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文檔簡介

第二節(jié)噬菌體載體(Bacteriophage,簡稱phage)

一、λ噬菌體載體λphage48.5kbinlengthLinearorcirculargenome

溶菌階段(復(fù)制和釋放)溶源階段

(整合到寄主染色體上)Thephage

cos

ends(cohesive-endsite

)

5‘-CGGGGCGGCGACCTCG-3’ 3’-GCCCCGCCGCTGGAGC-5’

CleavageLigation(duringpackaging)(afterinfection)5’-CG+

GGGCGGGCGACCTCG-3’3’-GCCCCGCCGCTGGAGC-5’CircularformLinearform通過Cos末端互補(bǔ)單鏈形成環(huán)狀DNA分子,在宿主細(xì)胞的DNA連接酶和旋促酶作用下,形成封閉的環(huán)狀DNA分子,充當(dāng)轉(zhuǎn)錄的模板。λ噬菌體的基因組結(jié)構(gòu)已經(jīng)定位的λ噬菌體的基因至少有61個,其中有一半左右參與了噬菌體生命周期的活動,我們稱這類基因?yàn)棣耸删w的必要基因;另一部分基因,當(dāng)它們被外源基因取代之后,并不影響噬菌體的生命功能,我們稱這類基因?yàn)棣耸删w的非必要的基因。λphageDNAProteincoatcoscosNonessentialregionLong(left)armshort(right)armExogenousDNA(~20-23kb)12bp

Virusesthatcaninfectbacteria.48.5kbinlengthLinearorcirculargenome(cosends)λphageLyticphase

(Replicateandrelease)Lysogenicphase(integrateintohostgenome)

1.插入式載體一種只具有一個可供外源DNA插入的克隆位點(diǎn)的派生載體。

2.替換型載體(取代型載體)具有成對的克隆位點(diǎn),在這兩個位點(diǎn)之間的λDNA區(qū)段可以被外源插入的DNA片段所取代。

λ噬菌體載體的主要類型

λ噬菌體載體相對于質(zhì)粒載體來說,克隆片段較大,所以一般用于cDNA文庫或基因組文庫的構(gòu)建。

cI基因插入失活:如λgt10、λNM1149等載體,在cI基因上有EcoRI及HindIII的酶切位點(diǎn)。外源基因插入后將導(dǎo)致cI基因的失活。cI基因失活后將導(dǎo)致噬菌體不能溶原化,產(chǎn)生清晰的噬菌斑。相反,產(chǎn)生混濁的噬菌斑。

LacZ基因插入失活:如charon16A載體,在非必須區(qū)段引入lacZ基因,在lacZ基因上有EcoRI位點(diǎn),插入失活后利用X-gal法篩選(蘭白篩選)。

插入式載體

cIEcoRI

LA32.7RA10.6

λgt10

Charon16A

lacZRA21.9EcoRILA19.9λ

替換型載體(取代型載體)外源DNA取代噬菌體染色體中對于噬菌體的感染和復(fù)制非必要的片段

(~20kb)

高感染效率(109

轉(zhuǎn)化株/ug

載體DNA,比質(zhì)粒高

100倍)EMBL3、DASH

野生型噬菌體染色體的中段對于噬菌體的感染和復(fù)制是非必要的,外源DNA可以取代這一片段,例如Charon4A、λEMBL3/4、Charon40等載體,這些載體是用Lac5(乳糖操縱子的大部分系列,包括完整的LacZ)替換入噬菌體的中間區(qū)段,同時將Lac5作為選擇標(biāo)記,使用時用EcoRI水解,去掉中間的片段,再與欲克隆片段在體外進(jìn)行重組、包裝。而后,感染E.coli使之在E.coli內(nèi)繁殖,并裂解E.coli,形成空斑。

spi-選擇

λ噬菌體的red和gam基因產(chǎn)物可抑制噬菌體在宿主細(xì)菌中正常生長,red-和gam-突變型λ噬菌體則可正常生長。當(dāng)置換型載體的可置換片段中放上red和gam基因后,外源DNA片段取代了置換片段,則同時除去了red、gam基因,就可在宿主菌中生長,否則就不能正常生長。替換型噬菌體λ是使用最廣泛的載體。

