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文檔簡(jiǎn)介
遺傳
學(xué)Ⅰ
本課程的性質(zhì)和任務(wù)
21世紀(jì)是生命科學(xué)蓬勃發(fā)展的世紀(jì)。隨著“人類基因組計(jì)劃”的進(jìn)行和深入,遺傳學(xué)已成為21世紀(jì)生命科學(xué)領(lǐng)域發(fā)展最為迅速的學(xué)科之一,是當(dāng)代生命科學(xué)的核心和前沿之一,它的分支幾乎擴(kuò)展到生物學(xué)的各個(gè)研究領(lǐng)域。遺傳學(xué)課是生命科學(xué)學(xué)院以及相關(guān)學(xué)院本科生的基礎(chǔ)課。本課程的任務(wù)系統(tǒng)地講授遺傳學(xué)的基本原理和遺傳分析的基本方法,同時(shí)介紹現(xiàn)代遺傳學(xué)發(fā)展的最新成就,使學(xué)生對(duì)遺傳物質(zhì)的本質(zhì)、遺傳物質(zhì)的傳遞、遺傳物質(zhì)的變異以及遺傳信息的表達(dá)與調(diào)控有一個(gè)較為全面和深入的認(rèn)識(shí)和了解。培養(yǎng)學(xué)生的遺傳分析能力和解決遺傳學(xué)問(wèn)題的技巧。Ⅱ教學(xué)要求與教學(xué)方法
本課程始終注重培養(yǎng)學(xué)生的遺傳分析能力和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)能力。要求學(xué)生掌握孟德爾式遺傳分析,連鎖遺傳分析與染色體作圖,基因精細(xì)結(jié)構(gòu)的遺傳分析,病毒的遺傳分析,細(xì)菌的遺傳分析,真核生物的遺傳分析、遺傳重組、核外遺傳、分子標(biāo)記與基因組研究、遺傳物質(zhì)的改變,群體遺傳與進(jìn)化,數(shù)量性狀的遺傳分析等基本內(nèi)容和原理方法等。Ⅲ
教學(xué)學(xué)時(shí)分配和安排本課程講授,按每周3學(xué)時(shí)安排,共54學(xué)時(shí)。Ⅳ
成績(jī)?cè)u(píng)定:期末考試:70%文獻(xiàn)閱讀與綜述:10%平時(shí)練習(xí)與測(cè)驗(yàn):20%教學(xué)方法:采用多功能教室教學(xué),采用國(guó)內(nèi)外最新的彩色原版圖片示范。課堂教學(xué)為主,課余閱讀為輔。指定閱讀參考書。每章講授完畢,布置練習(xí)作業(yè),以掌握和鞏固所學(xué)知識(shí)。采用教
材戴灼華、王亞馥、粟翼玟主編:遺傳學(xué)(第二版),高等教育出版社
,2008年1月20日第1次印刷第1版
1999年6月1.1遺傳學(xué)的定義:遺傳學(xué)(Genetics):是研究生物遺傳和變異規(guī)律的科學(xué)?,F(xiàn)代遺傳學(xué)(Modern
Genetics):是研究基因的結(jié)構(gòu)、功能及其變異、傳遞和表達(dá)規(guī)律的學(xué)科。遺傳(
heredity)和變異(
variation)是生物界最普遍和最基本的特性。
遺傳和變異是遺傳信息決定的,因此,遺傳學(xué)也就是研究生物體遺傳信息的組成、傳遞和表達(dá)規(guī)律的一門科學(xué)。遺傳學(xué)
第1章
緒論Genetics:
The
study
of
Biological
informationGenetics,
the
science
of
heredity,
is
at
its
corethe
study
of
biological
information.
All
living
organism---from
single-celled
bacteria
and
protozoa
tomulticellular
plants
and
animals--must
store,
replicate,transmit
to
the
next
generation,
and
use
vastquantities
of
information
to
develop,
grow,
reproduce,and
survive
in
their
environments.
Geneticists
examinehow
organisms
pass
biological
information
on
to
theirprogeny
and
how
they
use
it
during
their
lifetime.——L.
H.Hartwell,2000
從遺傳學(xué)角度理解:1.Biological
information
is
encoded
in
the
DNA
molecule
(f-1)2.Biological
function
emerges
primarily
from
protein
molecules
(f-2)3.All
living
forms
are
closely
related
(f-3)4.The
modular
construction
of
genomes
hasallowed
the
relatively
rapid
evolution
ofbiological
complexity(f-4)5.Genetic
techniques
permit
the
dissection
ofbiological
complexity1.2
遺傳學(xué)的研究?jī)?nèi)容:⑴
遺傳現(xiàn)象(phenomenology
of
heredity)例:植物的遺傳現(xiàn)象:種瓜得瓜,種豆得豆
水稻、大麥、小麥等各種農(nóng)作物抗病遺傳、品質(zhì)遺傳等。
動(dòng)物的遺傳現(xiàn)象:代謝病、遺傳病、白化現(xiàn)象等⑵
基因組與基因的結(jié)構(gòu)和功能(
structure
and
function
of
Genome
and
genes)真核生物、原核生物基因組結(jié)構(gòu)和功能、基因的結(jié)構(gòu)、啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)等⑶
基因如何控制代謝和發(fā)育(基因表達(dá)的規(guī)律及其調(diào)控的分子機(jī)制)例:種子植株
受精卵個(gè)體⑷
基因在世代之間的傳遞方式與規(guī)律
(群體中的基因的分布和行為)ABO血型,南方人、北方人中的基因頻率的分布;遺傳病分布等,基因的流動(dòng)。⑸
基因組的進(jìn)化與遺傳信息流1.3、遺傳學(xué)的三個(gè)主要分支
1.Transimisson
GeneticsGenetics2.
Molecular
Genetics
3.
