腫瘤的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)資源

腫瘤研究的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)資源一篇論文的題目ZhuF,ZykovaTA,KangBS,WangZ,EbelingMC,AbeY,MaWY,BodeAM,DongZ.BidirectionalsignalstransducedbyTOPK-ERKinteractionincreasetumorigenesisofHCT116colorectalcancercells.Gastroenterology.2007;133(1):219-31.主要內(nèi)容NCBI的相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)資源腫瘤學(xué)和血液學(xué)的細(xì)胞遺傳學(xué)ExPASy的數(shù)據(jù)庫(kù)資源和工具NCBI的相關(guān)資源NationalCenterforBiotechnologyInformationhttp://Genesanddisease單基因遺傳病的站點(diǎn)介紹多個(gè)系統(tǒng)的遺傳病，可下載PDF文件。圖示遺傳病相關(guān)基因在染色體的定位與相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)相互鏈接Genesanddisease頁(yè)面染色體的圖譜SK鐘Y—要Sp座ec值tr豪al螞K騰ar國(guó)yo梅ty臣pi塘ng多色檢標(biāo)記謹(jǐn)?shù)奶礁樑c鐘染色伸體雜臥交M-如FI稅SH釋—M材ul彎ti唉pl財(cái)ex乞F子lu愛(ài)or戀es荷ce觸nc仰e跟In踏S置it粱u密Hy成br誓id警iz錯(cuò)at點(diǎn)io賢nCG幫H—熊Co旺mp殿ar止at譜iv摟e賞Ge幣no朗mi棚c屢Hy徐br任id叉iz艦at這io鳴n腫瘤夫和對(duì)贈(zèng)照細(xì)跡胞的仗基因栽組D農(nóng)NA謙標(biāo)記結(jié)不同態(tài)顏色緩熒光其探針倆等量?jī)H混合陶后分煩別與竭腫瘤無(wú)和對(duì)羽照細(xì)寬胞的例染色艙體雜仔交。SK冰Y的劉原理CG頓H的原省理CG襪H比較番工具輸入烈染色銀體片州段和附得失朱，如蛛：7[問(wèn)ga郵in霧]或纖3p交[l繞os躬s]姻.比較互工具比較羨結(jié)果CG面H圖逮示大規(guī)毀模分慮析基捧因表叨達(dá)的勝方法對(duì)某陽(yáng)一組mR鍵NA中基含因表谷達(dá)定僻量檢本測(cè)一群mR英NA中的水每一把個(gè)mR畫NA的同濁一位預(yù)置取9-蠶10撇bp的一絞段序姿列，樣（從基統(tǒng)計(jì)溫學(xué)上鹿說(shuō)這左樣的己序列鏟可以清代表95贊%的人掠類基孩因）扎，每誓一種9-這10翠bp的序許列的欠拷貝哈數(shù)則劍代表墓基因蒜表達(dá)刺的拷含貝數(shù)門，也欄就可蜜以說(shuō)序明基展因表左達(dá)活窮性的擦高低。方法RN榆A反奮轉(zhuǎn)錄簡(jiǎn)為c胸DN紛A，同姥時(shí)用卷生物搞素標(biāo)授記cD竿NA末端隨后若用一卸種限童制性自內(nèi)切螺酶（Nl和aI袍II(C走AT培G)）切周割cD挺NA分離寇酶切芬位點(diǎn)3‘端的葛序列另一恢種酶桿再切殘割cD嗓NA片段趟，去蜘除帶分生物形素的3’端用PC炸R擴(kuò)增喝每一甚個(gè)標(biāo)型簽片誰(shuí)段，掌將30煙-5則0個(gè)不偷同的智標(biāo)簽含片段狡連成塑一個(gè)商單一笨的DN速A分子最后戴克隆秧并測(cè)便序這狼些分閥子酶切都位點(diǎn)3'端的孩序列吊出現(xiàn)妄的拷才貝數(shù)炒就代密表了問(wèn)基因脫表達(dá)盼活性錯(cuò)的高士低流程店圖選擇沃細(xì)胞磁珠摔分離RN格A并合路成cD校NA錨定綁內(nèi)切癥酶（Nl議aI謠II）酶南切Nl確aI諒II蓄3’端序更列為護(hù)標(biāo)簽縫，再辱用Bs仔mF療1酶切聚后釋蛛放標(biāo)持簽將標(biāo)豎簽相栗互連戶接并殿連入狡質(zhì)粒細(xì)載體測(cè)序年并計(jì)逮算標(biāo)旺簽的鳥拷貝書數(shù)計(jì)算峰機(jī)分鉤析查詢胞方式..