分子生物學(xué)蛋白質(zhì)的翻譯

分子生物學(xué)蛋白質(zhì)的翻譯第一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日重點(diǎn)內(nèi)容：①基本概念：遺傳密碼、密碼子、搖擺假說；②遺傳密碼的性質(zhì)；③核糖體結(jié)構(gòu)組成及幾個(gè)活性部位生物學(xué)功能；④原核生物蛋白質(zhì)合成起始的深刻理解；⑤真核生物蛋白質(zhì)合成起始時(shí)幾種復(fù)合物變換；⑥原核生物和真核生物蛋白質(zhì)合成起始性比較；⑦肽鏈延伸的機(jī)理；⑧釋放因子終止肽鏈合成的機(jī)理。第二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日1遺傳密碼1.1兩個(gè)概念1.2破譯簡(jiǎn)史1.3遺傳密碼字典1.4遺傳密碼性質(zhì)第三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日遺傳密碼(geneticcode):

DNA（或mRNA）中核苷酸序列與蛋白質(zhì)中氨基酸序列之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系。密碼子(codon)：

mRNA上每3個(gè)相鄰核苷酸編碼多肽鏈中一個(gè)氨基酸，這三個(gè)核苷酸稱一個(gè)密碼子或三聯(lián)體密碼。1.1兩個(gè)概念第四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日（1）1954年Gamow首先對(duì)遺傳密碼進(jìn)行了探討；（2）1961年Crick證明三聯(lián)體密碼子是正確的；（3）1961年，Nirenberg以均聚物、隨機(jī)共聚物、特定序列的共聚物作模板合成多肽，破譯遺傳密碼；（4）1964年Nirenberg用核糖體結(jié)合技術(shù)研究遺傳密碼，直接測(cè)出三聯(lián)體對(duì)應(yīng)的氨基酸；（5）到1966年，遺傳密碼全部破譯。1.2遺傳密碼破譯簡(jiǎn)史第五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日核糖體結(jié)合技術(shù)保溫

硝酸纖維濾膜過濾分析留在濾膜上的核糖體-AA-tRNA

確定與核糖體結(jié)合的AA和模板特定三核苷酸為模板+核糖體+20種AA-tRNA(其中一種AA-tRNA的氨基酸被14C標(biāo)記）第六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日1.3遺傳密碼字典第七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日1.4遺傳密碼的性質(zhì)

1.4.1簡(jiǎn)并性與兼職性

簡(jiǎn)并性：許多氨基酸對(duì)應(yīng)的密碼子不止一種。兼職性：

AUG（Met)和GUG（Val)兩個(gè)密碼子除代表特定氨基酸外，還兼作起始密碼子。第八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Aminoacidshave1-6codonseach第九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日1.4.2普遍性與特殊性

普遍性：遺傳密碼無論在體內(nèi)還是體外，無論是對(duì)病毒、細(xì)菌、動(dòng)物還是植物而言都通用；特殊性：遺傳密碼的個(gè)例很少見；基因組中編碼含義的改變常涉及到對(duì)終止密碼子的解讀；密碼子系統(tǒng)性改變只存在于線粒體中。第十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日ChangesinthegeneticcodeusuallyinvolveStop/Nonesignals第十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

1.4.3密碼子-反密碼子識(shí)別的搖擺性

在密碼子與反密碼子的配對(duì)中，前兩對(duì)嚴(yán)格遵守堿基配對(duì)原則，而第三對(duì)堿基有一定的自由度，可以“擺動(dòng)”。第十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Thirdbaseshaveleastmeaning第十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日密碼子與反密碼子的識(shí)別第十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日r第十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日在密碼子第三位堿基與反密碼子第一位堿基之間，堿基配對(duì)的擺動(dòng)允許形成G-U配對(duì)。G-Upairsformatthethirdcodonbase第十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Anticodon3`G-C-IG-C-IG-C-I5`Codon5`C-G-AC-G-UC-G-C3`I:次黃嘌呤第十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

