醫(yī)藥信息檢索與利用精簡版

信息、知識、情報、文獻1.信息(information):在自然界、人類社會以及人類思維活動中普遍存在，是物質的一種基本屬性，是物質存在方式及其運動的規(guī)律、特點的外在表現(xiàn)。2.知識(knowledge):人們通過信息對自然界、人類社會以及思維活動規(guī)律的認識與掌握，是人的大腦通過思維重新組合的系統(tǒng)化信息的集合。3.文獻(literature):以文字、圖形、符號、聲頻、視頻等手段記錄和傳播知識的載體就是文獻。4.情報(information):傳遞著的有特定效用的知識。第一頁，共57頁。信息、知識、情報的聯(lián)系與區(qū)別（考選擇或者填空）信息>知識>情報情報知識信息文獻第二頁，共57頁。信息源的分類：(1)零次信息指未經(jīng)正式發(fā)表或不宜公開和大范圍內(nèi)交流的比較原始的素材、底稿、手稿、書信、工作文稿、工程圖紙、考察記錄、實驗記錄、調(diào)查稿、原始統(tǒng)計數(shù)字，以及各種口頭交流的知識、經(jīng)驗或意見論點等。這類文獻在較小的范圍內(nèi)交流、使用、參考，其傳播渠道少，或常保密，或限制使用以及因珍稀的原因，不為人們知曉。其形式多是抄件、打字件、油印件以及內(nèi)部錄音、錄像等等。其特點是信息來源直接、真實，內(nèi)容新穎。因特網(wǎng)的普及，為廣大網(wǎng)民提供了跨越空間的口頭交流便利，如各種聊天工具。第三頁，共57頁。信息源的分類：(2)一次信息又稱原始文獻，也稱原始信息源，它是作者依據(jù)本人的科研和工作成果而形成的文獻，這類文獻是腦力勞動的正式產(chǎn)品，是科研成果的一種主要表述方式，代表新知識，組成了可供交流的系統(tǒng)性信息。此類文獻主要包括：專著、期刊和報紙、科學考察報告、研究報告、會議論文、學位論文、專利說明書、技術標準、政府出版物、產(chǎn)品樣本等。第四頁，共57頁。信息源的分類：（3）二次信息指根據(jù)實際需要，按照一定的科學方法，將特定范圍內(nèi)的分散的一次信息進行加工整理使之簡化和有序化而形成的文獻信息。它能較為全面地系統(tǒng)地反映某學科某專業(yè)文獻的線索，是檢索一次信息的工具。這類文獻有：書目、題錄、索引和文摘等。第五頁，共57頁。信息源的分類：（4）三次信息指通過二次信息提供的線索，選用一次信息的內(nèi)容，進行分析、綜合、研究后而編成的信息。一般包括專題述評、動態(tài)綜述、系統(tǒng)評價、進展報告、學科年度總結、年鑒、指南和百科全書等。

