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本文格式為Word版,下載可任意編輯——分子生物學(xué)復(fù)習(xí)題及其答案
復(fù)習(xí)題第一章緒論
中心法則(centraldogma)
答:DNA通過復(fù)制將遺傳信息由親代傳遞到子代,通過轉(zhuǎn)錄和翻譯,將遺傳信息傳遞給蛋白質(zhì)分子,從而決定生物的表現(xiàn)型。蛋白質(zhì)的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯過程就構(gòu)成遺傳學(xué)的中心法則。
其次章染色體與DNA
一、填空題
1.線粒體DNA的復(fù)制為____D環(huán)___方式,大腸桿菌染色體的復(fù)制為__?型____方式,ФX174環(huán)狀染色體和噬菌體λDNA后期復(fù)制為____滾環(huán)__方式,真核生物染色體復(fù)制為____多起點(diǎn)雙向線形___方式。2.DNA的二級結(jié)構(gòu)為_____DNA雙螺旋_______。
3.在真核細(xì)胞中DNA的三級結(jié)構(gòu)為______核小體______結(jié)構(gòu),它由140bp的DNA纏繞于由______H2A/H2B/H3/H4各兩個______組成的八聚體外,又以60bp的DNA及_____H1_______形成的細(xì)絲相連組成串珠狀結(jié)構(gòu)。
4.在DNA合成過程中改變DNA分子超螺旋構(gòu)型的酶是_____拓?fù)洚悩?gòu)酶_______。
5.原核生物DNA聚合酶有三種,其中參與DNA復(fù)制的是______DNA聚合酶1______和______DNA聚合酶3______,參與DNA切除修復(fù)的是______DNA聚合酶1______。
6.紫外線照射可在相鄰的兩個_____胸腺_______嘧啶間形成_____嘧啶二聚體_______。
7.在同源重組過程中,往往形成_______Holliday_____中間體。
8.大腸桿菌整個染色體DNA是_____環(huán)狀_______的,它的復(fù)制開始于______oriC______,復(fù)制的方向是______5端向3端______,復(fù)制的機(jī)制是_______半保存半不連續(xù)_____。
9.假使將15N標(biāo)記的大腸桿菌在14N培養(yǎng)基中生長三代,提取其DNA,進(jìn)行CsCl密度梯度離心,其15N,14N-DNA分子與純14N-DNA分子之比為______1:3______。10.在真核生物中DNA復(fù)制的主要酶是_____DNA聚合酶?_______。
11.在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中,除了需要模板DNA外,還必需參與______DNA聚合酶______、_______dNTP_____、______引物______、和鎂離子。
12.DNA復(fù)制時,合成DNA新鏈之前必需合成_____RNA引物_______,它在原核生物中的長度大約有_____6~10個堿基____bp。
13.DNA復(fù)制的兩大特點(diǎn)是_____半保存_____和______半不連續(xù)______。
14.DNA復(fù)制和修復(fù)的模板是______DNA______,原料是______4種脫氧核苷酸______。
15.引起DNA損傷的因素有_自發(fā)因素_、___物理因素__和__化學(xué)因素___等。
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二、選擇題
1.DNA復(fù)制中解開雙螺旋的酶是(B)。
A.拓?fù)涿窧.解螺旋酶C.DNA結(jié)合蛋白D.連接酶2.DNA受熱變性時(D)。
A.在260nm波優(yōu)點(diǎn)吸光度下降B.多核苷酸鏈斷裂
C.堿基對可形成共價(jià)連接D.參與互補(bǔ)RNA鏈冷卻可形成DNA:RNA雜交分子3.以下序列中,在雙鏈狀態(tài)下屬于完全回文結(jié)構(gòu)的序列是(C)。A.AGTCCTGAB.AGTCAGTCC.AGTCGACTD.GACTCTGA4.有關(guān)DNA結(jié)構(gòu)的正確說法是(D)。
A.雙螺旋的兩股鏈?zhǔn)且恢碌腂.雙螺旋兩股鏈平行,也即走向同一方向
C.雙螺旋中的堿基平行于螺旋的軸D.雙螺旋的兩股長鏈以反向平行方式盤繞5.真核生物復(fù)制起點(diǎn)的特征包括(B)。
A.富含G-C區(qū)B.富含A-T區(qū)C.Z-DNAD.無明顯特征6.插入序列(IS)編碼(A)。
A.轉(zhuǎn)座酶B.逆轉(zhuǎn)錄酶C.DNA聚合酶D.Klenow酶7.原核生物基因組中沒有(A)。
A.內(nèi)含子B.外顯子C.轉(zhuǎn)錄因子D.插入序列
8.自然界中以DNA為遺傳物質(zhì)的大多數(shù)生物DNA的復(fù)制方式是(C)。A.環(huán)式B.D環(huán)式C.半保存D.全保存9.關(guān)于組蛋白以下說法正確的是(D)。
A.為中性蛋白B.為酸性蛋白C.進(jìn)化上不具保守性D.染色體結(jié)合蛋白10.構(gòu)成染色體的基本單位是(B).
ADNAB.核小體C.螺線管D.超螺線管11.以下屬于DNA自發(fā)損傷的是(A)。
A.DNA復(fù)制時的堿基錯配B.紫外線照射DNA生成嘧啶二聚體C.亞硝基鹽使胞嘧啶脫氨D.雙功能烷化劑使DNA交聯(lián)
三、名詞解釋
semiconservationreplication半保存復(fù)制——在復(fù)制過程中雙螺旋DNA解旋并分開,然后以每條鏈為模板,按堿基互補(bǔ)配對原則,由DNA聚合酶催化合成新的互補(bǔ)鏈,結(jié)果由一條鏈合成為互補(bǔ)的兩條鏈,這樣新形成的兩個DNA分子與原來的DNA分子的堿基序列完全一致。由于每個子代DNA的一條鏈來自親代DNA,另一條鏈則是新和成的。這種復(fù)制方式稱為半保存復(fù)制。
semidiscontinuousreplication半不連續(xù)復(fù)制——以紡織叉移動的方向?yàn)榛鶞?zhǔn),一條模板鏈?zhǔn)?端向5端,以此為模板新生成的DNA鏈合成沿5端向3端方向連續(xù)進(jìn)行,另一條模板鏈的方向?yàn)?端向3端,以此為模板的新鏈合成方向也是5端向3端,但與復(fù)制叉前進(jìn)方向相反,可以先分段不連續(xù)合成岡崎片段,岡崎片段再由DNA連接酶連接成完整的DNA鏈,這種合成方式被稱為DNA合成的半不連續(xù)復(fù)制。
IS插入序列——是最簡單的轉(zhuǎn)座子,不含任何宿主基因,它們是細(xì)菌染色體或質(zhì)粒DNA的正常組成部分(?:IS1)。IS序列是可以獨(dú)立存在的單元,帶有介導(dǎo)自身移動的蛋白質(zhì)。
C值勃理——C值是一種生物的單倍體基因組DNA總量。由于真核細(xì)胞基因組
-2-
中含有大量的重復(fù)序列,造成物種的C值和它的進(jìn)化繁雜性之間無嚴(yán)格的對應(yīng)關(guān)系,這種現(xiàn)象稱為C值悖論。
