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分子生物學(xué)第五次課第一頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日轉(zhuǎn)錄(
transcription
)——生物體以DNA為模板合成RNA的過(guò)程轉(zhuǎn)錄RNADNA
第二頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日一、與RNA生物合成的相關(guān)概念1.轉(zhuǎn)錄單位:
從啟動(dòng)子延伸到終止子所跨越的DNA部分稱為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位。2.啟動(dòng)子:指DNA分子上被RNA聚合酶識(shí)別并結(jié)合形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的區(qū)域,還包括一些調(diào)節(jié)蛋白因子的結(jié)合序列。3.終止子:在轉(zhuǎn)錄的過(guò)程中提供轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的序列成為終止子第三頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日RNA的作用及種類RNA主要以單鏈形式存在于生物體內(nèi),負(fù)擔(dān)著儲(chǔ)藏及轉(zhuǎn)移遺傳信息的功能,又能作為核酶在細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮代謝功能。生物體內(nèi)共有3種RNA:mRNA
rRNAtRNA第四頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日DNA
mRNAtRNArRNA蛋白質(zhì)第五頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日生物信息的傳遞從DNA到RNA蛋白質(zhì)ArgGlyTyrDNA5’3’C----GG----CT-----AG----CG----CA----TT----AA----CC----G3’5’mRNA5’CGUGGAUAC3編碼鏈又稱有義鏈模板鏈又稱反義鏈第六頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日
模板
5335模板鏈編碼鏈(codingstrand)結(jié)構(gòu)基因(structuralgene
)編碼鏈模板鏈(templatestrand)
第七頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄
(asymmetrictranscription)在DNA分子雙鏈上某一區(qū)段,一股鏈可轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;
模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一單鏈上。第八頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日二、參
與
轉(zhuǎn)
錄
的
物
質(zhì)原料:4種NTP
(ATP,UTP,GTP,CTP)
模板:DNA酶:RNA聚合酶其他蛋白質(zhì)因子第九頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日36512決定哪些基因被轉(zhuǎn)錄150618催化功能
155613結(jié)合DNA模板
70263
辨認(rèn)起始點(diǎn)
ω
110000?
亞基分子量功能1.RNA聚合酶
原核生物的RNA聚合酶
:第十頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日核心酶coreenzyme全酶holoenzyme第十一頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日2.真核生物的RNA聚合酶
種類
Ⅰ
Ⅱ
Ⅲ
對(duì)鵝膏蕈堿的反應(yīng)45S-rRNAhnRNA
5S-rRNAtRNA、snRNA耐受極敏感中度敏感轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物胞內(nèi)定為核仁核質(zhì)核質(zhì)第十二頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日
所有三種RNA聚合酶均有其對(duì)應(yīng)的啟動(dòng)子和終止子。以聚合酶Ⅲ所識(shí)別的啟動(dòng)子研究得最多,并發(fā)現(xiàn)這種啟動(dòng)子很奇怪──不是位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的前面,而是在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游(+50-+83)。
RNA聚合酶Ⅱ合成hnRNA,它是最直接和遺傳調(diào)節(jié)相關(guān)的酶。因此對(duì)聚合酶Ⅱ的研究是目前的熱點(diǎn)之一。第十三頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日3.模板和酶的辨認(rèn)、結(jié)合
一個(gè)轉(zhuǎn)錄區(qū)段可視為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,稱為操縱子(operon,包括若干個(gè)結(jié)構(gòu)基因及其上游的調(diào)控序列。
5335結(jié)構(gòu)基因調(diào)控序列RNA-pol第十四頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日啟動(dòng)子的研究:
(RNA聚合酶保護(hù)法)55RNA聚合酶保護(hù)區(qū)結(jié)構(gòu)基因第十五頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日
保守序列
(一致性序列)開始轉(zhuǎn)錄TTGACAAACTGT-35
區(qū)(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10