第六頁，共57頁。

知識產(chǎn)生

記錄原始文獻知識重組

知識濃縮詞典名錄指南手冊年鑒書目等述評專著教科書論文叢集百科全書等三次文獻

期刊論文會議論文科技報告學位論文專利說明書文獻整理目錄

索引文摘新書通報等二次文獻一次文獻零次文獻第七頁，共57頁。

研究活動（實驗、觀察、思考）

信息的直接記錄或傳遞

零次文獻（創(chuàng)造知識的素材）

將知識以文字等形式固化

一次文獻（初始的知識產(chǎn)品）

將分散的文獻序列化

二次文獻（一次文獻的替代品）將知識重新組合，使知識序列化

三次文獻（濃縮的新的信息產(chǎn)品）第八頁，共57頁。學位論文是為了取得某一級學位而提交的論文，包括學士論文、碩士論文和博士論文。它們的特點是：論文的水平和質量差別較大，論題比較專一，闡述系統(tǒng)、具體，有一定的獨創(chuàng)性觀點，且經(jīng)過一定的審查，故有一定的參考價值。第九頁，共57頁。信息交流和信息素養(yǎng)信息交流：個體之間借助于共同的符號系統(tǒng)所進行的信息傳播、交換和分享。信息需要：就是指人們在從事各項實踐活動的過程中，為解決所遇到的各種問題而產(chǎn)生的對信息的需求。信息動機：指激勵和推進個體發(fā)動并維持其信息行為導向某一目標的心理過程。信息行為：人們滿足自己信息需要的社會活動的過程。用戶的信息行為主要有信息檢索行為、信息的選擇行為和信息利用行為。信息需要是信息行為發(fā)生的根本基礎，而信息動機則是信息行為發(fā)生的根本動力。第十頁，共57頁。信息素養(yǎng)：包括信息獲取的意識，評價、判斷信息的能力，查找、收集、組織信息的能力，信息決策及處理能力。標準：2000年1月18日，美國大學與研究圖書館協(xié)會(ACRL)通過了《美國高等教育信息素養(yǎng)能力標準》第十一頁，共57頁。信息檢索語言（1）自然語言：指文獻作者或文摘提要的作者原來使用的語言，即 出現(xiàn)在文獻題名、摘要或正文中的語詞。自然語言檢索不足：

(1)不能簡單明了而又專指地表達文獻及檢索課題的主題概念；(2)不能夠語詞與概念一一對應，不能夠排除多詞一義、一詞多義和詞義含糊現(xiàn)象；例如：艾滋病、愛滋病、aids獲得性免疫缺陷綜合癥(3)不能顯示出概念之間的關系；(4)不能將概念進行系統(tǒng)排列；(5)不能夠在檢索時便于將標引用語和檢索用語進行相符 性比較。第十二頁，共57頁。人工語言——情報檢索語言：情報檢索語言是根據(jù)情報檢索的需要而創(chuàng)制的人工語言，專門用于各種手工的和計算機化的情報檢索系統(tǒng)，表達文獻主題概念和檢索課題概念。其實質是一系列概括文獻情報內(nèi)容的概念及其相互關系的概念標示系統(tǒng)。情報檢索語言可分為分類檢索語言、主題檢索語言和代碼檢索語言三大語系。舉例:第十三頁，共57頁。醫(yī)學主題詞表（這個考選擇，必考，作為一個常年開小差聽課的我，是知道的哦~）《美國醫(yī)學主題詞表》（mesh）荷蘭醫(yī)學文摘的主題詞表（EMTree）《中國中醫(yī)藥學主題詞表》（pubmed）主題詞表第十四頁，共57頁?？疾鞕z索效率的常用指標

