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第五章?lián)p傷與修復演示文稿本文檔共58頁;當前第1頁;編輯于星期三\12點30分優(yōu)選第五章?lián)p傷與修復本文檔共58頁;當前第2頁;編輯于星期三\12點30分為什么要研究DNA損傷應答?(DNADamageResponse,DDR)本文檔共58頁;當前第3頁;編輯于星期三\12點30分DNA損傷類型和數(shù)量TYPEOFDAMAGEevents/cell/day%oftotaldailydamageSingle-strandbreak120,00050.9N7-MethylGuanine84,00035.6Depurination24,00010.2OxidizedDNA2,8801.2Depyrimidation1,3200.5Cytosinedeamination3600.2Double-strandbreaks90.01本文檔共58頁;當前第4頁;編輯于星期三\12點30分DNA損傷與疾病本文檔共58頁;當前第5頁;編輯于星期三\12點30分第一節(jié)DNA損傷何謂DNA損傷?在內源或外源因素作用下,DNA結構發(fā)生的任何改變都稱為DNA損傷DNA損傷的后果:一、DNA失去作為復制和轉錄模板的功能,導致細胞死亡;二、DNA的結構發(fā)生永久性改變本文檔共58頁;當前第6頁;編輯于星期三\12點30分一、DNA損傷的類型堿基的更替、缺失、插入、鏈的斷裂、鏈內或鏈間的交聯(lián)、DNA重排等。天然的線性染色體末端—端粒?本文檔共58頁;當前第7頁;編輯于星期三\12點30分二、損傷因素內源因素:染色體復制、活性氧等外源因素:紫外線、電離輻射、堿基類似物、修飾劑、烷化劑、化學誘變劑等。本文檔共58頁;當前第8頁;編輯于星期三\12點30分三、突變的類型1.點突變:是指DNA分子中一個堿基的改變。包括轉換(嘌呤堿基→嘌呤堿基)和顛換(嘌呤堿基→嘧啶堿基或嘧啶堿基→嘌呤堿基)2.插入突變:是指DNA分子中插入多余的堿基。3.缺失突變:是指DNA分子中堿基的丟失。插入突變和缺失突變可引起移碼突變。4.三聯(lián)體擴增:脆性X染色體綜合征是由于FMR-1基因中CGG重復突變5.DNA片段重組本文檔共58頁;當前第9頁;編輯于星期三\12點30分四、突變的后果1.中性突變基因突變(特別是點突變),不一定就是有害突變。突變是生物進化和分化的分子基礎;只有基因型改變的突變,即堿基組成改變,但蛋白質分子中氨基酸未改變。如有些點突變發(fā)生在同義密碼子的第二或第三位堿基,或發(fā)生在基因的內含子上。因此突變不一定就是損傷。Pointmutation---GCG------CGC------GCC------CGG---精氨酸精氨酸本文檔共58頁;當前第10頁;編輯于星期三\12點30分2.有害突變嚴重的突變或突變的長期積累,導致DNA復制障礙或不能進行,或基因表達異常,引起DNA損傷導致疾病。因此突變是某些疾病的分子基礎本文檔共58頁;當前第11頁;編輯于星期三\12點30分鐮狀紅細胞貧血-點突變本文檔共58頁;當前第12頁;編輯于星期三\12點30分第二節(jié)DNA損傷的機制一、自發(fā)性損傷1.DNA復制過程中的堿基錯配(錯誤率為10-9,修復后降為10-10
