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文檔簡介
第九章蛋白質(zhì)的生物合成第1頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第2頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第3頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月翻譯(translation)以mRNA為直接模板,tRNA為氨基酸運載體,核糖體為裝配場所,共同協(xié)調(diào)完成蛋白質(zhì)生物合成的過程。也就是把mRNA的堿基排列順序轉(zhuǎn)譯成多肽鏈中氨基酸的排列順序。第4頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月
主要內(nèi)容
掌握三種RNA在蛋白質(zhì)生物合成中的作用(第一節(jié))熟悉各種輔助因子的作用(第二節(jié))熟悉蛋白質(zhì)的生物合成過程(第二節(jié))第5頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第一節(jié)
RNA在蛋白質(zhì)生物合成中的重要
功能
第6頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月一、mRNAmRNA上四種堿基→蛋白質(zhì)組成20種aa堿基與氨基酸對應(yīng)關(guān)系?
3個相鄰的堿基→1個aa,有43種排列→64種密碼子—UAAUAUUAGUAC—破譯了64種密碼子第7頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月密碼子(codon)mRNA中每三個相鄰的堿基決定一個AA,這三個相鄰的堿基稱為一個密碼子或者三聯(lián)體密碼。第8頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第9頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第10頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第11頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月遺傳密碼子的主要特點連續(xù)性:密碼子是不重疊、無標(biāo)點的、不間斷。第12頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月Insertionordeletion
Frameshift
Frameshiftmutation第13頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月2.簡并性:degeneracy
幾個不同密碼子表示同一種氨基酸。
61種密碼子→20種aa,同種aa可由2-6種密碼子編碼。同義密碼子(synonymouscodon)
編碼同一個氨基酸的一組密碼子稱為第14頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第15頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月3.擺動性:密碼子與反密碼子配對時出現(xiàn)不遵從堿基配對規(guī)律的情況。第16頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月tRNA反密碼子堿基IUG(第一位)mRNA密碼子堿基
A,C,UA,GC,U
(第三位)
密碼子與反密碼子配對的搖擺現(xiàn)象第17頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第18頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月密碼的簡并性有什么生物學(xué)意義第19頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月4.通用性:
病毒、原核細(xì)胞、真核細(xì)胞都用同一套遺傳密碼子表。終止密碼子UAA、UAG、UGA,起始密碼子AUG第20頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月二、tRNA和氨基酰-tRNAtRNA的結(jié)構(gòu)tRNA應(yīng)具備的功能氨基酸活化過程氨基酰-tRNA的表示方法第21頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第22頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第23頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月tRNA須具備的功能:
(1)與氨基酸結(jié)合(3′末端)
(2)識別特異的氨基酰-tRNA合成酶(3)識別mRNA鏈上密碼子
(4)與核糖體結(jié)合
根據(jù)tRNA在合成蛋白質(zhì)中的作用,試推想tRNA須具備什么功能
第24頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月D環(huán)可被氨酰tRNA酶識別TψC環(huán)可與核糖體結(jié)合活化的CCA末端可連接AA反密碼環(huán)含反密碼子第25頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月同功受體tRNA:Isoacceptor
能夠運輸同一種氨基酸的多種tRNA分子稱為氨基酸的同功受體tRNA第26頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月氨基酸的活化和氨酰tRNA生成一個氨基酸的羧基與另一個氨基酸的氨基失水縮合成為肽鍵,從熱力學(xué)上是極端困難的。但是若將氨基酸轉(zhuǎn)移到tRNA分子上,則能使氨基酸的羧基活化,就能較容易地與氨基酸失水縮合了。第27頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月1.氨基酸的活化
