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原核生物轉(zhuǎn)錄及調(diào)控第1頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三原核生物轉(zhuǎn)錄和翻譯是偶聯(lián)的,其mRNA為編碼多種蛋白的多順?lè)醋?。原核生物?/p>
因子協(xié)助RNA聚合酶識(shí)別啟動(dòng)子基本元件并由此起始轉(zhuǎn)錄,并在具有發(fā)卡結(jié)構(gòu)的終止子處(或在ρ因子協(xié)助下)結(jié)束轉(zhuǎn)錄。σ
因子是基因選擇性轉(zhuǎn)錄的調(diào)控因子。啟動(dòng)子上游具有能結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活因子如CAP的調(diào)控元件從而大幅度地提高轉(zhuǎn)錄效率。操縱子是原核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控的主要模式,其中最典型的代表為乳糖操縱子和色氨酸操縱子。除了調(diào)控蛋白(阻遏蛋白)與操縱元件結(jié)合阻止RNA聚合酶前進(jìn)達(dá)到降低轉(zhuǎn)錄效率主要調(diào)控途徑外,還存在一種稱之為“弱化子”特殊調(diào)控模式。弱化子通過(guò)前導(dǎo)肽的翻譯過(guò)程中核糖體占位是否影響前導(dǎo)mRNA的終止子形成而控制后續(xù)mRNA分子合成。第2頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三轉(zhuǎn)錄單位Figure8.2編碼鏈/+鏈模板鏈/-鏈轉(zhuǎn)錄起始不需要引物。RNA聚合酶不具備識(shí)別啟動(dòng)子的能力,需要基本轉(zhuǎn)錄因子的協(xié)助。轉(zhuǎn)錄過(guò)程如下:起始-延伸-終止。第3頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三啟動(dòng)子(promoter)是能啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的一段DNA片段。常含有轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別和結(jié)合的保守的和特異順式元件(cis-elements),用以控制基因的轉(zhuǎn)錄起始?!ぁぁど嫌翁禺愒?/p>
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TTGACA······
TATAAT······
CA/GT-35序列-10序列+1
特異轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合元件基本轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合元件轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)控制基因特異表達(dá)(何時(shí)何地多少
)招募RNA聚合酶組裝轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物
第4頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三原核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控模型
第5頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三第6頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三RNA聚合酶第7頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三3.在轉(zhuǎn)錄期間RNA聚合酶的結(jié)構(gòu)和功能位點(diǎn)(+)鏈(β’)(-)鏈EnzymeMovement解旋(α)復(fù)旋(α)覆蓋約40bp,其中約17bp解鏈區(qū)
第8頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三Thechannelthroughtheenzyme(denotedc)isclosedinthecoreandopenintheholoenzyme.
OverallshapesofE.coliRNApolymerasecore(a)andholoenzyme(b)deducedfromelectronmicroscopystudiesontwo-dimensionalcrystalsoftheenzymes.25?第9頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三第10頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三BindingofRNApolymerasetopromoterClosedpromotercomplexOpenpromotercomplexσ-factorselectsthepromoterstowhichRNApolymerasewillbindtightly.Thegenesadjacenttothesepromoterswillthenbetranscribed.第11頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三延伸起始成功后,聚合酶釋放出σ因子,形成核心酶-DNA-新生RNA鏈三元(三聚)復(fù)合物。隨著轉(zhuǎn)錄泡的移動(dòng),不斷地解螺旋和再螺旋(解螺旋區(qū)域的大小穩(wěn)定地保持在17bp),RNA鏈不斷的延長(zhǎng)。Figure8.16第12頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三終止子終止序列的特點(diǎn):
1)發(fā)夾結(jié)構(gòu)(減速)2)4個(gè)或更多的U殘基(脫離)Figure8.6第13頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三第14頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三第15頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三依賴ρ的轉(zhuǎn)錄終止不形成強(qiáng)的發(fā)夾結(jié)構(gòu),必須一種輔助因子即ρ蛋白來(lái)幫助轉(zhuǎn)錄終止。六聚體蛋白,識(shí)別72bp序列(特異結(jié)構(gòu)),依賴單鏈RNA水解ATP。第16頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三依賴ρ的轉(zhuǎn)錄終止Rhofactor(ρ)-dependenttermination第17頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三第18頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三操縱子與乳糖操縱子1.提出:1961年,Jacob(雅格布)-Monod(莫諾).2.操縱子:操縱子是基因表達(dá)和調(diào)控的單元,典型的操縱子包括:結(jié)構(gòu)基因、調(diào)控元件和阻遏蛋白編碼基因。大腸桿菌K12中共有4136個(gè)基因,以操縱子結(jié)構(gòu)存在的基因接近1/4(256操縱子
控制879基因)第19頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三操縱子結(jié)構(gòu)
結(jié)構(gòu)基因:控制某一代謝途徑關(guān)鍵酶的多順?lè)醋?。調(diào)控元件:?jiǎn)?dòng)子和操縱區(qū)(覆蓋在啟動(dòng)子和編碼區(qū)交叉區(qū),是阻遏調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn))。調(diào)節(jié)基因:編碼阻遏蛋白質(zhì)獨(dú)立的基因。第20頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三乳糖操縱子第21頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三轉(zhuǎn)錄激活因子CAP第22頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三啟動(dòng)區(qū)PlaclacZlacAlaclOlaclacY調(diào)控元件結(jié)構(gòu)基因
β-半乳糖苷透性酶分解乳糖半乳糖和葡萄糖運(yùn)送乳糖透過(guò)細(xì)胞壁乙酰輔酶A乙酰半乳糖β-半乳糖苷酶β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙酰酶
乳糖轉(zhuǎn)化異乳糖調(diào)節(jié)基因A
YZ操縱區(qū)轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄單元lacZYA分解X-gal藍(lán)色第23頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三乳糖阻抑物RNAlaclPlacI乳糖阻抑物單體乳糖阻抑物四聚體lacZlacYlacA透性酶β-半乳糖苷酶轉(zhuǎn)乙酰酶
PlaclacZlacAlaclOlaclacY含回文結(jié)構(gòu)(-5/+21)第24頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三PlaclacZlacAlaclOlaclacYPlaclacZlacAlaclOlaclacY
異乳糖誘導(dǎo)物安慰誘導(dǎo)物IPTGRNA聚合酶iRNARNA聚合酶lacZlacYlacA被激活的乳糖阻抑物四聚體乳糖轉(zhuǎn)化第25頁(yè),共27頁(yè),2023年,2月20日,星期三色氨酸阻抑物PtrpOtrp色氨酸所需的酶Trp
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