)本文檔共58頁;當前第13頁;編輯于星期三\12點30分2.三聯(lián)體擴增(即三核苷酸重復)是指三個不同的堿基為一個單位重復排列而形成的DNA序列。理論上,基因組中應該含有10類60種三核苷重復DNA序列。如CAG\CTG、GAA\TTC等三核苷酸重復序列。其中,CAG\CTG、GAA\TTC、CGG\CCG等三核苷酸重復序列序列與20種以上的神經-肌肉系統(tǒng)退行性疾病的發(fā)病有關。這些三核苷重復序列可以出現(xiàn)不明原因的擴增,從而累及所在或周圍基因的正常表達或正常的生物活性。本文檔共58頁;當前第14頁;編輯于星期三\12點30分19q13.2~19q13.3本文檔共58頁;當前第15頁;編輯于星期三\12點30分果蠅FMRP調節(jié)DNA損傷導致的細胞周期檢驗點和凋亡fmr突變導致DNA損傷敏感FMRP工作模式Liuetal.HumanMolecularGenetics.2012本文檔共58頁;當前第16頁;編輯于星期三\12點30分本文檔共58頁;當前第17頁;編輯于星期三\12點30分3.堿基的烯醇式-酮式或氨基-亞氨基異構體互變引起堿基錯配本文檔共58頁;當前第18頁;編輯于星期三\12點30分4.自發(fā)脫氨基C→U引起U→A、A→I引起I→C、G→X(無配對堿基)本文檔共58頁;當前第19頁;編輯于星期三\12點30分5.堿基丟失引起突變3′5′3′5′本文檔共58頁;當前第20頁;編輯于星期三\12點30分二、環(huán)境因素誘發(fā)DNA損傷分子機制(一)紫外線引起DNA損傷的機制當DNA暴露與260nm的紫外線時,DNA鏈相鄰的嘧啶堿基可形成5,6雙鍵,產生嘧啶二聚體—TT、TC或CC,最常見為TT二聚體。人皮膚細胞受紫外線照射形成二聚體的可達5×104/細胞/小時。此外,紫外線還可引起DNA鏈間交聯(lián)、DNA與蛋白質交聯(lián)、甚至斷鏈。本文檔共58頁;當前第21頁;編輯于星期三\12點30分(二)電離輻射引起DNA損傷的機制1.可導致DNA堿基改變電離輻射可產生OH自由基,引起DNA鏈上堿基氧化修飾(如T轉變?yōu)?-羥甲基尿嘧啶)、堿基開環(huán)(如腺嘌呤7,8-雙鍵斷開)和脫落。嘧啶與嘌呤更敏感。2.可導致DNA斷鏈.OH自由基破壞脫氧核糖脫落或斷裂3′,5′-磷酸二酯鍵使DNA斷鏈3.可導致DNA鏈交聯(lián)電離輻射可使同一條DNA鏈內或兩條DNA鏈之間或DNA與蛋白質間發(fā)生交聯(lián)。本文檔共58頁;當前第22頁;編輯于星期三\12點30分三、烷化劑引起DNA損傷的機制烷化劑是親電子化合物,分子中帶有活性烷基?;钚酝榛赊D移到DNA的堿基或磷酸基上,使之烷基化。鳥嘌呤最易烷基化。烷化劑包括芥子氣、硫酸二乙酯、甲基-亞硝基胍、甲基甲烷碘酸、氮芥、硫芥、環(huán)磷酰氨、苯丁酸氮芥、絲裂霉素等1.可導致堿基錯配烷基常加到堿基的N(N7烷基化鳥嘌呤G或N3烷基化腺嘌呤A)或O原子上,使烷基化的G與T配對。2.可導致堿基脫落烷基化鳥嘌呤的糖苷鍵不穩(wěn)定而斷裂,使DNA鏈產生無堿基位點,復制時可插入任何堿基。2.可導致DNA斷鏈磷酸基上O的烷基化,使3′,5′-磷酸二酯鍵斷裂4.可導致DNA鏈的交聯(lián)本文檔共58頁;當前第23頁;編輯于星期三\12點30分四、堿基類似物引起DNA損傷的機制堿基類似物在結構上與堿基相似,它們進入體內后,在DNA復制過程中,可替代堿基摻入而干擾DNA合成,引起堿基錯配。堿基類似物包括5-溴尿嘧啶(5-BU)、5-氟尿嘧啶(5-FU)、2-氨基腺嘌呤等。