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文檔簡(jiǎn)介
蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解翻譯過(guò)程2蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解第一節(jié)遺傳密碼mRNA分子上以5’→3’方向,從AUG開(kāi)始每三個(gè)連續(xù)的核苷酸組成一個(gè)密碼子,四種堿基可以組成43計(jì)64種密碼子。這些密碼不僅代表了20種氨基酸,還決定了翻譯過(guò)程的起始與終止位置。每種氨基酸至少有一種密碼子,最多的有6種密碼子。這種代表遺傳信息的三聯(lián)體稱為密碼子,或三聯(lián)體密碼子。3蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解遺傳密碼4蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解遺傳密碼子的特點(diǎn):
(1)起始碼與終止碼
mRNA5’末端的AUG(少數(shù)GUG)是起始密碼,對(duì)應(yīng)肽鏈的第一個(gè)氨基酸(蛋氨酸)的位置,因此原、真核生物合成的第一個(gè)氨基酸都是蛋氨酸;UAA,UAG,UGA是肽鏈成的終止密碼,不代表任何氨基酸,它們單獨(dú)或共同存在于mRNA3’末端。因此翻譯是沿著mRNA分子5′→3′方向進(jìn)行的。5蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解(2)密碼的通用性與例外
生命世界從低等到高等,都使用一套密碼,密碼表在生物界是通用的。但不同的生物中,不同codon使用頻率不同。例外:真核生物線粒體的密碼子。如人線體中,UGA→色氨酸(非終止密碼子),AGA、AGG→終止密碼子(非Arg)。6蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解(3)簡(jiǎn)并性與防錯(cuò)一種氨基酸有幾組密碼子,或者幾組密碼子代表一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼子的簡(jiǎn)并性。
--第三位堿基決定對(duì)應(yīng)于同種氨基酸的不同密碼子稱為同義密碼子。只有色氨酸和蛋氨酸只有一個(gè)密碼子。7蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解(4)不重疊,無(wú)逗號(hào)
兩個(gè)密碼子之間沒(méi)有任何核苷酸隔開(kāi),因此從起始碼AUG開(kāi)始,三個(gè)堿基代表一個(gè)氨基酸,這就構(gòu)成了一個(gè)連續(xù)不斷的讀碼框,直至終止碼。如果在讀碼框中間插入或缺失一個(gè)堿基就會(huì)造成移碼突變,引起突變位點(diǎn)下游氨基酸排列的錯(cuò)誤。8蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解密碼子的特點(diǎn)
從5’開(kāi)始,三聯(lián)體密碼。有起始碼與終止碼之分,無(wú)標(biāo)點(diǎn),不重疊,簡(jiǎn)并性、搖擺性、通用性與防錯(cuò)系統(tǒng)。9蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解第二節(jié)蛋白質(zhì)合成的主要物質(zhì)
(一)合成原料-20種基本氨基酸;(二)mRNA是合成蛋白質(zhì)的直接模板;(三)tRNA是氨基酸的運(yùn)載工具;(四)核糖體是蛋白質(zhì)的合成場(chǎng)所;(五)多種蛋白因子參與蛋白合成過(guò)程起始因子;延伸因子;釋放因子10蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解二、tRNA轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸到mRNA模板
反密碼子的擺動(dòng)性11蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解反密碼子與密碼子配對(duì)時(shí)
的搖擺現(xiàn)象密碼子的第3個(gè)堿基與反密碼子的第1個(gè)堿基配對(duì),兩者配對(duì)并不嚴(yán)格,反密碼的第1位堿基常出現(xiàn)次黃嘌呤I,與A、C、U結(jié)合,這是最常見(jiàn)的擺動(dòng)現(xiàn)象。反密碼第1位堿基
ACGUI密碼第3位堿基
UGC,UA,GA,C,U12蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解四、核糖體
核糖體是蛋白質(zhì)合成的場(chǎng)所,由大、小兩個(gè)亞基組成,需結(jié)構(gòu)完整才能發(fā)揮功能。在體內(nèi)可游離或與mRNA以串狀形式存在。真核生物的核糖體還可與細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合,形成粗糙內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。成份:rRNA和幾十種蛋白質(zhì)。13蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解原核生物核糖體組成真核生物核糖體組成14蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解核糖體的功能區(qū)mRNA、
