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文檔簡介
核酸的分類及分布存在于細(xì)胞核和線粒體內(nèi)。存在于胞核、胞液和線粒體。(deoxyribonucleicacid,DNA)(ribonucleicacid,RNA)脫氧核糖核酸核糖核酸攜帶遺傳信息,決定細(xì)胞和個體的遺傳型(genotype)。參與遺傳信息的復(fù)制與表達(dá)。某些病毒RNA也可作為遺傳信息的載體。目前一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)第一節(jié)核酸的化學(xué)組成及一級結(jié)構(gòu)TheChemicalComponentandPrimaryStructureofNucleicAcid目前二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)核酸的基本組成單位是核苷酸(nucleotide)。堿基戊糖磷酸核苷酸核苷核酸DNA的基本組成單位是脫氧核糖核苷酸。RNA的基本組成單位是核糖核苷酸。目前三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)嘌呤嘧啶堿基腺嘌呤(A)鳥嘌呤(G)胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)尿嘧啶(U)DNA、RNA均有DNA有RNA有一、核苷酸的結(jié)構(gòu)每種核酸都含有四種堿基。目前四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)嘌呤(purine)腺嘌呤(adenine,A)鳥嘌呤(guanine,G)堿基目前五頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)嘧啶(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)目前六頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
五種堿基都能形成酮式-烯醇式或氨基-亞氨基的互變異構(gòu)。這兩種異構(gòu)體的平衡關(guān)系受介質(zhì)酸堿環(huán)境的影響。
目前七頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)戊糖(構(gòu)成RNA)核糖(ribose)(構(gòu)成DNA)脫氧核糖(deoxyribose)目前八頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)堿基和核糖(或脫氧核糖)通過糖苷鍵連接形成核苷(nucleoside)(或脫氧核苷)。目前九頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP脫氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP核苷(脫氧核苷)和磷酸以酯鍵連接形成核苷酸(脫氧核苷酸)。目前十頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)多磷酸核苷酸:
NMP,NDP,NTP目前十一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)環(huán)化核苷酸:cAMP,cGMP目前十二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)二、核酸的一級結(jié)構(gòu)定義核酸中核苷酸的排列順序。由于核苷酸間的差異主要是堿基不同,所以也稱為堿基序列。目前十三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)5′端3′端核苷酸之間以3,5-磷酸二酯鍵連接形成多核苷酸鏈,即核酸。CGA目前十四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)書寫方法目前十五頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
DNA與RNA的區(qū)別核酸堿基戊糖DNAA、G、C、T脫氧核糖RNAA、G、C、U核糖目前十六頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)第二節(jié)DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能DimensionalStructureandFunctionofDNA目前十七頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)一、DNA的二級結(jié)構(gòu)——雙螺旋結(jié)構(gòu)目前十八頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)(一)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的研究背景堿基組成分析Chargaff規(guī)則:[A]=[T][G]=[C]堿基的理化數(shù)據(jù)分析A-T、G-C以氫鍵配對較合理
DNA纖維的X-線衍射圖譜分析目前十九頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)已知的核酸化學(xué)數(shù)據(jù)目前二十頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)1.兩條鏈反向平行,圍繞同一中心軸構(gòu)成右手雙螺旋(doublehelix)。螺旋直徑2nm,表面有大溝和小溝。2.磷酸-脫氧核糖骨架位于螺旋外側(cè),堿基垂直于螺旋軸而伸入內(nèi)側(cè)。每圈螺旋含10個堿基對(bp),螺距為3.4nm。目前二十一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)堿基平面與縱軸垂直,糖環(huán)平面與縱軸平行目前二十二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)3.兩條鏈通過堿基間的氫鍵相連,A對T有兩個氫鍵,C對G有三個氫鍵,這種A-T、C-G配對的規(guī)律,稱為堿基互補(bǔ)規(guī)則。4.維持雙螺旋穩(wěn)定的因素:橫向為氫鍵,縱向為堿基間的堆積力。