Population
Genetics(1)、傳遞遺傳學(xué)(Transimission
Genetics)
孟德爾遺傳學(xué)(
Mendelian
Genetics
)
經(jīng)
典
遺傳學(xué)(
Classical
Genetics
)研究基因從親代傳遞到子代以及基因如何重組(2)、分子遺傳學(xué)(Molecular
Genetics)在分子水平上研究基因的結(jié)構(gòu)和功能,基因的表達(dá)和調(diào)控等或者說(shuō)是研究遺傳信息大分子的結(jié)構(gòu)與功能的一門科學(xué)例:DNA的結(jié)構(gòu)、
基因的分子結(jié)構(gòu)和功能、操縱子、啟動(dòng)子轉(zhuǎn)座子的分子結(jié)構(gòu)、基因家族等mRNA的表達(dá)和調(diào)控、
RNA
的拼接、RNA干擾等所有發(fā)生在細(xì)胞中的分子遺傳變異事件傳統(tǒng)的遺傳學(xué)“主要研究遺傳單元在各世代的分布情況”分子遺傳學(xué)則著重研究遺傳信息大分子在生命系統(tǒng)中的儲(chǔ)存、復(fù)制、表達(dá)及調(diào)控過(guò)程。它的研究范疇:信息源信息模板工作分子(生長(zhǎng)、分化、發(fā)育過(guò)程中的分子事件)
中心法則
分子遺傳學(xué)的范疇分子遺傳學(xué)所研究的應(yīng)該是細(xì)胞中動(dòng)態(tài)的遺傳變異過(guò)程,
以及與此相關(guān)的所有的分子事件
圖-55DNARNA肽鏈功能蛋白質(zhì)性狀(3).
群體遺傳學(xué)(Population
Genetics)
以群體為單位研究群體內(nèi)遺傳結(jié)構(gòu)及其變化規(guī)律的遺傳學(xué)分支學(xué)科。根據(jù)遺傳學(xué)原理,采用數(shù)字、統(tǒng)計(jì)或其他方法研究生物群體的遺傳結(jié)構(gòu),群體中遺傳變異的程度,其變化規(guī)律以及種群演變規(guī)律。研究群體中基因的分布和行為(通常按數(shù)學(xué)術(shù)語(yǔ)),基因頻率ABO血型在人群中的分布,基因在群體中的演變、進(jìn)化等。1.4.遺傳學(xué)的發(fā)展1.4.1遺傳學(xué)的誕生
(孟德爾以前的遺傳學(xué))
關(guān)于遺傳機(jī)制的假說(shuō)
(1)
預(yù)成論(preformation
theory)
認(rèn)為生物從預(yù)先存在于性細(xì)胞(精子或卵)中雛形發(fā)展而來(lái),所謂發(fā)育只不過(guò)是這一雛形生物的機(jī)械性擴(kuò)大,并沒有新的東西產(chǎn)生出來(lái)。
精源論者(荷蘭
leeuwenhoek
列克虎文)認(rèn)為雛形(微小的
“原形人”)存在于精子中,而卵源論者(Janswammerdam
1679)主張雛形存在于卵中。矮人/
侏儒蜷縮(2).
漸成論(epigenesis)亦稱后成論與預(yù)成論相對(duì)立的理論
德國(guó)胚胎學(xué)家C.F,Wolff認(rèn)為生物體的各種組織和器官,都是在個(gè)體發(fā)育過(guò)程中逐步形成的,性細(xì)胞(精子或卵)中并不存在任何雛形。(3).泛生論(pangenesis)C.Darwin(1809-1882)1868年
生物體每個(gè)細(xì)胞里都有一種代表性的“微芽”
——“泛子”(pangen)。泛子隨著血液循環(huán)→生殖細(xì)胞→
受精卵分裂和發(fā)育→
各種泛子又不斷地分配到不同的細(xì)胞中去,從而導(dǎo)致它們所代表的組織器官的分化和性狀的發(fā)育,形成一個(gè)同親代相似的新個(gè)體。達(dá)爾文認(rèn)為生物的遺傳就是通過(guò)這種方式實(shí)現(xiàn)的。(4).種質(zhì)論(Germplasmtheory)
Weismann(1834-1914)“種質(zhì)連續(xù)的遺傳學(xué)說(shuō)”認(rèn)為:生物體分成種質(zhì)和體質(zhì)兩部分。種質(zhì)指生殖細(xì)胞,專營(yíng)生殖和遺傳,通過(guò)細(xì)胞分裂在一生中及世代間保持連續(xù),生物的遺傳就在于種質(zhì)的連續(xù)。體質(zhì)是種質(zhì)以外的所有其他部分(體細(xì)胞),負(fù)責(zé)各種營(yíng)養(yǎng)活動(dòng)。
種質(zhì)決定了體質(zhì),種質(zhì)的變異必將引起體質(zhì)的變異,但體質(zhì)的改變不會(huì)引起種質(zhì)的改變。
他指出:種質(zhì)的連續(xù)性是建立在這樣的基礎(chǔ)上,即遺傳是由具有一定化學(xué)成分和一定分子性質(zhì)的物質(zhì),一代又一代的傳遞來(lái)實(shí)現(xiàn)的。(5).融合遺傳學(xué)說(shuō)(blending
theory/blending
inheritance)
英國(guó)學(xué)者F.Galton和他的學(xué)生K.Pearson于1886-1894用統(tǒng)計(jì)方法研究數(shù)量性狀(例如
人的身高)在親代與子代之間的相關(guān)性。
認(rèn)為“父母的遺傳性在子女中各占一半,并且徹底混合
,
祖父母的遺傳性在孫代中各占1/4等等。依次類推,融合遺傳學(xué)說(shuō)只能解釋一部分?jǐn)?shù)量性狀的遺傳現(xiàn)象,不能解釋其全部,對(duì)絕大多數(shù)非數(shù)量性狀則完全不適合。(6).獲得性狀遺傳(Inheritance
of
acquired
characters)法國(guó)學(xué)者拉馬克(Lamarck,1744-1829)認(rèn)為個(gè)體由于在長(zhǎng)時(shí)間受到環(huán)境條件的影響,使生物發(fā)生變異,獲得了新的性狀,經(jīng)過(guò)世代的積累加深了這個(gè)新的性狀,如果雌雄兩性都獲得這種共同的變異,那么這種變異便可以傳給后代。1856-1863
孟德爾
著名的豌豆實(shí)驗(yàn)涉及基因分離1866
孟德爾《植物雜交實(shí)驗(yàn)》(Experimentson
plant
hybrids)提出了遺傳學(xué)的兩個(gè)基本定律:分離定律和自由組合定律(孟德爾
)1859達(dá)爾文
《