替換式載體Lac

EcoRIEcoRICharon4A

EcoRIBanHISalISalIBamHIEcoRIEMBL3/4Lac

MCSMCS

Charon40Lac1.應(yīng)用適當(dāng)?shù)暮怂醿?nèi)切酶消化λ載體,除去可取代的DNA片段;2.將上述所得的

λDNA載體臂同外源DNA片段的連接;3.對重組體的λDNA分子進(jìn)行包裝和增殖,以得到有感染性的λ重組噬菌體3.組裝4.侵染2.連接1.酶切替換型載體克隆外源DNA的步驟

λ噬菌體DNA體外重組后,一般必須經(jīng)過體外包裝,然后以噬菌體感染的方式將重組DNA導(dǎo)入E.coli細(xì)胞內(nèi)。這是因?yàn)橐愿腥痉绞綄?dǎo)入細(xì)胞的頻率可達(dá)106~108/μgDNA,而以轉(zhuǎn)染(translation)的方式導(dǎo)入的頻率僅為103~105/μgDNA。

λ噬菌體的包裝限制為野生噬菌體DNA(約48.5kb)的75%-105%。體外包裝

由于λ噬菌體包裝時,當(dāng)DNA的長度短于野生型的78%或超過105%時,噬菌體的活性就急劇下降。因此只包裝它的野生型DNA(48.5KB)的75%~

105%左右的DNA,要求λ載體DNA和外源DNA長度之和在39~53kb之間。

插入式載體可攜帶的外源DNA片段較替換式為小。根據(jù)體外互補(bǔ)作用研究發(fā)現(xiàn),λ噬菌體的頭部和尾部的裝配是分開進(jìn)行的。頭部基因發(fā)生了突變的噬菌體只能形成尾部,而尾部基因發(fā)生了突變的噬菌體則只能形成頭部。將這兩種不同突變型的噬菌體的提取物混合起來,便能夠在體外裝配成有生物活性的噬菌體顆粒。這就是噬菌體體外包裝所依據(jù)的基本原理。(左右臂連接)(三段自身連接)(插入片段)根據(jù)噬菌斑的透明度或顏色來進(jìn)行重組子的篩選二、單鏈DNA噬菌體載體(M13)

M13是一種含單鍵(+)DNA(ssDNA)的絲狀大腸桿菌噬菌體,其基因組大小為6.4kb。這類載體主要用來獲得大量的單鏈DNA片段,這種單鏈DNA片段在遺傳學(xué)研究中主要用來測定DNA序列(sanger雙脫氧法)、基因的定點(diǎn)突變研究、異源雙鏈DNA的分析等。

M13噬菌體載體.感染Ecoli后,在宿主細(xì)胞內(nèi)會形成雙鏈的復(fù)制型DNA(replicationformDNA,RFDNA)。可以象質(zhì)粒DNA那樣在體外進(jìn)行純化和操作。M13噬菌體的特點(diǎn)2.成熟的噬菌體顆粒僅能感染E.coli的F+細(xì)胞,這是因?yàn)檫@種噬菌體的感染位點(diǎn)在性散毛上。但是無論是RFDNA或ssDNA都能轉(zhuǎn)染E.coli的F+或F-細(xì)胞。