DNA的變性與復(fù)性——變性是DNA雙鏈的氫鍵斷裂,最終完全變成單鏈的過程,復(fù)性是熱變性的DNA緩慢冷卻、單鏈恢復(fù)成雙鏈的過程。
核小體——核小體是由直徑2nm的DNA雙螺旋鏈繞組蛋白形成直徑為11nm的核小體“串珠〞結(jié)構(gòu),是染色體基本結(jié)構(gòu)單元。每個單元中含義H2A/H2B/H3/H4,各兩分子(它們構(gòu)成一個八聚體),1分子H1,。染色質(zhì)中的DNA雙螺旋鏈一般為18~200bp,等距離纏繞組蛋白八聚體形成眾多核心顆粒,各顆粒之間為帶有H1組蛋白的連接區(qū)DNA。
岡崎片段——DNA復(fù)制合成滯后鏈時候首先合成的短DNA片段。
Transponson——存在于細(xì)菌染色體DNA上可以自主復(fù)制和位移的基本單位。包括插入序列和復(fù)合轉(zhuǎn)座子,前者末端具有倒轉(zhuǎn)重復(fù)序列,后者兩端是插入序列,中間含義宿主基因。
復(fù)合轉(zhuǎn)座子——一類帶有某種抗藥性基因(或其它宿主基因)的轉(zhuǎn)座子,其兩翼往往是兩個一致或高度同源的IS序列,IS序列插入到某個功能基因兩端時候就可能產(chǎn)生復(fù)合轉(zhuǎn)座子。
反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子——以RNA為中介通過反轉(zhuǎn)錄成DNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)座的可動元件。
四、問答題
1.為什么DNA復(fù)制時,只有一條新鏈(前導(dǎo)鏈)是連續(xù)復(fù)制的,而另一條新鏈(滯后鏈)只能是斷續(xù)復(fù)制?并簡述滯后鏈復(fù)制的各個步驟。
答:1.DNA雙螺旋的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?,在?fù)制叉附近解開的DNA鏈一條是5端向3端,另一條是3端向5端,兩個模板極性不同;2.DNA聚合酶的合成方向都是5端向3端,而不是3端向5端;3DNA復(fù)制時局部解鏈暴露出模板鏈;4.以3端向5端為模板的前導(dǎo)鏈的合成方向是5端向3端,與復(fù)制叉移動方向一致,能連續(xù)合成,以5端向3端為模板的滯后鏈的合成方向也是5端向3端,與復(fù)制叉前進(jìn)方向相反,無法直接復(fù)制,一定要等前導(dǎo)鏈開始合成而將其合成模板暴露出來以后,合成才得以進(jìn)行,因此只能分段地不連續(xù)合成。
2.有哪些酶和蛋白質(zhì)參與原核生物的DNA復(fù)制,它們在復(fù)制中的生物學(xué)功能是什么?答:1.DNA聚合酶1——除去岡崎片段上RNA引物,完成兩個岡崎片段間的DNA合成;2DNA聚合酶2——可能在DNA的修復(fù)中起某種作用;3.DNA聚合酶3——合成新鏈DNA主要的酶;4.引物酶或RNA聚合酶(引發(fā)酶)——合成DNA復(fù)制所需的RNA引物;5解螺旋酶——DNA兩條鏈解開;6.DNA解旋酶——消除復(fù)制叉前進(jìn)時候帶來的扭曲張力;7.單鏈DNA結(jié)合蛋白——防止復(fù)性和保護(hù)單鏈DNA不被核酸酶降解;8.DNA連接酶——連接岡崎片段;9.DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶——消除或引人DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)
3.什么是DNA的半保存復(fù)制?它的試驗(yàn)依據(jù)是什么?
答:在DNA復(fù)制過程中雙螺旋解旋并分開,然后以每條鏈為模板,按堿基互補(bǔ)配對原則,由DNA聚合酶催化合成新的互補(bǔ)鏈,結(jié)果由一條鏈成為互補(bǔ)的兩條鏈,這樣新形成的兩個DNA分子與原來的DNA分子的堿基序列完全一致。由于每個子代DNA的一條鏈來自親代DNA,另一條鏈則是新和成。這種復(fù)制方式
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成為半保存復(fù)制。
試驗(yàn)依據(jù):1958年,Meselson和Stahl利用同位素標(biāo)記和密度梯度離心試驗(yàn),將大腸桿菌放在15NH4Cl培養(yǎng)基中生長15代,使DNA被15N標(biāo)記后,再將細(xì)菌轉(zhuǎn)移到只含有14NH4Cl的培養(yǎng)基中培養(yǎng)。分別取0代、1代、2代、3代的細(xì)胞,提取DNA,進(jìn)行密度梯度離心,結(jié)果發(fā)現(xiàn),當(dāng)含有15N-DNA的細(xì)胞在14NH4Cl培養(yǎng)液中培養(yǎng)一代后,只有一條區(qū)帶介于14N-DNA與15N-DNA之間,說明DNA一條鏈來自15N-DNA,另一條鏈為含有14N的新合成鏈;培養(yǎng)兩代后則出現(xiàn)兩條帶,一條帶在14N-DNA區(qū),另一條在14N-DNA與15N-DNA之間,依照半保存復(fù)制方式培養(yǎng)兩代,只能出現(xiàn)14N-DNA和14N,15N-DNA兩種分子;培養(yǎng)三代后則出現(xiàn)三條代,一條帶14N—DNA區(qū),另一條帶在14N—DNA與15N-DNA之間,還有一條帶在15N-DNA區(qū),依照半保存復(fù)制方式培育三代,能出現(xiàn)14N-DNA14N,15N-DNA和15N-DNA三種分子,隨代數(shù)的增加14N-DNA逐漸增加而14N,15N-DNA區(qū)帶逐漸減弱。
4.原核生物中存在哪些類型的轉(zhuǎn)座子?其轉(zhuǎn)座機(jī)理有哪些?
答:轉(zhuǎn)座機(jī)理:①復(fù)制型轉(zhuǎn)座——在相互作用時,轉(zhuǎn)座子被復(fù)制,因此轉(zhuǎn)座實(shí)體是原轉(zhuǎn)座子的一個拷貝。轉(zhuǎn)座子中作為移動的部分被拷貝。一個拷貝保存在原味點(diǎn),另一個位點(diǎn)插入到新的位點(diǎn),復(fù)制型轉(zhuǎn)座涉及到兩種類型的酶活性:一是轉(zhuǎn)座酶,他們在原轉(zhuǎn)座子的末端起作用。另一種為拆分酶,它對復(fù)制拷貝起作用。②非復(fù)制型轉(zhuǎn)座——轉(zhuǎn)座因子直接從原來位置插入新的位置,并保存在插入位置上,這中轉(zhuǎn)座只需轉(zhuǎn)座酶的作用。非復(fù)制轉(zhuǎn)座的結(jié)果是原來的位置上丟失了轉(zhuǎn)座因子,而在插入的位置上增加了轉(zhuǎn)座因子這可能是表型的變化③反轉(zhuǎn)座因子通過在將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA拷貝的能力而遷移;DNA拷貝同時被整合在基因組的新位點(diǎn),反轉(zhuǎn)座作用在出現(xiàn)在真核生物,所有反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子都有一個共同的特點(diǎn),即在其插入微點(diǎn)上產(chǎn)生短的正向重復(fù)序列。
