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文檔簡介
本文格式為Word版,下載可任意編輯——分子生物學(xué)綜合性試驗講義
分子生物學(xué)綜合性試驗
生命科學(xué)與生物制藥學(xué)院
生物制藥研究所
分子生物學(xué)綜合性試驗教學(xué)小組
2023年12月
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分子生物學(xué)試驗內(nèi)容與流程
一、試驗內(nèi)容1、小鼠肝臟總RNA提取
2、RT-PCR、擴增產(chǎn)物電泳鑒定與純化3、擴增產(chǎn)物克隆
4、轉(zhuǎn)化子篩選與PCR鑒定5、重組質(zhì)粒提取與酶切鑒定
二、流程
日期試驗內(nèi)容
20/12:小鼠肝臟總RNA提取RT-PCR:逆轉(zhuǎn)錄、-20℃凍存
21/12:RT-PCR:PCR
RT-PCR產(chǎn)物電泳鑒定與回收
接種DH5α2
22/12
23/12
24/12
RT-PCR產(chǎn)物與T載體連接轉(zhuǎn)化、涂平板轉(zhuǎn)化子藍白斑篩選轉(zhuǎn)化子PCR鑒定重組子接種重組子質(zhì)粒制備重組子酶切鑒定
宿主菌感受態(tài)制備3
試驗要求與質(zhì)量控制
綜合試驗涉及的知識點和試驗技術(shù)眾多,為了培養(yǎng)學(xué)生嚴謹求實、科學(xué)求真之精神,并達到綜合試驗之最大成效,以下對本綜合試驗過程的要求進行說明,且納入試驗考核成績。
1、預(yù)習(xí)
試驗前須充分預(yù)習(xí),要求隨機抽查時,每一位同學(xué)能夠明了的闡述整體試驗思路和具體的試驗項目、原理。
2、試驗過程
除了遵守學(xué)校與學(xué)院一般試驗紀律與要求外,還必需做到主動性、能動性與團隊精神相接合,利用有限的資源與時間得到最好的培訓(xùn)與試驗結(jié)果。為此,本綜合試驗將能否在規(guī)定時間內(nèi)完成試驗內(nèi)容作為衡量學(xué)生動手能力的關(guān)鍵指標之一,并作為考核結(jié)果記入試驗成績中。要達到此目的,同學(xué)們必需提前細心閱讀試驗講義,全面了解試驗內(nèi)容,透徹理解試驗原理,熟悉各個操作步驟,并在試驗過程中合理安排時間。
3、試驗原始記錄與結(jié)果整理
每天必需及時、真實、完整地記錄當(dāng)天所做試驗狀況,記錄試驗過程中的異常狀況,分析其原因,并將下述關(guān)鍵性試驗狀況整理于試驗記錄本上,并于當(dāng)天由帶教老師簽閱:
1)記錄日期、天氣2)試驗名稱、負責(zé)人3)原理(簡述)4)實際操作狀況5)試驗結(jié)果6)分析
4、綜合試驗報告
4
須按下述規(guī)范撰寫、并提交綜合試驗報告(電子版及電子打印版)。1)封面:
見下一頁。2)論文內(nèi)容目錄中文摘要英文摘要前言材料與方法結(jié)果與探討
1.總RNA提取與RT-PCR:PCR產(chǎn)物電泳凝膠掃描圖、PCR產(chǎn)物回收電泳凝膠掃描圖。
2.RT-PCR產(chǎn)物克隆:轉(zhuǎn)化篩選平板照片3.重組子PCR鑒定:PCR鑒定電泳凝膠掃描圖4.重組質(zhì)粒提取與酶切鑒定:酶切鑒定電泳凝膠掃描圖
分子生物學(xué)綜合性試驗論文
小鼠β-actin基因的克隆
姓名:…………班級:…………學(xué)號:…………
生命科學(xué)與生物制藥學(xué)院
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試驗一小鼠肝臟總RNA提取
試驗?zāi)康?/p>
1.把握真核細胞總RNA提取的方法與本卷須知2.了解真核細胞總RNA提取的原理
試驗原理