區(qū)1-30-5010-10-40-205335嘌呤Sextamabox第十六頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日
原核生物啟動(dòng)子的序列長(zhǎng)約20-200bp不等。E.coli典型的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)(80bp)如下:
TGTTGACATATAAT起始位點(diǎn)…16~19bp……5~8bp…-35序列-10序列AATAAT下降突變TATGTTTATATT上升突變?cè)鰪?qiáng)子72bp第十七頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日
-35序列是RNA聚合酶全酶的識(shí)別位點(diǎn),對(duì)全酶有很高的親和性。如果-35序列發(fā)生突變或缺失,將大大降低對(duì)全酶的親和性,即降低RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合速度,但不影響轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)附近DNA雙鏈的解開。
第十八頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日4.啟動(dòng)子區(qū)的識(shí)別RAN聚合酶不直接識(shí)別堿基對(duì)本身,而是通過(guò)氫鍵加以識(shí)別RNA聚合酶啟動(dòng)子區(qū)DNA二元閉合復(fù)合物二元開鏈復(fù)合物三元復(fù)合物(DNA、RNA聚合酶、RNA)RNA聚合酶既是雙鏈DNA結(jié)合蛋白,也是單鏈DNA結(jié)合蛋白第十九頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:
RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域
DNA雙鏈解開,使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板第二十頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合模式圖50-90bp/s第二十一頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日5.原核生物的轉(zhuǎn)錄起始
DNA雙鏈解開,形成轉(zhuǎn)錄空泡
RNA聚合酶全酶(2)與模板結(jié)合
在RNA聚合酶作用下發(fā)生第一次聚合反應(yīng)–
5’-pppGpN–OH+ppiRNApol-DNA-pppGpN-OH
pppGNTPpppGpN-OHppi三元復(fù)合物:5’-pppG-OH+NTP第二十二頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日6.真核生物的轉(zhuǎn)錄起始也需要RNA聚合酶辨認(rèn)、結(jié)合轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游的DNA序列,生成起始復(fù)合物。順式作用元件
------
真核生物結(jié)構(gòu)基因上游的調(diào)控區(qū)存在相似或一致性的DNA序列。
第二十三頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日-GCGC---CAAT---TATA轉(zhuǎn)錄起始
Hogness,-25bpTATA盒
-75bp,CAAT盒
-90bp,GC盒
結(jié)構(gòu)基因
增強(qiáng)子
順式作用元件上游啟動(dòng)子元件也稱上游激活序列,第二十四頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日真核生物啟動(dòng)子對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響將TATA區(qū)上游序列稱為上游啟動(dòng)子元件UTP,或者上游激活序列TATA區(qū)主要作用使轉(zhuǎn)錄精確的起始CAAT區(qū)和GC區(qū)控制轉(zhuǎn)錄起始頻率第二十五頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日DTATAABDNATATAFE反式作用因子
------
直接或間接辨認(rèn)、結(jié)合順式作用元件并影響其功能的蛋白質(zhì)。
RNA聚合酶與模板DNA的結(jié)合需一系列轉(zhuǎn)錄因子(TF)的參與。RNA聚合酶第二十六頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日1、下列有關(guān)TATA盒(Hognessbox)的敘述,哪個(gè)是正確的:A.它位于第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因處
B.它和RNA聚合酶結(jié)合
C.它編碼阻遏蛋白
D.它和反密碼子結(jié)合
B第二十七頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日
2.轉(zhuǎn)錄需要的原料是:dNTPB.dNDPC.dNMPD.NTPE.NMPD第二十八頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日3、DNA模板鏈為5’-ATTCAG-3’,其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是:A.5’-GACTTA-3’
B.5’-CTGAAT-3’
C.5’-UAAGUC-3’
D.5’-CUGAAU-3’
D第二十九頁(yè),共三十一頁(yè),2022年,8月28日4、DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄過(guò)程有許多相同點(diǎn),下列描述哪項(xiàng)是錯(cuò)誤的?A.轉(zhuǎn)錄以DNA一條鏈為模板,而以DNA兩條鏈為模板進(jìn)行復(fù)制
B.在這兩個(gè)過(guò)程中合成均為5`-3`方向
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