3.噬菌體顆粒的大小是受其DNA的大小制約的,這一點(diǎn)正好與λ噬菌體相反。所以M13噬菌體并不存在包裝限制的問題。

M13lifecycle具有多克隆位點(diǎn)(MCS),方便克隆。許多M13載體的多克隆位點(diǎn)與質(zhì)粒載體pUC序列的多克隆位點(diǎn)是相同的,在克隆位點(diǎn)選擇上更為方便。可以定向的克隆DNA片段,克隆在M13RFDNA分子上的雙鏈DNA片段,到了子代噬菌體便成了單鏈的形式。所以如果要同時分離DNA分子中的雙鏈,則需要兩種獨(dú)立的克隆。根據(jù)M13的生物學(xué)特性知道,M13子代噬菌體中總是只含有(+)鏈,所以M13載體克隆的外源DNA片段在子代噬菌體中究竟是含有DNA分子中的哪條鏈,則完全取決于外源DNA克隆時的取向。這樣一來,為分別分離外源DNA分子的兩條鏈帶來一定的麻煩,解決這一問題的一個行之有效的方法就是定向克隆技術(shù)。M13載體Blue-whiteselection1.在這類載體的基因組中有一條飾變的β-半乳糖苷酶基因片段(HindⅢ片段),其中插入了一段具有密集的多克隆位點(diǎn)的序列;2.M13載體系列是應(yīng)用基因工程技術(shù)成對地構(gòu)建的,可有效地克隆雙鏈DNA分子中的每一條鏈。M13載體系列的優(yōu)點(diǎn)M13mp18MCSM13mp19MCS

EcoRI

BamHI

HindIII

PstI

BglI

BglI

PstI

HindIII

BamHI

EcoRI

BP

PBBP

BPBPBamHI&PstIM13克隆載體分子結(jié)構(gòu)圖M13、f1、fd優(yōu)越性:1.單鏈DNA噬菌體的復(fù)制,是以雙鏈環(huán)形的DNA為媒介的,這種復(fù)制形式的DNA簡稱RFDNA;2.不論是RFDNA還是ssDNA都能感染大腸桿菌;3.單鏈DNA噬菌體顆粒的大小,是受其DNA的多少制約的,不存在包裝限制問題;4.容易測定外源DNA片斷的插入取向;5.可產(chǎn)生含外源片斷的單鏈DNA分子。

單鏈DNA噬菌體載體三、噬菌粒載體由質(zhì)粒載體和單鏈?zhǔn)删w載體結(jié)合而成的新型的載體系列。它具有質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn)、選擇性標(biāo)記、多克隆位點(diǎn)等,方便DNA的操作,可在細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)定存在;又具有單鏈?zhǔn)删w的復(fù)制起點(diǎn),在輔助噬菌體的存在下,可進(jìn)行噬菌體的繁殖,產(chǎn)生單鏈的子代噬菌體。1.具有較小分子量的共價、閉合、環(huán)形的基因組DNA,可克隆10kb的外源DNA片段,并易于進(jìn)行分離與操作;2.編碼一個ampr基因作為選擇記號,因此只有攜帶pUC118或pUC119噬菌粒載體的大腸桿菌轉(zhuǎn)化子細(xì)胞,才能夠在含有氨芐青霉素的培養(yǎng)基中生長,便于轉(zhuǎn)化子的選擇;常用的噬菌粒載體pUC118和pUC1194.存在著一個多克隆位點(diǎn)區(qū),因此許多種不同類型的外源DNA片段,不經(jīng)修飾便可直接插入到載體分子上;3.拷貝數(shù)含量高,每個寄主可高達(dá)500個,所以只要用少量的大腸桿菌細(xì)胞培養(yǎng)物,便可制備出大量的載體DNA;5.由于多克隆位點(diǎn)區(qū)阻斷了大腸桿菌lacZ基因的5’-端編碼區(qū),可按照IPTG組織化學(xué)顯色反應(yīng)試驗(yàn),篩選重組子;7.含有質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn),在沒有輔助噬菌體的情況下,克隆的外源基因可以像質(zhì)粒一樣按常規(guī)的方式,復(fù)制形成大量的雙鏈DNA分子8.帶有一個M13噬菌體的復(fù)制起點(diǎn),在有輔助噬菌體感染的寄主細(xì)胞中,可以合成出單DNA拷貝,并包裝成噬菌體顆分泌到培養(yǎng)基中;6.lacZ基因是置于lac啟動子的控制之下,這樣插入的外源基因便會以融合蛋白質(zhì)的形式表達(dá);9.在pUC118和pUC119這兩個載體中,多克隆位點(diǎn)區(qū)的核苷酸序列取向是彼此相反的,于是它們當(dāng)中的一個可轉(zhuǎn)錄克隆基因的正鏈DNA,另一個則可轉(zhuǎn)錄出負(fù)鏈DNA;10.可以直接對克隆的DNA片斷進(jìn)行核苷酸的序列測定,免去了從質(zhì)粒載體到噬菌體的這一煩瑣的亞克隆步驟?;窘Y(jié)構(gòu):1.在多克隆位點(diǎn)的兩側(cè),有一對T3和T7噬菌體的啟動子,可以定向指導(dǎo)外源基因的轉(zhuǎn)錄活動;2.同時具有一個單鏈?zhǔn)删wM13或f1的復(fù)制起點(diǎn)和一個來自ColE1質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn),在不同的情況下,可以采取不同的復(fù)制形式,分別合成單鏈或雙鏈的DNA;3.編碼有一個氨芐青霉素抗性基因,供作轉(zhuǎn)化子記號;4.含有l(wèi)acZ基因,可用Xgal-IPTG組織顯色反應(yīng)法篩選噬菌粒載體。pBluescript