5.簡述DNA復(fù)制的過程,并比較原核生物和真核生物DNA復(fù)制的差異。答:(1)DNA復(fù)制的過程可被分為三個階段:復(fù)制的起始、延伸和終止。每個DNA復(fù)制的獨(dú)立單元主要包括復(fù)制的起始位點(diǎn)和終止位點(diǎn)。DNA復(fù)制的起始包括預(yù)引發(fā)和引發(fā)兩個階段。在預(yù)引發(fā)階段,DNA解旋解鏈,形成復(fù)制叉,引發(fā)體組裝;在引發(fā)階段,在引發(fā)酶的催化下以DNA鏈為模板合成一段短的RNA引物。復(fù)制時DNA鏈的延伸由DNA聚合酶催化,以親代DNA鏈為模板,引發(fā)體移動,從5ˊ→3ˊ方向聚合子代DNA鏈。當(dāng)子鏈延伸達(dá)到終止位點(diǎn)時,DNA復(fù)制就終止了,切除RNA引物,填補(bǔ)缺口,在DNA連接酶的催化下相鄰的岡崎片段連接起來形成完整的DNA長鏈。
(2)原核生物和真核生物DNA復(fù)制的差異:DNA復(fù)制差異項(xiàng)原核生物真核生物復(fù)制起始點(diǎn)和單位單復(fù)制子、單點(diǎn)起始多復(fù)制子100-200bp、多點(diǎn)起始、分段進(jìn)行復(fù)制復(fù)制叉移動速度快、5kb/min慢、1-3kb/min復(fù)制方向雙向雙向復(fù)制的終止復(fù)制叉相遇即終止端粒DNA聚合酶E.coliDNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、DNA聚合酶a、β、r、Ⅲσ、ε
-4-
組蛋白的裝配——————————需要組蛋白全保存裝配,5種組蛋白形成八聚體核小體
6.簡述DNA損傷修復(fù)的機(jī)制。
答:DNA損傷以后可以生物體可通過多種修復(fù)機(jī)制進(jìn)行修復(fù)。
①直接修復(fù):又稱光復(fù)活修復(fù),可見光可以激活光復(fù)活酶,由光復(fù)活酶識
別嘧啶二聚體并與之結(jié)合形成復(fù)合物,在可見光照射下,酶獲得能量,將環(huán)丁烷胸腺嘧啶二聚體的丁酰環(huán)開啟和6-4光化物還原成單體,另外甲基轉(zhuǎn)移酶使O-甲基鳥嘌呤脫甲基生成鳥嘌呤,防止G-T配對,使之完全修復(fù)。
②切除修復(fù),包括堿基切除修復(fù)和核苷酸切除修復(fù)。堿基切除修復(fù):DNA
糖苷水解酶能特異性識別常見的DNA損傷位點(diǎn),并特異地切除受損核苷酸上的N-β-糖苷鍵,在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn),統(tǒng)稱AP位點(diǎn);由AP磷酸內(nèi)切酶將受損核苷酸的糖苷-磷酸鍵切開;利用DNA聚合酶Ⅰ切除損傷部位,補(bǔ)上核苷酸;再由DNA連接酶將切口連接。核苷酸切除修復(fù):該修復(fù)機(jī)制由兩種不同的酶來發(fā)動,一種是核酸內(nèi)切酶,另外一種是DNA糖苷酶。特異性的核酸內(nèi)切酶或DNA糖苷酶識別DNA受損部位,并在該部位的5ˊ端作一切口;由核酸外切酶從5ˊ→3ˊ端逐一切除損傷的單鏈;在DNA聚合酶的催化作用下,以互補(bǔ)鏈為模板,合成新的單鏈片段以填補(bǔ)缺口;由DNA連接酶催化連接片段封閉缺口。
③重組修復(fù):重組修復(fù)發(fā)生在DNA復(fù)制之前,而當(dāng)DNA發(fā)動復(fù)制時尚未
修復(fù)的損傷部位,DNA復(fù)制時,損傷部位導(dǎo)致子鏈DNA合成障礙,形成空缺;此空缺誘導(dǎo)產(chǎn)生重組酶,該酶與空缺區(qū)結(jié)合,并催化子鏈空缺與對側(cè)親鏈進(jìn)行重組交換;對側(cè)親鏈產(chǎn)生的空缺以互補(bǔ)的子鏈為模板,在DNA聚合酶和連接酶的催化下,重新修復(fù)缺口;親鏈上的損傷部位繼續(xù)保存或以切除修復(fù)方式加以修復(fù)。④易錯修復(fù)和應(yīng)急反應(yīng)(SOS反應(yīng)),誘導(dǎo)修復(fù)是細(xì)胞DNA受到嚴(yán)重?fù)p傷
或DNA復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急狀況下,為求得生存而出現(xiàn)的一系列誘導(dǎo)性修復(fù),SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)系統(tǒng)包括避免過錯的修復(fù)和傾向過錯的修復(fù)。避免過錯的修復(fù):SOS反應(yīng)能誘導(dǎo)光復(fù)活切除修復(fù)和重組修復(fù)中某些關(guān)鍵酶和蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,從而加強(qiáng)光復(fù)活切除修復(fù)和重組修復(fù)的能力。傾向過錯的修復(fù):SOS反應(yīng)還能誘導(dǎo)產(chǎn)生缺乏校對動能的DNA聚合酶,它能在DNA損傷部位進(jìn)行復(fù)制而避免了死亡,可是卻帶來了高的突變率。
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第三章
一、填空題
1、轉(zhuǎn)錄的底物是四種NTP,原核生物RNA聚合酶可受利福霉素抑制,后者與該酶的β亞基結(jié)合。
2、真核生物的三類RNA聚合酶對α-鵝膏蕈堿的敏感度不同,RNA聚合酶Ⅱ最敏感,RNA聚合酶Ⅰ不敏感,RNA聚合酶Ⅲ具有種屬特異性。
3、尋常原核生物的終止子在終止點(diǎn)之前均有一個富含GC堿基的二重對稱區(qū),其產(chǎn)生的RNA可形成發(fā)夾式結(jié)構(gòu)。
4、DNA結(jié)構(gòu)基因中存在被轉(zhuǎn)錄也被翻譯的序列稱為外顯子,被轉(zhuǎn)錄但是不被翻譯的序列稱為內(nèi)含子。
5、真核生物的mRNA加工過程中,5?端加上帽子,在3?端加上poly(A),后者由催化。假使被轉(zhuǎn)錄基因是不連續(xù)的,那么,一定要被切除,并通過過程將連接在一起。
6、–10位的5′-TATAATG-3′區(qū)和–35位的5′-TTGACA-3′區(qū)是RNA聚合酶與啟動子的結(jié)合位點(diǎn),能與σ因子相互識別而具有很高的親和力。7、決定基因轉(zhuǎn)錄基礎(chǔ)頻率的DNA元件是,它是的結(jié)合位點(diǎn)。
8、原核生物RNA聚合酶核心酶由2個a亞基、一個β亞基、一個βˊ亞基和一個ω亞基組成,全酶由2個a亞基、一個β亞基、一個βˊ亞基、一個ω亞基和一個σ亞基組成。
二、選擇題
1、以下有關(guān)TATA盒的表達(dá),哪個是正確的:(BB)A.它位于第一個結(jié)構(gòu)基因處B.它和RNA聚合酶結(jié)合C.它編碼阻遏蛋白D.它和反密碼子結(jié)合2.轉(zhuǎn)錄需要的原料是:(D)
A.dNTPB.dNDPC.dNMPD.NTPE.NMP3、DNA模板鏈為5?-ATTCAG-3?,其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是:(D)A.5?-GACTTA-3?B.5?-CTGAAT-3?C.5?-UAAGUC-3?D.5?-CUGAAU-3?