檢全率與漏檢率檢全率與漏檢率是可以說是同一問題的兩個相對的概念。檢全率高則漏檢率就低，而漏檢率高則檢全率就低：如果檢全率為65％，則漏檢率就是35％。檢全率是情報檢索質量的主要標志，因為漏檢率高表明重要情報被遺漏的危險性大，所以在情報檢索中，總是力求提高檢全率，或者說力求降低漏檢率。檢準率與誤檢率檢準率也是文獻檢索質量的重要標志，因為誤檢率高表明用于甄別所檢出文獻是否真正有用的勞動的增加利時間的延誤，雖不如遺漏重要文獻那樣嚴重，但對檢索效率也有重大影響，所以在文獻檢索中，總是力求提高檢準率．或者說力求降低誤檢率。第十五頁，共57頁。文獻數(shù)據(jù)庫的結構（填空或選擇）文獻數(shù)據(jù)庫一般由記錄、字段、文檔組成。文檔在數(shù)據(jù)庫中有順排文檔和倒排文檔之分。順排文檔是數(shù)據(jù)庫的主體，又稱主文檔，它按每條記錄的順序號排列。數(shù)據(jù)庫中得到的檢索結果都來自于順排文檔。倒排文檔是供檢索順排文檔的工具，在一個數(shù)據(jù)庫中可能有若干個倒排文檔，如主題詞索引、著者索引、刊名索引等，它按索引的字順排列。檢索時，計算機按輸入檢索詞的字順先從指定的倒排文檔（索引）中找到匹配的索引詞，然后根據(jù)索引詞后的記錄順序號到主文檔中調(diào)出記錄。記錄是構成文獻數(shù)據(jù)庫的一個完整的信息單元，每條記錄描述了一原始信息的外部特征和內(nèi)部特征。例如，書目數(shù)據(jù)庫中的一條記錄通常代表一篇文獻，其他類型數(shù)據(jù)庫中的記錄可能是一種治療方案、一組理化指數(shù)。字段是組成記錄的數(shù)據(jù)項目。例如，在MEDLINE中一條記錄代表一篇書目文獻，在這條記錄中有題名、著者、來源、文摘、主題詞等字段。每個字段都有自己的字段標識符（Fieldtag），如TI（篇名）、AU（著者）、SO（文獻出處）、AB（文摘）、AD（著者所在結構）、AN（記錄順序號）等。將記錄細劃成字段作用是：幫助識別記錄內(nèi)容，方便檢索結果輸出時格式的選擇，便于進行字段檢索。

第十六頁，共57頁。文獻數(shù)據(jù)庫的類型（1）按文獻數(shù)據(jù)庫的記錄內(nèi)容劃分：書目數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫混合數(shù)據(jù)庫第十七頁，共57頁。（2）按文獻數(shù)據(jù)庫的運行方式劃分：光盤數(shù)據(jù)庫聯(lián)機數(shù)據(jù)庫網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫第十八頁，共57頁。幾種主要的文獻數(shù)據(jù)庫（1）題錄數(shù)據(jù)庫：（論文結構）“題錄”是指文獻的基本信息，也稱為目錄。包括題名、作者、關鍵詞、作者機構、文獻來源、摘要等。題錄數(shù)據(jù)庫是用各種索引方法制作的二次文獻數(shù)據(jù)庫，又稱題錄數(shù)據(jù)庫或篇名數(shù)據(jù)庫，以簡略的形式向用戶提供文獻的信息。如：中國生物醫(yī)學文獻服務系統(tǒng)(Sinomed)

、（2）文摘數(shù)據(jù)庫（3）圖書館館藏目錄數(shù)據(jù)庫（4）全文數(shù)據(jù)庫（5）光盤數(shù)據(jù)庫（6）多媒體數(shù)據(jù)庫（7）網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫第十九頁，共57頁。布爾運算符的優(yōu)先級為：-、*、+，使用括號可改變運算順序。如果含兩個或兩個以上的邏輯算符，應先算NOT，然后算AND，最后算OR。也可以用（）來改變計算次序，因為（）里的部分可最先算。()>->*>+第二十頁，共57頁。3截詞檢索截詞檢索是指在檢索詞中保留相同的部分，用截詞符號代替可變化的部分。它是為了部分解決由于檢索式中對同義詞列舉不全造成的漏檢現(xiàn)象而提出的，相當于用邏輯“或”擴展檢索范圍。截詞符號一般用“?”或“*”等。？代表零或一個字母；*代表任意個以上字母舉例：Child*可代表child,children,childly,childhoodColo?r可檢索出color,colourDra???t可檢索出drat,draft,draught截詞檢索主要用于年代、作者、同根詞和單復數(shù)詞的檢索，減少輸入負擔，節(jié)省檢索時間和費用，提高檢全率。

