文獻檢索pubmed講解課件

PubMed文獻服務系統(tǒng)

及PubMedRSS學科跟蹤服務PubMed文獻服務系統(tǒng)

及PubMedRSS學科跟蹤服務1PubMed簡介

PubMed(Medline)由美國國立醫(yī)學圖書館（NLM）、國際MEDLARS成員（中國為第16個成員國）及合作的專業(yè)組織共同研制開發(fā)，是目前國際上公認的檢索生物醫(yī)學文獻最具權威、利用率最高、影響最廣的數(shù)據(jù)庫，也是我國衛(wèi)生部認定的科技查新必須檢索的國外醫(yī)學數(shù)據(jù)庫。PubMed簡介PubMed(Medli2

提綱PubMed概況PubMed功能欄介紹認識PubMed文獻PubMed基本檢索PubMed高級檢索主題詞MeSH檢索循證及臨床查詢檢索PubMed全文獲取PubMedRSS學科跟蹤提綱PubMed概3概況網(wǎng)址：/pubmed

或PubMed收錄的期刊最早追溯至1865年，共收錄了70余個國家36000余種期刊，1900多萬篇文獻；PubMed的子集Medline收錄的文獻最早追溯至1902年，現(xiàn)有記錄1790多萬篇；目前每年增加約60余萬條文獻記錄；在全部記錄中有76%的文獻為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻為英文，共計收錄國內(nèi)出版的期刊170余種。概況網(wǎng)址：www.4/pubmedWelcometoPubMed使用幫助檢索詞輸入框常用工具更多服務/pubmedWel5認識PubMed文獻出處SO篇名TI作者AU文獻類型(狀態(tài))Summary認識PubMed文獻出處SO篇名TI作者AU文獻類型(狀態(tài))6認識PubMed文獻調(diào)整顯示設置可改變顯示模式，顯示數(shù)量及檢索結果排序顯示設置顯示摘要顯示數(shù)量排序模式認識PubMed文獻調(diào)整顯示設置顯示設置顯示摘要顯示數(shù)量排序7認識PubMed文獻在摘要顯示模式下可以看到詳細的文獻信息作者地址文獻摘要文獻作者文獻篇名全文鏈接文獻類型文獻主題詞認識PubMed文獻在摘要顯示模作者地址文獻摘要文獻作者文獻8認識PubMed文獻出版社上傳PreMedlinePubMedMedlinePubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻的狀態(tài)，主要為Medline認識PubMed文獻出版社上傳PreMedlinePubMe9認識PubMed文獻非英文的文獻篇名上有方括號[]且注明有語種英文文獻土耳其語[篇名]英文文獻認識PubMed文獻非英文的文獻英文文獻土耳其語[篇名]10認識PubMed文獻電子優(yōu)先即最新文獻，一般比印刷出版提前三個月以上電子優(yōu)先2009年5月2008年9月認識PubMed文獻電子優(yōu)先即最電子優(yōu)先2009年5月20011PubMed基本檢索

自由詞檢索

在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。例如：檢索腫瘤(cancer)方面的文章。在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。

PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進行檢索，比如，檢索“cancer”

將自動轉換為："neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]PubMed基本檢索12自由詞檢索時PubMed自動將不規(guī)范的詞轉換成規(guī)范的詞進行檢索自動詞匯轉換PubMed基本檢索自由詞檢索時自動詞匯轉換PubMed基本檢索13PubMed基本檢索布爾邏輯組合檢索，常用的邏輯關系詞有AND，OR，NOT等ABAB

邏輯與（AND）--檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B.