本文檔共58頁;當前第24頁;編輯于星期三\12點30分本文檔共58頁;當前第25頁;編輯于星期三\12點30分五、化學修飾劑和化學誘變劑引起DNA損傷的機制化學修飾劑能專一地修飾DNA分子的堿基導致堿基錯配如亞硝酸鹽(使C氧化脫氨基變成U,導致G-C轉變?yōu)锳-T,或使A氧化脫氨基變成I,導致A-T轉變?yōu)镚-C)、羥氨(使T脫甲基變?yōu)镃,導致A-T轉變?yōu)镃-G)致癌物黃曲霉素B也是導致序列的變化。丫啶類化合物、溴化乙啶等也引起DNA損傷。本文檔共58頁;當前第26頁;編輯于星期三\12點30分本文檔共58頁;當前第27頁;編輯于星期三\12點30分第三節(jié)損傷DNA的修復在一定條件下,損傷的DNA分子恢復正常的過程。修復方式有:直接修復、切除修復、重組修復、跨
損傷修復和SOS修復本文檔共58頁;當前第28頁;編輯于星期三\12點30分一)、光修復光復活酶(即光裂合酶)直接修復嘧啶二聚體(見于細菌和低等真核生物)光復活酶300~500nmUV照射一、直接修復本文檔共58頁;當前第29頁;編輯于星期三\12點30分二)、DNA連接酶直接修復DNA斷裂口本文檔共58頁;當前第30頁;編輯于星期三\12點30分三)、烷基化堿基的直接修復例如,E.Coli的Ada酶和人類的O6甲基鳥嘌呤-DNA甲基轉移酶(MGMT)可將烷基不可逆地轉移到自身而完成修復,本身失活(自殺修復)。本文檔共58頁;當前第31頁;編輯于星期三\12點30分四)、DNA嘌呤插入酶直接修復無嘌呤位點(APsite)本文檔共58頁;當前第32頁;編輯于星期三\12點30分二、切除修復—最普遍和常見的修復方式切除修復需要DNA特異內切酶、核酸外切酶、糖苷酶、DNA聚合酶和DNA連接酶的參與。包括單個核苷酸切除和核苷酸片段切除修復。切除修復屬于復制前修復本文檔共58頁;當前第33頁;編輯于星期三\12點30分ACUTCATGGAGTACG*TCATGGAGT糖苷酶ACG*TCATGGAGTAP內切酶和外切酶ACCTCATGGAGTDNA聚合酶DNA連接酶1.單個核苷酸切除修復本文檔共58頁;當前第34頁;編輯于星期三\12點30分2.核苷酸片段切除修復
--UvrABC修復系統(tǒng)具有ATP酶活性的UvrA
與UvrB結合,并識別
與結合DNA損傷部位。
具有內切酶作用的UvrC
置換出UvrA,與UvrB-DNA結合。UvrD(DNA解旋酶Ⅱ)釋放
切
下的損傷片段。DNA聚合酶Ⅰ填補缺
口,并由DNA連接酶
連接。本文檔共58頁;當前第35頁;編輯于星期三\12點30分人類著色性干皮?。▁erodermapigmentosis,XP)常染色體隱性遺傳。皮膚對日光,尤其是對紫外線敏感。主要臨床表現(xiàn)是皮膚雀斑樣色素沉著,毛細血管擴張,局限性萎縮,疣狀增生,淺表潰瘍,最后可癌變。這種病人的XP類基因(XPA、XPB、XPC、XPF、XPG)有缺陷,導致DNA損傷后的修復障礙。本文檔共58頁;當前第36頁;編輯于星期三\12點30分3.錯配修復當DNA復制時,摻入了錯誤的堿基,在校讀時未被去除,可經由該通路的酶偵測出來,將其中一股切出,并加以修補。本文檔共58頁;當前第37頁;編輯于星期三\12點30分三、重組修復--復制后修復本文檔共58頁;當前第38頁;編輯于星期三\12點30分本文檔共58頁;當前第39頁;編輯于星期三\12點30分四、跨損傷DNA合成修復跨損傷DNA合成(TranslesionDNASynthesis,TLS是近年來新發(fā)現(xiàn)的參與DNA修復的又一機制。TLS包括無錯損傷旁路(error-freelesionbypass)及易錯損傷旁路(error-pronelesionbypass);易錯損傷旁路可導致DNA損傷誘導的突變。