物種起源
》
現(xiàn)代進(jìn)化理論1871米歇爾從細(xì)胞核中分離出nuclein(核素)1875赫特維希指出受精是雌雄兩原核融合1.4.2
孟德爾以后的遺傳學(xué)發(fā)展
遺傳學(xué)的孕育期-19001882-1885strasburgar
and
Flemming證明細(xì)胞核含有染色體。1900
孟德爾定律重新發(fā)現(xiàn)
突變理論
荷蘭
de
Vries
(費(fèi)里斯)
《論雜交分離的定律》
月見草
遺傳基礎(chǔ)研究
德國(guó)
Correns(柯倫斯)
《雜交分離的孟德爾定律》
玉米
植物育種
奧地利
Tschermak
(丘歇馬克)
《豌豆的人工雜交》
豌豆
他們的論文都刊登在1900年出版的《德國(guó)植物學(xué)會(huì)雜志》上,各自獨(dú)立地證明遺傳的孟德爾原理,這就是遺傳學(xué)史上的孟德爾定律的重新發(fā)現(xiàn)。
1900年遺傳學(xué)作為一門獨(dú)立的學(xué)科正式誕生了(1)細(xì)胞遺傳學(xué)時(shí)期1901年
W.sutton
研究蝗蟲
;
T.Bovert
研究海膽觀察:染色體的減數(shù)分裂行為,孟德爾因子分離和自由組合與染色體的分離和自由組合一致,他們大膽地認(rèn)為孟德爾因子就在染色體上。
提出Chromosome
theory
of
heredity(遺傳的染色體假說(shuō))19021905
willian
E,Castle
首先認(rèn)識(shí)等位基因和基因型頻率之間的關(guān)系willan
Bateson
將遺傳的科學(xué)稱為遺傳學(xué)
the
Science
of
heredity
:“genetics”1909W.Johannsen基因、基因型、表現(xiàn)型概念用基因取代“因子”﹑“性狀”和“特性”等含糊概念。1910-1939細(xì)胞遺傳學(xué)時(shí)期(摩爾根):1910T.H.Morgan果蠅sex-linked
inheritance通過(guò)果蠅實(shí)驗(yàn)提出基因連鎖定律,用實(shí)驗(yàn)證明基因位于染色體上。白眼→伴性遺傳→一個(gè)特點(diǎn)基因位于一個(gè)特定的染色體上。遺傳連鎖圖19131927A.H.Sturtevant
H.J.Mullerχ-射線誘導(dǎo)染色體突變
人工改變基因的實(shí)驗(yàn)
摩爾根(1866-1945)《基因論》——?jiǎng)?chuàng)立“基因?qū)W說(shuō)”
提出染色體遺傳理論:細(xì)胞遺傳學(xué);1933年獲諾貝爾獎(jiǎng)摩爾根學(xué)派染色體——基因理論:
基因是控制遺傳性狀的單位,并以直線排列染色體上;
生物的某種性狀是受一個(gè)或幾個(gè)基因控制;
染色體上基因的變化(或突變)是生物性狀變異和生物進(jìn)化的直接原因;提出遺傳學(xué)的第三定律
論證﹑概括和總結(jié)了遺傳學(xué)的三大定律:
分離﹑自由組合和基因連鎖交換定律。(2)生化和微生物遺傳學(xué)時(shí)期
1923年
A.Garrod(枷羅德)英國(guó)醫(yī)生(生化遺傳),進(jìn)行家譜研究
,撰寫“Inborn
Errors
of
Metabolism”《先天性代謝病》
鑒別了第一個(gè)人類遺傳病,黑尿?。ㄈ蹦蚝谒嵫趸福?。他認(rèn)為這種疾病是由于單個(gè)基因發(fā)生突變后,產(chǎn)生一種不具功能的產(chǎn)物,從而導(dǎo)致代謝紊亂(
metabolic
disorder)
。提出“一個(gè)突變基因決定一種代謝紊亂”的觀點(diǎn),但在當(dāng)時(shí)未受到廣泛的關(guān)注。
1927
F.Griffith(格里菲思)
肺炎鏈球菌的轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)
為了證明遺傳物質(zhì)是DNA,但沒有進(jìn)行單因子轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)
1944
O.T.Avery
進(jìn)行單因子轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)
證明DNA是遺傳物質(zhì)
肺炎鏈球菌的轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)(a)將S型肺炎鏈球菌注入小鼠體內(nèi),小鼠被殺死;(b)將R型肺炎鏈球菌注入小鼠體內(nèi),小鼠仍活著;(c)將加熱滅活的S型菌株注入小鼠體內(nèi),小鼠仍活著;(d)將R型菌株與加熱滅活的S型菌株混合后注入小鼠體內(nèi),小鼠被殺死。1940-1953細(xì)胞遺傳學(xué)向分子遺傳學(xué)過(guò)渡階段1941
G.W.Beadle
&
E.L.Tatum分離出紅色面包菌(Neurospora
crassa)的突變型
提出
“一個(gè)基因一個(gè)酶”的假說(shuō)
(one
gene-one
enzyme)
酶1
酶2
酶3
前體→鳥氨酸→瓜氨酸→精氨酸后來(lái)被修改為:“一個(gè)基因一種多肽”
(one
gene-one
polypeptide)圖1-401946J.Lederberg
&
Tatum_
細(xì)菌的結(jié)合實(shí)驗(yàn)
多營(yíng)養(yǎng)缺陷型之間進(jìn)行雜交
_
_
_
_Met
bio
Thr+Leu+thi+
╳
Met+bio+Thr
Leu
thi
硫胺(VB1)
Met+Thr+Leu+thi+(營(yíng)養(yǎng)型)1950Barbara
McClintock
玉米Ac-Ds系統(tǒng)
可移動(dòng)因子
轉(zhuǎn)座因子說(shuō)明遺傳物質(zhì)不是不變的,基因是可以移動(dòng)的。
圖1-381953James
Watson,Francis
Crick
DNA雙螺旋模型(圖1-41)
該模型被認(rèn)為是二十世紀(jì)生物學(xué)方面最偉大的發(fā)現(xiàn),是分子遺傳學(xué)誕生的標(biāo)志。1953~1957
進(jìn)入分子遺傳學(xué)時(shí)期:H.Fraenkel-Conrat
&