第二十一頁，共57頁。SinoMed介紹中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(sinomed)由中國醫(yī)學科學院醫(yī)學信息研究所開發(fā)研制。數(shù)據(jù)規(guī)范

sinomed注重數(shù)據(jù)的規(guī)范化處理和知識管理，全部題錄均根據(jù)美國國立醫(yī)學圖書館最新版《醫(yī)學主題詞表（MeSH）》中譯本、中國中醫(yī)研究院中醫(yī)藥信息研究所《中國中醫(yī)藥學主題詞表》，以及《中國圖書館分類法·醫(yī)學專業(yè)分類表》進行主題標引和分類標引。檢索系統(tǒng)與PUBMED具有良好兼容性

sinomed檢索系統(tǒng)具有檢索入口多，檢索方式靈活，以及主題、分類、期刊、作者等多種詞表輔助查詢功能，可滿足簡單檢索和復雜檢索的需求，與PUBMED具有良好兼容性?？色@得良好的查全率和查準率。與維普鏈接全文

文摘型數(shù)據(jù)庫第二十二頁，共57頁。中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫（CBM）收錄1978以來1600余種中國生物醫(yī)學期刊，以及匯編、會議論文的文獻題錄530余萬篇，全部題錄均進行主題標引和分類標引等規(guī)范化加工處理。年增文獻40余萬篇，每月更新。學科范圍覆蓋基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學、藥學、中醫(yī)學和中藥學等生物醫(yī)學各領域。第二十三頁，共57頁。CBM中的主題檢索（力薦?。?/p>

主題詞的作用：對同一概念具有不同表達方式的詞語進行規(guī)范利于查全率和查準率便于擴大或縮小檢索范圍便于限定文獻的主要概念及方面

主題檢索的功能：將非主題詞引見到主題詞形式提供主題詞的定義和注釋顯示主題詞之間的族性關系（上位詞、下位詞、同位詞）第二十四頁，共57頁。副主題詞對主題詞進行限定，用于描述某個主題范圍內(nèi)的某個方面，如藥物副作用、疾病的診斷、治療等。目前MeSH詞表中共有83個副主題詞，《中醫(yī)藥學主題詞表》有11個，每個副主題詞都有嚴格的適用范圍。有了副主題詞的限定，更能提高文獻檢索的準確性（查準率）。第二十五頁，共57頁。CBM中的檢索歷史最多允許保存200條檢索表達式。可從中選擇一個或多個檢索表達式并用邏輯運算符組成更恰當?shù)臋z索策略。根據(jù)需求選擇一個或多個有意義的檢索表達式保存成特定的“檢索策略”。在“我的空間”中可定期調(diào)用該檢索策略，及時獲取最新信息。無意義的檢索表達式選中后點擊“刪除檢索史”可進行刪除。系統(tǒng)退出后，檢索歷史清除。第二十六頁，共57頁。