4、DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄過程有大量一致點(diǎn),以下描述哪項(xiàng)是錯誤的?(DD)A.轉(zhuǎn)錄以DNA一條鏈為模板,而以DNA兩條鏈為模板進(jìn)行復(fù)制B.在這兩個過程中合成均為5`-3`方向C.復(fù)制的產(chǎn)物尋常狀況下大于轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物D.兩過程均需RNA引物
5、以下哪種RNA的剪切需要剪切體參與(AA)。
A:真核細(xì)胞mRNAB:線粒體mRNAC:rRNAD:tRNA6、參與轉(zhuǎn)錄終止的因素是(DD)。
A:σ因子B:ρ因子C:轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3?端發(fā)夾結(jié)構(gòu)D:ρ因子或轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3?端發(fā)夾結(jié)構(gòu)7、常見內(nèi)含子的剪切位點(diǎn)具有的特征(AA)。
A:5?-GU,3?-AGB:5?-AG,3?-GUC:5?-GA,3?-UGD:5?-UG,3?-GA8、真核生物中,存在于核仁中的RNA聚合酶是(A)。
A:RNA聚合酶αB:RNA聚合酶βC:RNA聚合酶γD:RNA聚合酶δ9、下面那一項(xiàng)不屬于原核生物mRNA的特征(CC)
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A:半衰期短B:存在多順反子的形式
C:5?端有帽子結(jié)構(gòu)D:3?端沒有或只有較短的多聚(A)結(jié)構(gòu)10、真核細(xì)胞中的mRNA帽子結(jié)構(gòu)是(AA)
A.7-甲基鳥嘌呤核苷三磷酸B.7-甲基尿嘧啶核苷三磷酸C.7-甲基腺嘌呤核苷三磷酸D.7-甲基胞嘧啶核苷三磷酸12、下面哪一項(xiàng)為哪一項(xiàng)對三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的正確描述(B)(A)σ因子、核心酶和雙鏈DNA在啟動子形成的復(fù)合物(B)全酶、模板DNA和新生RNA形成的復(fù)合物(C)三個全酶在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)形成的復(fù)合物(D)σ因子、核心酶和促旋酶形成的復(fù)合物
三、名詞解釋
CAAT盒:真核生物轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游的極端保守DNA序列,被一組轉(zhuǎn)錄因子識別,調(diào)控轉(zhuǎn)錄的起始頻率TATA盒:真核生物RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游大約25核苷酸處的富含AT的保守區(qū),其功能涉及RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄的正確起始。內(nèi)含子:在原始轉(zhuǎn)錄物中通過RNA剪接反應(yīng)而被去除的RNA序列或基因中與這種RNA序列相對應(yīng)的DNA序列。
外顯子:在原始轉(zhuǎn)錄物中通過RNA剪接反應(yīng)將內(nèi)含子去除后而保存下來的RNA序列或基因中與這種RNA序列相對應(yīng)的DNA序列
啟動子:DNA分子上結(jié)合RNA聚合酶并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的區(qū)域,尋常位于5′上游區(qū)域。在多數(shù)狀況下還包括促進(jìn)轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)理蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。
RNA編輯:是某些RNA,特別是mRNA的一種加工方式,通過核苷酸的替換、插入或刪除初生轉(zhuǎn)錄物特定部位的堿基而改變其中的核苷酸序列,它導(dǎo)致了DNA所編碼的遺傳信息的改變,由于經(jīng)過編輯的mRNA序列發(fā)生了不同于模板DNA的變化。
σ因子:原核生物RNA聚合酶的一個亞基,是轉(zhuǎn)錄起始所必需的因子,主要影響RNA聚合酶對轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的正確選擇。
四、問答題
1、簡述真核細(xì)胞與原核細(xì)胞基因的不同結(jié)構(gòu)特征,說明由此造成的不同轉(zhuǎn)錄后加工過程。答:真核生物的基因結(jié)構(gòu)由單順反子構(gòu)成,具有內(nèi)含子和較多的重復(fù)序列。轉(zhuǎn)錄和翻譯分別在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中進(jìn)行。原核生物的基因結(jié)構(gòu)是由多順反子組成,無內(nèi)含子,重復(fù)序列較少。因此真核生物進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后的加工需要在mRNA5′端加帽子和3′端加poly(A)尾巴,以保持mRNA的穩(wěn)定性。同時,還要進(jìn)行RNA的剪接和修飾以切除內(nèi)含子。而原核生物的多順反子多形成一個操縱子,完成各項(xiàng)功能。其轉(zhuǎn)錄和翻譯是緊湊連接的,不需要進(jìn)行加尾和加冒的過程,由于沒有內(nèi)含子,也無需剪接步驟。2、試比較真核生物RNA聚合酶Ⅱ識別的啟動子與原核生物RNA聚合酶所識別的啟動子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),各結(jié)構(gòu)單元的功能是什么?
答:啟動子是RNA聚合酶特異結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列。在這段序列內(nèi),有一些對于啟動子功能很關(guān)鍵的保守短序列。
原核生物啟動子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):啟動區(qū)長約40bp,-10序列是幾乎所有的啟動子都含有的一個6bp的序列,該六聚體尋常位于轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游10bp處,共有-10序列是TATAAT,尋常稱為Pribnow框,是RNA聚合酶的緊湊結(jié)合位點(diǎn)。-35序列是另一個在大多數(shù)啟動子中都可以找
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到的6bp序列,該六聚體一般位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游35bp處,共有-35序列TTGACA,是RNA聚合酶對啟動子的識別有關(guān)序列,對轉(zhuǎn)錄起始頻率影響很大。
真核生物啟動子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):真核生物啟動子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-25~-30bp處的共同序列TATAAA,也稱為TATA區(qū)(Hogness框),相當(dāng)于原核生物的-10序列的功能;在起始位點(diǎn)上游-70~-80bp處還有另一段共同序列CCAAT,這是與原核生物-35bp區(qū)的序列相對應(yīng),稱為CAAT區(qū)(CAAT框);
比較原核與真核生物轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游區(qū)的結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn):①原核基因啟動區(qū)范圍較小,一般狀況下,TATAAT(Pribnow區(qū))的中心位于-10~-7,上游-70~-10區(qū)為正調(diào)控因子結(jié)合序列,-20~+1區(qū)為負(fù)調(diào)控因子結(jié)合序列。真核基因的調(diào)控范圍較大,TATAA/TA區(qū)位于-30~-20,而-110~-40區(qū)為上游激活區(qū)。②原核生物基因啟動子上游只有TTGACA區(qū)(-40~-30)作為RNA聚合酶的主要結(jié)合位點(diǎn),參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控。真核基因除了含有與之相對應(yīng)的CAAT區(qū)之外,大多數(shù)基因還擁有GC區(qū)和増強(qiáng)子區(qū)。原核生物RNA聚合酶不需要大量多肽參與,一種RNA聚合酶能識別不同的結(jié)構(gòu)基因。
3、比較DNA復(fù)制與轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)。