如：AANDB

邏輯非（NOT）--在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。如：ANOTB

邏輯或（OR）--檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時含有檢索詞A和B的文獻。如：AORBABPubMed基本檢索布爾邏輯組合A14PubMed基本檢索

作者姓名檢索按照姓+名縮寫（不用標點）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。姓名第一個字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫。考慮到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動轉換功能進行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號將作者名引起來，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，這樣可避免PubMed自動轉換，實現(xiàn)精確查找。PubMed基本檢索15PubMed基本檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標點鍵入作者姓名smithjPubMed基本檢索作者姓名檢索smithj16PubMed基本檢索精確檢索避免PubMed自動詞匯轉換，實現(xiàn)精確查找"smithj"[au]PubMed基本檢索精確檢索避免"smithj"[au]17PubMed基本檢索期刊檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：Europeanjournalofimmunology，系統(tǒng)的“自動詞語匹配”功能會將它轉換成"EurJImmunol"[Journal]OR"europeanjournalofimmunology"[AllFields]進行檢索。也可以直接輸入Medline的期刊標準縮寫形式，如：EurJImmunol

，或者是輸入刊物的ISSN（國際標準出版物代碼）進行檢索，如：0014-2980。如果一個雜志名恰好是主題詞或關鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會首先將這些詞轉換成MeSH詞表中的主題詞進行檢索。因此，需要將檢索請求進行標準化處理，即在雜志名后面加[TA]。如："cell"[ta]PubMed基本檢索期刊檢索18PubMed基本檢索期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號EurJImmunolPubMed基本檢索期刊的一般檢EurJImmunol19PubMed基本檢索期刊的標準檢索，是在期刊名后面加字段限定[TA].比如:"cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本檢索期刊的標準檢"cell"[ta]20PubMed基本檢索

期刊數(shù)據(jù)庫（journaldatabase)期刊數(shù)據(jù)庫的作用：1、可以查看期刊的詳細信息，包括出版國家，出版社，出版語言，期刊類目等等；2、可以根據(jù)期刊的主題分類，查看medline收錄的各學科的期刊，比如查看medline收錄的關于麻醉學(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便檢索某本期刊上被PubMed收錄的所有文章。比如：我們想知道期刊AcadPediatr的全稱以及具體的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：點擊導航欄上的Journaldatabase，打開期刊數(shù)據(jù)庫檢索界面，在檢索框中輸入AcadPediatr，再點擊Go按鈕即可。PubMed基本檢索期刊數(shù)21PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導航欄的右下角部分期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫在期刊數(shù)據(jù)庫22PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以查看指定期刊的詳細信息Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)23PubMed基本檢索按期刊主題瀏覽medline收錄的各學科的期刊期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索按期刊主題瀏期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫24PubMed基本檢索按字母順序瀏覽medline收錄的各學科期刊麻醉學方面PubMed基本檢索按字母順序瀏麻醉學方面25PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以方便的查看medline收錄的各學科方面的期刊medline收錄的麻醉學方面的期刊PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可medline收錄的麻醉學方26PubMed基本檢索

截詞檢索截詞檢索的作用：擴大檢索范圍，提高查全率。截詞符：用*表示，代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進行檢索。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacteriophage，bacterium，等最多600個單詞。PubMed基本檢索27PubMed基本檢索截詞檢索可以擴大檢索范圍提高查全率。bacter*[TI]PubMed基本檢索截詞檢索可以bacter*[TI]28PubMed基本檢索

字段限制檢索采用字段限制方式進行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1[字段標識]邏輯運算符檢索詞2[字段標識]如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關DNA方面的文獻.檢索式：crick[au]AND1993[dp]ANDDNAPubMed基本檢索29PubMed基本檢索crick[au]AND1993[dp]ANDDNA字段限制檢索其規(guī)則是：檢索詞+[字段標識]

PubMed基本檢索crick[au]AND1993[d30PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation[ad]：著者地址字段。Authorname[au]：文章的作者，檢索格式：姓+名。如："smithja"[au]Journaltitle[ta]：期刊名稱。如：cell[ta]Language[la]：論文出版語種。語種檢索時可只輸入前3個字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻檢索式:hypertension[ti]ANDchi[la]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識31PubMed基本檢索hypertension[ti]ANDchi[la]檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻PubMed基本檢索hypertension[ti]AND32PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識Publicationdate[dp]:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DD[DP]要檢索一段時期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號，如：1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗等。如：review[pt]MeSHterms[mh]：主題詞字段。如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主題詞。與主題詞組配檢索.比如：檢索1995年到1996年出版的關于高血壓方面的綜述性文獻。1995/01:1996/12[DP]ANDhypertension[mh]ANDreview[pt]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識33PubMed基本檢索檢索

