的Medico-chirurgicaltransactions上的文獻(xiàn)，且為免費(fèi)全文。

需要注意的是：InProcessCitations和Publisher-suppliedCitations數(shù)據(jù)未標(biāo)引主題詞，因此使用主題詞檢索只能查到Medline中的數(shù)據(jù)。概況PubMed在不斷增加新數(shù)據(jù)的同時(shí)，還

檢索字段及標(biāo)識(shí)符AD(Address):第一作者所屬單位和地址ALL(AllFields):全部字段AU(Author):作者姓名DP(PublicationDate):出版時(shí)間EDAT(EntrezDate):錄入時(shí)間1AU(FirstAuthorName):第一作者姓名FAU(FullAuthorName):作者姓名全稱(02年以后）LASTAU(LastAuthor)最后一個(gè)作者（通訊作者）IP(Issue):期號(hào)、部分號(hào)、增刊號(hào)IS(ISSN):國際標(biāo)準(zhǔn)刊號(hào)LA(Language):原文語種檢索字段及標(biāo)識(shí)符AD(Address):

檢索字段及標(biāo)識(shí)符MH(MeshTerms):主題詞MAJR(MeshMajorTopic):主要主題詞PG(Pagination):頁碼（起頁）PT(PublicationType):出版類型SB(Subset):文獻(xiàn)子集SH(MeshSubheadings):副主題詞TA(JournalTitleAbbreviation):刊名縮寫TI(Title):文章題名TIAB(Title/Abstract):題名摘要TW(TextWords):文本詞VI(Volume):卷號(hào)檢索字段及標(biāo)識(shí)符MH(MeshTerms):

限定字段檢索兩種方式：1.通過“AdvancedSearch”頁面的“Builder”選擇字段并構(gòu)建檢索式，詳見“AdvancedSearch”。2.檢索式：檢索詞[字段標(biāo)識(shí)]

例：SmithJ[au]Chi[la]hypertension[mh]2000:2011[dp]2011/01/01:2011/01/31[edat]注：時(shí)間格式：YYYY/MM/DD限定字段檢索兩種方式：

開始檢索

在檢索框中輸入一個(gè)或多個(gè)檢索詞，單擊“Search”執(zhí)行檢索。在多個(gè)檢索詞間可使用布爾邏輯運(yùn)算符“AND”、“OR”、“NOT”，需注意的是，邏輯運(yùn)算符須用大寫字母，邏輯運(yùn)算符的優(yōu)先順序?yàn)閺淖笙蛴业捻樞?，可通過加括號(hào)提高運(yùn)算的優(yōu)先級(jí)。檢索詞可以是主題、作者名或期刊名等。開始檢索在檢索框中輸入一個(gè)或多個(gè)檢索詞，單擊“Se

自動(dòng)匹配檢索對(duì)于輸入檢索框中未加標(biāo)識(shí)的檢索詞，PubMed依次在下列詞表中查找匹配的內(nèi)容：MeSHtranslationtableJournalstranslationtableFullAuthortranslationtableAuthorindexFullInvestigator(Collaborator)translationtableInvestigator(Collaborator)index自動(dòng)匹配檢索對(duì)于輸入檢索框中未加標(biāo)識(shí)的檢索詞

自動(dòng)匹配檢索

如果在6個(gè)詞表的任何一個(gè)中找到匹配的內(nèi)容，則匹配結(jié)束。例如：如果輸入的檢索詞在主題詞轉(zhuǎn)換表中找到與其相匹配的主題詞，則使用該主題詞進(jìn)行檢索并結(jié)束匹配，不會(huì)在其他詞表中進(jìn)行匹配。如果輸入的單個(gè)詞在6個(gè)詞表中都未找到匹配的內(nèi)容，其將被在allfields中進(jìn)行檢索；如果輸入的詞組未找到匹配的內(nèi)容，該詞組將被拆成單詞并分別對(duì)其進(jìn)行匹配后將匹配結(jié)果以AND連接。輸入的檢索詞被自動(dòng)匹配后的具體檢索式可通過Advancedsearch頁面中的details選項(xiàng)查看或在檢索結(jié)果頁面右側(cè)的Searchdetails欄中查看。

自動(dòng)匹配檢索如果在6個(gè)詞表的任何一個(gè)中找到匹配的

自動(dòng)匹配檢索自動(dòng)匹配檢索

自動(dòng)匹配檢索自動(dòng)匹配檢索

自動(dòng)匹配檢索自動(dòng)匹配檢索

作者檢索兩種方式：1.以作者姓全稱加名首字縮寫的格式輸入姓名，PubMed通過自動(dòng)匹配自動(dòng)在作者字段進(jìn)行檢索。2.通過AdvancedSearch頁面中的“SearchBuilder”下拉列表選擇“Author”字段，在字段后的檢索框中輸入作者姓名，姓名的輸入具有自動(dòng)完成屬性。作者檢索有自動(dòng)截詞功能，可通過在姓名前后加雙引號(hào)并加作者字段標(biāo)識(shí)[au]關(guān)閉該功能，如：“SmithJ”[au]作者檢索兩種方式：