目前二十三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)堿基互補(bǔ)配對TAGC目前二十四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)(三)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性Z型DNAB型DNAA型DNA目前二十五頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)二、DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)及其在染色質(zhì)中的組裝(一)DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)超螺旋結(jié)構(gòu)(superhelix或supercoil)DNA雙螺旋鏈再盤繞即形成超螺旋結(jié)構(gòu)。正超螺旋(positivesupercoil)盤繞方向與DNA雙螺旋方同相同負(fù)超螺旋(negativesupercoil)盤繞方向與DNA雙螺旋方向相反目前二十六頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)意義DNA超螺旋結(jié)構(gòu)整體或局部的拓?fù)鋵W(xué)變化及其調(diào)控對于DNA復(fù)制和RNA轉(zhuǎn)錄過程具有關(guān)鍵作用。目前二十七頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)(二)原核生物DNA的高級結(jié)構(gòu)目前二十八頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)(三)DNA在真核生物細(xì)胞核內(nèi)的組裝真核生物染色體由DNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其基本單位是核小體(nucleosome)。核小體的組成DNA:約200bp組蛋白:H1H2A,H2BH3H4目前二十九頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)串珠狀核小體結(jié)構(gòu)目前三十頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)串珠狀核小體DNA雙螺旋片段染色質(zhì)纖維伸展形染色質(zhì)片段密集形染色質(zhì)片段整個染色體目前三十一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)核小體螺線管真核生物染色體DNA組裝目前三十二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)三、DNA的功能DNA的基本功能是以基因的形式荷載遺傳信息,并作為基因復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的模板。它是生命遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),也是個體生命活動的信息基礎(chǔ)?;驈慕Y(jié)構(gòu)上定義,是指DNA分子中的特定區(qū)段,其中的核苷酸排列順序決定了基因的功能。目前三十三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)肺炎雙球菌的轉(zhuǎn)化實驗OswaldAvery(1944)目前三十四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
實驗二,噬菌體的標(biāo)記實驗?zāi)壳叭屙揬總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
目前三十六頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
目前三十七頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
目前三十八頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)第三節(jié)
RNA的結(jié)構(gòu)與功能StructureandFunctionofRNA目前三十九頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)動物細(xì)胞內(nèi)主要RNA的種類及功能目前四十頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)一、信使RNA的結(jié)構(gòu)與功能hnRNA內(nèi)含子(intron)mRNA*mRNA成熟過程
外顯子(exon)目前四十一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)*mRNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)1.大多數(shù)真核mRNA的5′末端均在轉(zhuǎn)錄后加上一個7-甲基鳥苷,同時第一個核苷酸的C′2也是甲基化,形成帽子結(jié)構(gòu):m7GpppNm-。2.大多數(shù)真核mRNA的3′末端有一個多聚腺苷酸(polyA)結(jié)構(gòu),稱為多聚A尾。目前四十二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)帽子結(jié)構(gòu)目前四十三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)mRNA核內(nèi)向胞質(zhì)的轉(zhuǎn)位mRNA的穩(wěn)定性維系翻譯起始的調(diào)控帽子結(jié)構(gòu)和多聚A尾的功能mRNA的功能:作為蛋白質(zhì)合成的模板。目前四十四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)*tRNA的一級結(jié)構(gòu)特點(diǎn)含稀有堿基較多
3′末端為—CCA-OH5′末端大多數(shù)為G