1.4.4讀碼的連續(xù)性

生物合成過程中，mRNA的編碼方向是5`→3`，從N端向C端延伸肽鏈。一條肽鏈合成起始后，密碼子按3個(gè)一框讀下去不重疊也不跳格，直到終止。第十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日2蛋白質(zhì)合成中使用的RNA

概述2.1mRNA2.2tRNA2.3rRNA第二十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日mRNA：蛋白質(zhì)的DNA序列信息的中間體。tRNA：運(yùn)送特定氨基酸到核糖體上合成蛋白質(zhì)。rRNA：核糖體的組成元件。概述第二十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日ProteinsynthesisusesthreetypesofRNA5`3`第二十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

2.1mRNA第二十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日2.1.1原核生物mRNA與真核生物mRNA結(jié)構(gòu)比較

核糖體可以不從mRNA上解離連續(xù)合成三個(gè)蛋白質(zhì)EukaryoticmRNAProkaryoticmRNA第二十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日2.1.2原核生物mRNA與真核生物mRNA生命周期比較

第二十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日2)ThelifecycleofEukaryoticmRNAmessengerRNA:expressionofmRNAinanimalcellsrequirestranscription,modification,processing,nucleo-cytoplasmictransport,andtranslation.EukaryoticmRNAismodifiedandexported第二十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日2.2tRNA2.2.1tRNA的基本結(jié)構(gòu)第二十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日tRNA折疊為緊湊的L型三級(jí)結(jié)構(gòu)。第二十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日tRNAisanadaptor2.2.2tRNA的生物學(xué)功能第二十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日tRNA特異性只取決于反密碼子,與攜帶的氨基酸無關(guān)P111第三十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

2.2.3tRNA的分類（1）起始tRNA和延伸tRNA：一類能特異識(shí)別mRNA模板上起始密碼子的tRNA叫起始tRNA；其它tRNA稱為延伸tRNA。（2）同工tRNA:代表相同氨基酸的tRNA稱同工tRNA。（3）校正tRNA：通過tRNA中反密碼子改變來校正密碼子突變，使其在突變位點(diǎn)引入正確氨基酸。無義突變(nonsensemutation):指DNA上任何代表氨基酸的密碼子變?yōu)榻K止密碼子的改變。

錯(cuò)義突變(missensemutation):

指DNA分子中的核苷酸置換后改變了mRNA上遺傳密碼，從而導(dǎo)致合成的多肽鏈中一個(gè)氨基酸被另一氨基酸所取代的改變。

第三十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日3.1核糖體的基本結(jié)構(gòu)3.2核糖體在細(xì)胞中的占有比例3.3核糖體的生物學(xué)功能3核糖體第三十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日/80S/40S/60S3.1核糖體的基本結(jié)構(gòu)第三十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日SizecomparisonsshowthattheribosomeislargeenoughtobindtRNAsandmRNA.第三十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Ribosomesarelargeribo-nucleoproteinparticlesthatcontainmoreRNAthanproteinanddissociateintolargeandsmallsubunits.第三十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日細(xì)胞器核糖體：與胞質(zhì)中的存在明顯差異，并具不同形式。有時(shí)與細(xì)菌核糖體大小相當(dāng)（70%rRNA），有時(shí)僅60S（<30%rRNA）核糖體存在于每個(gè)進(jìn)行蛋白質(zhì)合成的細(xì)胞中。雖然在不同生物內(nèi)其大小有別，但組織結(jié)構(gòu)基本相同，而且執(zhí)行的功能也完全相同。NOTE：第三十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

3.2核糖體在細(xì)胞中的占有比例第三十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日3.3核糖體的生物學(xué)功能第三十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第三十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日①mRNA結(jié)合部位；②結(jié)合AA-tRNA部位（A位）；③結(jié)合肽基tRNA部位（P位）；④空載tRNA移出部位（E位）；⑤形成肽鍵的部位。此外，還有用于起始和延伸的各種蛋白質(zhì)因子結(jié)合部位。