噬菌粒載體用于體外轉(zhuǎn)錄四、柯斯(cosmid)質(zhì)粒載體CosmidAmprCossiteCoEⅠoripolylinkercosmid載體也稱粘粒、柯斯載體。

這是一類用于克隆大片段DNA的載體,它是由λ噬菌體的cos(cohesive)末端及質(zhì)粒(plasmid)重組而成的載體。cosmid載體帶有質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn)、克隆位點(diǎn)、選擇性標(biāo)記以及λ噬菌體用于包裝的cos末端等,因此該載體在體外重組后,可利用噬菌體體外包裝的特性進(jìn)行體外包裝,利用噬菌體感染的方式將重組DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞。但它不會產(chǎn)生子代噬菌體,而是以質(zhì)粒DNA的形式存在于細(xì)胞內(nèi)??滤官|(zhì)粒載體具有λ噬菌體的特性;具有質(zhì)粒載體的特性;具有較高容量的克隆能力;具有與同源性序列的質(zhì)粒進(jìn)行重組的能力柯斯質(zhì)粒載體的特點(diǎn)由質(zhì)粒pBR322和噬菌體λ的cos位點(diǎn)的一段DNA構(gòu)成全長4.3kb設(shè)計(jì)構(gòu)建的柯斯質(zhì)粒一般長4~6kb。其上的cos位點(diǎn)的一個重要作用是識別噬菌體的外殼蛋白。凡具有cos位點(diǎn)的任何DNA分子只要在長度相當(dāng)于噬菌體基因組,就可以同外殼蛋白結(jié)合而被包裝成類似噬菌體λ的顆粒。因此,插入柯斯質(zhì)粒的外源DNA可大于40kb。重組的柯斯質(zhì)??上笫删wλ一樣感染大腸桿菌,并在細(xì)菌細(xì)胞中復(fù)制。FormationofacosmidcloneLigationtocleavedcosmidvectormoleculescanproducevector-targetconcatemers,resultinginalargeexogenousDNAfragmentflankedbycossequences.采用柯斯質(zhì)粒作載體的困難①載體自身只相當(dāng)于可以插入片段的1/10左右,因此往往會出現(xiàn)載體同載體自身連接,結(jié)果在一個重組分子內(nèi)可有幾個柯斯質(zhì)粒載體連在一起。但用堿性磷酸酶處理,可阻止載體分子自身連接;②大小不等的外源片段相互連接后插入同一個載體分子,結(jié)果使在基因組內(nèi)本來不是相鄰的片段錯亂地連接成一個片段,會影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析,后來專門選出30~45kb的外源DNA插入載體DNA,此時,每個載體只可能插入一個外源片段,因?yàn)槿绻€片段,則將超過包裝成噬菌體顆粒的限度;③細(xì)菌的菌落體積遠(yuǎn)大于噬菌斑,因此如用柯斯質(zhì)粒制備基因文庫,則篩選所需的含某一DNA片段的菌落很費(fèi)時間?,F(xiàn)雖建立了高密度菌落篩選法,但由于柯斯質(zhì)粒制成的基因文庫常常不太穩(wěn)定,插入的大片段外源DNA有可能通過同宿主基因組交換而致丟失等,所以最常使用的還是噬菌體載體。常用載體的比較質(zhì)粒λ噬菌體柯斯質(zhì)粒單鏈?zhǔn)删w克隆DNA大片段±*++-構(gòu)建基因組文庫-++-構(gòu)建DNA文庫+---常規(guī)的亞克隆化+---構(gòu)建新型的DNA結(jié)構(gòu)+---序列分析+--+單鏈探針+**--+外源基因在大腸桿菌中的表達(dá)+---*外源DNA如超過10kb,則重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化率和DNA得率都非常低**已有個別材料可用于此目的酵母人工染色體載體(yeastartificialchromosome,YAC)細(xì)菌人工染色體載體(bacterialartificialchromosome,BAC)噬菌體人工染色體載體(Bacteriophageartificialchromosome,PAC)