作者檢索作者檢索

作者檢索如果只輸入作者的姓，則PubMed會(huì)在所有字段中對(duì)其進(jìn)行檢索，如只想將其作為作者檢索，需加作者字段標(biāo)識(shí)[au]。2002年以后的論文，如果提供作者全名，可使用作者全名進(jìn)行檢索。作者姓名可正序或倒序，如：juilaswong或wongjulias。為了區(qū)分姓名全稱與首字縮寫，需加標(biāo)全名字段標(biāo)識(shí)[fau]，如：petersondo[fau]作者檢索如果只輸入作者的姓，則PubMed會(huì)

期刊檢索

三種方式：使用PubMed資源的“JournalsDatabase”查詢特定期刊上的文章。通過AdvancedSearch頁面中的“Builder”下拉列表選擇“Journal”字段，在字段后的檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN直接在檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN，PubMed通過自動(dòng)匹配自動(dòng)在刊名字段進(jìn)行檢索。期刊檢索三種方式：

期刊檢索

如果刊名是Mesh詞（如：GeneTherapy、Science、Cell)，或刊名是單個(gè)單詞（Scanning)，如只想將其作為刊名檢索，需加刊名字段標(biāo)識(shí)[ta]。

推薦使用刊名全稱或縮寫查找，因?yàn)橛行┻^早的文獻(xiàn)沒有ISSN。

期刊檢索如果刊名是Mesh

詞組檢索

對(duì)于輸入PubMed的多詞詞組，PubMed會(huì)查詢?cè)~組索引，如果查到相應(yīng)詞組則將其作為一個(gè)檢索詞來檢索。如果未查到相應(yīng)詞組，則將其拆分成單個(gè)詞，分別進(jìn)行檢索并以邏輯和（AND）進(jìn)行組配，如：singlecell相當(dāng)于檢索singleANDcell?？赏ㄟ^如下方式強(qiáng)制將其作為一個(gè)詞組進(jìn)行檢索：

1.加雙引號(hào)，如：“singlecell”2.加標(biāo)段標(biāo)識(shí)[tw]:singlecell[tw]3.使用短橫線“-”將兩詞連接起來：single-cell4.使用截詞符*：singlecell*詞組檢索對(duì)于輸入PubMed的多詞

詞組檢索詞組檢索

截詞檢索和禁用詞截詞檢索：可通過在詞干后加“*”檢索以該詞干開頭的所有詞的文獻(xiàn)。需要注意的是：截詞檢索將關(guān)閉PubMed的自動(dòng)單詞匹配功能以及Mesh主題詞的擴(kuò)展檢索功能。如：輸入heartattack*，不會(huì)啟動(dòng)自動(dòng)匹配功能檢索與之匹配的Mesh主題詞“MyocardialInfarction”及其下位更專指的主題詞的相關(guān)文獻(xiàn)。截詞功能最多可使用600個(gè)詞形變化。超過600個(gè)會(huì)顯示如下圖的提示信息。截詞檢索和禁用詞截詞檢索：可通過在詞干后加“*”檢索以該

截詞檢索和禁用詞截詞檢索和禁用詞

截詞檢索和禁用詞PubMed在檢索時(shí)忽略一些常用的英語詞匯，下表為禁用詞列表截詞檢索和禁用詞PubMed在檢索時(shí)忽略一些

AdvancedSearch

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對(duì)檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield

?

Browsingtheindexofterms?Combiningsearchesusinghistory?Previewingthenumberofsearchresults?DisplayingthesearchdetailsAdvancedSearchPUBMED的APUBMED檢索-非常全面解讀課件Searchingbyaspecificfield通過高級(jí)檢索頁面的“PubMedAdvancedSearchBuilder”可以進(jìn)行特定字段的限定檢索。首先在下拉列表中選擇要檢索的字段，然后在檢索框中輸入檢索詞，再選擇“AND”、“OR”、“NOT”三種邏輯關(guān)系之一，即可將輸入的檢索詞在所選字段中檢索的策略以相應(yīng)的邏輯關(guān)系加入到檢索框中。SearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfieldSearchingbyaspecificfield

Index-Browsingtheindexofterms

通過“Builder”檢索框后面的“Showindexlist”選項(xiàng)可查詢?cè)谒凶侄位蚰骋惶囟ㄗ侄沃械乃饕?，可以從索引中選擇一個(gè)或幾個(gè)詞來完善檢索策略。