AA+ATP+酶→[AA?AMP?酶]+ppi2.氨酰tRNA的形成
[AA?AMP?酶]+tRNA→AMP+
AA-tRNA+酶
氨酰tRNA合成酶對氨基酸、tRNA高度特異地識別;水解酯鍵的催化作用,發(fā)揮酶的校正活性。第28頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第二套遺傳密碼氨酰tRNA合成酶既能識別相應(yīng)的氨基酸,又能識別與此氨基酸相對應(yīng)的一個或多個tRNA分子。因此把這種氨酰tRNA合成酶與tRNA分子間的相互作用稱為第二套遺傳密碼。副密碼子
tRNA分子上決定其攜帶氨基酸的區(qū)域稱為副密碼子第29頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第30頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第31頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第32頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月氨基酰-tRNA的表示方法tRNAAla
;Ala-tRNA
;Ala-tRNAAla
Met-tRNAm;
fMet-tRNAf第33頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月三、rRNArRNA與蛋白質(zhì)結(jié)合構(gòu)成核蛋白體,分為大小亞基(50S,30S)原核生物70S真核生物80S小亞基rRNA蛋白質(zhì)16S-rRNA18S-rRNA21種33種大亞基rRNA蛋白質(zhì)5S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA28S-rRNA5.8S-rRNA34種49種第34頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月核糖體第35頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第36頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第37頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第38頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月核糖體特點
小亞基可與mRNA結(jié)合
大亞基在沒有小亞基存在時不能與
mRNA結(jié)合,但可與tRNA非特異結(jié)合第39頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月30S50S
第40頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月核糖體的活性位點在50S亞基上二位點模型三位點模型第41頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月A部位:氨?;课?,接受氨?;鵷RNAP部位:肽?;课唬鹗及滨RNA或延伸的肽基tRNA結(jié)合的部位,及
tRNA被釋放的部位E部位:出口位,特異結(jié)合無負(fù)載的
tRNA及無負(fù)載的tRNA離開的位點第42頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第43頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月蛋白質(zhì)的合成過程,就是以mRNA為模板,在輔助因子和GTP等的作用下,核糖體從mRNA的5’端向3’端移動,不同的氨酰-tRNA
按照mRNA上密碼子所決定的順序進(jìn)入核糖體,對號入座,在不斷生長著的肽鏈上由氨基端逐個加上氨基酸的過程。第二節(jié)蛋白質(zhì)的生物合成過程第44頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月原料:20種L-氨基酸
3種RNA酶:氨基酰tRNA合成酶、轉(zhuǎn)肽酶兩種高能核苷酸:ATP、GTP金屬離子:K+,Mg2+(促進(jìn)肽鍵形成)第45頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月多種蛋白質(zhì)因子:
起始因子:IF(initiationfactors)
延長因子:EF(elongationfactors)
釋放因子:RF/TF(releasefactors)方向:氨基端-------羧基端
第46頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第47頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月mRNA是一條長鏈分子。因此,在進(jìn)行蛋白質(zhì)合成時,可同時被多個核糖體翻譯。這樣,在顯微鏡下便可見到多個核糖體排列成一串。這種結(jié)構(gòu)就稱為多聚核糖體(polyribosome或polysome)。第48頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月翻譯過程mRNA5′3′5′AUG…………3′UAA肽鏈延長方向NC
氨基酸活化起始階段進(jìn)入/進(jìn)位過程成肽延長階段轉(zhuǎn)位終止階段
第49頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月
一、
氨基酸的活化
AA+ATP+酶[氨酰~AMP?酶]+ppi [氨酰~AMP?酶]+tRNAAMP+
氨酰~tRNA+酶
氨酰tRNA合成酶,
合成部位,水解部位-----保證準(zhǔn)確性第50頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月氨酰~AMP氨酰~tRNA第51頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月二、翻譯的起始PA5’3’MetAUG