B.Singer煙草花葉病毒的重建(圖1-47),證明TMV的遺傳物質(zhì)是RNA。1958M.Meselson(梅塞爾森)
&
Stahl(史塔爾)
密度梯度超速離心實(shí)驗(yàn)(圖1-49)
證明DNA復(fù)制是半保留的。1958
~
1972重組DNA技術(shù)體系的建立1958Arthur
Kornberg從E.coli中分離出DNA聚合酶Ⅰ為分子遺傳學(xué)的開展、遺傳工程的進(jìn)行、人工合成基因奠定了基礎(chǔ)。1959Serero
Ochoa
(奧喬亞)從微生物棕色固氮菌(Azotobacter
vinelandi)分離出RNA
polymerase
I為遺傳密碼的破譯提供了實(shí)驗(yàn)方法和手段
siderey
Brener發(fā)現(xiàn)mRNAFramcois
JacobMathew
Meselson1961Framcois
Jacob
&Jacques
Monod提出乳糖操縱子模型現(xiàn)代分子遺傳學(xué)基因調(diào)控研究的一個(gè)重要的里程碑1965Robert
Holley
測(cè)得第一個(gè)tRNA分子的序列1966Marshall
Nirenberg
&H
Gobind
Khorana破譯遺傳密碼(
圖1-45)1967發(fā)現(xiàn)DNA連接酶1970
H.O.Smith等發(fā)現(xiàn)并分離出流感嗜血桿菌中的內(nèi)切酶H.M.Temin(梯明)&D.Baltimore在RNA腫瘤病毒中分離出反轉(zhuǎn)錄酶1972Paul
Berg(伯格)等首次完成DNA分子重組(體外重組DNA)1975Edward.M.SouthernSouthern
Blotting1976Walter
GilbertφⅩ174=
5387ntFrederick
Sanger
Phillip
Sharp
等建立DNA序列測(cè)定法(圖1-44)
(圖1-42)發(fā)現(xiàn)真核生物基因中存在內(nèi)含子
基因不連續(xù)概念(圖1-37)1983Thomas
CechSidney
AltmanRNA的自我拼接Catalytic
RNAs1986
Kary
Mullis
and
othersPolymerase
Chain
Reaction
(PCR)
(圖1-46)1989
L.C.Tsui
and
John
Riordan
,and
Francis
collins’s
group.鑒別和克隆了人類基因cystic
fibrosis(囊性纖維細(xì)胞)1990
James
Watson
and
many
other
scientist
Human
Genome
project
測(cè)療,圖譜
30億美元
30億個(gè)堿基,8-10萬(wàn)個(gè)基因。標(biāo)志著生物科學(xué)研究全面進(jìn)入基因組研究時(shí)期1992歐洲共同體各國(guó)35個(gè)實(shí)驗(yàn)室首先發(fā)表第一個(gè)真核生物染色體(酵母染色體III)DNA全序列(共315000bp)1995
完成了酵母基因組DNA(125×105bp)全序列的測(cè)定工作1997線蟲基因圖譜繪測(cè)成功(f1-8)199820002002完成人22號(hào)染色體DNA核苷酸全序列測(cè)定人的基因組全序列測(cè)定(工作草圖)
(圖1-48)
老鼠基因組物理圖測(cè)定
(1-51)2002年水稻基因組框架圖完成2004年家蠶基因組
框架圖完成基因組大?。?50
Mb基因數(shù)目:18510西南農(nóng)業(yè)大學(xué)等,Science,2004年12月10日2004年雞基因組框架圖完成
紅原雞基因組家雞(肉雞、蛋雞、烏雞)基因組多態(tài)性基因組大?。?050
Mb基因數(shù)目:20000-23000
(其中有60%與人類相同)平均每千個(gè)堿基5個(gè)變異位點(diǎn)
是人的變異率的6到7倍是大猩猩變異率的3倍2004年12月9日、西班牙組成的國(guó)際科研小組宣布,初步完成了黑猩猩基因組序列草圖,發(fā)表于9月1日出版的Nature上。
基因組大?。杭s3000
Mb與人類基因組DNA序列相似性:99%
考慮插入、缺失:96%
共同基因:29%
2005年黑猩猩基因組
框架圖完成8月31日美國(guó)、德國(guó)、以色列、意大利2006截至2008年1月人類基因組計(jì)劃ENCODE計(jì)劃
Project
Jim美國(guó)腫瘤基因組計(jì)劃HapMap計(jì)劃
蛋白質(zhì)組計(jì)劃
1、
國(guó)際人類基因組‘單體型圖’計(jì)劃“國(guó)際人類基因組‘單體型圖’計(jì)劃”(HapMap)是繼“國(guó)際人類基因組計(jì)劃”之后,人類基因組研究領(lǐng)域的又一重大研究計(jì)劃。其目的是在通過(guò)測(cè)序了解了遺傳基本信息的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步確立世界上主要族群基因組的遺傳變異圖譜。HapMap計(jì)劃是由加拿大、中國(guó)、日本、尼日利亞、英國(guó)和美國(guó)共同資助和合作進(jìn)行的項(xiàng)目,旨在建立一個(gè)將幫助研究者發(fā)現(xiàn)人類疾病及其對(duì)藥物反應(yīng)的相關(guān)基因的公眾資源。
這一計(jì)劃的主要內(nèi)容是對(duì)亞、非、歐裔全基因組中DNA序列上的多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)定和分析
,由此構(gòu)建出整合了人類遺傳多態(tài)信息的每條染色體的“單體型圖”,為疾病易感性、藥物敏感性、遺傳多態(tài)性等研究提供最基本的信息與工具。“國(guó)際人類基因組‘單體型圖’計(jì)劃”將以世界亞、非、歐三大族群為研究對(duì)象,三大群體樣本各占三分之一。其中,中國(guó)漢族將提供一半的亞裔樣本,即占世界樣本的六分之一。什么是單體型圖?意義:人類單體型圖的繪制,將為不同群體的遺傳
多態(tài)性研究、疾病和遺傳關(guān)聯(lián)分析、治病基因和治病因子的確定、藥效及副作用和疾病風(fēng)險(xiǎn)的分析、人類起源進(jìn)化遷徙歷史的研究等提供完整的人類基因組信息和有效的研究工具。將為人類常見疾病的研究提供最強(qiáng)大、最經(jīng)濟(jì)的工具。2