Index-Browsingtheindexoft

Index-Browsingtheindexofterms

Index-BrowsingtheindexoftHistory-Combiningsearchesusinghistory

檢索史按檢索式運(yùn)行的順序列出各檢索式，包括檢索式序號(hào)、檢索策略、檢索時(shí)間、檢索到的文獻(xiàn)條數(shù)。檢索史最多保存100條檢索式，檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時(shí)后消失。單擊檢索式后的文獻(xiàn)數(shù)鏈接可顯示該檢索式的檢索結(jié)果?？赏ㄟ^檢索策式的序號(hào)對(duì)檢索策略進(jìn)行組配，如：#2AND#6，#3AND(drugtherapyORdiettherapy)單擊檢索史窗口下方的ClearHistory按鈕可將所有檢索式刪除。History-CombiningsearchesusiHistory-CombiningsearchesusinghistoryHistory-Combiningsearchesusi

點(diǎn)擊檢索式序號(hào)將彈出一選項(xiàng)菜單，提供的選項(xiàng)包括布爾邏輯操作符AND,OR,NOT,點(diǎn)擊相應(yīng)的操作符菜單，將把該條檢索策略加入到檢索框中，并與檢索框中現(xiàn)有的檢索式進(jìn)行選中的邏輯組配。除邏輯操作符外，彈出的選項(xiàng)菜單還提供如下選項(xiàng)：

Deletefromhistory:從檢索史中刪除該條檢索式

Showsearchresults:查看該條檢索策略的檢索結(jié)果

Showsearchdetails:顯示該條檢索策略的具體執(zhí)行情況

SaveinMyNCBI：在MyNCBI中保存該條檢索策略。

History-Combiningsearchesusinghistory點(diǎn)擊檢索式序號(hào)將彈出一選項(xiàng)菜單，提供的選項(xiàng)包

Details-Displayingthesearchdetails

“Details”(細(xì)節(jié)）可實(shí)現(xiàn)如下功能：1.查看檢索策略被PubMed的自動(dòng)單詞匹配功能、檢索規(guī)則和句法轉(zhuǎn)換后的形式。2.存儲(chǔ)和編輯檢索策略并重新發(fā)送出該項(xiàng)策略。Details-Displayingthesearc

Details-Displayingthesearchdetails

Details-Displayingthesearc

Details-Displayingthesearchdetails

/pubmed?term=%22myocardial%20infarction%22%5BMeSH%20Terms%5D%20OR%20%28%22myocardial%22%5BAll%20Fields%5D%20AND%20%22infarction%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22myocardial%20infarction%22%5BAll%20Fields%5D%20OR%20%28%22heart%22%5BAll%20Fields%5D%20AND%20%22attack%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22heart%20attack%22%5BAll%20Fields%5D&cmd=DetailsSearchDetails-DisplayingthesearcPreview-Previewingthenumberofsearchresults

制定好檢索策略后，單擊“Addtohistory”，可在顯示文獻(xiàn)條目之前，預(yù)覽檢索到的文獻(xiàn)條數(shù)，節(jié)省查找文獻(xiàn)的時(shí)間；通過該功能可以逐漸增加檢索詞來完善檢索策略。Preview-Previewingthenumber

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PubMed在其臨床查詢頁面為臨床醫(yī)生提供如下特殊的PubMed檢索服務(wù):?SearchbyClinicalStudyCategory?FindingSystematicReviews?MedicalGeneticsSearches

UsingClinicalQueriesP

SearchbyClinicalStudyCategory

1.按臨床研究類別檢索文獻(xiàn)使用內(nèi)建過濾器專門查詢有關(guān)臨床研究類別的文獻(xiàn)，提供5種研究類別（etiology、diagnosis、therapy、prognosis、clinicalpredictionguides）和2種強(qiáng)調(diào)類型（narrowspecificsearch、broadsensitivesearch）SearchbyClinicalStudyCatResearchMethodologyFilters

SearchbyClinicalStudyCategoryResearchMethodologyFilters2.查詢系統(tǒng)綜述

系統(tǒng)綜述包括如下文獻(xiàn)類型：

systematicreviewsmeta-analysisreviewsofclinicaltrialsevidence-basedmedicineconsensusdevelopmentconferencesguidelines

FindingSystematicReviews2.查詢系統(tǒng)綜述FindingSystematicR

也可以通過在選擇過濾器頁面選擇Articletypes為“SystematicReviews”或直接在檢索框中輸入檢索詞加上“ANDsystematic[sb]”來檢索系統(tǒng)綜述。

FindingSystematicReviews也可以通過在選擇過濾器頁面選擇Articlet

MedicalGeneticResearchs3.醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究用來查找醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)相關(guān)的各主題的文獻(xiàn)，包括：DiagnosisDifferentialDiagnosisClinicalDescriptionManagementGeneticCounselingMolecularGeneticsGeneticTestingMedicalGeneticResearchs3.醫(yī)

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Topic-SpecificQueries列出了為臨床醫(yī)生和衛(wèi)生服務(wù)研究者進(jìn)行特殊目的檢索的目錄，可以按檢索目的、檢索主題以及特定期刊子集等分類來檢索相關(guān)信息。Topic-SpecificQueries列出了為

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