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第二章分子克隆工具酶第1頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一
基因工程的操作,是在分子水平上的操作,是依賴一些酶(如限制性核酸內(nèi)切酶,連接酶,DNA聚合酶等)作為工具對(duì)基因進(jìn)行人工切割,拼接和擴(kuò)增等操作。所以把這些酶稱之為“工具酶”。工具酶是對(duì)野生菌株(或真核生物如酵母)進(jìn)行改造、優(yōu)化、而產(chǎn)生的生物工程產(chǎn)品。分子克隆工具酶第2頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一工具酶
核酸內(nèi)切酶核酸外切酶DNA連接酶DNA聚合酶DNA及RNA修飾酶單鏈核酸內(nèi)切酶第3頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一酶主要用途限制性核酸內(nèi)切酶識(shí)別DNA特定序列,切割DNA分子DNA連接酶連接兩個(gè)DNA分子或片段大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ或Klenow酶1制作DNA探針;2合成cDNA第二鏈;3填補(bǔ)雙鏈DNA3`凹端;4DNA測(cè)序。TaqDNA聚合酶聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)多核苷酸激酶多核苷酸5`-OH磷酸化,制末端標(biāo)記探針末端轉(zhuǎn)移酶使3`-末端加同聚物尾S1核酸酶降解單鏈DNA或RNADNA酶Ⅰ在雙鏈DNA上產(chǎn)生隨機(jī)切口RNA酶A降解RNA逆轉(zhuǎn)錄酶補(bǔ)平反應(yīng),合成cDNA或制探針磷酸酶切除核酸末端磷酸基SUMMARY第4頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1限制性內(nèi)切酶1.1引言--核酸酶和限制性核酸內(nèi)切酶的定義1.2限制性核酸內(nèi)切酶的命名1.3限制性核酸內(nèi)切酶的分類1.4限制性核酸內(nèi)切酶活性及其影響因素第5頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一核酸酶(Nuclease):通過(guò)切割相鄰兩個(gè)核苷酸殘基之間磷酸二酯鍵,導(dǎo)致核酸分子多核苷酸鏈水解斷裂的蛋白酶。1)按作用對(duì)象可分為:Deoxyribonuclease(DNAase)&Ribonuclease(RNAase)2)按水解斷裂核酸分子不同方式可分為:Endonuclease&Exonuclease1.1引言--核酸酶和限制性核酸內(nèi)切酶的定義第6頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一限制性內(nèi)切核酸酶(restrictionendonuclease):
指一類能識(shí)別雙鏈DNA分子中特定核苷酸序列,并在識(shí)別序列內(nèi)或附近特異切割雙鏈DNA的核酸內(nèi)切酶。
限制酶天然存在于細(xì)菌體內(nèi),與相伴存在的甲基化酶共同構(gòu)成細(xì)菌的限制-修飾系統(tǒng)(Restriction-ModificationSystem)。第7頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一EcoRIEscherichia屬名Coli種名Ry13株系編號(hào)
若種名頭2個(gè)字母相同則其中一個(gè)可用種名的第一和第三個(gè)字母。1.2限制性核酸內(nèi)切酶的命名第8頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.3限制性核酸內(nèi)切酶的分類1.3.1Ⅰ型限制性內(nèi)切酶1.3.2Ⅱ
型限制性內(nèi)切酶1.3.3Ⅲ
型限制性內(nèi)切酶第9頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.3.1Ⅰ型限制性內(nèi)切酶功能:限制、修飾特點(diǎn):需Mg2+、ATP和S-腺苷蛋氨酸為輔助因子;識(shí)別位點(diǎn)和切割位點(diǎn)不一致,沒(méi)有固定切割位點(diǎn)(隨機(jī)性);應(yīng)用:不常用。第10頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.3.2Ⅲ型限制性內(nèi)切酶功能:限制、修飾特點(diǎn):需Mg2+、ATP和S-腺苷蛋氨酸為輔助因子;特異切割,切割位點(diǎn)在識(shí)別位點(diǎn)外,距識(shí)別位點(diǎn)3`端24-26bp處。應(yīng)用:數(shù)量很少,分子克隆中無(wú)實(shí)際作用。第11頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.3.3Ⅱ型限制性內(nèi)切酶功能:識(shí)別并特異切割DNA分子。