fMet-tRNAfMet-tRNAmfMet第52頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月S-D序列(Shine-Dalgarno序列):又稱核糖體結(jié)合位點(RBS),在翻譯起始密碼AUG的上游,相距8-13個核苷酸處,有一段富含嘌呤的核苷酸序列,可以與核蛋白體小亞基16S-rRNA互補(bǔ)配對,使核糖體與mRNA在特定位置上結(jié)合。這種結(jié)合能協(xié)助辨認(rèn)起始密碼子,這一段1.mRNA鏈上起始信號的辨認(rèn)第53頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月幾種基因mRNA上的S-D序列第54頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月Met-tRNAf+N10甲酰四氫葉酸
fMet-tRNAf+四氫葉酸Met-tRNAm只能用于延伸2.起始氨酰—tRNA的形成轉(zhuǎn)甲酰酶第55頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月3.起始因子(IF)
:參與蛋白質(zhì)生物合成起始的可溶性蛋白質(zhì)因子IF-1:無專一功能,增加IF-2,IF-3活性IF-2:使fMet-tRNAf選擇性地與30S亞基結(jié)合。結(jié)合并水解GTPIF-3:具有解離活性,使亞基保持為解離態(tài);使30S與mRNA起始部位連接第56頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月
翻譯的起始第57頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月4.起始復(fù)合物的生成過程mRNA.IF-3.30sIF-2.GTP.fMet-tRNAfmRNA.30s.fMet-tRNAf
.IF-3.GTP.IF-1.IF-2IF-3mRNA.70s.fMet-tRNAf50SIF-1IF-2.GDPIF-1第58頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第59頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第60頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月三、肽鏈的延長翻譯過程中的肽鏈延長,又稱核糖體循環(huán)(ribosomalcycle)。分三步驟:
進(jìn)入(進(jìn)位) 核糖體循環(huán) 轉(zhuǎn)肽(轉(zhuǎn)肽酶)
移位第61頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月
肽鏈的延伸第62頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月延伸因子(EF):
參與肽鏈延伸的蛋白質(zhì)因子EF-TU,EF-TS:
共同促使氨酰-tRNA進(jìn)入核糖體的A位具有GTP酶活性EF-G:
具有GTP酶活性促使肽酰-tRNA位移至P位及空的tRNA
離開核糖體第63頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月(1)進(jìn)入EF-Tu.GTP.氨酰-tRNA進(jìn)入A位消耗1個GTPEF-Ts功能是保護(hù)EF-Tu,并使EF-Tu.GDP再生為EF-Tu.GTP,繼續(xù)參與肽鏈延伸EF-Tu能不能與fMet-tRNAf結(jié)合?第64頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第65頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月(2)轉(zhuǎn)肽(形成肽鍵)肽酰轉(zhuǎn)移酶:轉(zhuǎn)肽酶,P位點A位點形成肽鍵:P位點的fMet-tRNAf(或肽酰-tRNA)的羧基與A位點的AA-tRNA的氨基結(jié)合形成肽鍵不消耗GTP,可能來自AA~tRNA(或肽酰~tRNA)間的酯鍵水解第66頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月(3)移位肽?;?tRNA從核糖體的A位移到P位的過程核糖體沿mRNA的5’----3’方向移動與移位過程相偶聯(lián)(每次移動距離是1個密碼子)移位酶,EF-G(G因子)消耗1個GTP第67頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月3’PA5’fMetAUG23’PA5’MetAUG2進(jìn)入ffMetfMet第68頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月轉(zhuǎn)肽移位f3’PA5’metAUG23PA3’5’AUG2fMetfMet第69頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月PA3’5’AUGMet23PA3’5’AUGMet234
進(jìn)位轉(zhuǎn)肽fffMetfMet第70頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月PA3’5’AUGMet234PA3’5’AUGMet234fffMetfMet第71頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月第72頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月釋放因子(RF):終止肽鏈合成并將其從核糖體上釋放出來的一類蛋白質(zhì)因子終止密碼子:UAA、UAG、UGARF-1:UAA,UAGRF-2:UAA,UGARF-3:本身無識別密碼子性質(zhì),但可增強(qiáng)RF-1,RF-2的活性。四、肽鏈合成的終止第73頁,課件共84頁,創(chuàng)作于2023年2月(1)終止密碼子(UAA、UAG、UGA)出現(xiàn)在核糖體A位時,釋放因子(RF)就與之結(jié)合,(2)肽基轉(zhuǎn)移酶變?yōu)樗饷?,使新生的肽鏈與tRNA分離,并從核糖體上脫落下來,(3
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