1995

年到

1996

年出版的關于高血壓方面的綜述性文獻1995/01:1996/12[DP]ANDhypertension[mh]ANDreview[pt]PubMed基本檢索檢索1995年1995/01:19934PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識FILTER[Filter]：由PubMed系統(tǒng)鏈接的外部資源站點所使用的用來限定文獻的技術標識，此檢索字段常用來限定檢索比如被F1000M評價的文獻等Facultyof1000是英國現(xiàn)代生物出版集團（BioMedCentral）為彌補只用期刊影響因子（IF）來衡量刊物的不足，近年來提出了“Facultyof1000”計劃。從全世界邀請數(shù)千名頂尖的生物學家和醫(yī)學專家，請他們從每年所發(fā)表的生物醫(yī)學SCI論文中評選出一小部分（約占0.1%）的文章，賦予F1000論文稱號，推薦給全世界的生物學和醫(yī)學工作者，并由“Facultyof1000”中的科學家對F1000論文逐篇加以評論。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的被Medline正式收錄且被F1000評價過的研究文獻”要求查準不要求查全，對此構建的檢索式：(nasopharyngealcancer)AND(Therapy/Narrow[filter])ANDmedline[sb]ANDloprovf1000m[filter]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識35PubMed基本檢索檢索鼻咽癌治療方面的且被Medline正式收錄及F1000評價過的研究文獻F1000M文獻評價PubMed基本檢索檢索鼻咽癌治F1000M文獻評價36PubMed基本檢索強制檢索功能PubMed允許使用雙引號來強制系統(tǒng)進行短語檢索。如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“singlecell”，并用雙引號引起來。點擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。如果不使用雙引號進行強制檢索，系統(tǒng)就會將其分成2個詞：single和cell檢索，其檢索表達式為：singleANDcell.很明顯這樣的檢索結果是不符號要求的。PubMed基本檢索強制檢索功能37PubMed基本檢索強制檢索普通檢索"singlecell"singlecellPubMed基本檢索強制檢索普通檢索"singlecell38PubMed高級檢索高級檢索PubMed高級檢索高級檢索39PubMed高級檢索限定欄預覽高級檢索界面下可以看到明細欄，預覽，檢索史，限定和高級檢索等檢索史明細欄高級檢索更多服務PubMed高級檢索限定欄預覽高級檢索界面檢索史明細欄高級檢40PubMed高級檢索姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻姚開泰作者PubMed高級檢索姚開泰院士姚開泰作者41PubMed高級檢索姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻時間2001使用說明PubMed高級檢索姚開泰院士時間2001使用說明42PubMed高級檢索Limit限定年齡物種子集全文字段時間性別語言文獻類型PubMed高級檢索Limit限定年齡物種子集全文字段時間性43PubMed高級檢索限定檢索范圍為近半年來以英文發(fā)表的循證醫(yī)學方面的文獻限定為英文限定為循證等文獻限定為近半年PubMed高級檢索限定檢索范圍限定為英文限定為循證等文獻限44PubMed高級檢索限定檢索范圍為被Medline正式收錄的有電子全文鏈接的中老年病例限定為Medline限定為有電子全文限定為中老年PubMed高級檢索限定檢索范圍限定為Medline限定為有45主題詞MeSH檢索

《醫(yī)學主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)

《醫(yī)學主題詞表》是對生物醫(yī)學文獻進行主題分析、標引和檢索的權威性詞表，它的作用是使醫(yī)學文獻的主題標引和檢索達到統(tǒng)一和一致，并指導用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學文獻。它可以指導用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞，告訴用戶主題詞如何使用，顯示主題詞之間的相互關系。主題詞MeSH檢索《醫(yī)學主題詞46主題詞MeSH檢索