、
ENCODE計(jì)劃The
Encyclopedia
of
DNA
Elements
Project
:即“DNA元件百科全書計(jì)劃”,簡(jiǎn)稱ENCODE計(jì)劃完成人類基因組全序列測(cè)定后,2003年9月由美國(guó)國(guó)立人類基因組研究所(National
Human
Genome
Research
Institute)組織的又一個(gè)重大的國(guó)際合作計(jì)劃其目的是解碼基因組的藍(lán)圖,鑒定人類基因組中包括基因、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、抑制子/沉默子、內(nèi)含子、復(fù)制原點(diǎn)等已知的和還不知功能的多個(gè)物種的保守序列等在內(nèi)的所有功能元件。ENCODE計(jì)劃中提出的每一類元件都是已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)過(guò)的,所不同的是現(xiàn)在要在全基因組的范圍內(nèi)進(jìn)行系統(tǒng)的研究。ENCODE計(jì)劃的實(shí)施分為3個(gè)階段:試點(diǎn)階段(
a
pilot
phase)、技術(shù)發(fā)展階段(a
technology
development
phase)和生產(chǎn)階段(a
producttion
phase)試點(diǎn)階段:首先集中對(duì)按一定標(biāo)準(zhǔn)選擇的人類基因組中約1%的序列,共長(zhǎng)30Mb,分布在不同染色體上的44個(gè)靶區(qū)(ENCODE
targets)序列,例如α-和β-珠蛋白基因族、囊性纖維化跨膜傳導(dǎo)調(diào)節(jié)蛋白基因CFTR等進(jìn)行解碼注釋,并評(píng)估現(xiàn)有各種鑒別基因組元件的策略方法正確與否,確定一套有效程序,促進(jìn)發(fā)展高通量更準(zhǔn)確的基因組功能元件的鑒別技術(shù)方法。技術(shù)發(fā)展階段:與試點(diǎn)階段同時(shí)進(jìn)行的,其主要目標(biāo)是設(shè)計(jì)發(fā)明新的實(shí)驗(yàn)方法和計(jì)算方法來(lái)改進(jìn)我們鑒別新的功能序列和發(fā)現(xiàn)新的基因組功能元件的能力。生產(chǎn)階段是利用以上兩個(gè)階段所建立的成熟的技術(shù)和方法,對(duì)人類基因組其余99%的基因組序列進(jìn)行高效益的全面分析(Science
2004,306:636-640)。ENCODE計(jì)劃聯(lián)合體(Consortium):11個(gè)國(guó)家
80家科研機(jī)構(gòu)
35個(gè)研究小組2007年6月
《Nature》和《Genome
Research》報(bào)道其4年來(lái)研究的主要成果:研究表明人類基因組的大多數(shù)DNA都會(huì)被轉(zhuǎn)錄成RNA,即基因組中的堿基大多會(huì)出現(xiàn)在原始轉(zhuǎn)錄物中,包括非蛋白編碼轉(zhuǎn)物錄和重疊轉(zhuǎn)錄物等,因此,人類基因組實(shí)際上是一個(gè)非常復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò);對(duì)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究,確定了許多以前不為人知的DNA轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)位點(diǎn),在基因之外的調(diào)控區(qū)域新發(fā)現(xiàn)了4491個(gè)轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)位點(diǎn),對(duì)轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)位點(diǎn)有了新的認(rèn)識(shí),包括它與特異性調(diào)控序列、組蛋白修飾和染色質(zhì)可接近性等之間的聯(lián)系。推翻了傳統(tǒng)觀點(diǎn)的認(rèn)識(shí),調(diào)控區(qū)域也有可能位于DNA轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)位點(diǎn)的下游;進(jìn)一步認(rèn)識(shí)了染色質(zhì)結(jié)構(gòu),以及它與DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄調(diào)控之間相互關(guān)系的復(fù)雜性;通過(guò)哺乳動(dòng)物種間和種內(nèi)的序列比較,對(duì)人類基因組在功能與進(jìn)化上又有了新的認(rèn)識(shí),研究表明大約一半人類基因組中的功能元件在進(jìn)化過(guò)程中不會(huì)受到很大限制。以上這些新的成果挑戰(zhàn)了關(guān)于人類基因組的傳統(tǒng)理論,說(shuō)明人類基因藍(lán)圖不是由孤立的基因和大量“垃圾DNA片段”組成的,而是一個(gè)復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),單個(gè)基因、調(diào)控元件以及與編碼蛋白無(wú)關(guān)的其他類型的DNA序列一道,以交疊的方式相互作用,共同控制著人類的生理活動(dòng)。與人類基因組計(jì)劃相比,“ENCODE計(jì)劃”的顯著特點(diǎn)是:采用綜合性研究策略,重視新技術(shù)的研究與開發(fā),將計(jì)劃向?qū)W術(shù)界和公司開放。ENCODE計(jì)劃的實(shí)施為進(jìn)一步認(rèn)識(shí)人類基因組的功能藍(lán)圖開辟了道路。?
ENCODE數(shù)據(jù)的主要門戶網(wǎng)址:/ENCODE?
ENCODE原始數(shù)據(jù)的門戶網(wǎng)址:/projects/geo/info/ENCODE.htmlhttp://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/?