RNA提取技術(shù)不僅是分子生物學(xué)技術(shù)的重要組成部分,也是功能基因組學(xué)科研技術(shù)的重要基礎(chǔ)。從RNA水平研究生物體內(nèi)基因的調(diào)控機制,已成為分子生物學(xué)研究的一個重要手段。利用提取的RNA人們可以對特定的基因表達進行定性和定量檢測,從分子水平確切的了解細胞生命活動的規(guī)律。
尋常一個典型的哺乳動物細胞約含有10-5μgRNA,其中約82%為rRNA(主要是28S、18S和5.8S、5S四種類型),16%為tRNA和核內(nèi)小分子RNA,2%為mRNA。這些高峰度的RNA,如rRNA的大小和序列確定,可通過凝膠電泳、密度梯度離心、陰離子交換層析和高壓液相層析(HPLC)分開。而mRNA雖然大小和核苷酸序列各不一致,從數(shù)百至數(shù)千堿基不等,但大多數(shù)真核細胞mRNA在其3'端均有一寡聚腺苷酸(polyA)組成的尾,其長度一般足以吸附于寡聚脫氧胸苷酸—纖維素[oligo(dT)],使得mRNA可以利用親和層析法分開。這個群體編碼了所有由該細胞合成的多肽。
真核細胞總RNA制備方法有多種,包括異硫氰酸胍—氯化銫超速離心法、鹽酸胍—有機溶劑法、氯化鋰—尿素法、熱酚法以及Trizol試劑提取法等。目前試驗室提取總RNA的常用方法為異硫氰酸胍法—酚—氯仿一步法和Trizol試劑提取法。異硫氰酸胍法制備真核細胞總RNA,是將已知最強的RNase酶抑制劑異硫氰酸胍、β-巰基乙醇和去污劑N-十二烷基肌氨酸鈉聯(lián)合使用,抑制了RNA的降解,加強了核蛋白復(fù)合物的解離,使RNA和蛋白質(zhì)分開并進入溶液,RNA選擇性地進入無DNA和蛋白質(zhì)的水相,簡單被異丙醇沉淀濃縮。我們這次試驗采用的是Trizol試劑提取法。TRIZOL試劑中的主要成分為異硫氰酸胍和苯酚,其中異硫氰酸胍可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質(zhì)分開,并將RNA
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釋放到溶液中,同時還抑制RNA酶,防止RNA的降解。當(dāng)參與氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚使蛋白變性,可促使RNA進入水相,離心后可形成水相層和有機層,這樣RNA與仍留在有機相中的蛋白質(zhì)和DNA分開開。水相層(無色)主要為RNA,有機層(黃色)主要為DNA和蛋白質(zhì)。
RNA極不穩(wěn)定,易于降解,而RNA酶幾乎無處不在,且特別穩(wěn)定,故在提取RNA時關(guān)鍵因素是最大程度的避免外源RNA酶的污染和抑制內(nèi)源RNA酶的活力,因此,創(chuàng)造一個無RNA酶的環(huán)境,嚴格防止RNA酶污染是成功提取RNA的關(guān)鍵。
1.抑制內(nèi)源性RNA酶。
主要運用RNA酶抑制劑,目前常用的RNA酶抑制劑有:①RNA酶的蛋白質(zhì)抑制劑(RNasin),它是從人胎盤分開的一種蛋白質(zhì),可以與多種RNA酶緊湊結(jié)合形成非共價結(jié)合的復(fù)合物,使RNA酶失活。RNA酶抑制劑經(jīng)數(shù)次凍融后或放在氧化條件下應(yīng)棄之不用。RNA酶抑制劑不干擾反轉(zhuǎn)錄或mRNA在無細胞體系中的翻譯;②氧釩核糖核苷復(fù)合物,它是由氧釩離子和4種核糖核苷之中的任意一種所形成的復(fù)合物,是一種過渡態(tài)似物,它能與多種RNA酶結(jié)合并高效抑制RNA酶活性。然而氧釩核糖核苷復(fù)合物能猛烈抑制mRNA在無細胞體系中的翻譯,因此必需用含0.1%羥基喹啉的苯酚屢屢抽提以除之;③硅藻土,硅藻土能吸附RNA酶,并且在后續(xù)的RNA純化過程中經(jīng)離心除去;④異硫氰酸胍,它是強力的蛋白質(zhì)變性劑,在破壞細胞結(jié)構(gòu)使核酸從細胞核中解離出來的同時也使RNA酶變性失活;⑤焦碳酸二乙酯(DEPC),它是RNA酶猛烈抑制劑,但其作用并不是絕對的。DEPC主要用于材料和器皿的RNA酶處理;⑥其它化學(xué)試劑,如SDS、尿素等對RNA酶也有一定的抑制作用。