答:一致點(diǎn):都以DNA鏈作為模板,合成的方向均為5ˊ→3ˊ,聚合反應(yīng)均遵循堿基配對原則,通過核苷酸之間形成的3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵使核苷酸鏈延長。不同點(diǎn):模板原料酶產(chǎn)物配對引物
復(fù)制兩條鏈均被復(fù)制dNTPDNA聚合酶A-T;G-CRNA引物轉(zhuǎn)錄模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對稱轉(zhuǎn)錄)NTPRNA聚合酶A-U;G-C;T-A無子代雙鏈DNA(半保存復(fù)制)mRNA、tRNA、rRNA-8-
第四章
一、填空題1、遺傳密碼的是由于mRNA上的密碼子與tRNA上的反密碼子不一定嚴(yán)格配對。2、核糖體上可區(qū)分出五個功能活性位點(diǎn),其中A位點(diǎn)主要在50S亞基上,而P位點(diǎn)主要在50S亞基上。
3、至少含有42個核苷酸的mRNA(不包括上游的非編碼序列)才能編碼含有13個氨基酸的多肽。
4、tRNA的二級結(jié)構(gòu)為三葉草形,三級結(jié)構(gòu)為倒L形。
5、原核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲酰甲硫氨酰-tRNA攜帶的氨基酸是甲酰甲硫氨酸,而真核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲硫氨酰-tRNA,它攜帶的氨基酸是甲硫氨酸。
6、真核生物中rRNA包括18SrRNA,28SrRNA,5.8SrRNA,5SrRNA。7、各類核糖核酸中,稀有堿基含量比例(%)最高的是。8、新生肽鏈每增加一個氨基酸單位都要經(jīng)過進(jìn)位,肽鍵形成和移位三步反應(yīng)。9、與mRNA密碼子ACG相對應(yīng)的tRNA的反密碼子是CGU,tRNA的反密碼子為UGC,它識別的密碼子為GCA。
10、一種氨基酸最多可以有6個密碼子,一個密碼子最多決定1種氨基酸。
11、多肽合成的起始密碼子是AUG,而UAA,UAG和UGA是終止密碼子。12、tRNA分子有氨基酸臂,TΨC環(huán),反密碼子環(huán)、可變環(huán)和尿嘧啶環(huán)等五個主要結(jié)構(gòu)。
二、選擇題
1.多數(shù)氨基酸都有兩個以上密碼子,以下哪組氨基酸只有一個密碼子?(CD)
A.蘇氨酸、甘氨酸B.脯氨酸、精氨酸C.絲氨酸、亮氨酸D.色氨酸、甲硫氨酸E.天冬氨酸和天冬酰胺2.tRNA分子上結(jié)合氨基酸的序列是(B)
A.CAA-3′B.CCA-3′C.AAC-3′D.ACA-3′E.AAC-3′3.遺傳密碼(C)
A.20種氨基酸共有64個密碼子B.堿基缺失、插入可致框移突變
C.AUG是起始密碼D.UUU是終止密碼E.一個氨基酸可有多達(dá)6個密碼子4、tRNA能夠成為氨基酸的轉(zhuǎn)運(yùn)體、是由于其分子上有(A)
A.-CCA-OH3′末端B.3個核苷酸為一組的結(jié)構(gòu)C.稀有堿基D.反密碼環(huán)E.假腺嘌吟環(huán)
5、蛋白質(zhì)生物合成中的終止密碼是(A)。
(A)UAA(B)UAU(C)UAC(D)UAG(E)UGA6、Shine-Dalgarno順序(SD-順序)是指:(AA)
A.在mRNA分子的起始碼上游8-13個核苷酸處的順序B.在DNA分子上轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)前8-13個核苷酸處的順序
C.16srRNA3?端富含嘧啶的互補(bǔ)順序D.啟動基因的順序特征7、“同工tRNA〞是:(A)
(A)識別同義mRNA密碼子(具有第三堿基簡并性)的多個tRNA(B)識別一致密碼子的多個tRNA(C)代表一致氨基酸的多個tRNA
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(D)由一致的氨酰tRNA合成酶識別的多個tRNA
8、反密碼子中哪個堿基對參與了密碼子的簡并性(搖擺)。(A)(A)第一個(B)其次個(C)其次個(D)第一個與其次個9、與mRNA的GCU密碼子對應(yīng)的tRNA的反密碼子是(B)(A)CGA(B)IGC(C)CIG(D)CGI10、真核與原核細(xì)胞蛋白質(zhì)合成的一致點(diǎn)是(C)(A)翻譯與轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)進(jìn)行(B)模板都是多順反子
(C)都需要GTP(D)甲酰蛋氨酸是第一個氨基酸
三、名詞解釋
單順反子:只編碼一條多肽鏈的mRNA。多順反子:編碼多條多肽鏈的順反子
簡并密碼子:三聯(lián)體第三位堿基不同而編碼同一種氨基酸的遺傳密碼
SD序列:原核生物mRNA起始密碼子上游8~13個核甘酸處的一段富含嘌呤的保守序列,該序列由Shine和Dalgarno發(fā)現(xiàn)而得名,其可與核糖體小亞基中的16SrRNA的3ˊ端序列進(jìn)行堿基配對,它的功能是相對于起始密碼子而正確定位核糖體。開放閱讀框(ORF):是指DNA或RNA分子中一組連續(xù)的不重疊的密碼子(不包含終止密碼子),觀測DNA序列,可以鑒別起始于ATG,終止于TGA、TAA、或TAG的連續(xù)的密碼子區(qū)域,是有可能編碼蛋白質(zhì)的DNA序列。
四、問答題
1、原核生物蛋白質(zhì)的合成可分為哪些階段?簡述各階段的主要事件。
答:原核生物的蛋白質(zhì)合成分為四個階段:氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、延伸和終止。①氨基酸的活化:游離的氨基酸必需經(jīng)過活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化,最終氨基酸連接在tRNA3ˊ端AMP的3ˊ-OH上,合成氨酰-tRNA。
②肽鏈合成的起始:首先IF1和IF3與30S亞基結(jié)合,以阻止大亞基的結(jié)合;接著,IF2和GTP與小亞基結(jié)合,以利于隨后的起始tRNA的結(jié)合;形成的小亞基復(fù)合物經(jīng)由核糖體結(jié)合點(diǎn)附著在mRNA上,起始tRNA和AUG起始密碼子配對并釋放IF3,并形成30S起始復(fù)合物。大亞基與30S起始復(fù)合物結(jié)合,替換IF1和IF2+GDP,形成70S起始復(fù)合物。這樣在mRNA正確部位組裝成完整的核糖體。
③肽鏈的延伸:延伸分三步進(jìn)行,進(jìn)位:負(fù)載tRNA與EF-Tu和GTP形成的復(fù)合物被運(yùn)輸至核糖體,GTP水解,EF-TuGDP釋放出來,在EF-Ts和GTP的作用下,EF-TuGDP可以再次利用。轉(zhuǎn)肽:肽酰轉(zhuǎn)移酶將相鄰的兩個氨基酸相連形成肽鍵,該過程不需要能量的輸入。移位:移位酶(EF-G)利用GTP水解釋放的能量,使核糖體沿mRNA移動一個密碼子,釋放出空載的tRNA并將新生肽鏈運(yùn)至P位點(diǎn)。
④肽鏈的終止與釋放:釋放因子(RF1或RP2)識別終止密碼子,并在RP3的作用下,促使肽酰轉(zhuǎn)移酶在肽鏈上加上一個水分子并釋放肽鏈。核糖體釋放因子有助于核糖體亞基從mRNA上解離。
2、簡述遺傳密碼破譯的方法。
答:①以均聚物、隨機(jī)共聚物和特定序列的共聚物為模板指導(dǎo)多肽的合成
制備大腸桿菌的無細(xì)菌合成體系,在含有DNA、mRNA、tRNA、核糖體、AA-tRNA合成酶及其他酶類的抽提物中參與DNase,降解體系中的DNA,耗盡mRNA時,體系中的
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蛋白質(zhì)合成中止,當(dāng)補(bǔ)充外源mRNA或人工合成的各種均聚物或共聚物作為模板以及ATP、GTP、氨基酸等成分時又能合成新的肽鏈,新生肽鏈的氨基酸順序由外加的模板所決定。因此,分析比較參與的模板和合成的肽鏈即可推知編碼某些氨基酸的密碼。
②核糖體結(jié)合技術(shù)
以人工合成的三核甘酸如UUU、UCU、UGU等為模板、在含核糖體、AA-tRNA的適當(dāng)離子強(qiáng)度的反應(yīng)液中保溫,然后使反應(yīng)液通過硝酸纖維素濾膜。游離的AA-tRNA因相對分子質(zhì)量小而能自由通過濾膜,參與三核苷酸模板可以促使其對應(yīng)的AA-tRNA結(jié)合到核糖體上,體積超過膜上的微孔而被滯留,這樣就能把已結(jié)合到核糖體的AA-tRNA與未結(jié)合的AA-tRNA分開。
第五章
名詞解釋
蛋白質(zhì)工程:應(yīng)用重組DNA技術(shù)設(shè)計(jì)并構(gòu)建具有新性質(zhì)的蛋白質(zhì)或酶的試驗(yàn)技術(shù)。該技術(shù)是將隨機(jī)性單個部位改變引入結(jié)構(gòu)基因以生成突變體基因,再將其與啟動子偶聯(lián)以指導(dǎo)發(fā)生特定改變的蛋白質(zhì)的合成,隨后分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能特征并與預(yù)期的特征進(jìn)行比較。蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì)可輔以計(jì)算機(jī)繪圖技術(shù)及其他先進(jìn)的分子模式技術(shù)。