即通常所指的DNA限制性核酸內(nèi)切酶;反應(yīng)特點(diǎn):僅需Mg2+作為催化反應(yīng)的輔助因子,能識(shí)別雙鏈DNA的特殊序列,并可特異切割DNA,產(chǎn)生特異性的片段;應(yīng)用:種類繁多,分子克隆中最常用的內(nèi)切酶。第12頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一限制性內(nèi)切酶限制酶第13頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一限制性內(nèi)切酶分布:主要在微生物中。作用特點(diǎn):特異性,即識(shí)別特定核苷酸序列,切割特定切點(diǎn)。結(jié)果:產(chǎn)生黏性未端(堿基互補(bǔ)配對(duì))。舉例:大腸桿菌的一種限制酶EcoRI能識(shí)別GAATTC序列,并在G和A之間切開(kāi)
被限制酶切開(kāi)的DNA兩條單鏈的切口,帶有幾個(gè)伸出的核苷酸,它們之間正好互補(bǔ)配對(duì),這樣的切口叫做黏性末端。第14頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一(1)基本特性識(shí)別長(zhǎng)度為4-8個(gè)核苷酸的特異序列;最常見(jiàn)的為6個(gè)堿基.許多識(shí)別序列具回文結(jié)構(gòu),如HindⅢ的識(shí)別序列:
5`AAGCTT3`3`TTCGAA5切割產(chǎn)生的末端有粘端
(cohesive/stickyend)如BamHI(G↓GATCC)和平端
(bluntend)如SmaI(CCC↓GGG)第15頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一PstⅠ切割后產(chǎn)生3ˊ粘性末端:有一些酶沿對(duì)稱軸切斷DNA,產(chǎn)生平端或鈍端(Bluntend),如SmaⅠ:第16頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一EnzymeRecognitionsequenceEnzymeRecognitionseuqenceBamHIG↓GATCCPstICTGCA↓GBglIIA↓GATCTSalIG↓TCGACEcoRIG↓AATTCSau3AI↓GATCHindIIGTPy↓PuACSfiIGGCCNNNN↓NGGCCHindIIIA↓AGCTTSmaICCC↓GGGKpnIGGTAC↓CXbaIT↓CTAGANotIGC↓GGCCGCXhoIC↓TCGAGRecognitionSequencesandCuttingsitesofselectedRestrictionEndonucleases第17頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一(2)同裂酶(isoschizomer)
識(shí)別相同序列的限制酶稱同裂酶,但它們的切割位點(diǎn)可能不同。①同序同切酶
這些酶識(shí)別序列和切割位置都相同
HindⅡ與HincⅡ識(shí)別切割位點(diǎn)為GTY↓RAC
,HpaⅡ與HapⅡ識(shí)別切割位點(diǎn)為C↓CGGMobⅠ與Sau3AⅠ識(shí)別切割位點(diǎn)為↓GATC
。第18頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一②同序異切酶
KpnⅠ和Acc65Ⅰ識(shí)別的序列是相同的,但它們的切割位點(diǎn)不同,分別為GGTAC↓C和G↓GTACC。
③“同功多位”許多識(shí)別簡(jiǎn)并序列的限制酶包含了另一種限制酶的功能。如EcoRⅠ識(shí)別和切割位點(diǎn)為G↓AATTC,ApoⅠ
識(shí)別和切割位點(diǎn)為R↓AATTY,后者可識(shí)別前者的序列。
④其它有些限制酶識(shí)別的序列有交叉,如在pUC系列質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)中有一個(gè)SalⅠ位點(diǎn)(識(shí)別切割位點(diǎn)為G↓TCGAC),該位點(diǎn)也可被AccⅠ(識(shí)別切割位點(diǎn)為GT↓MKAC)和HincⅡ(識(shí)別切割位點(diǎn)為
GTY↓RAC)切割。第19頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一(3)同尾酶有些限制酶識(shí)別序列不同,但是產(chǎn)生相同的粘性末端,這些酶稱為同尾酶(isocaudamer)
如:
BamHI:G↓GATCC
BglII:A↓GATCBclⅠ:5’-T↓