2.防止外源性RNA酶污染
外源性RNA酶主要通過以下幾個途徑污染RNA制品:①玻璃制品、塑料制品和電泳槽;②研究人員造成的污染;③污染的溶液。因此在試驗中必需采取以下措施抑制外源性RNA酶:①試驗室用的普通玻璃制品和塑料制品經(jīng)常有RNA酶污染,使用前必需于180℃干烤3h以上(玻璃制品)或用氯仿沖洗(塑料制品)。另一種方法是用0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)的水溶液浸泡玻璃制品和其它用品2h,然后用滅菌水淋洗數(shù)次,并于100℃干烤15min。RNA電泳槽需用去污劑洗滌,用水沖洗,乙醇枯燥,再浸泡于3%H2O2溶液10min,然后用0.1TPC水完全沖洗電泳槽。滅菌
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的一次性使用的塑料制品基本上無RNA酶,可以不需要處理;②在RNA提取過程中,應(yīng)戴一次性手套和口罩,對接觸可能污染的器皿時,應(yīng)勤換手套;③配制的溶液的水應(yīng)用0.1TPC水在37℃處理12h以上,然后高壓滅菌除去殘留的DEPC。對不能高壓滅菌的試劑,用經(jīng)DEPC水配制處理過的無菌蒸餾水配制。
儀器與試劑
1.儀器與材料:
低溫高速離心機、移液器、DEPC水處理的EP管與槍頭、一次性手套、組織研磨棒、眼科剪、眼科鑷、止血鉗2.試劑:
Trizol試劑、氯仿、異丙醇、75%乙醇
試驗步驟
1.吸取500μLTrizol參與一新的DEPC處理后的1.5mLEP中;
2.解剖小鼠,取小鼠肝臟組織,在生理鹽水中清洗后,剪成大小約黃豆大?。ㄖ亓考s100mg),放入已加有500μLTrizol的1.5mLEP中;
3.使用用組織研磨棒快速研磨4-5次,之后再參與500μLTrizol,繼續(xù)快速研磨2-3次研磨組織直至溶液變粘稠,室溫放置5min使其充分裂解;4.12000rpm離心5min,將上清轉(zhuǎn)移至一新的DEPC處理后的1.5mLEP中;5.參與200μL氯仿,振蕩混勻,室溫放置3min;6.12000rpm離心15min;
7.離心后混合物分為三層:下層紅色的苯酚-氯仿層,中間層,上層無色的水樣層。RNA無一例外地存在于水樣層當(dāng)中。防備移取上層無色水樣層,轉(zhuǎn)移至另一新EP管中;
8.參與500μL異丙醇,室溫放置15min;
9.12000rpm離心15min,這時會在EP管的底部看到白色沉淀;輕輕棄去上清;10.參與1mL75%乙醇(用DEPC處理的水配制)洗滌RNA沉淀;11.7500rpm離心5min,棄上清;12.將EP管倒置,枯燥,揮發(fā)剩余的乙醇;
9
13.用適量DEPC處理的水溶解RNA沉淀,推薦20μL。
本卷須知
1.研磨組織塊用于RNA提取的樣品,必需是新鮮的細胞或組織,如采樣后,不能馬上用于提取則樣品應(yīng)用液氮速凍并貯于-70℃的冰箱中保存。2.研磨過程中要盡量避免Trizol的溢出。
3.有屢屢離心過程,注意配平,防止出現(xiàn)事故以及對離心機的損害。4.整個抽提過程,要盡量避免RNase的污染,全程配戴一次性手套,皮膚經(jīng)常帶有細菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成為RNA酶的來源。培養(yǎng)良好的微生物試驗操作習(xí)慣,預(yù)防微生物污染。
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試驗三RT-PCR產(chǎn)物克隆
試驗?zāi)康?/p>