由70~90個核苷酸組成二、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的結(jié)構(gòu)與功能目前四十五頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)稀有堿基目前四十六頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)*tRNA的二級結(jié)構(gòu)——三葉草形氨基酸臂額外環(huán)目前四十七頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)*tRNA的三級結(jié)構(gòu)——倒L形*tRNA的功能活化、搬運(yùn)氨基酸到核糖體,參與蛋白質(zhì)的翻譯。目前四十八頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)*rRNA的結(jié)構(gòu)三、核蛋白體RNA的結(jié)構(gòu)與功能*rRNA的功能參與組成核蛋白體,作為蛋白質(zhì)生物合成的場所。目前四十九頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)核糖體的組成原核生物真核生物小亞基30S40SrRNA16S18S蛋白質(zhì)21種33種大亞基50S60SrRNA23S5S28S5.8S5S蛋白質(zhì)33種49種核糖體70S80S目前五十頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)四、其他小分子RNA及RNA組學(xué)除了上述三種RNA外,細(xì)胞的不同部位存在的許多其他種類的小分子RNA,統(tǒng)稱為非mRNA小RNA(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs)。snmRNAs目前五十一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)snmRNAs的種類核內(nèi)小RNA(snRNA)核仁小RNA(snoRNA)胞質(zhì)小RNA(scRNA)催化性小RNA小片段干擾RNA(siRNA)snmRNAs的功能參與hnRNA和rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工和轉(zhuǎn)運(yùn)以及基因表達(dá)過程的調(diào)控等。目前五十二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)是研究細(xì)胞中snmRNAs的種類、結(jié)構(gòu)和功能的科學(xué)。同一生物體內(nèi)不同種類的細(xì)胞、同一細(xì)胞在不同時間、不同狀態(tài)下snmRNAs的表達(dá)具有時間和空間特異性。RNA組學(xué)(RNomics)目前五十三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)核酸的理化性質(zhì)ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四節(jié)目前五十四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)一、核酸的一般理化性質(zhì)核酸為多元酸,具有較強(qiáng)的酸性;DNA是線性高分子,粘度極大;在260nm波長有最大吸收峰,是由堿基的共軛雙鍵決定的。這一特性常用作核酸的定性、定量分析。目前五十五頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)目前五十六頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相當(dāng)于50g/ml雙鏈DNA40g/ml單鏈DNA(或RNA)20g/ml寡核苷酸2.判斷核酸樣品的純度DNA純品:OD260/OD280=1.8RNA純品:OD260/OD280=2.0OD260的應(yīng)用目前五十七頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)二、DNA的變性(denaturation)定義:在某些理化因素作用下,DNA雙鏈解開成兩條單鏈的過程。變性因素:過量酸,堿,加熱等。變性后理化性質(zhì)的主要改變:OD260增高 粘度下降目前五十八頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)DNA變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂目前五十九頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)DNA的紫外吸收光譜增色效應(yīng):DNA變性時其溶液OD260增高的現(xiàn)象。目前六十頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)解鏈曲線:在連續(xù)加熱DNA的過程中以溫度對A260值作圖,所得的曲線稱為解鏈曲線。目前六十一頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)Tm:紫外光吸收值達(dá)到最大值的50%時的溫度稱為DNA的解鏈溫度,又稱融解溫度(meltingtemperature,Tm)。其大小與G+C含量成正比。目前六十二頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)三、DNA的復(fù)性與分子雜交
DNA復(fù)性(renaturation)的定義在適當(dāng)條件下,變性DNA的兩條互補(bǔ)鏈可恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱為復(fù)性。減色效應(yīng)DNA復(fù)性時,其溶液OD260降低。熱變性的DNA經(jīng)緩慢冷卻后即可復(fù)性,這一過程稱為退火(annealing)。目前六十三頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)
熱變性的DNA在復(fù)性過程中,具有堿基序列部分互補(bǔ)的不同的DNA之間或DNA與RNA之間形成雜化雙鏈的現(xiàn)象。核酸分子雜交(hybridization):目前六十四頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)變性復(fù)性復(fù)性目前六十五頁\總數(shù)七十頁\編于七點(diǎn)核酸分子雜交的應(yīng)用研究DNA分子中某一種基因的位置定兩種核酸分子間的序列相似性檢
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