核糖體發(fā)揮生物學(xué)功能的5個(gè)基本部位第四十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日大小亞基的生物學(xué)功能小亞基：通過密碼子與反密碼子的配對(duì)，識(shí)別并結(jié)合模板mRNA，蛋白質(zhì)合成中A位、P位、E位的一部分等。大亞基：

結(jié)合多肽鏈，催化肽鍵形成、蛋白質(zhì)合成中A位、P位、E位的一部分等。第四十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Ala（A）Val（V）Leu（L）Ile（I）Pro（P）Met（M）His（H）Gly（G）Ser（S）Thr（T）Cys（C）Phe（F）Trp（W）Asp（D）Glu（E）Lys（K）Gln（Q）

Arg（R）Tyr（Y）

Asn（N）4蛋白質(zhì)合成中使用的20種氨基酸第四十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5蛋白質(zhì)合成的生物學(xué)機(jī)制5.1氨基酸活化5.2基本過程5.3蛋白質(zhì)合成起始5.4蛋白質(zhì)合成延伸5.5蛋白質(zhì)合成終止第四十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.1氨基酸活化5.1.1氨酰-tRNA合成酶的生物學(xué)功能5.1.2氨酰-tRNA合成酶引入的兩種錯(cuò)誤第四十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.1.1氨酰-tRNA合成酶的生物學(xué)功能總反應(yīng)：

aminoacyl-tRNAsynthetaseAA+tRNA+ATP→AA-tRNA+AMP+PPi

實(shí)際反應(yīng)：第一步：AA+ATP+E→E-AA-AMP+PPi第二步：E-AA-AMP+tRNA→AA-tRNA+E+AMP

AA:aminoacid;AA-tRNA:aminoacyl-tRNA

E:

aminoacyl-tRNAsynthetase第四十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Anaminoacyl-tRNAsynthetasechargestRNAwithanaminoacidThechargingreactionusesATP第四十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日它可將tRNA和氨基酸進(jìn)行分類。每一種氨酰-tRNA合成酶識(shí)別一種氨基酸和所有能裝載該氨基酸的tRNA。關(guān)于氨酰-tRNA合成酶第四十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日◆蛋白質(zhì)合成真實(shí)性主要決定于：

tRNA能否把正確的氨基酸放到新生多肽鏈的正確位置?！舭滨?tRNA合成酶會(huì)引入兩種錯(cuò)誤：一種是將錯(cuò)誤的氨基酸加在正確的tRNA上；另一種是將正確的氨基酸加在錯(cuò)誤的tRNA上。前者現(xiàn)錯(cuò)的可能性更大。5.1.2氨酰-tRNA合成酶引入的兩種錯(cuò)誤第四十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Errorratesdifferateachstageofgeneexpression第四十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.2蛋白質(zhì)合成的基本過程5.2.1tRNA和mRNA的行進(jìn)路線5.2.2核糖體活性部位5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段5.2.4蛋白質(zhì)合成中核糖體循環(huán)第五十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.2.1tRNA和mRNA的行進(jìn)路線第五十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.2.2核糖體活性部位核糖體有三個(gè)tRNA結(jié)合位點(diǎn)：

氨酰-tRNA進(jìn)入A位（除用于起始的那個(gè)）肽酰-tRNA和起始氨酰-tRNA進(jìn)入P位去氨酰-tRNA通過E位脫出肽鏈從P位肽酰-tRNA上轉(zhuǎn)移到A位氨酰-tRNA上，這樣一個(gè)氨基酸就被加到肽鏈上。第五十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介Initiation30SsubunitonmRNAbindingsiteisjoinedby50Ssubunitandaminoacyl-tRNAbindsElongationRibosomemovesalongmRNA，extendingproteinbytransferfrompeptidyl-tRNAtoaminoacyl-tRNATerminationPolypeptidechainisreleasedfromtRNA,andribosomedissociatesfrommRNA5.2.3蛋白質(zhì)合成的三個(gè)階段簡(jiǎn)介第五十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.2.4蛋白質(zhì)合成中核糖體循環(huán)第五十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