或（會考的哦）

PubMed是由美國國立醫(yī)學圖書館（NLM）所屬的生物技術信息中心（NCBI）研制開發(fā)的網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫，是目前國際上公認的檢索生物醫(yī)學文獻最具權威、影響最廣的數(shù)據(jù)庫。PubMed于1997年6月26日開始，免費向公眾開放。第二十七頁，共57頁。維普資訊維普期刊資源整合服務平臺收錄我國1989年至今出版的8000余種科技期刊的全部原文，其中全文2000余萬篇。系統(tǒng)功能概述（考選擇或者填空）期刊文獻檢索文獻引證跟蹤科學指標分析搜索引擎服務第二十八頁，共57頁。維普鏡像網(wǎng)站（呵，這堂課我翹課了，估計是個考點吧?。。。┠暇┐髮W鏡像：蘇州大學鏡像礦業(yè)大學鏡像第二十九頁，共57頁。萬方數(shù)據(jù)知識服務平臺萬方數(shù)據(jù)股份有限公司是國內(nèi)第一家以信息服務為核心的股份制高新技術企業(yè)，是在互聯(lián)網(wǎng)領域，集信息資源產(chǎn)品、信息增值服務和信息處理方案為一體的綜合信息服務商。網(wǎng)址：第三十頁，共57頁。萬方數(shù)據(jù)庫檢索規(guī)則1.PQL語言（PairQueryLanguage）（1）PQ表達式的基本用法：每個PQ表達式由多個空格分隔的部分組成，每個部分稱為一個Pair，每個Pair由冒號分隔符“：”分隔為左右兩部分，“：”左側為限定的檢索字段，右側為要檢索的詞或短語。（2）精確匹配：使用””實現(xiàn)精確匹配（3）各文獻類型的檢索字段2.精確檢索/模糊檢索第三十一頁，共57頁。中國知網(wǎng)中國知識基礎設施工程（ChinaNationalKnowledgeInfrastructure，簡稱CNKI工程）涵蓋了我國自然科學、工程技術、人文與社會科學期刊、博碩士論文、會議論文等公共知識信息資源。第三十二頁，共57頁。讀秀學術搜索讀秀學術搜索是一個由海量全文數(shù)據(jù)及元數(shù)據(jù)組成的超大型數(shù)據(jù)庫。它能夠為讀者提供260萬種圖書、10億頁全文資料、100萬個人物簡介等一系列海量學術資源檢索及使用。同時，通過讀秀學術搜索，還能一站式檢索、借閱館藏紙質圖書、電子圖書、期刊等各種異構資源，幾乎囊括了圖書館內(nèi)的所有信息資源。第三十三頁，共57頁。PubMed主要包括三個層次的數(shù)據(jù)庫MEDLINEPREMEDLINE（處于加工階段的文獻記錄，提供基本的書目數(shù)據(jù)和文摘，但尚未標引主題詞）與出版商直接提供給PUBMED的文獻數(shù)據(jù)（這部分文獻是由出版商以電子版形式先傳送給PUBMED，然后再傳輸?shù)絅LM標引部加到PREMEDLINE數(shù)據(jù)庫）第三十四頁，共57頁。認識PubMed文獻在摘要顯示模式下可以看到詳細的文獻信息作者地址文獻摘要文獻作者文獻篇名全文鏈接文獻類型文獻主題詞第三十五頁，共57頁。認識PubMed文獻非英文的文獻篇名上有中括號[]且注明有語種英文文獻土耳其語[篇名]英文文獻第三十六頁，共57頁。PubMed基本檢索

自由詞檢索

在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，作者全稱表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。例如：檢索腫瘤(cancer)方面的文章。在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。

PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進行檢索，比如，檢索“cancer”

將自動轉換為："neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]（這個會考的，我知道，BELIEVEME,IKNOW)第三十七頁，共57頁。PubMed基本檢索

作者姓名檢索按照姓+名縮寫（不用標點）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。姓名第一個字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫。（有趣）

考慮到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動轉換功能進行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號將作者名引起來，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，實現(xiàn)精確查找。第三十八頁，共57頁。PubMed基本檢索期刊檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：molecularbiologyofthecell，系統(tǒng)的“自動詞語匹配”功能會將它轉換成molbiolcell[journal]進行檢索。也可以直接輸入Medline的期刊標準縮寫形式，如：molbiolcell，或者是輸入刊物的ISSN（國際標準出版物代碼）進行檢索，如：1059-1524。如果一個雜志名恰好是主題詞或關鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會首先將這些詞轉換成MeSH詞表中的主題詞進行檢索。因此，需要將檢索請求進行標準化處理，即在雜志名后面加[TA]。如："cell"[ta]（這個很妙大家研究一下）第三十九頁，共57頁。PubMed基本檢索

截詞檢索截詞檢索的作用：擴大檢索范圍，提高查全率。截詞符：用*表示，代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進行檢索。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacteriophage，bacterium，等最多600個單詞。第四十頁，共57頁。PubMed基本檢索

字段限制檢索采用字段限制進行檢索，其規(guī)則是：檢索詞[字段標識]如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關DNA方面的文獻.檢索式：

DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]第四十一頁，共57頁。主題詞MeSH檢索

MeshDatabase（考個簡答題）檢索方法:1、點擊主頁右下角的MeSHDatabase進入主題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關主題詞；3、點擊該主題詞進一步顯示該主題詞的定義、樹狀結構、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點擊sendto按鈕，進入檢索表達式瀏覽窗口；5、點擊SearchPubMed將顯示檢索結果。第四十二頁，共57頁。外文電子全文數(shù)據(jù)庫

學術性電子期刊出版方式分：印刷版本期刊電子化；純 電子形式出版 服務方式：出版商的電子數(shù)據(jù)庫；數(shù)據(jù)庫商集成；Open Access開放存取資源 全文格式：PDF；HTML（考的）

第四十三頁，共57頁。Elsevier全文數(shù)據(jù)庫-ScienceDirect（含CellPress）MDconsult（醫(yī)學資訊）EBSCOhost全文數(shù)據(jù)庫Ovid(lww)全文數(shù)據(jù)庫ProQuest（PQDD）Wiley-Blackwell全文數(shù)據(jù)庫ThiemeColorAtlasE-Book

第四十四頁，共57頁。Ovid(lww)全文數(shù)據(jù)庫

Ovid公司是全球著名醫(yī)學信息服務商，通過其檢索平臺

OvidSP，可以檢索電子期刊（Journals@ovid）、電子圖 書（Books@ovid）以及近百種數(shù)據(jù)庫。 電子期刊Journals@Ovid提供訪問包括Lippincott Williams&Wilkins（LWW）、美國醫(yī)學協(xié)會和Adis international醫(yī)學藥學期刊。 電子書Books@Ovid

數(shù)據(jù)庫Databases@Ovid

第四十五頁，共57頁。檢索結果：排序保存/輸出二次檢索…星級排序：5星：所有搜索的概念都完整出現(xiàn)在段落里。4星：大多數(shù)搜索概念都出現(xiàn)在段落里，但有些不完整3星：缺少一個概念2星：缺少兩個概念1星：缺少2個以上的概念其他：個性化服務與定制

第四十六頁，共57頁。Wiley-Blackwell全文數(shù)據(jù)庫（老師課上講過，當時還放了個搞笑視頻，不過對于搞笑視頻我一般不笑的）JohnWiley&SonsInc.和BlackwellPublishingHoldingsLtdWiley出版高質量的學術期刊、過刊集、圖書、參考工具書、實驗室指南、循證醫(yī)學圖書館（TheCochraneLibrary）、數(shù)據(jù)庫等，是眾多的國際權威學會的合作伙伴。Wiley整合科學、技術及醫(yī)學業(yè)務（STM）和Blackwell。WileyOnlineLibrary科學、技術、醫(yī)學、社會科學及人文1996-這是一個非常好的數(shù)據(jù)庫，醫(yī)學資源豐富。漫游功能開通后可在三個月內(nèi)非校內(nèi)IP訪問此庫。第四十七頁，共57頁。引文檢索引文：引文指一篇學術論文中引用的參考文獻，通常以腳注或者尾注的形式出現(xiàn)。引文索引：引文索引以某一文獻

(包括作者、題名、發(fā)表年份、出處等基本數(shù)據(jù))作為標目,標目下著錄引用或參考過該文獻的全部文獻及出處，它主要供用戶從被引文獻查找引用文獻。第四十八頁，共57頁。用于科學績效的評估

評估學術論文的影響力杰出青年基金、成果評獎、職稱評定……

評估國家宏觀科研狀況中國科技論文統(tǒng)計結果發(fā)布會

學術期刊的評價JCR、國內(nèi)的期刊引證報告、核心期刊評選第四十九頁，共57頁。WebofScienceISIWebofScience包括著名的三大引文索引：ScienceCitationIndexExpanded?(SCIE,1990至今)SocialScienc