分子克隆:指遺傳信息的分子操作和縝密施工,即按人們的需求,將一種生物的基因或化學(xué)合成的基因與適合的載體DNA分子連接,構(gòu)成重組DNA分子,然后將其導(dǎo)入受體細(xì)胞中復(fù)制擴(kuò)增,從而獲得該基因片段的大量拷貝。酵母雙雜交系統(tǒng):以酵母的遺傳分析為基礎(chǔ)研究反式作用因子之間相互作用對真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控影響的試驗(yàn)系統(tǒng),用于鑒定蛋白質(zhì)之間的相互作用。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):在體外將DNA靶序列的拷貝數(shù)大量擴(kuò)增的技術(shù),其基本過程包括變性、復(fù)性以及DNA聚合酶指導(dǎo)下的鏈的延伸三個階段的反復(fù)循環(huán)。RACE技術(shù):在已知cDNA序列的基礎(chǔ)上克隆5ˊ端或3ˊ端缺失序列的技術(shù),用于對RNA分子末端作圖
原位雜交技術(shù)(ISH):用標(biāo)記核酸探針,經(jīng)放射自顯影或非放射檢測體系,在組織、細(xì)胞、間期核及染色體上對核酸進(jìn)行定位和相對定量研究的一種手段,尋??煞譃镽NA原位雜交和染色體原位雜交兩大類。
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第七章
一、填空題
1.基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)在兩個方面:轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控。其中,后者又包括mRNA加工成熟水平上的調(diào)控和翻譯水平上的調(diào)控。
2.不同生物使用不同的信號來指揮基因調(diào)控。原核生物中,營養(yǎng)狀況和環(huán)境因素對基因表達(dá)起著舉足輕重的影響。在高等真核生物中,__激素水平_和____發(fā)育階段__是基因表達(dá)調(diào)控的最主要手段。
3.原核生物的基因調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平上,根據(jù)調(diào)控機(jī)制的不同可分為_負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控__和_正轉(zhuǎn)錄調(diào)控_。在第一種調(diào)控體系中,調(diào)控基因的產(chǎn)物是___阻遏蛋白___。根據(jù)其作用特征又可分為___負(fù)控誘導(dǎo)__和__負(fù)控阻遏___兩大類。在其次種調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)控基因的產(chǎn)物是__激活蛋白___。根據(jù)其作用性質(zhì)可分為__正控誘導(dǎo)___和__正控阻遏__系統(tǒng)。
4.大腸桿菌乳糖操縱子包括三個結(jié)構(gòu)基因:__lacZ__、lacY和lacA,以及__啟動子_、操縱基因和__阻遏子_。
5.對于大腸桿菌乳糖操縱子而言,乳糖并不與阻遏物相結(jié)合,真正的誘導(dǎo)物是乳糖的異構(gòu)體__異構(gòu)乳糖__,而后者是在β-半乳糖苷酶的催化下由乳糖形成的。
6.在大腸桿菌中,cAMP的濃度受到葡萄糖代謝的調(diào)理。假使將細(xì)菌放在缺乏碳源的培養(yǎng)基中培養(yǎng),細(xì)胞內(nèi)cAMP濃度就高;假使在含葡萄糖的培養(yǎng)基中培養(yǎng),cAMP的濃度就__低__;假使培養(yǎng)基中只有甘油或乳糖等不進(jìn)行糖酵解途徑的碳源,cAMP的濃度會_很高_(dá)。
7.在大腸桿菌色氨酸操縱子系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子為___色氨酸_。trpR基因突變常引起trpmRNA的組成型合成,該基因產(chǎn)物因此被稱為__輔阻遏蛋白_。它與_色氨酸__相結(jié)合形成有活性的阻遏物,與操縱區(qū)結(jié)合并關(guān)閉trpmRNA轉(zhuǎn)錄。
8.大腸桿菌中,色氨酸操縱子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控除了阻遏系統(tǒng)外,還有___弱化系統(tǒng)__。
9.色氨酸操縱子的弱化機(jī)制主要涉及__莖-環(huán)__的結(jié)構(gòu),它是一段可以通過自我配對形成的__弱化子__mRNA區(qū)域,有典型的終止子特點(diǎn)。前導(dǎo)區(qū)的堿基序列以不同的方式進(jìn)行堿基配對,在前導(dǎo)肽基因中有兩個相鄰的__色氨酸__密碼子,所以前導(dǎo)肽的翻譯對_色氨酸-tRNA__的濃度敏感,弱化子對RNA聚合酶的影響依靠于前導(dǎo)肽中__核糖體__所處的位置,實(shí)現(xiàn)對轉(zhuǎn)錄過程的調(diào)理。
二、選擇題
1.原核生物的基因調(diào)控主要發(fā)生在(A)。
A.轉(zhuǎn)錄水平B.轉(zhuǎn)譯水平C.轉(zhuǎn)錄后水平D.轉(zhuǎn)譯后水平2.操縱子一般是有(B)組成的。
A.結(jié)構(gòu)基因、啟動子和調(diào)理基因B.操縱基因、結(jié)構(gòu)基因和啟動子
C.操縱基因、結(jié)構(gòu)基因和加強(qiáng)子D.操縱基因、啟動子、結(jié)構(gòu)基因和調(diào)理基因3.加強(qiáng)基因轉(zhuǎn)錄的元件是(C)。
A.密碼子B.復(fù)制子C.啟動子D.內(nèi)含子E.外顯子4.以下關(guān)于大腸桿菌基因調(diào)控的說法錯誤的是(B)。A.幾個結(jié)構(gòu)基因往往連在一起,共同受調(diào)控序列的調(diào)控
B.在大腸桿菌中,假使調(diào)理基因突變造成阻遏物缺乏,那么乳糖分解代謝的三種酶就不能合成
C.大腸桿菌乳糖代謝的調(diào)控主要是對轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
D.在大腸桿菌中,假使控制乳糖代謝啟動子發(fā)生了突變,轉(zhuǎn)錄便不能進(jìn)行
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5.請根據(jù)原核生物負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的類型和特點(diǎn),選擇正確答案,完成下表格(A)。調(diào)理物結(jié)合到DNA上正調(diào)理負(fù)調(diào)理是否ⅠⅢⅡⅣA.Ⅰ:開啟Ⅱ:關(guān)閉Ⅲ:關(guān)閉Ⅳ:開啟B.Ⅰ:關(guān)閉Ⅱ:關(guān)閉Ⅲ:關(guān)閉Ⅳ:開啟C.Ⅰ:開啟Ⅱ:開啟Ⅲ:開啟Ⅳ:關(guān)閉D.Ⅰ:關(guān)閉Ⅱ:開啟Ⅲ:開啟Ⅳ:關(guān)閉6.原核生物與真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控有如下異同(D)。A.原核生物有啟動子,真核生物沒有B.兩者的RNA聚合酶一致
C.兩者的調(diào)控方式一致,都以正調(diào)控為主
D.在真核生物中已發(fā)現(xiàn)好多蛋白質(zhì)因子是參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的7.乳糖操縱子的直接誘導(dǎo)劑是(D)。
A.葡萄糖B.乳糖C.半乳糖D.異構(gòu)乳糖8.乳糖操縱子阻遏蛋白結(jié)合乳糖操縱子的(B)。
A.CAP結(jié)合位點(diǎn)B.O區(qū)C.P區(qū)D.Z基因E.I基因9.乳糖操縱子阻遏蛋白由(D)。
A.Z基因編碼B.Y基因編碼C.A基因編碼D.I基因編碼
10.以下mRNA5?端序列中,具有典型原核生物SD序列特征的是(B)。A.5???UUAAG??3?B.5???AGGAG??3?C.5???GCCCG??3?D.5???CUCCA??3?11.異丙基巰基半乳糖苷,即IPTG,是(A)的類似物。A.乳糖B.半乳糖C.葡萄糖D.乙酰半乳糖12.阻止乳糖基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制是(A)。A.調(diào)理基因→操縱基因→結(jié)構(gòu)基因B.啟動子→操縱基因→結(jié)構(gòu)基因C.操縱基因→調(diào)控基因→結(jié)構(gòu)基因D.結(jié)構(gòu)基因→調(diào)控基因→操縱基因
13.乳糖操縱子的表達(dá)產(chǎn)物代謝產(chǎn)生的,共給細(xì)胞的能源物質(zhì)是(B)。A.乳糖B.葡萄糖C.半乳糖D.異構(gòu)半乳糖14.色氨酸操縱子調(diào)理過程涉及(D)。
A.轉(zhuǎn)錄水平調(diào)理B.轉(zhuǎn)錄激活調(diào)理C.翻譯水平調(diào)理D.轉(zhuǎn)錄/翻譯調(diào)理
15.大腸桿菌乳糖操縱子包括如下部分:Z區(qū)、Y區(qū)、A區(qū)、P區(qū)、O區(qū)、I區(qū)。試問,它們代表何種意義,請從以下選項(xiàng)中選擇(A)。