I：游離核糖體可解離為不同亞基；II：合成起始并非完整核糖體所為；III：細(xì)菌核糖體以70S復(fù)合體形式延伸。核糖體循環(huán)與蛋白質(zhì)合成第五十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.3蛋白質(zhì)合成的起始5.3.1原核生物蛋白質(zhì)合成起始5.3.2真核生物蛋白質(zhì)合成起始5.3.3

原核和真核生物蛋白質(zhì)合成起始比較第五十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.3.1原核生物蛋白質(zhì)合成起始（1）起始總反應(yīng)式（2）細(xì)菌中三種重要的起始因子（3）起始反應(yīng)第一個(gè)氨基酸及第一個(gè)氨酰-tRNA（4）起始密碼子的選用（5）起始位點(diǎn)及其實(shí)驗(yàn)分析（6）多順反子mRNA的翻譯起始第五十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日(1)原核生物起始總反應(yīng)式：30S+50S+mRNA+fMet-tRNAfIF-1、IF-2、IF-3GTP[70S?mRNA?fMet-tRNAf]+GDP+Pi第五十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日(2)細(xì)菌中有三種起始因子IF-3：穩(wěn)定30S亞基；輔助30S亞基與mRNA上起始點(diǎn)特異性結(jié)合；IF-1：與30S亞基結(jié)合在A位，阻止氨酰-tRNA進(jìn)入；阻止30S與50S亞基結(jié)合。IF-2：結(jié)合特定起始因子tRNA，控制它進(jìn)入核糖體；有核糖體依賴GTP酶活性；Initiationrequiresfactorsandfreesubunits第五十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第六十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日在細(xì)菌和真核生物細(xì)胞器中：起始氨基酸是甲酰甲硫氨酸，與小亞基結(jié)合的是氨甲酰甲硫氨酰-tRNA(N-formyl-methionyl-tRNA，fMet-tRNAfMet或fMet-tRNAf)，由兩步反應(yīng)合成：第一步：Met+tRNAfMet+ATP→Met-tRNAfMet+AMP+PPi

第二步：甲?；D(zhuǎn)移酶N10-甲酰四氫葉酸+Met-tRNAfMet→四氫葉酸+fMet-tRNAfMet（3）起始反應(yīng)的第一個(gè)氨基酸及第一個(gè)氨酰-tRNA第六十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日甲酰基轉(zhuǎn)移酶第六十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日fMet-tRNAf結(jié)構(gòu)特征第六十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日fMet-tRNAf與30S-mRNA復(fù)合體結(jié)合需IF-2參與。50S亞基結(jié)合后，GTP能量被釋放，所有IF都被釋放。Initiationiscontrolledbythreefactors第六十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日30Ssubunitsinitiate；ribosomesenongate第六十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日(4)起始遺傳密碼的選用所有蛋白質(zhì)合成由同一氨基酸-甲硫氨酸開始。多肽合成起始信號(hào)是一個(gè)ORF開始的獨(dú)特密碼子。常為AUG。但細(xì)菌中也可GUG和UUG。三種密碼子被識(shí)別的效率不一樣：