P、A、E位點(diǎn);轉(zhuǎn)肽酶、各種因子位點(diǎn)15蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解(1)mRNA結(jié)合位點(diǎn):在大、小亞基的接觸面上???0s小亞基頭部中的16SrRNA3’端與mRNAAUG之前的一段序列(SD序列)互補(bǔ);(2)P位點(diǎn):又叫肽?;稽c(diǎn)。結(jié)合延伸的多肽酰tRNA;(3)A位點(diǎn)也稱氨?;稽c(diǎn)。結(jié)合新進(jìn)入的氨酰tRNA。(4)E位點(diǎn):結(jié)合空載的tRNA(5)轉(zhuǎn)肽酶活性部位:位于P位和A位的連接處。(6)結(jié)合參與蛋白質(zhì)合成的起始因子IF、延長(zhǎng)因子EF和終止因子或釋放因子RF。16蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解第三節(jié)蛋白質(zhì)合成機(jī)制
蛋白質(zhì)的合成亦稱翻譯,mRNA→氨基酸。方向:5’→3’,N端→C端。原核生物與真核生物的蛋白質(zhì)合成過(guò)程中有很多的區(qū)別,真核生物過(guò)程更復(fù)雜。蛋白質(zhì)生物合成可分為五個(gè)階段,氨基酸的活化、多肽鏈合成的起始、肽鏈的延長(zhǎng)、肽鏈的終止和釋放、蛋白質(zhì)合成后的加工修飾。17蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解一、氨基酸的活化→氨酰tRNA氨基酸在摻入多肽鏈之前必須先活化以獲得額外能量?;罨陌被幔ò滨MP)再與其特異的tRNA結(jié)合形成氨酰tRNA。在氨酰-tRNA合成酶催化下進(jìn)行。18蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解氨基酸活化成氨酰tRNA消耗兩個(gè)ATP19蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解氨酰-tRNA合成酶的特性①催化反應(yīng)的專一性。該酶至少有兩個(gè)識(shí)別位點(diǎn),既識(shí)別氨基酸,又能識(shí)別轉(zhuǎn)運(yùn)該氨基酸的一個(gè)或多個(gè)tRNA。對(duì)tRNA專一性極高。每種氨基酸都有2-6種各自特異的tRNA,它們之間的特異性是靠氨酰tRNA合成酶來(lái)識(shí)別的。
②校正功能??伤忮e(cuò)配的氨酰-tRNA。20蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解蛋氨酰tRNA啟動(dòng)蛋白質(zhì)合成轉(zhuǎn)運(yùn)蛋氨酸的tRNA有兩種:①tRNAiMet:特異識(shí)別mRNA上起始密碼子AUG,摻入第一個(gè)氨基酸,啟動(dòng)蛋白合成;
②tRNA
Met:與mRNA中間的AUG配對(duì),在肽鏈延伸中摻入Met。蛋氨酸的活化形式:①起始位置:Met-tRNAiMet(原核fMet-tRNAiMet)②中間位置:Met-tRNAMet21蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解22蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解原核細(xì)胞蛋氨酰tRNA甲?;思?xì)胞中起始氨基酸活化后,還要甲?;U婧思?xì)胞沒(méi)有此過(guò)程。
FH4供給甲基Met-tRNAi
fMet-tRNAi
甲?;?/p>
23蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解二、大腸桿菌中肽鏈合成的起始
(1)起始信號(hào)SD序列:位于起始AUG上游10個(gè)堿基處一段富含嘌呤的序列。這段序列正好與30S小亞基中的16SrRNA3’端一部分序列互補(bǔ),因此SD序列也叫做核糖體結(jié)合序列。這種互補(bǔ)就意味著核糖體能選擇mRNA上AUG的正確位置來(lái)起始肽鏈的合成。24蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解25蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解(2)起始復(fù)合物的形成:
30S起始復(fù)合物→70S起始復(fù)合物。在起始因子IF1,2,3和GTP參與下,fMet-tRNAf識(shí)別mRNA的起始密碼子AUG,與30S結(jié)合成30S起始復(fù)合物;50S與30S起始復(fù)合物結(jié)合生成70S-mRNA-fMet-tRNAf復(fù)合物,并釋放各種起始因子。此時(shí)fMet-tRNAf占據(jù)著P位點(diǎn),A位則空著。26蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解70S起始復(fù)合物30S起始復(fù)合物27蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解三、多肽鏈的延長(zhǎng)
在多肽鏈上每增加一個(gè)氨基酸都需要經(jīng)過(guò)進(jìn)位,轉(zhuǎn)肽和移位三個(gè)步驟。(1)進(jìn)位:為密碼子所規(guī)定的氨酰tRNA結(jié)合到核糖體的A位,稱為進(jìn)位。需延伸因子EF-Tu、EF-Ts和GTP參與。28蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解(2)轉(zhuǎn)肽(肽鍵的形成):P位上的肽酰tRNA提供α-COOH基,和新進(jìn)入的Aa的α-NH2形成肽鍵,從而使P位上的肽連接到A位氨基酸的氨基上。新合成的肽酰tRNA處于A位。23SRNA催化。