GATCA-3第20頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.4
限制性核酸內(nèi)切酶活性
及其影響因素(1)
活性大?。好笇?duì)DNA水解程度不同。(2)酶的活性單位:在指明pH與37℃,在0.05mL反應(yīng)混合物中,1小時(shí)消化1μg的λDNA的酶量為1單位。第21頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一(3)限制性核酸內(nèi)切酶的反應(yīng)條件1)底物DNADNA純度:RNA與E結(jié)合影響有效酶濃度;
DNA濃度:
[DNA]過(guò)大,抑制酶活,影響酶分子擴(kuò)散如:4μgDNA/1UHPaⅠ50μl37℃15h1μgDNA/1UHPaⅠ50μl37℃1h
第22頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一
2)反應(yīng)系統(tǒng)因素緩沖液(無(wú)菌、無(wú)污染)buffer(pH=8.0):50mmol/LTris-HCl10mmol/LMgCl21mmol/LDTT或巰基乙醇100μgBSA/ml(DDT:二硫蘇糖醇BSA:牛血清蛋白)
NaCL(0,500,1000mM)金屬離子如:Ⅱ型酶需Mg2+,若以Mn2+代替Mg2+(如HindⅢ,ECORI)則特異性改變。離子濃度不合適會(huì)抑制酶活。牛血清蛋白(BSA)BSA是酶穩(wěn)定劑,可避免熱、表面張力、化學(xué)品導(dǎo)致的酶變性。過(guò)量BSA會(huì)引起電泳拖尾限制性核酸內(nèi)切酶的反應(yīng)條件第23頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一限制性核酸內(nèi)切酶的反應(yīng)體系Buffer(10x)3LDNA(質(zhì)粒、載體、總DNA….0.1-1g酶2uddH2OBSA(1%)3L30L酶量不超過(guò)總體積的1/10第24頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一思考題用限制酶BglⅡ消化2ugλDNA,該DNA濃度為125ug/mL,BglⅡ?yàn)?units/uL.并提供了限制酶BglⅡ的10倍的緩沖鹽體系。請(qǐng)?jiān)O(shè)計(jì)一最佳方案來(lái)完成該實(shí)驗(yàn)第25頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一限制性內(nèi)切酶的選擇原則:選常見(jiàn)的、活性高的酶,如果雙酶切最好選有公用Buffer的酶推薦酶:Promega公司,Takara公司,Tyoyobo公司第26頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一雙酶切A有公用Buffer的。(直接用公用Buffer切)B兩種酶反應(yīng)溫度不同的。(先切其中一個(gè)然后高溫失活,再用另外一個(gè)酶切)C無(wú)公用Buffer的:先用低鹽Buffer切幾個(gè)小時(shí),再補(bǔ)加鹽分到高鹽加入另外一個(gè)酶繼續(xù)切第27頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一3.星活性在極端非標(biāo)準(zhǔn)條件下,限制酶能切割與識(shí)別序列相似的序列,這個(gè)改變的特殊性稱星星活性,如EcoRⅠ星活性用EcoRⅠ*表示。
影響因素:甘油濃度高(>5%),酶過(guò)量(>100U/ml),離子強(qiáng)度低(<25mM),pH值過(guò)高(>8.0),45%聚乙二醇(PEG),有機(jī)溶劑,8%二甲基亞楓,二價(jià)陽(yáng)離子,12%乙醇。限制性核酸內(nèi)切酶的反應(yīng)條件第28頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一DNA末段的長(zhǎng)度對(duì)限制酶切割的影響需要在識(shí)別序列兩端存在一定長(zhǎng)度的非識(shí)別序列增加切割效率
第29頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一位點(diǎn)偏愛(ài)(Sitepreference)
某些限制酶對(duì)同一介質(zhì)中的有些位點(diǎn)表現(xiàn)出偏愛(ài)性切割,即對(duì)不同位置的同一個(gè)識(shí)別序列表現(xiàn)出不同的切割效率的現(xiàn)象稱作位點(diǎn)偏愛(ài)。第30頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.5
限制酶的用途
1.
在特異位點(diǎn)上切割DNA,產(chǎn)生特異的限制片斷
2.
建立限制酶(物理)圖譜繪制
3.
