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職業(yè)教育醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫生物化學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)核酸分離純化技術(shù)BASICCLINICALLABORATORYMEDICINE2標(biāo)本:血液、尿液、唾液、分泌物、組織及培養(yǎng)細(xì)胞DNARNA核酸質(zhì)量要求結(jié)構(gòu)完整、純度、濃度核酸分離純化方法選擇原則:1、保證核酸分子一級結(jié)構(gòu)的完整性;2、排除其他分子污染。根據(jù)不同標(biāo)本性質(zhì)、起始量以及待分離核酸性質(zhì)、用途采用不同的分離純化方案。2023/5/16核酸分離純化方法選擇(一)影響核酸一級結(jié)構(gòu)因素物理因素溫度0-4℃
避免反復(fù)凍融、高溫防止其他機(jī)械剪切力的作用例如基因組DNA分子細(xì)長,容易受到機(jī)械剪切力的作用而斷裂,所以機(jī)械剪切作用是分離大分子線性DNA的主要危險因素。
化學(xué)因素
pH4-10,避免酸堿對核酸磷酸二酯鍵的破壞生物因素
避免核酸酶(DNA酶和RNA酶)破壞
采取措施:操作環(huán)境潔凈、操作者戴手套防止外來污染;所有器械及一些試劑應(yīng)進(jìn)行高溫滅菌處理;提取緩沖液加入核酸酶抑制劑。
DNA酶抑制劑
大多數(shù)DNA酶作用時需要二價金屬離子,如Ca2+,Mg2+等,因此加入EDTA(乙二胺四乙酸鈉),8-羥基喹啉等金屬離子螯合劑可抑制DNA酶活性;陰離子表面活性劑SDS,抑制DNA酶活性并沉淀蛋白。
RNA酶抑制劑(1)DEPC(焦炭酸二乙酯)
強(qiáng)烈的RNA酶抑制劑,可與RNA酶組氨酸殘基結(jié)合,抑制RNA酶活性。
劇毒易降解、需保存于低溫使用時,0.1%DEPC浸泡器械過夜或37
℃浸泡2h以上破壞單鏈核苷酸嘌呤環(huán)結(jié)構(gòu),但有效濃度比蛋白變性濃度高100-1000倍
(2)其他RNA酶抑制劑肝素復(fù)合硅酸鹽RNase阻抑蛋白(RNasin)氧釩核糖核苷復(fù)合物
異硫氰酸胍
(二)影響核酸純度的因素
多糖、蛋白質(zhì)、脂類有機(jī)溶劑、金屬離子其他非目的核酸的核酸類物質(zhì)
核酸分離純化技術(shù)路線
細(xì)胞裂解核酸提取核酸純化步驟一:細(xì)胞裂解物理法:超聲波法、研磨法、勻漿法、凍融法
化學(xué)法:表面活性劑SDS、高鹽酶法:溶菌酶、蛋白酶K、裂解酶
破壞細(xì)胞膜結(jié)構(gòu),釋放胞內(nèi)核酸,同時可降解核酸結(jié)合蛋白,促進(jìn)核酸提取。
步驟二:核酸提取蛋白質(zhì)是核酸分離提取最大污染,將與核酸緊密結(jié)合的蛋白質(zhì)分離且保證核酸結(jié)構(gòu)完整,是核酸分離提取的技術(shù)關(guān)鍵。常用核酸提取方法高鹽法(高濃度NaCl)NaCl加入,破壞核酸-蛋白靜電吸附力、氫鍵,使其解聚;RNA核蛋白與DNA核蛋白在NaCl溶液中溶解度不同,可以通過調(diào)節(jié)NaCl溶液濃度分離RNA核蛋白與DNA核蛋白。
SDS法SDS可裂解細(xì)胞、抑制核酸酶活性,還是蛋白質(zhì)變性劑,使得核酸結(jié)合蛋白變性解離,促進(jìn)核酸提取。酚-氯仿抽提法
酚:氯仿:異戊醇=25:24:1酚:蛋白質(zhì)變性劑,DNA酶抑制劑氯仿:加速有機(jī)相與水相分層,去除酚異戊醇:降低表面張力,減少氣泡,使離心后水相、有機(jī)相、變性蛋白層相對穩(wěn)定
步驟三:核酸純化
通常采用沉淀法濃縮純化核酸
(1)易于改變核酸溶解緩沖液;
(2)易于調(diào)整核酸濃度;
(3)易于除去核酸中殘余鹽離子和雜質(zhì)。沉淀劑一:鹽NaA
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