ENCODE聯(lián)合體的信息網(wǎng)址:/ENCODE
3
、
Project
Jim:世界首份“個(gè)人版”
全基因組圖譜面世?——
諾貝爾獎(jiǎng)得主“DNA之父”
詹姆斯·沃森
(James
Watson)的“生命天書”
1953年,沃森與克里克共同提出了DNA分子結(jié)構(gòu)的雙螺旋模型,由于其對(duì)DNA分子結(jié)構(gòu)的貢獻(xiàn),因而在1962年他們與威爾金斯共同獲得諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng),他們因此被譽(yù)為“DNA之父”。?2007年5月30日,隨著“吉姆工程(Project
Jim)”的完成,79歲的沃森博士獲得了一張由美國(guó)貝勒醫(yī)學(xué)院人類基因組測(cè)序中心和“454生命科學(xué)公司(454
Life
Sciences
Corporation)”共同合作完成的、儲(chǔ)存著沃森自己全基因組序列的DVD光盤,成為世界首份
“個(gè)人版”基因組圖譜的擁有者(Nature
1
June
2007,在線發(fā)表;doi:10.1038/
news
070528-10)。?這是從2003年人類基因組全序列圖譜完成以來(lái)分子遺傳學(xué)和基因組學(xué)研究領(lǐng)域的又一偉大成就。首先,這標(biāo)志著人類基因組測(cè)序技術(shù)的快速改進(jìn)和提高,所花時(shí)間和金錢大幅下降。1990年啟動(dòng)的“人類基因組”計(jì)劃用了13年才完成全序列圖譜的繪制,耗資近10億美元(預(yù)計(jì)為30億美元,但實(shí)際支出由于技術(shù)的更新而減少很多)。而這次沃森的圖譜繪制采用了一種新的測(cè)序技術(shù)——
Genome
Sequencer
FLX(TM)systems,不但極大地提高了測(cè)序效率,而且僅耗時(shí)2個(gè)月,花費(fèi)僅100萬(wàn)美元;第二,2007年5月31日,沃森的基因組圖譜被收入到美國(guó)國(guó)家健康協(xié)會(huì)的數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.
nlm.
/
Traces/
trace.cgi),并向全世界公開,研究者可以從中找到被認(rèn)為與基因有關(guān)的疾病、智力、冒險(xiǎn)精神、信仰和性格等問(wèn)題的密碼。沃森希望通過(guò)自己的行動(dòng)帶動(dòng)更多的人進(jìn)行基因測(cè)序。他認(rèn)為,了解這些信息有助于提早預(yù)防癌癥、心臟病、阿爾茨海默氏癥等多種頑疾,甚至還能讓人更富有同情心。這標(biāo)志著個(gè)人基因組時(shí)代的到來(lái);4、
黃種人基因組序列測(cè)定的完成?
我國(guó)科學(xué)家2007年10月11日對(duì)外宣布,已經(jīng)成功繪制完成
第一個(gè)完整中國(guó)人基因組圖譜(又稱“炎黃一號(hào)”),這也
是第一個(gè)亞洲人全基因序列圖譜。該項(xiàng)目是我國(guó)科學(xué)家繼
承擔(dān)國(guó)際人類基因組計(jì)劃1%任務(wù)、國(guó)際人類單體型圖譜
10%任務(wù)后,用新一代測(cè)序技術(shù)獨(dú)立完成的100%中國(guó)人
基因組圖譜。專家表示,這項(xiàng)在基因組科學(xué)領(lǐng)域里程碑式
的科學(xué)成果,對(duì)于中國(guó)乃至亞洲人的DNA、隱形疾病基因
、流行病預(yù)測(cè)等領(lǐng)域的研究具有重要作用。?
該項(xiàng)目由來(lái)自深圳華大基因研究院、生物信息系
統(tǒng)國(guó)家工程研究中心及中國(guó)科學(xué)院北京基因研究
所的科學(xué)家共同發(fā)起并承擔(dān)。該項(xiàng)目執(zhí)行博士王
俊說(shuō),遺傳保證了生命的延續(xù),而突變產(chǎn)生了不
同物種以及人與人之間的差異。不同族群有著各
自獨(dú)特的遺傳背景,對(duì)不同病的易感性也可能不
一樣。只有真正了解基因與疾病的關(guān)系,才能根
據(jù)每個(gè)個(gè)體的基因進(jìn)行疾病預(yù)測(cè)和檢測(cè),及早做
出預(yù)防方案或進(jìn)行針對(duì)性治療。“人類基因組計(jì)劃是由6國(guó)科學(xué)家共同努力完成的,現(xiàn)在中國(guó)人靠自己的努力獨(dú)立完成‘炎黃一號(hào)’100%的工作量,這是一個(gè)歷史性的跨越?!?/p>
有人將個(gè)體全基因組序列圖稱為“人體的第二張解剖圖”,其作用是通過(guò)分析人體染色體堿基序列,獲得個(gè)人基因組,以幫助預(yù)防遺傳疾病,并實(shí)現(xiàn)個(gè)性化治療。目前全世界共發(fā)現(xiàn)2000個(gè)與疾病有關(guān)的人類基因,其中1500個(gè)已在美國(guó)用于臨床診斷?;蝾A(yù)測(cè)、基因預(yù)防、基因診斷、基因治療將使整個(gè)醫(yī)學(xué)改觀。5
、國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃“人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃”是繼“人類基因組計(jì)劃”之后最大規(guī)模的國(guó)際性科技工程,也是21世紀(jì)第一個(gè)重大國(guó)際合作計(jì)劃,其首批行動(dòng)計(jì)劃包括:由美國(guó)牽頭的“人類血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃”由我國(guó)牽頭的“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”(簡(jiǎn)稱HLPP)。HLPP是第一個(gè)人類組織/器官蛋白質(zhì)組計(jì)劃,也將是我國(guó)第一次領(lǐng)導(dǎo)的重大國(guó)際協(xié)作計(jì)劃。HLPP的科學(xué)目標(biāo)完成“二譜、二圖、三庫(kù)”任務(wù):構(gòu)建蛋白質(zhì)表達(dá)全譜和蛋白質(zhì)修飾譜;繪制蛋白質(zhì)相互作用連鎖圖和細(xì)胞定位圖;建立符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的肝臟標(biāo)本庫(kù);發(fā)展規(guī)模化抗體制備技術(shù)并建立肝臟蛋白質(zhì)抗體庫(kù);建立完整的肝臟蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù);尋找藥物作用靶點(diǎn)和探索肝臟疾病防治診治的新思路和新方案。
2006年安德魯·法爾和克雷格·梅洛因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)了RNA(核糖核酸)干擾機(jī)制而獲得諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng),因?yàn)樗麄儭鞍l(fā)現(xiàn)了控制遺傳信息流動(dòng)的基本機(jī)制”,RNA干擾已被廣泛用作研究基因功能的一種手段,并有望在未來(lái)幫助科學(xué)家開發(fā)出治療疾病的新療法。
法爾出生于1959年,1983年獲美國(guó)麻省理工學(xué)院生物學(xué)博士學(xué)位,現(xiàn)任斯坦福醫(yī)學(xué)院病理學(xué)和遺傳學(xué)教授。梅洛出生于1960年,1990年獲得哈佛大學(xué)生物學(xué)博士學(xué)位,現(xiàn)任馬薩諸塞州醫(yī)學(xué)院分子醫(yī)學(xué)教授。6
、
美國(guó)腫瘤基因組計(jì)劃?