AUG=2GUG=4UUG第六十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日（5）起始位點(diǎn)及其實(shí)驗(yàn)分析細(xì)菌mRNA起始點(diǎn)包括AUG起始密碼子及其上游10個(gè)堿基處Shine-Dalgarno嘌呤六聚體；在起始過程中，細(xì)菌核糖體30S亞基的16SrRNA3`端有一個(gè)可與SD序列的互補(bǔ)序列。第六十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日TheAUGisprecededbyaShine-Dalgarnosequence第六十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日(6)多順反子的mRNA翻譯起始多數(shù)多順反子的翻譯獨(dú)立發(fā)生；某些細(xì)菌中，mRNA相鄰順反子翻譯直接相連，可由一個(gè)核糖體翻譯。第六十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第七十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.3.2真核生物蛋白質(zhì)合成的起始（1）小亞基查找起始位點(diǎn)（2）起始位點(diǎn)序列特點(diǎn)（3）起始復(fù)合體的形成過程第七十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日"scanning"model:Eukaryoticribosomesmigratefromthe5`endofmRNAtotheribosomebindingsite,whichincludesanAUGinitiationcodon.（1）小亞基查找起始位點(diǎn)第七十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日起始位點(diǎn)含一個(gè)典型序列:5`NNNPuNNAUGG3`，在AUG前的第三個(gè)嘌呤（G或A）以及緊跟其后的G，可十倍地影響翻譯效率。（2）起始位點(diǎn)序列特點(diǎn)第七十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

◆tRNA:起始和延伸Met-tRNA間區(qū)別僅在于tRNA本身。Met-tRNAi用于起始而Met-tRNAm用于延伸。

◆起始因子:真核比原核細(xì)胞擁有更多起始因子，它們?cè)谄鹗既^程中發(fā)揮作用。（3）起始復(fù)合體的形成過程第七十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日EukaryoticinitiationusesseveralcomplexesTheyactatallstagesoftheprocess,including5stages:1)formingacomplexwithMet-tRNAi

2)forminganinitiationcomplexwiththe5`endofmRNA3)bindingthemRNA-factorcomplextotheMet-tRNAi-factorcomplex4)enablingtheribosometoscanmRNAfromthe5`endtothefirstAUG5)mediatingjoiningofthe60Ssubunit.第七十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第七十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第七十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日poly(A)stimulatestheformationofaninitiationcomplexatthe5end.第七十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日第七十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.3.3原核生物和真核生物蛋白質(zhì)合成起始異同點(diǎn)分析

內(nèi)容原核生物真核生物核糖體完整70S80S亞基50S，30S60S，40S起始tRNAfMet-tRNAfMetMet-tRNAiMet起始因子3種至少7種起始復(fù)合物的生成順序1）30S?mRNA1)40S?Met-tRNAiMet2）30S?mRNA?fMet-tRNAfMet2)40S?Met-tRNAiMet?mRNA3）70S?mRNA?fMet-tRNAfMet3）80S?mRNA?Met-tRNAiMet第八十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.4肽鏈的延伸5.4.1氨酰-tRNA進(jìn)入A位5.4.2肽鏈從P位轉(zhuǎn)移到A位的氨酰-tRNA上5.4.3易位使核糖體相對(duì)于mRNA移動(dòng)5.4.4

不同延伸因子選擇性結(jié)合到核糖體上使肽鏈不斷延伸第八十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.4.1氨酰-tRNA進(jìn)入A位除起始子以外的氨酰-tRNA均進(jìn)入核糖體A位，并受延伸因子（細(xì)菌為EF-Tu）的催化(前提是P位有肽酰-tRNA占據(jù))。第八十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日EF-TurecyclesbetweenGTP-boundandGDP-boundformsactiveinactive第八十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日每個(gè)細(xì)菌約有70000個(gè)EF-Tu分子（約占總蛋白5%），與氨酰-tRNA分子數(shù)接近，意味著大多數(shù)氨酰-tRNA存在于三元復(fù)合體中。每個(gè)細(xì)胞約只有10000個(gè)EF-Ts分子。

EF-Tu*EF-Ts復(fù)合體僅是瞬時(shí)存在，EF-Tu可迅速轉(zhuǎn)變?yōu)镚TP結(jié)合形式，再形成三元復(fù)合體。第八十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