構(gòu)建基因文庫(kù)
4.用限制酶切出相同的粘性末端,以便重組第31頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一2DNA連接酶2.1定義及功能2.2種類及作用機(jī)理2.3使用時(shí)的注意事項(xiàng)第32頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一2.1定義及功能DNA連接酶(DNAligase):可使一段DNA的3`羥基末端和5`磷酸末端形成3`,5`-磷酸二酯鍵,把兩個(gè)DNA片段連在一起,封閉DNA雙鏈上形成的切口的酶。
DNA連接酶是1967年在三個(gè)實(shí)驗(yàn)室同時(shí)發(fā)現(xiàn)的。J:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\連接酶\DNA連接酶.swf生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\連接酶\DNA連接酶.J:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\連接酶\連接酶.swf生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\連接酶\連接酶.swf第33頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一OHP5`3`3`5`5`3`3`5`DNAligaseDNAligase連接缺刻(nick)第34頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一DNA連接酶連接的部位:磷酸二酯鍵(梯子的扶手),不是氫鍵(梯子的踏板)。第35頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一T4DNA連接酶(ATP提供能量)和大腸桿菌DNA連接酶(NAD+提供能量)兩種。2.2種類及作用機(jī)理第36頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一大腸桿菌的DNA連接酶
大腸桿菌的DNA連接酶是一條分子量為75KD的多肽鏈。對(duì)胰蛋白酶敏感,可被其水解。水解后形成的小片段仍具有部份活性,可以催化酶與NAD(而不是ATP)反應(yīng)形成酶-AMP中間物,但不能繼續(xù)將AMP轉(zhuǎn)移到DNA上促進(jìn)磷酸二酯鍵的形成。第37頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一大腸桿菌的DNA連接酶DNA連接酶在大腸桿菌細(xì)胞中約有300個(gè)分子,和DNA聚合酶Ⅰ的分子數(shù)相近,這也是比較合理的現(xiàn)象。因?yàn)镈NA連接酶的主要功能就是在DNA聚合酶Ⅰ催化聚合,填滿雙鏈DNA上的單鏈間隙后,封閉DNA雙鏈上的缺口。這在DNA復(fù)制、修復(fù)和重組中起著重要的作用,連接酶有缺陷的突變株不能進(jìn)行DNA復(fù)制、修復(fù)和重組。
第38頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一噬菌體T4DNA連接酶
噬菌體T4DNA連接酶分子也是一條多肽鏈,分子量為60KD,其活性很容易被0.2mol/L的KCl和精胺所抑制。此酶的催化過(guò)程需要ATP輔助。T4DNA連接酶可連接DNA-DNA,DNA-RNA,RNA-RNA和雙鏈DNA粘性末端或平頭末端。另外,NH4C1可以提高在大腸桿菌DNA連接酶的的催化速率,而對(duì)T4DNA連接酶則無(wú)效。無(wú)論是T4DNA連接酶,還是大腸桿菌DNA連接酶都不能催化兩條游離的DNA鏈相連接。
第39頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一AATTC······GG······CTTAAAATTC······GG······CTTAA5′5′5′5′(1)(2)AATTC······GG······CTTAAAATTC······GG······CTTAA5′5′AATTC······GG······CTTAA5′5′(a)分子間連接(b)分子內(nèi)連接(1)(2)ATGCTATAGCTAT4連接酶T4連接酶第40頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一T4DNAligase的作用機(jī)理第41頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一第42頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1)DNA連接酶不能催化兩單鏈DNA分子連接;2)只能連接雙鏈DNA分子的單鏈缺刻(nick);3)不能連接雙鏈中一個(gè)或多個(gè)核苷酸缺失所致的缺口(gap)。2.3使用時(shí)的注意事項(xiàng)第43頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一思考
要想獲得某個(gè)特定性狀的基因必須要用限制酶切幾個(gè)切口?可產(chǎn)生幾個(gè)黏性末端?要切兩個(gè)切口,產(chǎn)生四個(gè)黏性末端。
如果把兩種來(lái)源不同的DNA用同一種限制酶來(lái)切割,會(huì)怎樣呢?