1.把握DNA體外重組的原理與方法。
2.了解大腸桿菌氯化鈣法制備感受態(tài)的原理,把握制備的方法。3.把握大腸桿菌轉(zhuǎn)化原理與方法。
試驗原理
RT-PCR反應(yīng)之后,TaqDNA聚合酶一般會在目的基因的3’末端添加上一個A堿基,而T載體的3’末端附帶一個T堿基,擴增產(chǎn)物與T載體在連接酶的作用下,通過堿基互補配對作用,就可形成穩(wěn)固的重組克隆載體。
受體細胞經(jīng)過一些特別方法(如:電擊法、CaCl2等化學(xué)試劑法)的處理后,細胞膜的通透性發(fā)生變化,成為能容許帶有外源DNA的載體分子通過的感受態(tài)細胞。之后采用適當(dāng)?shù)姆椒ㄊ馆d體DNA分子進入受體細胞。本試驗通過42℃熱激、冰浴冷卻的方法將外源DNA載體分子轉(zhuǎn)化入宿主細胞內(nèi)。
儀器與試劑
1儀器
移液器(0.5-10微升、10-200微升,100-1000微升的量程)恒溫水浴鍋(16℃),冰盒,超凈工作臺,培養(yǎng)箱,搖床,玻璃試管,離心機,玻璃棒。2試劑
pMD19-T載體試劑盒,0.1MCaCl2。3菌株與培養(yǎng)基
大腸桿菌DH5α;LB(Amp-)培養(yǎng)基,含X-gal和IPTG的LB(Amp+)平板。
試驗步驟
1.PCR產(chǎn)物與T載體的連接
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(1)在清白的0.2ml的Eppendorf管中依次參與以下各組分:試驗組(每組做一個):
ddH2O3μLSolutionⅠ5μLpMD19-T載體1μLPCR產(chǎn)物1μL總體積10μL
對照組(一個班做一個,第五組同學(xué)做):
ddH2O3μLSolutionⅠ5μLpMD19-T載體1μLControlInsert1μL總體積10μL
(2)輕混反應(yīng)物,并在16℃或者室溫連接反應(yīng)30分鐘(時間可延長)。2.大腸桿菌感受態(tài)細胞的制備
(1)接種10μL甘油菌至含有2mlLB培養(yǎng)基(Amp-)的試管中,37℃振蕩
培養(yǎng)過夜。
注:前一步已經(jīng)由試驗中心老師準備好,同學(xué)們只需從下面其次步開始試驗。(2)以1%的接種量將甘油菌種30μL接種到3mlLB培養(yǎng)基(Amp-)中,
37℃振蕩培養(yǎng)3h(此時菌液的A600值達到0.3~0.4);(示范操作)
(3)室溫下,以5000rpm離心2min,回收細胞;
(4)在超凈工作臺里用槍頭吸取上清棄掉,再用100μL預(yù)冷的0.1MCaCl2溶
液重懸菌體(重懸時操作要輕),冰浴放置。3.大腸桿菌的轉(zhuǎn)化(無菌操作)
(1)將連接產(chǎn)物(試驗組和對照組)參與到制備好的感受態(tài)細胞里,用加樣槍
反復(fù)吹打,將質(zhì)粒與感受態(tài)細胞混合均勻,冰浴10min;(2)42℃水浴熱休克2min,時間到后迅速在冰上冷卻10min;(3)參與1mLLB培養(yǎng)基(Amp-),37℃靜置0.5~1小時;
(4)5000rpm離心2min,在超凈工作臺中用槍頭吸取800μL上清棄掉,用剩
余的液體將細胞懸浮;
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(5)將懸浮細胞全部吸取并轉(zhuǎn)移至含X-gal和IPTG的LB(Amp+)平板上,用
無菌玻璃棒涂布均勻,37℃倒置培養(yǎng)過夜。
本卷須知:
1、吸取微量液體時務(wù)必要防備,確保將其全部轉(zhuǎn)移到反應(yīng)液中;2、確保反應(yīng)液混合均勻;
3、為提高轉(zhuǎn)化率,要密切注意細胞的生長狀態(tài)和密度。
結(jié)果分析與探討:
若轉(zhuǎn)化平板上未能長出菌落,說明轉(zhuǎn)化失敗,可能原因有:(1)與T-載體連接試驗失??;(2)所制備感受態(tài)細胞質(zhì)量差,重組載體未能成功轉(zhuǎn)入;(3)進入宿主菌的外源載體分子未能表達。
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試驗四轉(zhuǎn)化子的篩選及PCR鑒定
試驗?zāi)康?/p>
1.把握藍白斑篩選的基本原理及具體操作。
2.把握常見的幾種鑒定轉(zhuǎn)化子DNA的方法,以及菌落PCR鑒定的原理和方法。
試驗原理
現(xiàn)在使用的大量商業(yè)化質(zhì)粒載體(如pUC系列和它們的衍生載體)都帶有一段大腸桿菌DNA的短片段,其中含有β-半乳糖苷酶N端146個氨基酸的編碼信息及調(diào)控序列。在這個編碼區(qū)中插入了一個多克隆位點,它不破壞閱讀框,而不影響其功能。這種類型的載體適用于可編碼β-半乳糖苷酶C端部分的宿主細胞。盡管宿主和載體編碼的片段都沒有活性,但它們能夠融為一體,形成具有酶活性的蛋白質(zhì)。這樣,lacZ基因上缺失操縱基因區(qū)段的突變體與帶有完整的近操縱基因區(qū)段的β-半乳糖苷酶陰性的突變體之間實現(xiàn)互補,這種互補現(xiàn)象稱為α互補。
IPTG(異丙基-β-D-半乳糖苷)是一種乳糖類似物,可使lacI阻遏蛋白失活,從而誘導(dǎo)lac操縱子轉(zhuǎn)錄。由α互補而產(chǎn)生的lac+細菌落易于識別,由于它們在生色底物X-gal存在的狀況下形成藍色菌落。然而外源DNA片段插入到質(zhì)粒的多克隆位點后,幾乎不可避免地導(dǎo)致產(chǎn)生無α互補能力的N端片段。因此,攜帶重組質(zhì)粒的細菌形成白色菌落。
這一簡單的顏色試驗,大大簡化了在這種構(gòu)建質(zhì)粒載體中鑒定重組子的工作,僅僅通過目測就可以輕而易舉地篩選數(shù)千個菌落,并識別可能含有重組質(zhì)粒的菌落。這樣的方法,即稱為藍白斑篩選法。
選擇性培養(yǎng)基上長出的菌落,由受體菌DH5α的表型Amp-轉(zhuǎn)變?yōu)锳mp+(由質(zhì)粒提供抗性),且顏色為白色的菌落,證明重組質(zhì)粒已轉(zhuǎn)化入受體菌,但要證明插入片段的大小和序列,還需進一步鑒定。常用方法之一是進行重組質(zhì)粒的抽提,然后電泳分析,觀測其分子量與原有載體相比是否增大;方法之二是將抽提的重組質(zhì)粒進行限制性內(nèi)切酶分析,觀測酶切下來得到的DNA片段大小是否與預(yù)計的相符;方法之三是以重組質(zhì)粒為模板進行PCR鑒定,觀測PCR產(chǎn)物的大小是
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否與目的基因大小相符;方法之四則是將重組質(zhì)粒進行DNA序列分析,直接分析重組質(zhì)粒上的插入片段即目的基因的大小與序列是否正確。
本試驗將初篩得到的白斑菌落進行菌落PCR分析,觀測PCR得到的DNA片段大小是否與預(yù)計的相符,從而對重組轉(zhuǎn)化子DNA進一步鑒定。
儀器與試劑
1儀器
1.1涂布器,1個
滅菌試管若干超凈工作臺1臺空氣浴水平搖床1臺電泳儀及配套電泳槽1臺紫外檢測儀1臺1.2移液器(200-1000μL)1支
移液器(5-200μL)1支移液器(0.5-10μL)1支
2試劑
2.1LB(含Amp)液體培養(yǎng)基15mL
Amp的終濃度為0.1g/L(以1LLB/Amp液體培養(yǎng)基為例,Amp的含量為100mg。)2.2配置1LLB/Amp/X-Gal/IPTG平板培養(yǎng)基(舉例說明):
終濃度試劑用量0.04mg/mLX-Gal40mg0.024mg/mLIPTG24mg1%(W/V)Tryptone10g0.5%(W/V)YeastExtract5g1%(W/V)NaCl10g0.1mg/mLAmpicillin100mg1.5%(W/V)Agar15g