叫.b彼y的ta羽g..耽.b虧y家se撞qu壓en澆ce..療.b眨y賢li剖br姜ar揚(yáng)y..樸.b說(shuō)y事ge否ne狡n蠢am扶e輸入名序列先查網(wǎng)詢序蠅列中廣的T法ag根據(jù)輪Ta城g來(lái)腸查詢伍在S性AG白E文殺庫(kù)中壤出現(xiàn)芳的頻璃率輸入濱Ge紐奉nB遇an期k號(hào)繪或序但列進(jìn)悔行查普詢查詢梅結(jié)果查詢比結(jié)果Ca黑nc本er棒G豬en漏om右e蹄An蹄at據(jù)om授y傍Pr算oj概ec俊t俊(皮ht屋tp當(dāng):/貝//傭)由Na綿ti碼on胡al反C泄an前ce突r菊In貪st染it戰(zhàn)ut敵e（N醋CI離）管增理目的衰是研沿究腫歪瘤細(xì)逼胞的落分子線改變CG翠AP辜主頁(yè)Ge距ne文s每個(gè)瞧基因——崖——一個(gè)Ge仔ne猴i適nf闖o頁(yè)面Un旬iG衛(wèi)en降e、Lo醉cu似sL恭in巖k、OM浮IM、DT僻P頃se疲ar襖ch、cD車NA抓L袍ib僑ra熔ri王es、Cl肅us尸te潔r懇As層se隊(duì)mb趕li安es、和SN罰Ps等數(shù)遼據(jù)庫(kù)最的鏈消接細(xì)胞視遺傳割學(xué)定隊(duì)位和Mi壇te葵lm筑an斷裂騎點(diǎn)信嬌息蛋白唯相似嗚性人類辱和小哥鼠的刃同源勁組IM訓(xùn)AG忠E（In緒te喬gr枝at脆ed筐M白o(hù)l優(yōu)ec休ul既ar留A琴na斬ly融si衛(wèi)s記of涌G亂en倡om廊es牽a耍nd霸t允he尊ir姻E檢xp參re駁ss衫io倘n）協(xié)牢議來(lái)漆源的賴序列罰鏈接全長(zhǎng)MG榨C（Ma籍mm惜al方ia代n腦Ge柄ne血C研ol艦le孝ct農(nóng)io捏n）克桿隆鏈膊接Ge滅ne雪O擾nt如ol霸og兼y功能再分類Ge糾ne渣s工具約列表Ge怪ne拘f熔in堆de極r：按鵲照特拿定標(biāo)坑準(zhǔn)查伙找單饒個(gè)或棄多個(gè)免基因嘗的工舅具Ge粒ne濾O眉nt陶ol我og雕y蛙Br活ow日se報(bào)r：通兇過(guò)分盾子功淚能、冶生物鋤學(xué)過(guò)伐程和苦細(xì)胞否組分助對(duì)人爛和小趕鼠的構(gòu)基因寸分類Nu趴cl店eo財(cái)ti花de扒B蜻LA噴ST：通陜過(guò)CG麥AP界面等，查吹找給閑定核獻(xiàn)苷酸您序列漿的代迷表基柳因Li桿st門s第of膚C送an洪di王da銹te耀,老Va盜li重da茫te脆d,何a曲nd顏C坦on原fi洞rm漏ed宅S鑼NP本s：包活含單柔核苷幣酸多壓態(tài)性烘的基元因信論息CG欣AP港S調(diào)NP銷I看nd瘡ex：通載過(guò)基平因名恩稱、廁符號(hào)針和Ge散nB射an朗k序列燥號(hào)查魂找代頓表SN逐PsSN觀P塞Ge米ne棍V迅ie閉we溫r：將榆人類SN缸Ps定位晶于參濤考序勒列和MG受C序列輩，預(yù)嗎測(cè)蛋身白編榮碼的敲變化Ge擺ne倡i宗nf翅oCh凳ro悔mo呼so陸me蒸sMi覺(jué)te和lm妨an江D蔑at應(yīng)ab較as晌e小of踏C株hr終om葉os撲om鏈e翻Ab郊er喜ra典ti殊on灶s攝in湖C糟an道ce峽r（腫瘤通染色復(fù)體畸敢變數(shù)感據(jù)庫(kù)翻）Re塌cu磚rr狡en卡t胡Ch念ro類mo礦so在me凈A呈be推rr訴at羨io綁ns肺S襲ea期rc炊he柄r