會(huì)產(chǎn)生相同的黏性末端,然后讓兩者的黏性末端黏合起來(lái),就可以合成重組的DNA分子了。第44頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一DNA聚合酶(DNApolymerase)
J:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\DNA聚合酶\Nucleotide_Polymerization.movJ
J:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\DNA聚合酶\Nucleotide_Polymerization.mov3.1DNA聚合酶I3.2Klenow聚合酶3.3TaqDNA聚合酶3.4逆轉(zhuǎn)錄酶3.5T4DNA聚合酶3.6T7DNA聚合酶第45頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一3.1DNA聚合酶I活性:5`→3`聚合活性,5`→3`外切和3`→5`外切活性。發(fā)揮生物學(xué)活性的條件:(1)DNA模板(可以是單鏈或雙鏈)(2)帶有3`-端游離羥基的引物鏈(3)底物和激活劑注:對(duì)雙鏈DNA,當(dāng)有dNTP存在時(shí),3`→5`降解活性會(huì)被5`→3`方向的聚合活性所抑制。應(yīng)用:缺口平移法制備DNA分子雜交探針第46頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一1、5′→3′聚合酶活性:
CCGGGCTATCGGE.coliDNApolIMg2+,4dNTPCCGATAGCCGGCTATCGG2、5′→3′外切酶活性
3、3′→5′外切酶活性
GATAGCCAGCTATCGGTCGATAGCCAGCTATCGGE.coliDNApolIMg2++pC,pT5′TCGATAGCCAGCTATE.coliDNApolIMg2+TCGATAAGCTAT+pC,pG,pC5′DNA聚合酶I的三種活性第47頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一DNA雜交探針的制備5‘3’3‘5’5‘3’3‘5’5‘3’3‘5’5‘3’3‘5’5‘3’3‘5’********(a)(b)(c)(d)(e)(a)雙鏈的DNA分子(b)帶有3’-OH末端的單鏈缺口(c)polⅠ從5‘-P移去一個(gè)核苷酸(d)polⅠ將32P標(biāo)記的核苷酸參入取代被移去的核苷酸(e)重復(fù)(c)(d)的步驟,缺口沿5’-3‘方向移動(dòng),形成32P標(biāo)記的核苷酸合成的DNA鏈第48頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一制備高比活性的探針當(dāng)雙鏈DNA分子的一條鏈上產(chǎn)生切口時(shí),E.coliDNA聚合酶Ⅰ就可將核苷酸連接到切口的3‘羥基末端。同時(shí)該酶具有從5’→3‘的核酸外切酶活性,能從切口的5’端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同時(shí)又在切口的3‘端補(bǔ)上核苷酸,從而使切口沿著DNA鏈移動(dòng),用放射性核苷酸代替原先無(wú)放射性的核苷酸,將放射性同位素?fù)饺氲胶铣尚骆溨?。最合適的切口平移片段一般為50-500個(gè)核苷酸。DNA聚合酶I在基因工程的應(yīng)用第49頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一用于分子克?。ㄌ畛淙笨诶谥亟M)
DNApolⅠ能填充DNA的小缺口區(qū)(Gappedregion)→以便有效在體外用于DNA分子重組第50頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一
DNA序列分析K:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\核酸特性、合成及轉(zhuǎn)運(yùn)\DNA測(cè)序生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\核酸特性、合成及轉(zhuǎn)運(yùn)\DNA測(cè)序
①
Sauger雙脫氧法
DNApolⅠ參入了2’3’-雙脫氧核苷酸到相應(yīng)的融合了的引物中,從而終止了鏈的進(jìn)一步延伸,這樣每個(gè)大小不同片段都帶有ddNTP。經(jīng)過(guò)PAGE測(cè)出DNA順序。
第51頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一②
化學(xué)降解法當(dāng)Mg2+被Mn2+取代時(shí),DNApolⅠ有參與相應(yīng)NTP取代dNTP的能力,參與的這個(gè)NTP可以作為1個(gè)特殊切割位點(diǎn)而被降解,得到帶有NTP末端的DNA片段,這是化學(xué)法測(cè)序的主要原理。③
加減法主要原理是在限制使用dNTP條件下加入DNApolⅠ和T4誘導(dǎo)的DNApol同時(shí)反應(yīng)。在減法反應(yīng)中從4個(gè)反應(yīng)混合物中每4個(gè)dNTP中減去1個(gè)。生長(zhǎng)鏈沿著引物延伸至缺少的那個(gè)dNTP為止。在加法反應(yīng)中所用的dNTP只有1種,如dATP,通過(guò)DNApol3′→5′外切酶活性使鏈終止在帶有A的3’末端用其它3種dNTP進(jìn)行類似反應(yīng),這樣通過(guò)加或減法8個(gè)混合物的電泳結(jié)果即可推出DNA鏈的順序。
