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藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠第三章基于結構的藥物設讠藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠基于結構的藥物設讠(計算機輔助藥物設計)·第一節(jié)計算機輔助藥物設計的基本理論和方法第二節(jié)基于配體的藥物設計方法(定量構效關系方法藥效團模型)第三節(jié)基于受體的藥物設計方法(分子對接,虛擬篩選全新藥物設計)藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠第一節(jié)計算機輔助藥物設計的基本理論和方法、基于藥物-靶標相互作用的藥物設計、類藥性預測方法與初步虛擬篩選分子三維結構表示藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠思考題·類藥性預測方法有哪些?各自的主要內容是什么?·一般的分子力場包含哪幾項·如何通過理論計算方法得到一個小分子的最低能量結構藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠1、已有藥物-靶結合作用的增強·通過研究先導化合物與靶分子的作用模式可以發(fā)現(xiàn)先導化合物的重要官能團可能不是出于最佳的位置或者與靶分子的相互作用較弱·可以通過各種結構修飾方法來增強先導化合物與靶分子的相互作用,提高先導化合物對靶分子的親和力和選擇性。藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠結合基團的替換變換結合基團是一種簡單的增強藥物-靶標相互作用的方法,通過分子對接等方法可以預測最佳的結合基團。在變換結合基團的過程中,需要考慮合成的可行性,一般避免對原合成路線有大的改動??怂诖〈兓瘜τ诹蛩诖Y合的影響藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠烷基替換最為常見:甲基、乙基、丙基、丁基、異丙基、異丁基、叔丁基等的變換來考察鏈的長度和體積對結合的影響。對于有些能同時作用于多個同類受體的藥物,可以通過烷基的改變,提高藥物選擇性。烷基替換腺章(2-1)異丙腎上腺素(2-2)可作用于α和β腎上腺素受體僅作用于β腎上腺素受體藥物設計學蘭州大學藥學院,李加忠芳香環(huán)和雜環(huán)的替換:通??梢愿淖儹h(huán)的大小和雜原子來增強藥物與靶分子的結合相互作用??拐婢幏蓟鎿Q氟康唑(2-3)伏立康唑(2-4三唑環(huán)用氟代嘧啶環(huán)替代后,大大增強了與唑類抗真菌藥物作用靶點羊毛甾醇14α-去甲基化酶的相互結合作用物設計學蘭州大學的學院,李加忠結合基團位置的變化延長鏈的長度在研究先導化合物與靶分子的作用模式時發(fā)現(xiàn),有時結縮短鏈的長度合基團并不處于一個最佳的位置,通過調整結合基團的位置,可以增強先
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