第三節(jié)、其他載體人基因組十分龐大,約含4×109bp,建立和篩選人的基因組文庫,要求有容量更大的載體,酵母人工染色體(yeastartificialchromosome,YAC)載體應(yīng)運(yùn)而生。

YAC含有酵母染色體端粒(telesome)、著絲點(diǎn)(centromere)及復(fù)制起點(diǎn)等功能序列,可插入長度達(dá)200-500kb的外源DNA,導(dǎo)入酵母細(xì)胞可以隨細(xì)胞分裂周期復(fù)制繁殖供作克隆,成為人基因組研究計(jì)劃的重要。一、酵母人工染色體載體構(gòu)建YAC需要4個短序列:2個端粒,著絲粒,ARS元件,與外源DNA連接成線性DNA分子,導(dǎo)入酵母細(xì)胞克隆。適用于克隆大片段DNA,0.2~5Mb。1)著絲粒(centromeresequence,CEN)

有絲分裂過程中紡錘絲的結(jié)合位點(diǎn),使染色體在分裂過程中能正確分配到子細(xì)胞中。在YAC中起到保證一個細(xì)胞內(nèi)只有一個人工染色體的作用。如pYAC4使用的是酵母第四條染色體的著絲粒。

YAC主要結(jié)構(gòu)的功能2)端粒(telomeresequences,TEL)

定位于染色體末端一段序列,用于保護(hù)線狀的DNA不被胞內(nèi)的核酸酶降解,以形成穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)。

3)自主復(fù)制序列(autonomousreplicatingsequence,ARS)一段特殊的序列,含有酵母菌中DNA進(jìn)行雙向復(fù)制所必須的信號,是染色體自主復(fù)制的復(fù)制起點(diǎn)。4)YAC載體的選擇標(biāo)記主要采用營養(yǎng)缺陷型基因,如色氨酸、亮氨酸和組氨酸合成缺陷型基因trp1、leu2和his3、尿嘧啶合成缺陷型基因ura3等,以及赭石突變抑制基因sup4。與YAC載體配套工作的宿主酵母菌AB1380,它的胸腺嘧啶合成基因攜帶赭石突變(ochremutation)ade-2

,從而影響嘌呤的代謝。這種突變能夠造成紅色素在酵母體內(nèi)的積累。然而,當(dāng)攜帶赭石突變抑制基因SUP4gene的載體存在于細(xì)胞中時,能夠使酵母細(xì)胞恢復(fù)為野生型,形成無色的酵母菌。同時寄主細(xì)胞trp1andura3的等位基因也是敏感型的,它們所控制的表型可由載體攜帶的TRP1andURA3來互補(bǔ)。由此可作為篩選是否攜帶YACvector的標(biāo)記。外源片段的插入則由

SUP4gene的插入失活來檢測。CloingintoaYeastArtificialChromosome

YAC載體功能強(qiáng)大,但有一些弊端,主要表現(xiàn)在3個方面:

首先,在YAC載體的插入片段會出現(xiàn)缺失(deletion)和基因重排(rearrangement)的現(xiàn)象。

其次,容易形成嵌合體。嵌合就是在單個YAC中的插入片段由2個或多個的獨(dú)立基因組片段連接組成。嵌合克隆約占總克隆的5%~50%。

最后,YAC染色體與宿主細(xì)胞的染色體大小相近,影響了YAC載體的廣泛應(yīng)用。

YAC染色體一旦進(jìn)入釀酒酵母細(xì)胞,由于其大小與內(nèi)源的染色體的大小相近,就很難從中分離出來,不利于進(jìn)一步分析。YAC載體的優(yōu)缺點(diǎn)

但是YAC的一個突出優(yōu)點(diǎn)是,酵母細(xì)胞比大腸桿菌對不穩(wěn)定的、重復(fù)的和極端的DNA有更強(qiáng)的容忍性。另外,YAC在功能基因和基因組研究中是一個非常有用的工具。由于高等真核生物的基因大多數(shù)是多外顯子結(jié)構(gòu)并且有長長的內(nèi)含子,大型基因組片段可通過YAC載體轉(zhuǎn)移到動物或動物細(xì)胞系中,進(jìn)行功能研究。

二、細(xì)菌人工染色體載體細(xì)菌人工染色體(bacterialartificialchromosome,BAC)由大腸桿菌單拷貝F質(zhì)粒衍生而成的,可用于克隆基因組大片段DNA及構(gòu)建基因組文庫的克隆載體,可攜帶大片段的外源DNA,其遺傳穩(wěn)定性比酵母人工染色體要高。

F質(zhì)粒

大腸桿菌的F因子是一個約100kb的質(zhì)粒。它編碼60多種參與復(fù)制、分配和接合過程的蛋白質(zhì)(WillettsandSkurray,1987)。雖然F因子通常以雙鏈閉環(huán)DNA(1-2個拷貝/細(xì)胞)的形式存在,但它可以在大腸桿菌染色體中至少30個位點(diǎn)處進(jìn)行隨機(jī)整合(Low,1987)。攜帶F因子的細(xì)胞,或以游離狀態(tài)或以整合狀態(tài)表達(dá)三根發(fā)樣狀的F菌毛。F菌毛為供體與受體細(xì)胞之間產(chǎn)生性接觸所必需。

細(xì)菌人工染色體載體用于克隆DNA測序的Sp6、T7啟動子(來源于噬菌體)。

BAC載體空載時大小約7.5kb,在大腸桿菌中以質(zhì)粒的形式復(fù)制。

BAC載體可以通過α互補(bǔ)的原理,篩選含有插入片段的重組子。一個來源于大腸桿菌F因子(致育因子)的嚴(yán)謹(jǐn)型控制的復(fù)制子oriS

;一個易于DNA復(fù)制的由ATP驅(qū)動的解旋酶(RepE);三個確保低拷貝質(zhì)粒精確分配至子代細(xì)胞的基因座(parA、parB和parC);用于回收克隆DNA的NotⅠ(GC↓GGCCGC)酶切位點(diǎn)(位點(diǎn)十分稀少,重組子通過NotⅠ消化后,可以得到完整的插入片段);cosN位點(diǎn)可被入噬菌體末端酶切割為黏末端,因而能像傳統(tǒng)的黏粒一樣在克隆后包裝每個環(huán)狀DNA分子中攜帶一個抗生素抗性標(biāo)記(氯霉素抗性基因);BAC載體特點(diǎn)

BAC與YAC和PAC(P1artificialchromosomes,P1人工染色體)相似,沒有包裝限制,因此可接受的基因組DNA大小也沒有固定的限制。大多數(shù)BAC文庫中克隆的平均大小約120kb,然而個別的BAC重組子中含有的基因組DNA最大可達(dá)300kb。

F質(zhì)粒能夠編碼形成性菌的蛋白,通過大腸桿菌的結(jié)合轉(zhuǎn)移可以進(jìn)行遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移。但是基因操作的時候一般不用這種自發(fā)的轉(zhuǎn)化方式。外源基因組DNA片段可以通過酶切、連接克隆到BAC載體多克隆位點(diǎn)上,通過電穿孔的方法將連接產(chǎn)物導(dǎo)入大腸桿菌重組缺陷型菌株。