A.β-半乳糖苷酶、透過酶、乙?;D(zhuǎn)移酶、啟動子、操縱基因、阻遏子B.β-半乳糖苷酶、乙?;D(zhuǎn)移酶、透過酶、操縱基因、啟動子、阻遏子C.透過酶、乙?;D(zhuǎn)移酶、β-半乳糖苷酶、操縱基因、阻遏子、啟動子D.乙?;D(zhuǎn)移酶、透過酶、β-半乳糖苷酶、啟動子、操縱基因、阻遏子
16.當(dāng)葡萄糖和乳糖同時存在于培養(yǎng)基中,lac啟動子表達(dá)受阻,沒有β-半乳糖苷酶活性;當(dāng)葡萄糖消耗完以后,細(xì)胞內(nèi)cAMP濃度將(),β-半乳糖苷酶活性將(),一度中止生長的細(xì)菌又將恢復(fù)分裂。(A)
A.增加;增加B.增加;減少C.減少;增加D.減少;減少17.基因表達(dá)過程中僅在原核生物中出現(xiàn)而真核生物沒有的是(A)。
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A.σ因子B.AUG用作起始密碼子C.岡崎片段D.DNA連接酶18.cAMP在轉(zhuǎn)錄的調(diào)控作用中將出現(xiàn)以下哪種現(xiàn)象?(C)A.cAMP轉(zhuǎn)變成CRPB.CRP轉(zhuǎn)變成cAMP
C.cAMP-CRP形成復(fù)合物
D.葡萄糖分解活躍,cAMP增加,促進(jìn)乳糖利用來擴(kuò)展能源
19.色氨酸操縱子的調(diào)控作用是受兩個相互獨(dú)立的系統(tǒng)控制的,其中一個需要前導(dǎo)肽的翻譯,下面哪一個調(diào)控這個系統(tǒng)?(B)
A.色氨酸B.色氨酸-tRNAC.氨酰-tRNAD.cAMP20.色氨酸操縱子調(diào)理基因產(chǎn)物是(B)。
A.活性阻遏蛋白B.失活阻遏蛋白C.cAMP受體蛋白D.無基因產(chǎn)物
三、名詞解釋
負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控:調(diào)理基因的產(chǎn)物是阻遏蛋白,起著阻止結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的作用。又分為負(fù)控誘導(dǎo)和負(fù)控阻遏兩大類。操縱子(operon):原核生物在轉(zhuǎn)錄水平上控制基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,包括啟動子(P)、操縱基因(O)、和在功能上相關(guān)的幾個結(jié)構(gòu)基因。阻遏蛋白(repressor):在負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中發(fā)揮作用,由調(diào)理基因產(chǎn)生的一種變構(gòu)蛋白,當(dāng)它與操縱基因結(jié)合時,能夠抑制轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行。在負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,阻遏蛋白不與效應(yīng)物結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄;在負(fù)控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應(yīng)物結(jié)合時,結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。代謝物阻遏效應(yīng):葡萄糖對乳糖操縱子表達(dá)是起到抑制效應(yīng)的,這種抑制是間接的。不是葡萄糖本身而是它的降解產(chǎn)物抑制了乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄,葡萄糖的這種效應(yīng)被稱為代謝物阻遏效應(yīng)。
安慰性誘導(dǎo)物:在對乳糖操縱子的研究中,往往使用兩種含硫的乳糖類似物——異丙基巰基半乳糖苷(IPTG)和巰甲基半乳糖苷(TMG),它們能夠像乳糖一樣誘導(dǎo)基因的轉(zhuǎn)錄與表達(dá),但它們都不是半乳糖苷酶的底物,不能被其降解,所以被稱為安慰性誘導(dǎo)物。弱化作用(attenuation):色氨酸操縱子中除阻遏-操縱調(diào)控機(jī)制外的另一種轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制。色氨酸生物合成所需的各種酶的濃度根據(jù)色氨酸濃度的變化而受到調(diào)理,是一種微弱調(diào)控機(jī)制。它通過轉(zhuǎn)錄與翻譯的偶聯(lián),使轉(zhuǎn)錄在達(dá)到第一個結(jié)構(gòu)基因之前就過早終止,從而實(shí)現(xiàn)對色氨酸操縱子結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控。細(xì)胞中色氨酸濃度的高低是能否實(shí)現(xiàn)過早終止的根本原因。
四、簡答題
1.簡述大腸桿菌乳糖操縱子的基本結(jié)構(gòu)及各部分功能。
答:大腸桿菌乳糖操縱子包括三個結(jié)構(gòu)基因:β-半乳糖苷酶基因(Z)、β-半乳糖苷透過酶基因(Y)和β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶基因(A),以及啟動子(P)、操縱子基因(O)和阻遏子(I)。
轉(zhuǎn)錄時,RNA聚合酶首先與啟動區(qū)(P)結(jié)合,通過操縱區(qū)(O)向右轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄從操縱區(qū)中間開始,按lacZ→lacY→lacA方向進(jìn)行,每次轉(zhuǎn)錄出來的一條mRNA上都帶有這三個基因。轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是在啟動區(qū)和操縱區(qū)進(jìn)行的。
①lacZ、lacY、lacA基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼。
②該mRNA分子的啟動區(qū)(P)位于阻遏基因(I)與操縱基因(O)之間,不能單獨(dú)起始半乳糖苷酶和透過酶基因的高效表達(dá)。
③操縱區(qū)是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)
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④當(dāng)阻遏物與操縱區(qū)相結(jié)合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。
⑤誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)像,使之不能與操縱區(qū)相結(jié)合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。這就是說,有誘導(dǎo)物存在時,操縱區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的轉(zhuǎn)錄。Lac操縱子阻遏物mRNA是由弱啟動子控制下組成型合成的,該阻遏蛋白有4個一致的亞基,每個亞基均含有347個氨基酸殘基,并能與1分子IPTG結(jié)合。
葡萄糖對lac操縱子表達(dá)的抑制是間接的,阻遏物與O區(qū)結(jié)合影響了RNA聚合酶與啟動區(qū)結(jié)合形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的效率。
2.結(jié)合cAMP的形成機(jī)制,簡述它在大腸桿菌利用乳糖方面的作用。
答:環(huán)腺苷酸cAMP是在腺苷酸環(huán)化酶的作用下由ATP轉(zhuǎn)變而來。cAMP與CRP蛋白結(jié)合形成復(fù)合物,該復(fù)合物是激活乳糖操縱子的重要組成部分,大腸桿菌乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄必需有cAMP-CRP復(fù)合物結(jié)合在DNA的啟動區(qū)域上。cAMP-CRP復(fù)合物是一個不同于阻遏物的正調(diào)控因子,它與阻遏體系形成兩個相互獨(dú)立的調(diào)控體系,調(diào)理乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄。在大腸桿菌中,cAMP的濃度受到葡萄糖代謝的調(diào)理。研究說明,在含有葡萄糖的培養(yǎng)基中,cAMP的濃度就低,大腸桿菌優(yōu)先使用葡萄糖;在缺乏碳源的培養(yǎng)基中,cAMP的濃度就高;大腸桿菌在只含有甘油或乳糖的培養(yǎng)基中(無進(jìn)行糖酵解途徑的碳源),cAMP的濃度也會很高,啟動大腸桿菌乳糖操縱子的表達(dá)。
3.你能解釋一下為什么作為數(shù)百萬年進(jìn)化蛻變的結(jié)果,在一個完全被誘導(dǎo)的大腸桿菌細(xì)胞中,β-半乳糖苷酶、透過酶及乙?;D(zhuǎn)移酶的拷貝數(shù)比例為1:0.5:0.2。這種不同的酶在數(shù)量上的差異是由于什么原因造成的?