“腫瘤基因組計(jì)劃”預(yù)計(jì)在未來(lái)13年里找出肺癌、腦癌、卵
巢癌等所有困擾人類癌癥的致癌基因元兇,從而診斷、治
療這一“絕癥”。研究人員表示,癌癥有很多種。每個(gè)腫瘤
都有自己獨(dú)特的基因藍(lán)圖。同時(shí),即使是同一種癌癥致病
的原因也不盡相同。而通過(guò)“腫瘤基因組計(jì)劃”,全球科學(xué)
家希望協(xié)力逐一解開所有癌癥的秘密,進(jìn)而建立一個(gè)共享
數(shù)據(jù)庫(kù)。屆時(shí),這一計(jì)劃就能真正造福于人類健康。?
美國(guó)準(zhǔn)備投入1億美元,用3年時(shí)間在DNA序列上找出與某
些癌癥相關(guān)的基因變異。考慮到腦癌、肺癌和卵巢癌,是
美國(guó)人健康的主要隱患。該計(jì)劃決定先完成這3種癌癥的
基因圖譜。7
、美英三科學(xué)家因干細(xì)胞研究的貢獻(xiàn)獲諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)?
8
October
2007?
The
Nobel
Assembly
at
Karolinska
Institutet
hastoday
decided
to
award?
The
Nobel
Prize
in
Physiology
or
Medicine
for
2007jointly
to:?
Mario
R.
Capecchi,
Martin
J.
Evans
and
OliverSmithies?
for
their
discoveries
of
"principles
for
introducing
specific
gene
modifications
in
mice
by
the
use
of
embryonic
stem
cells"獲獎(jiǎng)?wù)吆?jiǎn)介馬利歐·卡佩奇1937年出生
在意大利,后獲得美國(guó)國(guó)籍
。1967年獲美國(guó)哈佛大學(xué)
生物物理學(xué)博士學(xué)位,在
霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所工
作,還擔(dān)任猶他大學(xué)人類遺
傳學(xué)和生物學(xué)教授??ㄅ迤?/p>
因在“基因靶向”技術(shù)的研究
上做出了開創(chuàng)性工作而成名
。埃文斯1941年出生在英國(guó),1963年從劍橋大學(xué)畢業(yè)后,進(jìn)入倫敦大學(xué)學(xué)院學(xué)習(xí),獲得解剖學(xué)和胚胎學(xué)博士學(xué)位。1978年,他返回劍橋大學(xué)工作。3年后,他和同事從小鼠胚胎中第一次成功分離出未分化的胚胎干細(xì)胞。這為“基因靶向”技術(shù)提供了施展本領(lǐng)的空間。如今,埃文斯在英國(guó)加的夫大學(xué)擔(dān)任哺乳動(dòng)物遺傳學(xué)教授。獲獎(jiǎng)?wù)吆?jiǎn)介?
Oliver
Smithies,born
1925
in
GreatBritain,
US
citizen,PhD
in
Biochemistry1951,
OxfordUniversity,
UK.Excellence
Professorof
Pathology
andLaboratory
Medicine,University
of
NorthCarolina
at
ChapelHill,
NC,
USA.?奧利弗·史密斯1925年生于英國(guó),后獲美國(guó)國(guó)籍。1951年獲牛津大學(xué)生物化學(xué)博士學(xué)位,現(xiàn)在美國(guó)北卡羅來(lái)納大學(xué)工作。他一開始主要進(jìn)行胰島素的研究工作,后轉(zhuǎn)入分子生物學(xué)領(lǐng)域。在近60歲時(shí),他開發(fā)出了可關(guān)閉活體內(nèi)特定基因的技術(shù)。史密斯和卡佩基幾乎同時(shí)對(duì)“基因靶向”技術(shù)做出了奠基性貢獻(xiàn),這一技術(shù)使得科學(xué)家能培育出擁有特定變異基因的小鼠。獲獎(jiǎng)成就介紹這三位科學(xué)家是因?yàn)椤霸谏婕芭咛ジ杉?xì)胞和哺乳動(dòng)物DNA重組方面的一系列突破性發(fā)現(xiàn)”而獲得這一殊榮的。這些發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致了一種通常被人們稱為“基因打靶”的強(qiáng)大技術(shù)。這一國(guó)際小組通過(guò)利用胚胎干細(xì)胞在老鼠身上引入特定基因修飾。以上工作為胚胎發(fā)育、衰老和疾病治療指引了道路,有助于對(duì)囊腫性纖維化、心臟病、糖尿病和癌癥等疾病的研究?;虼虬屑夹g(shù)三.遺傳學(xué)與生物學(xué)其他領(lǐng)域以及與國(guó)民經(jīng)濟(jì)的關(guān)系1.遺傳學(xué)從各個(gè)層次上把生命科學(xué)連成一個(gè)整體
遺傳問(wèn)題只有在各個(gè)層次上進(jìn)行研究,才能揭露出其它的本質(zhì)。產(chǎn)物基因基因結(jié)構(gòu)
表型基因表達(dá)遺傳學(xué)研究的對(duì)象十分廣泛:從低等生物到高等生物:病毒遺傳學(xué)微生物遺傳學(xué)藻類遺傳學(xué)植物遺傳學(xué)動(dòng)物遺傳學(xué)人類遺傳學(xué)生態(tài)遺傳學(xué)
群體遺傳學(xué)
細(xì)胞遺傳學(xué)根據(jù)不同層次:染色體遺傳學(xué)
分子遺傳學(xué)
量子遺傳學(xué)以遺傳學(xué)為核心和紐帶,
使生物由宏觀到微觀聯(lián)系到了一起。2.遺傳學(xué)成為生命科學(xué)中最富有綜合性的中心學(xué)科
