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I.中性演化論 1一 自然界中的遺傳變自然選擇的基礎(chǔ):遺傳變異
2 突變:?jiǎn)? Dobzhansky的果蠅實(shí)驗(yàn)(1938-1940年) 4 Watson&CrickDNA雙螺旋結(jié)構(gòu)(double5 G6組(一般 中的
最終形成7
舉例:編碼蛋白質(zhì)
搬運(yùn) RNA上的三聯(lián) 相應(yīng)的氨基 豌豆天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(AAT)的多態(tài)AATAAT AAT2與AAT3: MotooKimura(11.13.1924–假設(shè)一個(gè)哺乳動(dòng)物有個(gè)獨(dú)立分離的loci,2alleles/locus;雜合子有選擇優(yōu)勢(shì),純合子的選擇系數(shù)(s)為 若要維持原來(lái)種群的大小,每 結(jié)論:不可能! 變率和遺傳漂變(geneticdrift)而定。1968年Kimura Evolutionaryrateatthemolecularlevel.Nature(1968)217:624-中性理論中sutrs= 基本的公式:p2+2pq+q2= 0,selected 0,selectNearly|s|
1/(2Ne),或|s|定義:一個(gè)種群中能將其連續(xù)傳遞到下一代的平均數(shù)。實(shí)際上相當(dāng)于理想狀態(tài)下(種群大小穩(wěn)定,世代之間沒(méi)有,所有個(gè)人以相同的 Ne=4NmNf/Nm:雄 Nf:雌 (Elaphurusdavidianus原產(chǎn)亞洲東部,1898年僅剩18 (江蘇省大豐市:N=819/Ne=50)種群恢復(fù)很快,2003年從國(guó)際“紅皮書(shū)”中“除名”從“瀕 群(7只)kN:population中的 每代Population中新的突變=u:?jiǎn)蝹€(gè)突變?cè)赑opulation每代被固定在Population中的中性突變的概率=因此,當(dāng)skv)(1/2N)v,與Population三 中性或近中性突變,隨機(jī)選擇(遺傳漂變承認(rèn)負(fù)選擇(negativeselection) King&Science(1969)164:788- 兼并性Neutral偏愛(ài)性——水 NaturalselectionTomokoOhta(太田朋子,1933-NearlyNeutralTheoryofEvolution 提出了一個(gè)slightlydeleteriousmodel,Slightlydeleteriousmutantsubstitutionsinevolution.Nature(1973)246:96-五.分子演化的主要研究
DNA、RNA、蛋白質(zhì)分長(zhǎng)短(核苷酸和氨基酸的數(shù)目序列(核苷酸和氨基酸的排列順序),MERPWKCCDNI
一致性(identity)相似性(Similarity) 或蛋白質(zhì)的序列一致性或相似性很鐘南山 并系同源paralogous:由
直系同 a2,a2,a3,a4,a2’,a2’,a4’,
a2
a2’,a4’,a2’,a4’,a2,a3,a4,物種 物種中性演化理 分子演化的一些術(shù)語(yǔ):相似性,同源性(直系、并系MotooKimura,1983,TheNeutralTheoryofMolecularEvolution,CambridgeUniversityPressWen-HsiungLi,1997,MolecularEvolution,SinauerAssociatesInc.,,OhtaT,2010,
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