第52頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一來(lái)源:
E.coliDNAPolymeraseⅠ經(jīng)蛋白酶水解的大片段(Klenow和Henningseon.19703.2Klenow聚合酶DNApolⅠ枯草桿菌蛋白酶或胰蛋白酶C端(76kd)+N端(36kd)
5’→3’外切第53頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一用途填補(bǔ)限制酶的5′-粘性末端為平齊末端5’…CC3’…GGAATT5’…CCTTAA3’3’…GGAATT5’Klenow3′-末端標(biāo)記
Klenow在無(wú)底物時(shí)只進(jìn)行3′→5′外切;有底物存在時(shí)則聚合。這種標(biāo)記也稱作交換標(biāo)記,但Klenow作用不如T4DNA聚合酶。第54頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一顯著特點(diǎn):熱穩(wěn)定性
70℃反應(yīng)2h殘留活性為原來(lái)的90%;93℃反應(yīng)2h殘留活性為原來(lái)的60%;94℃反應(yīng)2h殘留活性為原來(lái)的40%。應(yīng)用:(1)DNA序列測(cè)定(2)PCR(polymerasechainreaction)對(duì)DNA的特定片段進(jìn)行體外擴(kuò)增。K:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\分子\PCR3.3TaqDNA聚合酶第55頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase):又稱為RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶?;钚裕?/p>
5`→3`聚合酶活性和RNaseH活性。聚合作用所需模板可以是RNA或DNA,引物是帶3`-OH的RNA或DNA。K:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\逆轉(zhuǎn)錄酶\逆轉(zhuǎn)錄酶的作用原理.swf生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\逆轉(zhuǎn)錄酶\逆轉(zhuǎn)錄酶的作用原理.swfK:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\逆轉(zhuǎn)錄酶\DNA端部處理生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\逆轉(zhuǎn)錄酶\DNA端部處理K:\生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\反轉(zhuǎn)錄病毒\Life_Cycle_of_a_Retrovirus.mov生物視頻\細(xì)胞生物學(xué)視頻\反轉(zhuǎn)錄病毒\Life_Cycle_of_a_Retrovirus.mov3.4逆轉(zhuǎn)錄酶第56頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一逆轉(zhuǎn)錄酶的活性第57頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一
用途:(1)在體外以mRNA為模板合成cDNA;(2)對(duì)有5`突出末端的DNA片段作末端標(biāo)記(補(bǔ)平);(3)雙脫氧法測(cè)序;(4)以DNA或RNA為模板合成核酸探針。第58頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一活性:
5`→3`聚合酶活性和3`→5`外切酶活性,且3`→5`外切酶活性對(duì)單鏈DNA的作用比對(duì)雙鏈DNA強(qiáng)。
高濃度dNTP環(huán)竟下前者活性更強(qiáng)。應(yīng)用:標(biāo)記DNA平末端或隱蔽3`末端注意:3`外切酶活性無(wú)序列特異性3.5T4DNA聚合酶第59頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一活性:5`→3`聚合酶活性;有單鏈及雙鏈的3`→5`外切酶活性,但無(wú)5`→3`外切酶活性;特點(diǎn):極佳的連續(xù)合成能力應(yīng)用:(1)用于長(zhǎng)模板DNA的引物延伸反應(yīng);(2)通過(guò)單純的延伸或取代合成途徑標(biāo)記DNA3`末端;(3)使雙鏈DNA的5`或3`突出末端變成平末端。3.6T7DNA聚合酶第60頁(yè),共74頁(yè),2023年,2月20日,星期一T7DNA聚合酶(測(cè)序酶)來(lái)源:T7Phage感染的E.coli結(jié)構(gòu):由2個(gè)蛋白亞基組成:
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