遺傳學(xué)涉及生物學(xué)三大基本問(wèn)題:
⑴
生物遺傳變異問(wèn)題
⑵
生物進(jìn)化問(wèn)題
⑶
生命起源問(wèn)題
遺傳現(xiàn)象的普遍性,決定了遺傳學(xué)是最具有綜合性的學(xué)科。
在科學(xué)上的作用是:解釋生物遺傳變異與進(jìn)化的原因,闡明生物進(jìn)化的遺傳機(jī)理;揭示高等和低等生物的遺傳規(guī)律;認(rèn)識(shí)生命本質(zhì)(DNA、蛋白質(zhì))等等。
在生物學(xué)各研究領(lǐng)域強(qiáng)調(diào)了遺傳學(xué)的中心作用。
進(jìn)化、發(fā)育和遺傳的共同基礎(chǔ)是基因
遺傳、發(fā)育、進(jìn)化在基因水平上的統(tǒng)一。遺傳學(xué)有助于解決進(jìn)化和發(fā)育機(jī)理問(wèn)題,對(duì)遺傳學(xué)基本原理的理解,是充分了解生理、生化、發(fā)育以及進(jìn)化的各類生命現(xiàn)象的先決條件。遺傳與生理、生化、發(fā)育、進(jìn)化等密切相關(guān),對(duì)相應(yīng)的分支學(xué)科影響深遠(yuǎn)。1.3
遺傳學(xué)的應(yīng)用⑴直接指導(dǎo)農(nóng)業(yè)科學(xué)(豐富和更新育種新技術(shù))①高產(chǎn)優(yōu)勢(shì)新品種②抗蟲抗病農(nóng)作物如:“雜交水稻”
“雜交油菜”
“雜交小麥”如:抗蟲棉新品種③
改進(jìn)食用動(dòng)物的品質(zhì)
如:牛、羊、豬優(yōu)良品種的培育⑵生物制藥:利用植物大量生產(chǎn)人體蛋白利用遺傳工程技術(shù)生產(chǎn)抗菌素、胰島素、干擾素、生長(zhǎng)激素尿激酶、疫苗等。轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物。⑶指導(dǎo)醫(yī)學(xué)研究,提高健康水平:診斷和治療,
有效地治療人類的一些遺傳性疾病。
例如分子遺傳學(xué)已成功地應(yīng)用在于:
人工分離基因;人工合成基因;人工轉(zhuǎn)移基因;克隆技術(shù)應(yīng)用;
基因工程定向改變遺傳性狀,可以更自由和有效地改變生物性狀;
打破物種界限,克服遠(yuǎn)緣雜交困難;培育優(yōu)良動(dòng)、植物新品種;
遺傳學(xué)的進(jìn)步帶動(dòng)生產(chǎn)的發(fā)展,國(guó)家財(cái)力雄厚能提供更多的經(jīng)費(fèi)支持遺傳學(xué)的研究。
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20037.Genetics
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Genomes,Leland
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McGraw-Hill
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,1997謝謝!本章結(jié)束返回圖1-37返回圖1-38返回圖1-39返回圖1-40返回圖1-41返回圖1-42返回圖1-44返回圖1-44返回圖1-45圖1-46返回圖1-47返回正常煙草葉煙草“花葉”煙草花葉病毒(tobaccomosaicvirus,
TMV)圖1-48返回圖1-49返回1-51返回返回孟德爾(1822-1884)孟德爾簡(jiǎn)介
約翰·孟德爾(Johann
Mendel)
1822年7月22日出生在奧地利莫拉維亞(Moravia)
海欽多大(Heinzendorf)
村(現(xiàn)已劃歸捷克)
,農(nóng)民家庭,排行第二,是家中唯一的男孩。6歲上小學(xué),勤奮好學(xué)、成績(jī)突出。由于家境貧寒,付不起學(xué)費(fèi),高中階段的學(xué)習(xí)生活十分拮據(jù)。高中畢業(yè)后,他打算進(jìn)厄爾姆茲學(xué)院(Olmults)
大學(xué)預(yù)科學(xué)習(xí)。不幸的是,由于他父親健康狀況不佳而無(wú)力供養(yǎng)他繼續(xù)深造。最困難的時(shí)刻,孟德爾的妹妹變賣自己的嫁妝,資助他完成了學(xué)業(yè)。這使他永生難忘,并且把感激化為學(xué)習(xí)的動(dòng)力,學(xué)業(yè)一直名列前茅。然而,家境的窘迫,難以圓他大學(xué)之夢(mèng)。孟德爾意識(shí)到,必須先要找到一份可以聊生的職業(yè),才有可能繼續(xù)深造。他接受了老師的建議,于1843年9月進(jìn)入布隆(Brūnn,現(xiàn)名Brno)市的修道院當(dāng)了一名修道士,Gregor是他的教名。布隆是莫拉維亞省首府,也是奧匈帝國(guó)工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和經(jīng)濟(jì)中心。修道院擁有一個(gè)藏書20000冊(cè)的圖書館,可和當(dāng)時(shí)的大學(xué)圖書館媲美,也是當(dāng)時(shí)全市宗教和文化中心。教士們文化素質(zhì)很高,不少牧師都有正式的園藝、音樂(lè)、哲學(xué)等學(xué)位。在修道院,孟德爾進(jìn)行了系統(tǒng)的宗教學(xué)習(xí),成績(jī)突出,僅用3年時(shí)間就完成了4年的學(xué)業(yè)。學(xué)習(xí)結(jié)束,孟德爾被任命為教區(qū)教士,但
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