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———干貨分享丨PCR耗材如何選擇
導(dǎo)讀
耗材的選擇對得到滿意的PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果至關(guān)重要,在分析PCR結(jié)果時(shí),我們往往側(cè)重于對引物、酶的濃度、溫度和時(shí)間的分析,卻忽略了PCR耗材也是影響因素之一。PCR耗材類型眾多,如何選擇合適的PCR耗材呢?下面幾個(gè)問題可以幫你找到答案。
1.PCR耗材一般選擇什么材質(zhì)?
不管是普通的PCR還是實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR),通常其耗材會與試劑或樣品直接接觸,因而在生產(chǎn)制備過程中要求選用高質(zhì)量的材料和良好的加工工藝。一般耗材都是選擇聚丙烯(PP)材質(zhì)。聚丙烯(PP)材質(zhì)是生物學(xué)惰性材料,表面不易于粘附生物分子,且有著良好的化學(xué)耐性,及溫度耐受性。
2.不同體積的PCR管/板,該怎么選?
PCR管/板常見的體積:
單管/8連管/12連管:0.5mL、0.2mL、0.1mL
96孔板:0.2mL、0.1mL
384孔板:0.02mL
PCR管/板的規(guī)格:
依據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)要求選用合適的產(chǎn)品。PCR管的體積大多數(shù)都可以滿足PCR反應(yīng)的要求。容量規(guī)格有標(biāo)準(zhǔn)容量和低容量可選,一般情況下推薦優(yōu)先選用低容管。因?yàn)榈腿莘磻?yīng)管/板有著較小的上方空間,可提高熱傳導(dǎo)率并降低蒸發(fā)。同時(shí),在加樣時(shí)需要避免加樣過量或過少。過量會導(dǎo)致熱傳導(dǎo)率下降,溢出及交叉污染,而過少可能會造成樣品蒸發(fā)損失。
3.單管或8聯(lián)管的平蓋/凸蓋有什么區(qū)別?
當(dāng)樣品量較少時(shí),都會優(yōu)先選用單管或者8聯(lián)管。但是當(dāng)反應(yīng)體積需求較大時(shí),單管占優(yōu)勢,體積可達(dá)0.5mL。單管和8聯(lián)管有平蓋和凸蓋兩種,各有優(yōu)點(diǎn)。平蓋可為qPCR提供精確的熒光信號傳遞;便于書寫標(biāo)記。凸蓋與PCR儀蓋接觸,減少壓力引起的管變形等;但會影響熒光信號傳遞,無法應(yīng)用于qPCR實(shí)驗(yàn)。
4.不同的96孔板使用場景有什么不同?
96孔板一般分為無裙邊板、半裙邊板和全裙邊板。
無裙邊板:可適用于大多數(shù)的PCR儀或qPCR儀,但不適用于自動化應(yīng)用。移液過程中穩(wěn)定性不高,需要配合板托使用。
半裙邊板:可適配標(biāo)簽或應(yīng)用條碼,及自動化應(yīng)用,且有著較好的移液穩(wěn)定性。
全裙邊板:非常適用于自動化實(shí)驗(yàn)應(yīng)用,也可適配標(biāo)簽及應(yīng)用條碼。機(jī)械強(qiáng)度較好,可適用于凸出模塊的PCR儀,且移液過程中穩(wěn)定性高。
5.PCR板/管材質(zhì)是厚點(diǎn)的穩(wěn)定性更好嗎?
不是的。PCR耗材的管壁厚度要均一,才能提供一致的熱傳導(dǎo)。超薄管壁較標(biāo)準(zhǔn)版薄50%,可進(jìn)一步減少熱屏障,帶來更快更好的反應(yīng)效果。
6.為何96孔和384孔板切角和標(biāo)識不相同?
切角:PCR板的切角位置選擇取決于適配儀器要求,便于定位。
標(biāo)識:PCR板的數(shù)字字母標(biāo)記有助于識別單個(gè)孔及樣品位置。一般為凸出的顏色數(shù)字標(biāo)識或者印刻標(biāo)識。對于一些自動化應(yīng)用實(shí)驗(yàn),印刻標(biāo)記的反應(yīng)板密封性會更好。
7.PCR板孔有凸出的,有平的,如何選?
常見的PCR板有平孔緣和加高孔緣兩種。平孔緣的反應(yīng)板,可適用于大多數(shù)的PCR儀。升孔緣的反應(yīng)板,便于封膜,可降低樣品間的交叉污染風(fēng)險(xiǎn)。
8.不同顏色的PCR管/板,該怎么選?
對于普通的PCR反應(yīng)選用透明的就可以。在實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)時(shí),白管的靈敏度和一致性相對更高。白色管壁能夠阻止熒
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