用來(lái)通查找液重復(fù)哲出現(xiàn)挽的染慌色體蝴畸變SN甜P5傾00絕C吉an抗ce冶r顯Da酷t(yī)a穗ba膠se用于偶查找闊SN亡P的環(huán)工具可以驚通過(guò)慮基因雅名稱饑、S神NP轎號(hào)、切染色榮體和委基因屑功能接查詢查找筋腫瘤秤重復(fù)老出現(xiàn)罩的染禽色體繩畸變Ti現(xiàn)ss膜ue閱s來(lái)源箭于組印織的素基因撐表達(dá)嶄信息Li贊br礦ar扒y據(jù)Fi做nd埋er工具山可以換幫助茅查找豬組織瞞特異末性的腸文庫(kù)場(chǎng)。Ge膨ne掌L墾ib釋ra魂ry寄S聾um冠ma傻ri害ze卻r（GL到S）：在特登定的cD貪NA文庫(kù)蔥中查嘆找所耐有基怎因。cD董NA破x鳳Pr持of縱il第er：用絹于在艙兩個(gè)cD起NA文庫(kù)希之間扮比較才基因角表達(dá)集。Di業(yè)ff懲er賣en剝ti本al康G宰en擱e吸Ex地pr她es怕si俗o(hù)n級(jí)D國(guó)is膛pl且ay鄉(xiāng)豐er（DG捕ED）：盯用于席在兩儲(chǔ)個(gè)cD諸NA文庫(kù)濁之間四比較糊基因泥表達(dá)獄的統(tǒng)見計(jì)學(xué)任差異掘。SA蜘GE匙ma拉p宅xP扎ro采fi威le窮r：xP術(shù)ro塔fi默le弦r程序間比較蕩一個(gè)cD唇NA在不貓同cD攏NA文庫(kù)誘中的英表達(dá)護(hù)情況泥。SA高GE搬ma篩p禽Vi歐rt駝ua敬l路No額rt蛋he各rn：以緞圖形瘦形式半顯示亭一個(gè)引基因委在不絞同cD向NA文庫(kù)睡中出懷現(xiàn)的狹頻率金，代囑表其過(guò)表達(dá)鬼豐度獵。cD傭NA乎x盛Pr受of燈il修erSA崗GESA循GE醫(yī)A諒na緩to合mi墓c疑Vi矮ew鐮er查詢景結(jié)果Ti值ss挎ue剝o叉nl灘y查詢沃結(jié)果SA巖GE濫的數(shù)致?lián)N揮AiPA傍TH閉WA眠YSBi把oC迎ar笑ta公司鄭信號(hào)耳轉(zhuǎn)導(dǎo)體途徑鑰圖譜KE計(jì)GG代謝驗(yàn)途徑什和信多號(hào)轉(zhuǎn)殿導(dǎo)途晃徑圖濕譜Pa河th殖wa壟y冷Se飽ar簡(jiǎn)ch嶼erCG撕AP基因愧表達(dá)偽分析知工具攀的匯異總To妻ol赴s腫瘤煙學(xué)和港血液翠學(xué)的兼細(xì)胞凈遺傳捎學(xué)ht筐tp繼:/元//收集禽了各址種在患腫瘤善中具荒有染滲色體胞異常牲的基雀因，億包括啞其基猜因名早稱、季產(chǎn)物少、在雪腫瘤陳中的豈異常株情況弓，以示及與錯(cuò)各種動(dòng)數(shù)據(jù)胳庫(kù)的序鏈接收集直了白膜血病盾、實(shí)宅體瘤螞、癌槍前病施變的蕉細(xì)胞避遺傳頃學(xué)數(shù)蜂據(jù)以染辦色體抽來(lái)分林類描鼠述各泄種腫喘瘤中露的染富色體灘異常包括南了許遍多高滲水平障的綜們述(蠻De希ep街I壁ns失ig僅ht遍)和群病例盟報(bào)告22刑號(hào)染森色體t(寨9;狡22遷)(披q3萄4;藏q1佩1)t(2;8)(p12;q24)t(8;22)(q24;q11)IGKChr2IGLChr22t(8;14)(q24;q32)MYCChr8IGHChr14Bu零rk凈it劍t污Ly服mp頂ho應(yīng)maPromoterCodingsequencesPromoterCodingsequencesPromoterCodingsequencesDeregulatedgeneCo捷ns候eq求ue擊nc否es礦o鍛f漂Ba隸la寸nc唯ed汪C魄hr興om遺os瞧om瓣e寧Re代ar瓦ra煉ng質(zhì)em灶en刑tsIG矛H,IG兩K,IG資LMY但CDe線re女gu羽la筐te警d豈tr金an阿sc芬ri隊(duì)pt笛io帶n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