5.4.2肽鏈從P位轉(zhuǎn)移到A位的氨酰-tRNA上新生肽鏈從P位的肽酰-tRNA轉(zhuǎn)移至A位的氨酰-tRNA，這導(dǎo)致肽鏈延伸；負(fù)責(zé)肽鍵形成的催化酶稱肽基轉(zhuǎn)移酶（peptidyltransferase)，50S亞基具肽基轉(zhuǎn)移酶的活性；肽鍵形成使P位產(chǎn)生脫?；膖RNA，A位產(chǎn)生肽酰-tRNA。第八十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Peptidebondformationtakesplacebyreactionbetweenthepolypeptideofpeptidyl-tRNAinthePsiteandtheaminoacidofaminoacyl-tRNAintheAsite.Nascentpolypeptideistransferredtoaa-tRNA第八十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

5.4.3易位使核糖體相對(duì)于mRNA移動(dòng)核糖體易位使mRNA在核糖體上移動(dòng)3堿基長(zhǎng)度。易位使脫氨酰的tRNA進(jìn)入E位，肽酰-tRNA進(jìn)入P位，A位空出。雜合狀態(tài)模型提出移位分兩步進(jìn)行：50S亞基相對(duì)于30S亞基移動(dòng)，然后30S亞基移動(dòng)使核糖體構(gòu)象復(fù)原。第八十七頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Thehybridstatetranslocationmodel第八十八頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日tRNAmovesthrough3ribosomesites第八十九頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日

5.4.4不同延伸因子選擇性結(jié)合到核糖體上使肽鏈不斷延伸▲易位需要EF-G，其結(jié)構(gòu)類似于氨酰-tRNA*EF-TU*GTP復(fù)合體，該因子為細(xì)胞的主要組分，一個(gè)核糖體就約有1個(gè)分子?！鳨F-Tu及EF-G與核糖體的結(jié)合是相互排斥的?！孜恍枰狦TP水解，這引起EF-G的變化，繼而又引起核糖體結(jié)構(gòu)的變化。第九十頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日Thestructureoftheternarycomplexofaminoacyl-tRNA·EF-Tu·GTP(left)resemblesthestructureofEF-G(right).StructurallyconserveddomainsofEF-TuandEF-Gareinredandgreen;thetRNAandthedomainresemblingitinEF-Gareinpurple.第九十一頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日EFfactorshavealternatinginteractionsBindingoffactorsEF-TuandEF-Galternatesasribosomesacceptnewaminoacyl-tRNA,formpeptidebonds,andtranslocate.黃色霉素梭鏈孢酸第九十二頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.5蛋白質(zhì)合成的終止5.5.1三種終止密碼子5.5.2釋放因子5.5.3肽鏈合成終止反應(yīng)過程第九十三頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.5.1三種終止密碼子三個(gè)終止密碼子（terminationcodon，stopcodon)UAA、UAG和UGA終止蛋白質(zhì)合成；UAA是最常用的終止密碼子。UGA比UAG使用頻率高一點(diǎn)，但UGA出錯(cuò)的可能性更大一點(diǎn)。第九十四頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日5.5.2釋放因子終止密碼子是被蛋白質(zhì)釋放因子(releasefactor，RF)而不是氨酰-tRNA所識(shí)別；第九十五頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日（1）原核生物的RF

I型釋放因子結(jié)構(gòu)類似于氨酰-tRNA*EF-Tu和EF-G；

I型釋放因子（RF1識(shí)別UAA和UAG，RF2識(shí)別UGA和UAA），它們?cè)贏位發(fā)揮作用（此時(shí)P位要有肽酰-tRNA），并水解肽酰-tRNA上的鍵；釋放因子約占核糖體的1/10

II型釋放因子(RF3)依賴GTP發(fā)揮作用，它協(xié)助I型因子；第九十六頁(yè)，共一百零八頁(yè)，編輯于2023年，星期日SeveralfactorshavesimilarshapesMolecularmimicryenablestheelongationfactorTu-tRNAcomplex