(3)移位(Translocation):肽酰tRNA又進(jìn)入P位,空載tRNA進(jìn)入E位。重復(fù)進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽、移位,肽鏈沿N→C方向延伸。29蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解30蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解31蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解四、翻譯的終止及肽鏈的釋放
當(dāng)肽鏈延伸到終止密碼子時(shí),沒(méi)有任何tRNA與之對(duì)應(yīng),故A位空出,釋放因子RF識(shí)別終止密碼子,進(jìn)入A位,使肽酰轉(zhuǎn)移酶變?yōu)樗饷富钚?,釋放出肽鏈和tRNA。生物體為了加強(qiáng)終止,通常設(shè)置了兩個(gè)以上并排的終止密碼。所以要合成含n個(gè)AA殘基的肽鏈,mRNA至少含有3n+6個(gè)核苷酸。
32蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解34蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解多聚核糖體上述只是單個(gè)核糖體的翻譯過(guò)程,事實(shí)上在細(xì)胞內(nèi)一條mRNA鏈上結(jié)合著多個(gè)核糖體,甚至可多到幾百個(gè)。第一個(gè)核糖體翻譯移動(dòng)一定距離后,第二個(gè)核糖體又在mRNA的起始部位結(jié)合。兩個(gè)核糖體之間有一定的長(zhǎng)度間隔,每個(gè)核糖體都獨(dú)立完成一條多肽鏈的合成,所以這種多核糖體可以在一條mRNA鏈上同時(shí)合成多條相同的多肽鏈,這就大大提高了翻譯的效率。35蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解系列核糖體同時(shí)翻譯同一條mRNA36蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解37蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解真核生物蛋白質(zhì)的合成核糖體不同:原核70S(50+30),真核80S(60+40)起始Aa不同:原核是fMet,真核是Met起始機(jī)制不同:原核SD序列,真核5’端帽子。起始復(fù)合物的形成過(guò)程不同。真核生物過(guò)程更復(fù)雜,需要的因子更多。38蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解五、蛋白質(zhì)合成的抑制劑抗生素直接抑制蛋白質(zhì)合成:原核:氯霉素、四環(huán)素、鏈霉素、新霉素、卡拉霉素、紅霉素、真核:亞胺環(huán)己酮、白喉毒素嘌呤霉素(628)對(duì)原核、真核均有抑制作用。39蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解與DNA模板作用與RNA聚合酶作用原核生物真核生物放線菌素D--插入dG*dC間低濃度--(-)RNA延長(zhǎng)高濃度--(-)RNA起始
(-)DNA復(fù)制利福平/利福霉素和RNA聚合酶β亞基結(jié)合--(-)轉(zhuǎn)錄起始/延伸α鵝膏蕈堿--(-)RNA聚合酶Ⅱ間接抑制40蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解第四節(jié)蛋白的運(yùn)輸?shù)鞍踪|(zhì)的合成部位在核糖體,合成后去向有三個(gè):①保留在胞漿;②進(jìn)入細(xì)胞核、線粒體或其它細(xì)胞器;③分泌到細(xì)胞外??缒み\(yùn)輸:②③去向需越過(guò)不同的膜結(jié)構(gòu)。信號(hào)肽決定了肽的走向。靶向運(yùn)輸:蛋白質(zhì)合成后,定向到達(dá)其執(zhí)行功能的目的地點(diǎn)。41蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解信號(hào)肽:絕大多數(shù)越膜蛋白的N端約有15-30個(gè)以疏水氨基酸為主的N端信號(hào)序列。共有特征:①N端堿性Aa;②中間15~30個(gè)疏水氨基酸;③C端有信號(hào)肽酶切位點(diǎn)。42蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解第五節(jié)加工修飾多肽移位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)后,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的小腔上被修飾。修飾作用包括切去信號(hào)肽,形成二硫鍵,使線性多肽呈獻(xiàn)一定空間結(jié)構(gòu)及糖基化作用。在高爾基體中,糖蛋白的寡糖核進(jìn)一步修飾,并將多肽分類輸送到各處。43蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解加工修飾切除信號(hào)肽糖基化44蛋白質(zhì)的生物合成專業(yè)知識(shí)講解蛋白質(zhì)翻譯后的折疊
大多數(shù)蛋白質(zhì)翻譯后要進(jìn)行不同形式的加工修飾,并折疊成一定形狀才有活性。蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列沒(méi)有改變,只是其高級(jí)結(jié)構(gòu)或者說(shuō)構(gòu)象改變引起的疾病,那就是所謂“構(gòu)象病”,或稱“折疊病”,如瘋牛病、老年性癡呆癥、家族性高膽固醇癥、家族性淀粉樣蛋白癥、某些腫瘤、白內(nèi)障等等。對(duì)蛋白質(zhì)折疊機(jī)
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