《醫(yī)學主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)利用主題詞進行檢索方法:1、點擊主頁右下角的MeSHDatabase進入主題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關主題詞；3、點擊該主題詞進一步顯示該主題詞的定義、樹狀結構、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點擊sendto按鈕，進入檢索表達式瀏覽窗口；5、點擊SearchPubMed將顯示檢索結果。主題詞MeSH檢索《醫(yī)學主題詞47主題詞MeSH檢索主題詞數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導航欄的右下角主題詞數(shù)據(jù)庫主題詞MeSH檢索主題詞數(shù)據(jù)庫主題詞數(shù)據(jù)庫48主題詞MeSH檢索輸入普通詞查找對應主題詞MeSH主題詞檢索可以指導用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學文獻主題詞MeSH檢索輸入普通詞MeSH主題詞檢索可49主題詞MeSH檢索一般一個主題詞還要配合一個副主題詞進行組合檢索選擇副主題詞主題詞MeSH檢索一般一個主題選擇副主題詞50SearchBoxwithAND主題詞MeSH檢索點Sentto

將檢索詞添加到檢索表達式瀏覽窗口SearchBoxwithAND主題詞MeSH檢索點S51主題詞MeSH檢索SearchPubMed主題詞檢索可以達到比較滿意的查全率和查準率主題詞MeSH檢索SearchPubMed主題詞檢索可52主題詞MeSH檢索主題詞檢索是在有主題標引的Medline數(shù)據(jù)庫中檢索主題詞檢索結果主題詞MeSH檢索主題詞檢索是主題詞檢索結果53主題詞MeSH檢索普通詞不是規(guī)范化的主題詞檢索結果相關度低普通詞檢索結果主題詞MeSH檢索普通詞不是規(guī)普通詞檢索結果54臨床查詢檢索

“Clinicalqueries”是專門為臨床醫(yī)生研究設計的內(nèi)置的臨床方法學“過濾器”（ClinicalMethodologyFilters），這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學和生物統(tǒng)計學研究人員HaynesRB等人在1994年提出來的，并進行了查全率和查準率分析。用戶通過這一臨床方法學檢索過濾器，不需掌握復雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻。臨床查詢檢索55臨床查詢檢索

使用方法:1、點擊主頁左側導航欄的ClinicalQueries進入臨床查詢頁面；2、在檢索框中輸入檢索詞，并選擇副主題詞組配，指定檢索結果是查全(sensitive)，還是查準(specific)；3、點擊GO按鈕執(zhí)行檢索。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的研究文獻”臨床查詢檢索56臨床查詢檢索臨床查詢在PubMed首頁導航欄的中間部分臨床查詢臨床查詢檢索臨床查詢在臨床查詢57臨床查詢檢索臨床查詢主要用于檢索臨床方面的研究文獻臨床查詢檢索臨床查詢檢索臨床查詢主要臨床查詢檢索58臨床查詢檢索臨床查詢主要包括某種疾病的治療，診斷病因和預后四個方面檢索結果臨床查詢檢索臨床查詢主要檢索結果59PubMed全文獲取

通過PubMed檢索出來的文獻，部分我們通過瀏覽摘要即可，部分我們還需要查看全文，以作進一步的研究，那么，我們?nèi)绾潍@取全文呢？一：免費的全文PubMed全文獲取通過PubMed檢索出來的60PubMed全文獲取PubMed收錄的文獻大約有5%是免費的可以直接打開全文免費全文可直接打開PubMed全文獲取PubMed收錄免費全文可直接打開61PubMed全文獲取打開PDF全文免費的全文并不代表學術價值低，大部分的生命科學的全文都是免費的PubMed全文獲取打開PDF全文免費的全文并62PubMed全文獲取二：學校已訂購的全文如果我們所需要的文獻，學校已訂購了該文獻所在的全文型數(shù)據(jù)庫，我們也可以直接打開或到相應的全文數(shù)據(jù)庫中查找。PubMed全文獲取63國內(nèi)出版的期刊，學校一般都有訂購，請查找清華同方或維普，萬方學校已訂購PubMed全文獲取國內(nèi)出版的期學校已訂購PubMed全文獲取64PubMed全文獲取SpringerLink和EBSCO等外文全文庫，一般學校也有訂購學校已訂購PubMed全文獲取Sp