答:①乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物lacmRNA可能與翻譯過程中的核糖體相脫離,從而終止蛋白質(zhì)
鏈的翻譯。這種現(xiàn)象發(fā)生的頻率取決于每一個后續(xù)的AUG密碼子再度起始翻譯的概率。因此,就存在這一個從mRNA的5ˊ端到3ˊ端的蛋白合成梯度。
②在乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物lacmRNA分子內(nèi)部,lacA基因比lacZ基因更簡單受到內(nèi)切酶作用發(fā)生降解,因此,在任何時候lacZ基因的完整拷貝數(shù)要比lacA基因多。因此對于乳糖操縱子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物lacmRNA所編碼的各種蛋白質(zhì),其相對濃度都由每一個順反子的翻譯頻率所決定。
4.如何理解“在色氨酸操縱子中,弱化子對RNA聚合酶的影響依靠于前導(dǎo)肽翻譯中核糖體所處的位置〞這句話,請簡要地加以解釋。
答:轉(zhuǎn)錄的弱化理論認(rèn)為mRNA轉(zhuǎn)錄的終止是通過前導(dǎo)肽基因的翻譯來調(diào)理的。由于在前導(dǎo)肽基因中有兩個相鄰的色氨酸密碼子,所以這個前導(dǎo)肽的翻譯必定對tRNA的濃度敏感。當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸濃度很低時,負(fù)載有色氨酸的tRNA也就很少,這樣翻譯通過兩個相鄰的色氨酸密碼子的速度就會很慢,當(dāng)4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時,核糖體才進(jìn)行到1區(qū)(或停留在兩個相鄰的Trp密碼子處),這是前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)是2-3區(qū)配對,不形成3-4區(qū)域配對的終止結(jié)構(gòu)所以轉(zhuǎn)錄可以繼續(xù)進(jìn)行,直到將Trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因全部轉(zhuǎn)錄。而當(dāng)培養(yǎng)基中的色氨酸濃度高時,核糖體可以順利通過兩個相鄰的色氨酸密碼子,在4區(qū)被轉(zhuǎn)錄之前,核糖體就達(dá)到2區(qū),這樣使2區(qū)和3區(qū)不能配對,3區(qū)和4區(qū)可以自由配對形成莖-環(huán)狀終止子結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄中止,trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因被關(guān)閉而不再合成色氨酸。所以,弱化子對RNA聚合酶的影響依靠于前導(dǎo)肽翻譯中的核糖體所處的位置。
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第八章
一、填空題
1.原核生物主要是通過轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以開啟或關(guān)閉某些基因的表達(dá)來適應(yīng)環(huán)境條件主要是__營養(yǎng)水平_的變化。_環(huán)境因子__往往是調(diào)控的誘導(dǎo)物,群體中每個細(xì)胞對環(huán)境變化的反應(yīng)是直接和基本一致的。
2.真核生物基因調(diào)控可分為兩大類,第一類是_瞬時調(diào)控_或稱為可逆性調(diào)控,它相當(dāng)于原核細(xì)胞對環(huán)境變化所作出的反應(yīng);其次類是_發(fā)育調(diào)控_或稱為不可逆調(diào)控,它決定了真核細(xì)胞生長、分化、發(fā)育的全部進(jìn)程。
3.原核細(xì)胞中具有操縱子結(jié)構(gòu),并且以多順反子mRNA方式進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,整個體系被置于一個啟動子的控制之下。真核細(xì)胞的DNA是__單順反子_結(jié)構(gòu),大量相關(guān)的基因常按功能成套組合,被稱為_基因家族_。
4.大多數(shù)真核基因都是由蛋白質(zhì)編碼序列和非蛋白質(zhì)編碼序列兩部分組成。編碼序列稱為__外顯子_,英文寫作_exon_,非編碼序列稱為_內(nèi)含子_,英文寫作_intron_。真核基因有時被稱為__斷裂基因_,英文寫作interruptedgene。
5.DNA水平的調(diào)控是真核生物發(fā)育調(diào)控的一種形式,它包括了基因丟失、_擴(kuò)增_、重排_、和易位等方式,通過這些方式可以消除或變換某些基因并改變它們的活性。這些調(diào)控方式與轉(zhuǎn)錄及翻譯水平的調(diào)控是不同的,由于它使_基因組_發(fā)生了改變。
6.DNA甲基化主要形成_5-甲基胞嘧啶_和少量的N6-甲基腺嘌呤及7-甲基鳥嘌呤。
7.鋅指結(jié)構(gòu)家族蛋白大體可以分為鋅指、鋅鈕和鋅簇結(jié)構(gòu),其特有的_半胱氨酸_和_組氨酸_之間氨基酸殘基數(shù)基本恒定,與鋅離子結(jié)合,有鋅參與時才表現(xiàn)轉(zhuǎn)錄活性。
8.真核生物rRNA加工主要是有兩個內(nèi)容:_分子內(nèi)切割_和_化學(xué)修飾_。rRNA基因轉(zhuǎn)錄時先產(chǎn)生一個45S的前體rRNA,然后被核酸酶逐漸降解,形成成熟的18S、_28S_和5.8SrRNA。rRNA的化學(xué)修飾主要是甲基化_,原核生物rRNA主要是堿基甲基化,真核生物rRNA主要是_核糖甲基化_。
9.在真核生物中,_核不均一RNA_,即hnRNA,是mRNA的前體。
10.與DNA結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子大多以二聚體形式起作用,轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合的功能域常見有以下幾種:螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋、_鋅指模體、_堿性-亮氨酸拉鏈模體_、_同源結(jié)合域_。
二、選擇題
1.在真核生物中,DNA甲基化主要形成()和少量的()及()。(A)A.5-甲基胞嘧啶;N6-甲基腺嘌呤;7-甲基鳥嘌呤B.5-甲基胸腺嘧啶;N6-甲基腺嘌呤;7-甲基鳥嘌呤C.N6-甲基腺嘌呤;5-甲基鳥嘌呤;7-甲基鳥嘌呤D.7-甲基鳥嘌呤;N6-甲基腺嘌呤;7-甲基胞嘧啶
2.在基因家族中,基因排列的順序就是它們在發(fā)育階段的表達(dá)順序。這方面的典型例子是(D)。
A.免疫球蛋白B.白蛋白C.組蛋白D.珠蛋白
3.一般狀況下,DNA關(guān)閉某些基因的活性并誘導(dǎo)基因的重新活化和表達(dá)分別需要的操作為(A)。
A.甲基化;去甲基化B.去甲基化;甲基化C.磷酸化;去磷酸化D.去磷酸化;磷酸化
4.真核基因啟動子由核心啟動子和上游啟動子兩部分組成,核心啟動子和上游啟動子分別包含(A)。
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A.TATA盒;CAAT盒和GC盒B.TATA盒和CAAT盒;GC盒C.CAAT盒和GC盒;TATA盒D.CAAT盒;GC盒和TATA盒
5.加強(qiáng)子大多為重復(fù)序列,一般長約50bp,適合與某些蛋白因子結(jié)合。其內(nèi)部常含有一個核心序列,它是產(chǎn)生加強(qiáng)效應(yīng)時所必需的。這一核心序列為(A)。A.TGGA/TA/TA/TB.TGGG/AG/AG/AC.TAAA/AA/GG/TD.TAGG/AG/AG/T
三、名詞解釋
基因家族(genefamily):真核細(xì)胞中大量相關(guān)的基因常按功能成套組合,被稱為基因家族。同一家族中的成員有時緊湊地排列在一起,成為一個基因簇;更多的時候,它們分散在同一條染色體的不同部位,甚至位于不同的染色體上,具有各自不同的表達(dá)調(diào)控模式。斷裂基因(interruptedgene):大多數(shù)真核基因都是由蛋白質(zhì)編碼序列和非蛋白質(zhì)編碼序列兩部分組成的。編碼序列稱為外顯子。非編碼序列稱為內(nèi)含子。在一個結(jié)構(gòu)基因中,編碼某一個蛋白質(zhì)不同區(qū)域的各個外顯子并不連續(xù)排列在一起,而是往往被長度不等的內(nèi)含子所隔離,形成鑲嵌排列的斷裂方式。所以,真核基因常被稱為斷裂基因。
GT-AG法則:幾乎每個內(nèi)含子5ˊ端起始的兩個堿基都是GT,而3ˊ端最終兩個堿基總是AG,由于這兩個堿基的高度保守性和廣泛性,常把這一現(xiàn)象稱為GT-AG法則。
順式作用元件:真核生物啟動子和加強(qiáng)子是由若干DNA序列元件組成的,由于它們常與特定的功能基因連鎖在一起,因此被稱為順式作用元件。這些序列組成基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控區(qū),影響基因的表達(dá)。反式作用因子:是能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。
鋅指結(jié)構(gòu):鋅指結(jié)構(gòu)家族蛋白大體可分為鋅指、鋅鈕和鋅簇結(jié)構(gòu),其特有的半胱氨酸和組氨酸殘基之間氨基酸殘基數(shù)基本恒定,有鋅參與時才具備轉(zhuǎn)錄調(diào)控活性。重復(fù)的鋅指結(jié)構(gòu)都是以鋅將一個a螺旋與一個反向平行β片層的基部以鋅原子為中心,通過與一對半胱氨酸和一對組氨酸之間形成配位鍵相連接,鋅指環(huán)上突出的賴氨酸、精氨酸參與DNA的結(jié)合。加強(qiáng)子:是指能使與它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列,最早發(fā)現(xiàn)于SV40早期基因的上游,有兩個長72bp的正向重復(fù)序列。加強(qiáng)子往往遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的時間、空間特異性表達(dá)、加強(qiáng)啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列,其發(fā)揮作用的方式尋常與方向、距離無關(guān),可位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游或下游。
四、問答題
1.簡述DNA甲
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