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參與1mL70%的乙醇,用槍頭輕輕吹打洗滌沉淀,注意不要將沉淀打碎或吸走
12000r/min離心5分鐘,防備用棄去上清,注意不要將沉淀倒走
將EP管倒置于吸水紙上,除盡乙醇,室溫自然枯燥
用20μL含RNaseA的無菌蒸餾水溶解提取物,室溫放置,充分溶解DNA
2.酶切鑒定
在EP管內(nèi)參與酶切反應(yīng)體系(20μL)質(zhì)粒DNA10μL10×酶切反應(yīng)緩沖液2μLEcoRI1μLHindIII1μL無菌蒸餾水6μL
離心混勻,37℃水浴反應(yīng)3-4小時
制備1%的瓊脂糖凝膠板
取酶切后全部DNA樣品參與上樣緩沖液混勻
上樣進行瓊脂糖凝膠電泳
紫外監(jiān)測儀觀測結(jié)果
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2.3菌落PCR:
PCRBuffer、dNTPmix、Primer1#、Primer2#、TaqDNApolymerase、H2O、瓊脂糖、TAE電泳緩沖液、上樣緩沖液、DNA染料
試驗步驟(以下操作均在超凈工作臺中進行)
1.藍白斑平板的制作(此步已由試驗準備老師完成,以下平板配置各試劑的劑量以1L為例進行說明):
(1)稱取以下試劑,置于1L燒杯中。
Tryptone10gYeastExtract5gNaCl10g(2)參與約800mL的去離子水,充分攪拌混勻。(3)滴加5NNaOH(約0.2mL),調(diào)理PH值至7.0。(4)加去離子水將培養(yǎng)基定容至1L后,參與15gAgar。(5)高溫高壓滅菌后,冷卻至60度左右。
(6)參與1mLAmpicillin(100mg/mL)、1mLIPTG(24mg/mL)、2mLX-Gal(20mg/mL)后均勻混合。
(7)鋪制平板(30-35mL培養(yǎng)基/90mm培養(yǎng)皿)。(8)4度避光保存,一般存放24小時后才開始使用。
(9)做轉(zhuǎn)化液涂布平板操作時,提前1-2小時將平板從4度冰箱取出,室溫避光溫育,以待涂布使用。
(10)見試驗三中具體轉(zhuǎn)化操作。
(11)次日從37度溫箱中取出平板觀測,藍色菌落即初步認定為未轉(zhuǎn)化菌,白色菌落初步認定為轉(zhuǎn)化子。2.菌落PCR:
(1)按順序在PCR管中參與
10XPCRBuffer2μL
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dNTPmix1.6μLPrimer1#1μLPrimer2#1μLTaqDNApolymerase0.5μL
ddH2O13.9μL
總體積20μL
(2)常溫下隨機挑揀一個轉(zhuǎn)化板上的轉(zhuǎn)化子,用滅菌的小槍頭挑取少量菌體;
先將小槍頭放入一支裝有約3mLLB(Amp+)培養(yǎng)基的試管中洗滌2-3次,然后將同一槍頭浸入裝有PCRmixture的PCR管中反復(fù)吹打以作擴增培養(yǎng)細菌用;另取一PCR管,先進行操作(2)的操作,但不加轉(zhuǎn)化子模板,作為陰性對照。將以上兩個PCR管微弱離心后,放入PCR儀,設(shè)置反應(yīng)程序:
94℃5min94℃30sec
61.5℃30sec30Cycle72℃1.5min72℃7min4℃
(3)取少量5μLPCR反應(yīng)產(chǎn)物,1%瓊脂糖電泳分析。(4)紫外檢測儀下觀測并記錄擴增片段大小。
注意:電泳時需有標準DNA分子量Marker和不加模板的陰性對照樣品(5)上述操作(2)中的洗滌過有菌槍頭的試管,空氣搖床37℃,180-200rpm
過夜(12-14hr)擴增培養(yǎng),以備后續(xù)試驗質(zhì)粒提取及酶切使用。