跨損傷DNA合成,這是一種利用損傷核苷酸為模板,通過跨損傷DNA聚合酶使堿基摻入到復制終止處進行DNA合成,從而延長DNA的修復。
本文檔共58頁;當前第40頁;編輯于星期三\12點30分五、SOS修復—誘導修復SOS修復是細胞DNA受到廣泛損傷而難以復制的緊急情況下,細胞為求生存而出現(xiàn)的一種應急反應。此時,細胞需調動其所有的修復系統(tǒng)進行修復。20世紀50年代,Weigle首次在E.coli中發(fā)現(xiàn)SOS修復系統(tǒng)。1973年,Raelman首次稱為SOS修復。SOS反應誘導的修復系統(tǒng)包括避免差錯修復(光修復、切除修復和重組修復)和傾向差錯修復。誘導產生缺乏校正功能的DNA聚合酶,一方面進行修復,同時也容易造成堿基錯配的機會而產生新的損傷。但總的結果是細胞可以生存下去。本文檔共58頁;當前第41頁;編輯于星期三\12點30分SOS反應是由RecA蛋白和LexA阻遏物蛋白相互作用引起的,LexA(22kD)阻遏物蛋白是許多基因的阻遏物。RecA蛋白是SOS反應的最初發(fā)動因子。在ATP存在時,RecA被損傷的DNA激活而表現(xiàn)出蛋白水解酶活力,水解LexA阻遏物蛋白,使與修復有關的基因開放,表達產物即可對損傷的DNA進行修復。本文檔共58頁;當前第42頁;編輯于星期三\12點30分本文檔共58頁;當前第43頁;編輯于星期三\12點30分DNA損傷修復缺陷與疾病本文檔共58頁;當前第44頁;編輯于星期三\12點30分本文檔共58頁;當前第45頁;編輯于星期三\12點30分DNA損傷應答的若干關鍵因子
與損傷的時間和空間關系本文檔共58頁;當前第46頁;編輯于星期三\12點30分Checkpoint本文檔共58頁;當前第47頁;編輯于星期三\12點30分p53:“GuardianofGenome”腫瘤抑制因子最初鑒定為癌基因獲得性功能“Gainoffunction”超過50%的腫瘤中突變或異常本文檔共58頁;當前第48頁;編輯于星期三\12點30分主要功能細胞周期檢驗點(checkpoint)凋亡本文檔共58頁;當前第49頁;編輯于星期三\12點30分p53突變導致不同的轉錄譜Kollareddyetal.NATURECOMMUNICATIONS|Published12Jun2015|6:7389本文檔共58頁;當前第50頁;編輯于星期三\12點30分什么是端粒(telomere)天然的染色體末端染色體末端由DNA和蛋白質共同構成的結構來源于希臘語telos=endmeros=part本文檔共58頁;當前第51頁;編輯于星期三\12點30分保護端粒的“T-loop”結構本文檔共58頁;當前第52頁;編輯于星期三\12點30分端粒的功能維持染色體末端保護染色體不發(fā)生融合、降解等本文檔共58頁;當前第53頁;編輯于星期三\12點30分熒光原位雜交檢測端粒
(FluorescenceInSituHybridization,FISH)telomeresred
centromeregreen本文檔共58頁;當前第54頁;編輯于星期三\12點30分端粒長
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