BAC載體的低拷貝性可以避免嵌合體的產(chǎn)生,減小外源基因的表達(dá)產(chǎn)物對宿主細(xì)胞的毒副作用。三、噬菌體PI載體和PAC(Pl-derivedArtificialChromosome

)

以噬菌體P1為基礎(chǔ)的克隆系統(tǒng)。

PI噬菌體與λ噬菌體一樣,外有蛋白質(zhì)殼。內(nèi)含相當(dāng)大的(110~115kb)線性DNA,并在體外包裝于PI殼內(nèi)。PI進(jìn)入宿主細(xì)胞后環(huán)化,擴(kuò)增。

1994年,有人將PI和F因子克隆結(jié)合產(chǎn)生PI人工染色體克隆系統(tǒng)-----PAC。

PAC載體含有很多P1噬菌體來源的順式作用元件,能容納70~100kb大小的基因組DNA片段。含有基因組和載體序列的線狀重組分子在體外被組裝到P1噬菌體顆粒中,總?cè)萘靠蛇_(dá)115kb(包括載體和插入片段)。PAC載體載體攜帶一個通用的選擇標(biāo)記kanr;一個區(qū)分?jǐn)y帶外源DNA克隆的陽性標(biāo)記sacB

以及一個能夠使每個細(xì)胞都含有約一個拷貝環(huán)狀重組質(zhì)粒的P1質(zhì)粒復(fù)制子。另一個P1復(fù)制子(P1裂解性復(fù)制子)在可誘導(dǎo)的lac啟動子(IPTG誘導(dǎo))控制下,用于DNA分離前質(zhì)粒的擴(kuò)增。

cre-loxP

位點(diǎn)特異性重組。

SacB基因:編碼一種將蔗糖轉(zhuǎn)化為果聚糖的酶,當(dāng)含該基因的細(xì)胞培養(yǎng)在2%以上蔗糖培養(yǎng)基中時,果聚糖積累在細(xì)胞周質(zhì)空間內(nèi),導(dǎo)致大腸桿菌細(xì)胞死亡

SacB基因上游加上E.coli基因啟動子,克隆位點(diǎn)BamHI位于這兩個DNA片段間,外源DNA片段插入時可進(jìn)行顯性篩選重組子將重組DNA注入到表達(dá)Cre

重組酶的大腸桿菌中,線狀DNA分子通過重組于載體的兩個loxP

位點(diǎn)之間而發(fā)生環(huán)化。質(zhì)粒和噬菌體載體只能在細(xì)菌中繁殖,不能滿足真核DNA重組需要。感染動物的病毒可改造用作動物細(xì)胞的載體。由于動物細(xì)胞的培養(yǎng)和操作較復(fù)雜、花費(fèi)也較多,因而病毒載體構(gòu)建時一般都把細(xì)菌質(zhì)粒復(fù)制起始序列放置其中。使載體及其攜帶的外來序列能方便地在細(xì)菌中繁殖和克隆,然后再引入真核細(xì)胞。目前病毒載體常用者有改造來自猴腎病毒SV40(SimianVirus40)、逆轉(zhuǎn)錄病毒和昆蟲桿狀病毒等,使用這些病毒載體的目的多為將目的基因或序列放入動物細(xì)胞中表達(dá)或試驗(yàn)其功能、或作基因治療等。

四、病毒載體猴病毒40(SV40)的基因組常用來作為克隆載體,把外源DNA轉(zhuǎn)入哺乳類細(xì)胞。猴病毒40是球形動物病毒,直徑40nm,呈20面體,有一個共價閉環(huán)的雙鏈DNA基因組,全長5244bp。它在猴腎中增殖。被SV40感染的細(xì)胞都會出現(xiàn)SV40的T抗原。早已證明完整的小鼠染色體β珠蛋白基因(包括所有的間插順序和兩

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