本卷須知
1.α互補篩選是十分可靠的,但并非永不出錯:外源DNA的插入并不總是激活β-半乳糖苷酶α片段的互補活性。假使外源DNA很小(小于100bp),或者插入片段沒有破壞編碼框,也沒有影響α片段的結(jié)構(gòu),就可能不會嚴重影響α互補。雖然這種現(xiàn)象在文獻中有所報道,但是極為罕見,因此只對遇到這種問題的
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研究者才有意義。
不是所有的白色克隆都攜帶重組質(zhì)粒。Lac序列的突變或者丟失可能掩蓋質(zhì)粒表達α片段的能力。
2.PCR方法操作簡便,但影響因素較多,欲得到好的反應(yīng)結(jié)果,需根據(jù)不同的DNA模板,摸索最適條件。同時還要注意避免操作中每一步可能造成的人為污染。
結(jié)果分析與探討
1.LB/Amp/X-Gal/IPTG平板存放在4度避光的條件下,要使用時須提前1-2個小時取出,在室溫下溫育,以供涂布所用。
2.本次試驗中所用的質(zhì)粒為商品化的T載體pMD19-T,在試驗過程中會注意到,它的顏色指示,將不如pUC19等質(zhì)粒在藍白斑篩選中的顏色指示明顯。3.挑取轉(zhuǎn)化子菌落的時候,要注意挑取菌落的位置確鑿,沾取到平板上的些許瓊脂不太會影響試驗結(jié)果;用槍頭在裝有LB(Amp+)培養(yǎng)基的試管中上下2-3次即可,過分洗滌后,會造成PCR反應(yīng)模版不夠,影響試驗結(jié)果。
先
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試驗五重組質(zhì)粒提取與酶切鑒定
試驗原理
用NaOH和SDS破壞細菌包膜,并制造PH12.0~12.6的堿性環(huán)境,胞內(nèi)容物釋放出來后,線性的大分子量細菌染色體DNA變性,而共價閉環(huán)質(zhì)粒DNA仍為自然狀態(tài)。當(dāng)參與高鹽的酸性乙酸鉀溶液后,PH值調(diào)至中性,染色體DNA之間交聯(lián)形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。大部分DNA和蛋白質(zhì)在SDS的作用下形成沉淀,而質(zhì)粒DNA依舊為可溶狀態(tài)。通過離心就可以除去大部分細胞碎片染色體DNA、RNA和蛋白質(zhì),質(zhì)粒DNA尚在上清中,利用酚、氯仿、異丙醇、乙醇等試劑進一步純化質(zhì)粒DNA。
核酸限制性內(nèi)切酶是一類能識別雙鏈DNA中特定堿基序列的核酸水解酶,分I、II、III型三種,II型酶是我們分子生物學(xué)中最常用的內(nèi)切酶,試驗中使用的EcoRI和HindIII兩種內(nèi)切酶能夠識別質(zhì)粒上的特定DNA序列,并能在識別的序列內(nèi)切斷DNA雙鏈,形成一定長度的DNA片斷。
瓊脂糖凝膠電泳適用于分開0.2-50kb范圍的DNA片斷,因DNA分子帶負電荷,在電場中向正極移動,不同DNA分子所帶電荷數(shù)、分子量大小和構(gòu)象不同,在同一電場中的泳動速度就不一樣,從而達到分開的目的。
儀器與試劑1.質(zhì)粒提取試劑
1.1含質(zhì)粒DNA的過夜培養(yǎng)的DH5α菌株LB菌液1.5mL
1.2溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris.Cl(pH8.0),10mmol/LEDTA(pH8.0)。溶液Ⅰ可成批配制,每瓶100mL,高壓滅菌15分鐘,儲存于4℃冰箱
1.3溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH,1%SDS。溶液Ⅱ需
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